جنگ ستارگان: قسمت اول – تهدید شبح
داستان

فدراسیون تجارت نظم را در جمهوری کهکشانی با محاصره سیاره نابو، در آماده‌سازی برای تهاجم تمام عیار، برهم می‌زند. رهبر جمهوری، صدراعظم والوروم، استاد جدای کوای‌گان جین را با شاگردش اوبی‌وان کنوبی برای مذاکره با رئیس فدراسیون تجارت، نیت گانری، اعزام می‌کند. دارت سیدیوس، لرد سیت و حامی مخفی فدراسیون تجارت، به رئیس فدراسیون دستور می‌دهد که از طریق لشکری از درویدهای جنگی دو جدای را سر به نیست کند. جدای‌ها فرار و به نابو می‌گریزند و در آنجا کوای‌گان جارجار بینکز، یکی از گانگان‌های طرد شده، را نجات می‌دهد. جار جار برای جبران عمل کوای‌گان جدای‌ها را به اوت گانگا، شهر زیر آبی گانگان‌ها، می‌برد. جدای‌ها در متقاعد رهبر گانگان‌ها، رئیس ناس، در کمک به ساکنان سطح سیاره موفق نمی‌شوند، اما موفق می‌شوند اجازه رفتن به تید، پایتخت شهر نابو، از طریق حمل و نقل آبی با راهنمایی جار جار را به دست آورند. پس از نجات ملکه پدمه آمیدالا، گروه با سفینه سلطنتی او از نابو فرار می‌کنند و سفینه را به سمت سیاره کوروسکانت، پایتخت جمهوری، هدایت می‌کنند.
سفینه در عبور از محاصره فدراسیون، در تیراندازی متقابل آسیب می‌بیند و هایپردرایو آن خراب می‌شود. گروه برای تعمیر در سیاره بیابانی دورافتاده تاتویین، واقع در خارج از حوزه قضایی جمهوری، فرود می‌آیند. کوای‌گان، جار جار، دروید آر تو دی تو، و پدمه، در پوشش یک خدمتکار، از شهرک موس اسپا دیدن می‌کنند تا یک قطعه جدید برای هایپردرایو سفینه خریداری کنند. آنها با یک دلال سمساری، واتو، و برده نه ساله‌اش، آناکین اسکای واکر، خلبان و مهندس با استعدادی که دروید تشریفات سی‌تری‌پی‌او را ساخته است، روبرو می‌شوند. کوای‌گان حضور قوی نیرو را در آناکین حس می‌کند و متقاعد می‌شود که او همان «برگزیده» پیشگویی شده است که قرار است تعادل را به نیرو بازگرداند. با امتناع واتو از پذیرش ارز جمهوری، کوای‌گان هم هایپردرایو مورد نیاز و هم آزادی آناکین را بر سر یک مسابقه رانندگی شرط‌بندی می‌کند. آناکین در مسابقه برنده می‌شود و به گروه می‌پیوندد تا به عنوان جدای آموزش ببیند و مادرش شمی را ترک می‌کند. کوای‌گان در مسیر رسیدن به کشتی فضایی خود مورد حمله دارت ماول، شاگرد سیدیوس، قرار می‌گیرد که برای گرفتن آمیدالا فرستاده شده بود. کوای‌گان، پس از یک دوئل کوتاه شمشیر نوری با ماول، به همراه سایرین با سفینه فرار می‌کنند.
کوای‌گان و اوبی وان پدمه را تا کوروسکانت همراهی می‌کنند تا نزد والوروم و سنای کهکشانی از مردم خود دفاع کند. کوای‌گان از شورای جدای درخواست می‌کند تا آناکین را به عنوان جدی آموزش دهد، اما شورا با نگرانی از آسیب‌پذیر بودن آناکین در مقابل بخش تاریک نیرو، خواسته او را رد می‌کند. اما کوای‌گان قول داد که آناکین را به عنوان شاگرد جدید خود انتخاب کند. در همین حال، پالپاتین، سناتور نابو، آمیدالا را متقاعد می‌کند که برای انتخاب رهبر تواناتر و حل بحران، خواستار رای عدم اعتماد به والوروم شود. اگرچه آمیدالا در تلاش برای رای‌گیری موفق است، اما از فساد در سنا ناامید می‌شود و تصمیم می‌گیرد به نابو بازگردد. شورای جدای به کوای‌گان و اوبی وان دستور می‌دهد تا ملکه را همراهی کنند و در مورد بازگشت سیث‌ها، که گمان می‌رفت بیش از یک هزار سال منقرض شده‌اند، تحقیق کنند.
در نابو، پدمه از هویت اصلی خود به عنوان ملکه در برابر گانگان‌ها رونمایی کرده و آنها را متقاعد می‌کند که با یکدیگر علیه فدراسیون تجارت متحد شوند. جار جار ژنرال می‌شود و در نبرد علیه درویدهای جنگی به قبیله خود می‌پیوندد. درحالی که پادمه جستجو برای گانری را در تد رهبری می‌کند. در طی یک نبرد در آشیانه، آناکین به سمت یک سفینه جنگنده فرار و به‌طور تصادفی خلبان خودکار آن را فعال می‌کند و به نبرد علیه سفینه کنترلی دروید فدراسیون می‌رود و ناخواسته باعث تخریب آن از درون می‌شود و ارتش دروید را غیرفعال می‌کند. در همین حال، دارت ماول به کاخ تد نفوذ می‌کند و با کوای‌گان و اوبی وان در یک دوئل شمشیر نوری درگیر می‌شود و زخم مهلکی به کوای‌گان می‌زند اما توسط اوبی وان به دو نیم تقسیم می‌شود. کوای‌گان در آخرین لحظات عمر خود از اوبی وان می‌خواهد که آناکین را آموزش بدهد.
پس از نبرد، گانری توسط جمهوری دستگیر و پالپاتین به عنوان صدراعظم انتخاب می‌شود. استاد بزرگ یودا اوبی وان را به درجه شوالیه جدای ارتقا می‌دهد و با اکراه آناکین را به عنوان شاگرد اوبی وان می‌پذیرد. مراسم تشییع جنازه‌ای برای کوای‌گان، با شرکت جدای‌های دیگر، برگزار می‌شود. جدای‌ها معتقدند که هنوز یک سیث باقی مانده است. در طی یک رژه جشن در نابو، پدمه برای برقراری صلح و سپاس گذاری هدیه‌ای به رئیس ناس و گانگان‌ها می‌دهد.