Kontroversi ras Mesir kuno
Kontroversi masa kini > Tutankhamun

Beberapa akademisi, termasuk Diop, menyatakan bahwa Tutankhamun berkulit hitam dan memprotes upaya rekonstruksi fitur wajah Tutankhamun (seperti yang tercetak di sampul majalah National Geographic) yang menggambarkan bahwa Raja "terlalu putih". Di antara para penulis, termasuk sejarawan dan sosiolog Chancellor Williams, juga berpendapat bahwa orang tua, kakek dan nenek Raja Tutankhamun adalah orang yang [berkulit] hitam.
Dengan menggunakan CT-Scan tengkorak, para seniman forensik dan antropolog fisik yang berasal dari Mesir, Prancis dan Amerika Serikat secara independen membuat patung Tutankhamun. Seorang antropolog biologi dan Kepala tim Amerika, Susan Anton, mengutarakan bahwa ras tengkorak tersebut "sulit untuk diketahui". Ia juga menyatakan bahwa bentuk rongga tengkorak menandakan tengkorak tersebut sebagai orang Afrika, sedangkan bukaan hidung menunjukkan lubang hidung sempit, yang secara umum dianggap sebagai ciri orang Eropa. Dengan demikian, tengkorak tersebut disimpulkan sebagai orang Afrika Utara. Para pakar lain berpendapat bahwa baik bentuk tengkorak maupun bukaan hidung, bukanlah indikasi ras yang dapat diandalkan.
Meskipun teknologi modern dapat merekonstruksi struktur wajah, berdasarkan data CT dari mumi Tutankhamun dengan tingkat akurasi yang tinggi, untuk menentukan warna kulit dan warna matanya tidaklah mungkin dapat dilakukan. Oleh karenanya, menurut seniman yang membuat model tanah liat kemudian diberi pewarnaan, hal tersebut didasarkan pada "warna rata-rata orang Mesir modern".
Wakil presiden eksekutif National Geographic untuk misi program, Terry Garcia, mengatakan dalam menanggapi beberapa orang yang menyanggah tentang rekonstruksi Tutankhamun:
Variabel terbesar adalah warna kulit. Orang-orang Afrika Utara yang kita kenal saat ini, memiliki beragam warna kulit, dari terang hingga [berkulit] gelap. Dalam hal ini, kami memilih warna kulit sedang dan kami berkata, 'ini di tengah-tengah'. Sesungguhnya, kita tidak akan pernah tahu dengan kepastian 100%, apa warna kulitnya atau warna matanya ...Mungkin di masa yang akan datang, orang-orang akan sampai pada kesimpulan yang berbeda.
Pada September 2007, ketika didesak oleh para aktivis Amerika, Sekretaris Jenderal Dewan Tertinggi Purbakala Mesir, Zahi Hawass menyatakan "Tutankhamun tidak berkulit hitam."
Tahun 2002, Discovery Channel melakukan rekonstruksi wajah Tutankhamun berdasarkan CT scan dari bentuk tengkoraknya. Kemudian dalam sebuah publikasi majalah Ancient Egypt terbitan November 2007, Zahi Hawass menegaskan bahwa tidak ada rekonstruksi-rekontruksi wajah yang menyerupai Raja Tut dan ia berpendapat tentang gambaran mengenai Raja Tut yang paling akurat adalah topeng dari makamnya.
Sebuah perusahaan genomika iGENEA meluncurkan proyek DNA Tutankhamun pada tahun 2011, berdasarkan penanda genetik yang terindikasi telah diambil dari Discovery Channel, khusus tentang Firaun. Berdasarkan data dari mikrosatelit, iGENEA menunjukkan bahwa Tutankhamun termasuk ke dalam haplogroup R1b1a2, yakni klad paternal yang paling umum di antara laki-laki di Eropa Barat. Carsten Pusch dan Albert Zink, sebagai pemimpin unit yang bertindak atas ekstraksi DNA Tutankhamun, menegur iGENEA karena tidak melakukan komunikasi terlebih dahulu dengan mereka, sebelum membangun proyek tersebut. Setelah memeriksa hasil rekaman tersebut, mereka juga menyimpulkan bahwa metodologi yang digunakan iGENEA tidaklah ilmiah, sehingga Putsch menyebut mereka "tidaklah mungkin".