נרקוס
עלילה > עונה שלישית

העונה השלישית מתמקדת ב"קרטל הסמים קאלי", שמקום שבתו בעיר סנטיאגו דה קאלי, ובניסיון של רשויות האכיפה הקולומביאניות וסוכני ה-DEA למוטטו. בעונה זו פועל מתוך שגרירות ארצות הברית בקולומביה זוג סוכני DEA בשם כריס ודניאל, כשמפקדם הוא חאבייר פניה (בגילומו של פדרו פסקל) המוכר מהעונה הראשונה והשנייה של הסדרה.
עד לקריסת הקרטל של אסקובר, שמקום מושבו היה במדיין, נחשב קרטל קאלי לשני בעוצמתו בין קרטלי הסמים בקולומביה. לאחר מותו של אסקובר, המתואר בסוף העונה השנייה של הסדרה, הופך 'קאלי' לקרטל הסמים החזק והגדול ביותר. עובדה זו מושכת אליו תשומת לב ציבורית בלתי-רצויה מבחינתו ומציבה אותו כמטרה עקרית מבחינת רשויות האכיפה, שכעת יכולות להפנות אליו את משאביהן.
מסיבה זו, מחליט ראש הקרטל, חילברטו רודריגס אורחואלה, להסתפק בעושר הרב שצברו הוא ואנשיו עד לשלב זה ולפרק את הקרטל. על-פי תוכניתו של חילברטו נרקמת מאחורי הקלעים עסקה בין הקרטל לבין ממשלת קולומביה, על-פיה הקרטל יפורק וראשי הקרטל יסגירו את עצמם. בתמורה, על-פי העסקה המתרקמת, ראשי הקרטל ירצו עונשי מאסר קצרים בתנאים נוחים והרכוש הרב שצברו, כתוצאה מפעילותם הפלילית, יישאר בחזקתם.
העסקה המתרקמת עולה במפתיע על שרטון בעקבות מעצר מוצלח של ראש הקרטל, חילברטו, המאפשר למצות את הדין עמו ובכך לפגוע בקרטל מבלי להזדקק לעסקה. מעצרו של חילברטו ועיכוב העסקה שעמדה על הפרק מערערים את קרטל 'קאלי' ומעוררים חילוקי דעות בארגון ובסביבתו.
לאחר מעצרו המפתיע של חילברטו, עובר לעמוד בראש הקרטל אחיו מיגל החסר את הכריזמה ויכולת ההנהגה של אחיו. בתחילה, נדמה שבכירי הקרטל כולם ושותפיו רואים בעין יפה את ההסדר המתרקם אולם הנסיבות החדשות מביאות לאי-בהירות ביחס לעתידו של הקרטל, עתיד אנשיו ועתיד עסקי הסמים שבשליטתו. אי-הוודאות והיעדרה של מנהיגות חזקה והחלטית מביאות לקושי בשליטה בארגון, המתפרש כחולשה בעיני ארגוני הפשיעה המתחרים. ארגוני הפשיעה המתחרים רואים בכך הזדמנות לפתוח במאבק אלים מול קרטל 'קאלי', כדי לגזול ממנו נתחים מעסקי היצור והברחת הסמים. בנסיבות האלה נקלע קרטל 'קאלי' לעימותים אלימים חיצוניים, מול הארגונים המתחרים, ופנימיים, מול חברי קרטל העשויים לשתף פעולה עם רשויות האכיפה.
מאבקו של הקרטל נקלע לעברי פי פחת כאשר מבצע מוצלח של רשויות האכיפה מביא למעצרו של מיגל, ראש הקרטל. כעת, מששני האחים אורחואלה, שהיוו את ראשי הקרטל, נתונים במעצר הרי שהקרטל חלש מתמיד ובכירי הארגון שאינם במעצר נתונים בסכנת חיים מצד הארגונים המתחרים. בלית ברירה, מחליטים בכירי הארגון להסגיר את עצמם לידי רשויות האכיפה ובכך לפרק למעשה את הקרטל.
הכניעה וההסגרה העצמית נועדו למנוע את המאבקים האלימים מול הארגונים המתחרים ובכך לנטרל את האיום על חייהם של אנשי הארגון. מעבר לכך, ראשי הארגון מתכננים להפעיל בעת מעצרם אנשי ממשל קולומביאנים מושחתים שבראשם ניצב הנשיא, כדי לנסות ולהשיג עסקה חדשה שתבטיח תנאי מאסר קלים, שחרור מוקדם ושמירה על ההון שצברו. עסקה כזו, אם תגובש, תהיה מן-הסתם גרועה יותר עבורם מהעסקה הראשונית שתוכננה, מאחר שכעת אנשי הארגון כבר נתונים במעצר, אך תהיה טובה יותר מכלום. כדי להסדיר עסקה כזו, בה לראשי הארגון נותר מעט מאוד לתת, ולהוציאה לפועל מפעילים בכירי הארגון שורה של פוליטיקאים מושחתים, איתם עמד הארגון בקשר במשך שנים מאחורי הקלעים, בין היתר באמצעות העברת סכומי כסף עצומים.
בשלב זה נדמה שידם של אנשי הארגון תהיה בסופו של דבר על העליונה, אך כתבי אישום המתגבשים נגדם בארצות הברית מביאים ללחץ מצד הממשל האמריקאי על ממשלת קולומביה להסגירם. מתוך ארבעת הסנדקים של הארגון, פאצ'ו נרצח בזמן מאסרו וצ'אפה נרצח לאחר שנמלט ממאסר וניסה לחבור למחתרת האנטי-קומוניסטית (אך ראשי המחתרת לא אהבו את כמות הכסף המעטה שהסכים לתרום עבור מאבקם). שני ראשי הקרטל לשעבר, האחים חילברטו ומיגל אורחואלה, שנותרו במעצר בקולומביה, מוסגרים לארצות הברית, שם הם מורשעים ומרצים עונשי מאסר עד עצם היום הזה.
מאסרם של חלק גדול מאנשי הקרטל והפסקת מעורבותו בעסקי הסמים, כמו גם מאסרם של האחים אורחואלה ומות יתר בכירי הארגון, סתם את הגולל על קרטל הסמים 'קאלי' ומביא לסיומה את העונה שעסקה במאבק בו.
אחרית דבר, לאחר שקרטל 'קאלי' פורק ובכיריו נאסרו, שב סוכן ה-DEA חאבייר פניה לארצות הברית. שם, לנוכח הצלחותיו במאבק מול קרטלי הסמים בקולומביה, מבקשים ממנו מפקדיו ליטול חלק במאבק מול סוחרי הסמים במקסיקו אך הוא לא מסכים להצעה.