Jalur kereta api Jakarta–Bogor
Sejarah > Era Staatsspoorwegen

Pada tanggan 1 November 1913, seluruh aset perkeretaapian di jalur kereta api Batavia–Buitenzorg resmi diakuisisi oleh Staatsspoorwegen (SS). Persetujuan pembelian jalur ini dituangkan dalam Staatsblaad No. 469 tertanggal 20 Juni 1913. Sebelumnya, SS sudah tertarik untuk membeli jalur ini pada tahun 1877, saat pemerintah berencana membangun jalur kereta api Batavia–Bandung. Setelah pembelian jalur kereta api Batavia–Buitenzorg, SS mulai melakukan penataan ulang besar-besaran di jalur kereta api ini untuk mempermudah lintasan antara satu dengan lainnya. Pasca-akuisisi, SS membuat percabangan Halte Cikini dan Halte Pegangsaan, menuju Salemba.
Pada saat itu, Stasiun Batavia mulai tidak ideal dan tidak efektif mengingat jaraknya yang sangat dekat dengan Stasiun Batavia Zuid. Hal tersebut sangat menyulitkan penumpang yang ingin transit ke rute kereta api lainnya. Akibatnya, penumpang yang tiba di Stasiun Batavia Zuid harus berjalan kaki terlebih dahulu untuk dapat melanjutkan perjalanan ke Buitenzorg melalui Stasiun Batavia. Untuk menyatukan kedua stasiun tersebut, SS merencakanan pembangunan stasiun sentral yang lebih besar dan megah. Stasiun ini kemudian dibangun pada tahun 1926 di lokasi bekas Stasiun Batavia Zuid. Selama pembangunan stasiun tersebut berlangsung , SS tetap menggunakan Stasiun Batavia (kemudian disebut "Batavia Noord") sebagai stasiun utama dengan merenovasi bangunan dan emplasemennya.
Penataan ulang lainnya juga dilakukan di daerah Bukit Duri. Stasiun Meester Cornelis dibongkar dan diubah menjadi depo lokomotif yang kemudian bernama Depo Bukit Duri. Sebagai gantinya, SS membangun Stasiun Manggarai yang kapasitasnya lebih besar pada tahun 1914. Dengan masa pembangunan selama 4 tahun, Stasiun Manggarai diresmikan pada tanggal 1 Mei 1918. Di stasiun ini juga terdapat  jalur penghubung ke Stasiun Meester Cornelis SS yang dibuka lebih awal pada bulan Maret 1917. Selain membangun Stasiun Manggarai, SS juga membangun stasiun-stasiun kecil di sepanjang jalur kereta api ini. Jalur Weltevreden–Manggarai juga dibuat ganda, meski awalnya SS tak berniat untuk menggandakan jalur tersebut.
Pada tahun 1917, Ir. P.A. Roelofsen mendapat tugas untuk melakukan penelitian mengenai sumber air yang dapat digunakan untuk pembangkit listrik. Hal ini berkaitan dengan pembangunan proyek jaringan kereta listrik di Batavia dan sekitarnya. Pada tahun 1919, mulai dibangun Pembangkit Listrik Tenaga Air (PLTA) di Cicacih, dan di Ciatan. Sesuai rencana, listrik disalurkan menuju gardu induk yang terletak di unit Buitenzorg, Depok, Meester Cornelis, dan Ancol. Pembangunan dapat diselesaikan pada tahun 1921, dan siap digunakan untuk elektrifikasi jalur kereta api Batavia–Buitenzorg. Tetapi akibat dari adanya krisis malaise di Eropa, Anggota Dewan Belanda memutuskan menunda pemberian anggaran untuk proyek elektrifikasi jalur kereta api Batavia–Buitenzorg. Proyek tersebut dapat terealisasi pada tanggal 1 Mei 1927 sebagai bagian dari elektrifikasi untuk rute yang disebut secara kolektif sebagai ceintur-baan ini. Namun hanya segmen Batavia–Manggarai dari lintas Batavia–Buitenzorg  saja yang dialiri listrik. Bahkan alih-alih meniatkan proyek elektrifikasi ke Buitenzorg, Menteri Urusan Jajahan justru pikir-pikir untuk mengalihkan elektrifikasi ini ke lintas yang lebih ramai dan sudah jalur ganda, yakni Meester Cornelis (Jatinegara)–Cikampek. Namun, keputusan untuk melistriki segmen Manggarai–Buintenzorg baru direalisasikan 3 tahun berikutnya, yakni rampung pada tanggal 1 Mei 1930.
Setelah Stasiun Sentral Batavia-Benedenstad dibuka pada tanggal 8 Oktober 1929, SS resmi menutup Stasiun Batavia. Per 1930, semua lintas sekitar Batavia sudah berupa jalur ganda.
Pada masa pendudukan Jepang di Hindia Belanda, jawatan yang dibentuk oleh pemerintahan pendudukan Jepang, Rikuyu Sokyoku, mengumumkan perubahan nama stasiun dan perhentian yang masih menggunakan nama Belanda (termasuk mengganti "Batavia" menjadi "Jakarta" dan "Buitenzorg" menjadi "Bogor"). Di lintas Batavia–Buitenzorg, nama perhentian yang diumumkan untuk diganti per 1 Juli 1942 antara lain:
Noordwijk menjadi Pintu Air
Dierentuin menjadi Kebun Binatang