علم العقاقير
الخلفية الحيوية

جميع النباتات تنتج مواد كميائيه طبيعه كجزء من نشاطها الحيوي الايضي الطبيعي. وتنقسم هذه الموادالكيميائية النباتية إلى:
أيضة أوليةلمركبات الايضية الأساسية مثل السكريات والدهون، والتي توجد في جميع النباتات. و
أيضة ثانويةالمركبات الايضيه الثانوية التي توجدفي نطاق أصغرمن النباتات، تخدم وظيفة أكثرتحديدا. على سبيل المثال، بعض المركبات الثانوية هي السموم المستخدمة لردع الافتراس والبعض الآخرالفيرومونات التي تعمل على جذب الحشرات للتلقيح. والأصباغ التي يمكن أن تستعمل للإجراءات العلاجية في البشروالتي يمكن أن تمتكريره لإنتاج عقاقير، على سبيل المثال الحبوب (الأنيولن إينولين)من جذور زهره الاضاليا (أضاليا)، الكينينكينينمن الكيناوالمورفين والكودايين من الخشخاش، والديجوكسينمنالديجيتال قمعية.]
النباتات تقوم بتصنيع أنواع مذهله من المواد الكيميائية النباتية ولكن معظمها هذه المواد مشتق من عدد قليل من العناصرالكيمياء الحيوية:
شبه قلوي-القلويدات أو أشباه القلويات هي فئة من المركبات الكيميائية التي تحتوي على حلقة النيتروجين. ويتم إنتاج القلويات من قبل مجموعة كبيرة ومتنوعة من الكائنات الحية، بمافي ذلك البكتيرياوالفطريات والنباتات والحيوانات، والتي هي جزءمن مجموعة من المنتجات الطبيعية (وتسمى أيضا المركبات الثانوية secondary metabolites). العديدمن القلويات يمكن تنقيته من المستخلصات الخام عن طريق الاستخلاص الحمضي القاعدي. العديدمن قلويات سامة للكائنات الحية الأخرى. القلويات بالعادة تمتلك تأثيرات دوائية اذتستخدم كأدوية وعقاقيرالمنشطة، أوفيالطقوسentheogenic. ومن الأمثلة على ذلك المخدرالموضعي والكوكايين المنشط. و السيلوسين المخدر. الكافيين منبه. النيكوتين. المورفين المسكن. وبربارين المضادللجراثيم. وفينكريستين المركب المضادلسرطان. وريزيربين المضاد لارتفاع الضغط. الجلوتماين المشابه في عمله للاستيل كولين. والأتروبينوكيل إزالة التشنج. وفينكامين الموسع للاوعيه. مركب الكينيدين لمكافحة اضطراب النظم. لمكافحة الربوالايفيدرين العلاجي؛ والكينينالأدوية المضادة للملاريا. على الرغم من أن القلويات تعمل على مجموعة متنوعة من أنظمة التمثيل الغذائي لدى البشروالحيوانات الأخرى، لكنهاتقريباموحدة الطعم المر.
البوليفينولمتعدد الفينول (المعروف أيضا باسم الفينولات) هي مركبات التي تحتوي على حلقات الفينول.مثل الانثوسيانين التي تعطي العنب لونها بنفسجي، الايسوفلافون، فيتويستروغنز من فول الصويا والعفص عفص (مادة) التي تعطي الشاي خاصيه قبض الأوعية.
جليكوسيداتغليكوزيد عباره عن جزيئات يوجد فيه السكر مرتبط إلى جزء غير الكربوهيدراتي، هي عادة جزيء عضوي صغير. جليكوسيدات تلعب العديد من الأدوار الهامة في الكائنات الحية. العديد من النباتات تخزين المواد الكيميائية عل شكل جليكوسيدات غير فعاله. ويمكن تفعيلها من خلال التحلل الانزيمي الذي يسبب بتكسير جزيء السكر منه، مما يجعل هذه المادة الكيميائية متوفرة للاستخدام. وتستخدم العديد من هذه الجليكوسيدات النباتيه كأدوية. في الحيوانات والبشر، بالعادة ترتبط السموم بدلا من جزيئات السكر كجزء من عمليه إزالتها من الجسم. ومن الأمثلة على ذلك سيانوجلايكوسايدcyanoglycosides في حفر الكرز التي تطلق السموم فقط عندما تعض من قبل أكلة الأعشاب.
تربين هي فئة كبيرة ومتنوعة من المركبات العضوية، التي تنتجها مجموعة متنوعة من النباتات، خاصة الصنوبريات، والتي هي في كثير من الأحيان تتميز بالرائحة القوية، وبالتالي قد تكون لها وظيفة وقائية. وهي المكونات الرئيسية راتنجresin، وزيت التربنتين المنتجة من الراتنج. (اسم «تربين» مشتق من كلمة «التربنتين»). تربين هي الكتلة الرئيسية لبناء السكروز تقريبا داخل كل كائن حي. المنشطات على سبيل المثال، مشتقه من السكوالين تريتيربيني. عندما يتم تعديل التربينات كيميائيا، مثل الأكسدة أو إعادة ترتيب الهيكل الكربوني يشار إلى المركبات الناتجة عادة إلى تيربينويدسterpenoids. تربين وتيربينويدس هي المكونات الأساسية للزيوت الموجوده في أنواع كثيرة من النباتات والزهور. وتستخدم الزيوت الأساسية على نطاق واسع كمواد مضافه لتحسين النكهة الطبيعية للأغذية، وكعطور في صناعة العطور، وفي مجال الأدوية التقليدية والبديلة كالعطارة. الاختلافات والتنوع فيالتركيب والاشتقاق لكل منالتربين الطبيعية وتيربينويدس عملت على توسيع تنوع المعطرات والمنكهات aromas المستخدمة في صناعة العطور والمنكهات في الصناعات الغذائية أيضا على نحو كبير. فيتامين (أ) هو مثال على التربين. رائحة الورد والخزامى هي بسبب وجود مركب احاديه التربينس. الكاروتينات تنتج الأحمر، الأصفر والبرتقالي لكل من اليقطين والذرة والطماطم (البندورة).
مجموعة من باحثين الجزيئية النباتية في جامعة ولاية واشنطن، ومركز دونالد دانفورث علوم النبات، والمركز الوطني للموارد الجينوم، وجامعة إلينوي في شيكاغو. برعاية المعاهد الوطنية للصحة بدأ بدراسه إلى أكثر من ثلاثين نوعا من النباتات الطبية أواخر عام 2009. العمل الأولي، لوضع إشارة تسلسل لكلTranscriptome ، مما أدى إلى تطوير قاعدة البيانات الطبية النباتيه للTranscriptomics