Shin Megami Tensei: Persona 4
Juoni

Peli sijoittuu vuoden 2011 huhtikuun ja vuoden 2012 maaliskuun väliselle ajalle. Alussa protagonisti (jolle pelaaja voi itse antaa nimen) kutsutaan Samettihuoneeseen, jossa Igor ja tämän assistentti, Margaret, ennustavat tämän joutuvan selvittämään mysteeriä, jonka ratkaisemisesta riippuu tulevaisuus. Protagonisti joutuu tämän jälkeen matkustamaan junalla vanhempiensa kiireiden takia vuoden ajaksi maalaiskaupunki Inabaan enonsa, rikosetsivä Ryotaro Dojiman ja serkkunsa Nanakon luokse. Seuraavana aamuna hän aloittaa opiskelun Yasogamin lukiossa, jossa hän ystävystyy Junes-kauppakeskuksen johtajan pojan Yosuke Hanamuran, itsepuolustuslajeja rakastavan Chie Satonakan sekä sukunsa omistaman majatalon perijätär Yukiko Amagin kanssa. Kyseisenä päivänä paikallinen uutistenlukija ja toimittaja Mayumi Yamano löytyy kuolleena.
Chie kertoo protagonistille ja Yosukelle Keskiyön kanavasta (Midnight Channel), joka ilmestyy sammutetun television näytölle vain keskiyön aikaan sateisella säällä. Katsoessaan sitä ensimmäisen kerran protagonisti huomaa kykenevänsä kulkemaan television läpi. Seuraavina päivinä myös kolmannen vuoden opiskelija Saki Konishi löytyy kuolleena. Protagonisti, Yosuke ja Chie kulkevat television läpi ja päätyvät "televisiomaailmaan", jossa he kohtaavat Teddien, karhumaiseen klovninasuun pukeutuvan olennon. Maailma on täynnä varjoiksi (Shadows) kutsuttuja olentoja. Protagonisti herättää persoonansa, Izanagin, jonka avulla hän kykenee puolustautumaan niiltä. Yosuke ja Chie kohtaavat omat varjominänsä ja heidän hyväksyessään ne, niistä tulee heidän omat persoonansa. He tajuavat jonkun työntäneen Yamanon ja Konishin television kautta tähän maailmaan, ja heidät oli surmannut heidän omat varjominänsä. Mutta kukaan televisiomaailmaan joutunut henkilö ei ollut todellisessa vaarassa, ellei siellä oleva "sumu" siirry pitkäkestoisella ja sateisella säällä todelliseen maailmaan. Mutta Keskiyön kanavan kautta he saisivat aina kuvan siitä, kuka seuraava uhri voisi olla. He perustavat Tutkintaryhmän (Investigation Team) etsiäkseen murhaajan ja pelastaakseen tulevat uhrit.
Yukiko joutuu myös televisiomaailmaan ja hänen lisäkseen sinne joutuvat seuraavien kuukausien aikana myös feminiinisiin harrastuksiin kiintynyt ongelmanuori Kanji Tatsumi sekä itseään etsivä entinen teini-idoli Rise Kujikawa. Heidän sekä Teddien saadessa käyttöön omat persoonansa hekin liittyvät ryhmään. Heinäkuussa päähenkilön rääväsuinen luokanvalvoja Kinshiro Morooka löytyy kuolleena ja Mitsuo Kubo, toisesta koulusta erotettu opiskelija, löytyy televisiomaailmasta ja väittää tehneensä sekä murhat että kidnappaukset. Mutta hänkin kohtaa oman varjominänsä, joka persoonaksi muuttumisen sijaan vain katoaa. Syyskuussa, kun poliisia avustanut opiskelija Naoto Shirogane katoaa televisiomaailmaan, paljastuu, että Kubo olikin vastuussa vain Morookan kuolemasta.
Naoton pelastumisen ja Tutkintaryhmään liittymisen jälkeen protagonisti saa kaksi uhkauskirjettä. Dojima huomaa yhden näistä ja vie protagonistin yöksi poliisiasemalle. Mutta sitten Keskiyön kanava näyttää Nanakon, joka joutuu kidnapatuksi. Johtolangat osoittavat syylliseksi kuljetusmies Taro Namatamen, joka oli entinen Tokion kaupunginvaltuuston sihteeri ja joka oli pettänyt vaimoaan Yamanon kanssa. Kun protagonisti ja muut saapuvat televisiomaailmaan, Namatame väittää "pelastaneensa" kaikki uhrinsa ja varjot muuttavat hänet olennoksi nimeltä Kunino-sagiri. Mutta hänet kukistetaan ja viedään Nanakon mukana sairaalaan. Mutta yhtäkkiä televisiomaailman sumu alkaa vuotaa todelliseen maailmaan ja eräänä päivänä Nanakon sydän pysähtyy. Tämän jälkeen protagonistin on tehtävä valinta: joko hän kostaa Namatamelle lähettämällä tämän televisiomaailmaan tai sitten hän päättää selvittää, onko Namatame todella murhaaja.
Jos pelaaja säästää Namatamen hengen, Nanakon sydän alkaa jälleen lyödä. Lisäksi selviää, ettei Namatame ollut Yamanon ja Konishin kuolemien takana tai ettei hän ollut se, joka kirjoitti uhkauskirjeet. Hän oli heittänyt ihmisiä televisiomaailmaan luulleen heidän olevan siellä turvassa oikealta murhaajalta. Lopulta paljastuu, että oikea murhaaja on Dojiman assistentti, Tohru Adachi. Hän oli Yamanon ja Konishin tappamisen lisäksi myös manipuloinut Namatamen ryhtymään "pelastajaksi" sekä oli vastuussa Kubon joutumisesta televisiomaailmaan. Adachilla ei ollut muuta motiivia kuin, että tämä kaikki oli hänestä hauskaa ja että oli muutenkin tyytymätön ihmisten maailman sääntöihin. Hän paljasti myös, että vuoden lopussa televisiomaailmasta vuotanut sumu muuttaisi kaikki ihmiset varjoiksi ja vangitsisi heidät elämään pelkästään illuusioissa. Adachin kukistumisen jälkeen hänen ruumiinsa valtaa olento nimeltä Ameno-sagiri, joka oli vastuussa sumun olemassaolosta. Ameno-sagiri oli pitänyt yllä Keskiyön kanavaa sekä sumua todistaakseen, etteivät ihmiset enää välittäneet totuudesta, ja väittää toimivansa heidän tahtonsa mukaisesti. Mutta hävittyään taistelun Tutkintaryhmää vastaan hän poistaa sumun todellisesta maailmasta ja Adachi toimitetaan poliisien käsiin. Viimeisenä päivänään Inabassa protagonisti saa Adachilta kirjeen ja voi vielä halutessaan selvittää kuka aloitti huhun Keskiyön kanavasta ja mistä hän, Namatame ja Adachi olivat saaneet kykynsä kulkea televisiomaailmaan.
Mikäli protagonisti aikoo selvittää asian, hänen täytyy etsiä käsiinsä Moel-huoltoaseman työntekijä, jonka oli kohdannut pelin alussa. Työntekijä paljastaa olevansa jumalatar Izanami, jonka Tutkintaryhmä kohtaa myöhemmin televisiomaailmassa. Igorin antaman Näön kuulan (Orb of Sight) avulla protagonisti paljastaa Izanamin todellisen muodon, Izanami-no-Okamin. Protagonistin luomat sosiaaliset linkit muuttavat Izanagin äärimmäiseksi persoonaksi nimeltä Izanagi-no-Okami, joka tuhoaa Izanamin. Samalla sumu katoaa myös televisiomaailmasta, joka palautuu alkuperäiseen muotoonsa. Seuraavana päivänä protagonisti hyvästelee ystävänsä ja palaa kotikaupunkiinsa.