Percobaan pembunuhan Paus Yohanes Paulus II
Motivasi upaya pembunuhan > Klaim Komisi Mitrokhin

Informasi lebih lanjut: Komisi Mitrokhin
Menurut surat kabar Italia Corriere della Sera, dokumen yang diperoleh dari mantan badan intelijen Jerman Timur mengonfirmasi bahwa upaya pembunuhan tahun 1981 terhadap Paus Yohanes Paulus II diperintahkan oleh KGB Soviet dan ditugaskan ke Bulgaria dan Timur. Agen Jerman dengan Stasi untuk mengoordinasikan operasi dan menutupi jejak setelahnya.[butuh rujukan]
 Markus Wolf, mantan kepala mata-mata Stasi, menyangkal adanya kaitan apa pun, dan menyatakan bahwa file sudah dikirim pada tahun 1995.
Pada bulan Maret 2006, sambil menunggu pemilihan umum Italia 2006 yang diadakan pada bulan April, Komisi Mitrokhin yang kontroversial, yang dibentuk oleh Silvio Berlusconi dan dipimpin oleh senator Forza Italia Paolo Guzzanti, mendukung sekali lagi teori Bulgaria, yang dikecam oleh Yohanes Paulus II selama perjalanannya ke Bulgaria. Guzzanti menyatakan bahwa "para pemimpin bekas Uni Soviet berada di balik upaya pembunuhan tersebut", dan menyatakan bahwa "kepemimpinan Uni Soviet mengambil inisiatif untuk melenyapkan Paus Yohanes Paulus" karena dukungannya terhadap Solidaritas, menyampaikan "keputusan ini kepada dinas rahasia militer" dan bukan kepada KGB. Klaim laporan tersebut didasarkan pada analisis komputer terbaru terhadap foto-foto yang dimaksudkan untuk menunjukkan kehadiran Antonov di Lapangan Santo Petrus selama penembakan dan informasi yang dibawa oleh hakim anti-teroris Prancis Jean-Louis Bruguière, seorang tokoh kontroversial yang prestasi terakhirnya adalah mendakwa presiden Rwanda Paul Kagame, dengan alasan bahwa ia sengaja memprovokasi genosida Rwanda tahun 1994 terhadap kelompok etnisnya sendiri untuk mengambil alih kekuasaan. Menurut Le Figaro, Bruguière, yang memiliki kontak dekat dengan Moskow dan Washington, D.C., termasuk agen intelijen, dituduh oleh banyak rekannya "mengistimewakan alasan negara atas hukum".
Baik Rusia dan Bulgaria mengecam laporan tersebut. Juru bicara Kementerian Luar Negeri Dimiter Tzantchev mengatakan: "Bagi Bulgaria, kasus ini ditutup dengan keputusan pengadilan di Roma pada Maret 1986." , Ia mengenang komentar meremehkan Paus selama kunjungannya pada Mei 2002 ke Bulgaria. Guzzanti mengatakan bahwa komisi telah memutuskan untuk membuka kembali bab laporan mengenai upaya pembunuhan tersebut pada tahun 2005, setelah Paus menulis tentang hal tersebut dalam buku terakhirnya, Memori dan Identitas: Percakapan Antar Milenium. Paus menulis bahwa dia yakin penembakan itu bukanlah inisiatif Ağca dan bahwa "ada orang lain yang mendalanginya dan ada orang lain yang menugaskannya". Komisi Mitrokhin juga menuduh Romano Prodi, mantan Perdana Menteri Italia, adalah "orang KGB di Italia".
Pada akhir Desember 2006, Mario Scaramella, salah satu informan utama Guzzanti, ditangkap dan didakwa, antara lain, atas pencemaran nama baik. Dikutip oleh La Repubblica, jaksa Roma Pietro Salvitti, yang bertanggung jawab atas penyelidikan terkait Scaramella, menunjukkan bahwa Nicolò Pollari, kepala SISMI, badan intelijen militer Italia dan didakwa dalam kasus Abu Omar, serta SISMI no 2, Marco Mancini, yang ditangkap pada bulan Juli 2006 karena alasan yang sama, adalah beberapa informan, bersama Scaramella, dari Guzzanti. Menurut Salvitti, selain menargetkan Prodi dan stafnya, jaringan ini juga bertujuan untuk mencemarkan nama baik Jenderal Giuseppe Cucchi (yang saat itu menjabat sebagai direktur CESIS), hakim Milan Armando Spataro, yang menangani kasus Abu Omar, dan Guido Salvini, serta reporter La Repubblica Carlo Bonini dan Giuseppe D'Avanzo, yang menemukan perselingkuhan Pemalsuan Kue Kuning. Investigasi juga menunjukkan adanya koneksi antara Scaramella dan CIA, khususnya melalui Filippo Marino, salah satu mitra terdekat Scaramella sejak tahun 1990-an dan salah satu pendiri Program Pencegahan Kejahatan Lingkungan, yang datang untuk tinggal di Amerika Serikat. Dalam sebuah wawancara, Marino mengakui hubungannya dengan mantan perwira aktif CIA, termasuk Robert Lady, mantan kepala stasiun CIA di Milan, yang didakwa oleh jaksa Armando Spataro karena mengoordinasikan penculikan Hassan Mustafa Osama Nasr yang mengarah pada kasus Abu Omar.