אקס-מן: התריסר
עלילה

אפוקליפס החל את מתקפתו בכך ששתל מתחזה של וולברין בקרב האקס-מן. הדבר הוביל את אקסבייר, שחשד בהסתננות לקבוצה, לפרק את האקס-מן. מעט לאחר מכן, רוג ושאדוקאט מוצאות את עצמן כשהן מגנות על נבלת-העל מיסטיק מפני צבא יפן. בעוד רוג לחמה בסאנפייר ואנשיו, קיטי שמרה על מיסטיק ומצאה ללא רצונה את יומנה של דסטיני, מוטאנטית בעלת כוחות ראיית הנולד. היומן כלל תיאור מעורפל מאוד של "החבר השלושה-עשר", וכי התריסר יהיו מעורבים בהשמדת העולם.
עם מותו של המתחזה לוולברין, האקס-מן מתאחדים באחוזת אקס ומגלים כי מדובר במתחזה מגזע הסקרול משני הצורה. כדי להציל את פולאריס מחטיפה, סייקלופס החליף את דמותה באמצעות שימוש במחליף זהויות, והאקס-מן עקבו אחריו למאורתם של הסקרול. הם הותקפו שם בידי מוות, חבר ארבעת הפרשים הקטלני והמסוכן ביותר, שגם היה אחראי למות המתחזה לוולברין. אחרי קרב קשה, זהותו מתגלה בידי קולוסוס, והאקס-מן נדהמים לגלות שמדובר בוולברין האמיתי. הוא עוזב, ומשאיר אותם מבולבלים ומלאי תהיות על החידה הניצבת בפניהם.
מעט אחר מכן, אקסבייר חושף את רשימת "התריסר" שנכתבה ביומניה של דסטיני:
מגנטו ופולאריס, המייצגים שני קטבי מגנטיות מנוגדים.
סטורם, סאנפייר ואייסמן, המייצגים את כוחות האלמנטלים.
סייקלופס, ג'ין גריי וקייבל, המייצגים משפחה (אב, אם וילד), ואשר נבחרו בשל שושלת היוחסין של משפחת סאמרס.
בישופ ומיקאיל רספוטין, המייצגים את הזמן והמרחב, בהתאמה.
פרופסור אקס, המייצג את המוח.
המונולית האנושי, המייצג את הבסיס עליו מושתת הכל.
פרשי אפוקליפס חוטפים את קייבל, מיקאיל רספוטין, אייסמן, סאנפייר והמונולית האנושי. האקס-מן, בעזרתו של מגנטו, ממהרים למאורתו של אפוקליפס במצרים. הם מותקפים בידי חיילי הסקרול ומאמיניו של אפוקליפס. באמצעו של הקרב, בישופ מופיע לפתע מתוך האוויר, לאחר שהיה כלוא במרחבי העתיד החלופי. באמצעות תכסיסים ואשליות, מאמיניו של אפוקליפס חוטפים את שאר חברי התריסר, שתפקידם האמיתי מתגלה לבסוף. אפוקליפס מכניס את התריסר לתאי הכלה - חלק ממכונה שמיימית עתיקת-יומין - וחושף את תוכניתו לשאוב את כוחותיהם של "האחד-עשר", בעוד החבר האחרון מפעיל את המכונה, כדי להעניק לו כוח אומניפוטנטי. אפוקליפס מסביר את תפקידם של חברי התריסר: פולאריס ומגנטו היו שני קטבים מגנטיים מנוגדים; סטורם, אייסמן וסאנפייר היו כוחות טבע קיצוניים; סייקלופס, ג'ין וקייבל היו לאחדות משפחה; בישופ ומיקאיל סיפקו שליטה על המרחב והזמן; ואקסבייר סיפק את כוחה של המחשבה הטהורה. אולם, אפוקליפס ידע כי גופו העתיק והחלוש לא יוכל לאכלס את הכוח האדיר. אי לכך, הוא חושף את קיומו של מוטאנט שלוש-עשרה במספר, איש אקס. הוא מתעתד להעביר את תודעתו לתוך גופו של המוטאנט הצעיר ולהשתמש באנרגיות התריסר כדי להוסיף ולהתפתח.
אפוקליפס החל בתהליך, אולם אובדן כוחותיו של מגנטו לאחרונה היה משהו שהוא לא ציפה לו. עד מהרה, רמת האנרגיה התרוקנה ויצרה קרע בשרשרת הכוחות. אפוקליפס העלה את זרימת האנרגיה וניסה לעקוף את הקרע, אך הדבר דחף את המונולית האנושי לכדי שיגעון, והוא השתחרר מתא ההכלה שלו ובטירופו שחרר את חברי האקס-מן מכלאם. בזמן שמחצית מהקבוצה לחמה במונולית חסר הרסן, השאר ניסו לעצור את אפוקליפס. ג'ין גריי חשפה את טיבו האמיתי - גופו מעלה הריקבון מתחת לשריון שלו. כאשר הוא ניסה להיכנס לגופו של נייט גריי, סייקלופס לקח את מקומו והקריב את חייו כדי להציל את נייט. ג'ין ניסתה ליצור קשר עם מוחו של בעלה, אך אקסבייר טען כי לא נותר דבר מסייקלופס בתוך אפוקליפס.
הסיפור ממשיך בקשת הסיפור "עידני אפוקליפס" ממרץ 2000. אפוקליפס משתמש באנרגיות אותן אסף, ויוצר מחדש שתי מציאויות בניסיון להשלים את התהליך ואת הטרנספורמציה הסופית שלו. הוא לא יכל לעשות זאת, משום שהאקס-מן לחמו בו בשתי המציאויות - בעבר ובהווה. האנרגיה שלו אוזלת, והוא והמונולית האנושי נמלטים. האקס-מן מנעו מאפוקליפס להפוך לאל חי וקיים, במחיר חייו של סייקלופס. ג'ין שבורת לב ממותו של בעלה, ולוקחת היעדרות ממושכת מהקבוצה.