James Mattis
Karier Marinir > Perang di Afganistan

Informasi lebih lanjut: Perang di Afganistan (2001–2021)
Jim Mattis memimpin Brigade Ekspedisi Marinir ke-1 sebagai komandan setelah dipromosikan menjadi brigadir jenderal. Sebagai komandan resimen inilah dia mendapatkan julukan dan tanda panggilnya, "CHAOS" terj. har. 'KEKACAUAN', singkatan dari "Colonel Has Another Outstanding Solution", yang pada awalnya terdengar aneh.
Selama perencanaan awal untuk Perang di Afganistan, Mattis memimpin Gugus Tugas 58 dalam operasi di bagian selatan negara itu yang dimulai pada November 2001, dan menjadi perwira Korps Marinir pertama yang memimpin Gugus Tugas Angkatan Laut dalam pertempuran. Menurut Mattis, tujuannya ketika tiba di Afganistan adalah untuk "memastikan bahwa musuh tidak merasa memiliki tempat berlindung yang aman, menghancurkan rasa aman mereka di Afganistan selatan, mengisolasi Kandahar dari jalur komunikasinya, dan bergerak melawan Kandahar."  Pada bulan Desember 2001, sebuah serangan udara yang dilakukan oleh sebuah pesawat pengebom B-52 secara tidak sengaja menarget sebuah posisi yang ditempati oleh pasukan operasi khusus Amerika Serikat dan anggota milisi Afganistan di Provinsi Uruzgan. Sejumlah personel terluka dalam insiden tersebut, tetapi Mattis berulang kali menolak untuk mengirim helikopter dari Kamp Rhino [en] di dekatnya untuk menyelamatkan mereka, dengan alasan keamanan operasional. Alih-alih, sebuah helikopter Angkatan Udara terbang dari Uzbekistan untuk mengangkut para prajurit ke pangkalan Korps Marinir di mana helikopter sudah tersedia tetapi tidak diizinkan untuk terbang. Kapten Jason Amerine menyalahkan penundaan yang disebabkan oleh keputusan Mattis yang menolak memerintahkan operasi penyelamatan atas kematian beberapa personelnya. Amerine menulis, "Setiap elemen di Afghanistan berusaha membantu kami kecuali unit sahabat terdekat, yang dikomandoi oleh Mattis," lebih lanjut dia juga menulis bahwa "Tidak ada yang dinilai dengan benar karena [Grup Pasukan Khusus ke-5] memilih untuk tidak meminta penyelidikan formal. Grup ke-5 ingin mengakhiri pemberitaan buruk yang terkait dengan friendly fire dan kelambanan dari Mattis hanya memperburuk keadaan, sehingga mereka mengubur keluhan saya yang penuh kemarahan dan berusaha untuk menutup mulut saya tentang semua yang terjadi pada hari itu." Kasus ini digunakan untuk menyerang Mattis saat dia dicalonkan sebagai menteri pertahanan pada tahun 2016.
Mattis menjelaskan bahwa ia diberi tahu lokasi Osama bin Laden pada bulan Desember 2001 dan membuat rencana untuk membunuhnya, namun rencana tersebut tidak pernah terlaksana.
Saat bertugas di Afganistan sebagai brigadir jenderal, Mattis dikenal sebagai perwira yang melibatkan anak buahnya dengan "kepemimpinan yang nyata." Seorang perwira Marinir, Nathaniel Fick [en], mengatakan bahwa dia menyaksikan Mattis berada di dalam lubang pertempuran berbicara dengan sersan dan kopral lance: "Tidak seorang pun akan mempertanyakan Mattis jika dia tidur selama delapan jam setiap malam di kamar pribadi, untuk dibangunkan setiap pagi oleh ajudan yang menyeterika seragam dan menghangatkan MRE-nya [en]. Tapi di sanalah dia, di tengah malam yang membeku, berada di garis depan bersama pasukan Marinirnya."