סקובי-דו וקללת רוח הרפאים ה-13
עלילה

הסרט נפתח בפלאשבק של וינסנט ואן גול הצעיר ועמיתו, מורטיפר קווינץ', צדים וחותמים בהצלחה את רוח הרפאים ה-13 בתיבה של השדים. עם זאת, מורטיפר הותקף ונהרג לכאורה על ידי רוחות רפאים משרתים כאשר ואן גול בורח. בגותרות הפתיחה של הסרט, ואן גול משחזר את אירועי הסדרה "13 הרוחות של סקובי-דו", שבהם סקובי-דו שחרר את 13 הרוחות לחופשי פעם נוספת בטעות, אבל היה תופס את כולם מלבד אחת בעזרת שאגי רוג'רס, דפני בלייק ופלים-פלאם הצעיר.
בהווה, סקובי, שאגי, דפני, פרד ג'ונס וולמה דינקלי רודפים אחרי החוואי מורגן דרך הקניון ובסופו של דבר לוכדים אותו בחנות צעצועים. כשהחבורה מנסה לחשוף אותו, נראה שמורגן הוא אמיתי ללא מסכה. בדיוק אז, השריף מגיע עם האשמה האמיתית, גברת מאלבו, שעצרה עסקה עם מורגן. השריף מעניש את החבורה על כך שהיא לכדה את החשוד הלא נכון, והוא מאיים עליהם שאם אי פעם יראה אותם מסתובבים במכונת המסתורין, הוא ישים אותם בכלא וגם יזכיר להם את חוק הרצועה החדש לכלבים. בנוסף לכך, הוא אומר לחבורה להפסיק לפתור תעלומות.
למחרת, החבורה עורכת מכירת מוסך, בה היא מוכרת את כל תחפושות המפלצות מהתעלומות הקודמות שלהן, וגם את מכונת המסתורין, לצערו של פרד. בזמן ששאגי וסקובי נרגעים בכיסאות נוח, לקוח בשם ברני אלן מגלה את כדור הבדולח בין חומרי המסתורין הישנים שלהם, מה שגורם לשאגי וסקובי לזהות אותו מ-13 הרפתקאות הרוחות שלהם. בדיוק אז, ואן גול יוצר קשר עם דפני, שאגי וסקובי בנוגע לרוח הרפאים ה-13 והאחרונה. כאשר פרד וולמה מבררים מה קורה, דפני מעדכנת אותם על 13 תעלומות הרוחות שלה עם שאגי וסקובי בזמן שפרד וולמה היו רחוקים מהחבורה לאחר אירועי הסדרה "סקובי-דו וסקראפי-דו".
לאחר שהחליפה לתלבושת הישנה שלה מהסדרה "13 הרוחות", דפני חושפת את הטנדר האדום הישן שלה, מכונת המיס-תורין, לפרד ולולמה, והחבורה מתחילה במסע לפגוש את ואן גול בטירה שלו. בדרכם, החבורה נרדפת על ידי מכונית רפאים, אך דפני מצליחה לתמרן אותה במיומנות. כשפרד רואה את דפני לוקחת אחריות, זה מקדם את המשבר הקיומי שלו כיוון שהוא מרגיש שהוא חסר תפקיד. כשהחבורה פוגשת את ואן גול, הם מותקפים על ידי הרוח ה-13, שד מכונף בשם אסמודאוס. שאגי מגלה בביישנות שהוא שלח את התיבה למעונו של ואן גול בהרי ההימלאיה, והחבורה נוסעת לשם באמצעות סירה מעופפת.
כשהם מגיעים, החבורה נתקלת בברני אלן, ששאל על כדור הבדולח במכירת המוסך שלהם, ודפני, שאגי, סקובי וואן גול עוקבים אחריו, אבל אז מותקפת על ידי מכונית הרפאים והיא מפעילה את המנוע שלה כדי לגרום למפולת שלגים. ואן גול מגלה שהוא לא מסוגל להשתמש בכוחות הקסם שלו והארבעה מתרסקים למקדש. בינתיים, פרד וולמה מחפשים סניף דואר נטוש לכאורה בכפר, והם פוגשים את פלים-פלאם, כיום מבוגר, שמנסה למכור להם את הסחורה שלו מבית השדים וציוד לוכד רפאים. כשפרד וולמה עוזבים את החנות, הם פתאום נחטפים על ידי משהו שאפילו ולמה לא יכולה להסביר.
במקדש, אסמודאוס חיכה לוואן גול והוא רודף אחרי הארבעה כשהם מוצאים את התיבה. תוך כדי ריצה, ואן גול הורס את כדור הבדולח שלו ומעביר את שאגי, סקובי ודפני אל מחוץ למקדש שם הם פוגשים את פרד וולמה. כשהחבורה נקלעה לדיכאון, פרד מגלה שהוא למעשה הלך לבית ספר למעודדות בזמן שהותו רחוק מחבריו. בעוד פרד מעודד את הכנופיה המיואשת שלו, דפני, שחזרה לעצמה, רוקחת תוכנית.
ולמה מבקרת בחנות של פלים פלאם ולוקחת הכל. לפתע, מכונית הרפאים רודפת אחרי פרד, ולמה ופלים פלאם, אך הם מתחמקים עם השדרוגים המותקנים של מכונת המיס-תורין. בינתיים, שאגי, סקובי ודפני מסתננים לטירה כדי להציל את ואן גול. לאחר מכן, הם מתאחדים עם פרד, ולמה ופלים-פלאם. האחרון שואל על סקראפי, מה שמבלבל את החבורה לרגע. נכנסים לטירה, הם מוצאים את ואן גול מובס. הוא מגלה לחבורה שאסמודאוס הוא באמת צורת השד של אביו הקדמון החזק בקסם, אסאמאד ואן גול, ומאשים את האבדון הממשמש ובא על עצמו.
אסמודאוס פותח את התיבה, ולמה מציינת שזה בלתי אפשרי, שכן התיבה יכולה להיפתח רק על ידי אדם חי. אסמודאוס מנסה להימלט, אך הוא נתפס על ידי דפני. אסמודאוס מתגלה כמורטיפר, שחשף שהוא זייף את מותו על ידי יציקת אשליה כדי לשטות בוואן גול והוא מסביר שהוא רצה למכור את התיבה של פלים-פלאם תמורת 10 מיליון דולר. ברני אלן מגיע, והוא מתגלה כסוכן אינטרפול בשם ואנס לינקלייטר והוא עוצר את מורטיפר. בדיוק כשמורטיפר נלקח למעצר, הוא בורח במכונית הרפאים אך נתפס מחדש.
מראהו של אסמודאוס/אסאמאד האמיתי מופיע בקצרה לפני החבורה, ולמה מסיקה שאסמודיאוס האמיתי באמת שומר על ואן גול, והוא השיג גאולה. עם זאת, היא המציאה את הסיפור כדי לתת לוואן גול סגירה ומפריכה את 12 הרוחות הקודמות כהזיות בשל האוויר הדליל של ההימלאיה והקנטות בפתיחת התיבה האמיתית, אך לאחר שראתה את הפרצופים המפוחדים של כולם, היא מחליטה שלא.
כשהחבורה מתכוננת לצאת הביתה, דפני מנשקת את פלים-פלאם כהודיה על עזרתו, ואן גול מזהיר את פלים-פלאם להימנע מצרות. כשהם טסים חזרה הביתה, דפני מחליטה שהחבורה צריכה להמשיך לפתור תעלומות ומחזירה את תפקיד המנהיגות לפרד.