Sejarah Ordo Bait Allah
Ajaran Sesat, Penghinaan Agama, dan Tuduhan Lainnya

Bukti yang tak terbantahkan bahwa para imam Templar tidak memotong kata-kata pada saat konsekrasi dalam misa diberikan di dalam proses persidangan di Siprus oleh para rohaniwan yang lama mengembara bersama para Kesatria Ordo Bait Allah di Timur.
Perdebatan terus berlangsung mengenai apakah tuduhan akan ajaran sesat memiliki dasar sesuai dengan standar zaman itu. Di dalam penyiksaan, beberapa Kesatria Ordo Bait Allah mengaku melakukan kegiatan homoseksual, dan menyembah kepala-kepala dan seorang dewa yang dikenal dengan nama Baphomet. Para pemimpin mereka nantinya akan membantah pengakuan-pengakuan ini, dan oleh karenanya dihukum mati. Beberapa sejarawan, seperti Malcolm Barber, Helen Nicholson dan Peter Partner, membantah hal-hal ini sebagai pengakuan akibat penyiksaan yang biasa dilakukan selama masa Inkuisisi Abad Pertengahan.
Kebanyakan tuduhan ini sama persis dengan tuduhan yang dijatuhkan pada orang-orang lain yang disiksa oleh aparat Inkuisisi, kecuali satu hal: penyembahan kepala. Para Kesatria Ordo Bait Allah secara khusus dituduh menyembah semacam potongan kepala; sebuah tuduhan yang hanya dijatuhkan terhadap para Kesatria Ordo Bait Allah. Penjelasan mengenai kepala ini yang diduga disembah oleh para Kesatria Ordo Bait Allah terdapat berbagai macam dan pada dasarnya saling bertentangan. Mengutip Norman Cohn:
Beberapa orang menggambarkannya sebagai kepala yang memiliki tiga wajah, yang lain mengatakannya memiliki empat kaki, yang lain menceritakannya sebagai sebuah wajah tanpa kaki. Bagi beberapa pihak benda itu adalah tengkorak kepala manusia, diawetkan dan ditanami dengan berlian; yang lain mengatakan benda itu adalah hasil pahatan dari kayu. Beberapa orang percaya bahwa benda itu berasal dari tulang-belulang seorang mantan pemimpin agung ordo ini, sementara yang lain sama percayanya bahwa benda itu merupakan Baphomet - yang diinterpretasikan oleh beberapa pihak di zaman itu sebagai 'Mohammed'. Beberapa orang mengatakan bahwa mereka melihat kepala itu memiliki tanduk.
Malcolm Barber menghubungkan tuduhan ini dengan cerita rakyat abad pertengahan mengenai kepala sakti, dan kepercayaan abad pertengahan popular bahwa kaum Muslim menyembah berhala. Beberapa pihak berpendapat bahwa hal tersebut merujuk pada ritual yang menggunakan relik dari Santo Yohanes Pembaptis, Euphemia, salah satu dari sebelas perawan pengikut Santa Ursula, dan/atau Hugues de Payens  dan bukannya patung berhala dewa kaum pagan.
Tuduhan-tuduhan akan ajaran sesat meliputi tindakan meludahi, menginjak-injak, atau mengencingi salib; sambil telanjang, diciumi secara vulgar oleh pasangannya di bagian bibir, pusar dan bagian bawah tulang belakang; ajaran sesat dan penyembahan berhala; homoseksualitas yang terorganisasi; dan juga tuduhan atas penghinaan terhadap Misa Suci dan penolakan terhadap sakramen. Barbara Frale berpendapat bahwa tindakan-tindakanm ini ditujukan untuk memberikan contoh bagaimana bentuk penghinaan dan penyiksaan yang akan dialami oleh seorang tentara Perang Salib bila ditangkap hidup-hidup oleh kaum Saracen. Mengikuti jalan pemikiran ini, mereka diajarkan bagaimana melakukan permutadan hanya dengan pikiran saja dan tidak dengan hati.
Tuduhan atas penyembahan pada Baphomet lebih sulit. Karen Ralls menemukan bahwa, "Tidak pernah disebutkan nama Baphomet baik di dalam Hukum Templar maupun di dalam dokumen-dokumen Ordo Bait Allah lainnya dari periode abad pertengahan". Sejarawan almarhum Hugh J. Schonfield berspekulasi bahwa para imam kepala Ordo Bait Allah menciptakan kata Baphomet melalui sandi Atbash untuk menyembunyikan istilah Gnostik Sophia (Bahasa Yunani untuk "kebijaksanaan") atas dasar pengaruh gulungan naskah kaum Eseni di Qumran (Naskah Laut Mati) yang berdasarkan hipotesis mungkin Ordo Bait Allah menemukannya saat melakukan penggalian arkeologi di wilayah Kerajaan Yerusalem.