Josef Mengele
Auschwitz > Eksperimen manusia

Lihat pula: Eksperimen manusia Nazi
Mengele menggunakan Auschwitz sebagai kesempatan untuk melanjutkan studi antropologi dan penelitiannya terhadap keturunan, menggunakan tahanan dalam eksperimen manusia. Prosedur medis yang ia lakukan tidak menunjukkan adanya pertimbangan akan kesehatan, keamanan, atau penderitaan fisik dan batin dari para korban. Ia secara khusus tertarik kepada kembar identik, seseorang dengan heterokromia iridum (mata dengan dua warna), orang kerdil, dan seseorang dengan ketidaknormalan fisik. Izin diberikan oleh Deutsche Forschungsgemeinschaft (Yayasan Penelitian Jerman), atas permintaan dari von Verschuer, yang menerima laporan rutin dan spesimen dari Mengele. Izin yang diberikan termasuk pembuatan laboraturium patologi yang berada di Krematorium II di Auschwitz II-Birkenau. Dr. Miklós Nyiszli, seorang ahli patologi yang juga seorang Yahudi-Hungaria dibawa ke Auschwitz pada 29 Mei 1944, melakukan pembedahan dan menyiapkan spesimen untuk laboratorium ini. Percobaan saudara kembar ini adalah bagian dari tujuan untuk membuktikan supremasi keturunan atas lingkungan dan memperkuat premis Nazi yaitu superioritas Ras Arya.
Subyek penelitian Mengele diberi makanan yang lebih baik dari tahanan yang lain, dan tidak dikenakan eksekusi di kamar gas untuk sementara waktu. Ia membuat taman kanak-kanak untuk anak-anak yang menjadi subyek penelitiannya, seperti sekolah anak yang sudah ada di kamp Rumania. Fasilitas ini menyediakan makanan yang lebih baik dan kondisi hidup yang lebih layak dari area kamp yang lain, dan juga terdapat taman bermain anak. Saat mengunjungi subyeknya, ia memperkenalkan diri sebagai "Paman Mengele" dan memberi mereka permen, bersamaan dengan ia jugalah yang bertanggung jawab atas kematian yang belum diketahui jumlah pastinya terhadap anak-anak yang ia bunuh lewat suntikan mati, tembakan, pukulan dan beberapa metode mematikannya. Pada 1986, Lifton dalam bukunya menyebut Mengele adalah seseorang yang sadistik, tidak memiliki empati dan seorang antisemit yang ekstrim, mempercayai bahwa bangsa Yahudi harus dibinasakan seluruhnya sebagai ras yang rendah dan berbahaya. Rolf Mengele kemudian mengklaim ayahnya tidak menunjukkan penyesalan terhadap apa yang ia lakukan saat perang.
Seorang mantan tahanan yang juga dokter berpendapat mengenai Mengele:
Ia mampu berlaku baik terhadap anak-anak, membuat mereka menyukainya, membawakan mereka permen, memikirkan detil kecil dalam kehidupan sehari-hari mereka, dan melakukan sesuatu yang akan membuat kita kagum ... Namun selanjutnya, ... krematorium berasap, dan anak anak ini esok harinya atau dalam setengah jam kemudian, ia akan mengirimnya kesana. Yah, disinilah anomali terjadi.
Saudara kembar ini menjalani pemeriksaan mingguan untuk mengukur bagian-bagian fisik mereka. Hal ini dilakukan oleh Mengele sendiri ataupun salah satu asistennya. Eksperimen yang ia lakukan termasuk amputasi bagian tubuh, menginfeksi mereka dengan tifus atau penyakit lainnya, dan mentransfusikan darah satu sama lain. Banyak dari korbannya meninggal saat prosedur dilakukan, dan yang masih hidup terkadang  dibunuh dan dibedah ketika Mengele tidak memerlukannya lagi. Nyiszli teringat pada satu kesempatan Mengele sendiri membunuh 14 pasang saudara kembar dalam satu malam dengan menyuntik jantung mereka dengan kloroform. Jika satu pasang saudara kembar sudah mati, ia akan membunuh yang lain untuk mendapatkan data perbandingan untuk laporan pasca-kematian untuk tujuan penelitian.
Eksperimen mata Mengele termasuk percobaan mengubah warna mata dengan menyuntik bahan kimia ke mata subyek hidup, dan ia juga membunuh seseorang dengan heterokromatik sehingga matanya bisa diambil dan dikirim ke Berlin untuk diteliti. Eksperimennya terhadap orang kerdil atau orang dengan fisik yang abnormal dilakukan dengan mengukur bagian fisik, mengambil darah, mengambil gigi yang sehat dan pemberian perlakuan dengan obat tertentu atau dengan sinar-x. Beberapa dari korbannya dikirim ke kamar gas setelah dua minggu dan tengkorak mereka akan dibawa ke Berlin untuk analisis lebih lanjut. Mengele mencari wanita hamil, dimana ia bisa melakukan eksperimen sebelum mengirim mereka ke kamar gas. Seorang saksi bernama Vera Alexander menggambarkan bahwa Mengele menjahit sepasang saudara kembar dalam percobaan membuat kembar siam; dua anak ini lalu meninggal karena gangren setelah beberapa hari menderita.