stanford-oval/wikipedia huggingface dataset:
שקרן שקרנית
דמויות ושחקנים

ג'ואן פרוגט – לורה נילסון, מורה חכמה ומסורה שנפרדה מהחבר שלה.
יואן גריפית' – אנדרו ארלהם, מנתח מוכר שבנו לוק הוא תלמיד בבית הספר בו לורה מלמדת.
זואי טאפר – קייטי סטקליף, אחותה הגדולה של לורה, שעובדת עם אנדרו בבית החולים המקומי.
וורן בראון – השוטר טום ביילי, החבר לשעבר של לורה, שהיה לו רומן עם אחותה קייטי.
ריצ'י קמפבל – ליאם סטקליף, בעלה של קייט ואבי שני ילדיה
ג'יימי פלאטרס – לוק ארלהם, בנו של אנדרו ותלמיד בכיתתה של לורה
שלי קון – מפקחת בילוש ונסה הרמון, בלשית במשטרה שחוקרת את האשמה של לורה באונס.
דני וב – סמל בילוש רורי מקסוול, בלש במשטרה כפוף לוונסה הרמון
קתרין קלי – מפקחת בילוש קארן רנטון (עונה שנייה)
איימי נוטל – ויני פיטרסון (עונה שנייה)
הווארד צ'ארלס – קארל פיטרסון (עונה שנייה)
דרמוט קראולי – הנרי נילסון (עונה שנייה)
פיטר דייוויסון – דניס וולטרס
קירן ביו – איאן
ג'יל האפפני – ג'ניפר
לורה אייקמן – שרלוט
קלייר היגינס – פליסיטי קסידי
דון סטיל – קתרין מקולי
הפקה

ב-15 באפריל 2016 הוכרז על הסדרה "שקרן שקרנית" כהפקה ראשונה של Two Brothers Pictures. ב-30 בספטמבר 2016 הוזמנה הסדרה על ידי חברת הכבלים האמריקאית SundanceTV ורשת השידור הבריטית ITV. הצילומים החלו בלונדון ובקנט בנובמבר 2016. צילומי הביצות נערכו בטולסברי שבאסקס. חוף הים צולם בדיל, בקינגסדאון ובוולמר. הצילומים בתוך העיר נערכו בברוקלי, נאנהד, שורטלנדס (פרק 3), סאות' אילינג ואדינבורו (פרק 4). צילומים נוספים בחוף הים נערכו בוולפול ביי שבמרגייט במחוז קנט.
אחרי סיום העונה הראשונה ב-16 באוקטובר 2017, פורסם שהסדרה תחזור לעונה שנייה. קו העלילה מתמקד בחקירת מקרה הרצח שבסיום העונה הראשונה. פרוגט וגריפית' חזרו לשחק בעונה זו.
פרקים

| מס' בסדרה | מס' בעונה | שם הפרק | בימוי | תסריט | תאריך שידור מקורי |
| --- | --- | --- | --- | --- | --- |
| 1 | 1 | "הפגישה" | ג'יימס סטרונג | הארי ויליאמס וג'ק ויליאמס | 11 בספטמבר 2017 |
לורה, מורה במקצוע, יוצאת לדייט עם אנדרו ארלהם, אותו היא מאשימה אחר כך שאנס אותה. מי מהם משקר?
| 2 | 2 | "ברור לי שזה שקר" | ג'יימס סטרונג | הארי ויליאמס וג'ק ויליאמס | 18 בספטמבר 2017 |
אנדרו ולורה לוקחים פסק זמן מעבודתם. העבר של לורה מתגלה, ודמות מעברה חוזר לרדוף אותה.
| 3 | 3 | "ארנב לבן" | ג'יימס סטרונג | הארי ויליאמס וג'ק ויליאמס | 25 בספטמבר 2017 |
אחת התלמידות של לורה נזקקת לעזרתם של לורה ושל אנדרו. המשטרה מחליטה לא להעמיד לדין את אנדרו. בעלה של קייט מתחיל לחשוד בה.
| 4 | 4 | "קתרין" | סמואל דונובן | הארי ויליאמס וג'ק ויליאמס | 2 באוקטובר 2017 |
לורה נוסעת לאדינבורו כדי לגלות דבר מה על מותה של מרי, אשתו של אנדרו, ומגלה שחברתה של מרי, קתרין, אף היא נפלה קורבן למעשיו של אנדרו.
| 5 | 5 | "שחמט" | סמואל דונובן | הארי ויליאמס וג'ק ויליאמס | 9 באוקטובר 2017 |
לורה נחושה להביא את אנדרו לדין ומגייסת את טום לעזרה. כשהיא מגלה את ההונאה בחייה הפרטיים, היא פונה לדרכים מסוכנות כדי לתפוס את אנדרו.
| 6 | 6 | "הביצות" | סמואל דונובן | הארי ויליאמס וג'ק ויליאמס | 16 באוקטובר 2017 |
שלושה חודשים אחר כך אנדרו מבקש מלוק שיתן לו אליבי. לורה מחליטה להמשיך בחייה, עד שהיא פוגשת שוב את אנדרו. מתברר שוונסה אינה יכולה להוכיח את אשמתו של אנדרו. לורה מבינה שאנדרו הסריט את מעשיו, ותוצאות המאבק הסופי ביניהם הן אלימות.
שידור

שידור הבכורה של הסדרה בערוץ ITV היה ב-11 בספטמבר 2017 בשעה 9:00 בערב, במקביל לסדרה "רליק" ששודרה באותו זמן בערוץ BBC One. ברשת הכבלים SundanceTV שודרה הסדרה ב-27 בספטמבר 2017.
הערות שוליים

1 2 3  Petski, Denise (30 בספטמבר 2016). "Joanne Froggatt & Ioan Gruffudd To Star In 'Liar' For Sundance TV & ITV". Deadline.com. {{cite web}}:  (עזרה)
↑  Barraclough, Leo (15 באפריל 2016). "'The Missing' Writers Harry and Jack Williams Unveil Thriller 'Liar'". Variety. {{cite web}}:  (עזרה)
↑  Holloway, Daniel (30 בספטמבר 2016). "Sundance TV, ITV Partner for 'Liar' Starring Joanne Froggatt, Ioan Gruffudd". Variety. {{cite web}}:  (עזרה)
↑  "Where is Liar filmed? The Deal and Kingsdown Kent filming locations for the ITV drama series revealed". 16 באוקטובר 2017. {{cite web}}:  (עזרה)
↑  Moon, Ra. "Filming locations and pictures". atlasofwonders.com. נבדק ב-29 באוקטובר 2017. {{cite web}}:  (עזרה)
↑  Kent Film Office. "Kent Film Office Liar Article". אורכב מ-המקור ב-2018-10-31. נבדק ב-2018-10-30.
↑  Meechan, Lauren (17 באוקטובר 2017). "Liar season 2: Joanne Froggatt and Ioan Gruffudd WILL return for another series". Express. נבדק ב-17 באוקטובר 2017. {{cite web}}:  (עזרה)
↑  Griffiths, Eleanor Bley (19 ביוני 2017). "Downton's Joanne Froggatt is a serious schoolteacher in first-look image from ITV thriller Liar". Radio Times. {{cite web}}:  (עזרה)
רצף חוזר

רצפים חוזרים (הידועים גם כאלמנטים חוזרים, יחידות חוזרות או חזרות) הם תבניות קצרות או ארוכות של חומצות גרעין (DNA או RNA) המופיעות במספר עותקים ברחבי הגנום. באורגניזמים רבים, חלק ניכר מה-DNA חוזר על עצמו, כאשר למעלה משני שלישים מהרצף מורכב מאלמנטים חוזרניים בבני אדם. חלק מהרצפים החוזרים הללו נחוצים לשמירה על מבני גנום חשובים כגון טלומרים.
רצפים חוזרים מסווגים לסיווגים שונים לפי תכונות כגון מבנה, אורך, מיקום, מוצא ואופן ההכפלה.
בעוד שרצפי DNA חוזרים מסוימים חשובים לתפקוד הסלולרי ולתחזוקת הגנום, רצפים חוזרים יכולים גם לפגוע. רצפי DNA רבים שחוזרים על עצמם נקשרו למחלות אנושיות כמו מחלת הנטינגטון ואטקסיה של פרידרייך. חלק מהאלמנטים החוזרים על עצמם הם נייטרליים ומתרחשים כאשר אין העדפה עבור רצפים ספציפיים בהתאם לאופן שבו מתרחשת טרנספוזיציה או מעבר. עם זאת, שפע של חזרות נייטרליות יכול להשפיע על התפתחות הגנום כפי שהם מצטברים עם הזמן. בסך הכל, רצפים חוזרים הם תחום מיקוד חשוב מכיוון שהם יכולים לספק תובנה לגבי מחלות אנושיות והתפתחות הגנום.
היסטוריה של גילוי

בשנות ה-50, ברברה מקלינטוק צפתה לראשונה בשינוי מיקום של DNA והמחישה את תפקידי הצנטרומר והטלומר בסימפוזיון Cold Spring Harbor. עבודתו של מקלינטוק הכינה את הבמה לגילוי רצפים חוזרים, מכיוון שהטרנספוזיציה, מבנה הצנטרומר ומבנה הטלומרים נוצרו כולם באמצעות אלמנטים שחוזרים על עצמם, אך הדבר לא הובן במלואו באותה תקופה. המונח "רצף חוזר" שימש לראשונה על ידי רוי ג'ון בריטן ו-DE Kohne ב-1968; הם גילו שיותר ממחצית מהגנומים האאוקריוטים (עם גרעין) היו עם DNA שחוזר על עצמו באמצעות הניסויים שלהם על חיבור מחדש של DNA. למרות שרצפי ה-DNA החוזרים ונשנים נשמרו ונמצאו בכל מקום, תפקידם הביולוגי עדיין לא היה ידוע. בשנות ה-90, מחקר נוסף נערך כדי להבהיר את הדינמיקה האבולוציונית של חזרות minisatellite וmicrosatellite בגלל חשיבותם בזיהוי פלילי מבוסס-DNA ואקולוגיה מולקולרית. חזרות מפוזרות ב-DNA הוכרו יותר ויותר כמקור פוטנציאלי לשונות ורגולציה גנטית. גילויים של מחלות חוזרות ונשנות הקשורות ל-DNA חוזר עוררו עניין נוסף בתחום המחקר הזה. בשנות ה-2000, הנתונים מרצף הגנום האאוקריוטי המלא (פרויקט הגנום האנושי) אפשרו זיהוי של מקדמים, משפרים ו-RNA רגולטוריים שונים אשר כולם מקודדים על ידי אזורים חוזרים. כיום, התפקידים המבניים והרגולטוריים של רצפי DNA חוזרים ונשנים נותרו תחום מחקר פעיל.
סוגים ופונקציות

רצפים חוזרים רבים צפויים להיות שרידים לא פונקציונליים, שאריות של אלמנטים ניתנים להעברה, אלה סומנו כ"זבל" או "אנוכי" DNA. עם זאת, לפעמים כמה חזרות עשויות להיות הרחבה של פונקציות אחרות.
סוגים ופונקציות > חזרות טנדם

חזרות טנדם הן רצפים חוזרים ונשנים שצמודים זה לזה ישירות בגנום. חזרות טנדם עשויות להשתנות במספר הנוקלאוטידים המרכיבים את הרצף החוזר, כמו גם במספר הפעמים שהרצף חוזר על עצמו. כאשר הרצף החוזר הוא באורך של 2–10 נוקלאוטידים בלבד, החזרה מכונה חזרת טנדם קצרה (STR) או microsatellite.. כאשר הרצף החוזר הוא באורך 10–60 נוקלאוטידים, החזרה מכונה minisatellite. עבור minisatellite וmicrosatellite, מספר הפעמים שהרצף חוזר בלוקוס בודד יכול לנוע בין פעמיים למאות פעמים.
לחזרות טנדם יש מגוון רחב של פונקציות ביולוגיות בגנום. לדוגמה, מיני לוויינים הם לעיתים קרובות נקודות חמות של רקומבינציה הומולוגית מיוטית באורגניזמים אוקריוטיים. רקומבינציה היא כאשר שני כרומוזומים הומולוגיים מתיישרים, נשברים ומתחברים מחדש כדי להחליף חלקים. הרקומבינציה חשובה כמקור לגיוון גנטי, כמנגנון לתיקון DNA פגום וכצעד הכרחי בהפרדה מתאימה של כרומוזומים במיוזה. הנוכחות של DNA ברצף חוזר מקלה על אזורי הומולוגיה להתיישר, ובכך לשלוט מתי והיכן מתרחש רקומבינציה.
בנוסף לתפקיד החשוב ברקומבינציה, חזרות טנדם ממלאות גם תפקידים מבניים חשובים בגנום. לדוגמה, הטלומרים מורכבים בעיקר מחזרות טנדם של TTAGGG. חזרות אלו מתקפלות למבני G quadruplex מאורגנים מאוד אשר מגנים על קצוות ה-DNA הכרומוזומלי מפני השפלה. אלמנטים חוזרים מועשרים גם באמצע הכרומוזומים. צנטרומרים הם האזורים הדחוסים ביותר של כרומוזומים המחברים את הכרומטידות האחיות יחדיו ומאפשרים גם לציר המיטוטי להיצמד ולהפריד בין כרומטידות אחיות במהלך חלוקת התא. צנטרומרים מורכבים מחזרת טנדם של 177 זוגות בסיסים בשם החזרה של α-לווין. הטרוכרומטין פריצנטרומרי, ה-DNA המקיף את הצנטרומר וחשוב לתחזוקה מבנית, מורכב מתערובת של תת-משפחות לוויינים שונות כולל הלוויינים α-, β- ו-γ וכן חזרות של HSATII, HSATIII ו-sn5.
חלק מהרצפים שחוזרים על עצמם, כמו אלה בעלי תפקידים מבניים שנדונו לעיל, ממלאים תפקידים הנחוצים לתפקוד ביולוגי תקין. לחזרות טנדם אחרות יש תפקידים מזיקים הגורמים מחלות. עם זאת, לחזרות טנדם רבות אחרות יש פונקציות לא ידועות או לא מובנות.
סוגים ופונקציות > חזרות משובשות

חזרות משובשות הן רצפי DNA זהים או דומים שנמצאים במקומות שונים ברחבי הגנום. חזרות רצופות מובדלות מחזרות טנדם בכך שהרצפים החוזרים אינם סמוכים זה לזה ישירות אלא עשויים להיות מפוזרים בין כרומוזומים שונים או רחוקים זה מזה על אותו כרומוזום. רוב החזרות המשולבות הן אלמנטים ניתנים להפיכה (TEs), רצפים ניידים שניתן "לחתוך ולהדביק" במקומות שונים בגנום. TEs נקראו במקור "גנים קופצים" בשל יכולתם לנוע, אולם המונח הזה מטעה במידה מסוימת מכיוון שלא כל ה-TEs הם גנים יחידים.
אלמנטים הניתנים להעברה המתועתקים ל-RNA, מתעתקים לאחור ל-DNA, ואז משתלבים מחדש בגנום נקראים רטרוטרנספוזונים. בדיוק כפי שחזרות טנדם מסווגות עוד יותר על סמך אורך הרצף החוזר, ישנם סוגים רבים ושונים של רטרוטרנספוזונים. אלמנטים גרעיניים ארוכים ( LINEs ) הם בדרך כלל באורך של 3–7 קילו-בסיסים. אלמנטים גרעיניים קצרים ( SINEs ) הם בדרך כלל 100–300 זוגות בסיסים ולא יותר מ-600 זוגות בסיסים. רטרוטרנספוזונים חוזרים ארוכי קצה (LTR) הם מחלקה עיקרית שלישית של רטרוטרנספוזונים ומאופיינים ברצפים שחוזרים על עצמם מאוד כקצוות החזרה. כאשר יסוד שניתן להעברה אינו עובר דרך RNA כחומר ביניים, זה נקרא טרנספוזון DNA.
על פי הערכות, יסודות הניתנים להעברה מהווים 45% מהגנום האנושי. מאז התפשטות בלתי מבוקרת של TEs עלולה להמיט הרס על הגנום, מנגנוני רגולציה רבים התפתחו כדי להשתיק את התפשטותם, כולל מתילציה של DNA, שינויים היסטונים, RNAs לא מקודדים (ncRNAs) כולל RNA מתערב קטן (siRNA), משפצי כרומטין, גרסאות היסטונים, וגורמים אפיגנטיים אחרים. עם זאת, TEs ממלאים מגוון רחב של פונקציות ביולוגיות חשובות. כאשר TEs מוכנסים למארח חדש, כגון מנגיף, הם מגבירים את המגוון הגנטי. במקרים מסוימים, אורגניזמים מארחים מוצאים פונקציות חדשות עבור החלבונים הנובעות מביטוי TEs בתהליך אבולוציוני הנקרא אקספטציה של TE. מחקרים אחרונים מראים גם ש-TEs משמשים לשמירה על מבנה כרומטין מסדר גבוה וארגון הגנום התלת-ממדי. יתר על כן, TEs תורמים לוויסות הביטוי של גנים אחרים בכך שהם משמשים כמשפרים דיסטליים ואתרי קשירה של גורמי שעתוק.
השכיחות של אלמנטים משולבים בגנום משכה תשומת לב למחקר נוסף על מקורותיהם ותפקידיהם. אופיינו כמה אלמנטים ספציפיים המשולבים, כמו החזרה של Alu ו-LINE1.
סוגים ופונקציות > חזרות ישירות והפוכות

בעוד שחזרות טנדם והפוכות מובדלות על סמך מיקומן בגנום, חזרות ישירות והפוכות מובדלות על סמך הסדר של בסיסי הנוקלאוטידים. חזרות ישירות מתרחשות כאשר רצף נוקלאוטידים חוזר על עצמו באותה כיווניות. חזרות הפוכות מתרחשות כאשר רצף נוקלאוטידים חוזר על עצמו בכיוון ההפוך. לדוגמה, חזרה ישירה של "CATCAT" תהיה חזרה נוספת של "CATCAT". לעומת זאת, החזרה ההפוכה תהיה "TACTAC". כאשר אין נוקלאוטידים המפרידים בין החזרה ההפוכה, כגון "CATCATTACTAC", הרצף נקרא חזרה פלינדרום. חזרות הפוכות יכולות למלא תפקידים מבניים ב-DNA וב-RNA על ידי יצירת לולאות גזע וצלבים.
רצפים חוזרים במחלות אנושיות

עבור בני אדם, כמה רצפי DNA חוזרים ונשנים קשורים למחלות. באופן ספציפי, רצפים חוזרים בטנדם, עומדים בבסיס מספר מצבי מחלה אנושיים, במיוחד מחלות חוזרות של טרינוקלאוטידים כמו מחלת הנטינגטון, תסמונת X שביר, מספר אטקסיות ספינו - מוחיות, ניוון מיוטוני ואטקסיה של פרידרייך. התרחבות חוזרת של טרינוקלאוטידים בקו הנבט לאורך דורות עוקבים עלולה להוביל לביטויים חמורים יותר ויותר של המחלה. הרחבות חוזרות אלו של טרינוקלאוטיד עשויות להתרחש באמצעות החלקת גדיל במהלך שכפול DNA או במהלך סינתזת תיקון DNA. צוין כי גנים המכילים CAG חוזרים פתוגניים מקודדים לרוב לחלבונים שיש להם בעצמם תפקיד בתגובת נזק ל-DNA וכי הרחבות חוזרות עלולות לפגוע במסלולי תיקון DNA ספציפיים. תיקון שגוי של נזקי DNA ברצפים חוזרים עלול לגרום להרחבה נוספת של רצפים אלו, ובכך ליצור מעגל קסמים של פתולוגיה.
רצפים חוזרים במחלות אנושיות > מחלת הנטינגטון

מחלת הנטינגטון היא הפרעה נוירודגנרטיבית הנובעת מהתרחבות של CAG ברצף טרינוקלאוטידים חוזר באקסון 1 של הגן האנטינגטין ( HTT ). גן זה אחראי על קידוד החלבון huntingtin אשר ממלא תפקיד במניעת אפופטוזיס, הידוע גם בשם מוות תאי, ותיקון נזק ל-DNA חמצוני. במחלת הנטינגטון ההרחבה של רצף הטרינוקלאוטידים CAG מקודדת לחלבון האנטינגטין מוטנטי עם תחום פוליגלוטמין מורחב. תחום זה גורם לחלבון ליצור אגרגטים בתאי עצב המונעים תפקוד תאי תקין וכתוצאה מכך לניוון עצבי.
רצפים חוזרים במחלות אנושיות > תסמונת ה-X השביר

תסמונת X שביר נגרמת מהרחבת רצף ה-DNA CCG בגן FMR1 על כרומוזום X. גן זה מייצר את החלבון קושר RNA FMRP. במקרה של תסמונת X שביר הרצף החוזר הופך את הגן לבלתי יציב ולכן משתיק את הגן FMR1. מכיוון שהגן שוכן על כרומוזום X, נשים שיש להן שני כרומוזומי X מושפעות פחות מזכרים שיש להם רק כרומוזום X וכרומוזום Y אחד, מכיוון שכרומוזום X השני יכול לפצות על השתקת הגן בכרומוזום X השני.
רצפים חוזרים במחלות אנושיות > אטקסיה של Spinocerebellar

למחלה spinocerebellar ataxias יש רצפים חוזרים של טרינוקלאוטידים של CAG העומדים בבסיס מספר סוגים של אטקסיות spinocerebellar (SCAs - SCA1 ; SCA2; SCA3; SCA6; SCA7; SCA12; SCA17 ). בדומה למחלת הנטינגטון, זנב הפוליגלוטמין שנוצר עקב התרחבות טרינוקלאוטיד זו גורם לצבירה של חלבונים, מונע תפקוד תאי תקין וגורם לניוון עצבי.
רצפים חוזרים במחלות אנושיות > האטקסיה של פרידרייך

אטקסיה של פרידרייך היא סוג של אטקסיה שיש לה רצף חוזר מורחב GAA בגן frataxin. הגן frataxin אחראי לייצור חלבון frataxin, שהוא חלבון מיטוכונדריאלי המעורב בייצור אנרגיה ובנשימה התאית. רצף ה-GAA המורחב מביא להשתקת האינטרון הראשון וכתוצאה מכך לאובדן תפקוד בחלבון הפרטקסין. אובדן של גן FXN תפקודי מוביל לבעיות בתפקוד המיטוכונדריאלי בכללותו ויכול להופיע באופן פנוטיפי בחולים כקושי בהליכה.
רצפים חוזרים במחלות אנושיות > ניוון מיוטוני

ניוון מיוטוני היא הפרעה המתבטאת כחולשת שרירים ומורכבת משני סוגים עיקריים: DM1 ו-DM2. שני סוגי ניוון מיוטוניים נובעים מרצפי DNA מורחבים. ב-DM1 רצף ה-DNA שמתרחב הוא CCG ואילו ב-DM2 הוא CCTG. שני רצפים אלו נמצאים על גנים שונים כאשר הרצף המורחב ב-DM2 נמצא בגן ZNF9 והרצף המורחב ב-DM1 נמצא בגן DMPK. שני הגנים אינם מקודדים לחלבונים בניגוד להפרעות אחרות כמו מחלת הנטינגטון או תסמונת ה-X השביר. עם זאת, הוכח שיש קשר בין רעילות RNA לבין הרצפים החוזרים ב-DM1 ו-DM2.
רצפים חוזרים במחלות אנושיות > טרשת צדדית אמיוטרופית ודמנציה פרונטוטמפורלית

לא כל המחלות הנגרמות על ידי רצפי DNA חוזרים הם מחלות חוזרות של טרינוקלאוטידים. המחלות amyotrophic lateral sclerosis ו-frontotemporal דמנציה נגרמות על ידי רצפים חוזרים של hexanucleotide GGGGCC בגן C9orf72, הגורמים לרעילות RNA המובילה לניוון עצבי.
ביוטכנולוגיה

קשה לרצף DNA חוזר באמצעות טכניקות רצף מהדור הבא מכיוון שהרכבת רצף מקריאות קצרות פשוט לא יכולה לקבוע את אורכו של חלק שחוזר על עצמו. בעיה זו חמורה במיוחד עבור מיקרו-לוויינים, העשויים מיחידות חוזרות זעירות של 1-6bp. למרות שקשה לרצף אותם, לחזרות הקצרות הללו יש ערך רב בטביעת אצבע של DNA ובמחקרים אבולוציוניים. חוקרים רבים השאירו היסטורית רצפים חוזרים בניתוח ופרסום נתוני גנום שלם בשל מגבלות טכניות.
בוסטוס. וחב' הציעו שיטה אחת לרצף קטעים ארוכים של DNA שחוזר על עצמו. השיטה משלבת שימוש בוקטור ליניארי לייצוב ו-exonuclease III למחיקה של אזורים עשירים ברצף פשוט מתמשך (SSRs). ראשית, קטעים עשירים ב-SSR משובטים לוקטור ליניארי שיכול לשלב ביציבות חזרות טנדם של עד 30kb. ביטוי של חזרות אסור על ידי מסימי התעתיק בווקטור. השלב השני כולל שימוש באקסונוקלאז III. האנזים יכול למחוק נוקלאוטיד בקצה 3' מה שגורם לייצור של מחיקה חד כיוונית של שברי SSR. לבסוף, מוצר זה אשר נמחק מקטעים מוכפל ומנתח עם מושבה PCR. הרצף נבנה לאחר מכן על ידי רצף מסודר של קבוצה של שיבוטים המכילים מחיקות שונות.
שדה געשי

השדה הגעשי טויה, קולומביה הבריטית
שדה געשי הוא חבל גאולוגי בקרום כדור הארץ, שבו מתקיימת – או התקיימה בעבר – געשיות מקומית. שדה כזה עשוי לכלול כמה הרי געש – ולעיתים אף עשרות או מאות – סמוכים זה לזה. הרי הגעש בשדה הגעשי עשויים לנבוע ממקורות געשיים שונים או ממקור געשי משותף. הרכב המאגמה הפעילה בשדות געשיים הוא בזלתי, ולכן הם נקראים לרוב "שדות געשיים בזלתיים", אף שהסלעים בשדה עשויים להיות מגוונים.
לעיתים קרובות, געשיות מסתיימת בהיווצרות שדה געשי במקום מבנה חרוטי יחיד. שדות געשיים מנוקדים לרוב בחרוטי אפר צעירים מבחינה גאולוגית, או במבנים גאולוגיים שלא זוהו כהרי געש נפרדים. במקרים רבים מורכבים השדות הגעשיים מהרי געש רבים וקטנים שנפחם קטן מקילומטר מעוקב, הנוצרים בהתפרצות געשית יחידה – העשויה להימשך ימים אחדים,  שנים אחדות, ובמקרים נדירים אף עשרות שנים. הרי געש אלה נקראים "הרי געש מונוגנטיים". זאת, בניגוד להרי געש אחרים, הפעילים לאורך זמן רב ומפיקים התפרצויות חוזרות ונשנות ונקראים "הרי געש פוליגנטיים".
המבנים הגעשיים בשדות אלה עשויים להיות חרוטי אפר, מארים, חרוטי וטבעות טוף, חרוטי מגן קטנים וכיפות לבה. הרי געש המונוגנטיים מקובצים באשכולות בתוך השדה הגעשי ועשויים ליצור שרשרות קוויות לאורך מבנים טקטוניים דוגמת העתקים. שדות געשיים נוצרים גם בשולי הרי געש שכבתיים או חרוטי מגן גדולים, וכן להימצא בתוך קלדרות – שם הם לרוב נפוצים לאורך רצועות בקעים. פעילותם של הרי געש מונוגנטיים לאורך תקופות של מאות, אלפי ומיליוני שנים, עשויה להסתיים בשדות געשיים נרחבים המורכבים ממאות ואף אלפי הרי געש, ולצבור נפחים הקרובים לאלה של הרי געש שכבתיים יחידים.
מחקר

מחקר של שדות געשיים היה אחד התחומים הראשונים במחקר הוולקנולוגי. הגאולוג ניקולה דמארה מיפה בשנת 1766 חרוטי אפר בשדה הגעשי שן דה פוי (Chaîne des Puys) באוברן – במיוחד את הכיפה הגעשית פוי דה דום (Puy de Dôme) – ויצר בתוך כך את אחת המפות הגאולוגיות המדויקות הראשונות, שלדברי צ'ארלס לייל ניחנה ב"דיוק מדוקדק ועוצמה גרפית נערצת". אחת מתרומותיו החשובות ביותר של דמארה הייתה תיארוך חרוטי האפר באברן, תוך שימוש בגאומורפולוגיה שלהם והסופרפוזיציה של זרמי הלבה אחריהם עקב בזהירות למקורם בצינורות ההזנה במידת האפשר. הטכניקות של דמארה שימשו וולקנולוגים מאוחרים במיפוי שדות געשיים.
בין השנים 1759-1774 התרחשה התפרצות בהר הגעש אל חורויו במקסיקו, השוכן בשדה הגעשי מיצ'ואקאן-גואנחואטו, שמשכה תשומת-לב נוספת לשדות געשיים. גאולוגים כאלכסנדר פון הומבולדט, צ'ארלס לייל וג'ורג' סקרופ תיעדו מספר גדול של חרוטים מסביב להר הגעש, והבינו שחרוטים אלה נוצרו במהלך אפיזודות געשיות של אל חורויו. התפרצות זו ותיעוד של התפרצות קודמת שהתרחשה באותו שדה – בפריקוטין, בין השנים 1943-1952 – הובילו למיפוי שיטתי יותר של האזור.
מחקרים עכשוויים בשדות געשיים משתמשים בשיטות תיארוך מתקדמות ובטכניקות גאופיזיות וגאוכימיות לתיאור קצב הפעילות ומשכה, וכן מיקומם הטקטוני של השדות. רבים ממחקרים אלה התמקדו בתפוצה ובעיתוי של הגעשיות על-מנת להבין טוב יותר את התהליכים השולטים באספקת המאגמה ובהובלתה. מחקרים רבים שקלו את התפתחותם של השדות הגעשיים במונחים של מיקומים נאו-טקטוניים אזוריים, ואת השפעת המבנה הגאולוגי – למשל, העתקים – על תפוצת צינורות ההזנה. מחקרים אחרים התמקדו בהתפתחות הפטרולוגית של שדות געשיים במהלך הזמן, בניסיון לייחס שינויים פטרוגנזיים לשינויים בקצב ובדפוסי הגעשיות. ביחד מספקים כל המחקרים הללו תובנות מעמיקות על הוולקנולוגיה של שדות געשיים. תובנות אלה משמשות במידה הולכת וגוברת להערכת סיכונים ארוכי-טווח הקשורים בשדות געשיים הממוקמים סמוך ליישובים או למתקנים רגישים כתחנות כוח – בעיקר גרעיניות – ונמלים. סיכונים כאלה מהווים מניע חשוב לשיפור מודלים לחיזוי התפרצויות.
היווצרות שדה געשי

הרעיונות המוקדמים הנוגעים להיווצרות שדות געשיים כללו לעיתים קרובות התכה חלקית נרחבת ועליית מאגמה מבעד למבנים קיימים אל פני השטח. במודל כזה, שיעורי הגעשיות יושפעו מתהליכים המתרחשים בקרום, יותר מאשר משיעור היווצרות המאגמה. קל להבין את מקורם של רעיונות אלה: בשדות געשיים רבים נראה הקרום כ"דולף" בזלת מכל סדק והעתק. עם זאת, מודל זה אינו מתיישב עם הפטרוגנזיה של שדות געשיים בזלתיים – שכמעט תמיד מערבת שיעורים נמוכים של התכה חלקית ותוצריה, הנובעים ממגוון רחב של עומקים בליתוספירה, באסתנוספירה או בשתיהן. נתכים אלה אינם ממתינים תקופה ממושכת בקרום או במעטפת העליונה לתהליכים טקטוניים שיסייעו בפליטתם, אלא – כפי שמצביעים מחקרים עדכניים – תפוצת הגעשיות בשדות היא תוצאה טבעית של ייצור מאגמה מתמשך בשיעורים נמוכים. עם זאת, גם שיעורי מתיחה והפחתה משפיעים במידה רבה, מאחר שלתהליכים אלה השפעה משמעותית על שיעורי ההתכה החלקית.
מודל תרמו-פיזיקלי שפותח לתפוצת אשכולות הרי הגעש בשדות געשיים מבוסס על תצפיות בשדה הגעשי קליוצ'בסקוי (Ключевской группе) בקמצ'טקה. המודל מראה כי הרי געש מרכזיים מתפתחים כאשר אספקת המאגמה מספיקה לשמור על אנומליה תרמית בצינור ההזנה המרכזי. מוליך זה מאפשר מסלול הולכה באנרגיה נמוכה אל פני השטח, כל עוד נשמרת האנומליה התרמית. שיעורי אספקת המאגמה בשדות געשיים היא כה נמוכה, עד כי המוליכים – צינורות ההזנה – אינם נשמרים בין התפרצות להתפרצות. מאגמה חדשה – העולה באפיזודה געשית חוזרת – תמצא את דרכה אל פני השטח, ולא תיאגר בתאי מאגמה רדודים. לכן, שיעורים נמוכים של הסעת חום – הנובעים משיעורים נמוכים של התכה – יובילו להיווצרותם של שדות געשיים.
מודל זה נתקף בטענה כי גם שיעורי המתיחה הליתוספירית מהווים מרכיב חשוב בהיווצרות השדות. תמיכה לטענה זו התקבלה בניסויים פיזיקליים ואנלוגיים, שהראו כי קיומם של מקבצי סדקים ודייקים מתאפשר בליתוספירה שחלה בה מתיחה בשיעורים נמוכים, יותר מאשר בליתוספירה שחלים בה שיעורים גבוהים יותר של מתיחה. על-פי הניסויים, הרי געש נפוצים יותר באזורים של מתח ליתוספירי גבוה, בהם פוחתת היווצרות דייקים ואגירת מאגמה. לכן, בשדות געשיים יכולה להתפתח געשיות דו-אופנית כתגובה לשינויים בשיעורי ההתכה, המתיחה או בשניהם. מחקר זה מספק מנגנון יסודי לתצפיות, המראות כי שיעורים נמוכים של הפקת מאגמה ושיעורים גבוהים של מתיחה מסתיימים בהיווצרותם של שדות געשיים – יותר מאשר בהיווצרותם של הרי געש מרכזיים.
מאפיינים של שדות געשיים

שדות געשיים מקיפים שטחים ונפחים גדולים. שדות קטנים מכילים עד 50 צינורות המשתרעים על שטח המגיע ל-1,000 קמ"ר. שדות גדולים מכילים יותר מ-100 צינורות ומשתרעים על שטח של יותר מ-1,000 קמ"ר. פעילותם של שדות נעה על-פני תקופות ארוכות של זמן – יותר ממיליון שנים. לשדות געשיים רבים קשר למאפיינים טקטוניים כאגנים, העתקים ורצועות בקעים.
מאפיינים יסודיים של שדות געשיים כוללים:
אינטנסיביות געשית – קצב ושיעור ההישנות של פעילות געשית
דפוסים מרחביים – מספר צינורות ההזנה ופיזורם על-פני השטח
הסתברות עתידית – הסתברות להתפרצויות עתידיות