نیر: اتوماتا
توسعه > سناریو و طراحی هنری

نویسنده اصلی فیلم‌نامه بازی، شخص تارو یوکو بود. علاوه بر آن، دو نفر دیگر هم به عنوان نویسنده حضور داشتند: اولین نفر، هاها کیکوچی بود، که سابقاً روی سناریوی بازی‌های نیئا و دریکن‌گارد ۳ کار کرده بود، و نفر دوم، یوشیهو آکابانه، یکی از اعضای شرکت های‌استار. گروه توسعه، زمینه اصلی بازی را با الهام از «آگاکو» ، واژه‌ای ژاپنی به معنای مبارزه برای بیرون آمدن از یک موقعیت سخت، طراحی کردند. زمینه دیگری که سایتو به آن اشاره کرد، «عشق» بود، این اظهارات سایتو در آن زمان و به‌خاطر روبات بودن شخصیت‌های اصلی بازی، که معمولاً فاقد احساسات هستند، غیرمعمول به‌نظر می‌رسید. با توجه به اظهارات سایتو، زمان و زحمات زیادی برای ساخت داستان و رفتار شخصیت‌ها گذاشته شده، تا بتوانند با نسخه اصلی نیئا برابری کنند. در زمان ساخت داستان، تارو یوکو نسبت به قرار دادن دِوولا و پوپولا در بازی مردد بود، چون نقش آن‌ها در بازی نیئا به پایان رسیده بود، اما در نهایت تصمیم گرفت تا آن‌ها را در بازی قرار دهد. با توجه به سخنان تارو یوکو، با وجود این‌که سناریوی نیئا از لحاظ محتوای احساسی، غمگین و اشک‌آور بود، وی قصد داشت تا یک روایت خشک و جدی را در نسخه جدید پیاده کند، که مربوط به بی‌عدالتی ذاتی در جهان و تعصباتی است که شخصیت‌ها مجبور به مقابله با آن هستند. یکی از عناصر بازی که در عناوین قبلی تارو یوکو هم دیده شده بود، بررسی او روی این موضوع بود که چرا مردم آدم می‌کشند، و این‌که تأثیر کشت و کشتار روی دیگران چگونه است. این ناشی از مشاهداتش روی افرادی بود که از کشتن دشمنانی که در بازی‌ها با آن‌ها روبه‌رو می‌شدند لذت می‌بردند، که این ایده را به ذهنش رساند که احتمالاً چیزی در درون آن‌ها اشتباه است یا دچار کمبود هستند. او در این باره گفت که «ما در جهان صلح می‌خواهیم، اما همزمان از کشتن دیگران در بازی‌های ویدئویی لذت می‌بریم.»
مانند بازی نیئا، برای این بازی هم پایان‌های مختلفی طراحی شد، اما شرایط رسیدن به هر پایان، به اندازه بازی اصلی سخت‌گیرانه نبود.
بازی مجموعاً دارای ۲۶ پایان متفاوت است، که بعضی از آن‌ها، اصلی و برخی دیگر، پایان‌های فرعی هستند، و به تعداد حروف الفبای انگلیسی و به همان شکل، نام‌گذاری شده‌اند. تارو یوکو در نظر داشت تا بازی، به نحوی شاد به پایان برسد، که در زمان بررسی داستان توسط اعضای استودیو، این موضوع برای آنان عجیب به نظر می‌رسید. از دید تارو یوکو، پایان شاد بازی، پنجمین پایان آن (پایان E) است. با توجه به سخنان یوکو، در زمانی که وی در حال کار کردن روی دیگر جنبه‌های داستان بوده، این پایان هنوز به ذهن او نرسیده و از ابتدا، چنین پایانی را در نظر نداشته‌است. از نظر او، در طی فرایند طراحی شخصیت‌ها، وی به‌طور طبیعی به این ایده رسیده و در واقع، بیش‌از آن‌که او به‌طور اجباری این پایان را طراحی کرده باشد، خود فرایند توسعه شخصیت‌ها او را به سمت این موضوع راهنمایی کرده‌است. پایان نهایی، یک صحنه تیراندازی را به تصویر می‌کشد، که به فهرست توسعه‌دهندگان بازی ختم می‌شود، و در حین نشان‌دادن فهرست هم تیراندازی ادامه پیدا می‌کند، که نمادی از شخصیت‌هایی است که از یک قاعده شناخته‌شده و از قبل مشخص شده خارج می‌شوند، تا به آینده‌ای جدید، امید پیدا کنند. تارو یوکو گفت که این پایان، نشان‌دهنده تمرکز داستان بر آینده و عناصر نظام‌مند موجود در آن است. گروه توسعه بازی همچنین ویژگی حذف داده‌های ذخیره‌شده بازیکن را در بازی قرار دادند، که سابقاً در بازی نیئا موجود بود. این ویژگی، به بازیکنان اجازه می‌دهد تا در پایان بازی و برای کمک به دیگر بازیکنان، داده‌های خود را پاک کنند.
پس از دریافت بازخوردهای بازی نیئا، آکیهیکو یوشیدا به عنوان طراح شخصیت اصلی انتخاب شد. با وجود این‌که اعضای گروه توسعه بازی تصور می‌کردند وی به دلیل مشغله زیاد کاری، پیشنهاد همکاری با آنان را رد خواهد کرد، او نسبت به این کار علاقه‌مند بود، چون تعدادی از کارکنان شرکت خودش، سای‌دزیگنیشن از طرفداران بازی نیئا بودند. چون یوشیدا با کمی تأخیر به گروه پیوست، یوکو یک دستورالعمل کلی برای طراحی شخصیت‌ها را در اختیار وی قرار داد. بر خلاف بازی نیئا که در دو نسخه و با دو قهرمان اصلی متفاوت عرضه شد — یکی برای سلیقه‌های غربی — در این بازی، تمام نسخه‌ها دارای یک قهرمان یکسان است، و گروه توسعه تلاش کردند تا به‌جای انجام اصلاحاتی برای سلایق غربی، روی ساخت یک بازی نقش‌آفرینی ژاپنی با کیفیت تمرکز کنند. این ایده برای ساخت یک شخصیت یکسان، یکی دیگر از دلایلی بود که یوشیدا به عنوان طراح شخصیت اصلی استخدام شد. شخصیت‌های فرمانده، آدم و حوا نیز توسط یویا ناگای طراحی شدند. توشیئوکی ایتاهانا، طراح استودیو اسکوئر انیکس، باز طراحی شخصیت‌های دوولا و پوپولا را برعهده گرفت. تصویرسازی دشمنان توسط هیسایوشی کیجیما طراحی شد، و تصویرسازی محیط هم برعهده کوزوما کودا، یاسویوکا کاجی و شوهِی کامِئوکا بود. طراحی محیط با همکاری یوکو انجام گرفت و سعی شد تا محیط‌ها مانند مکان‌هایی که بازیکنان در دنیای واقعی می‌بینند طراحی شوند. یکی از چالش‌هایی که آن‌ها با آن مواجه شدند، این بود که شخصیت‌ها در عین حفظ ماهیت ماشینی خود، زنده به نظر برسند. پس از عرضه بازی، اعلام شد که برنامه‌هایی برای عرضه ادامه سری نیئا وجود دارد. یسوکه سایتو علاوه بر اعلام این خبر، گفت که تارو یوکو هم برای ساخت نسخه بعدی حضور خواهد داشت.
تارو یوکو پس از عرضه بازی و در مصاحبه‌ای با گاردین در ۲۳ اوت ۲۰۱۸، گفت که «من بازی‌هایی معمولی برای مردم معمولی می‌سازم، اما هنگامی که آن‌ها عرضه می‌شوند، مردم عجیب، این بازی‌ها را عجیب می‌دانند. این احتمالاً یعنی من مشکلی دارم» تارو همچنین گفت که بازی‌های قبلی او، در همین سبک بوده‌اند، اما موفقیت تجاری چندانی همراهشان نبوده، با وجود این‌که گروه توسعه و شخص تارو یوکو تلاش زیادی برای فروش بالا در عناوینی مانند نیئا کرده بودند. یوکو دربارهٔ نیئا: اتوماتا می‌گوید: «برای نیئا: اتوماتا، کسی به من نگفت تا گروه خاصی را برای فروش هدف قرار دهم. من فقط آنچه که می‌خواستم را ساختم، و تلاش کردم تا هرجا که ممکن است، از چشم اسکوئر انیکس پنهان شوم.» او همچنین در مورد شخصیت پردازی بازی‌هایش توضیح داد: «دلیل وجود این‌همه شخصیت رنج‌کشیده در بازی‌های من، این است که من می‌خواهم تا واقعیت را نشان دهم. این همان چیزی است که باعث می‌شود مردم بتوانند با درد و رنج شخصیت‌های بازی همدردی کنند. دلیل پرهرج و مرج بودن بازی‌های من، پرهرج و مرج بودن جهان است، نه من. هدف من، پایان‌های بد نیست، آن‌ها به‌طور طبیعی به‌وجود می‌آیند.» زمانی که از تارو یوکو در مورد دلیل ادامه دادن به ساخت بازی‌ها سؤال شد، او گفت: «چون برای زندگی، شما به پول نیاز دارید. هدف واقعی من، این است که نشان دهم کارگردانان می‌توانند چیزی بیشتر از یک بازی بسازند.»
تاکاهیسا تائورا در مصاحبه‌ای که در ۱ آوریل ۲۰۱۸ انجام داد، دربارهٔ آزادی عمل و تفکرات او و یوکو در هنگام توسعه بازی گفت که «اگر اسکوئر انیکس نزد من می‌آمد و می‌گفت 2B را در یک بازی به عنوان اندروید قرار دهم… خب، ممکن بود او را به شکل یک حشره کوچک در بیاورم. او یک اندروید است، پس می‌تواند در هر بدنی باشد. ما حتی پوشش صورتش را هم روی آن حشره قرار می‌دادیم. این کار جالبی است. نیئا، در بازی قبل، در نیئا: اتوماتا تبدیل به یک کامیون شد. اگر این ممکن است، پس 2B هم می‌تواند یک حشره باشد.»