Pembantaian Hari Santo Bartolomeus
Pembantaian > Provinsi-provinsi

Artikel utama: Pembantaian Hari Santo Bartolomeus di provinsi-provinsi
Meskipun Charles telah mengirimkan perintah kepada para gubernur provinsinya pada tanggal 24 Agustus untuk mencegah kekerasan dan mempertahankan ketentuan-ketentuan dari maklumat tahun 1570, sejak bulan Agustus hingga Oktober, pembantaian serupa terhadap kaum Huguenot terjadi di dua belas kota lainnya: Toulouse, Bordeaux, Lyon, Bourges, Rouen,
Orléans, Meaux, Angers, La Charité, Saumur, Gaillac and Troyes. Di sebagian besar dari mereka, pembantaian terjadi segera setelah berita pembantaian Paris tiba, tetapi di beberapa tempat ada jeda waktu lebih dari satu bulan. Menurut Mack P. Holt: "Kedua belas kota di mana pembantaian provinsial terjadi memiliki satu kesamaan yang mencolok; semuanya adalah kota dengan mayoritas Katolik di mana pernah ada minoritas Protestan yang 'signifikan' .... Semuanya juga pernah mengalami perpecahan agama yang serius... selama tiga perang saudara yang pertama... Selain itu, tujuh dari mereka memiliki pengalaman yang sama... [mereka] sebenarnya telah diambil alih oleh minoritas Protestan selama perang saudara pertama..."
Dalam beberapa kasus, pihak Katolik di kota percaya bahwa mereka telah menerima perintah dari raja untuk memulai pembantaian, beberapa disampaikan oleh pengunjung kota, dan dalam kasus-kasus lain tampaknya berasal dari bangsawan setempat atau utusannya. Tampaknya tidak mungkin ada perintah seperti itu yang datang dari raja, meskipun faksi Guise mungkin menginginkan pembantaian tersebut.
Rupanya surat-surat asli dari Adipati Anjou, adik raja, memang mendesak pembantaian atas nama raja. Di Nantes, walikota untungnya memegang surat-suratnya tanpa mempublikasikannya sampai seminggu kemudian ketika perintah yang berlawanan dari raja tiba. Di beberapa kota, pembantaian dipimpin oleh massa, sementara pemerintah kota berusaha menekan mereka, dan di kota-kota lain, kelompok-kelompok kecil tentara dan pejabat mulai mengumpulkan orang-orang Protestan dengan sedikit keterlibatan massa. Di Bordeaux, khotbah yang menghasut pada tanggal 29 September dari seorang Yesuit, Edmond Auger, mendukung pembantaian yang akan terjadi beberapa hari kemudian.
Di kota-kota yang terdampak, kehilangan yang dialami oleh komunitas Huguenot setelah pembantaian secara numerik jauh lebih besar daripada mereka yang terbunuh. Pada minggu-minggu berikutnya, terjadi perpindahan agama secara besar-besaran menjadi Katolik, tampaknya sebagai tanggapan atas suasana yang mengancam bagi kaum Huguenot di kota-kota ini. Di Rouen, di mana beberapa ratus orang terbunuh, komunitas Huguenot menyusut dari 16.500 menjadi kurang dari 3.000 orang, terutama sebagai akibat dari perpindahan agama dan emigrasi ke kota atau negara yang lebih aman. Beberapa kota yang tidak terkena dampak kekerasan mengalami penurunan tajam dalam populasi Huguenot mereka. Konon, komunitas Huguenot mewakili sebanyak 10% populasi Prancis pada malam pembantaian Hari Santo Bartolomeus, menurun menjadi 7-8% pada akhir abad ke-16, dan semakin menurun setelah penganiayaan berat dimulai lagi pada masa pemerintahan Louis XIV, yang berpuncak pada Pencabutan Maklumat Nantes.
Segera setelah itu kedua belah pihak bersiap untuk perang saudara keempat, yang dimulai sebelum akhir tahun.