الجزء المتساوي (علم الوراثة)
مراجع

↑  Macaya, Thiery, and Bernardi (1976). "An approach to the organization of eukaryotic genomes at a macromolecular level". Journal of Molecular Biology. ج. 108 ع. 1: 237–254. DOI:10.1016/S0022-2836(76)80105-2. PMID:826644.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
↑  Thiery, Macaya, and Bernardi (1976). "An analysis of eukaryotic genomes by density gradient centrifugation". Journal of Molecular Biology. ج. 108 ع. 1: 219–235. DOI:10.1016/S0022-2836(76)80104-0. PMID:826643.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
1 2 3 4 5  Bernardi؛ Olofsson، Birgitta؛ Filipski، Jan؛ Zerial، Marino؛ Salinas، Julio؛ Cuny، Gerard؛ Meunier-Rotival، Michele؛ Rodier، Francis؛ وآخرون (1985). "The mosaic genome of warm-blooded vertebrates". Science. ج. 228 ع. 4702: 953–958. Bibcode:1985Sci...228..953B. DOI:10.1126/science.4001930. PMID:4001930.
1 2  Cuny؛ Soriano، P؛ MacAya، G؛ Bernardi، G؛ وآخرون (1981). "The major components of the mouse and human genomes: Preparation, basic properties and compositional heterogeneity". European Journal of Biochemistry. ج. 115 ع. 2: 227–233. DOI:10.1111/j.1432-1033.1981.tb05227.x. PMID:7238506.
↑  Salinas؛ Zerial، M؛ Filipski، J؛ Crepin، M؛ Bernardi، G؛ وآخرون (1987). "Nonrandom distribution of MMTV proviral sequences in the mouse genome". Nucleic Acids Res. ج. 15 ع. 7: 3009–3022. DOI:10.1093/nar/15.7.3009. PMC:340712. PMID:3031617.
1 2  Bernardi (1993). "The vertebrate genome: isochores and evolution". Molecular Biology and Evolution. ج. 10 ع. 1: 186–204. DOI:10.1093/oxfordjournals.molbev.a039994. PMID:8450755.
↑  Bernardi (1995). "The human genome: organization and evolutionary history". Annual Review of Genetics. ج. 29: 445–476. DOI:10.1146/annurev.ge.29.120195.002305. PMID:8825483.
↑  Bernardi, Hughes, and Mouchiroud (1997). "The major compositional transitions in the vertebrate genome". Journal of Molecular Evolution. 44 Suppl 1 ع. S1: S44–51. Bibcode:1997JMolE..44S..44B. DOI:10.1007/PL00000051. PMID:9071011. S2CID:25234820.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
↑  Robinson, Gautier, and Mouchiroud (1997). "Evolution of isochores in rodents". Molecular Biology and Evolution. ج. 14 ع. 8: 823–828. DOI:10.1093/oxfordjournals.molbev.a025823. PMID:9254920.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
↑  Galtier and Mouchiroud؛ Mouchiroud، D (1998). "Isochore evolution in mammals: a human-like ancestral structure". Genetics. ج. 150 ع. 4: 1577–1584. DOI:10.1093/genetics/150.4.1577. PMC:1460440. PMID:9832533.
↑  Oliver؛ Bernaola-Galván، P؛ Carpena، P؛ Román-Roldán، R؛ وآخرون (2001). "Isochore chromosome maps of eukaryotic genomes". Gene. ج. 276 ع. 1–2: 47–56. CiteSeerX:10.1.1.14.1712. DOI:10.1016/S0378-1119(01)00641-2. PMID:11591471.
↑  Aota and Ikemura؛ Ikemura، T (1986). "Diversity in G + C content at the third position of codons in vertebrate genes and its cause". Nucleic Acids Res. ج. 14 ع. 16: 6345–6355. DOI:10.1093/nar/14.16.6345. PMC:311650. PMID:3748815.
↑  Galtier and Lobry؛ Lobry، J.R. (1997). "Relationships Between Genomic G+C Content, RNA Secondary Structures, and Optimal Growth Temperature in Prokaryotes". Journal of Molecular Evolution. ج. 44 ع. 6: 632–636. Bibcode:1997JMolE..44..632G. DOI:10.1007/PL00006186. PMID:9169555. S2CID:19054315.
1 2  Hughes, Zelus, and Mouchiroud (1999). "Warm-blooded isochore structure in Nile crocodile and turtle". Molecular Biology and Evolution. ج. 16 ع. 11: 1521–1527. DOI:10.1093/oxfordjournals.molbev.a026064. PMID:10555283.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
↑  Eyre-Walker and Hurst؛ Hurst، LD (2001). "The evolution of isochores". Nat Rev Genet. ج. 2 ع. 7: 549–555. DOI:10.1038/35080577. PMID:11433361. S2CID:2203093.
↑  Hurst and Merchant؛ Merchant، AR (2001). "High guanine-cytosine content is not an adaptation to high temperature: a comparative analysis amongst prokaryotes". Proceedings of the Royal Society B. ج. 268 ع. 1466: 493–497. DOI:10.1098/rspb.2000.1397. PMC:1088632. PMID:11296861.
1 2  Belle, Smith, and Eyre-Walker (2002). "Analysis of the phylogenetic distribution of isochores in vertebrates and a test of the thermal stability hypothesis". Journal of Molecular Evolution. ج. 55 ع. 3: 356–363. Bibcode:2002JMolE..55..356B. DOI:10.1007/s00239-002-2333-1. PMID:12187388. S2CID:16596135.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
1 2  Ream, Johns, and Somero (2003). "Base Compositions of Genes Encoding {alpha}-Actin and Lactate Dehydrogenase-A from Differently Adapted Vertebrates Show No Temperature- Adaptive Variation in G + C Content". Molecular Biology and Evolution. ج. 20 ع. 1: 105–110. DOI:10.1093/molbev/msg008. PMID:12519912. مؤرشف من الأصل في 2013-04-15.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
↑  Belle؛ Duret، L؛ Galtier، N؛ Eyre-Walker، A؛ وآخرون (2004). "The decline of isochores in mammals: an assessment of the GC content variation along the mammalian phylogeny". Journal of Molecular Evolution. ج. 58 ع. 6: 653–660. Bibcode:2004JMolE..58..653B. CiteSeerX:10.1.1.333.2159. DOI:10.1007/s00239-004-2587-x. PMID:15461422. S2CID:18281444.
↑  Hughes, Friedman, and Murray (2002). "Genomewide pattern of synonymous nucleotide substitution in two complete genomes of Mycobacterium tuberculosis". Emerging Infectious Diseases. ج. 8 ع. 11: 1342–1346. DOI:10.3201/eid0811.020064. PMC:2738538. PMID:12453367.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
↑  Costantini, Auletta, and Bernardi (2007). "Isochore patterns and gene distributions in fish genomes". Genomics. ج. 90 ع. 3: 364–371. DOI:10.1016/j.ygeno.2007.05.006. PMID:17590311.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
↑  Symonová, Majtánová, Arias-Rodriguez, Mořkovský, Kořínková, Cavin, Johnson Pokorná, Doležálková, Flajšhans, Normandeau, Ráb, Meyer, and Bernatchez (2016). "Genome Compositional Organization in Gars Shows More Similarities to Mammals than to Other Ray-Finned Fish". Journal of Experimental Zoology. ج. 328 ع. 7: 607–619. DOI:10.1002/jez.b.22719. PMID:28035749. مؤرشف من الأصل في 2023-10-04.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
1 2 3 4  Bernardi (2001). "Misunderstandings about isochores. Part 1". Gene. ج. 276 ع. 1–2: 3–13. DOI:10.1016/S0378-1119(01)00644-8. PMID:11591466.
1 2  Bernardi (2000). "Isochores and the evolutionary genomics of vertebrates". Gene. ج. 241 ع. 1: 3–17. DOI:10.1016/S0378-1119(99)00485-0. PMID:10607893.
1 2  Bernardi (2000). "The compositional evolution of vertebrate genomes". Gene. ج. 259 ع. 1–2: 31–43. DOI:10.1016/S0378-1119(00)00441-8. PMID:11163959.
↑  Wolfe, Sharp, and Li؛ Sharp؛ Li (1989). "Mutation rates differ among regions of the mammalian genome". Nature. ج. 337 ع. 6204: 283–285. Bibcode:1989Natur.337..283W. DOI:10.1038/337283a0. PMID:2911369. S2CID:4336541.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
1 2  Galtier؛ Piganeau، G؛ Mouchiroud، D؛ Duret، L؛ وآخرون (2001). "GC- content evolution in mammalian genomes: the biased gene conversion hypothesis". Genetics. ج. 159 ع. 2: 907–911. DOI:10.1093/genetics/159.2.907. PMC:1461818. PMID:11693127.
↑  Matassi, Sharp, and Gautier (1999). "Chromosomal location effects on gene sequence evolution in mammals". Current Biology. ج. 9 ع. 15: 786–791. DOI:10.1016/S0960-9822(99)80361-3. PMID:10469563.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
↑  Bernardi and Bernardi؛ Bernardi، G (1986). "Compositional constraints and genome evolution". Journal of Molecular Evolution. ج. 24 ع. 1–2: 1–11. Bibcode:1986JMolE..24....1B. DOI:10.1007/BF02099946. PMID:3104608. S2CID:26783774.
1 2  Jean؛ Linton، LM؛ Birren، B؛ Nusbaum، C؛ Zody، MC؛ Baldwin، J؛ Devon، K؛ Dewar، K؛ وآخرون (2001). "Initial sequencing and analysis of the human genome" (PDF). Nature. ج. 409 ع. 6822: 860–921. Bibcode:2001Natur.409..860L. DOI:10.1038/35057062. PMID:11237011. مؤرشف من الأصل (PDF) في 2024-10-08.
1 2  Elsik؛ Elsik، Christine G.؛ Tellam، Ross L.؛ Worley، Kim C.؛ Gibbs، Richard A.؛ Elsik، Christine G.؛ Tellam، Ross L.؛ Gibbs، Richard A.؛ Muzny، Donna M.؛ وآخرون (2009). "The genome sequence of taurine cattle: a window to ruminant biology and evolution". Science. ج. 324 ع. 5926: 522–528. Bibcode:2009Sci...324..522A. DOI:10.1126/science.1169588. PMC:2943200. PMID:19390049.
1 2  Nekrutenko and Li؛ Li، WH (2000). "Assessment of compositional heterogeneity within and between eukaryotic genomes". Genome Research. ج. 10 ع. 12: 1986–1995. DOI:10.1101/gr.10.12.1986. PMC:313050. PMID:11116093.
↑  Häring and Kypr؛ Kypr، J (2001). "No Isochores in the Human Chromosomes 21 and 22?". Biochemical and Biophysical Research Communications. ج. 280 ع. 2: 567–573. DOI:10.1006/bbrc.2000.4162. PMID:11162557.
1 2  Cohen؛ Dagan، T؛ Stone، L؛ Graur، D؛ وآخرون (2005). "GC composition of the human genome: in search of isochores". Molecular Biology and Evolution. ج. 22 ع. 5: 1260–1272. DOI:10.1093/molbev/msi115. PMID:15728737.
1 2 3 4  Elhaik؛ Graur، D؛ Josić، K؛ Landan، G؛ وآخرون (2010). "Identifying compositionally homogeneous and nonhomogeneous domains within the human genome using a novel segmentation algorithm". Nucleic Acids Res. ج. 38 ع. 15: e158. DOI:10.1093/nar/gkq532. PMC:2926622. PMID:20571085.
↑  Elhaik, Landan, and Graur (2009). "Can GC Content at Third- Codon Positions Be Used as a Proxy for Isochore Composition?". Molecular Biology and Evolution. ج. 26 ع. 8: 1829–1833. DOI:10.1093/molbev/msp100. PMID:19443854.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
↑  Tatarinova؛ Alexandrov، NN؛ Bouck، JB؛ Feldmann، KA؛ وآخرون (2010). "GC3 biology in corn, rice, sorghum and other grasses". BMC Genomics. ج. 11: 308. DOI:10.1186/1471-2164-11-308. PMC:2895627. PMID:20470436.
↑  Li؛ Bernaola-Galvan، Pedro؛ Carpena، Pedro؛ Oliver، Jose L؛ وآخرون (2003). "Isochores merit the prefix 'iso'". Computational Biology and Chemistry. ج. 27 ع. 1: 5–10. arXiv:physics/0209080. Bibcode:2002physics...9080L. DOI:10.1016/S1476-9271(02)00090-7. PMID:12798034. S2CID:53305489.
↑  Clay and Bernardi (2005). "How Not to Search for Isochores: A Reply to Cohen et al". Molecular Biology and Evolution. ج. 22 ع. 12: 2315–2317. DOI:10.1093/molbev/msi231. PMID:16093569.
↑  Romiguier؛ Ranwez، V؛ Douzery، EJ؛ Galtier، N؛ وآخرون (2010). "Contrasting GC-content dynamics across 33 mammalian genomes: Relationship with life-history traits and chromosome sizes". Genome Research. ج. 20 ع. 8: 1001–1009. DOI:10.1101/gr.104372.109. PMC:2909565. PMID:20530252.
↑  Elhaik, Graur, and Josic (2010). "Comparative testing of DNA segmentation algorithms using benchmark simulations". Molecular Biology and Evolution. ج. 27 ع. 5: 1015–1024. DOI:10.1093/molbev/msp307. PMID:20018981.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
↑  Costantini؛ Clay، O؛ Auletta، F؛ Bernardi، G؛ وآخرون (2006). "An isochore map of human chromosomes". Genome Research. ج. 16 ع. 4: 536–541. DOI:10.1101/gr.4910606. PMC:1457033. PMID:16597586.
↑  Robinson، Gene E.؛ Gibbs، Richard A.؛ Weinstock، George M.؛ Worley، Kim C.؛ Evans، Jay D.؛ Maleszka، Ryszard (2006). "Insights into social insects from the genome of the honeybee Apis mellifera". Nature. ج. 443 ع. 7114: 931–949. Bibcode:2006Natur.443..931T. DOI:10.1038/nature05260. PMC:2048586. PMID:17073008.
↑  Sodergren؛ Weinstock، George M.؛ Davidson، Eric H.؛ Cameron، R. Andrew؛ Gibbs، Richard A.؛ Weinstock، George M.؛ Angerer، Robert C.؛ Angerer، Lynne M.؛ Arnone، Maria Ina؛ وآخرون (2006). "The genome of the sea urchin Strongylocentrotus purpuratus". Science. ج. 314 ع. 5801: 941–952. Bibcode:2006Sci...314..941S. DOI:10.1126/science.1133609. PMC:3159423. PMID:17095691.
↑  Richards، S.؛ Gibbs، Richard A.؛ Weinstock، George M.؛ Brown، Susan J.؛ Denell، Robin؛ Beeman، Richard W.؛ Gibbs، Richard؛ Beeman، Richard W.؛ وآخرون (2008). "The genome of the model beetle and pest Tribolium castaneum". Nature. ج. 452 ع. 7190: 949–955. Bibcode:2008Natur.452..949R. DOI:10.1038/nature06784. PMID:18362917.
↑  Kirkness؛ Haas، BJ؛ Sun، W؛ Braig، HR؛ Perotti، MA؛ Clark، JM؛ Lee، SH؛ Robertson، HM؛ Kennedy، RC؛ وآخرون (2010). "Genome sequences of the human body louse and its primary endosymbiont provide insights into the permanent parasitic lifestyle". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 107 ع. 27: 12168–12173. Bibcode:2010PNAS..10712168K. DOI:10.1073/pnas.1003379107. PMC:2901460. PMID:20566863.
↑  Werren؛ Richards، S؛ Desjardins، CA؛ Niehuis، O؛ Gadau، J؛ Colbourne، JK؛ Nasonia Genome Working، Group؛ Werren، JH؛ Richards، S؛ وآخرون (2010). "Functional and evolutionary insights from the genomes of three parasitoid Nasonia species". Science. ج. 327 ع. 5963: 343–348. Bibcode:2010Sci...327..343.. DOI:10.1126/science.1178028. PMC:2849982. PMID:20075255.
↑  Smith؛ Zimin، A.؛ Holt، C.؛ Abouheif، E.؛ Benton، R.؛ Cash، E.؛ Croset، V.؛ Currie، C. R.؛ Elhaik، E.؛ وآخرون (2011). "Draft genome of the globally widespread and invasive Argentine ant (Linepithema humile)". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 108 ع. 14: 5673–5678. Bibcode:2011PNAS..108.5673S. DOI:10.1073/pnas.1008617108. PMC:3078359. PMID:21282631.
↑  Smith؛ Smith، C. D.؛ Robertson، H. M.؛ Helmkampf، M.؛ Zimin، A.؛ Yandell، M.؛ Holt، C.؛ Hu، H.؛ Abouheif، E.؛ وآخرون (2011). "Draft genome of the red harvester ant Pogonomyrmex barbatus". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 108 ع. 14: 5667–5672. Bibcode:2011PNAS..108.5667S. DOI:10.1073/pnas.1007901108. PMC:3078412. PMID:21282651.
↑  Suen؛ Teiling، C؛ Li، L؛ Holt، C؛ Abouheif، E؛ Bornberg-Bauer، E؛ Bouffard، P؛ Caldera، EJ؛ Cash، E؛ وآخرون (2011). Copenhaver، Gregory (المحرر). "The genome sequence of the leaf-cutter ant Atta cephalotes reveals insights into its obligate symbiotic lifestyle". PLOS Genetics. ج. 7 ع. 2: e1002007. DOI:10.1371/journal.pgen.1002007. PMC:3037820. PMID:21347285.
بوابة علم الوراثة