Daftar amfibi Jepang
Ordo: Anura (katak)

Famili: Bufonidae
Genus: Bufo
Katak asiatik, Bufo gargarizans LC IUCN
Katak miyako, B. g. miyakonis (subspesies endemik) (MoE: NT)
Katak jepang, Bufo japonicus LC IUCN (endemik)
Katak sungai jepang, Bufo torrenticola LC IUCN (endemik)
Genus: Rhinella
Kodok tebu, Rhinella marina LC IUCN (pendatang)
Famili: Dicroglossidae
Genus: Fejervarya
Kodok tegalan, Fejervarya limnocharis LC IUCN
Katak rawa, Fejervarya kawamurai
Kodok tegalan sakashima, Fejervarya sakishimensis LC IUCN
Genus: Limnonectes
Katak Namie, Limnonectes namiyei EN IUCN (endemik)
Famili: Hylidae
Genus: Dryophytes
Katak pohon jepang, Dryophytes japonicus LC IUCN
Genus: Hyla
Katak pohon Hallowell, Hyla hallowellii LC IUCN (endemik)
Famili: Microhylidae
Genus: Microhyla
Katak mulut sempit okinawa [ja], Microhyla okinavensis LC IUCN (endemik)
Katak mulut sempit yaeyama, Microhyla kuramotoi LC IUCN (endemik)
Famili: Pipidae
Genus: Xenopus
Katak bercakar afrika, Xenopus laevis LC IUCN (pendatang)
Famili: Ranidae
Genus: Babina
Katak Holst, Babina holsti EN IUCN (endemik)
Katak otton, Babina subaspera EN IUCN (endemik)
Genus: Glandirana
Katak keriput jepang, Glandirana rugosa LC IUCN (endemik)
Katak keriput sado, Glandirana susurra EN IUCN (endemik)
Genus: Lithobates
Katak lembu amerika, Lithobates catesbeianus LC IUCN (pendatang)
Genus: Nidirana
Katak harpa yaeyama, Nidirana okinavana EN IUCN |(endemik)
Genus: Odorrana
Katak amami ōshima [ja], Odorrana splendida EN IUCN (endemik)
Katak berhidung ujung amami, Odorrana amamiensis EN IUCN (endemik)
Katak berhidung ujung besar, Odorrana supranarina EN IUCN (endemik)
Katak Ishikawa, Odorrana ishikawae EN IUCN (endemik)
Katak berhidung ujung ryukyu, Odorrana narina EN IUCN (endemik)
Katak berhidung ujung Utsunomiya, Odorrana utsunomiyaorum EN IUCN (endemik)
Genus: Pelophylax
Katak kolam bintik hitam, Pelophylax nigromaculatus NT IUCN
Katak kolam daruma, Pelophylax porosus LC IUCN
Katak kolam daruma nagoya, P. p. brevipodus (subspesies endemik) (MoE: EN)
Katak kolam daruma tokyo, P. p. porosus (subspesies endemik) (MoE: NT)
Genus: Rana
Katak Dybowski, Rana dybowskii LC IUCN
Katak coklat ezo, Rana pirica LC IUCN
Katak coklat jepang, Rana japonica LC IUCN (endemik)
Katak coklat montane, Rana ornativentris LC IUCN (endemik)
Katak coklat Neba Tago [ja], Rana neba LC IUCN (endemik)
Katak okinawa [fr], Rana ulma VU IUCN (endemik)
Katak coklat ryukyu, Rana kobai NT IUCN (endemik)
Katak coklat sungai, Rana sakuraii LC IUCN (endemik)
Katak coklat Tago, Rana tagoi LC IUCN (endemik)
Katak coklat Oki Tago, R. t. okiensis  (MoE: NT)
Katak coklat Yakushima Tago, R. t. yakushimensis  (MoE: NT)
Katak coklat tsushima, Rana tsushimensis NT IUCN (endemik)
Famili: Rhacophoridae
Genus: Buergeria
Katak kajika, Buergeria buergeri LC IUCN (endemik)
Katak kajika ryukyu, Buergeria japonica LC IUCN (endemik)
Katak kajika yaeyama, Buergeria choui LC IUCN
Genus: Polypedates
Katak-pohon bergaris, Polypedates leucomystax LC IUCN (pendatang)
Genus: Kurixalus
Katak pohon Eiffinger, Kurixalus eiffingeri LC IUCN
Genus: Zhangixalus
Katak pohon hijau amami, Zhangixalus amamiensis LC IUCN (endemik)
Katak pohon hijau hutan, Zhangixalus arboreus LC IUCN (endemik)
Katak pohon hijau okinawa, Zhangixalus viridis LC IUCN (endemik)
Katak pohon hijau Owston, Zhangixalus owstoni NT IUCN (endemik)
Katak pohon hijau Schlegel, Zhangixalus schlegelii LC IUCN (endemik)