Perang Saudara Afganistan (1989-1992)
Pertempuran Jalalabad > Akibat

Bertentangan dengan harapan Amerika Serikat dan Pakistan, pertempuran ini membuktikan bahwa Tentara Afganistan dapat berperang tanpa bantuan Soviet, dan sangat meningkatkan kepercayaan para pendukung pemerintah. Sebaliknya, moral mujahidin yang terlibat dalam serangan itu merosot dan banyak komandan lokal Hekmatyar dan Sayyaf mengakhiri gencatan senjata dengan pemerintah. Dalam kata-kata Brigadir Jenderal Mohammed Yousaf, seorang perwira ISI, "jihad tidak pernah pulih dari Jalalabad". Secara khusus tentu saja rencana Pakistan untuk mempromosikan Hekmatyar juga dirugikan. Baik pemerintah Pakistan dan Amerika Serikat frustrasi dengan hasilnya. Akibat kegagalan ini, Jenderal Hamid Gul langsung dipecat oleh Perdana Menteri Pakistan Benazir Bhutto, dan digantikan Jenderal Shamsur Rahman Kallu sebagai Direktur Jenderal ISI. Kallu mengejar kebijakan dukungan yang lebih klasik kepada gerilyawan Afganistan. Dalam hal ini dia memotong penghalang yang telah ditempatkan pendahulunya, Akhtar Abdur Rahman dan Gul antara mujahidin dan dinas rahasia Amerika Serikat, yang untuk pertama kalinya memiliki akses langsung ke mujahidin. Mantan mata-mata Pakistan, seperti Gul, berargumen bahwa ini memberi Amerika Serikat kesempatan untuk melemahkan kepentingan Pakistan serta menjalin perselisihan di antara para mujahidin (sesuatu yang tentu saja dilakukan oleh Pakistan untuk mempromosikan Hekmatyar).
Memang, dengan akses langsung Amerika ke mujahidin – khususnya utusan Peter Tomsen, yang sikapnya terhadap warga Afganistan yang merdeka adalah arogan dan bisa dibilang bermusuhan karena dia menganggap mereka ekstremis berbahaya tanpa pengawasan langsung AS – setiap segmen persatuan mujahidin hancur. Para pemimpin mujahidin independen tradisional, seperti Yunus Khalis, Jalaluddin Haqqani, yang telah mencoba menyatukan saingan mujahidin Massoud dan Hekmatyar, sekarang bergerak lebih dekat ke Pakistan karena kecurigaan mereka terhadap niat Amerika Serikat. Lainnya, seperti Abdul Haq dan Massoud, malah menyukai Amerika Serikat karena hubungan mereka yang tegang dengan Pakistan. Sementara Abdul Haq tetap memusuhi pemerintah komunis dan milisinya, Massoud terus membuat aliansi kontroversial dengan mantan tokoh komunis. Massoud mengklaim bahwa ini adalah upaya untuk menyatukan Afghanistan, tetapi musuh-musuhnya seperti Hekmatyar menyerangnya untuk ini. Dorongan Hekmatyar juga didukung oleh Pakistan, sehingga pada tahun 1990 ada sepasang kapak bersaing yang pasti (jika longgar) – satu dipromosikan oleh Pakistan dan termasuk Hekmatyar, tetapi juga para pemimpin mujahidin lainnya seperti Khalis, Jalaluddin Haqqani dan para pemimpin mujahidin lainnya yang tidak simpatik kepada Hekmatyar – dan yang lainnya dipromosikan oleh Amerika Serikat dan dipimpin oleh Massoud, tetapi juga termasuk para pemimpin lain seperti Abdul Haq yang tidak simpatik kepada Massoud.
Pasukan pemerintah lebih lanjut membuktikan nilai mereka pada bulan April 1990, selama serangan terhadap kompleks berbenteng di Paghman. Setelah pemboman berat dan serangan yang berlangsung hingga akhir Juni, Angkatan Darat Afganistan, yang dipelopori oleh milisi Dostum, mampu membersihkan kubu mujahidin.