Protozoa
Sejarah

Kata “protozoa” diciptakan pada tahun 1818 oleh ahli zoologi Georg August Goldfuss, yang artinya hewan primitif atau asli. Goldfuss menciptakan Protozoa sebagai kelas yang menurutnya terkandung hewan paling sederhana. Awalnya, kelompok tersebut tidak mencakup hanya mikroorganisme bersel tunggal namun juga beberapa hewan multiseluler rendah, seperti rotifer, karang, spons, ubur-ubur, bryozoa, dan cacing polychaete. Istilah Protozoa dibentuk dari bahasa Yunani yaitu πρῶτος (prôtos) yang artinya pertama dan ζῶα (zôa), jamak dari ζῶον (zôon) yang artinya hewan. Penggunaan Protozoa sebagai taksa formal telah didukung oleh beberapa peneliti, umumnya karena istilah tersebut menyiratkan kekerabatan dengan hewan (Metazoa) dan mendukung pemisahan antara organisme “mirip hewan” dari organisme “mirip tumbuhan”.
Pada 1848, sebagai hasil dari kemajuan dalam teori sel yang dipelopori oleh Theodor Schwann dan Matthias Schleiden, ahli anatomi dan zoologi C. T. von Siebold mengusulkan bahwa tubuh protozoa seperti siliata dan amoeba tersusun dari sel tunggal, mirip dengan yang dimiliki jaringan multiseluler penyusun tumbuhan dan hewan. Von Siebold mendefinisikan ulang Protozoa untuk memasukkan hanya bentuk-bentuk uniseluler, dengan mengesampingkan semua metazoa (hewan). Pada saat yang sama, ia mengangkat kelompok tersebut ke tingkat filum yang mengandung dua kelas besar mikroorganisme: Infusoria (umumnya siliata dan ganggang berflagel) dan Rhizopoda (organisme amoeboid). Definisi Protozoa sebagai filum atau sub-kerajaan yang terdiri dari “hewan uniseluler” diadopsi oleh ahli zoologi Otto Bütschli - dirayakan pada usia seratus tahun sebagai “arsitek protozoologi” - dan istilah ini mulai digunakan secara luas.
Sebagai filum di bawah Animalia, Protozoa berakar kuat dalam klasifikasi kehidupan “dua kerajaan” yang lama, yang menurutnya semua makhluk hidup diklasifikasikan sebagai hewan atau tumbuhan.  Selama skema ini tetap dominan, protozoa dipahami sebagai hewan dan dipelajari di departemen zoologi, sedangkan mikroorganisme fotosintetik dan fungi mikroskopis - yang disebut Protophyta - dimasukkan pada tanaman dan dipelajari di departemen Botani.
Kritik dari sistem ini diawali pada paruh kedua abad ke-19, dengan kesadaran bahwa banyak organisme memenuhi kriteria untuk dimasukkan dalam tanaman dan juga hewan. Contohnya, ganggang Euglena dan Dinobryon memiliki kloroplas untuk fotosintesis m namun dapat memakanan materi organik dan dapat motil. Pada tahun 1860, John Hogg menentang penggunaan “protozoa”, dengan alasan bahwa “naturalis berbeda pendapat - dan mungkin beberapa akan terus demikian - apakah banyak dari organisme atau makhluk hidup ini adalah hewan atau tumbuhan”. Sebagai alternatif, dia mengusulkan kerajaan baru yang disebut Primigenum, yang terdiri dari protozoa dan ganggang uniseluler (Rhodophyta), yang dia gabungkan menjadi satu dengan nama “Protoctista”. Dalam konsepsi Hogg, kerajaan hewan dan tumbuhan disamakan dengan dua “piramida” besar yang bercampur di basis mereka di kerajaan Primigenum.
Enam tahun kemudian, Ernst Haeckel juga mengusulkan kerjaan kehidupan ketiga, yang dinamakan Protista. Pada awalnya, Haeckel memasukkan beberapa organisme multiseluler di kerajaan ini, tetapi dalam penelitian selanjutnya, ia membatasi Protista pada organisme bersel tunggal, atau koloni sederhana yang sel-sel individualnya tidak berdiferensiasi menjadi berbagai jenis jaringan.
Terlepas dari usulan ini, Protozoa muncul sebagai penempatan taksonomi yang disukai untuk mikroorganisme heterotrof seperti amoeba dan siliata, dan tetap demikian selama lebih dari satu abad. Namun, dalam perjalanan abad ke-20, sistem “dua kerajaan” lama mulai melemah, dengan tumbuhnya kesadaran bahwa jamur tidak termasuk dalam tumbuhan dan bahwa sebagian besar protozoa uniseluler tidak lebih dekat hubungannya dengan hewan daripada dengan tumbuhan. Pada pertengahan abad, beberapa ahli biologi seperti Herbert Copeland, Robert H. Whittaker dan Lynn Margulis, menganjurkan penggunaan kembali Protista usulan Haeckel atau Protoctista usulan Hogg sebagai kelompok eukariotik tingkat kerajaan, bersama tumbuhan, hewan, dan jamur. Berbagai sistem multi-kerajaan diusulkan, dan kerajaan Protista dan Protoctista yang digunakan dalam teks dan kurikulum biologi.
Sementara banyak ahli taksonomi telah meninggalkan Protozoa sebagai kelompok tingkat tinggi, Thomas Cavalier-Smith mempertahankannya sebagai kerajaan dalam berbagai klasifikasi yang dia usulkan. Pada tahun 2015, Protozoa Cavalier-Smith mengecualikan beberapa kelompok besar organisme yang secara tradisional ditempatkan di antara protozoa, termasuk siliata, dinoflagellata, foraminifera (semua anggota supergrup SAR). Dalam bentuknya saat ini, kerajaan Protozoa adalah kelompok parafiletik yang mencakup nenek moyang yang sama dan sebagian besar keturunannya, tetapi mengecualikan dua klade penting yang bercabang di dalamnya: hewan dan jamur.
Sejak protozoa, sebagaimana didefinisikan secara tradisional, tidak dapat lagi dianggap sebagai “hewan primitif”, istilah “protist”, “Protista” atau “Protoctista” terkadang lebih disukai. Pada tahun 2005, anggota Society of Protozoologist memilih untuk mengubah namanya menjadi International Society of Protistologist.
Flagellata
Ciliata