בית ספר למפלצות
עלילת הסרט

הסיפור מתחיל עם מפלצת צעירה בשם מייק ווזובסקי בטיול בית ספר ל"מפלצות בע"מ", מפעל להפחדת ילדים. בסיור, הכיתה פוגשת את פרנק מק'קי, מפחידן שנכנס לעולם האנושי כדי להפחיד את הילדים בלילה, קוצר את הצרחות שלהם, וממיר אותם לאנרגיית גז בעיר "מפלצופוליס". כשפרנק מכין דלת כניסה לעולם האנושי, הילדים שמים לב שמייק חומק לדלת של פרנק. פרנק מפחיד את הילד בהצלחה ולאחר מכן חוזר דרך הדלת למפלצופוליס. פרנק נוזף במייק, אבל מתרשם מיכולת ההתגנבות השקטה וכושר ההפחדה שלו, ונותן לו את כובע "אוניברסיטת המפלצות" שלו למזכרת. המורה של מייק מוכיחה אותו גם כן, אבל מייק שמח, ומקבל עידוד להיות מפחידן כשיגדל.
13 שנה אחרי, מייק מתחיל את יומו הראשון ב"אוניברסיטת המפלצות" היוקרתית. הוא פוגש בשותפו לחדר, מפלצת החנונית והביישנית, רנדל "רנדי" בוגס, שחפץ להיות פופולרי ויש לו קושי בשליטה בכוח ההסוואה שלו. (בסרט "מפלצות בע"מ" רנדל הופך לנבל ולמפלצת מאיימת במיוחד). במהלך המפגש הראשון של השיעור למפחידנים, מנהלת האוניברסיטה הקשוחה, הדיקנית הארדסקראבל, אומרת לסטודנטים-מפחידנים שהם חייבים לעבור את הבחינה הסופית של הסמסטר כדי להמשיך בתוכנית הלימודים. באחד הלילות, מייק פוגש בסטודנט-מפחידן אחר, מפלצת כחולה וגדולה בשם ג'יימס פ' "סאלי" סאליוון, שנכנס בטעות לחדרו של מייק כדי להסתיר את צ'ייס החזיר, הקמע של האוניברסיטה היריבה. לאחר שהם מציגים את עצמם, הקמע גונב את כובע האוניברסיטה של מייק ונמלט. מייק וסאלי נאבקים בצ'ייס החזיר בחוץ, ומנסים ללכוד אותו. מייק מצליח ללכוד אותו, אבל סאלי מקבל את הקרדיט על כך, והוא מוזמן להצטרף ל"לשאוג שאגת אומגה", האחווה השולטת בקמפוס. מייק מבקש להצטרף, אך סאלי מתכחש לו, ובכך מצית את היריבות בין השניים.
מייק מתחיל להקניט את סאלי בכך שעונה על שאלות קשות שוב ושוב בצורה נכונה, תוך כדי שסאלי מגמגם מפני שאינו יודע את התשובות. בבחינה הסופית, היריבות של מייק וסאלי יוצאת מכלל שליטה, וגורמת לדיקנית האדסקאבל להוריד את שניהם מתוכנית השיעורים, ונוסף על כך, סאלי מגורש מאחוות "לשאוג שאגת אומגה". מייק מחליט להיכנס למשחקי ההפחדות, תחרות מיוחדת של האחוות שכוללים אתגרים פיזיים שבוחנים את יכולת ההפחדה של המפלצות. מייק מצטרף ל"אוזמא קאפה", אחווה למפלצות חריגות. מייק מנסה להיכנס כחבר ב"אוזמא קאפה" למשחקי ההפחדה, אבל נדחה בטענה שהוא זקוק לחבר. סאלי, שרואה את התחרות כקבלת כרטיס הכניסה חזרה לתוכנית השיעורים למפחידנים, מוכן להצטרף, ומייק מקבל אותו בסופו של דבר בחוסר רצון. בתהליך ההצטרפות, מייק עושה עסקה עם הדיקנית הארדסקאבל, יוזמת המשחקים, להכנסת "אוזמא קאפה" לתוכנית השיעורים למפחידנים אם הם ינצחו, ואם הם יפסידו, מייק יהיה חייב לעזוב את אוניברסיטת המפלצות. סאלי רוצה לדאוג לניצחונות האחווה בעצמו, אבל מייק מאמין שעם מספיק אימונים, האחווה תוכל להצליח. בינתיים, רנדי הופך להיות חבר של "לשאוג שאגת אומגה" ומקלקל את ידידותו עם מייק.
בתחרות, "אוזמא קאפה" מתקדמים בסיבוב הראשון במפתיע ושורדים הודות למזל. לאחר מכן הם משתתפים במסיבה ש"לשאוג שאגת אומגה" ארגנה, אבל "אוזמא קאפה" נופלים קורבן להתעללויות. האחווה מיואשת מכיוון שעכשיו הם הבדיחה של הקמפוס כולו. האחווה ממשיכה להתאמן, ולבסוף זוכה בסיבוב האחרון, מייק מגלה שסאלי תמרן אותו, כך שרשם ציון מושלם. הלב של מייק נשבר, הוא רוצה להוכיח לכולם שהוא מסוגל להפוך למפחידן. מייק פורץ למעבדת יצירת דלתות לעולם בני התמותה ומשתמש בדלת חדשה כדי להיכנס לעולם האנושי, אך תוכניתו משתבשת כאשר הוא מועבר למחנה קיץ ונכשל בהפחדת הילדים.
באוניברסיטה, סאלי מתוודה בפני הדיקנית הארדסקאבל שהוא רימה, כשהיא מקבלת הודעה על פריצה למעבדה. כשהבינו מה קרה, סאלי נכנס כדי לחפש את מייק. לאחר שמצא את מייק ופייס אותו, הזוג נרדף על ידי שוטרים ומנסים לחזור לאוניברסיטה אך ללא הצלחה, מפני שהדיקנית הארדסקאבל ביטלה את האפשרות למעבר חזרה לעולם המפלצות עד שה"סוכנות לאיתור הילד" תגיע. לכודים בעולם האנושי, מייק מבין שהדרך היחידה לחזור לאוניברסיטה היא להפיק אנרגיה חזקה מספיק שתפעיל את הדלת מבחוץ. בעבודה משותפת, סאלי ומייק מפחידים את המבוגרים ומניבים כמות עצומה של אנרגיה שמספיקה כדי לחזור למעבדה. מעשיהם מובילים לגירושם מהאוניברסיטה, אבל שאר חברי "אוזמא קאפה" מתקבלים ל"תוכנית השיעורים למפחידנים" לסמסטר הבא. הדיקנית הארדסקאבל אומרת להם שהם הראשונים שהפתיעו אותה, ומאחלת להם בהצלחה בעתיד. מייק וסאלי מתקבלים ל"מפלצות בע"מ" בעבודה בחדר הדואר, ועם הזמן, הם הופכים לחלק מצוות המפחידנים.