Mutasi netral
Jenis > Mutasi sinonim dari basa

Ketika nukleotida yang salah dimasukkan selama replikasi atau transkripsi daerah pengkodean, hal itu dapat memengaruhi translasi dari urutannya menjadi asam amino. Karena banyak kodon digunakan untuk asam amino yang sama, perubahan dalam basa tunggal masih dapat menyebabkan translasi asam amino yang sama. Fenomena ini disebut degenerasi dan memungkinkan berbagai kombinasi kodon yang menghasilkan asam amino yang sama. Misalnya, kode TCT, TCC, TCA, TCG, AGT, dan AGC yang semuanya menyandi asam amino serin. Hal ini bisa dijelaskan dengan konsep keraguan (wobble concept). Francis Crick mengusulkan teori ini untuk menjelaskan mengapa molekul tRNA spesifik dapat mengenali banyak kodon. Area tRNA yang mengenali kodon yang disebut antikodon mampu mengikat banyak basa yang dapat dipertukarkan pada ujung 5 'karena kebebasan spasialnya. Basa kelima yang disebut inosin juga dapat disubstitusi pada tRNA dan mampu mengikat dengan A, U, atau C. Fleksibilitas ini memungkinkan untuk perubahan basa dalam kodon yang mengarah pada translasi asam amino yang sama. Perubahan basa dalam kodon tanpa perubahan asam amino yang ditrasnlasikan disebut mutasi sinonim. Karena asam amino yang ditranslasi tetap sama, mutasi sinonim secara tradisional dianggap mutasi netral. Beberapa penelitian telah menyarankan bahwa ada bias dalam pemilihan substitusi basa dalam mutasi sinonim. Hal ini bisa jadi karena tekanan selektif untuk meningkatkan efisiensi transasi terkait dengan tRNA yang paling tersedia atau hanya bias mutasional. Jika mutasi ini memengaruhi kecepatan translasi atau kemampuan organisme untuk menghasilkan protein, mutasi mungkin benar-benar memengaruhi fitness (representasi kuantitatif seleksi alam dan seksual dalam biologi evolusi) organisme yang terpengaruh.
| 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
| --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- |
| Asam amino sifat biokimia | nonpolar | polar | basa | asam |  | Terminasi: kodon stop |
| Basa pertama | Basa kedua> T | Basa kedua> T | Basa kedua> C | Basa kedua> C | Basa kedua> A | Basa kedua> A | Basa kedua> G | Basa kedua> G | 3rd  base |
| --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- | --- |
| T | TTT | (Phe/F) Phenylalanine | TCT | (Ser/S) Serine | TAT | (Tyr/Y) Tyrosine | TGT | (Cys/C) Cysteine | T |
| T | TTC | (Phe/F) Phenylalanine | TCC | (Ser/S) Serine | TAC | (Tyr/Y) Tyrosine | TGC | (Cys/C) Cysteine | C |
| T | TTA | (Leu/L) Leucine | TCA | (Ser/S) Serine | TAA | Stop (Ochre)  | TGA | Stop (Opal)  | A |
| T | TTG | (Leu/L) Leucine | TCG | (Ser/S) Serine | TAG | Stop (Amber)  | TGG | (Trp/W) Tryptophan     | G |
| C | CTT | (Leu/L) Leucine | CCT | (Pro/P) Proline | CAT | (His/H) Histidine | CGT | (Arg/R) Arginine | T |
| C | CTC | (Leu/L) Leucine | CCC | (Pro/P) Proline | CAC | (His/H) Histidine | CGC | (Arg/R) Arginine | C |
| C | CTA | (Leu/L) Leucine | CCA | (Pro/P) Proline | CAA | (Gln/Q) Glutamine | CGA | (Arg/R) Arginine | A |
| C | CTG | (Leu/L) Leucine | CCG | (Pro/P) Proline | CAG | (Gln/Q) Glutamine | CGG | (Arg/R) Arginine | G |
| A | ATT | (Ile/I) Isoleucine | ACT | (Thr/T) Threonine         | AAT | (Asn/N) Asparagine | AGT | (Ser/S) Serine | T |
| A | ATC | (Ile/I) Isoleucine | ACC | (Thr/T) Threonine         | AAC | (Asn/N) Asparagine | AGC | (Ser/S) Serine | C |
| A | ATA | (Ile/I) Isoleucine | ACA | (Thr/T) Threonine         | AAA | (Lys/K) Lysine | AGA | (Arg/R) Arginine | A |
| A | ATG | (Met/M) Methionine | ACG | (Thr/T) Threonine         | AAG | (Lys/K) Lysine | AGG | (Arg/R) Arginine | G |
| G | GTT | (Val/V) Valine | GCT | (Ala/A) Alanine | GAT | (Asp/D) Aspartic acid | GGT | (Gly/G) Glycine | T |
| G | GTC | (Val/V) Valine | GCC | (Ala/A) Alanine | GAC | (Asp/D) Aspartic acid | GGC | (Gly/G) Glycine | C |
| G | GTA | (Val/V) Valine | GCA | (Ala/A) Alanine | GAA | (Glu/E) Glutamic acid | GGA | (Gly/G) Glycine | A |
| G | GTG | (Val/V) Valine | GCG | (Ala/A) Alanine | GAG | (Glu/E) Glutamic acid | GGG | (Gly/G) Glycine | G |