Klasifikasi biologis
Era Linnaeus dan era modern > Klasifikasi Linnaeus

Carolus Linnaeus dianggap sebagai bapak taksonomi modern karena mencetuskan perubahan besar dalam taksonomi melalui buku-bukunya, Systema Naturae edisi pertama pada 1735, Species Plantarum pada 1753, dan Systema Naturae edisi ke-10 pada 1758 (volume 1) dan 1759 (volume 2). Judul lengkap Systema Naturae sendiri yaitu Systema naturæ per regna tria naturæ, secundum classes, ordines, genera, species, cum characteribus, differentiis, synonymis, locis atau Sistem alam melalui tiga kerajaan alam, menurut kelas, ordo, genus, dan spesies, dengan karakteristik, perbedaan, sinonim, tempat. Linnaeus mengelompokkan alam menjadi kerajaan hewan (regnum animale) dan kerajaan tumbuhan (regnum vegetabile), serta kerajaan mineral (regnum lapideum) berupa benda mati. Klasifikasi yang dibuat Linnaeus terdiri atas lima peringkat: kerajaan, kelas, ordo, genus, dan spesies. Systema Naturae sendiri hanya berisi sekitar 10.000 organisme, kurang lebih 6.000 tumbuhan dan 4.236 hewan.
Kontribusi terbesar Linnaeus adalah menciptakan sistem penamaan dan penggolongan yang lebih sistematis dan konsisten bagi tumbuhan dan hewan, yaitu penggunaan tata nama binomial. Menurut aturan ini, semua makhluk hidup diberi nama baku yang terdiri atas dua kata. Kata pertama diambil dari nama genus (marga) sedangkan kata kedua diambil dari nama spesies (jenis). Bahasa yang digunakan adalah bahasa Latin atau bahasa lain yang dilatinkan. Meskipun sistem ini lebih dahulu diperkenalkan oleh dua bersaudara Gaspard Bauhin dan Johann Bauhin melalui buku mereka Pinax theatri botanici (1596) dan Historia plantarum universalis (1650–1651, diterbitkan setelah Johann Bauhin wafat), tetapi Linnaeus yang berhasil mengembangkannya lebih lanjut dan memublikasikannya kepada masyarakat luas. Akibat popularitas dan jumlah spesimen baru yang dikirim kepadanya dari seluruh dunia, Linnaeus terus menerbitkan edisi baru yang terus berkembang. Systema Naturae pun berkembang dari sebelas halaman yang sangat besar pada edisi pertama (1735) menjadi 2.400 halaman pada edisi ke-12 (1766–1768). Tabel berikut ini menggambarkan perkembangan sistem klasifikasi yang diajukan sejak era Linnaeus (1735) hingga Thomas Cavalier-Smith (2015).
| Linnaeus 1735 | Haeckel 1866 | Chatton 1925 | Copeland 1938 | Whittaker 1969 | Woese et al>  1990 | Cavalier-Smith 1998 | Cavalier-Smith 2015 |
| --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- |
| 2 kerajaan | 3 kerajaan | 2 imperium | 4 kerajaan | 5 kerajaan | 3 domain | 2 imperium, 6 kerajaan | 2 imperium, 7 kerajaan |
| (belum dikenal) | Protista | Prokaryota | Monera | Monera | Bacteria | Bacteria | Bacteria |
| (belum dikenal) | Protista | Prokaryota | Monera | Monera | Archaea | Bacteria | Archaea |
| (belum dikenal) | Protista | Eukaryota | Protoctista | Protista | Eucarya | Protozoa | Protozoa |
| (belum dikenal) | Protista | Eukaryota | Protoctista | Protista | Eucarya | Chromista | Chromista |
| Vegetabilia | Plantae | Eukaryota | Plantae | Plantae | Eucarya | Plantae | Plantae |
| Vegetabilia | Plantae | Eukaryota | Plantae | Fungi | Eucarya | Fungi | Fungi |
| Animalia | Animalia | Eukaryota | Animalia | Animalia | Eucarya | Animalia | Animalia |