stanford-oval/wikipedia huggingface dataset:
ברוך קרוא
כתביו

גרי צדק - שתי אגדות עם, ברלין: מנורה, תרפ"א-1921.
מִלון שמושי לתלמוד, למדרש ולתרגום: עם פירוש המלות בעברית, באנגלית ובגרמנית ועם דוגמאות ומראי מקומות, (בהשתתפות א"מ זילברמן), לונדון: שפירא, וואלנטין ושותפיו, תרפ"ז, תש"ל, תל אביב: ברזני, 1996
תולדות הספרות: מראשיתה ועד ימינו, אנציקלופדיה תבל ומלאה, תל אביב: מ. מזרחי, 1962, 1964.
צרופי לשון: שלשת אלפים בטויים, עברית-גרמנית: גרמנית-עברית, ברלין: בית מסחר ספרים ראובן מס, תרצ"ב.
מלון תלמודי: ביאור עברי בתוספת מראי מקומות למלים ארמיות ויתר המלים הקשות שבתלמוד, ירושלים: אל המקורות, תשי"ז.
מלון עברי חדש, תל אביב: מצפה, תרצ"ו, תרצ"ט-1939, תש"ה.
מלון הארמית החיה: בעברית שבכתב ובדיבור ; בצירוף הסברים ומראי מקומות מן הספרות לדורותיה, תל אביב: יזרעאל, תש"ל-1970.
מלון בסיסי שמושי עברי אנגלי, תל אביב: ש’ פרידמן, 1963.
לכסיקון ראשי תיבות: פשר והסבר, בצירוף לוח המספרים ולוח השנים, תל אביב: שמש, תש"ה.
כתביו > בעריכתו

אברהם רובשוב, מלון רפואי עברי-רוסי;, תל אביב: יסוד, תשל"ב 1971. (עם אשר גולדשטיין)
ישראל צינברג, תולדות ספרות ישראל: מן הפייטנים הראשונים ומשוררי ספרד עד תקופת ההשכלה ברוסיה, מרחביה: ספרית פועלים, 1959–1960. (עם שלמה זלמן אריאל, דוד כנעני)
עם מ' וישניצר, רִמון: מאסף עתי לאמנות ולספרות; העריכה האמנותית בידי רחל וישניצר-ברנשטין, ברלין תרפ"ד.
ספר קהילת זלוצ’וב, עורך המשנה: אל' בונה (באומן), [תל אביב]: עידית - ארגון עולי זלוצ'וב, תשכ"ז.
מרגוט קלאוזנר, יוסף במצרים: חזיון תנכ"י בשני חלקים, תל אביב: ניב, תשכ"ו 1965.
וויטבסק, (בהשתתפות ועדת ספר וויטבסק), תל אביב: ארגון עולי וויטבסק והסביבה בישראל, תשי"ז.
אנציקלופדיה לספרות כללית וישראלית, (בהשתתפות חבר סופרים ומלומדים), תל אביב: מצפה, 1944, י' צ'צ'יק, תש"י, תשי"ג, 1961.
הערות שוליים

↑  הינדה קרופניק, דבר, 4 בדצמבר 1959 (נקרולוג);
ר' יעקב-יוסף בן הרב ר' חנוך קרופניק ז"ל, דבר, 17 בפברואר 1937 (מודעת אבל);
הינדה קרופניק (קרוא), דבר, 2 בדצמבר 1959 (מודעת אבל).
↑  הוענקו פרסי טשרניחובסקי לתרגום, על המשמר, 28 בנובמבר 1952.
↑  מ. קרוא למנוחת עולם, דבר, 23 בדצמבר 1954; מ. קרוא (קרופניק), על המשמר, 23 בדצמבר 1954; ד. ע., מנדל קרוא (שנה למותו), דבר, 12 בדצמבר 1955; מ. ק., לזכר נעדרים: מנדל קרוא (קרופניק) (עשר שנים למותו), דבר, 7 בדצמבר 1964.
| --- | --- |
בקרת זהויות :  NLI: 987007263668805171  PLWABN: 9810531061005606  BnF: cb13480198r (data)  GND: 1055431675  ISNI: 0000 0000 7975 3486  LCCN: no95011622  NKC: zmp20231173536  NTA: 143853945  RERO: 02-A003443402  SELIBR: 68786  SUDOC: 190665742  VcBA: 495/208417  VIAF: 52089778   WorldCat (עם VIAF): 52089778
ביל קוסבי

| --- | --- |

קוסבי ב-2011
 לידה:  12 ביולי 1937 (בן 87) פילדלפיה, פנסילבניה, ארצות הברית
 שם לידה:  William Henry Cosby Jr. 
 מדינה:  ארצות הברית 
 תקופת הפעילות:  1962–2015 (כ־53 שנים)
 מקום לימודים:  אוניברסיטת מסצ'וסטס אמהרסט  אוניברסיטת טמפל  תיכון ג'רמנטאון 
 בן או בת זוג:  Camille Cosby (25 בינואר 1964–?) 
 צאצאים:  Ennis Cosby, Evin Cosby, Erinn Cosby, Erika Ranee, Ensa Cosby 
 פרסים והוקרה:  מדליית ספינגארן (1985)  פרס פטל הזהב לתסריט הגרוע (1988)  פרס פטל הזהב - השחקן הגרוע ביותר (1988)  פרס פטל הזהב - הסרט הגרוע ביותר (1988)  פרס אמי לשחקן הטוב ביותר בסדרת דרמה (1966)  פרס אמי לשחקן הטוב ביותר בסדרת דרמה (1968)  פרס אמי לשחקן הטוב ביותר בסדרת דרמה (1967)  מדליית השלום של האו"ם (1987)  פרס פול רובסון (2006)  honorary degree from Spelman College (1986)  פרס מארק טוויין להומור אמריקני (2009)  פרס מריאן אנדרסון (2009)  אגדה חיה של ספריית הקונגרס  פרס תאודור רוזוולט (1982)  כוכב בשדרת הכוכבים בהוליווד  מדליית החירות הנשיאותית  פרס אמי לבידור בשעות היום  פרס מרכז קנדי  פרס גלובוס הזהב 
 www.billcosby.com
 פרופיל ב-IMDb
 
ויליאם הנרי "ביל" קוסבי הבן (באנגלית: William Henry "Bill" Cosby Jr.; נולד ב-12 ביולי 1937) הוא שחקן, קומיקאי, מפיק טלוויזיה ואקטיביסט לשעבר אמריקאי. הוא הורשע בעבירות מין וריצה עונש מאסר עד ביטול הרשעתו ב-30 ביוני 2021, אז הוחלט שישוחרר מהכלא.
ביוגרפיה

ביל קוסבי נולד בפילדלפיה, פנסילבניה לאם מטפלת ולאב שהצטרף לחיל הים האמריקני כשביל היה בן 8. ביל, שהיה האח הבכור, היה אחראי על שני אחיו הקטנים, ריצ'רד וקארל (להם היה אח צעיר נוסף שמת משיגרון). אף על פי שאמו עבדה יותר מעשר שעות ביום, ואביו שירת בצבא, משפחתו נאלצה למכור את ביתה עקב קשיים כלכליים, ולעבור לבית קטן בצפון פילדלפיה. על אף שהאזור היה קשה מבחינה חברתית, אמו של קוסבי הטיפה לו ולאחיו מסרים של שלום והקריאה להם מהתנ"ך ומספריו של מארק טוויין.
בבית הספר קוסבי היה אתלט מצטיין, קפטן נבחרת הכדורסל ונשיא ועד הכיתה. מורים רבים הבחינו כי למרות היותו אינטליגנטי, לא הייתה לו חיבה יתרה ללימודים, והיה עסוק בליצנות בזמן שחבריו למדו. בהגיעו לחטיבת הביניים נרשם לנבחרות הכדורסל, הפוטבול, הבייסבול והריצה. עובדה זו הקשתה עליו ללמוד, גם עקב עבודותיו לפני ואחרי בית הספר בצחצוח נעליים, סידור סחורה, ומכירת סחורות למיניהן. בתיכון עבר קוסבי לבית ספר קרוב יותר לבית אך לא עבר את כיתה י'. בנשרו מבית הספר החל לעבוד אצל סנדלר, ובהגיעו לגיל 18 הצטרף לצי ארצות הברית, שם שירת בבסיס קוונטיקו, בבסיס בניופאונדלנד ולברדור ובבית החולים הצבאי של הצי במרילנד. בשירותו הצבאי טיפל בפצועים במצב קשה ששבו ממלחמת קוריאה, ואז הבין את הצורך בחינוך. כשעזב את הצבא, סיים את לימודיו התיכוניים וקיבל מלגה לאוניברסיטת טמפל בפילדלפיה, שם היה חבר בנבחרת הריצה והיה מגן ימני בנבחרת הפוטבול. למרות זאת, עדיין היה עסוק בליצנות. בזמן לימודיו למד להיות ברמן בבר מקומי, שם גם גילה את כישרון המשחק שלו. הוא השלים את התואר רק ב-1971.
ביוגרפיה > קריירה

קוסבי עזב את האוניברסיטה והחליט להיות אמן סטנד-אפ בניו יורק. מ-1962 החלה הקריירה של קוסבי להמריא במהירות, במיוחד בזכות הופעתו בתוכנית The Tonight Show ב-1963 ופרסום האלבום "Very Funny... Right!" ב-1964. בזמן שקומיקאים רבים השתמשו בפרובוקציות ובחופש הביטוי שנכנס יותר ויותר לתחום הסטנד-אפ (בעיקר בזכות לני ברוס), יצר קוסבי הומור פשוט, נטול גסויות ומצליח, שכלל בעיקר חוויות מהילדות שלו. עובדה מפתיעה נוספת על ההומור של קוסבי היא שלמרות היותו קומיקאי אפרו-אמריקני (במיוחד בתקופה שהיו קומיקאים שחורים מעטים), הוא אינו משתמש בגזע כקלף לחיזוק הקומדיה או הסאטירה.
מ-1965 עד 1968, שיחק קוסבי בסדרת פעולה-ריגול בה כיכב יחד עם רוברט קלפ, בשם "אני מרגל" (אנ'). הסדרה רצה מ-1965 עד 1968, וזכתה להצלחה מועטה, אך קידמה את הקריירה של קוסבי. על תפקידו בסדרה זכה קוסבי שלוש פעמים ברציפות בפרס אמי.
עקב היותו מנחה אורח קבוע למדי בטונייט שואו, וכיכובו בתוכניות שנתיות של רשת הטלוויזיה NBC, הציעה לו הרשת ליצור תוכנית משלו, והוא נענה והחל לכתוב ולככב בסיטקום "המופע של ביל קוסבי" (אנ'): קומדיית מצבים שרצה במשך שתי עונות, מ-1969 עד 1971. בכך היה קוסבי לאפרו-אמריקאי הראשון ששיחק בתוכנית משלו.
במהלך שנות ה-70 יצר מספר תוכניות ילדים מצליחות. עבור מחקרו על אחת מהן (The Cosby Kids and fat Albert) קיבל ב-1976 תואר דוקטור לחינוך (.Ed.D) מאוניברסיטת מסצ'וסטס.
ההצלחה הטלוויזיונית הגדולה ביותר של קוסבי הגיעה בשנות ה-80 עם סדרת הקאלט "משפחת קוסבי" ששודרה מ-1984 עד 1992. את התוכנית יצר קוסבי וגם כיכב בה. הצלחתה של התוכנית התגברה, בין היתר, בזכות הופעות אורח של ענקי מוזיקה וקולנוע כגון: סמי דייוויס ג'וניור, סטיבי וונדר, נעמי קמפבל, בי. בי. קינג, פלאסידו דומינגו ועוד. במשך 5 עונות ניצבה הסדרה במקום הראשון בטבלת הרייטינג השנתית בארצות הברית. על משחקו בסדרה זו זכה קוסבי בשני פרסי גלובוס הזהב. מגזין פיפל כינה את יצירתו של קוסבי "מהפכנית".
ב-1987 קוסבי כתב, הפיק וכיכב בסרט "לאונרד חלק 6", פרודיה על סרטי ריגול. קוסבי לא היה מרוצה מעריכה והבימוי ולבסוף הוקיע את הסרט. הסרט גם זכה לביקורות על שכלל פרסום בולט של חברת קוקה קולה, ולא זכה להצלחה מסחרית.
ב-2002 הוענקה לו מדליית החירות הנשיאותית.
ביל קוסבי ניצב במקום ה-8 בקומדי סנטרל 100.
ב-2004 חתם קוסבי עם פוקס המאה ה-20 חוזה ליצירת סרט קומדיה על פי הדמות "אלברט השמן" מהסדרה "ילדי קוסבי ואלברט השמן" שיצר קוסבי בשנות ה-70, כשקינן תומפסון מגלם את דמותו.
מאז ילדותו הייתה לקוסבי חיבה לג'אז, והוא אף אירח את חתונתו של חברו הטוב מיילס דייוויס ב-1981.
לאורך הקריירה הוציא קוסבי 33 אלבומי קומדיה.
ב-2004 יצר קוסבי סדרת אנימציה "בשם האבא" שמבוססת על ספרו, שמדברת על משפחה אפרו אמריקאית שמתמודדת עם בעיות חיים ובגרות, אבל אחרי שתי עונות הסדרה בוטלה ב-2005.
ב-2014 החל בהפקת סדרת קומדיית מצבים חדשה, עבור רשת אן-בי-סי. אך הרשת החליטה לבטל את סדרה לאחר שנשים שונות אמרו שקוסבי תקף אותן מינית. פרויקט נוסף של קוסבי, שאמור היה לעלות בנטפליקס, בוטל גם הוא.
ביוגרפיה > חייו האישיים

קוסבי פגש את אשתו, קמילה, כשהופיע בוושינגטון, ונישא לה ב-1964. נולדו להם 4 בנות ובן. ב-1997, במהלך שוד, נורה בנו למוות. ב-1998 ניסתה צעירה בת 22 לתבוע אותו בטענה שהוא אביה הביולוגי, אך הוא דחה את הטענה, אף שהודה כי קיים יחסי מין עם אמה פעם אחת, ולמרות זאת שלח לה ולאמה כסף עד שהגיעה לגיל 18.
עמדות פוליטיות

קוסבי מתנגד להעדפה מתקנת, בטענה שהיא מזיקה לקהילה האפרו-אמריקנית בכך שהיא מבדילה אותה מהלבנים.
קוסבי היה האמן הראשון שהחרים את העיר סינסינטי שבאוהיו עקב מהומות גזעניות שהתרחשו בעיר. בעקבותיו החלו אמנים רבים אחרים להחרים את העיר.
הוא נשא את "נאום העוגה" שמחה על האשמות השחורים כנגד החברה ומערכת החוק בארצות הברית בעוון גזענות.
ביופייתון

| --- | --- |

 מפתח:  בראד צ'פמן, ג'ף צ'אנג
 מחזור חיים:  2000–הווה (כ־24 שנים)
 גרסה אחרונה:  1.74 (16 בספטמבר 2019)
 מערכת הפעלה:  פלטפורמות רבות
 נכתבה בשפות:  Python and C
 סוג רישיון:  Biopython License
 קוד מקור:  https://github.com/biopython/biopython 
 קטגוריה:  ביואינפורמטיקה
 biopython.org
 
פרויקט ביופייתון (באנגלית: Biopython) הוא אוסף של כלי פייתון לא מסחריים בקוד פתוח לביולוגיה חישובית וביואינפורמטיקה, שנוצר על ידי איגוד בינלאומי של מפתחים. הוא מכיל מחלקות לייצוג רצפים ביולוגיים ואנוטציות רצף, והוא מסוגל לקרוא ולכתוב למגוון פורמטים של קבצים. דבר זה מאפשר גישה פרוגרמטית למאגרי מידע מקוונים של מידע ביולוגי, כמו המאגר ב-NCBI. בנוסף לכלים בביופייתון קיימים מודולים נפרדים אשר מרחיבים את הכלים ליישור רצפים, מבנה חלבונים, גנטיקה של אוכלוסייה, פילוגנטיקה, מוטיבים של רצף ולמידת מכונה. פרויקט הביופייתון הוא אחד מתוך מספר פרויקטים של *Bio אשר נועדו להפחית שכפול קוד בביולוגיה חישובית.
היסטוריה

פיתוח הביופיתון החל בשנת 1999 והוא שוחרר לראשונה ביולי 2000. זמן הפיתוח של פרויקט זה וכן מטרותיו היו דומות ואף מקבילות לפרויקטים אחרים שמטרותיהם היו להוסיף יכולות של ביואינפורמטיקה לשפות תכנות, כמו BioPerl,‏ BioRuby ו-BioJava. המפתחים הראשונים בפרויקט כללו את ג'ף צ'אנג, אנדרו דאלק ובראד צ'פמן, אם כי למעלה ממאה אנשים תרמו עד כה. בשנת 2007 הוקם פרויקט פייתון דומה בשם PyCogent.
ההיקף הראשוני של ביופיתון כלל גישה, אינדקס ועיבוד קובצי רצף ביולוגיים. אף על פי שיכולות אלה עדיין מוקד מרכזי בפרויקט, במהלך השנים פותחו מודולים נוספים אשר הרחיבו את הכלים ומאפשרים כיסוי גבוה יותר לתחומי ביולוגיה נוספים (ראו מאפייני מפתח ודוגמאות).
החל מגרסה 1.62, ביופייתון תומך בריצה בפייתון 3 ובפייתון 2.
עיצוב

במידת האפשר, ביופייתון עוקב אחר המוסכמות בהן משתמשת שפת התכנות פייתון וזאת בשביל להקל על קהל המשתמשים המכירים את פייתון. לדוגמה, ניתן לטפל באובייקטים של Seq ו-SeqRecord באמצעות חיתוך (slicing), באופן הדומה למחרוזות ולרשימות של פייתון. הוא נועד להיות דומה באופן פונקציונלי לפרויקטים אחרים של *Bio, כגון BioPerl.
לכל אחד מהכלים הפונקציוניליים של ביופייתון יש את היכולת לקרוא ולכתוב לקבצים בפורמטים הנפוצים ביותר. הרישיון של ביופייתון תואם לרוב רישיונות התוכנה האחרים, דבר המאפשר שימוש בו במגוון פרויקטים של תוכנה.
תכונות עיקריות ודוגמאות > רצפים

מושג מרכזי בביופייתון הוא הרצף הביולוגי, וזה מיוצג על ידי מחלקה בשם Seq. אובייקט Seq בביופייתון דומה למחרוזת בפייתון במובנים רבים: הוא תומך בסינטקס ה-slice של פייתון, ניתן לשרשר אותו לרצפים אחרים והוא אינו ניתן לשינוי (immutable). בנוסף, קיימות פונקציות ספציפיות לרצפים וכן ניתן לפרט את האלף-בית הביולוגי בו נעשה שימוש.
>>> # This script creates a DNA sequence and performs some typical manipulations
>>> from Bio.Seq import Seq
>>> from Bio.Alphabet import IUPAC
>>> dna_sequence = Seq('AGGCTTCTCGTA', IUPAC.unambiguous_dna)
>>> dna_sequence
Seq('AGGCTTCTCGTA', IUPACUnambiguousDNA())
>>> dna_sequence[2:7]
Seq('GCTTC', IUPACUnambiguousDNA())
>>> dna_sequence.reverse_complement()
Seq('TACGAGAAGCCT', IUPACUnambiguousDNA())
>>> rna_sequence = dna_sequence.transcribe()
>>> rna_sequence
Seq('AGGCUUCUCGUA', IUPACUnambiguousRNA())
>>> rna_sequence.translate()
Seq('RLLV', IUPACProtein())
תכונות עיקריות ודוגמאות > אנוטציית רצף

המחלקה SeqRecord מתארת רצפים, בנוסף למידע כגון שם, תיאור ותכונות בצורה של אובייקטים מסוג SeqFeature. כל אובייקט SeqFeature מציין את סוג התכונה ואת מיקומה. סוגי תכונות יכולים להיות 'גן', 'CDS' (אזור מקודד), 'אזור חוזר', 'אלמנט נייד' וכו', ומיקום התכונות ברצף יכול להיות מדויק או משוער.
>>> # This script loads an annotated sequence from file and views some of its contents.
>>> from Bio import SeqIO
>>> seq_record = SeqIO.read('pTC2.gb', 'genbank')
>>> seq_record.name
'NC_019375'
>>> seq_record.description
'Providencia stuartii plasmid pTC2, complete sequence.'
>>> seq_record.features[14]
SeqFeature(FeatureLocation(ExactPosition(4516), ExactPosition(5336), strand=1), type='mobile_element')
>>> seq_record.seq
Seq('GGATTGAATATAACCGACGTGACTGTTACATTTAGGTGGCTAAACCCGTCAAGC...GCC', IUPACAmbiguousDNA())
תכונות עיקריות ודוגמאות > קלט ופלט

ביופייתון יכול לקרוא ולכתוב למספר פורמטים נפוצים של רצף, כולל פורמט FASTA,‏ פורמט FASTQ,‏ GenBank,‏ Clustal‏, PHYLIP ו-NEXUS. בעת קריאת קבצים, מידע תיאורי בקובץ משמש להגרת משתנים במחלקות של ביופייתון, כגון SeqRecord. זה מאפשר המרת רשומות של פורמט קובץ אחד לאחר.
קובצי רצף גדולים מאוד יכולים לחרוג ממשאבי הזיכרון של המחשב, לכן ביופייתון מספק אפשרויות שונות לגישה לרשומות בקבצים גדולים. ניתן לטעון אותם לזיכרון של מבני נתונים של פייתון, כגון רשימות או מילונים, אשר מספקים גישה מהירה למחיר של שימוש בזיכרון. לחלופין, ניתן לקרוא את הקבצים מהדיסק לפי הצורך, עם ביצועים איטיים יותר אך דרישות זיכרון נמוכות יותר.
>>> # This script loads a file containing multiple sequences and saves each one in a different format.
>>> from Bio import SeqIO
>>> genomes = SeqIO.parse('salmonella.gb', 'genbank')
>>> for genome in genomes:
... SeqIO.write(genome, genome.id + '.fasta', 'fasta')
תכונות עיקריות ודוגמאות > גישה למאגרי מידע מקוונים

דרך מודל Bio.Entrez משתמשים של ביופייתון יכולים להוריד נתונים ביולוגיים ממאגרי NCBI. כל אחת מהפונקציות המסופקות על ידי מנוע החיפוש של Entrez זמינות באמצעות פונקציות במודול זה, כולל חיפוש והורדת רשומות.
>>> # This script downloads genomes from the NCBI Nucleotide database and saves them in a FASTA file.
>>> from Bio import Entrez
>>> from Bio import SeqIO
>>> output_file = open('all_records.fasta', "w")
>>> Entrez.email = 'my_email@example.com'
>>> records_to_download = ['FO834906.1', 'FO203501.1']
>>> for record_id in records_to_download:
... handle = Entrez.efetch(db='nucleotide', id=record_id, rettype='gb')
... seqRecord = SeqIO.read(handle, format='gb')
... handle.close()
... output_file.write(seqRecord.format('fasta'))
תכונות עיקריות ודוגמאות > תולדות הגזע

המודול Bio.Phylo מספק כלים לעבודה עם ויזואליזציה של עצים פילוגנטיים. קבצים במגוון פורמטים נתמכים לקריאה וכתיבה, כולל Newick,‏ NEXUS ו-phyloXML. מניפולציות נפוצות של עצים וכן מעבר על העץ בשיטות שונות נתמכות דרך האובייקטים Tree ו-Clade. דוגמאות כוללות המרה ואיסוף קובצי עץ, חילוץ תתי קבוצות מעץ, שינוי שורש עץ וניתוח תכונות ענפים כגון אורך או ציון.
ניתן לצייר עצים מושרשים ב-ASCII או להשתמש ב-matplotlib (ראו איור 1), וניתן להשתמש בספריית Graphviz ליצירת פריסות לא שורשיות (ראו איור 2).
תכונות עיקריות ודוגמאות > דיאגרמות גנום

מודול GenomeDiagram מספק שיטות להמחשת רצפים בתוך ביופייתון. ניתן לצייר רצפים בצורה ליניארית או מעגלית (ראו איור 3), וכן נתמכים פורמטי פלט רבים, כגון PDF ו-PNG. הדיאגרמות נוצרות על ידי יצירת מסלולים ולאחר מכן הוספת מאפייני רצף למסלולים אלה. ניתן לשלוט על התצוגה של הדיארמה הסופית בעזרת לולאה שתרוץ על מאפייני הרצף, ושימוש בתכונות המאפיינים כדי להחליט אם וכיצד הם מתווספים למסלולי הדיאגרמה. ניתן לצייר קישורים צולבים בין מסלולים שונים, אשר מאפשרים השוואת רצפים מרובים בתרשים יחיד.
תכונות עיקריות ודוגמאות > מבנה מקרומולקולרי

המודול Bio.PDB יכול לטעון מבנים מולקולריים מקבצי PDB ו-mmCIF, והוא נוסף לביופייתון בשנת 2003. אובייקט מסוג Structure מרכזי במודול זה, והוא מארגן מבנה מקרומולקולרי בצורה היררכית: אובייקטים מסוג Structure מכילים אובייקטים מסוג Model המכילים אובייקטים מסוג Chain המכילים אובייקטים מסוג Residue המכילים אובייקטים מסוג Atom. שאריות ואטומים לא מאורגנים מקבלים מחלקות משלהם, DisorderedResidue ו-DisorderedAtom בהתאמה, המתארות את מיקומיהם הלא-ודאיים.
שימוש ב-Bio.PDB מאפשר לנווט בין רכיבים בודדים בקובץ מבנה מקרומולקולרי, כמו בחינת כל אטום בחלבון. ניתן לבצע ניתוחים כגון מדידת מרחקים או זוויות, השוואת שאריות וחישוב עומק השאריות.
תכונות עיקריות ודוגמאות > גנטיקה של אוכלוסייה

מודול ה-Bio.PopGen מוסיף תמיכה ל-Biopython for Genepop, חבילת תוכנה לניתוח סטטיסטי של גנטיקה של אוכלוסייה. דבר זה מאפשר ניתוח של שיווי משקל הארדי-וויינברג, תאחיזה לא שוויונית ותכונות אחרות של תדירות אללים באוכלוסייה.
מודול זה גם יכול לבצע סימולציות גנטיות של אוכלוסיות באמצעות תאוריית ה-"coalescent" בתוכנית fastimcoal2.
תכונות עיקריות ודוגמאות > עטיפות לכלי שורת פקודה

רבים מהמודולים של ביופייתון מכילים עטיפות של שורת פקודה לכלים נפוצים, מה שמאפשר להשתמש בכלים אלה מתוך ביופיתון. עטיפות אלה כוללות BLAST,‏ Clustal,‏ PhyML,‏ EMBOSS ו-SAMtools. משתמשים יכולים לסווג מחלקת עטיפה כללית כדי להוסיף תמיכה לכל כלי שורת פקודה.
ברטון מלכיאל

| --- | --- |
אין תמונה חופשית
 לידה:  28 באוגוסט 1932 (בן 92) בוסטון, ארצות הברית 
 ענף מדעי:  בורסה לניירות ערך 
 מקום לימודים:  בית הספר לעסקים של הרווארד  אוניברסיטת פרינסטון  בית הספר הלטיני של בוסטון 
 מנחה לדוקטורט:  ויליאם באומול 
 מוסדות:  אוניברסיטת פרינסטון 
 תלמידי דוקטורט:  Alvin K. Klevorick 
 פרסים והוקרה:  פרס סמית' ברידן (2001) 
 
ברטון גורדון מלכיאל (באנגלית: Burton Gordon Malkiel; נולד ב-28 באוגוסט 1932) הוא כלכלן אמריקאי, מפורסם בעיקר בשל ספרו הליכת אקראי בוול סטריט(אנ').
מלכיאל הוא תומך מובהק בתאוריית השוק היעיל הטוענת שמחיר המוצרים הפומביים משקפים את כל האינפורמציה הגלויה לגביהם, למרות שטען שבשווקים מסוימים יש עדויות למחירים שאינם אקראיים.
בספרו "הליכת אקראי בוול סטריט" טען ברטון ש”קוף עיוור הזורק חיצים על עיתון כלכלי יכול לבחור תיק השקעות טוב במידה שווה לתיק השקעות שנבחר על ידי מומחה”. טענה זו נבחנה ב-1988 על ידי Wall Street Journal שקיים תחרויות בין מומחים והציבור לתיק השקעות שנבחר בעזרת זריקת חיצים ונקרא הקוף. לאחר 100 תחרויות נמצא שהמומחים זכו רק ב-61% מהתחרויות מול הקוף. המושג תיק השקעות של הקוף הפך לשם נרדף לתיק השקעות שנבנה ללא ידע מומחה והיום בעיתונים כלכליים נהוג פעמים רבות להציג בתחרויות משקיעים תיק המייצג את המדד ונקרא קוף.
ספריו

הליכת אקראי בוול סטריט - הדרך הבדוקה להשקעה מוצלחת בשוק ההון. בעברית יצא בהוצאת ידיעות ספרים
בעלי אלשרח

בעלי אַלְשַׁרְח הם קבוצה של עשרות חכמים מתימן מתקופת הראשונים (בין המאות ה-13 וה-16), שחיברו חיבורי אלשרח.
אלשרח

"אַלְשַׁרְח" (בתרגום מערבית: פירוש) הוא השם בו כינו יהודי תימן פירושים על כל משנה תורה לרמב"ם שחוברו על ידי חכמי תימן. פירושים אלה חוברו בתקופת הראשונים, במשך כמאתיים שנה, בין המאות ה-13 וה-16.
פירוש אלשרח נועד לתאם את פסיקת הרמב"ם עם דברי התלמוד. בפירושי השרח משולבים דברי גאונים רבים שלא שרדו במקומות אחרים. פירושי השרח משקפים שיטת לימוד של בית מדרש עצמאי, שמהווים המשך לתורת גאוני בבל.
רוב מוחלט של פירושי אלשרח עדיין נמצאת בכתבי יד בידי יחידים וספריות שונות, ולא הודפסו עקב חסרון בתי דפוס בתימן, ולכן אינם מוכרים לרוב ציבור הלומדים.
כמות פירושי אלשרח בהלכות שחיטה וטריפות הוא גדול ביחס לשאר הנושאים, מפני המצב בתימן שבה אכילת בשר היה עיקר המזון.
קיטלוג של בעלי השרח וחיבוריהם פורסם בספר "תורתן שלבני תימן" שחיבר פרופ' יהודה רצהבי.
בעלי אלשרח מפורסמים

מארי חנניה בן ישועה
מארי נתנאל בן ישעיה
מארי זכריה הרופא
מארי סעדיה עדני
מארי דוד הלוי חמדי
| הראשונים לפי אזור גאוגרפי |
| --- | --- | --- |
| אשכנז | רבי משולם בן קלונימוס • רבנו גרשום מאור הגולה • רבי שמעון הגדול • רבי יצחק הלוי • רבי יעקב בן יקר • ריב"א • ראב"ן • רבי אליעזר ממיץ • ראבי"ה • רבי יהודה החסיד • רבי אלעזר מגרמייזא (הרקח) • רבי יצחק אור זרוע • מהר"ם מרוטנבורג • רא"ש • המרדכי • הגהות מיימוניות • תשב"ץ קטן • רבי אליעזר מטוך • רבי יצחק מדורא • האגודה • מהר"ם ס"ל • מהרא"ק • מהר"י טירנא • מהרי"ל • מהר"י וייל • תרומת הדשן • ראשונים נוספים |  |
| צרפת | רש"י • בעלי התוספות (רשב"ם • רבנו תם • ר"י הזקן • ריצב"א • רבי שמשון משאנץ) • בעל התרומה  • רבי משה מקוצי • רבי יחיאל מפריז • יצחק מקורביל (הסמ"ק) • רבנו פרץ • חכמי איוורא • רבי שמשון מקינון •  ראשונים נוספים |  |
| אנגליה | תוספות חכמי אנגליה • רבנו תם מאורליינש • רבי משה מלונדריש • רבי ברכיה מניקולא • רבי אליהו מנחם מלונדריש • רבי יעקב חזן מלונדון • ראשונים נוספים |  |
| פרובאנס | בעל האשכול • יוסף אבן פלאת • בעל העיטור • בעל המאור • הראב"ד • רבי יהונתן מלוניל • המנהיג • בעל שיטת ריב"ב • בעל ההשלמה • רבי שלמה מן ההר • רבי אברהם מן ההר • המאירי • רבי אהרון הכהן מלוניל • ראשונים נוספים |  |
| ספרד | ארבעת השבויים • רבי חנוך בן משה • רבי שמואל הנגיד • רי"ץ גיאת • רבי יצחק הברצלוני • רבי יהודה הברצלוני • רי"ף • ר"י מיגאש • רמ"ה • רבי שמואל הסרדי • רמב"ן • רבי יונה גירונדי • רא"ה • רשב"א • ריטב"א • רבי יהודה בן הרא"ש • רבנו ירוחם • מהר"ם חלאווה • אבודרהם • רבי יעקב בעל הטורים • ר"ן • רבי יוסף חביבא • רבי שמואל ירונדי (אוהל מועד) |  |
| איטליה | רבי משולם בן קלונימוס • רבי נתן מרומי (הערוך) • רבי ישעיה די טראני • רבי אליעזר בן שמואל • ריבב"ן • שבלי הלקט • ריא"ז • מהרי"ק • ראשונים נוספים |  |
| צפון אפריקה | ארבעת השבויים • רבנו חננאל • רב ניסים גאון • רי"ף • רבנו אפרים • רבי יהודה הכהן אבן סוסאן • רבי יוסף אבן עקנין • שמואל אבן ג'אמע • רבי זכריה אגמאתי • ריב"ש • רשב"ץ • רבי ישועה הלוי • רבי אפרים אנקוה |  |
| תימן | בעלי אלשרח (רבי חנניה בן ישועה • רבי נתנאל בן ישעיה • רבי זכריה הרופא • רבי סעדיה עדני • רבי דוד הלוי חמדי • רבי דוד עדני • רבי אברהם בן שלמה |  |
| מצרים | רבי שמריה בן אלחנן • רבי שמואל בן חנניה הנגיד •  רמב"ם •  רבי חננאל בן שמואל • רבי אברהם בן הרמב"ם • רב יוסף ראש הסדר • רבי פרחיה בן ניסים •  רבי דוד הנגיד • רבי תנחום הירושלמי • רבי יהושע הנגיד • רבי דוד ברבי יהושע הנגיד • ראשונים נוספים |  |
ראשונים נוספים תנאים • אמוראים • סבוראים • גאונים • ראשונים • אחרונים
ביל פקסטון

| --- | --- |

ביל פקסטון, 2014
 לידה:  17 במאי 1955 פורט וורת', טקסס ,ארצות הברית
 פטירה:  25 בפברואר 2017 (בגיל 61) לוס אנג'לס, ארצות הברית 
 מקום קבורה:  פארק הזכרון פורסט לוון 
 מדינה:  ארצות הברית 
 תקופת הפעילות:  מ-1975
 מקום לימודים:  אוניברסיטת ניו יורק  בית הספר למשחק סטלה אדלר  תיכון ארלינגטון הייטס  Richmond, The American International University in London 
 בן או בת זוג:  Kelly Rowan  Louise Newbury 
 צאצאים:  ג'יימס פקסטון 
 מספר צאצאים:  2 
 פרסים והוקרה:  פרס גילדת שחקני המסך לצוות השחקנים הטוב ביותר בסרט קולנוע (1996) 
 פרופיל ב-IMDb
 
ויליאם "ביל" פקסטון (באנגלית: William "Bill" Paxton;‏ 17 במאי 1955 - 25 בפברואר 2017) היה שחקן קולנוע ובמאי אמריקאי, שידוע מתפקידיו בסרטים כגון "שובו של הנוסע השמיני" (1986), טומבסטון עיר ללא חוק (1993), "שקרים אמיתיים" (1994), "אפולו 13" (1995), "טוויסטר" (1996), "טיטניק" (1997), "סופר ג'ו יאנג" (אנ') (1998) ו"צוללת U-571"‏ (2000). היו לו גם תפקידי משנה בסרטים "חלומות צעירים" (1985), "קצה המחר" (2014) ו"חיית הלילה" (2014).
פקסטון כיכב בתור ביל הנריקסון (אנ') בסדרת הדרמה של HBO, "אהבה גדולה" (2006–2011), עבורו קיבל שלוש מועמדויות לפרס גלובוס הזהב. הוא היה מועמד לפרס אמי ולפרס גילדת שחקני המסך על גילום רנדולף מק'קוי (אנ') במיני סדרה של ערוץ ההיסטוריה "הטפילד ומק'קוי" (אנ') (2012).
ביוגרפיה

ביל פקסטון נולד בפורט וורת', טקסס, ב-17 במאי 1955, בנם של מרי לו (לבית גריי; 1926–2016) וג'ון ליין פקסטון (1920–2011). אמו הייתה קתולית שגידלה אותו ואת אחיו באמונתה. אביו היה איש עסקים, סיטונאי עצים, בכיר במוזיאון, (ובמהלך הקריירה של בנו) שחקן מדי פעם, בעיקר הופיע בסרטי ספיידרמן של סם ריימי בתור ברנרד האוסמן ולצד פקסטון בסרט "תוכנית פשוטה" (1998). פקסטון היה ממוצא אוסטרי, הולנדי, אנגלי, צרפתי, גרמני, נורווגי, סקוטי-אירי, שווייצרי ולשי. סבא רבא-רבא שלו היה אלישה פרנקלין פקסטון (אנ') (1828–1863), בריגדיר גנרל בצבא הקונפדרציה במהלך מלחמת האזרחים האמריקנית שנהרג בפיקוד על חטיבת סטונוול (אנ') בקרב צ'נסלרסוויל (אנ').
פקסטון היה קרוב משפחה רחוק של השחקנית שרה פקסטון והיה אחיינה רבא של מרי פקסטון קילי, עיתונאית בולטת וחברה קרובה של הגברת הראשונה בס טרומן. בגיל שמונה, הוא היה בקהל כשהנשיא ג'ון קנדי הגיח ממלונו בפורט וורת' בבוקר ההתנקשות בו ב-22 בנובמבר 1963. תמונות של פקסטון הנמצא בקהל מוצגות במוזיאון הקומה השישית (אנ') בדאלאס, טקסס. מאוחר יותר הוא היה שותף להפקת הסרט "פארקלנד" (אנ') (2013) אודות ההתנקשות בג'ון קנדי.
הוא סיים את לימודיו בבית הספר התיכון ארלינגטון הייטס (אנ') בפורט וורת' ב-1973, ולאחר מכן למד בריצ'מונד קולג' (אנ') בלונדון, לצד חברו הוותיק לתיכון דני מרטין. שם, הם פגשו את יליד טקסס, טום האקבי, איתו הם עשו סרטי סופר 8 קצרים שעבורם הם בנו סטים משלהם. אחד התפקידים הראשיים הראשונים של פקסטון היה בסרטו הניסיוני של האקבי "Taking Tiger Mountain"‏ (1983). לאחר מכן עבר פקסטון ללוס אנג'לס, שם עבד בתור מעצב בסרטיו של במאי הסרטים רוג'ר קורמן, וכמחנה רכבים במלון בוורלי הילס. לאחר שנדחה על ידי בתי ספר לקולנוע בדרום קליפורניה, הוא החליף את שאיפותיו מבימוי למשחק, לשם כך נסע לניו יורק, שם למד אצל השחקנית סטלה אדלר.