Portal
Juoni

Portal sijoittuu Black Mesan kanssa kilpailevaan tieteelliseen tutkimuslaitokseen, Aperture Scienceen. Laitos on jostain syystä autioitunut ja sitä hallitsee tekoäly GLaDOS (Genetic Lifeform and Disk Operating System).
Chell-niminen nainen herää omasta lukitusta kammiostaan GLaDOSin ohjaamasta horrostilasta, ja järjestelmä päättää ottaa hänet testattavaksi. Chellin tulee suorittaa sarja testejä ASHPD (Aperture Science Handheld Portal Device)-aseella, jotka suoritettuaan GLaDOS lupaa hänelle kakkukahvit. Chell saa ensin vain sinisiä portaaleja ampuvan aseen, mutta pelin edetessä ase päivitetään, jolloin sillä voi ampua sekä sinisiä että oransseja portaaleja. Testit muuttuvat muutaman kammion jälkeen yhä vaarallisemmiksi, kun huoneisiin lisätään tappavaa nestettä, energiapellettejä sekä tykkirobotteja.
Chell huomaa pelin aikana, että on ainoa elävä ihminen koko laitoksessa, ja ainoat viitteet muihin ihmisiin ovat ”Apua!”- ja ”Kakku on valetta!” -tekstit kammioiden seinillä. Eräässä vaiheessa peliä hän saa seurakseen raskaan kumppanikuution (Aperture Science Weighted Companion Cube), joka hänen täytyy lopulta GLaDOSin käskystä tuhota polttouunissa.
Viimeisen kammion jälkeen GLaDOS väittää Chellin saavan kakkunsa, mutta yrittääkin tappaa tämän polttouunissa. Chell onnistuu kuitenkin pakenemaan ja koettaa paeta laitoksesta GLaDOSin yrittäessä tappaa häntä eri keinoin. Chell löytää lopulta GLaDOSin. Hetken sananvaihdon jälkeen GLaDOSista irtoaa tärkeä osa, jonka Chell heittää portaalin välityksellä polttouuniin. GLaDOS kertoo osan olleen moraaliydin, joka esti GLaDOSia vapauttamasta hermomyrkkyä laitoksen sisäilmaan. GLaDOS aloittaa jälleen laitoksen myrkyttämisen tappaakseen Chellin, mutta myrkyn hiljalleen myrkyttäessä hengitysilmaa Chell hyödyntää GLaDOSin ampumia ohjuksia kääntäen ne portaalien avulla takaisin tekoälyyn. Ohjukset irrottavat yksi kerrallaan GLaDOSin persoonallisuusytimiä, jotka Chell heittää polttouuniin. Chellin tuhottua ytimet GLaDOS tuhoutuu ja molemmat sinkoutuvat ulos tutkimuskeskuksesta. Pelaaja näkee hetken aikaa savuavat rauniot. Pelin loppu muutettiin kuitenkin 3. maaliskuuta 2010 osana virtuaalimarkkinointikampanjaa, johon sisältyi muun muassa peliin lisättyjen radioiden kautta saatavia Morse-viestejä sekä SSTV-signaaleja. Muutetussa lopussa pelaaja kuulee robottimaiset askeleet ja konemaisen äänen, joka ”kiittää alistumasta juhla-asentoon” (viittauksena GLaDOSin kommenttiin aiemmassa osassa peliä) sekä näkee pelihahmon silmin kuinka hänet raahataan pois, ilmeisesti takaisin Aperture Laboratoriesin tiloihin. Tällä viitattiin myöhemmin julkistettuun jatko-osaan.
Loppuvideossa kamera liikkuu putkistojen poikki saapuen lopulta laajaan pimeään huoneeseen, jossa on monia hyllyrivejä täynnä GLaDOSin persoonallisuusytimiä, jotka aktivoituvat yksi kerrallaan. Huoneen keskellä on pöytä, jonka vieressä on aiemmin näkynyt kumppanikuutio. Pöydän päällä on GLaDOSin pelaajalle lupaama kakku, jossa palaa huonetta valaiseva kynttilä. Ylhäältä laskeutuva robottikoura sammuttaa kakun kynttilän, jolloin kuva pimenee.
Lopputeksteissä kuullaan Jonathan Coultonin peliä varten säveltämä humoristinen laulu, ”Still Alive”, GLaDOSin laulamana. Laulun sanat viittaavat peliin ja vihjaavat, ettei GLaDOS tuhoutunut kokonaan.
Huhtikuussa 2011 Valve julkaisi sarjakuvan, jossa kerrotaan Doug Rattmanista. Rattman on yksi tärkeimmistä avainhenkilöistä, sillä hän kirjoitti ohjeita seinille ja kertoi kakun olevan valhe. Rattman oli ollut Aperture Sciencella töissä kehittämässä GLaDOSia, mutta kehittelyn aikana GLaDOS otti vallan ja tappoi kaikki laitoksen työntekijät – ainoastaan Rattman onnistui pakenemaan. Rattman muuttaa testihenkilöiden tietokantaa ja laittaa Chellin ensimmäiseksi koehenkilöksi tämän lannistumattoman luonteen vuoksi. Chell ”tuhoaa” GLaDOSin ja pääsee maan pinnalle (pelin tapahtumien mukaan). Samaan aikaan Rattman löytää uloskäynnin ja näkee kun yksi Aperturen roboteista raahaa Chellin takaisin. Rattman palaa takaisin pelastamaan Chelliä, mutta Chell on laitettu pitkäaikaiseen rentoutumistilaan (huoneeseen, josta Portal 2 alkaa). Generaattorit ovat menettäneet virran, joten Chell on kuolemassa. Rattman saa kytkettyä pitkäaikaiseen rentoutumistilaan virran, jotta Chell ei kuolisi, mutta Chellin heräämiseen menisi vielä monta vuotta – herätystapahtuma alkaa vain, kun tilan ovi avataan tai virta kytkeytyy päälle. Rattman menee lepäämään samanlaiseen kapseliin missä Chell herää alussa. Hänen kohtalonsa sen jälkeen on tuntematon.