Daftar bandar udara tujuan Lion Air
Indonesia

Indonesia
Jawa
Bandung - Bandar Udara Internasional Husein Sastranegara (JT dan IW saja)
Banyuwangi - Bandar Udara Banyuwangi (ID saja)
Majalengka - Bandar Udara Internasional Kertajati (Hub) (Berhenti sementara)
Jakarta (Tangerang) - Bandar Udara Internasional Soekarno-Hatta (Penghubung utama) (JT, ID dan IU)
Jakarta - Bandar Udara Internasional Halim Perdanakusuma (ID dan IW saja)
Semarang - Bandar Udara Internasional Achmad Yani (JT, ID, dan IW)
Surakarta (Boyolali) - Bandar Udara Internasional Adi Soemarmo (JT, ID, IU, dan IW)
Surabaya (Sidoarjo) - Bandar Udara Internasional Juanda (Hub) (JT, ID, IU, dan IW)
Yogyakarta (Sleman) - Bandar Udara Internasional Adisutjipto (ID dan IW)
Yogyakarta (Kulon Progo) - Bandar Udara Internasional Yogyakarta (JT, ID dan IU)
Kalimantan
Samarinda - Bandar Udara Internasional APT Pranoto JT, ID IU IW
Balikpapan - Bandar Udara Internasional Sultan Aji Muhammad Sulaiman (Hub) (JT, ID, IU dan IW saja)
Banjarmasin - Bandar Udara Internasional Syamsuddin Noor (JT, ID, IU dan IW
Palangkaraya - Bandar Udara Tjilik Riwut (JT, ID, dan IW)
Pontianak - Bandar Udara Internasional Supadio (JT, ID, IU dan IW saja)
Tarakan - Bandar Udara Internasional Juwata (ID dan IW)
Nusa Tenggara
Bima - Bandar Udara Bima (IW)
Denpasar (Badung) - Bandar Udara Internasional Ngurah Rai (Hub) (JT, ID, IU, dan IW)
Kupang - Bandar Udara Internasional El Tari (JT, ID, dan IW)
Lombok-Praya (Lombok Tengah) - Bandar Udara Internasional Lombok (JT, ID, IU, dan IW)
Sumbawa Besar - Bandar Udara Sultan Muhammad Kaharuddin III (IW)
Maluku
Ambon - Bandar Udara Internasional Pattimura (JT, ID, dan IW)
Ternate - Bandar Udara Babullah (JT, ID, dan IW)
Tual - Bandar Udara Karel Sadsuitubun (JT DAN IW)
Tobelo - Bandar Udara Kuabang (IW)
Papua
Fakfak - Bandar Udara Fakfak (IW)
Jayapura (Sentani) - Bandar Udara Dortheys Hiyo Eluay (JT, ID, dan IW)
Kaimana - Bandar Udara Kaimana (IW)
Nabire - Bandar Udara Nabire (IW)
Sorong - Bandar Udara Sorong (JT, ID, dan IW)
Sulawesi
Gorontalo - Bandar Udara Jalaluddin (JT dan IW)
Kendari - Bandar Udara Haluoleo (JT, ID, dan IW)
Makassar - Bandar Udara Internasional Sultan Hasanuddin (Hub) (JT, ID, dan IW)
Manado - Bandar Udara Internasional Sam Ratulangi (Hub) (JT, ID, dan IW)
Palu - Bandar Udara Mutiara SIS Al-Jufrie (JT, ID, dan IW)
Tahuna - Bandar Udara Naha (IW)
Mamuju - Bandar Udara Tampa Padang(IW)
Kolaka - Bandar Udara Sangia Nibandera (IW)
Bau-bau - Bandar Udara Betoambari (IW)
Sumatra
Banda Aceh - Bandar Udara Internasional Sultan Iskandar Muda (JT, ID, dan IW)
Jambi - Bandar Udara Sultan Thaha Syaifuddin (JT, ID, IU, dan IW)
Batam - Bandar Udara Internasional Hang Nadim (Hub) (JT, ID, IU, dan IW)
Bengkulu - Bandar Udara Fatmawati Soekarno (JT, ID, IU, dan IW)
Medan (Deli Serdang) - Bandar Udara Internasional Kualanamu (Hub) (JT, ID, IU, dan IW)
Padang (Padang Pariaman) - Bandar Udara Internasional Minangkabau (Hub) (JT, ID, IU, dan IW)
Palembang - Bandar Udara Sultan Mahmud Badaruddin II (Hub) (JT, ID, IU, dan IW)
Pangkal Pinang - Bandar Udara Depati Amir (JT, ID, dan IW)
Bandar Lampung - Bandar Udara Internasional Radin Inten II (JT, ID, dan IW)
Pekanbaru - Bandar Udara Internasional Sultan Syarif Kasim II (Hub) (JT, ID, IU, dan IW)
Tanjungpandan - Bandar Udara Internasional H.A.S. Hanandjoeddin (JT, ID, IU ,dan IW)
Tanjungpinang - Bandar Udara Internasional Raja Haji Fisabilillah (JT, ID, dan IW)