ספיידרמן: השיבה הביתה
עלילה

ב-2012, כהשלכות מהקרב בניו יורק בין צוות גיבורי-העל "הנוקמים" לגזע החוצנים הצ'יטאורי, ממשלת ארצות הברית, בסיועו של טוני סטארק, מחליטה להקים חברה לבנייה ושיקום בפיקוח ממשלתי אשר תטפל בנזקי קרבות מרובי נפגעים ונזק שכאלו, "בקרת נזקים". כתוצאה מכך, חברות משנה רבות אשר עסקו בתחום פושטות את הרגל ויוצאות מחוץ לעסקים. אדריאן טומס, הבעלים של אחת מהחברות האלו, משכנע את עמיתיו שלא לפרוש, אלא להשתמש בטכנולוגיה אותה אספו מעבודותיהם השונות לטובת פנייה לחיי פשע.
בהווה, כחמש שנים אחר כך (חמש שנים אחרי אירועי הנוקמים), ולאחר הקרב בשדה התעופה לייפציג בין סיעות "הנוקמים" המפוצלות של סטיב רוג'רס/קפטן אמריקה וטוני סטארק/איירון מן, פיטר פארקר, אשר לחם בזהות "ספיידרמן" לצידו של סטארק, משתוקק להצטרף לצוות "הנוקמים", אך נדחה באופן נחרץ על ידי סטארק בטענה כי הוא עוד לא מוכן לכך. בכך, פיטר "נאלץ" לחזור לחייו כתלמיד תיכון טיפוסי בגיל ההתבגרות בקווינס, לצד חברו הטוב ביותר נד (ג'ייקוב בטלון) וידידתו מישל, כשהוא מתמודד עם יריבו לספסל הלימודים פלאש תומפסון ומחזר אחר מושא אהבתו ליז אלן. למורת רוחה של דודתו מיי הוא פורש מצוות הדקאתלון האקדמי של בית ספרו בניהולו של המרצה הרינגטון, על מנת להתמקד בהתמחות המדעים שלו ב"תעשיות סטארק" – כיסוי לפעילותו כגיבור-העל "ספיידרמן".
במהלך אחת מפעולותיו באחד מן הערבים, פיטר מתעמת עם קבוצת פושעים המשתמשים בנשק הצ'יטאורי לשוד בנק, אך נכשל עם בריחתם, וסובל מ"כישלון" נוסף כאשר מיד לאחר מכן נד מגלה את זהותו הסודית. נחוש לתפוס את הפושעים, פיטר עוקב אחר הסחר בנשק ברחבי קווינס, ובפרט בנשק הצ'יטאורי, ומוצא את צמד הפושעים הרמן שולץ וג'קסון ברייס, אשר לכל אחד מהם זוג כפפות הלם משודרגות של קרוסבונז מהקרב בלאגוס המקנות להם את היכולת לשחרר פרצי אוויר מרוכזים, מוכרים נשק לגנגסטר המקומי אהרון דייוויס. פיטר מנסה לעצור אותם ומתעמת איתם, אך נתקל במנהיגם, טומס, בעל חליפה מתקדמת בעלת כנפיים מכניות המצוידת בנשק מתקדם, המכונה "הנשר". פיטר נלחם בטומס, אך כמעט ונהרג עד אשר סטארק מגיח כאיירון מן ומחלץ אותו. מאוחר יותר, ברייס מתעמת עם טומס בדבר האירועים האחרונים, ואף מאיים לספר לרעייתו של טומס אודות עסקיו הבלתי-חוקיים, ובתגובה טומס משתמש באחד מנשקיו על מנת להשבית את ברייס, אך בשוגג גורם למותו.
בעזרתו של נד, פיטר עוקב אחר צעדיו של טומס, ומגלה כי הוא בדרכו לוושינגטון על מנת לשדוד לארגונו הובלה של "בקרת נזקים" באמצעות נשק הצ'יטאורי. ככיסוי להגעתו לשם, פיטר מצטרף בחזרה לצוות הדקאתלון של בית ספרו, היות שהם נוסעים לביקור באנדרטת וושינגטון. בטרם פיטר יוצא אחר טומס, הוא מסיר מהחליפה שבב מעקב אותו סטארק התקין ומשבית את פרוטוקול הגבלת השימוש של החליפה, ובכך חושף את כל תכונותיה הפנימיות, וביניהן מערכת ההפעלה "K.A.R.E.N.‎". כאשר פיטר מוצא את טומס, הוא נאלץ להיאבק פעם נוספת בשולץ, בנוכחות המדען פינאס מייסון, אך בסופו של דבר הוא מובס. מוטל על הקרקע בחוסר אונים, פיטר נאלץ לשוב במהרה לחבריו, מכיוון שנשק הצ'יטאורי אותו נד שמר לעצמו בסתר הוביל פיצוץ ולנזק מסוכן באנדרטה. לבסוף, כשהוא מתחמק מהרשויות הרודפות אותו, פיטר מציל את חבריו וחוזר לביתו.
בחזרה לביתו, פיטר משכנע את דייוויס לגלות לו את מקום הימצאו של טומס, בראיית הטוב שבו. פיטר מגלה כי טומס נמצא עם שותפיו במעבורת המלאה בנשק הצ'יטאורי ויוצאת מסטטן איילנד כחלק מעסקת נשק נוספת, ויוצא לשם במהרה. בהגיעו, הוא מצליח להביס את שכיריו של טומס וללכוד את קונה הנשק שלהם, מאק גארגן, אך נאלץ להיאבק פעם נוספת בטומס, אשר משתמש בנשק מתקדם על מנת לקרוע את המעבורת לשניים, בטרם הוא בורח מהמקום ומשאיר אותו להתמוטט. פיטר מנסה לאחות את שני חלקי המעבורת, שמא היא תטבע ונוסעיה הרבים יימצאו את מותם, אך הוא נכשל, ובדיוק כשהיא עומדת להתמוטט באופן סופי, סטארק מגיח כאיירון מן, מייצב את המעבורת ומציל את הנוסעים. לאחר מכן, סטארק נוזף בפיטר על פעולותיו ולוקח ממנו את החליפה שלו, דבר המאלץ את פיטר לשוב ולהשתמש בחליפה תוצרת הבית המיושנת שלו.
פיטר חש דיכאון רב בעקבות האירועים האחרונים, ומחליט למצוא נחמה בהזמנתה של אהובתו ליז לנשף הסיום ("Homecoming"), אשר להפתעתו הרבה נענית בחיוב. כאשר פיטר אוסף את ליז מביתה, הוא מגלה כי אביה הוא לא אחר מאשר טומס עצמו, וזוכה ממנו לאיום מפורש לכך שלא יתעסק בענייניו שמא יזכה לנקמה חסרת מעצורים. במהלך הנשף, נד מוצא בבהלה את פיטר ומספר לו כי טומס מתכנן לחטוף מטוס מטען הנושא בתוכו נשק רב ממגדלו של סטארק אל בסיס "הנוקמים" בצפון בפיקוחו של האפי הוגאן. פיטר נאלץ לעזוב את ליז ולנוע במהרה, אך נתקל בעת יציאתו מבית ספרו בשולץ, איתו הוא נאלץ להיאבק, עד שלבסוף הוא ניצל על ידי נד שפוגע בו עם טווה הקורים של פיטר עצמו, שנפל לו לפני כן.
פיטר מוצא את טומס במאורתו הסודית ומתעמת איתו, כשהשניים מודעים לזהויותיהם זה של זה, וטומס מתרץ את פעולותיו כ"דאגה" לעתידה של ליז, שכן זו דרכו היחידה לאחר שסטארק הקים את "בקרת נזקים" וגרם לו לפשיטת רגל. לאחר שפיטר מסרב "לוותר" לו, טומס ממוטט את המאורה ומשאיר את פיטר תחת הריסותיה. לאחר שפיטר מצליח להיחלץ, הוא נאבק בטומס באוויר על גג המטוס, עד שהוא מסיט אותו להתרסקות בשטח פתוח ליד קוני איילנד. אז, השניים מתעמתים פעם נוספת, כשלבסוף חליפתו של טומס מתפוצצת והוא עולה בלהבות. פיטר מציל את חייו של טומס, ומסגיר אותו לידי המשטרה.
ביום שלמחרת, פיטר שב לחייו הרגילים. בבית הספר, הוא מגלה כי מישל מתמנה לנשיאה החדשה של צוות הדקאתלון (שמה המלא נגלה כ"מישל ג'ונס", והיא נקראת על ידי חבריה בקיצור "MJ"), מכיוון שליז, יחד עם אמה, עוזבת את העיר בעקבות המעצר של טומס. בהמשך היום, פיטר מבקר בבסיס "הנוקמים" בצפון בעקבות הזמנה מיוחדת מסטארק, אשר מציג בפניו חליפה חדשה ("איירון ספיידר") ומודיע לו כי אישר את הצטרפותו לצוות. עם זאת, פיטר מוותר על ההזדמנות בהבנה כי לתפקידו כגיבור-על שכונתי וצנוע ישנה חשיבות רבה. פפר פוטס, אשר ארגנה עבור ההצטרפות הצפויה מסיבת עיתונאים, מגלה כי פיטר ויתר ועזב, ולאחר שהיא נותרת בחוסר אונים, טוני אוסף מהאפי טבעת אירוסין אותה הוא שומר במשך שנים ומציע לפפר נישואים, זאת כנושא לסיקור עבור העיתונאים הנוכחים. מאוחר יותר, פיטר שב לביתו ומגלה כי סטארק החזיר לו את חליפתו, ובדיוק כשהוא עוטה אותה מיי נכנסת לחדרו, ומגלה אודות זהותו הסודית.
באפילוג, טומס נכלא בעקבות פשעיו. אחד מהאסירים, מאק גארגן, מספר לו כי כמה פושעים אשר נלכדו על ידי ספיידרמן מתאחדים במטרה לנקום בו על שעולל להם, ומבקש ממנו את זהותו הסודית, שכן רצה שמועה כי הוא יודע את הדבר, אך טומס מכחיש. בסצנה שאחרי הכתוביות, סטיב רוג'רס מצלם תשדיר שירות למחלקת החינוך של ארצות הברית בנושא סבלנות.