Hämähäkkimiehen kuvitteellinen historia
Salatut sodat ja muukalaispuku

Jumalan kaltaiset voimat omaava Tuonpuoleinen otti joukon supersankareita (Kostajat, Hulk, Ryhmä-X, Ihmeneloset, Hämähäkkimies ) ja joukon superkonnia (Imijä, Tohtori Doom, Tohtori Mustekala, Lumoajatar, Kang, Klaw, Lisko, Molekyylimies, Titania, Ultron, Volcana ja Romutusryhmä; Pallosalama, Romuttaja ja Paaluttaja ) sekä Magneton ja Galactuksen Taisteluplaneetta nimiselle planeetalle, kauas maapallosta toiseen galaksiin tutustuakseen häntä hämmentäviin sankareihin tarkemmin. Tuonpuoleinen lausui molemmille ryhmille "Minä olen Tuonpuoleinen! Voittakaa vihollisenne ja kaikki mitä haluatte on teidän! Mikään ei ole minulle mahdotonta!"
Hämähäkkimiehen osuus Salatuissa sodissa oli aluksi hyvin pieni. Tapahtumien edetessä Hämähäkkimiehen rooli tuli kuitenkin suuremmaksi. Aluksi Hämähäkkimiehen suurin etu sodassa oli hänen hämähäkkivaistonsa, jonka avulla hän osasi varoittaa Magneton hyökkäyksestä, joutuen kuitenkin itse tämän päihittämäksi. Varoituksen ansiosta Magneto kuitenkin pakeni omiin oloihinsa, Ampiainen perässään.
Hämähäkkimies epäili myös muiden Ryhmä-X:n jäsenten olevan petollisia, ja vakoili heitä. Väärinkäsityksen johdosta Hämähkkimies kävi Ryhmä-X:ää vastaan taisteluun. Havaittuaan kuitenkin, ettei pärjää heitä vastaan yksin, hän pakeni heitä. Hän aikoin kertoa kuulemansa Ihmenelosten Reed Richardsille, mutta Professori Xavier, Ryhmä-X:n johtaja ehti tyhjentää hänen muistinsa viimeisimmiltä minuuteilta.
Superkonnien hyökkäyksen vuoksi sankarit joutuivat 50 miljardin tonnin edestä maata sisältävän valtaisan kivimöykyn alle, Hulkin jäädessä pitämään kiveä putoamasta heidän päälleen, Hämähäkkimies uhrasi seittisinkonsa Reed Richardsin rakenteilla olevaa laitetta varten. Kohdatessaan Hämähäkkinainen 2:sen, hän oletti olevansa katkera, koska tämä oli ottanut käyttöönsä hämähäkki-aiheisen nimen, mutta huomasi myöhemmin, että kyse ei ollut katkeruudesta, vaan kateudesta tämän pukua kohtaan. Niinpä seittisingottoman ja rikkonaisen puvun omaavan Hämähäkkimiehen oli helppo selittää itselleen, miksi ajatuksia todeksi tekevä kone, jonka Thor ja Hulk sanoivat olevan viereisessä huoneessa, antoi hänelle mustan, myöhemmin muukalaissymbiootiksi paljastuneen, puvun.
Tietämättään puvun taustoista, Hämähäkkimies otti siitä kaiken irti. Orgaanisia seittejä tuottava, parantavia voimia omaava, voimia tehostava, ajatuksen voimalla toimiva ja miksikä tahansa asusteeksi muuttuva puku oli iloinen käänne sankarijoukolle, jotka olivat olleet jo pitkään alivoimaisia. Tästä huolimatta Reed Richards ehdotti, että Hämähäkkimies toisi pukunsa hänelle tutkittavaksi salattujen sotien jälkeen. Myöhemmin Salattujen sotien loputtua paljastui, etteivät Thor ja Hulk olleet käyttäneetkään samaa ajatuksia todeksi tekevää laitetta kuin Hämähäkkimies korjauttaessaan pukujaan. Hämähäkkimies palasi Salatuista sodista lopulta Lisko kainalossaan, kuulleen, että Musta kissa oli etsinyt häntä.
Salatuilla sodilla oli suuri vaikutus Hämähäkkimiehen elämään. Salatuissa sodissa tapahtuneen Titanian ja Hämähäkkimiehen välisen taistelun vuoksi Titania sai kammon Hämähäkkimiestä kohtaan. Lisäksi Hämähäkkimiehellä oli yhä musta pukunsa.
Ensimmäiseksi haasteeksi Mustalle kissalle ja Hämähäkkimiehelle koitui Vastaus-niminen Kingpinin palkollinen, jonka voima oli ennustaa vastustajansa heikkoudet ja liikkeet. Kingpin halusi parantaa vaimonsa Vanessan, ja vangitsi sitä varten pienen taistelun jälkeen Viitta ja Tikari parivaljakon Tikarin. Ongelmaksi koitui kuitenkin Silvermane, joka nuoruutta tavoitellessaan halusi saada myös Tikarin käsiinsä. Musta kissa ja Hämähäkkimies saapuivat Kingpinin pilvenpiirtäjään, Silvermanen jo rynnättyä brutaalisti seinien läpi. Kingpin sai joukkoineen juuri ja juuri pidäteltyä Silvermanen, mutta ongelmaa tuotti voimia tarvitseva Tikari. Kesken taistelua Kingpin pyysi palvelusta Mustalta kissalta siitä, että tämä oli saanut häneltä voimansa. Vaikka Musta kissa kieltäytyi, alkoi Hämähäkkimiehellä heräämään epäilyt. Pitkällisen taistelun jälkeen Viitta haavoittui kuolettavasti. Vastaus päätti taistelun ratkaisuksi lopulta uhrata itsensä, ja antoi voimillaan Tikarille tarvittavan energian. Vastaus kuoli, Tikarin herätessä. Tikari paransi Viitan, ja nuorensi Silvermanen. Tämän jälkeen kaksikko lähti seinässä olleesta reiästä jatkamaan huumevastaista tehtäväänsä. Hämähäkkimiehen ja Mustan kissan poistuessa, jäi Kingpin vannomaan kostoa kumppaneille.
Samoihin aikoihin kun Hämähäkkimies taisteli ensimmäistä kertaa Puumaa vastaan, Hämähäkkimies/Peter joutui kiperään tilanteeseen, kun Mary-Jane paljasti Peterille tienneensä aina, että tämä on Hämähäkkimies. Vaikka Peter yritti selitellä, ei Mary-Jane uskonut, vaan Peter joutui lopulta myöntämään totuuden. Vasta nyt vihdoin ja viimein Peter päätti lähteä antamaan uuden symbioottipukunsa Reed Richardsin tutkittavaksi. Reed Richardsin tutkimusten mukaan se osoittautui eläväksi symbiootiksi, jonka ainoat heikkoudet olivat tuli ja todella korkeat äänet. Reed pelkäsi että tuli voisi vahingoittaa Hämähäkkimiestä, ja käytti keksimäänsä ääniaaltoasetta. Symbiootti saatiinkin lopulta irti Hämähäkkimiehestä, mutta Peter jäi alastomaksi ja naamiottomaksi, paljastaen kasvonsa niin Liekille kuin Reed Richardsille. Liekki kuitenkin kaivoi varastosta vara-asunsa ja paperipussin. Peter puki asun päälle, laittoi pussin päähänsä, ja lähti kotiin.
Kotona Peteriä odotti Mary-Jane Watson, joka halusi kertoa kaiken menneisyydestään, koska tiesi kuitenkin Peter Parkerin salaisuuden. Samaan aikaan Mörkö paljastui olevan hengissä. Tällä kertaa hän teki töitä salaperäiselle Ruusulle. Tämä Mörkö ei kuitenkaan tiennyt/omannut edellisen Mörkön tavoin Norman Osbornin Vihreä Menninkäinen seeruumin salaisuutta, ja yritti hyökkäämällä Harry Osbornin kimppuun selvittää sen. Hämähäkkimiehen ja Mörkön käydessä taisteluaan, jossa lopulta Mörkö kidnappaa Lizin ja Harryn, symbiootti karkaa Reed Richardsin laboratoriosta.
May Parker saa kirjeen vanhalta poikaystävältään ennen Ben Parkeria. Peterin ollessa huolissaan, tämä lähtee Hämähäkkimiehenä seuraamaan tätä. May Parker muistelee menneisyyttään, ja hänen ja Benin taustoistaan paljastuu enemmän lukijoille, mutta ei itse Peterille.
Hämähäkkimies pyytää Mustalta kissalta selitystä voimiinsa, ja tämä kertoo niiden olevan peräisin Kingpiniltä. Yhdessä he päättävät lähteä Kingpinin luokse selvittämään, jahka voimiin olisi piilotettu jokin ansa. He kuitenkin kohtaavat Kingpinin pilvenpiirtäjällä Pilkun, joka saa heidät kyvyillään pakenemaan. He sopivat tulevansa seuraavana päivänä uudestaan, mutta molemmat ovatkin jo salaa suunnitelleet käyvänsä aikaisemmin, kun toinen ei ole mukana. Hämähäkkimies kohtaa uudestaan Pilkun, lopulta voittaen tämän, samaan aikaan, kun Musta kissa kuulee Kingpiniltä, että hänen voimissa piile kirous, joka tuottaa epäonnea kaikille hänen läheisilleen. Järkyttyneenä Musta kissa palaa erotakseen Hämähäkkimiehestä, ja lähteäkseen kauas pois. Hämähäkkimies, joka on tullut tyhjin käsin, kuitenkin ehtii ensin. Koko tänä aikana symbiootti lähenee yhä vain lähemmäksi Peterin asuntoa.
Hämähäkkimies kohtaa Ollie Osnickin, Hämmästyttävän Hämähäkkipojan, joka tahtoisi ryhtyä Hämähäkkimiehen kumppaniksi rikollisuutta vastaan. Myöhemmin pelastettuaan Mustan ketun hopeasapelin kynsistä, hän pelastaa itsemurhaa yrittävän Pahojen mutanttien veljeskunnan Sammakon. Hämähäkkimies kertoo Sammakolle, että voi olla tämän ystävänsä. Sammakko käsittää väärin, ja sanoo suorassa tv lähetyksessä olevansa Hämähäkkimiehen uusi partneri rikollisuutta vastaan. TV-lähetys tavoittaa Ollie Osnickin ja Hämmästyttävän Sammakkomiehen, jotka molemmat ovat koittaneet jo pitkään päästä Hämähäkkimiehen kumppaniksi. Kolmikon välille syntyy tappelu, joka lopulta ratkeaa siihen, että he päättävät perustaa yhteisen tiimin, nimeltä Roskasakki. Hämähäkkimies pääsee viimein eroon kolmesta paljon vaivaa tuottaneesta "sankarista".
Hämähäkkimies palaa asuntoonsa, jossa häntä odottaa symbioottipuku vaatekaapissa. Puku tarttuu häneen, eikä aio tällä kertaa päästää irti. Hämähäkkimies kuitenkin taistelee pukuansa vastaan viimeiseen asti. Samaan aikaan kolme rikollista on varastanut Korppikotkan, Adrian Thoomesin muistiinpanot. He päättävät ensi töikseen todistaa kykynsä tappamalla Hämäkkimiehen. Kohdatessaan Hämähäkkimiehen, tämä kuitenkin taistelee edelleen symbioottipukua vastaan. Lopulta pienen vaivan jälkeen Hämäkkimies pääsee kirkolle, jossa hän heiluttaa kelloja saadakseen mahdollisimman paljon ääntä aikaan. Muukalaispuku ei kuitenkaan reagoi, mutta päättää lopulta säälistä irrottautua Hämähäkkimiehestä. Peter palaa kotiinsa paranemaan kokemuksesta. Samaan aikaan Adrian Thoomes on seurannut uutisista huijareiden toimia. Hän päättää kostaa huijauksen ja lähtee taistelemaan kolmikkoa vastaan. Hämähäkkimies, joka on juuri palannut takaisin punaisen pukunsa käyttöön, menee ja pelastaa tilanteen.