יגאל לוינשטיין
עמדותיו

הרב לוינשטיין סבור ש"תפיסות מגדריות" מחלחלות אל תוך הצבא. הוא פרסם בעניין זה את החוברת "אג'נדה צבאית". בהרצאה שנשא ב"כנס ציון וירושלים" ביולי 2016, ביקר את קצין חינוך ראשי תת-אלוף אבנר פז-צוק, שלדבריו פועל להפסיק את השפעת הרבנות הצבאית על התכנים הערכיים בצה"ל, על ידי חיסול "המחלקה לתודעה יהודית", בגיבוי ראש אכ"א, הרמטכ"ל ושר הביטחון יעלון, ועל ידי סימון קצינים ואף חיילים בעלי השקפה ישיבתית. בין הערכים האלטרנטיביים שאותם לדבריו מנחיל הצבא ואותם ביקר כמסוכנים לרוח הלחימה, מנה את הפלורליזם, לרבות הכרת הנרטיב הפלסטיני, חיוב קצינים להשתתף בסמינרים רפורמיים והדרכות של הומוסקסואלים, עד כדי התנדבות לצבוע מועדון של הקהילה. בנוסף הזכיר טען כי חויבו חיילים, לרבות דתיים, לצפות במופעים שאינם צנועים ולשרת ביחידות קרביות מעורבות.
באחד מנאומיו, כינה את חברי הקהילה הגאה "סוטים". דבריו עוררו סערה תקשורתית וכונו "נאום הסוטים". בהמשך כינה אותם את נטייתם "עיוות מיני", הורה כי "בעיות מדבירים" וקרא לטפל בהומוסקסואליות כמו שטיפלו באיידס. משרד הביטחון פרסם הודעת גינוי לדבריו. הוא סבור שעל עולם המדע להגדיר נטיות הומוסקסואליות כבעיה, ואז להתגייס כדי למצוא להן פתרון, כפי שהתגייסו להדברת מגפת האיידס ומומים שונים כגון עיוורון. הוא תומך בטיפול המרה לשם שינוי הנטייה המינית, עבור אלו המעוניינים בכך, ובפרט בטיפול בהומוסקסואליות וביסקסואליות ("נטיות הפוכות", כלשונו). הוא סיפר כי הפנה לטיפול פסיכולוגי נערים שפנו אליו וביקשו סיוע בהתגברות על משיכה לבנים. מאידך, הוא מתנגד לטיפולים במכות חשמל. כ-300 מרבני הציונות הדתית פרסמו גילוי דעת התומך ברב לוינשטיין. בעקבות הביקורת פרסם הרב לוינשטיין מכתב הבהרה שבו כתב שדבריו פורשו באופן שלא התכוון לו ושלכל חלקי האוכלוסייה יש מקום בצה"ל.
במרץ 2017 שוב התבטא בחריפות נגד גיוס לוחמות לצה"ל, ובפרט דתיות ואמר: "שיגעו לנו את הילדות, מגייסים לנו אותן לצבא. הן נכנסות יהודיות - הן לא יהודיות בקצה". דבריו עוררו ביקורת ו-28 ראשי מכינות קדם-צבאיות, בהן שתי מכינות דתיות לבנות ומכינה דתית לבנים, פרסמו מכתב המגנה את דבריו. מנגד, כ-200 קצינים בוגרי מכינת עלי חתמו על עצומת תמיכה ברב לוינשטיין. לוינשטיין התנצל על הסגנון, אך לא חזר בו. בהזדמנות אחרת אמר שהבשורה הנשית היא בשורת השלום, לכן מלחמה ונשים סותרים זה את זה. "בעולם המודרני הפכו את הנשים לגברים וערכן נמדד רק בקריטריונים של גברים". בשיחה עם תלמידי ישיבה בשדרות טען שחיילות שפונות לשירות קרבי באות בעיקר מהפריפריה, משום שהן מנסות לשדרג את מעמדן החברתי. לעומתן, "האשכנזיות הולכות ל-8200, משחקות במחשב והולכות הביתה. הן גרות ברמת אביב ג' ומשרתות בגלילות". בעקבות דבריו אלו הודיע שר הביטחון אביגדור ליברמן שאם לא יתפטר מתפקידו במכינה הוא יבטל את ההכרה במכינה הקדם צבאית שבראשותו, אולם היועץ המשפטי לממשלה, אביחי מנדלבליט, הודיע כי אין בסמכותו של שר הביטחון להטיל סנקציה כזאת.
בשנת 2020, לאחר שכתב גל"צ אמר בשידור שלוינשטיין "מעודד טיפולי המרה", הגיש תביעת לשון הרע נגד התחנה. כעבור כחמישה חודשים הגיעו הצדדים לפשרה שתוקרא התנצלות בשידור התוכנית "בוקר טוב ישראל" וישולמו לו ולמכינת עלי 12,000 ש"ח על הוצאות המשפט ושכר טרחת עורך דין.
בשנת 2024 במהלך מלחמת חרבות ברזל הביע דעתו בסוגיית גיוס חרדים והצדיק את הציבור החרדי החושש מהשפעה חילונית על חרדים שישתלבו ויתגייסו לצבא. עוד התבטא בנושא ואמר שהעולם החרדי לא מתגייס משתי סיבות: אידאולוגיה שלא רואה ערך בציונות וקושי לשמור על הזהות החרדית בצבא. לדבריו אין לו ביקורת על העמדה החרדית הזאת מכיוון שזה סדר אלוקי עמוק מאוד שלא תאבד תורה מישראל, כדי לשמור על רצף התורה לדורות מסיני עד היום. ושמדובר בציבור גדול שמוצא בקרבו דחף פנימי עמוק למסור את הנפש שלא תאבד תורה מישראל. עם זאת, הוא טען כי שיתוף פעולה עם רשויות הצבא בפרויקטים כמו "שחר כחול" התואמים לאורחות חייהם של חרדים, הביא לעלייה ניכרת של מספר המתגייסים החרדים. אולם התערבות של בג"ץ מספר פעמים בטענה של "חוסר שוויוניות" מול רשויות הצבא גרמו להפסקת הפרויקטים. לדבריו, ניתן להביא לעלייה ניכרת בגיוס חרדים אם יובטח כי היועצת המשפטית לממשלה, היוהל"ן ונשיא בית המשפט העליון לא יתערבו בתהליך.