Rise of the Tomb Raider
עלילה > סיפור

המשחק מתרחש בשנת 2014, שנה לאחר אירועי המשחק הקודם. לארה קרופט מתקשה להסביר את חוויותיה עם העל-טבעי בימטאי. בחיפוש אחר תשובות, היא פונה אל המחקר האחרון של אביה על העיר האבודה קיטג' ועל מיתוס חיי נצח. השותפה ובת הזוג לשעבר של אביה, אנה, מזהירה את לארה על כך שהיא תהפוך לאובסיסבית, כיוון שהאובססיה של אביה הובילה להריסת חייו ולהתאבדותו. לארה מתעלמת מאזהרותיה ומארגנת משלחת לסוריה, בתקווה לחשוף את הקבר של הנביא של קונסטנטינופול, מפתח חשוב למציאת קיטג'. אף על פי שהצליחה, הקבר ריק ומיד לאחר מכן מגיעים טריניטי - ארגון עתיק אשר מתקיים כיום כארגון צבאי אשר חוקר על-טבעי ומונהג בידי קונסטנטין. לארה מצליחה לברוח ולפוצץ את הקבר ובזמן בריחתה היא שמה לב לסמל אשר טבוע בתוך הקבר שאותו היא מקשרת לספר דתי רוסי של אביה. מתנקש של טריניטי גונב את הספר וגורמים ללארה ולחברה ג'ונה (יונה) לרדוף אחר הארגון בסיביר שברוסיה. במהלך המשלחת לסיביר, לארה וג'ונה מופרדים לאחר מפולת שלגים ולארה נאלצת להמשיך לבדה.
לארה מגלה שטריניטי השתלטו על מתקן מכרה סובייטי והסבו אותו לבסיס המבצעים למציאת קיטג'. לארה מנסה להחזיר את הספר, אך נתפסת ונכלאת ביחד עם אנה, שמתגלה כי היא אחותו קונסטנטין ומרגלת של הארגון. השניים חוקרים אותה לגבי מיקומו של "המקור האלוהי", חפץ של על פי האמונה מאפשר חיי נצח. לארה בורחת בעזרתו של ג'יקוב, אדם מסתורי וזר שמוביל אותה דרך המכרה לעמק הנמצא מאחוריו.
ג'ייקוב מתגלה בתור המנהיג של הפליטה, הצאצאים של חסידיו של הנביא של קונסטנטינופול. בעוד לארה מסייעת במתקפת הנגד שלהם לטריניטי, היא מתחילה ללמוד יותר על הנביא ועל העיר האבודה קיטג'. לאחר שנקראו כופרים ונרדפו על ידי ארגון טריניטי, הנביא וחסדיו התיישבו ברוסיה ושם בנו את העיר קיטג'. אף על פי כן, המונגולים ברשותו של ג'ינגיס חאן, דורבנו על ידי סוכני ארגון טריניטי לתקוף את העיר והנביא נאלץ להקריב את העיר כדי להגן על "המקור האלוהי". חסדיו ששרדו ברחו והתיישבו באזור ונשבעו להגן על סוד העיר. ג'ייקוב מזהיר את לארה כי אף על פי ש-"המקור האלוהי" אכן קיים, הוא לא כפי שלארה מדמיינת. כוחותיו של קונסטנטין תוקפים שוב ושוב את הפליטה, באמונה שהם כופרים והם מצדיקים את הטבח בטענה שזהו רצון האל. אף על פי כן, לארה מגלה שאנה בעצמה גוססת ושהיא מתפעלת את אחיה שימצא את "המקור האלוהי" וישתמש בו כדי להציל אותה.
לארה וג'ייקוב מחליטים שהדרך היחידה להגן על "המקור האלוהי" היא להשיג אותו לפני טריניטי. כדי לעשות זאת, לארה משיגה את האטלס, חפץ שמשמש כמפה של קיטג'. היא מתאחדת עם ג'ונה, שריגל אחר כוחות טריניטי. למרות זאת, קונסטנטין, שהיה עירני לנוכחו של ג'ונה, נתן לו ללכת בחופשיות בתקווה שיוביל אותו ללארה. ג'ונה נחטף ביחד עם האטלס, כדי להכריח את לארה להצילו. ניסיון ההצלה נגמר באסון כשקונסטנטין דוקר את יונה, בידיעה שהצלת חייו תהיה בראש רשימת העדיפויות של לארה ובכך לתת לטריניטי יתרון בזמן. לארה לוקחת את ג'ונה לג'ייקוב, שמתגלה בתור הנביא עצמו כשהוא בדרך נס מרפא את ג'ונה.
בעוד טריניטי מתקרבים לעבר הקרחון הנשען מעל קיטג', לארה נאלצת להיכנס לעיר דרך "השביל של בני-אלמוות" (Path of the Deathless) שבו היא נתקלת בבני האל-מוות (Deathless Ones) השומרים האל-מתים של העיר. בעקבות קריאת היומנים של סוכן טריניטי שהוטבע בכוחות המונגולים, לארה מבינה את האמת על ההאזהרה של ג'ייקוב: "המקור האלוהי" מביא חיי נצח, אבל במחיר של שעבוד נצחי ואיבוד האני העצמי. בני האל-מוות הם התושבים האל-מתים של קיטג', שנאלצו להגן על העיר לנצח. בעוד לארה נכנסת לקיטג', הפלטה מתכנסת להתקפה כנגד בני האל-מוות, דבר שנותן ללארה זמן נוסף כדי להגיע ללב העיר. היא מותקפת בידי קונסטנטין ופוצעת אותו אנושות. הוא מת בחוסר אמונה שהוא לא ישא את רצון האל, אלא את הרצון של אנה. לארה מגיעה מאוחר מדי מכדי לעצור את אנה להשיג את "המקור האלוהי", אך מצליחה לחטוף אותו לפני שאנה משתמשת בו. לארה הורסת את "המקור האלוהי" ובכך הורגת את כל בני האל-מוות אך גם גורמת לג'ייקוב לאבד את חיי הנצח שלו. אף על פי כן, ברגעיו האחרונים הוא הביע שמחה על כך שזמנו הגיע סוף סוף והודה ללארה על כך שהביאה לו את סופו בעוד הוא מתפורר בשלווה.
בסופו של דבר, ביתו של ג'ייקוב, סופיה, לוקחת את תפקיד הנהגת הפלטה. ג'ונה מתאושש מפצעיו ומצטרף ללארה בתכנון המשלחת הבאה שלהם. לארה נשבעת להמשיך לחקור את מסתורי העולם וכן לסכל את תוכניותם של טריניטי. סצנה לאחר הכתוביות מראה את לארה ואנה עוזבות את רוסיה, שבועיים לפני שלארה מגיעה לאחוזה. לארה מתשאלת את אנה על מות אביה. אנה מודה שאביה של לארה אכן נרצח בידי טריניטי, אך לפני שהיא הספיקה לחשוף מידע נוסף, היא נורית בראשה ונרצחת על ידי צלף שעובד בשביל טריניטי. הצלף מבקש הוראות לגבי לארה, אך בכיר שלא נראה במשחק אומר לו ”לא, עדיין לא.” והמשחק מסתיים.