مرد عنکبوتی ۲: ورود الکترو
داستان

وقایع داستانی این بازی پس از ماجراهای شماره اول مرد عنکبوتی که در سال ۲۰۰۰ ساخته شد، اتفاق می‌افتد. در شهر نیویورک دزدی‌هایی به سرکردگی الکترو در حال انجام است. مرد عنکبوتی در حین گشت زنی یکی از دزدها را می‌بیند که از ساختمان «بیوتک» بیرون می‌آید. پس از تعقیب او به ساختمان متروکه‌ای می‌رسند که محل قرار دزدان است و باید یک چمدان دزدیده شده را تحویل طرف مقابل دهند. مرد عنکبوتی یکی از دزدها را دستگیر کرده و از او شروع به بازجویی می‌کند. اما در این حین سردسته دزدها که شوکر باشد به او حمله می‌کند.
بعد از شکست دادن شوکر، مرد عنکبوتی در تعقیب جانیان به فرودگاهی می‌رسد که محل قرارشان می‌باشد. در طول مسیر مرد عنکبوتی مجبور به خنثی کردن یک بمب، نابود کردن پناهگاه یک مسلسل و جلوگیری از تصادم یک هواپیما می‌شود. پس از فرار ملاقات‌کننده با هلی کوپتر، مرد عنکبوتی موفق به پیدا کردن رد او شده و به یک محوطه نگهداری قطار که متعلق به کله چکشی است می‌رسد. پس از مبارزه با مرد شنی، شروع به تعقیب قطاری کرده و به شخص ملاقات‌کننده که The Beetle نام دارد می‌رسد. این جانی که ماسکی بر چهره دارد با چمدان مسروقه فرار می‌کند، اما به‌طور عجیبی برای مرد عنکبوتی یک رد از خود به جا می‌گذارد. یک دعوتنامه به گردهمایی علمی و صنعتی.
در همان زمان و در مکانی دیگر، الکترو در حال بیان نقشه خود برای همکاران جنایتکار خود است، هدف آن‌ها دزدیدن بخش‌هایی از دستگاه بیو-نکسوس است. این دستگاه قابلیت افزایش شدید نیرویی موسوم به بیو-انرژی را دارد که الکترو قصد دارد از آن جهت افزایش قدرت خود استفاده کند. اما مشکل اینجا است که این دستگاه هنوز تکمیل نشده و فقط طراح آن «دکتر واتز» می‌تواند این دستگاه را کامل کند. به همین دلیل «کله چکشی» و افرادش به گردهمایی علمی و صنعتی می‌روند تا دکتر واتز را گروگان بگیرند.
مرد عنکبوتی وقتی به محل گردهمایی می‌رسد مجبور می‌شود با کله چکشی مبارزه و او را شکست دهد، در همین حین مرد شنی و دکتر به‌طور مخفیانه از آنجا خارج می‌شوند. مرد عنکبوتی تصمیم می‌گیرد با یکی از اعضای بیوتک به نام دکتر «کورت کونور» تماس بگیرد، اما در هنگام تماس از آن سوی خط صدای درگیری می‌شنود، مرد عنکبوتی بلافاصله به بیوتک و محل آزمایشگاه دکتر کونور می‌رود، اما دکتر کونور تبدیل به یک مارمولک وحشی شده‌است. بعد از اینکه دکتر کونور به حالت عادی خود بازمی‌گردد توضیح می‌دهد که الکترو قصد دارد با استفاده از قدرت دستگاه بیو-نکسوس تبدیل به یک خدا شود. سپس به مرد عنکبوتی پیشنهاد می‌کند به آزمایشگاه دکتر واتز برود. پس از رسیدن به آنجا، مرد عنکبوتی منبع نیروی دستگاه را پیدا می‌کند اما مجبور به مبارزه با مرد شنی می‌گردد. بعد از شکست مرد شنی، مرد عنکبوتی یک مقاله پیدا می‌کند در مورد منبع نیروی دستگاه و یک جواهر به نام «اشک زئوس» که در موزه قرار دارد. از طرفی الکترو نیز توسط افرادش از وجود این جواهر آگاهی پیدا کرده‌است.
در داخل موزه مرد عنکبوتی در حالی با الکترو روبرو می‌شود که دکتر واتز را همچنان به عنوان گروگان در اختیار دارد، الکترو پیشنهاد می‌کند که در قبال دریافت جواهر «اشک زئوس»، حاضر به آزاد کردن گروگان خود است. مرد عنکبوتی با اکراه این خواسته را می‌پذیرد و طی حوادثی در نهایت الکترو جواهر را به دست آورده و دستگاه را تکمیل و آن را فعال می‌کند. اکنون او دارای قدرت الکترومغناطیسی بسیار بزرگ و نیرومندی شده‌است. پس از تعقیب الکترو، آن دو وارد محفظه بزرگی در یک برج می‌شوند اما به دلیل برق دار شدن بدن الکترو، مرد عنکبوتی قادر به حمله مستقیم به او نیست. در عوض مرد عنکبوتی با استفاده از ژنراتور برج، دستگاه بیو-نکسوس را بیش از اندازه باردار و در نهایت دستگاه را نابود می‌کند تا قدرت بسیار زیاد الکترو از بین برود.