BNSF Railway
Merger dengan CN

Pada tanggal 20 Desember 1999, BNSF dan Canadian National Railway mengumumkan rencana (Keuangan Perkara STB No. 33842 Diarsipkan 2016-03-03 di Wayback Machine.) untuk bergabung sebagai anak perusahaan baru perusahaan induk, North American Railways, yang akan menguasai jalur sepanjang sekitar 50.000 mil (80.000 km). Dengan CN yang dialokasikan terutama di Kanada dan melalui anak perusahaan Illinois Central Railroad, pada koridor utara-selatan dekat tepi timur BNSF, kedua sistem memiliki sedikit tumpang tindih. Penggabungan akan memiliki manfaat baik bagi perusahaan dengan memperluas kas yang tersedia untuk peningkatan kapasitas, dan memungkinkan untuk memperpanjang gerakan sistem tunggal. Pengirim dan Dewan Transportasi Permukaan menyatakan keprihatinannya dan mengejutkan terkait waktu, semenjak merger yang melahirkan BNSF telah menjadi satu-satunya pada tahun 1990-an yang tidak menyebabkan kerusakan parah pada pelayanannya. Dikenakanlah oleh STB pada 17 Maret, 2000, 15-bulan moratorium (STB Ex Parte No. 582 Diarsipkan 2016-03-03 di Wayback Machine.) kepada merger yang melibatkan dua perusahaan kereta api Kelas I, mengutip oposisi luas tidak hanya untuk merger tapi dampaknya, kemungkinan besar akan memulai putaran final merger menjadi dua sistem besar. BNSF dan CN segera berbalik ke Pengadilan Banding AS, yang pada 14 Juli memutuskan bahwa STB berhak untuk mengatur merger yang diperbolehkan moratorium, dan kedua perusahaan kereta api membatalkan merger. STB merilis peraturan terakhir (STB Ex Parte No. 582 (Sub-No. 1) Diarsipkan 2016-03-03 di Wayback Machine.) pada tanggal 11 Juni 2001, memerlukan aplikasi baru untuk menggabungkan dua perusahaan kereta api Kelas I, dengan pengecualian kecil Kansas City Southern Railway, untuk menunjukkan bahwa persaingan akan dipertahankan dan mengatasi efek gerakan defensif oleh operator lain. Semenjak itu, tidak ada penggabungan perusahaan antar Kelas I terjadi.
BNSF Railway secara langsung memiliki dan mengoperasikan jalur di 28 negara bagian AS: Alabama, Florida, Arizona, Arkansas, California, Colorado, Idaho, Illinois, Iowa, Kansas, Louisiana, Minnesota, Mississippi, Missouri, Montana, Nebraska, Nevada, New Mexico, North Dakota, Oklahoma, Oregon, South Dakota, Tennessee, Texas, Utah, Washington, Wisconsin, dan Michigan. Mereka juga mengoperasikan sejumlah jalur kecil di Kanada, termasuk sekitar 30 mil (48 km) yang membentang dari perbatasan AS-Kanada ke Vancouver, British Columbia, beberapa jalur dan lapangan di Winnipeg, Manitoba, sekitar 70 mil (110 km) dari jalur bersama dengan Canadian National Railway, yang berjalan dari selatan ke perbatasan AS di Emerson, Manitoba, dan jalurnya kurang dari satu kilometer di perbatasan di Northgate, Saskatchewan.
Untuk tujuan administratif, BNSF dibagi menjadi dua wilayah dan sepuluh divisi operasi. Wilayah Utara meliputi Montana, Northwest, dan Twin Cities, Heartland dan divisi Powder River. Wilayah Selatan meliputi Red River, California, Chicago, Kansas dan divisi Southwest. Masing-masing divisi dibagi lagi menjadi subdivisi, yang mewakili jalur segmen dari 300 mil (482 km) dari jalur utama hingga 10 mil (16 km) jalur percabangan. Bekas divisi Texas dan Gulf digabungkan ke dalam Divisi Red River, dan bekas divisi Springfield dan Nebraska digabungkan ke Divisi Heartland, pada musim semi 2016.
Tidak termasuk jalur utama kedua, ketiga dan keempat, jalur depo kereta, dan jalur simpang, BNSF juga memiliki dan mengoperasikan lebih dari 24.000 mil (38,624 kilometer) dari jalur. Saat ini jalur tambahan yang dihitung, panjang jalur kereta api yang dikendalikan secara langsung meningkat menjadi lebih dari 50.000 mil (80,467 kilometer).
Selain itu, BNSF Railway telah memperoleh jalur hak pada jalur sepanjang lebih dari 8.000 mil (12,875 kilometer) dari jalur di seluruh Amerika Serikat dan Kanada. Hak-hak ini memungkinkan BNSF untuk beroperasi sendiri kereta dengan kru di perusahaan pesaing jalur utama. Lokomotif BNSF juga kadang-kadang muncul pada jalur milik pesaing di seluruh Amerika Serikat dan Kanada dengan cara sewa, jarak tempuh equalizations, dan pengaturan kontrak lainnya.