كارل التاسع
قبل الحكم

شقيقه الملك إريك الرابع عشر.
شقيقه يوهان الثالث
ابن شقيقه سيغيسموند
منذ عام 1568 اعتبار الزعيم الحقيقي للتمرد ضد شقيقه إريك الرابع عشر، ومع ذلك فهو لم يشارك في مخططات شقيقه يوهان الثالث ضد الملك التعيس بعد عزله، كانت علاقته مع يوهان دائمًا متوترة إلى حد ما، على الأقل كان يشتبه بتورطه في مؤامرة مورناي حول إقالة يوهان الثالث عام 1574، وأيضا اعتبر أحد الحكام البدلاء الذين تم اقترحهم من قبل المتآمرون في مؤامرة 1576، لم يكن لديه أي تعاطف مع ميول يوهان الكنسية، ومن ناحية أخرى قاوم بشدة كل مساعي الملك حول تقييد سلطته كدوق سودرمانلاند، ولكن النبلاء وأغلبية أعضاء ريكسداغ الطبقات كانت تدعمه، ومع ذلك خلال مساعيه لتوحيد المملكة، كان على كارل أن يتخلى عن ادعاءاته بالحكم الذاتي داخل دوقيته، ولكن على الرغم من كونه لوثريًا حازم، إلا أنه فيما يتعلق بالمسألة الدينية كان موقفه ثابتاً، وصل الأمر إلى أزمة بعد وفاة يوهان الثالث عام 1592 كان وريث العرش هو ابنه البكر سيغيسموند الثالث فاسا ملك بولندا وبالفعل كان كاثوليكي مخلص، أثار الخوف من أن سيغيسموند قد يعيد الكاثوليكية إلى البلاد قلق الأغلبية البروتستانتية في السويد - وخاصة عامة الناس وطبقة النبلاء الدنيا، ومما برز كارل كبطل لهم، وكذلك كمدافع عن أسرة فاسا ضد التدخل الأجنبي.
كان بسبب وراء أن سيغيسموند بصفته الملك المنتخب، اضطر كارل إلى تأكيد قرارات دينية في مجمع أوبسالا في عام 1593، وبالتالي الاعتراف بحقيقة أن السويد كانت في الأساس دولة بروتستانتية لوثرية، وبموجب الاتفاقية تقاسم كارل ومجلس الملكي الخاص السلطة وحكموا مكان سيغيسموند الشاغر الذي كان يقيم في بولندا منذ فترة، وفي الأعوام التالية 1593-1595 كانت مهمة كارل صعبة للغاية، كان عليه أن يعارض بشكل حازم ميول وتوجيهات سيغيسموند الرجعية، وكان عليه أيضًا كبح جماح النبلاء الذين سعوا إلى زيادة قوتهم على حساب الملك الغائب، وهو ما فعله بصرامة شديدة.
وقد اضطرته الضرورة إلى العمل مع رجال الدين والشعب بدلاً من طبقة النبلاء؛ ومن ثم فقد أصبح ريكسداغ الطبقات في ظل حكومة الوصاية قوة وأهمية لم يمتلكها من قبل، وبذلك في عام 1595 انتخب ريكسداغ سودرشوبينغ كارل وصيًا على العرش، وأدى محاولته لإجبار كلاوس فليمنغ حاكم أوسترلاند (فنلندا الحالية)؛ على الخضوع لسلطته بدلاً من سلطة الملك إلى اندلاع حرب أهلية، حاول الملك إدارة الموقف بالدبلوماسية على مدى عدة سنوات، حتى سئم منها وتمكن من الحصول على إذن من المجلس التشريعي للكومنولث لمتابعة الأمور التي تقسم رعاياه السويديين، وبذلك غزا البلاد مع جيش من المرتزقة.
في أبريل 1597 بعد إخضاع انتفاضة الفلاحين والاستعداد لمقاومة الغزو المتوقع لكارل، توفي فليمنغ وخلفه أرفيد ستالارم الأصغر في منصب الحاكم، وبحلول أغسطس غزا كارل وجيشه أوسترلاند، واستولى على أولاند التي اعتبرت إقطاعية أختها الأرملة كاثرين، وحاصر قلعة توركو لم يكن فليمنغ قد دُفن بعد، ووفقًا لأسطورة؛ قام كارل فتح التابوت ليطمئن بنفسه بأن عدوه فليمنغ قد مات بالفعل، وبعد التعرف عليه قام بشد لحيته قائلاً: "لو كنت على قيد الحياة، لما كان رأسك سليماً"؛ وهو ما ردت عليه زوجته إيبا ستينبوك، فأجابت: "لو كان زوجي الراحل على قيد الحياة، لما كنت سموك هنا أبدًا".
من الناحية الفنية كان كارل بلا شك، مذنبًا بارتكاب جريمة الخيانة العظمى، كانت الأقلية الكبيرة من جميع الطبقات التي انضمت إلى سيغيسموند بعد حُطّ في السويد عام 1598 تصرفوا بلا شك مثل الرعايا المخلصين، في الأحداث التي تلت ذلك بالرغم من بعض النجاحات الأولية، إلا أن سيغيسموند خسر معركة ستانجبرو الحاسمة، بحيث أُسر فيها، بالإضافة إلى ذلك إجباره على تسليم بعض النبلاء السويديين الذين وصفهم كارل وريكسداغ بالخونة، تم إعدامهم بشناعة، ومع هزيمة سيغيسموند ونفيه باعتباره أجنبيًا ومهرطقًا بالنسبة لغالبية الأمة السويدية، تم إقالته رسميًا من قبل الريكسداغ عام 1599، وفي نفس الوقت اعتبرت بمثابة تبرئة طبيعية وإضفاء الشرعية بأثر رجعي على موقف كارل طوال الوقت، بحيث عينته نفس الجلسة من أعضاء ريكسداغ حاكمًا وصيًا على العرش.