اتفاقية كيبك
تعاون

اعتبر  أن هذا العرض الخاص بمشروع مشترك مهم بما يكفي لتسليم الرسالة شخصيًا من قبل فريدريك ل. أكد روزفلت على استعداده للتعاون، وأبلغه أن هوفدي قد ناقش الأمر مع السير جون أندرسون واللورد شيرويل، كما يُعرف فريدريك ليندمان الآن. نظرت لجنة مود في مسألة التعاون مع الولايات المتحدة، وخلصت إلى أنه بينما يمكن إنشاء مصانع تجريبية لفصل النظائر في المملكة المتحدة، يجب بناء مرافق إنتاج على نطاق كامل في الولايات المتحدة. أعرب البريطانيون عن مخاوفهم بشأن أمن المشروع الأمريكي. ومن المفارقات أن المشروع البريطاني هو الذي تم اختراقه بالفعل من قبل الجواسيس الذريين.  أعطى جون كيرنكروس الاتحاد السوفيتي نسخة من تقرير لجنة مود.  على الرغم من عدم نقلها إلى الأمريكيين، كان لدى البريطانيين مخاوف أخرى بشأن ما قد يحدث بعد الحرب إذا اعتنق الأمريكيون الانعزالية، كما حدث بعد الحرب العالمية الأولى، وكان على بريطانيا محاربة الاتحاد السوفيتي بمفردها.  وبالتالي ضاعت فرصة مشروع مشترك. استمر تبادل المعلومات البريطاني والأمريكي لكن برامجهما ظلت منفصلة.
أدى الهجوم الياباني على بيرل هاربور في 7 ديسمبر 1941 إلى دخول الولايات المتحدة الحرب.  أصبح التمويل الآن متاحًا بمبالغ غير متوقعة في العام السابق.  كان من المقرر أن تنتهي عقود OSRD في نهاية يونيو 1942، وكانت هناك منافسة شديدة في زمن الحرب على المواد الخام. تم الاتفاق على أنه في 1942-1943، سيمول جيش الولايات المتحدة 53 دولارًا مليون دولار من 85 مليون برنامج. في 18 يونيو 1942، صدر أمر للعقيد جيمس سي مارشال بتنظيم عنصر الجيش.   أسس مقره في الطابق الثامن عشر من 270 برودواي في مدينة نيويورك، مع الاسم غير الضار لمنطقة مانهاتن الهندسية، بعد الممارسة المعتادة لتسمية مناطق المهندسين بعد المدينة التي يقع فيها المقر الرئيسي. وسرعان ما تبنى المشروع اسم «مانهاتن» أيضًا.  بحلول سبتمبر 1942، شعر بوش وكونانت أن الوقت قد حان لتولي الجيش زمام الأمور، وهو أمر وافق عليه الرئيس بالفعل في 17 يونيو 1942، وأصبح العميد ليزلي ر. مشروع في 23 سبتمبر 1942.  حاول غروفز تشديد الأمن من خلال سياسة التقسيم الصارم المشابهة لتلك التي فرضها البريطانيون على الرادار.
سرعان ما تفوقت الجهود الأمريكية على البريطانيين. اندهش العلماء البريطانيون الذين زاروا الولايات المتحدة في عام 1942 من التقدم والزخم اللذين احظهما مشروع مانهاتن.  في 30 يوليو 1942، نصح أندرسون تشرشل بما يلي: «يجب أن نواجه حقيقة أن... عملنا الرائد... هو أصل متضائل وأنه ما لم نستفد منه بسرعة، فسوف يتم تجاوزنا. لدينا الآن مساهمة حقيقية في» الاندماج«. قريباً سيكون لدينا القليل أو لا شيء».   بوش وكونانت قررا بالفعل أن المساعدة البريطانية لم تعد ضرورية. اتفاقية التبادل العلمي غير المقيد بين الولايات المتحدة .
كانت مواقف البلدين على عكس ما كانت عليه في عام 1941.  كان المسؤولون الأمريكيون قلقين من أن أكيرز وأشخاص آخرين من ICI مشاركين في مشروع سبائك الأنبوب كانوا يحاولون استغلال المعرفة العلمية النووية الأمريكية لإنشاء وظيفة مربحة. صناعة الحرب.  شعر وزير الحرب، هنري إل ستيمسون، أنه نظرًا لأن الولايات المتحدة كانت تقوم بـ "تسعين بالمائة من العمل" على القنبلة، فسيكون من الأفضل لنا المضي قدمًا في الوقت الحاضر دون مشاركة أي شيء أكثر من يمكننا المساعدة ".  في ديسمبر 1942، وافق روزفلت على تقييد تدفق المعلومات لما يمكن أن تستخدمه بريطانيا أثناء الحرب، حتى لو أدى ذلك إلى إعاقة المشروع الأمريكي.  توقف الأمريكيون عن مشاركة أي معلومات عن إنتاج الماء الثقيل، وطريقة الفصل الكهرومغناطيسي، والخصائص الفيزيائية أو الكيميائية للبلوتونيوم، وتفاصيل تصميم القنبلة الذرية، أو الحقائق حول التفاعلات النيوترونية السريعة. وقد أثر ذلك سلبًا على عمل مختبر مونتريال، المشروع البريطاني والكندي المشترك الذي كان يبحث في تصميم المفاعل النووي. ردًا على ذلك، توقف البريطانيون عن إرسال العلماء إلى أمريكا، مما أدى إلى إبطاء وتيرة العمل هناك، والتي كانت تعتمد على العلماء البريطانيين. ثم توقف الأمريكيون عن تبادل المعلومات.
نظرت مديرية سبائك الأنبوب فيما إذا كان بإمكان بريطانيا إنتاج قنبلة دون مساعدة أمريكية. معمل انتشار غازي لإنتاج 1 قدرت تكلفة كيلوغرام من اليورانيوم المستخدم في صنع الأسلحة يوميًا بما يصل إلى 3 جنيهات إسترلينية مليون في البحث والتطوير وأي شيء يصل إلى 50 جنيهًا إسترلينيًا مليون لبناء في زمن الحرب في بريطانيا. مفاعل نووي لإنتاج 1 يجب بناء كيلوغرام من البلوتونيوم يوميًا في كندا. سيستغرق البناء ما يصل إلى خمس سنوات وتكلفته 5 جنيهات إسترلينية مليون. سيتطلب المشروع أيضًا مرافق لإنتاج الماء الثقيل المطلوب للمفاعل بتكلفة تتراوح بين 5 جنيهات إسترلينية مليون و10 جنيهات استرلينية مليون، ولإنتاج معدن اليورانيوم، والذي سيكلف 1.5 جنيه إسترليني أخرى مليون. سيحتاج المشروع إلى أولوية قصوى، حيث كان من المقدر أنه يتطلب 20.000 عامل، كثير منهم من ذوي المهارات العالية، و500.000 طن من الفولاذ، و500.000. كيلوواط من الكهرباء. سيكون تعطيل المشاريع الأخرى في زمن الحرب أمرًا لا مفر منه، ومن غير المرجح أن يكون جاهزًا في الوقت المناسب للتأثير على نتيجة الحرب في أوروبا. كان الرد بالإجماع أنه قبل الشروع في ذلك، يجب بذل جهد آخر للحصول على تعاون أمريكي.
بحلول مارس 1943، قرر بوش وكونانت أن المساعدة البريطانية ستفيد بعض مناطق مشروع مانهاتن. على وجه الخصوص، يمكن أن تستفيد بدرجة كافية من المساعدة من تشادويك وعالم أو اثنين من العلماء البريطانيين الآخرين لتبرير خطر الكشف عن أسرار تصميم السلاح.  أراد بوش وكونانت وغروفز من تشادويك وبيرلس مناقشة تصميم القنبلة مع روبرت أوبنهايمر، وأرادت شركة البناء Kellogg تعليقات بريطانية على تصميم مصنع الانتشار الغازي الذي كانت تقوم ببنائه.