Mycobacterium tuberculosis
Evolusi > Co-evolusi dengan manusia modern

Saat ini ada dua narasi paralel mengenai usia MTBC dan bagaimana bakteri ini telah menyebar dan berkembang bersama dengan manusia dari waktu ke waktu. Salah satu studi membandingkan filogeni M. tuberculosis dengan filogeni genom mitokondria manusia dan menafsirkannya sebagai sangat mirip. Berdasarkan ini, penelitian menunjukkan bahwa M. tuberculosis, seperti manusia, berevolusi di Afrika dan kemudian menyebar dengan manusia modern secara anatomis dari Afrika ke seluruh dunia. Dengan mengkalibrasi tingkat mutasi M. tuberculosis untuk mencocokkan narasi ini, penelitian menunjukkan bahwa MTBC berevolusi 40.000-70.000 tahun yang lalu. Dengan menerapkan skala waktu ini, penelitian menemukan bahwa ukuran populasi efektif M. tuberculosis meningkat selama Transisi Demografis Neolitik (sekitar 10.000 tahun yang lalu) dan menyarankan bahwa M. tuberculosis mampu beradaptasi dengan perubahan populasi manusia dan bahwa sejarah keberhasilan patogen ini. setidaknya sebagian didorong oleh peningkatan dramatis dalam kepadatan populasi inang manusia. Juga telah dibuktikan bahwa setelah beremigrasi dari satu benua ke benua lain, daerah asal inang manusia dapat memprediksi garis keturunan TB yang mereka bawa, yang dapat mencerminkan hubungan yang stabil antara populasi pejamu dan M. tuberculosis tertentu. garis keturunan dan / atau interaksi sosial yang dibentuk oleh sejarah budaya dan geografis bersama.
Mengenai kesesuaian antara filogeni manusia dan M. tuberculosis, sebuah studi yang mengandalkan M. tuberculosis dan sekuens DNA kromosom Y manusia untuk menilai secara formal korelasi di antara mereka, menyimpulkan bahwa mereka tidak kongruen. Juga, sebuah penelitian yang lebih baru yang memasukkan urutan genom dari anggota kompleks M. tuberculosis yang diekstrak dari tiga mumi Peru berumur 1.000 tahun, memperkirakan bahwa nenek moyang terbaru dari kompleks M. tuberculosis hidup hanya 4.000 - 6.000 tahun yang lalu. Laju evolusi M. tuberculosis diperkirakan oleh Bos et al. studi juga didukung oleh studi di Lineage 4 yang mengandalkan urutan aDNA genom dari mumi Hungaria yang berusia lebih dari 200 tahun. Secara total, bukti mendukung perkiraan yang lebih baru tentang usia MTBC nenek moyang paling baru, dan dengan demikian bahwa evolusi global dan penyebaran M. tuberculosis telah terjadi selama 4.000–6.000 tahun terakhir.
Di antara tujuh garis keturunan M. tuberculosis yang diakui, hanya dua yang benar-benar mendunia dalam penyebarannya: Garis keturunan 2 dan 4. Di antara garis keturunan ini, Garis 4 adalah yang paling tersebar dengan baik, dan hampir seluruhnya mendominasi di Amerika. Lineage 4 terbukti telah berkembang di atau di sekitar Eropa, dan telah menyebar secara global dengan orang Eropa mulai sekitar abad ke-13. Studi ini juga menemukan bahwa Lineage 4 tuberculosis menyebar ke Amerika tidak lama setelah penemuan benua Eropa pada tahun 1492, dan menunjukkan bahwa ini merupakan pengenalan pertama TB pada manusia di benua itu (walaupun strain hewan telah ditemukan pada sisa-sisa manusia sebelum Columbus. Demikian pula, Lineage 4 ditemukan telah menyebar dari Eropa ke Afrika selama Age of Discovery, dimulai pada awal abad ke-15.
Telah dikemukakan bahwa mikobakteri leluhur mungkin telah menginfeksi hominid awal di Afrika Timur sejak tiga juta tahun yang lalu. Meskipun MRCA dari M. tuberculosis yang masih ada tampaknya telah ada sekitar 4.000-6.000 tahun yang lalu, ini tidak berarti bahwa TB tidak ada sebelumnya, ini hanya berarti bahwa semua strain M. tuberculosis yang beredar saat ini dapat dilacak. kembali ke leluhur bersama yang hidup pada saat itu.