Jutaan Suara Menentang Korupsi, Presiden Chen Harus Pergi
Akibat > Dakwaan terhadap istri Presiden Chen

Pada tanggal 3 November 2006, istri Chen, Wu Shu-chen dan tiga pejabat tingkat tinggi lainnya dari Kantor Presiden didakwa pemalsuan dan penggelapan dana pemerintah sebesar NTD14,8 juta (US$450.000) menggunakan dokumen-dokumen palsu. Karena perlindungan konstitusi terhadap presiden yang sedang memerintah, Chen tidak dapat dituntut sampai dia meninggalkan kantor, dan dia tidak didakwa, melainkan dituduh berkomplot dalam dakwaan istrinya.
Jaksa penuntut kasus itu mengindikasikan bahwa saat Chen meninggalkan kantor, kantornya akan memulai prosedur untuk melayangkan tuntutan terhadap Chen. Istrinya, Wu, menjadi Ibu Negara Republik Tiongkok pertama yang menghadapi tuntutan kejahatan sejak berdirinya republik ini di tahun 1911.
Dakwaan yang diajukan oleh jaksa penuntut menyatakan bahwa terdakwa memperoleh dana pemerintah yang dialokasikan untuk urusan asing rahasia, namun dari enam misi diplomatik rahasia yang seharusnya dijalankan, terdapat cukup bukti yang dihadirkan hanya dua yang dijalankan. Untuk keempat sisanya, disimpulkan satu tidak ada, dan dalam kasus tiga lainnya, faktur-faktur yang dihadirkan tidak berhubungan dengan misi rahasia.
Koalisi Pan-Biru, setelah menerima kabar ini, menuntut mosi pemanggilan lainnya kecuali Chen segera mundur. Partai kecil lain yang semula menyokong Chen, Serikat Solidaritas Taiwan, yang didirikan oleh mantan ketua KMT dan Presiden RT, Lee Teng-hui, mengatakan mereka mungkin akan mendukung tindakan pemanggilan berikutnya. Namun, SST mengatakan hanya akan mendukung mosi pemanggilan jika "bukti konkret berkaitan dengan korupsi dihadirkan." Jika pemanggilan itu lolos, akan diserahkan para pemberi suara untuk memutuskan nasib Chen dalam referendum di seluruh pulau.
Para pimpinan Partai Progresif Demokratik melakukan pertemuan pada hari Jumat untuk mendiskusikan tuduhan-tuduhan yang memberatkan itu. Pertemuan berakhir ketika para pimpinan partai menuntut Chen untuk menjelaskan tuduhan dalam waktu tiga hari. Telah lama terjadi pertengkaran di dalam PPD bahwa Chen telah menjadi kekurangan mereka dan mereka harus memanggilnya sebelum pemilihan presiden. Jika Chen mundur, dia akan menjadi presiden Taiwan pertama yang mundur dan wakil presiden Annette Lu yang blak-blakan kemungkinan akan mengambil alih.
Setelah jaksa penuntut mengumumkan kabar dakwaan, pimpinan kampanye Shih menyatakan unjuk rasa bahwa dakwaan itu merupakan titik tinggi historis di Taiwan dan kampanye sebulan penuh merupakan keberhasilan. Kemudian, Shih memimpin para pengunjuk rasa kembali ke Jalan Ketagalan untuk melakukan unjuk rasa duduk lagi.
Dalam sebuah konferensi pers tanggal 5 November 2006, Chen menyangkal dakwaan terhadap istrinya dan anggota kantor presidennya. Dia mengatakan bahwa kantor-kantor pemerintah Taiwan menyarankannya untuk menyiapkan tanda terima dengan cara seperti itu, dan bahwa setelah 6 tahun melakukannya, merupakan hal yang aneh mereka tidak pernah mengatakan sebagai ketidakbiasaan jika memang caranya benar. Dia berjanji bahwa semua uangnya sebenarnya diberikan pada misi-misi diplomatik dan tidak masuk ke dalam saku pribadi. Lebih jauh lagi, dia menyebutkan bahwa ketika dia mengambil alih kantor, dia pikir gajinya terlalu berlebihan sehingga memotong gajinya sendiri sampai setengahnya, dan pengurangannya lebih banyak daripada jumlah yang dituduhkan padanya digelapkan, jadi tak perlu baginya mengambil uang itu. Sebagai tambahan, dia mengatakan bahwa jika dakwaan terhadap istrinya dibuktikan dalam pengadilan seperti yang dituduhkan, pada saat itu dia akan mundur sebagai Presiden Republik Tiongkok.
Ibu Negara dikatakan pingsan saat konferensi pers berlangsung, dan kemudian dibawa ke Rumah Sakit NTU. Namun, banyak yang berselisih bahwa Wu benar-benar kehilangan kesadaran, ketika dia mencengkeram seorang pengawalnya setelah terjatuh.