Jean Fernandez
Valmentajana

Valmennusuransa Fernandez aloitti siellä, missä peliuransakin päätti eli AS Cannes'ssa. Fernandezin valmennusaikana seurassa pelasi nuori Zinédine Zidane. 
Viiden vuoden valmennusrupeaman jälkeen Fernandez jätti seuran ja siirtyi OGC Niceen, jossa hän valmensi vain pari kuukautta. 
Tammikuussa 1991 Fernandez aloitti Olympique de Marseillen kakkosvalmentajana ja siirtyi kauden 1992/93 alusta seuran päävalmentajaksi saaden kuitenkin potkut jo marraskuussa.
Marseillesta Fernandez siirtyi saudiarabialaiseen Al Nasr Riadiin, jonka hän valmensi 1994 maan mestaruuteen palaten sen jälkeen Ranskaan ja Lilleen. 
Helmikuussa 1996 Fernandez palkattiin toisen saudiseuran, Al Shababin valmentajaksi. Al Shababissa hän voitti Saudi-Arabian mestaruuden 1996 ja cupin 1997.
Fernandezin Saudi-Arabian kiertely jatkui kesällä 1997 mekkalaisseura Al Wahdaan, josta hän palasi Al Nasr Riadiin tammikuussa 1998. Saudi-Arabian matka päättyi sinne mistä se oli alkanutkin ja menestyksekkäästi, sillä Al Nasr voitti 1998 Aasian seurajoukkueiden supercupin.
Kauden 1998–1999 Fernandez valmensi tunisialaista Étoile du Sahelissa, kunnes palasi takaisin Ranskaan ja FC Sochaux'iin.
Hän nosti seuran Ranskan pääsarjaan kauden 2000/01 päätteeksi.
Sochaux'ssa. Hän teki 2002 tilaa Guy Lacombelle ja siirtyi FC Metziin, jonka hän nosti myös pääsarjatasolle.
2005–2006 Fernandez valmensi Marseillea.
Kesällä 2006 Fernandez valittiin Jacques Santinin seuraajaksi burgundialaisseura AJ Auxerren päävalmentajaksi. Hänen johdollaan Auxerre on taistellut Liguen alemmassa keskikastissa parin kauden ajan. Kausi 2008/09 antoi jo viitteitä paremmasta, mutta lopullinen läpimurto tapahtui kaudella 2009/10. Fernandezin suojatit taistelivat jopa mestaruudesta Olympique Marseillea vastaan, mutta joutuivat lopulta tyytymään paikkaan eurokentillä. Loistavien suoritusten myötä Ranskan pelaajayhdistys UNFP valitsi Fernandezin kauden parhaaksi valmentajaksi.  Kausi 2010/11 oli eurokentillä uurastaneelle Auxerrelle vaikeampi. Seura selvisi Mestarien liigan lohkovaiheeseen voittamalla FK Zenitin karsinnoissa yhteismaalein 2–1. Lohkovaiheessa Auxerre joutui vaikeaan alkulohkoon Real Madridin, AC Milanin ja AFC Ajaxin kanssa jääden lopulta lohkojumboksi. Ainoat pisteet Fernandezin miehistö saalisti voittamalla Ajaxin kotonaan 2–1. Europelit aiheuttivat seuralle vaikeuksia, eikä vauhtia syksyllä tahtonut riittää kotimaahan. Fernandez sai kuitenkin puristettua pahimmillaan putoamisviivalla käyneestä joukkueesta tarvittavat tehot irti ja lopulta Auxerre kipusi liigassa yhdeksänneksi. Kauden jälkeen Fernandez jätti Auxerren tähytäkseen uusia haasteita uralleen.
Kesäkuun alussa 2011 Fernandezista tuli AS Nancy-Lorrainen päävalmentaja.  Ensimmäinen kausi seuran peräsimessä päättyi keskikastiin sijalle 11. Joukkue taisteli läpi kauden maalinteko-ongelmien kanssa ja samat vaikeudet jatkuivat myös kaudella 2012/13. Seura voitti liigakauden avausottelussaan Stade Brestois'n 1–0, mutta sen jälkeen seuran ainoa voitto Fernandezin alaisuudessa tuli Ranskan cupissa tammikuun alussa 2013. Surkeat tulokset ja jämähtäminen liigajumboksi johtivat lopulta tammikuun puolivälissä siihen, että Nancy ja Fernandez purkivat sopimuksensa.
Huhtikuun lopulla 2013 Montpellier HSC ilmoitti, että Fernandez on seuran uusi päävalmentaja kaudella 2013/14.  Fernandezin johdolla Montpellier’n menestys oli syyskaudella heikkoa ja joukkue vajosi putoamisviivan tuntumaan. Lopulta Fernandez erosi tehtävästään joulukuun alussa 2013, kun Montpellier oli pudonnut liigassa sijalle 17. Seura voitti hänen johdollaan vain kaksi liigaottelua.
Kesällä 2015 Fernandezista tuli qatarilaisseura Al-Khorin päävalmentaja. Fernandez valmensi seuraa kaksi kautta voittamatta suurempia turnauksia. Kaudeksi 2017/18 hän siirtyi Al-Gharafan päävalmentajaksi. Hän sai potkut tehtävästään joulukuun lopussa 2017.