Kingdom Hearts II
Juoni

Vuosi Kingdom Heartsin jälkeen, Sora, Aku Ankka ja Hessu ovat olleet unessa, jotta heidän muistonsa saataisiin korjattua. Samaan aikaan Roxas, oman muistinsa menettänyt Soran ei-kukaan, viettää kesälomansa ystäviensä Haynerin, Pencen ja Oletten kanssa Twilight Townissa, joka on pelkkä DiZin ja "Ansemiksi" itsensä muuttaneen Rikun simuloima versio oikeasta Twilight Townista. Kuitenkin Organisaatio XIII:n ei-ketkään yrittävät Axelin, Organisaation jäsenen VIII ja Roxasin entisen parhaan ystävän, johdolla pilata DiZin aikeet. Roxasin oltua simuloidussa kaupungissa 6 päivää, hän saa tietää totuuden itsestään ja että hänen yhdistyttävä takaisin Soraan voidakseen saada tämän muistot täysin palautumaan. Lopulta Roxas suostuu ja saa Soran heräämään.
Todellisessa Twilight Townissa Sora, Aku ja Hessu tapaavat kuningas Mikin, joka lähettää heidät entisen opettajansa, mestari Yen Sidin luokse. Yen Sid kertoo ei-keidenkään olevan pelkistä ruumiista ja sieluista koostuvia olentoja. Vahvan sydämen omaava jakautuu sydämensä menettäessään sydämettömäksi ja ei-keneksikään. Lisäksi hän kertoo Organisaatio XIII:sta, joka kontrolloi heikompia ei-ketään. Sora ja kumppanit lähtevät jälleen pelastamaan maailmoja ja Organisaation lisäksi saavat vastaansa kuolleista palanneen Pahattaren ja tämän apuriksi värväytyneen Mustan Pekan.
Viidennellä vierailullaan Hollow Bastionissa, jota Squall ”Leon” Leonheart ja muut Traverse Townista tutut henkilöt olivat kunnostamassa entiseen muotoonsa Radiant Gardeniksi, he jälleen tapaavat Kuningas Mikin, joka paljastaa Soran aiemmin kukistaman ”Ansemin” olevan pelkkä sydämettömmäksi muuttunut huijari. Huijarin oikea nimi on Xehanort ja hän oli oikean Ansemin oppipoika. Hänen ei-kukaan puolestaan oli Xemnas, Organisaatio XIII:n johtaja. Organisaation ei-ketkään paljastavat aikovansa käyttää Soran tuhoamien sydämettömien viemiä sydämiä luodakseen omat Kingdom Heartsista tullakseen oikeasti eläviksi.
Vapautettuaan yhä useamman maailman, Sora ja kumppanit saapuvat kolmatta kertaa Twilight Towniin, josta he löytävät DiZin simulaatioversion Twilight Townista. Siellä Axel uhraa itsensä auttaakseen heitä pääsemään Maailmaan jota ei koskaan ollut, joka toimi Organisaation tukikohtana. Siellä Sora löytää sekä Rikun että Kairin, tuhoaa kaikki Xemnasta alemmat Organisaation jäsenet ja saa kuulla kaiken Roxasista. Lisäksi Mikki tapaa DiZin, joka paljastuu itse oikeaksi Ansem Viisaaksi, joka käyttää kehittämäänsä laitetta viedäkseen osan keinotekoisten Kingdom Heartsin voimista. Mutta laite ylikuormittuu ja sen räjähtäessä Ansem katoaa ja Riku palautuu entiselleen.
Xemnas imee itseensä jäljelle jääneiden sydänten voimat ja taistelee usean taistelun, jotka hän häviää. Mutta Kairin palattua Kohtalon saarille (Destiny Islands) Mikin, Akun ja Hessun mukana, Sora ja Riku kohtaavat vielä kerran Xemnasin, jonka he onnistuvat tuhoamaan. He päätyvät Pimeyden maailmaan, jossa oltuaan hetken aikaa he löytävät, pullon, jossa on viesti Kairilta. Heidän eteensä ilmestyy ovi Valon maailmaan ja he palaavat lopulta takaisin kotisaarilleen. Lopputekstien jälkeen näytetyssä kohtauksessa Sora, Riku ja Kairi saavat Mikiltä kirjeen, jonka sisältöä ei vielä näytetty.