Transformers One
Juoni

Planeetta Cybertronilla, energon-kaivaja Orion Pax tunkeutuu salaa arkistoon ja katsoo tallenteen alkuperäisistä kolmestatoista Primesta, joiden sanottiin kuolleen sodassa Quintessoneita vastaan vuosia sitten, jolloin myös Johtajuuden Matrix katosi. Arkiston turvallisuusvahdit nappaavat Orionin, mutta hänen paras ystävänsä D-16 pelastaa hänet. Sillä välin, Cybertronin johtaja ja viimeinen hengissä selvinnyt Prime, Sentinel Prime, puhuu taistelusta Quintessoneja vastaan ja Johtajuuden Matrixin etsimisestä, sillä sen katoaminen on saanut Cybertronin elintärkeät energonvirtaukset kuivumaan. Kaivoksessa, Jazz jää räjähdyksen vangiksi. Orion ja D-16 pelastavat hänet aiheuttaen sortuman, jonka seurauksena kaivostyöntekijä Elita-1 saa alennuksen.
Orion ja D-16 ottavat salaa osaa Iacon 5000 -kisaan. He häviävät sen, mutta Sentinel kiinnostuu heistä kovasti. Kisaan itsekin osallistunut Orionia ja D-16:tä inhoava turvallisuusvahti Darkwing siirtää heidät kuitenkin Sentinelin tietämättä töihin alataso 50:llä sijaitsevaan sulattamoon, missä he tapaavat B-127:n. He löytävät mikrosirun, joka sisältää viestin Alpha Trionilta, yhdeltä alkuperäisistä Primeistä, joka kertoo reitin planeetan pinnalle. Ystävykset kulkevat junan katolla pinnalle tuoden huomaamatta mukanaan myös Elita-1:n. Pinnalla he löytävät Alpha Trionin ja muiden Primejen ruumiit luolassa. He saavat herätettyä Alpha Trionin henkiin, joka kertoo heille, ettei Sentinel ole oikea Prime. Sentinel oli ollut pelkkä Primejen pääavustaja, joka vallahimoissaan liittoutui Quintessonien kanssa ja surmasi näiden avulla muut Primet. Hän myös poisti salaa alempiarvoisten transformereiden muuntautumiscogit, päästäkseen antamaan heidän kaivamansa energonin Quintessoneille. Alpha Trion antaa Orionille, D-16:lle, Elitalle ja B-127:lle kuolleiden Primejen cogit, jolloin he pystyvät muuntautumaan. Pian tämän jälkeen Sentinelin sotilaat saapuvat paikalle ja Alpha Trion jää jälkeen, antaen itsensä joutua viedyksi Sentinelin luokse, joka tappaa hänet.
Orion, Elita ja B-127 aikovat paljastaa Sentinelin petturuuden Alpha Trionin antaman mikrosirun avulla, mutta Sentineliin aiemmin kovasti uskonut D-16 oli paljastuksesta niin järkyttynyt, että halusi tappaa Sentinelin. Starscreamin johtama Cybertronin entinen eliittikaarti, joka vastusti Sentineliä ja Quintessoneja, vangitsee heidät ja kieltäytyy auttamasta heitä. Pitäen Starscreamin johtamistapaa pelkurimaisena, D-16 voittaa hänet taistelussa ja kaappaa kaartin johtajuuden itselleen. Mutta Sentinelin joukot löytävät heidät, ja siitä syntyneen taistelun aikana siru tuhoutuu. Lisäksi Orion ja Elita-1 hautautuvat romun alle, samalla kun D-16, Starscream, B-127 ja puolet kaartista joutuvat vangeiksi.
Elita-1:n rohkaisemana Orion saa jäljelle jääneen Shockwaven, Soundwaven ja muut jäljelle jääneet kaartilaiset puolelleen. Sentinel kiduttaa D-16:ta ja polttaa Megatronus Primen symbolin kiinni hänen rintaansa. Samalla D-16 saa tietää, että Sentinel oli varastanut itselleen Megatronuksen muuntautumiscogin. Iaconissa, Orion kertoo kaivostyöläisille totuuden ja johtaa nämä kapinaan Sentineliä vastaan. Taistelun aikana, he näyttävät videolähetyksenä Sentinelin apulaisen, Airachnidin, muistitallenteet koko Cybertronille todistaakseen Sentinelin korruption. D-16 yrittää tappaa Sentinelin, mutta ampuu vahingossa Orionia, kun tämä hyppää Sentinelin eteen, koska ei halunnut D-16:n tulevan yhtä julmaksi kuin Sentinel. Ensin D-16 kauhistuu tapahtuneesta, mutta päästää hänet lopulta putoamaan kohti Cybertronin ydintä. D-16 tappaa Sentinelin, asentaa Megatronuksen muuntautumiscogin itseensä, ja julistautuu Cybertronin uudeksi johtajaksi nimellä Megatron, samalla kun eliittikaarti alkaa vallata Iaconia.
Transformereiden luojan, Primuksen, sekä alkuperäisten Primejen henget kuitenkin herättävät Orionin henkiin ja antavat hänelle Johtajuuden Matrixin, jolloin hänestä tulee Optimus Prime. Optimus palaa Iaconille pysäyttämään Megatronin, ja karkottaa hänet ja eliittikaartin pois Iaconista. Raivostuneena siitä, että Optimus on saanut Matrixin, Megatron vannoo kostoa. Matrix palauttaa Cybetronin energonvirtaukset ja transformereiden muuntautumiscogit. Optimus nimeää seuraajansa Autoboteiksi ja lähettää viestin Quintessoneille, varoittaakseen näitä pysymään poissa.
Lopputekstien jälkeen näytetyssä kohtauksessa, Megatron nimeää eliittikaartinsa Decepticoneiksi, jotka haluavat tuhota Optimuksen ja valloittaa koko Cybertronin.