قلب قاعدة الحمض النووي
مراجع

↑  Roberts، RJ؛ Cheng، X (1998). "Base flipping". Annual Review of Biochemistry. ج. 67 ع. 1: 181–198. DOI:10.1146/annurev.biochem.67.1.181. PMID:9759487.
↑  Reiter، NJ؛ Blad، H؛ Abildgaard، F؛ Butcher، SE (2004). "Dynamics in the U6 RNA intramolecular stem-loop: a base flipping conformational change". Biochemistry. ج. 43 ع. 43: 13739–47. DOI:10.1021/bi048815y. PMID:15504036. S2CID:25391616.
1 2 3  Klimasauskas، Saulius؛ Kumar, Sanjay؛ Roberts, Richard J.؛ Cheng, Xiaodong (يناير 1994). "Hhal methyltransferase flips its target base out of the DNA helix". Cell. ج. 76 ع. 2: 357–369. DOI:10.1016/0092-8674(94)90342-5. PMID:8293469.
1 2  Brown، Tom. "Nucleic Acids Book". مؤرشف من الأصل في 2021-02-17. اطلع عليه بتاريخ 2014-02-26.
1 2 3 4 5  Huang، Niu؛ Nilesh K. Banavali؛ Alexander D. MacKerell (7 يناير 2003). "Protein-facilitated base flipping in DNA by cytosine-5-methyltransferase". PNAS. ج. 100 ع. 1: 68–73. Bibcode:2003PNAS..100...68H. DOI:10.1073/pnas.0135427100. PMC:140885. PMID:12506195.
1 2  Grubmüller، Helmut. "DNA Base Flipping". مؤرشف من الأصل في 2017-02-04. اطلع عليه بتاريخ 2014-02-26.
↑  Bouvier، Benjamin؛ Grubmüller, Helmut (أغسطس 2007). "A Molecular Dynamics Study of Slow Base Flipping in DNA using Conformational Flooding" (PDF). Biophysical Journal. ج. 93 ع. 3: 770–786. Bibcode:2007BpJ....93..770B. DOI:10.1529/biophysj.106.091751. PMC:1913169. PMID:17496048. مؤرشف من الأصل (PDF) في 2017-08-09.
1 2  Lariviere، L. (23 يونيو 2004). "Structural Evidence of a Passive Base-flipping Mechanism for Glucosyltransferase". Journal of Biological Chemistry. ج. 279 ع. 33: 34715–34720. DOI:10.1074/jbc.M404394200. PMID:15178685.
↑  Grosjean، [edited by] Henri (2009). DNA and RNA modification enzymes : structure, mechanism, function and evolution. Austin, Tex.: Landes Bioscience. ISBN:978-1-58706-329-9. مؤرشف من الأصل في 2014-04-07. اطلع عليه بتاريخ 2014-03-10. {{استشهاد بكتاب}}: |الأول= باسم عام (مساعدة)
1 2 3  Huang، N.؛ Banavali, N. K.؛ MacKerell, A. D. (27 ديسمبر 2002). "Protein-facilitated base flipping in DNA by cytosine-5-methyltransferase". Proceedings of the National Academy of Sciences. ج. 100 ع. 1: 68–73. DOI:10.1073/pnas.0135427100. PMC:140885. PMID:12506195.
↑  Giudice، E. (1 مارس 2003). "Base pair opening within B-DNA: free energy pathways for GC and AT pairs from umbrella sampling simulations". Nucleic Acids Research. ج. 31 ع. 5: 1434–1443. DOI:10.1093/nar/gkg239. PMC:149832. PMID:12595551. مؤرشف من الأصل في 2021-04-18. اطلع عليه بتاريخ 2014-03-15.
↑  O'Neil، Lauren. Base Flipping in DNA: Detection, Structures and Energetics, A Dissertation. ISBN:9780549590743. مؤرشف من الأصل في 2022-08-18. اطلع عليه بتاريخ 2014-03-15.
↑  Bischerour، Julien؛ Chalmers, Ronald؛ Bielinsky, Anja-Katrin (10 يوليو 2009). "Base Flipping in Tn10 Transposition: An Active Flip and Capture Mechanism". PLOS ONE. ج. 4 ع. 7: e6201. Bibcode:2009PLoSO...4.6201B. DOI:10.1371/journal.pone.0006201. PMC:2705183. PMID:19593448.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
1 2 3 4 5  University، James D. Watson, Cold Spring Harbor Laboratory, Tania A. Baker, Massachusetts Institute of Technology, Alexander Gann, Cold Spring Harbor Laboratory, Michael Levine, University of California, Berkeley, Richard Losik, Harvard (2014). Molecular biology of the gene (ط. Seventh). Boston: Pearson/CSH Press. ISBN:978-0-321-76243-6.{{استشهاد بكتاب}}:  صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
↑  Krokan، Hans E؛ Drabløs, Finn؛ Slupphaug, Geir (16 ديسمبر 2002). "Uracil in DNA – occurrence, consequences and repair". Oncogene. ج. 21 ع. 58: 8935–8948. DOI:10.1038/sj.onc.1205996. PMID:12483510.
↑  Banerjee، Anirban؛ Yang, Wei؛ Karplus, Martin؛ Verdine, Gregory L. (31 مارس 2005). "Structure of a repair enzyme interrogating undamaged DNA elucidates recognition of damaged DNA". Nature. ج. 434 ع. 7033: 612–618. Bibcode:2005Natur.434..612B. DOI:10.1038/nature03458. PMID:15800616.
↑  Fuxreiter، Monika؛ Luo, Ning؛ Jedlovszky, Pál؛ Simon, István؛ Osman, Roman (نوفمبر 2002). "Role of Base Flipping in Specific Recognition of Damaged DNA by Repair Enzymes". Journal of Molecular Biology. ج. 323 ع. 5: 823–834. DOI:10.1016/S0022-2836(02)00999-3. PMID:12417196.
↑  Patel، Premal H.؛ Suzuki, Motoshi؛ Adman, Elinor؛ Shinkai, Akeo؛ Loeb, Lawrence A. (مايو 2001). "Prokaryotic DNA polymerase I: evolution, structure, and "base flipping" mechanism for nucleotide selection". Journal of Molecular Biology. ج. 308 ع. 5: 823–837. DOI:10.1006/jmbi.2001.4619. PMID:11352575. S2CID:16277925.
↑  Lim، H. M.؛ Lee, H. J.؛ Roy, S.؛ Adhya, S. (4 ديسمبر 2001). "A "master" in base unpairing during isomerization of a promoter upon RNA polymerase binding". Proceedings of the National Academy of Sciences. ج. 98 ع. 26: 14849–14852. Bibcode:2001PNAS...9814849L. DOI:10.1073/pnas.261517398. PMC:64947. PMID:11734629.
↑  Voloshin، Oleg N.؛ Camerini-Otero, R.Daniel (سبتمبر 2004). "Synaptic Complex Revisited". Molecular Cell. ج. 15 ع. 6: 846–847. DOI:10.1016/j.molcel.2004.09.010. PMID:15383274.
↑  Folta-Stogniew، E؛ O'Malley, S؛ Gupta, R؛ Anderson, KS؛ Radding, CM (24 سبتمبر 2004). "Exchange of DNA base pairs that coincides with recognition of homology promoted by E. coli RecA protein". Molecular Cell. ج. 15 ع. 6: 965–75. DOI:10.1016/j.molcel.2004.08.017. PMID:15383285.
↑  Bischerour، J.؛ Lu, C.؛ Roth, D. B.؛ Chalmers, R. (31 أغسطس 2009). "Base Flipping in V(D)J Recombination: Insights into the Mechanism of Hairpin Formation, the 12/23 Rule, and the Coordination of Double-Strand Breaks". Molecular and Cellular Biology. ج. 29 ع. 21: 5889–5899. DOI:10.1128/MCB.00187-09. PMC:2772739. PMID:19720743.
↑  Klose، Robert J.؛ Adrian P. Bird (2006). "Genomic DNA methylation: the mark and its mediators". Trends in Biochemical Sciences. ج. 31 ع. 2: 89–97. DOI:10.1016/j.tibs.2005.12.008. ISSN:0968-0004. PMID:16403636.
↑  Nakao، M (2001). "Epigenetics: Interaction of DNA Methylation and Chromatin". Gene. ج. 278 ع. 1–2: 25–31. DOI:10.1016/s0378-1119(01)00721-1. PMID:11707319.
↑  Plass، C؛ Soloway، PD (2002). "DNA Methylation, Imprinting and Cancer". Eur J Hum Genet. ج. 10 ع. 1: 6–16. DOI:10.1038/sj.ejhg.5200768. PMID:11896451.
↑  Esteller، M؛ Herman، JG (2002). "Cancer as an Epigenetic Disease: DNA Methylation and Chromatin Alterations in Human Tumours". J Pathol. ج. 196 ع. 1: 1–7. DOI:10.1002/path.1024. PMID:11748635.
↑  "Archived copy". مؤرشف من الأصل في 2014-04-18. اطلع عليه بتاريخ 2014-04-03.{{استشهاد ويب}}:  صيانة الاستشهاد: الأرشيف كعنوان (link)
↑  Horton، John R.؛ Zhang، Xing؛ Maunus، Robert؛ Yang، Zhe؛ Wilson، Geoffrey؛ Roberts، Richard؛ Cheng، Xiaodong (2006). "DNA Nicking by HinP1I Endonuclease: Bending, Base Flipping and Minor Groove Expansion". Nucleic Acids Research. ج. 34 ع. 3: 939–948. DOI:10.1093/nar/gkj484. PMC:1363774. PMID:16473850.
بوابة علم الأحياء
بوابة علم الوراثة