Gendo Ikari
Latar belakang

Gendo Ikari terlahir dengan nama Gendo Rokubungi (六分儀, yang berarti sekstan. Hampir tidak ada yang diketahui tentang masa kecilnya maupun masa remajanya. Selama studinya di universitas, dia bertemu dengan Yui Ikari, dan memulai hubungan dengannya. Melalui Yui, dia diperkenalkan dengan Profesor Kozo Fuyutsuki. Fuyutsuki membenci Gendo, karena ia memiliki perasaan romantis yang tak diungkapkan ke Yui, dan merasa curiga Gendo memiliki motif tersembunyi sehingga ingin menjalin hubungan dengan Yui: termasuk agar dapat terhubung ke organisasi gelap SEELE. Gendo dan Yui menikah pada awal abad ke-21, dan mengubah nama keluarganya menjadi Ikari. Akhir tahun 2000, Gendo bersama ketua SEELE Keel Lorenz mengunjungi Ekspedisi Katsuragi di Antartika untuk mengawasi proyek pemulihan Adam. Gendo dan timnya kemudian meninggalkan Antartika, beberapa hari sebelum Second Impact. Pada tahun 2001, setelah Second Impact, putra Yui dan Gendo, Shinji, lahir.
Pada tahun 2003, Gendo dan Yui bekerja bersama di organisasi riset GEHIRN. Gendo kemudian merekrut Fuyutsuki ke dalam organisasi. Setelah tes aktivasi Unit 01 yang gagal dan kematian Yui dalam acara ini, Gendo mengubah pribadinya secara mendasar. Dia menjadi sangat dingin dan meninggalkan Shinji. Dia kemudian mengusulkan rencana untuk SEELE untuk mencapai Instrumentalitas Manusia melalui Third Imapct; namun tanpa sepengetahuan SEELE, rencana Gendo yang sebenarnya adalah untuk bersatu kembali dengan jiwa Yui. Satu-satunya orang yang Gendo percayakan dengan rencananya adalah Fuyutsuki, yang meskipun tidak suka pada Gendo, ia setuju untuk membantu rencana tersebut. Gendo kemudian mendekati Naoko Akagi, dan beberapa tahun kemudian dengan putrinya, Ritsuko, sehingga memunculkan keraguan atas komitmennya pada Yui. Namun, tersirat bahwa Gendo hanya menggunakan mereka untuk menciptakan Third Impact. Tak lama kemudian, Gendo dan Fuyutsuki sembunyi-sembunyi menciptakan klon Yui yang tidak sempurna, dengan menggabungkan materi DNA Yui dan Malaikat kedua Lilith, menamakannya Rei Ayanami. Untuk memastikan dirinya dapat mengendalikan Third Impact saat hari itu tiba, Gendo menghidupkan Rei dengan menanamkan jiwa Lilith pada Rei, dan memperkenalkannya kepada yang lain sebagai putri seorang teman yang dia jaga. Sehari setelah pengembangan sistem komputer revolusioner MAGI selesai, GEHIRN direorganisasi menjadi NERV, di mana Gendo menjadi Komandannya.
Malafungsi yang masif selama tes aktivasi pertama untuk Unit 00 menyebabkan Eva "berserk." Untuk mencegah Rei mengalami cedera serius, entry plug kemudian dikeluarkan, dan Gendo membuka pintu yang sangat panas tersebut dengan tangan kosong untuk mengeluarkan Rei. Tangannya memiliki bekas luka bakar parah karena hal ini dan dia tidak pernah terlihat tanpa sarung tangannya (kecuali di episode 5, ketika dia melepasnya sebentar; ketika Shinji melihatnya, Ritsuko menceritakan kisahnya).
Meskipun Gendo berpura-pura mengikuti perintah SEELE tanpa bertanya, dia memiliki agendanya sendiri dan mencoba memanipulasi komite. Pemberontakan vokal terakhirnya terhadap SEELE berasal dari keinginannya untuk memulai Third Impact di bawah kendali penuhnya. Dia menanamkan embrio Adam di tangannya dan mencoba menggabungkannya dengan Rei untuk mencapai tujuan ini.
Dalam The End of Evangelion, Rei akhirnya menentang Gendo secara langsung dan berpisah dengannya (setelah bergabung dengan Adam) untuk dapat bergabung dengan Lilith dan memulai Instrumentalitas seorang diri. Melihat bahwa semua rencananya untuk bersatu kembali dengan Yui tidak menghasilkan apa-apa, Gendo memohon agar Rei kembali kepadanya; dia menolak. Setelah Instrumentalitas dimulai, Gendo berhadapan dengan bayangan dari berbagai Rei serta dengan Kaworu dan Yui sendiri. Gendo mengaku bahwa dia takut pada "ikatan tak terlihat" yang dibentuk oleh orang-orang yang berada di sekitarnya, dan bahwa dia takut menghadapi putranya setelah kematian Yui. Penampakan Unit 01 yang sudah kehilangan banyak pelindungnya terlihat memegang Gendo dengan cara yang sama seperti Kaworu dalam Episode 24; Unit 01 yang sebenarnya pada saat itu berada dalam Pohon Kehidupan, dan masih utuh. Gendo menyatakan bahwa "...ini adalah pembayaran utangku", dan Unit 01 menggigit tubuhnya ketika dia mengucapkan kata-kata terakhirnya: "Maafkan aku, Shinji." Kamera kemudian bergeser kembali ke Terminal Dogma, di mana tubuh bagian bawah Gendo terlihat masih berdiri, dengan tubuh bagian atasnya terputus.