Hanyutan genetik
Kemacetan populasi

Kemacetan (bottleneck) populasi terjadi ketika suatu populasi tiba-tiba berkurang ukurannya, menjadi lebih kecil secara signifikan, karena peristiwa lingkungan yang acak. Selama kemacetan populasi yang sebenarnya, peluang bertahan hidup untuk setiap individu dalam populasi sepenuhnya acak dan tidak dipengaruhi oleh keunggulan genetik tertentu. Kemacetan ini dapat menyebabkan pergeseran signifikan dalam frekuensi alel, yang sama sekali tidak terkait dengan seleksi alam.
Konsekuensi dari kemacetan populasi dapat bertahan bahkan ketika hal itu terjadi hanya sekali, seperti bencana alam. Kasus menarik yang menggambarkan dampak dari bottleneck adalah kejadian buta warna sel batang (achromatopsia) yang relatif tinggi di antara individu-individu di atol Pingelap di Mikronesia. Setelah terjadi bottleneck, perkawinan sedarah menjadi lebih umum, yang memperkuat dampak negatif dari mutasi resesif yang berbahaya, sebuah fenomena yang dikenal sebagai depresi perkawinan sedarah. Mutasi yang paling parah dari mutasi ini menghadapi tekanan seleksi, yang menyebabkan hilangnya alel lain yang secara genetis terkait dengannya, sebuah proses yang disebut sebagai seleksi latar belakang. Untuk mutasi resesif yang berbahaya, seleksi ini dapat diintensifkan karena adanya hambatan, sebuah proses yang disebut pembersihan genetik. Hal ini mengakibatkan berkurangnya keanekaragaman genetik. Selain itu, penurunan ukuran populasi yang berkepanjangan meningkatkan kemungkinan fluktuasi alel di masa depan yang disebabkan oleh hanyutan genetik.
Sebuah populasi dapat mengalami penurunan keragaman genetik yang signifikan akibat peristiwa bottleneck, dan bahkan adaptasi yang menguntungkan pun dapat hilang secara permanen. Berkurangnya variasi dalam populasi yang masih hidup membuatnya lebih rentan terhadap tekanan seleksi baru seperti penyakit, perubahan iklim, atau pergeseran sumber makanan, karena kemampuan untuk beradaptasi terhadap perubahan lingkungan bergantung pada memiliki keragaman genetik yang cukup agar seleksi alam dapat berjalan secara efektif.
Ada banyak contoh kemacetan populasi dalam sejarah baru-baru ini. Sebagai contoh, sebelum kedatangan bangsa Eropa, padang rumput di Amerika Utara merupakan rumah bagi jutaan ayam padang rumput yang lebih besar. Namun, jumlah mereka menyusut drastis di Illinois, turun dari sekitar 100 juta ekor pada tahun 1900 menjadi sekitar 50 ekor pada tahun 1990-an. Penurunan ini terutama disebabkan oleh perburuan dan perusakan habitat, yang mengakibatkan hilangnya sebagian besar keanekaragaman genetik spesies ini. Analisis genetik yang membandingkan burung-burung dari pertengahan abad ke-20 dengan burung-burung di tahun 1990-an menunjukkan penurunan variasi genetik yang signifikan hanya dalam beberapa dekade. Saat ini, ayam padang rumput besar menghadapi tantangan dalam hal keberhasilan reproduksi. Contoh lain dari kemacetan yang disebabkan oleh perburuan berlebihan terjadi pada anjing laut gajah utara selama abad ke-19. Pengurangan keragaman genetik pada populasi ini dapat diamati dengan membandingkannya dengan anjing laut gajah selatan, yang tidak mengalami perburuan agresif pada tingkat yang sama.
Namun demikian, perlu dicatat bahwa dalam beberapa kasus, hilangnya genetik yang disebabkan oleh kemacetan dan hanyutan genetik sebenarnya dapat meningkatkan kebugaran suatu organisme, seperti yang terlihat pada Ehrlichia.