باشگاه فوتبال پرسپولیس در رقابت‌های آسیایی
پیشینه > لیگ قهرمانان آسیا

مقالهٔ اصلی: پرسپولیس در لیگ قهرمانان آسیا
فصل ۰۳–۲۰۰۲
در سال ۲۰۰۲، با تلفیق جام برندگان جام و جام باشگاه‌ها، لیگ قهرمانان آسیا راه‌اندازی شد. پرسپولیس که در نخستین دوره این جام شرکت کرده بود، در گروه خود دوم شد و از صعود بازماند. در آن دوره از هر گروه تنها تیم صدرنشین به‌طور مستقیم راهی مرحله نیمه نهایی شد و بازی‌های هر گروه به میزبانی یک کشور برگزار می‌شد و پرسپولیس با شکست مقابل میزبان گروه خود تیم پاختاکور ازبکستان فرصت صعود را از دست داد.
پس از حذف در این دوره پرسپولیس وارد دوران بحران خود شد و ۵ فصل نتوانست هیچ جام کشوری را ببرد و از راهیابی به این جام بازماند.
فصل ۲۰۰۹
در این فصل تیم پرسپولیس با تیم‌های شارجه، الشباب عربستان و الغرافه همگروه شد که تیم شارجه در فاصله ۲ هفته مانده به پایان بازی‌ها انصراف داد. پرسپولیس در این گروه با ۲ برد (بدون حساب برد مقابل شارجه)، ۱ مساوی و ۱ باخت جایگاه اول را بدست آورد و به مرحله حذفی رفت. در مرحله حذفی این تیم مقابل بنیادکار ایستاد. این تیم که ستاره‌های بزرگی همچون ریوالدو را داشت موفق شد با تک‌گل همین بازیکن از روی نقطه پنالتی تیم پرسپولیس را در ورزشگاه آزادی شکست دهد.
فصل ۲۰۱۱
شاید بتوان گفت این فصل، بدترین فصل برای پرسپولیس در تمامی رقابت‌های آسیایی‌اش بود. این تیم در مرحله گروهی با تیم‌های الاتحاد، الوحده و بنیادکار همگروه شد و با ۱ برد و ۲ تساوی و ۳ باخت رتبه چهارم را بدست آورد.
فصل ۲۰۱۲
در این فصل تیم پرسپولیس همگروه الهلال، الشباب امارات و الغرافه شد. و با بازی‌های درخشان از جمله برد ۶–۱ مقابل الشباب توانست رتبه دوم را بدست بیاورد. اما در مرحله حذفی نتوانست خوب ظاهر شود و مقابل الاتحاد با نتیجه ۰–۳ مغلوب شد.
فصل ۲۰۱۵
در این فصل تیم پرسپولیس با تیم‌های لخویا، بنیادکار و النصر همگروه شد و با ۴ برد و ۲ باخت به رتبه دوم رسید و موفق به صعود شد. در مرحله حذفی تیم پرسپولیس با الهلال دیدار کرد. در بازی رفت با گل به خودی دیگائو در دقایق پایانی موفق شد الهلال را شکست دهد اما در بازی برگشت با نتیجه ۰–۳ مغلوب این تیم شد و از دور مسابقات کنار رفت.
لیگ قهرمانان آسیا ۲۰۱۷
در لیگ قهرمانان آسیا ۲۰۱۷ پرسپولیس پس از صعود از گروهی دشوار به عنوان تیم دوم، در مرحله یک‌هشتم نهایی لخویا قطر را در مجموع ۱–۰ برد و صعود کرد. سپس تیم الاهلی عربستان را در مجموع ۵–۳ برد و برای پنجمین بار به نیمه نهایی رسید ولی با قبول باخت مقابل الهلال عربستان از صعود به فینال بازماند و به کار خود در این دوره پایان داد.
لیگ قهرمانان آسیا ۲۰۱۸
مقالهٔ اصلی: لیگ قهرمانان آسیا ۲۰۱۸
در فصل ۲۰۱۸ پرسپولیس با هدایت برانکو ایوانکوویچ پس از صعود از مرحله گروهی با ۱۳امتیاز به عنوان صدرنشین در مراحل حذفی رقبای متمول و قدرتمند عربی همچون الجزیره امارات، الدحیل قطر و السد قطر را از پیش رو برداشت و به عنوان سومین تیم ایرانی در تاریخ راهی فینال لیگ قهرمانان آسیا شد.
حریف پرسپولیس در فینال تیم کاشیما آنتلرز ژاپن بود. بازی رفت فینال در روز ۱۲ آبان ۱۳۹۷ در ورزشگاه کاشیما ساکر کاشیما برگزار شد و تیم کاشیما آنتلرز با دو گل پرسپولیس را شکست داد. بازی برگشت در روز ۱۹ آبان ۱۳۹۷ در ورزشگاه آزادی تهران و در حضور ۱۰۰٬۰۰۰ تماشاگر برگزار شد و با تساوی بدون گل به اتمام رسید و کاشیما در مجموع با برتری ۲–۰ قهرمان شد و پرسپولیس نیز به عنوان نایب قهرمانی لیگ قهرمانان آسیا دست یافت، فینال برگشت پرتماشاگرترین فینال تاریخ لیگ قهرمانان آسیا لقب گرفت، در این دوره همچنین تیم پرسپولیس به جایزه بازی جوانمردانه دست یافت.
لیگ قهرمانان آسیا ۲۰۱۹
پرسپولیس که به عنوان نایب‌قهرمان دوره قبل گام به این مسابقات گذاشته بود با عملکرد ضعیف خود در همان مرحله گروهی از این مسابقات حذف شد.
لیگ قهرمانان آسیا ۲۰۲۰
مقالهٔ اصلی: لیگ قهرمانان آسیا ۲۰۲۰
پرسپولیس پس از قهرمانی در لیگ برتر (چهارمین قهرمانی پیاپی) به عنوان نماینده ایران در این رقابت‌ها حضور پیدا کرد. پرسپولیس در دور گروهی با تیم‌های التعاون عربستان، شارجه امارات و الدحیل قطر همگروه شد و توانست به عنوان تیم صدرنشین راهی دور بعدی شود. در این مرحله که به دلیل شیوع ویروس کرونا به صورت متمرکز و تک بازی در کشور قطر انجام می‌شد در مقابل تیم السد قطر قرار گرفت و با نتیجه یک بر صفر پیروز و راهی مرحله یک چهارم نهایی شد. در دیدار یک چهارم نهایی نیز پرسپولیس توانست با درخشش عیسی آل کثیر تیم پاختاکور ازبکستان را از پیش رو برداشته و حریف تیم النصر عربستان در مرحله نیمه نهایی شود. قبل از دیدار نیمه نهایی و با کارشکنی‌های برخی در داخل و خارج از کشور باعث محرومیت شش‌ماهه عیسی آل کثیر شد. در مرحله نیمه نهایی (فینال غرب آسیا) نیز پرسپولیس موفق به شکست تیم النصر عربستان در ضربات پنالتی شد. اما کارشکنی سعودی‌ها تمامی نداشته و با شکایت به AFC و فیفا و دادگاه عالی ورزش (CAS) به دنبال محرومیت پرسپولیس به دلیل استفاده غیرمجاز از بازیکنان خود را داشته ولی راه به جایی نبرد و پرسپولیس به عنوان فینالیست راهی دیدار پایانی شد. در دیدار پایانی که در تاریخ ۲۹ آذر ۱۳۹۹ در ورزشگاه الجنوب الوکره برگزار شد دو تیم پرسپولیس و اولسان هیوندای کره جنوبی مقابل هم به میدان رفتند و تیم کره ای با نتیجه ۲–۱ به برتری رسید و قهرمان مسابقات شد. تک گل پرسپولیس را در این دیدار مهدی عبدی به ثمر رساند.