Stasiun Yogyakarta
Layanan kereta api > Antarkota

| Nama kereta api> Eksekutif | Kelas> Eksekutif | Relasi perjalanan> Eksekutif | Relasi perjalanan> Eksekutif | Keterangan> Eksekutif |
| --- | --- | --- | --- | --- |
| Taksaka | Luxury | Yogyakarta | Gambir | Via Purwokerto–Cirebon |
| Taksaka | Eksekutif | Yogyakarta | Gambir | Via Purwokerto–Cirebon |
| Argo Lawu | Luxury | Gambir | Solo Balapan | Via Cirebon–Purwokerto |
| Argo Lawu | Eksekutif | Gambir | Solo Balapan | Via Cirebon–Purwokerto |
| Argo Dwipangga | Luxury | Gambir | Solo Balapan | Via Cirebon–Purwokerto |
| Argo Dwipangga | Eksekutif | Gambir | Solo Balapan | Via Cirebon–Purwokerto |
| Manahan | Eksekutif | Gambir | Solo Balapan | Via Cirebon–Purwokerto |
| Argo Wilis | Panoramic | Bandung | Surabaya Gubeng | Via Tasikmalaya–Yogyakarta |
| Argo Wilis | Eksekutif | Bandung | Surabaya Gubeng | Via Tasikmalaya–Yogyakarta |
| Turangga | Panoramic | Bandung | Surabaya Gubeng | Via Tasikmalaya–Yogyakarta |
| Turangga | Eksekutif | Bandung | Surabaya Gubeng | Via Tasikmalaya–Yogyakarta |
| Argo Semeru | Compartment Suite | Gambir | Surabaya Gubeng | Via Cirebon–Yogyakarta |
| Argo Semeru | Eksekutif | Gambir | Surabaya Gubeng | Via Cirebon–Yogyakarta |
| Bima | Compartment Suite | Gambir | Surabaya Gubeng | Via Cirebon–Yogyakarta |
| Bima | Eksekutif | Gambir | Surabaya Gubeng | Via Cirebon–Yogyakarta |
| Gajayana | Luxury | Gambir | Malang | Via Cirebon–Yogyakarta |
| Gajayana | Eksekutif | Gambir | Malang | Via Cirebon–Yogyakarta |
Campuran
| Sancaka | Eksekutif | Yogyakarta | Surabaya Gubeng | Jadwal malam hanya beroperasi pada hari Jumat-Minggu dan hari libur nasional. |
| Sancaka | Ekonomi Premium | Yogyakarta | Surabaya Gubeng | Jadwal malam hanya beroperasi pada hari Jumat-Minggu dan hari libur nasional. |
| Fajar dan Senja Utama Yogyakarta | Eksekutif | Yogyakarta | Pasar Senen | Via Purwokerto–Cirebon |
| Fajar dan Senja Utama Yogyakarta | Ekonomi Premium | Yogyakarta | Pasar Senen | Via Purwokerto–Cirebon |
| Lodaya | Eksekutif | Bandung | Solo Balapan | Via Tasikmalaya–Kroya |
| Lodaya | Ekonomi | Bandung | Solo Balapan | Via Tasikmalaya–Kroya |
| Bogowonto | Eksekutif | Pasar Senen | Lempuyangan | Via Cirebon Prujakan–Purwokerto |
| Bogowonto | Ekonomi | Pasar Senen | Lempuyangan | Via Cirebon Prujakan–Purwokerto |
| Malioboro Ekspres | Eksekutif | Purwokerto | Malang | Via Yogyakarta–Blitar |
| Malioboro Ekspres | Ekonomi | Purwokerto | Malang | Via Yogyakarta–Blitar |
| Kertanegara | Eksekutif | Purwokerto | Malang | Via Yogyakarta–Blitar |
| Kertanegara | Ekonomi | Purwokerto | Malang | Via Yogyakarta–Blitar |
| Fajar dan Senja Utama Solo | Eksekutif | Pasar Senen | Solo Balapan | Via Cirebon–Purwokerto |
| Fajar dan Senja Utama Solo | Ekonomi | Pasar Senen | Solo Balapan | Via Cirebon–Purwokerto |
| Mataram | Eksekutif | Pasar Senen | Solo Balapan | Via Cirebon–Purwokerto |
| Mataram | Ekonomi | Pasar Senen | Solo Balapan | Via Cirebon–Purwokerto |
| Batavia | Eksekutif | Gambir | Solo Balapan | Via Cirebon–Purwokerto Hanya beroperasi pada akhir pekan dan hari libur nasional |
| Batavia | Ekonomi | Gambir | Solo Balapan | Via Cirebon–Purwokerto Hanya beroperasi pada akhir pekan dan hari libur nasional |
| Madiun Jaya | Eksekutif | Pasar Senen | Madiun | Via Cirebon–Yogyakarta |
| Madiun Jaya | Ekonomi | Pasar Senen | Madiun | Via Cirebon–Yogyakarta |
| Mutiara Selatan | Eksekutif | Bandung | Surabaya Gubeng | Via Tasikmalaya–Yogyakarta |
| Mutiara Selatan | Ekonomi Premium | Bandung | Surabaya Gubeng | Via Tasikmalaya–Yogyakarta |
| Bangunkarta | Eksekutif | Pasar Senen | Jombang | Via Cirebon–Yogyakarta |
| Bangunkarta | Ekonomi | Pasar Senen | Jombang | Via Cirebon–Yogyakarta |
| Malabar | Eksekutif | Bandung | Malang | Via Tasikmalaya–Yogyakarta |
| Malabar | Ekonomi Premium | Bandung | Malang | Via Tasikmalaya–Yogyakarta |
| Wijayakusuma | Eksekutif | Cilacap | Ketapang | Via Yogyakarta–Surabaya Gubeng |
| Wijayakusuma | Ekonomi Premium | Cilacap | Ketapang | Via Yogyakarta–Surabaya Gubeng |
| Ranggajati | Eksekutif | Cirebon | Jember | Via Purwokerto–Surabaya Gubeng |
| Ranggajati | Ekonomi | Cirebon | Jember | Via Purwokerto–Surabaya Gubeng |
| Nama kereta api> Campuran | Kelas> Campuran | Relasi perjalanan> Campuran | Relasi perjalanan> Campuran | Keterangan> Campuran |
| --- | --- | --- | --- | --- |
| Sancaka Utara | Eksekutif | Cilacap | Surabaya Pasarturi | Via Solo Balapan–Gambringan |
| Sancaka Utara | Ekonomi | Cilacap | Surabaya Pasarturi | Via Solo Balapan–Gambringan |