Daftar episode BoBoiBoy
Ringkasan seri > Musim kedua (2012-2013)

Musim kedua BoBoiBoy mulai disiarkan di TV3 pada bulan Mei 2012. Sebanyak 13 episode dengan masing-masing berdurasi 22 menit ditayangkan pada musim ini. Di musim ini pula, karakter Fang mulai dihadirkan di hampir setiap episode setelah diperkenalkan perdana di akhir musim pertama.
| #  | Judul  | Waktu siaran pertama  |  |
| --- | --- | --- | --- |
| 1 | "Episode 1" | 27 Mei 2012 |  |
 Prolog : Di pesawat luar angkasa yang misterius, Bago Go menawarkan SampahBot yang dijual oleh Probe. Alien yang memiliki pesawat tersebut rencananya ingin beli untuk sekadar koleksi barang antik saja. Alien tersebut akan terlihat jelas di episode kesepuluh. BoBoiBoy yang kembali ke Pulau Rintis menjadi murid baru di SD Pulau Rintis. Seluruh temannya kaget akan kedatangannya.  Di sekolah barunya, Gopal berpesan kepada BoBoiBoy supaya jangan melewati sebuah rumah berhantu di kota ketika pergi ke sekolah. Walau demikian, BoBoiBoy mengabaikan pesan Gopal dan memberanikan diri untuk memasuki perkarangan rumah usang itu. Lantas, sebuah misteri muncul di balik rumah ini.
| 2 | "Episode 2" | 3 Juni 2012 |  |
 Di Tok Aba's Kokotiam, Ayah Gopal berjam-jam menceritakan kepada BoBoiBoy dan Tok Aba tentang rumah berhantu itu. Hal itu membuat BoBoiBoy semakin penasaran untuk berkunjung rumah itu, dan juga mengajak Gopal untuk ikut ke sana. Di kesempatan yang sama, Probe juga mengajak Adu Du pergi ke sana untuk memburu hantu.  Ternyata, BoBoiBoy dan Gopal saling bertemu dengan Adu Du dan Probe. Adu Du dan Probe sempat akan saling berkelahi setelah pertemuan tersebut. Akan tetapi, perkelahian mereka dicegat oleh Fang, teman sekelas BoBoiBoy yang juga murid baru SD Pulau Rintis, yang sudah lama cemburu dengan BoBoiBoy karena menurutnya Fang kalah populer dari BoBoiBoy. Fang memperlihatkan kekuatan kegelapan yang menandingi ketiga elemen kekuatan milik BoBoiBoy. Salah satunya adalah kekuatan Harimau Bayang yang sukses mengusir Adu Du dan Probe dari rumah berhantu itu.
| 3 | "Episode 3" | 10 Juni 2012 |  |
 Papa Zola yang mengajar Kelas Pendidikan Jasmani menantang BoBoiBoy dan Fang untuk berlomba membawa telur dalam sendok mengitari lapangan sebagai cara untuk mendisiplinkan mereka karena menganggap olahraga tersebut "kekanak-kanakan" dan "tidak menantang". Mereka berdua bersaing sengit dalam balapan, bahkan sampai harus menggunakan kekuatan super mereka. Akan tetapi, perlombaan tersebut berakhir dengan keputusan yang tidak diduga dan menimbulkan rasa tidak puas hati Fang.  Setelah mendengar penjelasan Fang mengapa ia begitu benci pada BoBoiBoy, Papa Zola merencanakan sebuah pertandingan sepak bola antara BoBoiBoy dan Fang yang akan dilaksanakan seminggu setelahnya.
| 4 | "Episode 4" | 24 Juni 2012 |  |
 Seperti yang dijanjikan seminggu lalu, BoBoiBoy dan kawan-kawan (Gopal, Yaya, Ying dan Iwan) berhadapan dengan Fang (dengan anggota Adu Du, Probe dan dua robot lain) dalam pertandingan sepak bola lima lawan lima. Awalnya, Papa Zola sebagai wasit bersikeras agar pertandingan tersebut berjalan tanpa main kasar dan mengeluarkan kekuatan masing-masing individu. Sayangnya peraturan tersebut dilanggar karena sang wasit pingsan dihantam sepakan bola yang sangat kuat oleh Yaya. Tim Fang mengambil kesempatan dengan bermain kotor dan menggunakan kekuatan yang menyebabkan Tim Boboiboy terpaksa menggunakan kekuatannya. Mereka hampir kalah saat skor sama kuat 2-2, namun Iwan yang saat itu tepat di depan gawang Fang membuat Tim Boboiboy menang. Akhirnya, Papa siuman dan memberi sanksi pada Fang, Probe dan Adu Du (walaupun Probe dan Adu Du tidak menjadi murid sekolah tersebut) karena membuat gawang sekolah terbakar.
| 5 | "Episode 5" | 26 Agustus 2012 |  |
 Ochobot membangunkan BoBoiBoy dengan memasukkan setengah bungkus biskuit Yaya ke dalam mulutnya. BoBoiBoy sangat kesal dengan perbuatan Ochobot. Namun, hal tersebut tidak membuat BoBoiBoy malas saat menyiapkan kedai Tok Aba di pagi buta sebelum berangkat ke sekolah. Kemudian, pelanggan setia kedai Tok Aba yang ternyata selalu datang ke kedai saat kedai dibuka jam 5.30 pagi, Gopal, datang ke kedai tersebut. Sementara itu di Markas Kotak, Adu Du mempunyai sebuah ide saat sudip elektrik milik Probe menepuk habis seekor lalat yang berada di dalam markas.  Boboiboy dan Gopal mencari tahu bagaimana Fang mendapatkan kekuatannya, mengapa Ochobot pingsan setiap kali dia melihat muka Fang, dan mengapa dia membeli biskuit Yaya setiap hari. Sebaliknya, Boboiboy, Gopal dan Fang diserang oleh Kucing Sewel Pak Senin Koboi sebab mereka melalui lorongnya sebagai jalan pintas ke sekolah. Oleh itu, mereka terpaksa masuk ke sekolah melalui ruang guru karena pagar sekolah dijaga oleh Yaya. Mereka berhasil masuk tanpa didenda karena lewat ke sekolah, akan tetapi mereka tetap didenda karena melewati ruang guru, salah satu ruang terlarang di sekolah. Ketika mereka melaksanakan sanksi yang diberikan Yaya, mereka telah ditembak oleh Probe dengan pistol Pengecil. Mujurnya, Probe lupa untuk menghantam mereka dengan sudip. Boboiboy, Gopal dan Fang berada di halaman sekolah dalam ukuran kecil seperti lalat.
| 6 | "Episode 6" | 9 September 2012 |  |
 Dalam ukuran kecil akibat Pistol Pengecil Adu Du, BoBoiBoy, Gopal dan Fang bersegera pergi ke kedai Tok Aba untuk segera menjemput Ying dan Yaya supaya dapat menghajar Adu Du dan Probe sehingga mereka bertiga kembali normal. Akan tetapi, mereka harus melalui Lorong Pak Senin Koboi yang dikuasai oleh kucing sewel. Fang merencanakan agar mereka membawa biskuit Yaya untuk menumpaskan kucing itu. Probe Rencana untuk mengantikan film dan lagu untuk Adudu. Selepas itu, Yaya dan Ying membawa mereka ke Markas Kotak Adu Du untuk mencari penawar dan melawan Adu Du dan Probe.
| 7 | "Episode 7" | 9 Desember 2012 |  |
 BoBoiBoy bertanya kepada Fang mengapa Ochobot pingsan setiap kali dia melihat wajahnya, tetapi Fang tidak dapat menjawab karena lupa. Di Markas Kotak, Adu Du yang teringat dengan Pistol Emosi X yang sempat digunakan di musim pertama merencanakan agar pistol ini kembali bekerja dengan nama Pistol Emosi Y sehingga BoBoiBoy dan kawan-kawan (termasuk Fang) dapat berubah emosinya.
| 8 | "Episode 8" | 16 Desember 2012 |  |
 BoBoiBoy, Ying, Yaya, Gopal dan Fang yang berubah emosi akibat Pistol Emosi Y yang ditembakkan Adu Du beramai-ramai ke Markas Kotak untuk mencari penawar dengan bertemankan Ochobot. Di dalam markas, mereka berlima berhadapan dengan bilik seribu satu perangkap yang dipasang oleh Adu Du dan Probe, sementara Ochobot dan Fang berangsur-angsur kembali mengingat bagaimana Fang memperoleh kekuatannya dan juga mengapa Ochobot pingsan setiap kali dia melihat wajah Fang. Setelah itu, kesan jahat Fang pada Ochobot akhirnya pudar.
| 9 | "Episode 9" | 23 Desember 2012 |  |
 BoBoiBoy dan kawan-kawan akhirnya mengambil penawar dari Adu Du dan menewaskan musuhnya dengan kombinasi tiga kuasa. BoBoiBoy turut meminta maaf pada Fang atas salah sangkanya selama ini. Untuk kesekiankalinya, karena kecewa atas kekalahannya, Adu Du dan Probe merancang untuk merampas gelombang siaran televisi dan membuat program televisi bernama MKHIPI atau "Markas Kotak Hari Ini Pagi Ini". Program ini berisikan wawancara dengan niat untuk memfitnah BoBoiBoy atas segala kesalahan yang dibuat oleh pemuda itu padanya, termasuk juga menjemput Papa. Akan tetapi, lantaran acara ini disiarkan pagi buta, acara ini tidak begitu sukses.
| 10 | "Episode 10" | 30 Desember 2012 |  |
 Adu Du terkejut mendengar kabar bahwa Ejo Jo tahu tentang misi di Bumi. Kemudian, komputer dalam pesawat luar angkasa Ejo Jo menceritakan bagaimana Adu Du, yang diceritakan sebagai makhluk kelas rendah di Planet Ata Ta Tiga, bertemu Probe (bernama asli P.R.O.B.E.) yang ternyata adalah robot tempur gagal hasil ilmuwan planet tersebut. Probe semakin memperburuk keadaan ketika ia menukarkan pesawat luar angkasa milik Adu Du dengan "Mesin Pemotong Rumput S8000" alias seekor kambing. Adu Du dan Probe terancam karena misi mereka di Bumi terancam diambil alih oleh Ejo Jo.
| 11 | "Episode 11" | 10 Maret 2013 |  |
 Cikgu Papa telah mengumumkan bahwa ada ujian matematika setelah sekolah. Tiba-tiba ujian matematika diadakan di kelas. Gopal sangat kelimpungan karena ia belum belajar. Komputer yang mengetahui hal tersebut melalui Probe menyuruh Adu Du menjadi murid baru di kelas 5 Jujur. Walaupun Boboiboy dan yang lain sudah mengecam Adu Du karena jelas-jelas ia adalah musuh BoBoiBoy, Cikgu Papa tetap mengatakan bahwa Adu Du telah diterima sebagai murid baru dalam kelas tersebut. Dalam ujian matematika, keanehan terjadi ketika cuaca di seluruh ruangan kelas diutak-atik oleh Probe yang menggunakan mesin pengubah cuaca. Walau cuaca berganti-ganti, Cikgu Papa bersikeras tetap melanjutkan ujian. Suatu ketika di saat kelas bergoyang hebat, Adu Du mengira bahwa gempa termasuk dalam bagian mesin. Lantas, Probe berkata bahwa pesawat angkasa milik Ejo Jo telah tiba di Bumi dan menimpa gedung SD BoBoiBoy.
| 12 | "Episode 12" | 17 Maret 2013 |  |
 Boboiboy dengan penerima kekuatan dari bola kuasa yang lain berhadapan dengan Ejo Jo untuk pertama kalinya. Ejo Jo kemudian melepas robot tempur bernama Perisai Tempur Angkasa I, disingkat P.E.T.A.I., untuk menyerang Probe dan menghancurkannya. Adu Du, pemilik Probe, lantas dihabisi kemudian oleh Ejo Jo. Tidak tega melihat Probe dan Adu Du dihabisi, Boboiboy dan kawan-kawan mencoba melawan robot Petai itu, namun perisai robot itu terlalu luat untuk mereka. Kemudian, Yaya, Ying, Gopal, Papa Zola serta murid-murid kelas 5 Jujur kecuali Boboiboy, Fang dan Ochobot akhirnya ditangkap oleh Ejo Jo. Boboiboy, Fang dan Ochobot akhirnya ditinggalkan oleh mereka.
| 13 | "Episode 13" | 24 Maret 2013 |  |
 Rupanya, Adu Du telah diselamatkan oleh Boboiboy, Fang, Ochobot, dan Tok Aba setelah kalah telak dari Ejo Jo. Boboiboy yang telah berpecah tiga dalam bentuk tahap kedua bersusah-payah mengalahkan Ejo Jo dalam pertarungan dengan menggunakan Gerakan Kombo Boboiboy namun tidak kunjung berhasil menghancurkan perisai yang melindungi robot tersebut. Kemudian Fang  mengeluarkan Naga Bayang sehingga berhail menghancurkan lawannya itu, tetapi pingsan akibat menggunakan terlalu banyak tenaga. Akhirnya, Ejo Jo memasangnya perisainya sendiri untuk bertempur melawan Boboiboy. Sementara itu, Adu Du mengeluarkan senjata Robot Pemusnah Mukalakus yang sudah lama tersimpan di markasnya untuk melawan balik Ejo Jo.