Persona 3 The Movie
Elokuvat > Midsummer Knight’s Dream

SEES kukistaa heinäkuussa täydenkuun yönä Ylipapin (Hierophant Arcana) ja Rakastavaisten arkanoiden  (Lovers Arcana) suuret varjot, kolmen salaperäisen henkilön tarkkaillessa heitä. Myöhemmin he lähtevät lomalle Yakushiman saarelle, missä Mitsurun isä Takeharu Kirijo kertoo totuuden siitä miksi pimeä tunti oli olemassa: Mitsurun isoisä Kouetsu Kirijo yritti löytää keinoa manipuloida aikaa varjojen avulla, mutta alkoikin lopulta tutkia jotain aivan muuta, minkä vuoksi Yukarin isä Eiichiro Takeba oli ennen kuolemaansa pysäyttänyt kokeen ja päästänyt suuret varjot vapaiksi. Ikutsuki uskoo, että 12 suuren varjon tuhoaminen hävittäisi pimeän tunnin. Yukari on järkyttynyt isänsä teoista ja Makoto yrittää lohduttaa häntä. Varjot hyökkäävät heidän kimppuunsa, mutta persoonankäyttäjäksi ja androidiksi paljastunut vaaleahiuksinen tyttö pelastaa heidät. Androidin nimi oli Aigis ja hän oli 7. sukupolven varjotorjunta-ase, joka liittyy SEESiin.
Loman jälkeen Makoto alkaa Mitsurun pyynnöstä tarkkailla ala-asteopiskelijaa nimeltä Ken Amada, selvittääkseen onko tällä potentiaalia tulla persoonankäyttäjäksi. Mutta pimeän tunnin aikana varjo hyökkää Naganakin pyhäkköön, jota suojelee sen edesmenneen papin lemmikkikoira Koromaru. Ken herättää persoonansa ja uskoen varjojen aiheuttaneen myös äitinsä kuoleman kaksi vuotta sitten, hän liittyy Koromarun kanssa SEESiin. Elokuun täydenkuun yönä Takaya Sakaki ja Jin Hirato, jotka kuuluivat ryhmään nimeltä Strega, esittäytyvät SEESille, julistaen aikovansa estää näiden aikeet eliminoida pimeä tunti. He lukitsevat nämä toisen maailmansodan aikaiseen bunkkeriin ja täyttävät myrkkykaasulla. Mutta Shinjiro vapauttaa heidät ja Makoto tuhoaa Sotavaunun (Chariot Arcana) ja Oikeuden arkanoiden (Justice Arcana) suuret varjot. Kesän lopussa SEESin jäsenet osallistuvat kesäfestivaalille ja Ken alkaa tulla toimeen Shinjiron kanssa. Aigis aloittaa lukion käynnin Makoton luokalla.
Syyskuun täydenkuun yönä, SEES käy Escapade-yökerhon tiloissa taistelua Erakon arkanan (Hermit Arcana) suurta varjoa vastaan. Mutta Makoto alkaa epäröidä, koska pelkää elämänsä ainoan merkityksen katoavan pimeän tunnin eliminoitumisen myötä ja lisäksi Shinjiro menettää persoonansa, Kastorin (Castor), hallinnan. Ken tunnistaa Kastorin samaksi olennoksi, joka aiheutti hänen äitinsä kuoleman. Seuraava täysikuu oli 4. lokakuuta. Akihiko ja Mitsuru paljastavat muille SEESin jäsenille Kenin äidin kuolleen samana päivänä kaksi vuotta sitten, koska Shinjiro oli silloinkin menettänyt persoonansa hallinnan. Mutta SEESin yrittäessä lähteä estämään Kenin aikeet tappaa Shinjiro, Kohtalonpyörän (Fortune Arcana) ja Voiman arkanoiden (Strength Arcana) suuret varjot hyökkäävät. Makoto ja Akihiko pysäyttävät varjot, mutta Takaya saapuu paikalle ja paljastaa myyneensä Shinjirolle pillereitä, jotka auttaisivat persoonan hallitsemisessa. Nämä pillerit olivat sivuvaikutuksena lyhentäneet Shinjiron elinaikaa. Koska Shinjiro kuolisi joka tapauksessa, Ken menettää halunsa elää ja pyytää saada kuolla Takayan luotiin. Mutta Shinjiro ottaa luodin vastaan Kenin sijasta. Muut SEESin jäsenet saapuvat, mutta Shinjiro kuolee haavoihinsa ja kehottaa Keniä jatkamaan elämäänsä.