באטמן: ארקהם נייט
עלילה

תשעה חודשים לאחר מותו של הג'וקר, העיר גות'אם נהנית מחוסר בפשע, התושבים חוזרים לחייהם הרגילים והכל חזר לשגרה. בזמן הזה באטמן, שמבין שמדובר בשקט שלפני הסערה מתחיל במבצע איסוף והשמדה של מנות הדם הנגועות שהג'וקר שלח מארקהם סיטי לבתי חולים בגות'אם. בנוסף, מתגלה שחמישה אנשים נחשפו לדם הנגוע בטיטאן שהג'וקר שלח וכעת ארבעה מהם הפכו לדמויי ג'וקר בעצמם. באטמן, בעזרתו של רובין (טים דרייק) מנסה לסנתז נוגדן למחלתם.
בערב ליל כל הקדושים, הדחליל משחרר דגימה קטנה של גז הפחד שלו בדיינר ומודיע שביום למחרת כל העיר תכוסה בגז, מה שגורם לששת מיליוני האזרחים להתפנות מהעיר. לעומתם, פושעי העיר ונבלי העל נשארים מאחור וגורמים לכאוס. המשטרה חסרת סיכוי מולם וג'יימס גורדון, מפכ"ל המשטרה, מפעיל את אות העטלף.
באטמן חוקר את אחד מחייליו של הדחליל ומגלה שהוא מסתגר בפנטהאוס בצ'יינהטאון. באטמן מגיע ומגלה שהדחליל לא שם, אך צוותו של הדחליל מחזיק בפויזן אייבי בתור בת ערובה ושהיא חסינה לגז הפחד של הדחליל. באטמן מוציא אותה ולוקח אותה למאסר ב-GCPD (תחנת המשטרה של העיר גות'אם). באטמן מגיע למגדל השעון שמשמש כבסיסה וביתה של אורקל (ברברה גורדון, באטגירל לשעבר שהפכה למשותקת באירועי "באטמן: הבדיחה ההורגת" וכעת משמשת אשת המחשבים מרחוק של באטמן). אורקל מצליחה לנתח דגימה מגז הפחד והשניים מגלים שהגז מיוצר באייס כימיקלים.
באטמן מגיע לאייס כימיקלים ומגלה שחמישה מאנשי הצוות של המפעל מוחזקים כבני ערובה. באטמן מגלה ששלושה אנשי צוות נרצחו ומציל את השניים הנותרים. במהלך ההצלה באטמן מתוודע לאויב חדש בשם "ארקהם נייט" (אביר ארקהם) שמשתף פעולה עם הדחליל ונראה נוטר טינה לבאטמן בגלל סיבה לא ידועה. באטמן מניס את ארקהם נייט ומתעמת עם הדחליל בחדר הכימיקלים. במהלך העימות, הדחליל אומר שצוותו לכד את ברברה גורדון ומשאיר את באטמן נעול במפעל. באטמן מסכן את חייו ומצליח לצמצם את היקף הפיצוץ במטרה שיפגע רק במפעל עצמו ולא בעיר, אך בעקבות גז הפחד שזורם בחדר הוא הוזה את הג'וקר למולו ומתעלף. באטמן מתעורר, מצליח לברוח מהמפעל ומגלה שהשילוב בין גז הפחד ודמו הנגוע של הג'וקר גורם לבאטמן להזות את הג'וקר, שבינתיים מנסה להאט את באטמן, להפריע לו ולהשתלט על גופו בהדרגה.
באטמן מספר לגורדון שברברה נחטפה ומגלה לו שהיא שימשה כעוזרת שלו לכל אורך הדרך. גורדון מרגיש נבגד ומחליט לחפש את ברברה לבדו. בהמשך הערב באטמן נפגש עם נייטווינג (דיק גרייסון, לשעבר רובין) והשניים חוקרים את הפינגווין ומגלים שהדחליל משתף פעולה עם איש עסקים בשם סיימון סטאג, הבעלים של שתי ספינות אוויר בשמי גות'אם ומייסדה של חברת אנרגיה. באטמן מגיע לאחת מספינות האוויר של סטאג ומתוודע לפרויקט בשם "שבר ענן" שקשור לגז הפחד, אך לפני שבאטמן מספיק לחקור את סטאג אודות המכשיר, סטאג נושם את גז הפחד ומנוטרל. במהלך החיפושים בספינת האוויר באטמן מתעמת מול הדחליל בשנית, שהפעם מזריק לו כמות גדולה יותר של גז פחד. הג'וקר משתלט על גופו של באטמן, מנטרל את הדחליל אך באטמן חוזר לשפיות רגע לפני שהוא הורג את הדחליל במו ידיו. הדחליל מצליח לברוח ומספר לבאטמן שברברה נמצאת באותו הפנטהאוס שבו הוא החזיק את פויזן אייבי קודם לכן.
באטמן מגיע לפנטהאוס ורואה את ברברה מחוסרת הכרה כשלצידה אקדח בחדר אטום שאליו זורם גז הפחד. ברברה נושמת את הגז ומרוב פחד מתאבדת בירייה. אלפרד מסביר לבאטמן במכשיר הקשר כי הוא גילה ששבר הענן הוא בעצם מכשיר פיזור שאמור לפזר את הגז בשמי גות'אם. באטמן השבור נזכר שפויזן אייבי חסינה לגז הפחד של הדחליל, חוזר ל-GCPD ומביא אותה לגנים הבוטאניים של גות'אם במטרה שזו תפיק נוגדן לגז במידה והוא ישתחרר מעל העיר. פויזן אייבי מצליחה בעזרת באטמן לשחרר את שורשיו של עץ עתיק ומצמיחה פרחי ענק מעל העיר, אלו אמורים לבלוע את הגז במידה וירחף באוויר.
באטמן מגיע לאולפן הסרטים במטרה לבדוק האם רובין התקדם עם הנוגדן למחלת הג'וקר. באטמן, המבין שרובין מנהל מערכת יחסים רומנטית עם ברברה מחליט לא לספר לו על מותה על מנת שזה יתרכז בחיפוש התרופה. באטמן מגיע לאולפן הסרטים ומגלה שהארלי קווין השתלטה עליו ושחררה את שלושה מתוך ארבעת הנגועים לחופשי ברחבי האולפן, מלבד את הרביעי ששמו הנרי, אשר נראה חסין להשפעת המחלה ולכן נשאר מאחור וסייע לבאטמן ורובין להשיב את הנגועים חזרה. באטמן ורובין חוזרים למעבדה ומגלים את שלושת הנגועים מתים. מתגלה שהנרי הוא זה שעזר להארלי לפרוץ לאולפן הסרטים והרג את כל הג'וקרים האחרים במטרה שרק אחד מהם, הנעלה ביותר יוכל לרשת את הג'וקר. הג'וקר משתלט על גופו של באטמן בשנית והנרי מבין שבאטמן יהיה ג'וקר טוב ממנו, ומתאבד בירייה. רובין מבין שבאטמן הוא החולה החמישי ומנסה לנעול אותו באחד התאים על מנת שלא יפגע באף אחד.
בהזיה שמתרחשת באותו רגע באטמן נועל את עצמו בתא ורובין יוצא על מנת לעצור את הדחליל. הג'וקר מספר לבאטמן על הזמן שבו הוא לכד ועינה את ג'ייסון טוד (הרובין השני שנהרג על ידי הג'וקר באירועי "באטמן: מוות במשפחה") באחד החדרים הנסתרים בארקהם אסיילום ולבסוף רצח אותו ביריית אקדח. באטמן מתעשת ומבין שהכל היה רק אשליה ושהוא עדיין לא ננעל בתא. באטמן נועל את רובין בתא במקומו במטרה להגן עליו, ומספר לו על מותה של ברברה.
הדחליל מפעיל את שבר הענן והמכשיר משחרר את גז הפחד מעל שמי גות'אם. באטמן ופויזן אייבי משתפים פעולה, מצליחים להרוס את המכשיר ולנקות את הגז, אך פויזן אייבי לא עומדת בזרם הגז בגופה ומתה בזרועותיו של באטמן.
לאחר מכן באטמן מגלה שארקהם נייט מחזיק במפקח גורדון בתור בן ערובה ויוצא למרדף אחריו. בסופו של דבר מתגלה שארקהם נייט הוא בעצם ג'ייסון טוד שלא מת בידיו של הג'וקר, ונטר טינה לבאטמן על שנטש אותו כי חשב שהוא מת. הוא חושף את זהותו של באטמן מול גורדון, והשניים נלחמים בזמן שבאטמן מנסה לשכנע אותו להפסיק. באטמן מנטרל את ג'ייסון שמצליח לברוח ומשחרר את גורדון. השניים עולים לגג הבניין להתעמת מול הדחליל וגורדון (שכעת יודע את זהותו של באטמן) מתנצל בפני באטמן על כעסו ומתוודה שהוא מעולם לא שכח את הפגישה הראשונה שלו עם ברוס ווין הצעיר לאחר שהוריו נרצחו. באטמן וגורדון מגיעים לגג שם מתברר שברברה עודנה חיה ומסתבר כי התאבדותה הייתה רק אשליה של באטמן בגלל גז הפחד. גורדון יורה בבאטמן בתמורה לחיי בתו, אך הוא כיוון במכוון אל האזור החסין בחליפה שלו. הדחליל בכל זאת זורק את ברברה מהגג ובאטמן מציל אותה ולוקח אותה חזרה לתחנת המשטרה של גות'אם.
באטמן חוזר לאולפן הסרטים ומגלה שהדחליל חטף את רובין מהתא ומחזיק בו ובגורדון בתור בני ערובה בארקהם אסיילום. הדחליל מציב לבאטמן אולטימטום: להסיר את מסכתו או שהם ימותו. באטמן מסכים ובהגיעו לשם, הדחליל חושף את זהותו של באטמן כברוס ווין מול מצלמות הטלוויזיה ומזריק לו גז פחד בכמות עצומה. במוחו של באטמן, באטמן והג'וקר מתעמתים בקרב סופי על גופו של באטמן. באטמן מבין שפחדו הגדול של הג'וקר הוא להישכח ולבסוף מצליח לכלוא אותו בתת-המודע שלו ומקבל שליטה מלאה על גופו. הדחליל רואה שבאטמן מצליח להתנגד ומזריק לו עוד מנה מגז הפחד, אבל מיד מגלה שבאטמן כבר לא מפחד מכלום. ג'ייסון טוד חוזר, הפעם בתור הברדס האדום ומחלץ את באטמן. באטמן מזריק לדחליל טעימה מגז הפחד שלו עצמו, מה שחושף שפחדו הגדול של הדחליל הוא באטמן.
בסופו של דבר, באטמן מבין שתפקידו הסתיים כיוון שזהותו הסודית (גורם ההפחדה שלו) נחשפה לעולם, אך גות'אם זקוקה לבאטמן לעוד לילה אחד אחרון ולאחר שהשחקן סיים את משימות "המבוקשים ביותר" (המשימות הצדדיות במשחק) באטמן יכול להפעיל את פרוטוקול "נפילתו של אביר" גורדון שולח את כוחות המשטרה להתמודד עם הפושעים הנותרים. באטמן חוזר לאחוזת ויין, מסתגר בתוכה עם אלפרד ומפוצץ אותה. ואם השחקן מגיע ל-100% במשימות הצדדיות נפתח הסוף המורחב שבו בסוף המשחק באטמן מת לכאורה, רובין ואורקל התחתנו וגורדון הפך לראש העיר של גות'אם. בקטע האחרון נראית משפחה שיוצאת מבניין האופרה ונתקלת בשודדים ברחוב (אזכור לסיפור מקורו של באטמן), אך דמות אפלה עם גלימה שמזכירה את באטמן מגיחה מאחד הגגות אל עבר השודדים.