محادثات جوبا 2006–08
وقف إطلاق النار > هجمات

تم إيقاف المفاوضات مؤقتاً في أوائل شهر أكتوبر بينما تم إرسال فريق مراقبة وقف الأعمال القتالية إلى (Owiny KiBul) تم إيقاف الفريق بأنه لم يقع أي هجم، لكن جيش الرب للمقاوم قد إبتعد ببساطة عن المواقع المحدده وأوصى الفريق بأن يعدو متمردو جيش الرب للمقاومة تجميع صفوفهم في (أويني كي بول)، بينما ذكروا أن جيش الرب للمقاومة لم يحترم الإتفاق وكان يستخدم دعاية معادية وأن قوات الدفاع الشعبية والأوغندية كانت موجودة بالقرب من نقاط التجمع وأن الوسطاء قد فشلوا في توفير حراس مسلحين. في 11 أكتوبر 2006 ، اقترح جيش الرب للمقاومة أن تتبنى أوغندا هيكلاً فيدرالياً، مما أثار انتقادات من المتحدث الرسمي باسم الحكومة.
في 20 أكتوبر 2006م سافر الرئيس الأوغندي(يوويري موسيفيني) إلى جوبا للقاء مفوضي جيش الرب للمقاومة وجهاً لوجه لأولة مرة في محاولة لإحياء المحادثات التي وصفتها بي بي سي نيوز بأنها «متوقفة» و «متعثرة» من قبيل صحيفة
ذا مونيتور.أفاد مصدر حكومي أوغندي بأن الرئيس تحدث بغضب ووبخ فريق جيش الرب للمقاومة عدة مرات قبل الإشارة لاحقاً إلى جيش الرب للمقاومة على أنه «غير جاد» في خطاب لاحق لمسؤولي حكومة جنوب السودان.
وأليت شاحبة خلال المحادثات بقتل عشرات المدنيين بما في ذلك إطلاق النار على النساء والأطفال في الرأس، بالقرب من مدينة جوبا (عاصمة جنوب السودان) خلال اليومين السابقين ونفذت الهجمات جماعات لم تُحدد هويتها بعد لكن البعض إشتبه في أنه جيش الرب للمقاومة هو المسؤول عن هذه الفوضى.
بعد مأزق استمر أسبوعاً وقع جيش الرب للمقاومة والحكومة هدنة ثانية في 1نوفمبر 2006م كلفت فريق المراقبة حتى 1ديسمبر وكان الإتفاق السابق قد إنتهى من الناحية الفنية في ديسمبر. كجزء من الإتفاقية كان على جيش الرب الانسحاب من بعد مأزق استمر أسبوعاً وقع جيش الرب للمقاومة والحكومة هدنة ثانية في 1نوفمبر 2006م كلفت فريق المراقبة حتى 1ديسمبر وكان الإتفاق السابق قد إنتهى من الناحية الفنية في ديسمبر. كجزء من الإتفاقية كان على جيش الرب للمقاومة الانسحاب من (أويني كي بول) بعد منطقة عازلة يبلغ طولها 30 كلم.
مُنح جيش الرب للمقاومة أسبوعًا لإعادة تجميع صفوفه في أويني كي بول، وأربعة أسابيع للتجمع في ري كوانجبا. رفض كوني وأوتي دخول المخيمات، بدعوى الخوف من الاعتقال بناء على أوامر المحكمة الجنائية الدولية. ينص الاتفاق كذلك على أنه لن يتم توفير المواد الغذائية لوحدات جيش الرب للمقاومة خارج نقاط التجمع إلا في «ظروف استثنائية».
في واحدة من أهم لحظات جيش الرب للمقاومة خلال المحادثات إلتقى وكيل الأمين العام للأمم المتحدة للشؤون الإنسانية ومنسق الإغاثة في حالات الطوارئ (جان إيغلاند)
مع (كوني وأوتي) على أمل دفع المحادثات إلى الأمام في 12نوفمبر 2006. كان (إيجلاند) قد صرح في وقت سابق بأنه لن يجتمع مع (كوني)إلا إذا أطلق جيش الرب للمقاومة المختطفين من الأطفال والأفراد المصابين لكن (كوني) نفى أن يكون أي شخص من جيش الرب للمقاومة إما محتجزاً ضد إرادته أو مصاباً.
أعلن جيش الرب للمقاومة انسحابه من المحادثات في الـ30 من نوفمبر، قائلاً إن قوات الدفاع الشعبية الأوغندية قتلت ثلاثة من مقاتليها. كان الموعد النهائي لمقاتلي جيش الرب للمقاومة لإنهاء التجمع عند نقاط التجمع هو 1ديسمبر  أنكرت اوغندا التهمة، كذلك قام الأمين العام للأمم المتحدة المنتهية ولايته (كوي عنان) بتعيين (يواكيم شايسانو) الرئيس السابق (لموزمبيق) ليكون مبعوث الأمم المتحدة للصراع. وتم تمديد الهدنة لمدة شهرين آخرين في 18 ديسمبر.
في 12ياناير 2007م صرح (أوجول) أن التعليقات الأحيرة التي أدلى بها عمر البشير و (كير تشير) بوضح إلى أن جيش الرب للمقاومة لم يوضح موضوع ترحيب في السودان وأنه ينبغي إجراء المزيد من المحادثات في كينيا بدلاً من ذلك. في 14 مارس 2007 أعلن جيش الرب للمقاومة أنه سيعود مرة أخرى إلى محادثات جوبا. بعد أن وافقت كل من جنوب أفريقيا وكينيا وموزنبيق على الانضمام إلى محادثات السلام (وهو طلب قدمه جيش الرب للمقاومة قبل عودته إلى جوبا).
عقدت الجولة الثانية من هذه المحادثات في الفترة من 13 أبريل إلى 14 أبريل 2007م  في هذه الجولة تم تمديد وقف إطلاق النار حتى 30يونيو 2007م وكانت (ري كوانجبا) نقطة التجمع التي أتفق عليها وتم تحديد الجولة التالية من المحادثات في 25أبريل 2007م.