Perang Salib Pertama
Pengepungan Antiokhia

Artikel utama: Pengepungan Antiokhia
Tentara salib, tanpa Baldwin dan Tancred, terus bergerak menuju Antiokhia, yang terletak di antara Konstantinopel dan Yerusalem. Sebagaimana dijelaskan oleh Stephen dari Blois dalam suratnya, Antiokhia adalah "sebuah kota yang sangat luas, diperkokoh dengan kekuatan yang luar biasa dan hampir tak tertembus". Gagasan untuk menyerang dan merebut kota tersebut mulai diragukan oleh bala tentara salib. Berharap bisa memaksa pemimpin kota menyerahkan diri, atau menemukan pengkhianat di dalam kota—taktik yang dahulunya menyebabkan Antiokhia jatuh ke tangan Bizantium dan kemudian Turki Seljuk—tentara salib memulai pengepungan pada tanggal 20 Oktober 1097. Antiokhia teramat besar sehingga tentara salib tidak memiliki cukup pasukan untuk mengepungnya secara penuh, alhasil kota tersebut tetap mendapatkan pasokan makanan. Pengepungan Antiokhia kelak disebut sebagai "pengepungan paling menarik dalam sejarah."
Pada bulan Januari, pengepungan telah berlangsung selama delapan bulan, yang amat menguras tenaga dan menyebabkan ratusan, atau bahkan ribuan tentara salib mati kelaparan. Adhemar mempercayai bahwa hal tersebut disebabkan oleh dosa-dosa yang telah mereka perbuat, maka dilakukanlah ibadat berpuasa, berdoa, bersedekah, dan kebaktian. Para perempuan diusir dari perkemahan. Banyak prajurit yang melarikan diri, termasuk Stephen dari Blois. Ketersediaan makanan lumayan menenangkan keadaan, sebab pasokan tiba secara teratur dari Kilikia dan Edessa lewat pelabuhan Latakia dan St Symeon yang baru direbut. Pada bulan Maret, armada kecil Inggris tiba membawa pasokan. Pasukan Franka memanfaatkan perpecahan di dunia Muslim dan menduga bahwa tentara salib adalah tentara bayaran Bizantium. Para sultan Seljuk, Duqaq dari Damaskus dan Ridwan dari Aleppo, mengirimkan tambahan pasukan bagi Turki pada bulan Desember dan Februari, dan gabungan pasukan tersebut kemungkinan akan berhasil memenangkan pertempuran.
Setelah mengalami kegagalan, Kerbogha membentuk koalisi pasukan yang berasal dari Suriah selatan, Irak utara, dan Anatolia dengan tekad memperluas kekuasaannya dari Suriah hingga ke Mediterania. Koalisi tersebut butuh waktu tiga minggu untuk merebut kembali Saruj. Bohemond berupaya membujuk para pemimpin lainnya bahwa jika Antiokhia berhasil direbut, ia boleh menguasainya sendirian, dan mengungkapkan bahwa seorang komandan Armenia di dalam tembok kota setuju untuk membiarkan tentara salib masuk. Stephen dari Blois telah meninggalkan pasukannya. Ia berpapasan dengan rombongan Kaisar Aleksius di Philomelium dan berpesan kepada kaisar bahwa para pejuang telah kalah dan meyakinkannya agar kembali ke Konstantinopel dan jangan melanjutkan perjalanan menuju Anatolia.
Firouz dari Armenia membantu Bohemond dan serombongan kecil pasukan memasuki kota pada tanggal 2 Juni. Ia membuka sebuah gerbang, dan pada saat terompet dibunyikan, penduduk Kristen di kota tersebut membuka gerbang lainnya dan tentara salib pun masuk dengan leluasa. Tentara salib mulai menjarah kota dan membantai sebagian besar penduduk Muslim dan Kristen Yunani, Suriah, dan Armenia yang kebingungan.
Pada tanggal 4 Juni, barisan depan pasukan Kerbogha yang berjumlah 40.000 prajurit tiba dan mengepung pasukan Franka. Dari tanggal 10 sampai 14 Juni, pasukan Kerbogha menggempur tembok kota mulai dari fajar hingga senja. Bohemond dan Adhemar menutup gerbang kota untuk mempertahankan diri serta mencegah para prajuritnya melarikan diri. Kerbogha lalu mengubah taktik dengan membuat bala tentara salib kelaparan. Perilaku para prajurit di dalam kota amat tidak beradab dan peluang kekalahan makin besar. Seorang prajurit Prancis bernama Peter Bartholomew mengaku bahwa Rasul Santo Andreas mendatanginya untuk menunjukkan lokasi Tombak Takdir yang digunakan untuk menusuk Yesus Kristus di kayu salib. Pengakuan tersebut seharusnya membangkitkan semangat tentara salib, tetapi cerita tersebut tidaklah benar, sebab terjadinya dua minggu berselang sebelum pertempuran terakhir untuk merebut Antiokhia. Pada tanggal 24 Juni, prajurit Franka mengusulkan untuk menyerahkan diri, tetapi ditolak. Pada pagi hari tanggal 28 Juni 1098, prajurit Franka keluar dari kota dalam empat rombongan pasukan untuk menghadapi musuh. Kerbogha membiarkan pasukan tersebut mempersiapkan diri dan hendak menghabisi mereka di tempat terbuka. Sayangnya, kedisiplinan pasukan Muslim tidak bertahan lama dan serangan tidak karuan mulai dilancarkan. Pasukan Muslim kewalahan mengalahkan pasukan Franka yang jumlahnya dua kali lebih sedikit. Mereka membuka Gerbang Jembatan dan melarikan diri dari medan pertempuran. Dengan sedikit korban, pasukan Muslim kocar-kacir dan Antiokhia berhasil direbut.
Stephen dari Blois tengah berada di Alexandretta dan belum mengetahui apa yang terjadi di Antiokhia. Ia menganggap sudah tidak ada harapan kemenangan bagi tentara salib dan bersiap meninggalkan Timur Tengah. Dalam perjalan pulang menuju Prancis, ia memperingatkan Aleksius mengenai situasi di Antiokhia. Para pemimpin pasukan di Antiokhia menganggap ketidakhadiran Aleksius di medan pertempuran adalah bentuk pengkhianatan, dan oleh sebab itu mereka berhak membatalkan sumpah kepadanya. Bohemond mengklaim Antiokhia sebagai miliknya, tetapi tidak semuanya setuju (terutama Raymond dari Toulouse), alhasil Perang Salib tertunda sampai akhir tahun selagi para bangsawan saling bertikai mengenai kepemilikan wilayah. Tatkala membahas masa-masa tersebut, para sejarawan berpendapat bahwa bangsa Franka dari Prancis utara, Provençal dari Prancis selatan, dan Normandia dari Italia selatan menganggap diri mereka sebagai bangsa yang terpisah, sehingga memicu perseteruan sebab masing-masingnya menganggap bahwa bangsa mereka lebih cakap dari yang lainnya. Sejarawan lainnya berpendapat bahwa selain disebabkan oleh perseteruan antar bangsa, ambisi pribadi di kalangan para pemimpin tentara salib juga bisa disalahkan sebagai penyebabnya.
Sementara itu, wabah penyakit merebak, yang menewaskan banyak prajurit, termasuk legatus Adhemar, yang wafat pada tanggal 1 Agustus. Jumlah kuda juga jauh berkurang dari sebelumnya, dan yang lebih buruk lagi, para petani Muslim di Antiokhia menolak memberikan makanan kepada tentara salib. Pada bulan Desember setelah Pengepungan Ma'arrat al-Numan, sejumlah sejarawan mengungkapkan bahwa telah terjadi kanibalisme pertama di kalangan tentara salib, meskipun informasi tersebut tidak muncul dalam satu pun catatan sejarah Muslim kontemporer. Pada saat bersamaan, para kesatria dan pasukan jelata semakin resah dan mengancam akan melanjutkan perjalanan ke Yerusalem tanpa para pemimpin yang masih berseteru. Akhirnya, pada awal 1099, perjalanan dilanjutkan setelah Bohemond dinyatakan sebagai Pangeran Antiokhia pertama.