Asal-usul anjing domestik
Penyebaran dari serigala > Tempat divergensi genetik > Dua asal-usul

Anjing menunjukkan garis keturunan kuno dan modern. Silsilah purba muncul paling banyak di Asia tetapi terdapat juga di Eropa karena pada Era Victoria anjing modern berkembang biak menggunakan sedikit garis silsilah kuno. Semua populasi anjing (berkembang biak, baik di desa maupun alam liar) menunjukkan beberapa bukti pencampuran genetik antara anjing modern dan purba. Beberapa populasi anjing purba yang pernah menduduki Eropa dan Dunia Baru sudah tidak ada lagi. Ini menyiratkan bahwa beberapa populasi anjing purba sepenuhnya tergantikan dan yang lain, dicampur dalam jangka waktu yang lama. Populasi anjing Eropa telah mengalami pergantian ekstensif selama 15.000 tahun terakhir yang telah menghapus ciri khas genomik anjing Eropa awal, warisan genetik dari trah modern telah menjadi kabur karena pencampuran tersebut, dan ada kemungkinan hasil domestikasi di masa lalu telah punah atau sebagian besar telah digantikan oleh populasi anjing yang lebih modern.
Siberian husky dan trah utara sebagian dari keturunan mereka (1,4-27,3%) mirip serigala Taimyr, yang menunjukkan kemungkinan lebih dari satu peristiwa domestikasi.
Pada tahun 2016, sebuah studi membandingkan DNA mitokondria dan Pengurutan seluruh genom dari panel anjing modern di seluruh dunia, urutan mDNA dari 59 spesimen anjing Eropa kuno berumur 14.000-3.000 tyl, dan urutan genom nuklir dari spesimen anjing yang ditemukan di kuburan Neolitikum Akhir di Newgrange, Irlandia dan penanggalan radiokarbon pada 4.800 tyl. Sebuah analisis genetik menunjukkan anjing Newgrange tersebut berkelamin jantan, tidak memiliki varian genetik yang terkait dengan panjang atau warna bulu modern, tidak mampu memproses pati seefisien anjing modern tetapi lebih efisien daripada serigala, dan menunjukkan keturunan dari suatu populasi serigala yang tidak dapat ditemukan pada anjing lain atau serigala hari ini. Karena klasifikasi taksonomi dari "anjing proto" anjing Paleolitik sebagai anjing atau serigala tetap kontroversial, mereka dikeluarkan dari penelitian. Pohon filogenetika yang dihasilkan dari sekuens mDNA menemukan pembagian yang dalam antara Anjing serigala Sarloos dan semua anjing lain, yang menunjukkan bahwa trah baru-baru ini berasal dari Gembala Jerman dan serigala abu-abu yang tertahan. Pembagian terbesar berikutnya adalah antara anjing-anjing Asia timur dan Eurasia barat (Eropa dan Timur Tengah) yang terjadi antara 14.000-6.400 tyl, dengan anjing Newgrange mengelompok dengan anjing-anjing Eurasia barat.
Sekuens mDNA anjing Newgrange dan Eropa kuno sebagian besar dapat ditempatkan ke haplogroup mDNA C and D tetapi daftar anjing Eropa modern sebagian besar dapat ditempatkan ke haplogroup mDNA A dan B, yang mengindikasikan pergantian anjing di masa lalu dari tempat selain Eropa. Karena tanggal perpisahan ini lebih tua dari anjing Newgrange, ini menunjukkan bahwa penggantian itu hanya sebagian. Analisis menunjukkan bahwa sebagian besar anjing Eropa modern telah mengalami hambatan populasi (pengurangan) yang dapat menjadi indikator perjalanannya. Catatan arkeologis menunjukkan anjing tetap berhubungan lebih dari 15.000 tyl di Eurasia barat, lebih dari 12.500 tyl di Eurasia timur, tetapi tidak ada yang lebih tua dari 8.000 tyl di Asia Tengah. Studi ini mengusulkan bahwa anjing mungkin telah didomestikasi secara terpisah di Eurasia timur dan barat dari dua populasi serigala yang secara genetis berbeda dan sekarang telah punah. Anjing-anjing Eurasia Timur kemudian pindah dengan orang-orang yang bermigrasi ke Eropa Barat antara 14.000-6.400 tyl di mana mereka sebagian menggantikan anjing-anjing Eropa. Dua peristiwa domestikasi di Eurasia barat dan Eurasia timur baru-baru ini ditemukan untuk babi domestik.
Hipotesisnya adalah bahwa dua populasi serigala yang secara genetik berbeda, dan mungkin punah, didomestikasi secara mandiri di Eurasia timur dan barat untuk menghasilkan anjing paleolitik. Anjing-anjing Eurasia timur kemudian menyebar ke barat bersama manusia, mencapai Eropa barat 6.400–14.000 tahun yang lalu di mana mereka sebagian menggantikan anjing-anjing paleolitik barat. Domestikasi tunggal diperkirakan suatu kebetulan, namun domestikasi ganda di berbagai belahan dunia tidak mungkin terjadi secara acak dan ini menunjukkan bahwa faktor-faktor eksternal - pendorong lingkungan - mungkin telah memaksa serigala untuk bekerja sama dengan manusia untuk bertahan hidup. Mungkin saja serigala mengambil keuntungan dari sumber daya yang dimiliki manusia, atau manusia mungkin telah memperkenalkan pada serigala di daerah dimana mereka sebelumnya tidak hidup.
Segera setelah perbedaan ini, populasi anjing melebihi jumlah populasi serigala, dan kemudian populasi anjing mengalami pengurangan populasi menjadi jauh lebih rendah.