Watch Dogs
Juoni

Vuonna 2012 Chicagosta tulee maailman ensimmäinen kaupunki, jossa otetaan käyttöön ctOS (central Operation System). Se on teknologiayhtiö Blumen kehittämä laskentaverkko, joka yhdistää kaikki laitteet yhdeksi järjestelmäksi. Kun Aiden Pearce ja hänen mentorinsa ja kumppaninsa Damien Brenks ovat tekemässä elektronista ryöstöä huippuluokan Merlaut-hotellissa, he laukaisevat toisen hakkerin asettaman hiljaisen hälytyksen. Damien yrittää löytää hakkerin, mutta paljastaa samalla itsensä ja Aidenin. Peläten perheensä puolesta Aiden ajaa heidät turvaan maaseudulle yllätysmatkan varjolla. Matkalla palkkamurhaaja Maurice Vega hyökkää heidän kimppuunsa, mistä seuraa auto-onnettomuus. Auto-onnettomuudessa kuolee Aidenin kuusivuotias siskontytär Lena.
Vuotta myöhemmin Aiden jäljittää Vegan pesäpallostadionille, mutta ei onnistu selvittämään hänen toimeksiantajansa henkilöllisyyttä. Aiden jättää Vegan kumppaninsa Jordi Chinin käsiin ja vierailee siskonsa Nicolen ja veljenpoikansa Jacksonin luoma tämän syntymäpäivänä, mutta saa selville jonkun ahdistelevan heitä. Blumen korruptiota paljastamaan pyrkivän hakkerisyndikaatti DedSecin jäsen Clara Lillen avulla Aiden jäljittää häirikön. Häirikkö paljastuu Damieniksi, joka halusi saada Aidenin huomion, jotta tämä auttaisi löytämään toisen Merlaut-hotellin ryöstöä tehneen hakkerin. Aiden kieltäytyy, mutta tavattuaan stadionilla olleen todistajan hän saa tietää, että Damien kidnappasi Nicolen pakottaakseen hänet suostumaan. Kun Aiden on asettunut uuteen piilopaikkaansa Bunkkeriin - entiseen Blumen tukikohtaan, jota ei voi havaita ja jossa on pääsy ctOS:ään - hän jäljittää Claran avulla hakkerin; tämä hakkeri on jengin johtaja ja armeijan veteraani Delford "Iraq" Wade. Päästäkseen Iraqin palvelimille Aiden soluttautuu ihmishuutokauppaan kopioidakseen hänen pääsyavaimensa ja kiristää serkkunsa Tyrone "Bedbug" Hayesin toimimaan "sisäpiirimiehenään". Bedbug onnistuu hankkimaan datanäytteen, joka paljastaa Iraqilla olevan tietoja lähes jokaisesta Chicagon asukkaasta, ja hän suojelee jengiään viranomaisilta kiristyksen avulla.
Kun Aiden ja Clara saavat salattua dataa, jonka purkaminen ylittää heidän kykynsä, he onnistuvat jäljittämään legendaarisen hakkerin ja entisen Blume-pilliinpuhaltajan Raymond "T-Bone" Kenneyn. Kenney aiheutti Yhdysvaltojen koillisen sähkökatkoksen vuonna 2003 yrittäessään paljastaa ctOS:n vaarat, joiden luomisessa hän oli mukana. Aiden soluttautuu Blumen päämajaan pyyhkiäkseen Kenneyn henkilöllisyyden ctOS:stä ja mahdollistaakseen hänen paluunsa Chicagoon. Damien kuitenkin paljastaa Kenneyn sijainnin vastineeksi täydestä pääsystä ctOS:ään, ja Aidenin on pakko pelastaa Kenney ennen kuin Blumen yksityiset turvallisuusjoukot tappavat hänet. Sen jälkeen hän hyökkää Iraqin tukikohtaan saadakseen sen palvelintiedot ladattua ja tappaa Iraqin.
Aiden, Kenney ja Clara eivät pyrky purkamaan datan salausta, koska toinen hakkeri JB "Defalt" Markovicz tunkeutuu heidän järjestelmäänsä, varastaa ne ja poistaa ne heidän palvelimiltaan. Defalt myös paljastaa, että Clara palkattiin jäljittämään Aidenia Merlautin-murron jälkeen, joten hän on epäsuorasti vastuussa Lenan kuolemasta. Tämä saa Aidenin vihaisena häätämään Claran. Samaan aikaan Damien on ärsyyntynyt Aidenin puutteellisesta edistymisestä, ja paljastaa henkilöllisyytensä viranomaisille. Kun Kenney on saanut tiedot Defaltilta, Kenney auttaa Aidenia jäljittämään Nicolen, jolloin Aiden voi pelastaa hänet ja viedä hänet ja Jacksonin turvaan pois Chicagosta.
Kun Kenney on saanut purettua datan salauksen, hän kertoo Aidenille kuka määräsi hänet murhattavaksi: Irlantilainen mafiapomo ja Merlautin omistaja Dermot "Lucky" Quinn. Aiden kohtaa Quinnin, joka kertoo tilanneensa iskun, koska uskoi Aidenin etsivän salaista videomateriaalia. Videomateriaalissa Donovan Rushmore tappaa sihteerinsä sen jälkeen kun tämä oli saanut selville hänen ja Quinnin väliset suhteet, ja jota tämä oli käyttänyt Rushmoren kiristykseen. Tapettuaan Quinnin hakkeroimalla hänen tahdistimensa Damien kertoo Aidenille, että Quinn lähetti palkkamurhaajat Claran perään, koska tämä oli hänelle rasite. Koska Aiden ei voi pelastaa Claraa, hän julkistaa kaiken kirisysmateriaalin, mikä suututtaa Damienin, joka alkaa aiheuttaa tuhoa Chicagossa CtOS:n avulla. Aiden sammuttaa järjestelmän Kenneyn luoman viruksen avulla ja jäljittää Damienin majakalle. Jordi saapuu paikalle, koska hänet on palkattu tappamaan molemmat miehet, mutta Aiden haavoittaa häntä ja tappaa Damienin. Myöhemmin Jordi soittaa Aidenille viimeisen kerran kertoakseen, missä Vegaa pidetään; Aiden suuntaa sinne ja päättää hänen kohtalostaan.