קדם
אתחול התעתוק > אאוקריוטים

באאוקריוטים בקרת גנים היא מורכבת יותר מאשר בחיידקים והיא משלבת עיצוב מחדש של כרומטין, גורמי תעתוק, מַעַצְמִים, משתיקים ועוד. גורמי תיעתוק אאוקריוטיים יכולים להיות באינטראקציה עם רצפי מַעַצְמִים (Enhancers), משתיקים (Silencers) ומבודדים (insulators) הנמצאים רחוק יותר מאזור הקדם המרכזי. קישורם של גורמי התעתוק לרכיב מַעֲצֵם יכול לעודד ביטוי גנים, ובמקביל, קישורם לרכיב משתיק עלול לעכב את הביטוי.
בהשוואה לחיידקים, בתאים אאוקריוטיים יש יותר מאנזים רנ"א פולימראז אחד, כל אחד מהאנזימים האלה מעורב בסינתזה של תת-קבוצה של תעתיקים, אשר שונים בפונקציה, מבנה, שכיחות, ועוד. כל רנ"א פולימראז מזהה ומתעתק סוגים ספציפיים של גנים:
רנ"א פולימראז I אחראי לתעתוק גנים המקודדים לרנ"א ריבוזומלי.
רנ"א פולימראז II אחראי בעיקר לתעתוק גנים המקודדים לחלבונים.
רנ"א פולימראז III אחראי לתעתוק גנים של רנ"א לא מקודד (non-coding RNA), רנ"א מוביל (transfer RNA) ועוד מולקולות רנ"א קטנות.
רנ"א פולימראז IV ו- V נמצאים בצמחים בלבד, ואחראיים לסינתזה של siRNA (small interfering RNA).
POLRMT רנ"א – פולימראז שאחראי לסינתזת רנ"א המקודד בדנ"א המיטוכונדרי.
בתאים של יצורים אאוקריוטיים ישנם שלושה רכיבים מרכזיים בעלי תפקידים שונים (איור 2):
ליבת הקדם (Core promoter)
אזור ליבת הקַדָּם בדרך כלל משתרע על פני קטע קצר יחסית של דנ"א, בדרך כלל באורך של 50–100 זוגות בסיסים, והוא ממוקם מייד במעלה הזרם של אתר התחלת התעתוק (1+). האלמנטים העיקריים של הקדמים חיוניים לקביעת הדיוק והיעילות של תהליך התחלת התעתוק. ישנם מספר אלמנטים של ליבת הקדם הנמצאים בדרך כלל בגנים של אאוקריוטים. שלושה מהאלמנטים העיקריים הידועים ביותר של ליבת הקדם כוללים: תיבת TATA, אלמנט התחלת התיעתוק (INR) ואלמנט הזיהוי (B).
תיבת TATA: היא אחת מרכיבי הקדם הידועים ביותר וממוקמת בדרך כלל סביב 25–30 זוגות בסיסים במעלה הזרם של אתר תחילת התעתוק. תיבת TATA מורכבת מרצף שמור, בדרך כלל "TATAAA" ומשמשת כאתר זיהוי עבור קומפלקס חלבונים הנקרא (TATA-Binding Protein) TBP. קומפלקס זה מהווה חלק ממכלול חלבונים גדול יותר הנוצר באזור קדם הגן לפני תחילת התעתוק והידוע בשם (pre-initiation complex) PIC. הקישור של TBP לתיבת TATA מסייע למקם את הרנ"א פולימראז II במיקום הנכון על גבי הגן לצורך התחלת התעתוק.
אלמנט התחלת התיעתוק (The initiator element (INR)): הוא רכיב קדם חיוני שנמצא בדנ"א של אאוקריוטים. רכיב זה ממוקם בדרך כלל ליד אתר התחלת התעתוק ומכיל רצף שמור ומורכב לעיתים קרובות מהרצף המוסכם "YYANWYY", כאשר Y מייצג פירימידין (C או T), A מייצג אדנין, W מייצג A או T ו-N מייצג כל נוקלאוטיד. אלמנט התחלת התיעתוק מזוהה על ידי גורמי תעתוק שונים, ביניהם גורם התעתוק הכללי TFIID (Transcription factor IID), אשר מגויס על ידי האינטראקציה בין תיבת TATA לבין TBP. האינטראקציה בין TFIID לבין רכיב התחלת התיעתוק INR מסייעת לייצב PIC ולמקם במדויק את הרנ"א פולימראז II באתר תחילת התעתוק.
אלמנט הזיהוי (B) (B recognition element (BRE)): הוא רכיב הנמצא בסמוך לתיבת ה-TATA ברוב הגנים באאוקריוטים. ישנם שני סוגים של רכיב הזיהוי B, אשר נמצאים באזור קדם הליבה, אחד מהם ממוקם במעלה הזרם ביחס לתיבת ה-TATA ונקרא BREu והשני ממוקם במורד הזרם ונקרא BREd, והם מתפקידים יחד עם תיבת ה-TATA. אלמנט הזיהוי B משמש כאתר עגינה עבור גורם התעתוק TFIIB (Transcription factor IIB) ובכך מסייע למקם את PIC באתר התחלת התעתוק.
קדם פרוקסימלי (Proximal promoter)
בהמשך מעלה הזרם של ליבת הקדם ניתן למצוא את הקדם הפרוקסימלי המכיל אלמנטים רגולטוריים רבים. הקדם הפרוקסימלי נמצא כ-250 זוגות בסיסים במעלה הזרם מאתר התחלת התעתוק (1+) והוא האתר שבו גורמי התעתוק הכלליים נקשרים.
קדם דיסטלי (Distal promoter):
החלק האחרון של אזור הקדם נקרא הקדם הדיסטלי, והוא נמצא במעלה הזרם ביחס לקדם הפרוקסימלי. הקדם הדיסטלי מכיל גם אתרי קישור של גורמי תעתוק.
בנוסף, לאאוקריוטים יש מגוון של אזורים ואלמנטים נוספים שיכולים להיחשב כחלק מרצף הקדם, כגון DPE (downstream promoter element), תיבת ה-CAAT ותיבת ה-CG ועוד אלמנטים רגולטוריים אחרים מרוחקים יותר מאזור הקדם (איור 2).