Emilia Pérez
Alur Cerita

Rita Mora Castro, seorang pengacara tidak sukses di Kota Meksiko, memimpin tim pembela untuk kasus pembunuhan yang melibatkan istri seorang sosok besar media. Melawan hati nuraninya sendiri, Rita tetap melanjutkan argumennya bahwa wanita tersebut meninggal akibat bunuh diri ("El alegato"). Setelah memenangkan kasus tersebut, Rita menerima telepon anonim dengan penawaran yang misterius namun sangat menarik. Bercermin pada keadaan dirinya yang kurang beruntung, ia setuju untuk melakukan sebuah pertemuan ("Todo y nada"). Kliennya, yang ternyata adalah raja kartel Juan "Manitas" Del Monte, menyampaikan keinginannya untuk menjalani tindakan pembedahan penentuan ulang gender secara sembunyi-sembunyi dan memulai hidup yang baru dan autentik ("El encuentro") sebagai seorang wanita.
Setelah berkonsultasi dengan dokter-dokter di Bangkok ("La vaginoplastia") dan Tel Aviv ("Lady"), Rita menemukan seorang ahli bedah yang bersedia untuk melakukan tindakan pembedahan setelah mendengarkan ingatan ulang Manitas mengenai disforia gender yang ia alami di masa kecil ("Deseo"). Setelah prosedur pembedahan, istri Manita, Jessi, dan anak-anak mereka pindah ke Swiss. Jessi memohon untuk pindah ke Amerika Serikat agar dapat bersama dengan saudara perempuannya, namun ia diberitahu bahwa Swiss dipilih demi keselamatan mereka. Rita dibayar dengan jumlah yang sangat besar untuk pelayanan-pelayanan yang ia berikan. Sementara itu, Manitas memalsukan kematiannya dan memulai hidup baru sebagai Emilia Pérez.
Empat tahun kemudian di London, Rita menemukan Emilia, yang ingin bersatu dengan anak-anaknya ("Por casualidad"). Rita mengatur agar Jessi dan anak-anaknya untuk kembali ke Kota Meksiko untuk tinggal bersama Emilia, memperkenalkan Emilia sebagai saudara sepupu jauh dan kaya raya dari Manitas yang telah bersedia secara sukarela untuk membantu membesarkan anak-anak tersebut. Jessi tidak mengenali Emilia dan menolak perjanjian tersebut, dan pada akhirnya setuju untuk kembali ke Meksiko hanya untuk bersatu kembali dengan Gustavo Brun, pacarnya di masa lalu yang menjadi pasangan selingkuhannya di tahun-tahun akhir pernikahannya ("Bienvenida").
Menyesuaikan diri dengan kehidupan baru mereka di Meksiko, Rita dan Emilia memiliki kesempatan bertemu dengan ibu yang kehilangan anaknya. Emilia merefleksikan kejahatannya di masa lalu ("Mis siete hermanos y yo"). Kemudian, saat dia menidurkan anak laki-lakinya di kasur, anaknya mengatakan bahwa ia masih mengenali bau tubuhnya ("Papá"). Merasa menyesal, Emilia menggunakan koneksinya dengan anggota-anggota kartel di penjara untuk membuat lembaga amal yang mengidentifikasi tubuh-tubuh korban kartel ("Para") dengan tujuan mengembalikan mereka ke keluarga mereka. Rita dan Emilia berkolaborasi dalam membangun lembaga nonprofit dan merekrut donor-donor, yang beberapa dari mereka, Rita perhatikan, adalah orang-orang berbahaya dan korup ("El mal"). Epifanía, seorang wanita yang jenazah suaminya yang abusif diidentifikasi oleh lembaga nonprofit ini, bertemu dengan Emilia untuk mengonfirmasi kematiannya. Keduanya kemudian mulai menjalin sebuah hubungan ("El amor").
Sementara itu, Jessi terus menghidupkan kembali hubungannya dengan Gustavo ("Mi camino"). Dia memberitahu Emilia bahwa keduanya berencana untuk menikah dan memindahkan keluarga mereka ke rumah yang baru. Ketika Emilia menyebut anak-anak tersebut dengan kepemilikan "saya" dan menjadi agresif secara fisik, Jessi kabur dengan anak-anaknya. Setelah Emilia memutus tunjangan Jessi dan mengancam Gustavo untuk meninggalkan Meksiko, Jessi dan Gustavo menculik Emilia dan menuntut uang tebusan dari Rita. Ia menerima sebuah paket dengan sejumlah kecil potongan jari-jari Emilia. Saat tiba di lokasi yang ditentukan, Rita mencoba bernegosiasi dengan Gustavo, namun terjadi baku tembak dengan tim keamanan yang Rita sewa untuk menyelamatkan Emilia.
Emilia akhirnya membuka identitas aslinya kepada Jessi, menyebutkan ulang detail-detail intim dari pertemuan pertama mereka dan hari pernikahan mereka ("Perdóname"). Gustavo dan Jessi yang kebingungan memasukkan Emilia ke dalam bagasi mobil Gustavo dan pergi kabur. Ketika Jessi perlahan menyadari apa yang telah terjadi, dia jadi dihantui rasa bersalah dan menyuruh Gustavo untuk berhenti, dengan menodongkan senjata ke arahnya. Sementara keduanya bergelut dengan senjata, mobil tersebut berbelok keluar dari jalan, membunuh Gustavo, Jessi, dan Emilia.
Rita, merasa terpukul oleh kematian Emilia, memberitahukan anak-anak Jessi apa yang sudah terjadi dan menawarkan diri untuk menjadi wali mereka. Epifanía berpawai di jalan menyanyikan eulogi Emilia dan merayakan perlawanannya untuk kebenaran dan kebebasan ("Las damas que pasan").