כוכב הקופים: המלחמה
תקציר עלילת הסרט

סיזר ושבטי הקופים חיים במעבה היערות בעוד שהקולונל חסר רחמים ושאריות מצבא ארצות הברית שבפיקודו מנסים לצוד אותם. החיילים שנעזרים בקופים שנאמנים להם סופגים תבוסה וחלקם נשבים. בעוד סיזר בא לראות את השבויים, מסתבר שהקופים שמסייעים לבני האדם הם אלו שהיו נאמנים לקובה (הקוף שבגד בסיזר בסרט הקודם). סיזר מחליט לשחרר את החיילים השבויים מתוך תקווה שהקולונל המנהיג אותם יראה בכך מחווה של שלום מצד הקופים. לאחר מכן במחנה הקופים המוסתר, ריבר, בנו הגדול של סיזר חוזר ממשימת סיור ומספר לסיזר שמצא מפלט עבור הקופים: מקום במדבר שהוא מרוחק מבני האדם ובטוח עבור הקופים.
באותו לילה מתקיפים שוב החיילים את מחנה הקופים והורגים את אשתו של סיזר ואת בנו הגדול, ריבר, שאותו הם מזהים בטעות כסיזר. בנו הצעיר קורנליוס שורד וסיזר מבקש מקופה נקבה בשם לייק לשמור עליו. בעקבות התפתחות זו מבין סיזר שאין להם זמן עד המתקפה הבאה ומורה לקופים לצאת באופן מיידי למסע לעבר אותו מפלט שמצא בנו. במקום להוביל אותם במסע מחליט סיזר לצאת ולנקום את מות אשתו ובנו ובו זמנית לעכב את החיילים ולאפשר לכל שאר הקופים מנוסה בטוחה אל המפלט. סיזר רצה להישאר לבד במשימתו הזו אך עוד שלושה קופים מתעקשים להישאר איתו ולסייע לו. קופים אלו הם: רוקט (חברו הטוב של בנו ריבר), מוריס (האורנגאוטן, חברו הטוב של סיזר) וגורילה בשם לוקה.
יחד הם מתחקים אחרי עקבות בני האדם ומגלים מבנה נטוש שבו נוכחות בני אדם. עם הגעתם לשם הם נתקלים בחייל והורגים אותו. במהלך סריקת המבנה אחרי עוד חיילים, הם מגלים במבנה ילדה שאינה מסוגלת לדבר. מוריס שמתחבר איתה לא מוכן להשאיר אותה לבד ומשכנע את סיזר לקחת אותה איתם. הם ממשיכים במעקב אחרי החיילים ומאתרים חיילים שנורו והושארו מאחור גוססים, הם מנסים לדובב אחד מהם ומגלים שגם הוא, כמו הילדה, אינו יכול לדבר. הם ממשיכים ומאתרים מחנה חיילים נוסף. בהתגנבות לתוכו הם מגלים את ווינטר, גורילה לבקן שנעלם מהמחנה של הקופים מספר ימים לפני שיצאו לדרך. הם מבינים שהוא חבר לבני האדם מתוך פחד ומתוך תקווה שלא יהרגו אותו כתודה על הסיוע שלו. הוא מספר להם שהחיילים המשיכו עם הגנרל צפונה ושעוד חיילים אמורים להגיע כתגבורת.
סיזר והחבורה ממשיכים ומתצפתים מאנטנה ובעודם למעלה, אדם גונב מהסוסים שלהם משקפת ורובה. הם רודפים אחריו למבנה נטוש רק כדי לגלות שזה אינו אדם אלא קוף. הקוף שקורא לעצמו "קוף רע" (Bad Ape) מדבר באופן שוטף אך אינו יודע שפת סימנים. סיזר והאחרים מבינים שאיננו אחד משלהם. הוא שונה מהם, חסר שיער ונראה שהוא סובל מהקור. בשיחה איתו מבין סיזר שהוא קוף מגן חיות שהווירוס שהשמיד את בני האדם יצר אצלו את אותו תהליך שנוצר אצל סיזר ושאר הקופים (עליה באינטליגנציה, הפיכת עיניים לירוקות וכו') הוא מספר להם שידוע לו על בסיס דמוי מכלאה שבו מחזיקים קופים בשבי.
סיזר מקווה למצוא שם את הקולונל ומשכנע את "קוף רע" להוביל את החבורה לשם. בעודם מתקרבים למקום, מאתרים אותם חיילים הסורקים מסביב ולפני שהקופים מנטרלים אותם הם מספיקים להרוג את הגורילה לוקה. סיזר לא רוצה להמשיך ולסכן את האחרים, הוא מורה למוריס ורוקט להצטרף אל שאר הקופים במסע למפלט, בעוד הוא יישאר ויתעמת עם הקולונל. הם נפרדים וסיזר ממשיך ומתקרב לבסיס אך נתפס על ידי החיילים ובעודו מוכנס למתקן כליאה הוא מבין שכל הקופים שברחו למקום המבטחים נלכדו על ידי החיילים ומוחזקים כעובדי כפייה, הבונים חומה להגנה על הבסיס של הקולונל. הוא מוצא בתוך הכלוב את הקופה לייק ואת בנו הצעיר קורנליוס.
בהמשך, בפגישה עם הקולונל, סיזר מבין שהמגפה שהשמידה את רוב האנושות עברה מוטציה הגורמת לבני האדם הנותרים לאבד את יכולת הדיבור. הקולונל, שבנו חלה במחלה, החליט על דעת עצמו להרוג את כל הנשאים של המוטציה וכך הפך למנהיג מיליציה אל מול שאר הצבא. למעשה הצבא שהקופים שיערו שחובר לקולונל הוא צבא שמגיע על מנת לחסל אותו ואת הנאמנים לו. הקולונל התמקם בבסיס זה, שבו כל המחילות שבהר מלאות בתחמושת, על מנת להילחם בשאר הצבא. סיזר מנסה להמריד את הקופים מול בני האדם אך נכשל.
בינתיים מוצאים מוריס ורוקט, שעקבו אחרי סיזר והבינו מה המצב, דרך פנימה למכלאת הקופים על ידי הסתננות במנהרות תת-קרקעיות. בעודם מבריחים את כל הקופים החוצה מתקיפים כוחות הצבא מבחוץ את המיליציה של הקולונל. סיזר פונה למגורי הקולונל כדי להרוג אותו, אך כשמוצא אותו מבין שגם הוא חולה במוטציה וכבר איבד את יכולתו לדבר. הקולונל הנואש מבקש מסיזר לירות בו אך סיזר מסרב ובסופו של דבר הקולונל מתאבד.
בעודו בורח החוצה כדי לחבור לשאר הקופים נפצע סיזר על ידי אחד מהחיילים הנאמנים לקולונל. על אף הפציעה הקשה הוא מצליח באמצעות רימון יד שגנב לפוצץ מכלית דלק שיוצרת תגובת שרשרת המפוצצת את כל הבסיס על מחסני הנשק הענקיים החבויים בתוך ההר. בעודו בורח החוצה רואה סיזר את החיילים שהתקיפו את המיליציה חוגגים את ניצחונם. הם מבחינים בו ועומדים לירות בו אך ממש לפני שהם יורים בו הם שומעים רעם ומבינים שהפיצוצים הענקיים יצרו מפולת שלגים עצומה שצונחת על צלע ההר לכיוונם. במנוסתם הם נקברים תחתיה יחד עם כל מתקן הכליאה. סיזר ושאר הקופים ניצלים ממפולת השלגים בכך שהם מטפסים על העצים שבקרבת מקום.
הקופים ממשיכים במסע במדבר ובסופו של דבר מגיעים לנווה מדבר שהוא המקום שאיתר עבורם ריבר. עם הגעתם לשם מבין מוריס שסיזר פצוע אנושות ובעודו גוסס מולו הוא מבטיח לסיזר שבנו הצעיר קורנליוס ידע מי הוא היה ומה הוא עשה עבור הקופים. הסרט מסתיים במותו של סיזר.