Baabullah dari Ternate
Masa pemerintahan > Masa keemasan Ternate

Selepas kepergian Portugis, Sultan Baabullah mengambil alih São João Baptista dan memanfaatkannya sebagai benteng sekaligus istana kediamannya. Ia merenovasi serta memperkuat pertahanan benteng tersebut dan mengganti namanya menjadi Gammalamo. Di bawah perlindungan Baabullah, kapal-kapal dagang dari Melaka diperbolehkan singgah di Ternate setiap tahunnya, untuk memastikan bahwa arus niaga dengan kawasan sekitar serta Eropa tetap berlangsung dengan baik. Hanya saja, hak-hak istimewa kini ditiadakan, sehingga pedagang Barat diperlakukan serupa pedagang dari negeri lainnya dan mendapatkan pengawasan yang ketat. Sultan Baabullah bahkan mengeluarkan peraturan yang mengharuskan setiap orang Eropa yang singgah ke Ternate untuk melepaskan topi dan sepatu mereka, sebagai pengingat agar mereka tahu diri dan menjaga sikap.
Sultan Baabullah merawat dan merintis jejaring persekutuan dengan penguasa-penguasa dan negeri-negeri lain di Nusantara. Muslim Jawa dari negeri-negeri pasisir (pantai utara) Jawa menjadi sekutu utama Ternate. Beberapa misi dikirimkan kepada wilayah-wilayah yang diklaim oleh Ternate untuk menuntut kesetiaan mereka kepada kebijakan-kebijakan Sultan. Pada tahun 1580 Baabullah disebut memimpin sebuah ekspedisi pelayaran besar-besaran (hongi) yang mengunjungi sejumlah tempat di Sulawesi. Sang sultan sempat pula singgah ke Makassar dan bertemu dengan raja Gowa, Tunijalloʼ. Kedua penguasa ini mengikat perjanjian persekutuan. Kemudian, Baabullah mengajak Tunijalloʼ untuk masuk Islam, tetapi Tunijalloʼ menolak permintaan tersebut secara halus. Walaupun begitu, sebagai tanda pertemanan, Baabullah menawarkan untuk membantu renovasi Benteng Somba Opu di pantai timur Gowa. Setelah beranjak dari Gowa, armada Ternate menaklukkan wilayah Selayar di selatan Sulawesi.
Di bawah kepemimpinan Baabullah, Kesultanan Ternate menggapai masa jayanya. Kombinasi dari pengaruh sosiopolitik agama Islam, imbas dari keberadaan Portugis (yang sebelumnya menyuplai persenjataan serta mendorong penyeragaman pertanian cengkeh demi efisiensi), serta harga cengkeh yang semakin melonjak, memperkuat dan memperluas cengkeraman Ternate atas jalur perdagangan rempah. Pada awal masa pemerintahannya, Sultan mengirimkan armada untuk menaklukan Buru, Seram, dan sebagian wilayah Ambon. Pada ekspedisi tahun 1580 negeri-negeri di Sulawesi Utara juga ditaklukkan. Tradisi setempat menyebutkan bahwa Ternate menggabungkan strategi interferensi atas persaingan kekuasaan internal dan politik perkawinan untuk mendapatkan pengaruh. Raja Humonggilu dari Limboto, misalnya, meminta bantuan Ternate untuk mengalahkan saingannya, Raja Pongoliwu dari Gorontalo. Humonggilu lalu menikahi adik Baabullah, Jou Mumin. Sementara, saudari dari raja yang dikalahkan dibawa ke Ternate untuk dinikahkan dengan seorang bangsawan. Baabullah sendiri dsiebut-sebut menikahi seorang putri dari Teluk Tomini bernama Owutango, yang memiliki peran penting dalam penyebaran agama Islam di kawasan tersebut. Dalam ekspedisi yang sama, wilayah Banggai, Tobungku (keduanya di Sulawesi Timur), Tiworo (Sulawesi Tenggara) dan Buton juga jatuh ke dalam kuasa Sultan. Pengaruh Ternate bahkan mencapai Solor, yang menjadi gerbang bagi perdagangan cendana di Timor, serta Kepulauan Banda tempat penghasil pala.
Daftar wilayah jajahan Ternate yang disusun oleh sumber Spanyol pada sekitar tahun 1590 juga menyebut Mindanao, Kepulauan Papua (Raja Ampat) serta Bima dan Kore di Sumbawa, walaupun sepertinya wilayah-wilayah ini tidak terlalu terikat dengan Ternate. Meski kawasan-kawasan yang jauh dari Ternate hanya merupakan negara pembayar upeti yang lumayan merdeka, banyak pula wilayah yang diperintah oleh wakil (bergelar sangaji) yang ditunjuk langsung oleh Sultan. Karena luas wilayah kekuasaannya, Baabullah juga dijuluki sebagai "Penguasa 72 Pulau", sebagaimana dicatat oleh sejarawan dan ahli geografi Belanda François Valentijn (1724). Pada masa ini, Ternate merupakan negara terkuat dan termakmur di kawasan timur Nusantara. Menurut sumber-sumber Spanyol, Baabullah bahkan memiliki kekuatan untuk memanggil 2.000 kora-kora dan 133.300 tentara dari Sulawesi hingga Papua di bawah panjinya.