Stasiun Kutoarjo
Bangunan dan tata letak

Stasiun Kutoarjo memiliki tujuh jalur kereta api. Pada awalnya jalur 2 merupakan sepur lurus. Setelah jalur ganda menuju Stasiun Yogyakarta pada segmen Kutoarjo–Wojo selesai pada tanggal 17 Agustus 2007, jalur 3 dijadikan sebagai sepur lurus jalur ganda arah Yogyakarta sekaligus sepur raya jalur tunggal dari dan ke arah Kroya, sedangkan jalur 2 dijadikan sebagai sepur lurus jalur ganda dari arah Yogyakarta sekaligus sebagai sepur badug panjang untuk langsiran rangkaian kereta api. Kemudian setelah jalur ganda menuju Stasiun Butuh dioperasikan per 30 November 2019, jalur 2 sepenuhnya dijadikan sebagai sepur lurus untuk arah Kroya, sedangkan jalur 3 sepenuhnya dijadikan sebagai sepur lurus hanya untuk arah Yogyakarta.
Di bagian dalam stasiun, tepatnya di dekat ruang kepala stasiun, terdapat prasasti peresmian jalur ganda segmen Kutoarjo–Yogyakarta yang dilaksanakan pada tanggal 22 Januari 2008, yang ditandatangani oleh Presiden RI saat itu, Susilo Bambang Yudhoyono.
Rel di jalur 4–6 dirancang tanpa menggunakan batu balast/kricak. Jalur 4 dan 5 digunakan untuk menampung KA yang diberangkatkan dari stasiun ini, sementara jalur 6 biasanya digunakan untuk menampung kereta luar dinas dan langsir. Ke arah timur dari jalur 1 terdapat percabangan jalur menuju Purworejo, tetapi jalur cabang tersebut kini telah dinonaktifkan dan pernah digunakan untuk menampung sejumlah gerbong barang yang sudah tidak terpakai.
| 0 | 1 | 2 | 3 | 4 |
| --- | --- | --- | --- | --- |
| P Lantai peron | Jalur 7 |  | Jalur parkir dan langsiran kereta api |  |
| P Lantai peron | Jalur 6 |  | Jalur parkir kereta api |  |
P Lantai peron: Peron pulau
| P Lantai peron | Jalur 5 |  | Jalur parkir kereta api |  |
P Lantai peron: Peron pulau
| P Lantai peron | Jalur 4 | ← |  Kedatangan dan keberangkatan kereta api antarkota | → |
P Lantai peron: Peron pulau, pintu terbuka di sebelah kiri kedatangan KA dari arah barat dan sebelah kanan kedatangan KA dari arah timur
| P Lantai peron | Jalur 3 | ← | Sepur lurus arah Yogyakarta |  |
| P Lantai peron | Jalur 3 | ← | Jalur berjalan langsung kereta api ke arah timur |  |
| P Lantai peron | Jalur 3 | ← |  Pemberhentian kereta api antarkota ke arah timur |  |
P Lantai peron: Peron pulau, pintu terbuka di sebelah kiri kedatangan KA dari arah barat
| P Lantai peron | Jalur 2 |  | Sepur lurus arah Cilacap | → |
| P Lantai peron | Jalur 2 |  | Jalur berjalan langsung kereta api ke arah barat | → |
| P Lantai peron | Jalur 2 |  |  Pemberhentian kereta api antarkota ke arah barat | → |
P Lantai peron: Peron pulau, pintu terbuka di sebelah kanan kedatangan KA dari arah timur
| P Lantai peron | Jalur 1 | ↔ | Sepur lurus dari dan ke arah Purworejo (nonaktif) |  |
| P Lantai peron | Jalur 1 | ↔ (Jenar) | P Commuter Line Prameks, dari dan tujuan Yogyakarta |  |
| P Lantai peron | Jalur 1 | ← |  Pemberhentian kereta api antarkota | → |
P Lantai peron: Peron sisi, pintu terbuka di sebelah kiri kedatangan KA dari arah barat dan sebelah kanan kedatangan KA dari arah timur
G: Bangunan utama stasiun
Bangunan stasiun ini kini sudah tidak asli, kecuali atap kanopi utama yang menaungi jalur 1–3 serta beberapa pintu dan tembok yang menghadap peron jalur 1. Stasiun ini diduga memiliki arsitektur yang mirip dengan Stasiun Purworejo. Hal ini karena Stasiun Kutoarjo memiliki arus penumpang yang sangat tinggi sehingga bangunan utama stasiun perlu dilakukan renovasi supaya mampu mengurangi kesemrawutan. Di sisi timur stasiun terdapat  sub depo lokomotif dan depo kereta yang dikhususkan untuk perawatan ringan sarana kereta. Di sisi selatan stasiun terdapat dua jalur simpan kereta yang akan/selesai dinas dan cuci kereta, serta jalur tersebut juga mengarah ke turntable.
Perubahan besar pada Stasiun Kutoarjo juga terjadi pada tahun 2024 meliputi proyek peninggian peron dan penambahan overcapping yang bertujuan untuk meningkatkan pelayanan kepada penumpang agar mudah naik turun dari kereta. Kemudian terdapat pembangunan instalasi air dan pemasangan mossel untuk pengisian bahan bakar lokomotif. Proyek ini juga dipersiapkan untuk angkutan Natal 2024 dan Tahun Baru 2025 serta diharapkan selesai pada Desember 2024.