Wilayah sungai
Pembagian > 1989 - 2006

Berikut ini pembagian wilayah sungai di Indonesia yang ditetapkan pada tahun 1989 oleh Menteri Pekerjaan Umum dengan didasarkan pada pendekatan hidrologis, administrasi pemerintah, dan perencanaan saat itu:
| Kode WS | Wilayah Sungai | Jumlah Sungai | Lokasi Wilayah Sungai |
| --- | --- | --- | --- |
| 01.00 | Krueng Aceh | 20 | Aceh |
| 01.02 | Meureudu - Ureun | 10 | Aceh |
| 01.03 | Pase - Peusangan | 27 | Aceh |
| 01.04 | Jambu Aye | 17 | Aceh |
| 01.05 | Tamiyang - Langsa | 16 | Aceh |
| 01.06 | Woyla - Lambesi | 26 | Aceh |
| 01.07 | Singkulat - Tripa | 40 | Aceh |
| 01.08 | Singkil | 22 | Aceh - Sumatera Utara |
| 01.09 | Wampu - Besitang | 14 | Sumatera Utara |
| 01.10 | Belawan - Belumai - Ular | 17 | Sumatera Utara |
| 01.11 | Bahbolon | 5 | Sumatera Utara |
| 01.12 | Asahan | 2 | Sumatera Utara |
| 01.13 | Barumun - Kualuh | 4 | Sumatera Utara |
| 01.14 | Batang Gadis - Batang Toru | 60 | Sumatera Utara |
| 01. 15 | Rokan | 2 | Riau - Sumatera Barat |
| 01.16 | Siak | 13 | Riau - Sumatera Barat |
| 01.17 | Kampar | 8 | Riau - Sumatera Barat |
| 01.18 | Indragiri | 8 | Riau - Sumatera Barat |
| 01.19 | Silaut | 37 | Sumatera Barat |
| 01.20 | Anai - Sualang | 27 | Sumatera Barat |
| 01.21 | Batang Hari | 7 | Jambi - Sumatera Barat |
| 01.22 | Sugihan | 45 | Sumatera Selatan |
| 01.23 | Baturusa - Cerucut | 11 | Sumatera Selatan |
| 01.24 | Musi | 12 | Sumatera Selatan - Bengkulu |
| 01.25 | Mesuji - Tulang Bawang | 12 | Sumatera Selatan - Lampung |
| 01.26 | Seputih - Sekampung | 111 | Lampung |
| 01.27 | Semangko | 95 | Lampung |
| 01.28 | Kanal Alas - Talo | 35 | Bengkulu |
| 01.29 | Lais - Bintunan - Ketahun | 24 | Bengkulu |
| 01.30 | Ipuh - Teramang - Manjuto | 19 | Bengkulu |
| 02.01 | Ciujung - Ciliman |  | Jawa Barat |
| 02.02 | Cisadane - Ciliwung | 7 | DKI Jakarta - Jawa Barat |
| 02.03 | Cisadeg - Cikuningan | 91 | Jawa Barat |
| 02.04 | Citarum | 14 | Jawa Barat |
| 02.05 | Cimanuk | 29 | Jawa Barat - Jawa Tengah |
| 02.06 | Ciwulan | 46 | Jawa Barat |
| 02.07 | Citanduy | 7 | Jawa Barat - Jawa Tengah |
| 02.08 | Pemali - Comal | 32 | Jawa Tengah |
| 02.09 | Serayu | 17 | Jawa Tengah |
| 02.10 | Jratun - Seluna | 54 | Jawa Tengah |
| 02.11 | Progo - Opak - Oyo | 2 | Jawa Tengah - DI Yogyakarta |
| 02.12 | Bengawan Solo | 25 | Jawa Tengah - Jawa Timur |
| 02.13 | Kali Brantas | 3 | Jawa Timur |
| 02.14 | Pekalen - Sampean | 156 | Jawa Timur |
| 02.15 | Madura | 65 | Jawa Timur |
| 03.01 | Bali | 167 | Bali |
| 03.02 | Lombok |  | Nusa Tenggara Barat |
| 03.03 | Sumbawa | 350 | Nusa Tenggara Barat |
| 03.04 | Sumba | 114 | Nusa Tenggara Timur |
| 03.05 | Flores | 286 | Nusa Tenggara Timur |
| 03.06 | Timor Barat | 357 | Nusa Tenggara Timur |
| 03.07 | Timor Timur | 118 | Timor Timur |
| 04.01 | Cengal - Batulicin | 75 | Kalimantan Selatan |
| 04.02 | Barito | 11 | Kalimantan Selatan - Kalimantan Tengah |
| 04.03 | Kahayan | 8 | Kalimantan Tengah |
| 04.04 | Mendawai | 8 | Kalimantan Tengah |
| 04.05 | Sampit | 14 | Kalimantan Tengah |
| 04.06 | Pembuang | 40 | Kalimantan Tengah |
| 04.07 | Pawan | 57 | Kalimantan Barat |
| 04.08 | Kapuas | 44 | Kalimantan Barat |
| 04.09 | Mempawah - Sambas | 92 | Kalimantan Barat |
| 04.10 | Sesayap | 14 | Kalimantan Timur |
| 04.11 | Kayan | 17 | Kalimantan Timur |
| 04.12 | Berau - Kelai | 53 | Kalimantan Timur |
| 04.13 | Karangan | 32 | Kalimantan Timur |
| 04.14 | Mahakam | 49 | Kalimantan Timur |
| 05.01 | Ranowangko - Tondano | 72 | Sulawesi Utara |
| 05.02 | Limboto - Bone | 25 | Sulawesi Utara |
| 05.03 | Paguyaman - Randangan | 46 | Sulawesi Utara |
| 05.04 | Lambunu - Bual | 81 | Sulawesi Tengah |
| 05.05 | Parigi - Poso | 98 | Sulawesi Tengah |
| 05.06 | Bongka - Malik | 115 | Sulawesi Tengah |
| 05.07 | Lombok - Mantawa | 66 | Sulawesi Tengah |
| 05.08 | Laa - Tambalako | 82 | Sulawesi Tengah |
| 05.09 | Palu - Lariang | 147 | Sulawesi Tengah - Sulawesi Selatan |
| 05.10 | Lasolo - Sampara | 61 | Sulawesi Tenggara |
| 05.11 | Paleang - Roraya | 38 | Sulawesi Tenggara |
| 05.12 | Towari - Susua | 70 | Sulawesi Tenggara |
| 05.13 | Kaluku - Karama | 67 | Sulawesi Selatan |
| 05.14 | Pompengan - Larona | 69 | Sulawesi Selatan |
| 05.15 | Sadang | 39 | Sulawesi Selatan |
| 05.16 | Walanae - Cenranae | 93 | Sulawesi Selatan |
| 05.17 | Jeneberang | 81 | Sulawesi Selatan |
| 06.01 | Maluku Tenggara | 4 | Maluku |
| 06.02 | Maluku Tengah | 203 | Maluku |
| 06.03 | Maluku Utara | 99 | Maluku |
| 07.01 | Wasi - Kais - Omba | 43 | Irian Jaya |
| 07.02 | Mamberamo | 21 | Irian Jaya |
| 07.03 | Eilanden - Edera | 102 | Irian Jaya |
| 07.04 | Digul - Bikuma | 108 | Irian Jaya |
Wilayah sungai yang meliputi lebih dari satu provinsi dikelola langsung oleh pemerintah pusat, sementara pengelolaan wilayah sungai yang hanya meliputi satu provinsi diperbantukan kepada pemerintah provinsi setempat, kecuali Wilayah Sungai Kali Brantas yang dikelola sebagian oleh Perum Jasa Tirta dan Wilayah Sungai Citarum yang dikelola sebagian oleh Perum Otorita Jatiluhur.