Tumbuhan dan hewan terdomestikasi di Austronesia
Tanaman > Cocos nucifera (kelapa)

Wilayah antara Asia Barat Daya dan Melanesia merupakan tempat asal kelapa (Cocos nucifera), di mana kelapa memiliki keragaman genetik terbesar. Sebuah penelitian pada tahun 2011 mengidentifikasi dua subpopulasi kelapa yang sangat terdiferensiasi secara genetis, satu berasal dari Asia Tenggara Kepulauan (kelompok Pasifik) dan yang lainnya dari pinggiran selatan Anak Benua India (kelompok Indo-Atlantik). Kelompok Pasifik adalah satu-satunya kelompok yang menunjukkan gejala genetik dan fenotipik yang mengarah pada domestikasi; termasuk ukuran buah yang lebih kecil, penyerbukan sendiri, dan bentuk buah "niu vai" yang bulat dengan rasio endosperma terhadap tempurung yang lebih besar. Persebaran kelapa Pasifik sesuai dengan wilayah hunian para penjelajah Austronesia yang menunjukkan bahwa penyebarannya sebagian besar merupakan hasil introduksi manusia.
Hal paling mencolok terlihat di Madagaskar, sebuah pulau yang mulai dihuni oleh pelaut Austronesia pada sekitar 2.000 hingga 1.500 yang lalu. Populasi kelapa di pulau tersebut menunjukkan adanya percampuran genetik antara kedua subpopulasi yang menunjukkan bahwa kelapa Pasifik dibawa oleh pemukim Austronesia yang kemudian kawin silang dengan kelapa lokal Indo-Atlantik.
Kata untuk "kelapa" dalam bahasa-bahasa Austronesia berasal dari *niuʀ dalam bahasa Proto-Melayu-Polinesia. Kata kerabat modern termasuk niyog dalam bahasa Tagalog; niyok dalam bahasa Chamorro; nyiur dalam bahasa Melayu; nuu dalam bahasa Tetum; nu dalam bahasa Drehu; nii dalam bahasa Kiribati; niu dalam bahasa Hawaii, Samoa, Tonga, Fiji, dan Rapa Nui; dan nio dalam bahasa Malagasi.
Studi genetik terhadap kelapa juga telah mengonfirmasi populasi kelapa pra-Kolumbus di Panama di Amerika Selatan. Namun, populasi ini bukanlah tanaman asli dan menunjukkan hambatan genetik akibat efek pendiri. Sebuah penelitian pada tahun 2008 menunjukkan bahwa kelapa di Benua Amerika secara genetik memiliki kekerabatan paling dekat dengan kelapa di Filipina, dan tidak dengan populasi kelapa lain di dekatnya (termasuk Polinesia). Informasi demikian menunjukkan bahwa kelapa tidak diperkenalkan secara alami, misalnya melalui arus laut. Para peneliti menyimpulkan bahwa buah ini dibawa oleh para pengelana Austronesia awal ke sana setidaknya sejak 2.250 tahun yang lalu, dan mungkin menjadi bukti adanya kontak pra-Kolumbus antara budaya Austronesia dan budaya Amerika Selatan, meskipun arahnya berlawanan dengan hipotesis awal seperti yang diajukan Heyerdahl. Hal ini semakin diperkuat oleh bukti kontak botani serupa lainnya, seperti kemunculan ubi jalar asli Amerika pada budaya Oseania selama masa pra-kolonial. Selama masa kolonial, kelapa Pasifik diperkenalkan lebih jauh ke Meksiko dari Hindia Timur Spanyol dengan galiung Manila.
Berbeda dengan kelapa Pasifik, kelapa Indo-Atlantik umumnya diintroduksi oleh pedagang Arab dan Persia ke pesisir Afrika Timur. Kelapa Indo-Atlantik juga diangkut ke Samudra Atlantik oleh kapal-kapal Portugis dari koloni mereka di India dan Sri Lanka; dan pertama kali diperkenalkan ke pesisir Afrika Barat, kemudian ke Kepulauan Karibia dan pantai timur Brasil. Semua introduksi ini terjadi dalam beberapa abad terakhir, relatif baru dibandingkan dengan introduksi kelapa Pasifik.