Baldur’s Gate II: Shadows of Amn
Juoni

Pelaaja on pelin alussa maagi Jon Irenicuksen vankina. Pian lapsuudenystävä Imoen vapauttaa hänet sellistä. Minsc ja Jaheira, jotka olivat myös edellisessä Baldur’s Gate -pelissä mukana, ovat niin ikään vangittuina. He pakenevat Irenicuksen tyrmästä Amnin pääkaupunkiin Athkatlaan, ja matkalla he tapaavat Yoshimon, joka myös on Irenicuksen vankina. Päästyään pois vankilasta he kohtaavat Irenicuksen, jolloin raivostunut Imoen langettaa häneen "Magic missile" -loitsun. Koska luvaton taiankäyttö on Athkatlassa kielletty, voimakkaat velhot (Cowled wizards) vievät sekä Irenicuksen että Imoenin kaukaiseen vankilaan, Spellholdiin.
Kun pelaaja saapuu Athkatlan slummialueelle mies nimeltä Gaelan Bayle kertoo voivansa esitellä hänet joukkiolle, joka pystyy vapauttamaan Imoenin Spellholdista 20 000 kultarahan maksua vastaan. Kun pelaaja on saanut kokoon 15 000 kultarahaa, hän voi päättää, liittyykö hän Bodhin vampyyreihin vai Varjovarkaisiin (Shadow Thieves). Kun pelaaja on suorittanut valitsemansa puolen tehtävät ja tappanut vastakkaisen puolen johtajan (tosin Bodhi pääsee karkuun) killan päällikkö esittelee pelaajan Saemon Havarianille. Tämä vie pelaajan laivalla Brynnlawin saarelle, jossa Spellhold sijaitsee.
Tällä välin Irenicus on ottanut Spellholdissa vallan, ja jatkaa kokeitaan Imoenilla. Kun pelaaja pääsee sisään Spellholdiin, häntä vastassa on velho, joka vie pelaajan katsomaan SpellHoldin "potilaita". Yksi näistä on Tiax, joka oli edellisessä pelissä. Kierroksen lopussa velho paljastuu Irenicukseksi, joka vangitsee pelaajan tainnutusaineen avulla, jota Yoshimo (tai Saemon Havarian jos Yoshimo ei ole joukossasi) laittoi pelaajan ruokaan. Kun pelaaja herää, hänelle selviää, että Irenicus ja Bodhi ovat varastaneet hänen ja Imoenin sielun. Kun Irenicuksella ei ole enää käyttöä pelaajalle ja Imoenille, hän käskee Bodhia tappamaan heidät. Mutta Bodhi haluaakin "leikkiä" pelaajan kanssa ja antaa pelaajan etsiä hänet Spellholdin tyrmästä. Myöhemmin kun Bodhi hyökkää pelaajan kimppuun, pelaaja muuttuu hetkellisesti Surmaajaksi (Slayer), Bhaalin avataraksi. Bodhi vetäytyy vampyyreidensä kanssa ja pelaajaa pääsee takaisin Spellholdin potilasosastolle. Pelaaja käy vapauttamiensa potilaiden kanssa Irenicuksen kimppuun, joka vetäytyy taistelusta pois Uumenalaan (Underdark).
Uumenalassa pelaaja tapaa hopealohikäärme Adalonin. Adalon lupaa opastaa pelaajan maan pinnalle, jos hän käy hakemassa takaisin Adalonin poikasten munat (jotka mustat haltijat varastivat häneltä) läheisestä mustien haltijoiden kaupungista nimeltä Ust'Natha. Tähän tehtävään Adalon muuttaa pelaajan ja hänen ryhmänsä väliaikaisesti mustiksi haltijoiksi. Tehtävän suoritettuaan ja päästyään takaisin maan pinnalle pelaaja kohtaa haltia-armeijan Suldanessellarin haltijakaupungista. Haltijat eivät voi palata takaisin kaupunkiinsa Irenicuksen langettaman loitsun takia. Päästäkseen kaupunkiin pelaajan on haettava Rhynn Lanthorn -artefakti Bodhilta, joka on varastanut sen haltijoilta. Voitettuaan Bodhin taistelussa pelaaja saa Iomenin sielun palautettua.
Rhynn Lanthornin avulla pelaaja pääsee Suldanessellariin, joka on Irenicuksen ja hänen alamaistensa valloittama. Kaupungissa pelaaja saavuttaa elämänpuun (Tree of Life), josta Irenicus imee voimia, mikä on koitua kaupungin tuhoksi. Pelaaja voittaa Irenicuksen taistelussa, mutta koska Irenicuksella on yhä pelaajan sielu, pelaaja joutuu ryhmänsä kanssa Irenicuksen mukaanvetämänä helvettiin. Kun pelaaja saa voitettua Irenicuksen helvetissä, hän palaa henkiin ja saa Suldanessellarin haltioiden kunnioituksen.