Pengepungan Bagdad
Kampanye Bagdad > Penjarahan dan dampak

Pada tanggal 13 Februari, penjarahan Bagdad pun dimulai. Penjarahan tersebut bukan merupakan penghancuran yang disengaja sebagaimana yang umum dinyatakan, tetapi lebih sebagai keputusan yang diperhitungkan untuk menunjukkan konsekuensi dari melawan Kekaisaran Mongol. Para sayyid, cendekiawan, pedagang yang berdagang dengan Mongol, dan umat Kristen di kota tersebut atas perantaraan istri Hulegu Doquz Khatun yang juga Kristen, dianggap berharga dan diperintahkan untuk menandai pintu mereka sehingga rumah mereka akan dibiarkan. Sementara sisanya menjadi subyek penjarahan dan pembunuhan selama sepekan penuh. Menurut Kirakos Gandzaketsi, seorang sejarawan Armenia abad ke-13, umat Kristen dalam tentara Hulegu sangat senang menjarah Bagdad. Tidak diketahui seberapa banyak penduduk yang dibunuh. Para penulis Muslim pada masa berikutnya memperkirakan antara 800.000 hingga dua juta orang terbunuh, sementara Hulegu sendiri, dalam sebuah surat kepada Louis IX dari Prancis, menyatakan bahwa pasukannya telah membunuh 200.000 orang. Jumlah tersebut mungkin membesar akibat adanya epidemi di kalangan penduduk yang tersisa. Para cendekiawan pun berdebat apakah epidemi tersebut berupa mewabahnya pes yang mendahului Wabah Hitam.
Pada hari kedua penjarahan, tanggal 15 Februari, Hulegu mengunjungi istana khalifah dan memaksa al-Musta'sim untuk mengungkapkan hartanya yang kemudian sebagian dibagikan kepada para panglima seperti Guo Kan, tetapi sebagian besar dinaikkan ke atas gerobak dan dibawa ke Möngke Khan di Karakorum atau ke Pulau Shahi di Azerbaijan, di mana Hulegu akan dimakamkan. Setelah memberikan istana tersebut kepada Makkikha untuk dijadikan gereja, Hulegu lalu mengadakan sebuah jamuan makan, di mana ia berlagak menjadi tuan rumah bagi al-Musta'sim. Nasir al-Din al-Tusi yang kemungkinan hadir dalam jamuan tersebut, mencatat dialog berikut:
[Hulegu] meletakkan nampan emas di hadapan al-Musta'sim dan berujar: "Makanlah!"
"Ini tidak dapat dimakan," ujar al-Musta'sim.
"Lalu kenapa kau menyimpannya," tanya Hulegu, "dan tidak memberikannya kepada para prajuritmu? Dan kenapa kau tidak mengubah pintu-pintu besi ini menjadi anak-anak panah dan memasangnya di tepi sungai agar aku tidak dapat melintasinya?"
"Begitulah", jawab al-Musta'sim, "kehendak Tuhan."
"Apapun yang akan terjadi kepadamu," ujar Hulegu, "juga merupakan kehendak Tuhan."
Peristiwa tersebut tampaknya menjadi sumber dari sebuah cerita rakyat yang direproduksi dalam tulisan dari penulis Kristen seperti Marco Polo yang menyatakan bahwa Hulegu kemudian mengurung al-Musta'sim dalam sebuah sel yang diisi dengan hartanya, di mana akhirnya ia mati kelaparan empat hari kemudian. Pada kenyataannya, pada tanggal 20 Februari, setelah Hulegu menghentikan penjarahan dan pembunuhan, serta memindahkan kampnya menjauh dari kota tersebut untuk menghindari udara yang makin tercemar, al-Musta'sim dihukum mati bersama seluruh keluarga dan pegawainya. Untuk menghindari pertumpahan darah kerajaan, sebuah hal yang sangat tabu bagi Mongol, al-Musta'sim dibalut dengan karpet dan diinjak-injak hingga mati oleh sejumlah kuda. Hulegu sempat ragu apakah al-Musta'sim harus dihukum mati atau tidak, tetapi ia akhirnya memutuskan untuk melakukannya guna mematahkan mitos bahwa khalifah adalah entitas yang maha kuasa, kebal, dan tidak dapat diganggu gugat.
Jika, sebagaimana tuduhan dari para penulis pada masa berikutnya, al-Alqami memang mengkhianati Bagdad untuk Mongol, maka Hulegu juga akan mengeksekusi al-Alqami—sebagaimana kebijakan Mongol terkait pengkhianat. Sebaliknya, berkat upaya al-Alqami dalam mencegah al-Musta'sim mengambil langkah yang salah, ia diangkat kembali menjadi wazir, meskipun ia akhirnya meninggal kurang dari tiga bulan kemudian. Selain mengangkat seorang daruyachi ('pejabat pengawas') Khwarazm yang bernama Ali Ba'atar untuk wilayah tersebut dan menempatkan 3.000 orang prajurit di kota tersebut, Hulegu juga memerintahkan pembangunan kembali Bagdad dan membuka bazarnya. Pada tanggal 8 Maret, Hulegu meninggalkan wilayah tersebut, bergerak ke arah utara menuju Hamadan dan kemudian Azerbaijan, di mana ia tinggal selama satu tahun.