Trauma Center: New Blood
Juoni

New Blood alkaa seitsemän vuotta Trauma Center: Under the Knife 2 -pelin tapahtumien jälkeen, vuonna 2028. Tarina seuraa kirurgeja Markus Vaughn ja Valerie Blaylock. Molemmat työskentelivät Concordia Medical Institutessa, Los Angelesissa, ennen siirtymistään Montgomery Memorial -sairaalaan Alaskassa. Markus Vaughn avusti Concordiassa Lloyd Wilkensiä tutkimuksissaan, kunnes hän vahingossa loi Stigman. Kun Lloyd ei suostunut lopettamaan tutkimustaan ja pysäyttämään Stigmaa ennen kuin siitä tulisi liian vaarallinen, Markus pyysi, että hänet siirrettäisiin Montgomery Memorial -sairaalaan, mukanaan Valerie, joka halusi palavasti oppia Healing Touchin. Tohtori Vaughnin tavoitteena on hioa taitojaan, peruuttaa tehty vahinko ja tuhota Stigma lopullisesti.
Ollessaan Montgomery Memorial -sairaalassa, kirurgit suorittavat monia leikkauksia monille potilaille - heidän joukossaan Miles Hoover, sairaalan johtaja. Eräänä päivänä Montgomery Memorialissa, jaksossa 1-3, miestä on ammuttu kiväärillä ja nuori nainen tuo hänet sairaalalle hoitoon. Miehen leikkauksen jälkeen paljastuu, että naisen nimi on Elena Salazar. Hän on Markus Vaughnin entinen potilas. Trauma Center: Under the Knife 2 -pelissä Markus Vaughn istutti pumpun silloin 13-vuotiaan Elenan haimaan. Pumppuun on kuitenkin tullut toimintahäiriö ja se pitää korvata uudella. Elena yllyttää Markus Vaughnia leikkaamaan hänet, sillä hän oli alun perinkin se, joka pumpun asensi. Markus suorittaa leikkauksen Elenalle Healing Touchia käyttäen. Myöhemmin juonessa Salazarista tulee pysyvä sairaanhoitaja Vaughnille ja Blaylockille.
Montgomery Memorial on sulkeutumassa ja tohtori Hoover käskee heidän palata takaisin Concordiaan. Markus on vastentahtoinen takaisin palaamisesta, mutta lopulta hän käsittää, että hänellä ei ole valinnan varaa. Palatessaan Concordiaan he joutuvat suorittamaan leikkauksen Lloyd Wilkensille, joka sai tartunnan Stigmasta. Tarina saa ikävän käänteen, kun professori Wilkens siepataan leikkauksen jälkeen ja kaikki kallisarvoinen tieto Stigmasta hänen mukanaan. Tähän aikaan Markus Vaughnia ja Valerie Blaylockia pyydetään liittymään Caduceusiin, sillä heillä on arvokasta tietoa Stigmasta. Ensimmäiset Stigma-tapaukset yritettiin pitää poissa julkisuudesta, mutta sen olemassaolo paljastuu Miracle Surgery -televisio-ohjelmassa, jossa Elena, Valerie ja Markus esiintyvät saadakseen sen lopettamaan lähetyksensä. Ohjelman jälkeen Kidman Family sieppaa heidät.
Kidman Family on rikollisjärjestö, joka on pannut merkille kirurgien taidot ja Stigman mahdolliset hyödyt. Kidman Familyn vankeudessa Blaylock ja Vaughn pakotetaan suorittamaan leikkauksia Stigma-potilaille, joiden kehoon se on tarkoituksella istutettu. Panttivankina olleessaan  Markus paljastaa vihdoin Valerielle ja Elenalle, että hän on syyllinen Stigman syntyyn. Professori Wilkens halusi tulla kuuluisaksi hänen ja Markusin keräämällä tiedolla Stigmasta, mutta Vaughn ei halunnut käyttää niin suurta mahdollista uhkaa rikastuakseen, joten hän lähti Alaskaan.
Matkustettuaan Etelä-Amerikkaan hoitaakseen lisää Stigma-potilaita Valerie, Elena ja Markus löytävät Kidmanin kuolleena. Heidän palatessaan Caduceusiin heille selviää, että Cynthia Kazakov, Valerien läheinen ystävä, oli suhteessa miehen nimeltä Master Vakhushti kanssa, joka suunnitteli Elenalle samanlaista istutetta, joka Cynthialla on. Kyseisessä istutteessa on kaukosäädin, jolla voitaisiin pysäyttää verenkierto kokonaisuudessaan. Vakhushti suunnitteli asettavansa sellaisen Elenaan, jotta voisi kiristää Markusia jatkamaan Stigman tutkimista. Poistettuaan laitteen Cynthian elimistöstä he tapaavat Vakhushtin, jolla on Cardia-tyyppinen Stigma. Valerie ja Markus hoitavat viimeisen Stigman ja heille selviää, että Vahkushti käytti Cardiaa hoitona. Tämä oli kuitenkin tehnyt hänestä sosiopaattisen sekopään. Hän kuolee tiedostaen vääryytensä vain hieman leikkauksen jälkeen ja elämän palatessa normaaliksi Valerie, Markus ja Elena mietiskelevät, miten on heidän työnsä pelastaa jonkun henki kun sitä tarvitaan.
Derek Stiles ja Angela Thompson edellisestä Trauma Centeristä nähdään tässäkin pelissä jaksossa 7-4 ja neljännessä Challenge-tehtävässä, jossa Derek ja Angie esittelevät Markusille ja Valerielle leikkaussimulaattorin, joka on suunniteltu demonstroimaan sekä GUILTia että Stigmaa sairastavien potilaiden hoitoa.