Half-Life 2: Episode One
Tarina > Juoni

Peli alkaa takaumalla Half-Life 2:n loppukohtauksesta, jossa Linnoituksen (engl. Citadel) ”pimeä fuusioreaktori” räjähtää ja pelaajahahmo Gordon Freemanin vierellä seisoneen Alyx Vancen kohtalo jätetään pelaajalle epäselväksi. Kun aika pysähtyy, salaperäiset purppuranväriset vortigauntit ilmestyvät ja pelastavat Alyxin hengen kaukosiirtämällä hänet pois paikalta, ennen kuin räjähdysaalto kykenee saavuttamaan hänet. Seuraavassa kohtauksessa G-Man nähdään kävelemässä valoa hohtavasta ovesta kohti Freemania yrittäen sanoa jotakin, mutta samalla hetkellä vortigauntit ilmestyvät ja estävät G-Mania liikkumasta Freemanin luokse. Hetkeä myöhemmin vortigauntit kaukosiirtävät Gordonin pahoin raunioituneen Linnoituksen juurella sijaitsevan kivikasan alle.
Kun Gordon herää, Dog kaivaa hänet esille, minkä jälkeen Gordon kohtaa Alyxin. Kolmikko ottaa monitorin kautta yhteyden Eli Vanceen ja Isaac Kleineriin, jotka kertovat Linnoituksen reaktoriytimen olevan räjähdyspisteessä, sillä edellisessä pelissä Gordon tuhosi pimeän fuusioreaktorin ja täten aiheutti Linnoitukselle vakavia rakenteellisia vaurioita. Koska Kleinerin mukaan reaktoriytimen räjähdys voisi tuhota koko Kaupunki 17:n, Gordon ja Alyx päättävät palata takaisin Linnoitukseen ja estää reaktoriytimen romahtamisen. Eli vastahakoisesti suostuu tähän, sillä reaktoriytimen stabilisointi voisi pelastaa Kaupunki 17:n asukkaat, jotka ovat suorittamassa laajamittaista evakuointioperaatiota pahoin rauniotuneesta kaupungista.
Half-Life 2: Episode Onen kappaleet
Kappale 1: Undue Alarm
Kappale 2: Direct Intervention
Kappale 3: Lowlife
Kappale 4: Urban Flight
Kappale 5: Exit 17
Kun Gordon ja Alyx tunkeutuvat takaisin Linnoitukseen, he löytävät suuresta kammiosta monitorin, jossa näkyy tallenne tohtori Breenin ja niin sanotun ”muukalaisneuvonantajan” (engl. Alien Advisor) välisestä keskustelusta Half-Life 2:n viimeisestä jaksosta ”Dark Energy”. Kun tallenne päättyy, kammioon ilmestyy neuvonantajaa kuljettava kapseli, minkä seurauksena Gordon ja Alyx altistuvat olennon psyykkisille voimille. Gordon ja Alyx jatkavat matkaansa Linnoituksen reaktoriytimeen, missä he onnistuvat käynnistämään reaktorin stabilisointimekanismin. Alyx saa selville, että Combine pyrkii tarkoituksellisesti räjäyttämään reaktorin, sillä Linnoituksen tuhoutuminen lähettäisi hätäsanoman muissa ulottuvuuksissa oleskeleville Combinen sotajoukoille.
Gordon ja Alyx pakenevat Linnoituksesta panssarijunan kyydissä, mutta juna suistuu pois raiteilta. Kaksikko joutuu vaeltamaan lukemattomien zombien valtaaman tunnelin ja maanalaisen pysäköintihallin läpi, minkä jälkeen he saapuvat maanpinnalle. Kaupungin kaduilla he huomaavat, että Isaac Kleiner on ottanut yhteyden kaupungin asukkaisiin aikaisemmin tohtori Breenin käytössä olleiden propagandamonitorien kautta. Lähetyksessä Kleiner kehottaa kaupunkilaisia poistumaan välittömästi Kaupunki 17:sta ja hankkimaan jälkikasvua sekä paljastaa, että pimeän fuusioreaktorin räjähtämisen seurauksena Combinen viestintäyhteydet Maahan ovat katkenneet siten, ettei Combine kykene kaukosiirtämään uusia sotajoukkoja Maahan muista ulottuvuuksista tai edes kommunikoimaan näiden kanssa.
Gordon ja Alyx taistelevat Combinen sotilaita ja erilaisia muukalaishirviöitä vastaan, kunnes he kohtaavat Barneyn ja joukon kaupunkilaisia, jotka yrittävät paeta Kaupunki 17:sta ennen Linnoituksen reaktorin räjähtämistä. Gordon ja Alyx päättävät kiinnittää Combinen sotilaiden huomion, jotta Barney ja kaupunkilaiset voisivat huomaamattomasti ja turvallisesti edetä rautatieasemalle. Kaksikko taistelee tiensä hylättyyn sairaalaan, joka on muuttunut Combinen sotilaiden ja erilaisten zombien väliseksi taistelutantereeksi. Sairaalasta he etenevät juna-asemalle, missä he jälleen tapaavat Barneyn ja avustavat tätä kaupunkilaisten saattamisessa matkustajajunalle.
Kun Barney ja kaupunkilaiset ovat ehtineet paeta kaupungista junalla, Gordon joutuu kaksintaisteluun Combinen valtavan Strider-sotakoneen kanssa. Gordon tuhoaa Striderin raketinheittimellä, minkä jälkeen hän ja Alyx pakenevat Kaupunki 17:sta viimeisellä junalla. Kun juna poistuu asemalta, Gordon ja Alyx näkevät Linnoituksen lähettämässä hätäviestin muissa ulottuvuuksissa oleskeleville Combinen sotajoukoille. Kun hätäviesti on lähetetty, junan yläpuolella lentää kaupungista pakenevien muukalaisneuvonantajien pakokapseleita, minkä jälkeen Linnoitus ja Kaupunki 17 alkavat hehkua aavemaista, sinistä valoa. Hetkeä myöhemmin Linnoituksen reaktoriydin räjähtää, Kaupunki 17 tuhoutuu ja valtava paineaalto lähestyy suurella vauhdilla junaa kohti. Kuva täyttyy sokaisevaan valoon, minkä jälkeen Gordon kuulee kirskuvan metallin äänen ja Alyxin kuiskaamassa Gordonin nimen.
Episode One päättyy cliffhanger-tyyliseen loppuratkaisuun. Pelin juonen tapahtumat jatkuvat seuraavassa lisäosassa, Half-Life 2: Episode Twossa.