רשת ביטוי משותף של גנים
הערות שוליים

↑  Stuart, Joshua M; Segal, Eran; Koller, Daphne; Kim, Stuart K (2003). "A gene-coexpression network for global discovery of conserved genetic modules". Science. 302 (5643): 249–55. Bibcode:2003Sci...302..249S. CiteSeerX 10.1.1.119.6331. doi:10.1126/science.1087447. PMID 12934013.
↑  Weirauch, Matthew T (2011). "Gene coexpression networks for the analysis of DNA microarray data". Applied Statistics for Network Biology: Methods in Systems Biology. pp. 215–250. doi:10.1002/9783527638079.ch11.
↑  Roy, Swarup; Bhattacharyya, Dhruba K; Kalita, Jugal K (2014). "Reconstruction of gene co-expression network from microarray data using local expression patterns". BMC Bioinformatics. 15: S10. doi:10.1186/1471-2105-15-s7-s10. PMC 4110735. PMID 25079873.
↑  Butte, Atul J; Kohane, Isaac S (1999). "Unsupervised knowledge discovery in medical databases using relevance networks". Proceedings of the AMIA Symposium.
↑  Butte, Atul J; Kohane, Isaac S (2000). "Mutual information relevance networks: functional genomic clustering using pairwise entropy measurements". Pac Symp Biocomput. 5.
↑  Villa-Vialaneix, Nathalie; Liaubet, Laurence; Laurent, Thibault; Cherel, Pierre; Gamot, Adrien; SanCristobal, Magali (2013). "The structure of a gene co-expression network reveals biological functions underlying eQTLs". PLOS ONE. 8 (4): 60045. Bibcode:2013PLoSO...860045V. doi:10.1371/journal.pone.0060045. PMC 3618335. PMID 23577081.
↑  Persson, Staffan; Wei, Hairong; Milne, Jennifer; Page, Grier P; Somerville, Christopher R (2005). "Identification of genes required for cellulose synthesis by regression analysis of public microarray data sets". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 102 (24): 8633–8. Bibcode:2005PNAS..102.8633P. doi:10.1073/pnas.0503392102. PMC 1142401. PMID 15932943.
↑  Reverter, Antonio; Chan, Eva KF (2008). "Combining partial correlation and an information theory approach to the reversed engineering of gene co-expression networks". Bioinformatics. 24 (21): 2491–2497. doi:10.1093/bioinformatics/btn482. PMID 18784117.
↑  Song, Lin; Langfelder, Peter; Horvath, Steve (2012). "Comparison of co-expression measures: mutual information, correlation, and model based indices". BMC Bioinformatics. 13 (1): 328. doi:10.1186/1471-2105-13-328. PMC 3586947. PMID 23217028.
↑  Elo, Laura L; Järvenpää, Henna; Orešič, Matej; Lahesmaa, Riitta; Aittokallio, Tero (2007). "Systematic construction of gene coexpression networks with applications to human T helper cell differentiation process". Bioinformatics. 23 (16): 2096–2103. doi:10.1093/bioinformatics/btm309. PMID 17553854.
↑  Luo, Feng; Yang, Yunfeng; Zhong, Jianxin; Gao, Haichun; Khan, Latifur; Thompson, Dorothea K; Zhou, Jizhong (2007). "Constructing gene co-expression networks and predicting functions of unknown genes by random matrix theory". BMC Bioinformatics. 8 (1): 299. doi:10.1186/1471-2105-8-299. PMC 2212665. PMID 17697349.
ערך זה הוא יתום, כלומר אין ערכים בוויקיפדיה שמקשרים אליו. אתם מוזמנים לתרום לוויקיפדיה ולקשר אליו מכמה מהערכים שמכילים את המונח "רשת ביטוי משותף של גנים".
שני השלבים הכלליים לבניית רשת ביטוי משותף של גנים: חישוב ציון ביטוי משותף (למשל הערך המוחלט של מקדם מתאם פירסון) עבור כל זוג גנים, ובחירת סף מובהקות (למשל מתאם > 0.8).