الشبكة المنطقية
المصادر

↑  Naldi، A.؛ Monteiro، P. T.؛ Mussel، C.؛ Kestler، H. A.؛ Thieffry، D.؛ Xenarios، I.؛ Saez-Rodriguez، J.؛ Helikar، T.؛ Chaouiya، C. (25 يناير 2015). "Cooperative development of logical modelling standards and tools with CoLoMoTo". Bioinformatics. ج. 31 ع. 7: 1154–1159. DOI:10.1093/bioinformatics/btv013. PMID:25619997.
↑  Albert، Réka؛ Othmer، Hans G (يوليو 2003). "The topology of the regulatory interactions predicts the expression pattern of the segment polarity genes in Drosophila melanogaster". Journal of Theoretical Biology. ج. 223 ع. 1: 1–18. CiteSeerX:10.1.1.13.3370. DOI:10.1016/S0022-5193(03)00035-3. PMC:6388622. PMID:12782112.
↑  Li، J.؛ Bench، A. J.؛ Vassiliou، G. S.؛ Fourouclas، N.؛ Ferguson-Smith، A. C.؛ Green، A. R. (30 أبريل 2004). "Imprinting of the human L3MBTL gene, a polycomb family member located in a region of chromosome 20 deleted in human myeloid malignancies". Proceedings of the National Academy of Sciences. ج. 101 ع. 19: 7341–7346. Bibcode:2004PNAS..101.7341L. DOI:10.1073/pnas.0308195101. PMC:409920. PMID:15123827.
1 2  Drossel، Barbara (ديسمبر 2009). "Random Boolean Networks". في Schuster، Heinz Georg (المحرر). Chapter 3. Random Boolean Networks. Reviews of Nonlinear Dynamics and Complexity. Wiley. ص. 69–110. arXiv:0706.3351. DOI:10.1002/9783527626359.ch3. ISBN:9783527626359.
↑  Wolfram، Stephen (2002). A New Kind of Science. Champaign, Illinois: Wolfram Media, Inc. ص. 936. ISBN:978-1579550080. مؤرشف من الأصل في 2020-05-16. اطلع عليه بتاريخ 2018-03-15.
1 2  Kauffman، Stuart (11 أكتوبر 1969). "Homeostasis and Differentiation in Random Genetic Control Networks". Nature. ج. 224 ع. 5215: 177–178. Bibcode:1969Natur.224..177K. DOI:10.1038/224177a0. PMID:5343519.
↑  Aldana، Maximo؛ Coppersmith، Susan؛ Kadanoff، Leo P. (2003). Boolean Dynamics with Random Couplings. ص. 23–89. arXiv:nlin/0204062. DOI:10.1007/978-0-387-21789-5_2. ISBN:978-1-4684-9566-9. {{استشهاد بكتاب}}: |صحيفة= تُجوهل (مساعدة)
↑  Gershenson، Carlos (2004). "Introduction to Random Boolean Networks". In Bedau, M., P. Husbands, T. Hutton, S. Kumar, and H. Suzuki (eds.) Workshop and Tutorial Proceedings, Ninth International Conference on the Simulation and Synthesis of Living Systems (ALife IX). Pp. ج. 2004: 160–173. arXiv:nlin.AO/0408006. Bibcode:2004nlin......8006G.
↑  Wuensche، Andrew (2011). Exploring discrete dynamics : [the DDLab manual : tools for researching cellular automata, random Boolean and multivalue neworks [sic] and beyond]. Frome, England: Luniver Press. ص. 16. ISBN:9781905986316. مؤرشف من الأصل في 2020-05-17. اطلع عليه بتاريخ 2016-01-12.
↑  Greil، Florian (2012). "Boolean Networks as Modeling Framework". Frontiers in Plant Science. ج. 3: 178. DOI:10.3389/fpls.2012.00178. PMC:3419389. PMID:22912642.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
↑  Bastolla، U.؛ Parisi، G. (مايو 1998). "The modular structure of Kauffman networks". Physica D: Nonlinear Phenomena. ج. 115 ع. 3–4: 219–233. arXiv:cond-mat/9708214. Bibcode:1998PhyD..115..219B. DOI:10.1016/S0167-2789(97)00242-X.
↑  Bilke، Sven؛ Sjunnesson، Fredrik (ديسمبر 2001). "Stability of the Kauffman model". Physical Review E. ج. 65 ع. 1: 016129. arXiv:cond-mat/0107035. Bibcode:2002PhRvE..65a6129B. DOI:10.1103/PhysRevE.65.016129. PMID:11800758.
↑  Socolar، J.؛ Kauffman، S. (فبراير 2003). "Scaling in Ordered and Critical Random Boolean Networks". Physical Review Letters. ج. 90 ع. 6: 068702. arXiv:cond-mat/0212306. Bibcode:2003PhRvL..90f8702S. DOI:10.1103/PhysRevLett.90.068702. PMID:12633339.
↑  Samuelsson، Björn؛ Troein، Carl (مارس 2003). "Superpolynomial Growth in the Number of Attractors in Kauffman Networks". Physical Review Letters. ج. 90 ع. 9: 098701. Bibcode:2003PhRvL..90i8701S. DOI:10.1103/PhysRevLett.90.098701. PMID:12689263.
↑  Mihaljev، Tamara؛ Drossel، Barbara (أكتوبر 2006). "Scaling in a general class of critical random Boolean networks". Physical Review E. ج. 74 ع. 4: 046101. arXiv:cond-mat/0606612. Bibcode:2006PhRvE..74d6101M. DOI:10.1103/PhysRevE.74.046101. PMID:17155127.
↑  Kauffman، S. A. (1969). "Metabolic stability and epigenesis in randomly constructed genetic nets". Journal of Theoretical Biology. ج. 22 ع. 3: 437–467. DOI:10.1016/0022-5193(69)90015-0. PMID:5803332.
↑  Derrida، B؛ Pomeau، Y (15 يناير 1986). "Random Networks of Automata: A Simple Annealed Approximation". Europhysics Letters (EPL). ج. 1 ع. 2: 45–49. Bibcode:1986EL......1...45D. DOI:10.1209/0295-5075/1/2/001. مؤرشف من الأصل في 2020-05-17.
↑  Solé، Ricard V.؛ Luque، Bartolo (2 يناير 1995). "Phase transitions and antichaos in generalized Kauffman networks". Physics Letters A. ج. 196 ع. 5–6: 331–334. Bibcode:1995PhLA..196..331S. DOI:10.1016/0375-9601(94)00876-Q.
↑  Luque، Bartolo؛ Solé، Ricard V. (1 يناير 1997). "Phase transitions in random networks: Simple analytic determination of critical points". Physical Review E. ج. 55 ع. 1: 257–260. Bibcode:1997PhRvE..55..257L. DOI:10.1103/PhysRevE.55.257.
↑  Fox، Jeffrey J.؛ Hill، Colin C. (1 ديسمبر 2001). "From topology to dynamics in biochemical networks". Chaos: An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science. ج. 11 ع. 4: 809–815. Bibcode:2001Chaos..11..809F. DOI:10.1063/1.1414882. ISSN:1054-1500. PMID:12779520.
↑  Aldana، Maximino؛ Cluzel، Philippe (22 يوليو 2003). "A natural class of robust networks". Proceedings of the National Academy of Sciences. ج. 100 ع. 15: 8710–8714. Bibcode:2003PNAS..100.8710A. DOI:10.1073/pnas.1536783100. ISSN:0027-8424. PMC:166377. PMID:12853565.
↑  Pomerance، Andrew؛ Ott، Edward؛ Girvan، Michelle؛ Losert، Wolfgang (19 مايو 2009). "The effect of network topology on the stability of discrete state models of genetic control". Proceedings of the National Academy of Sciences. ج. 106 ع. 20: 8209–8214. arXiv:0901.4362. Bibcode:2009PNAS..106.8209P. DOI:10.1073/pnas.0900142106. ISSN:0027-8424. PMC:2688895. PMID:19416903.
↑  Aldana، Maximino (أكتوبر 2003). "Boolean dynamics of networks with scale-free topology". Physica D: Nonlinear Phenomena. ج. 185 ع. 1: 45–66. arXiv:cond-mat/0209571. Bibcode:2003PhyD..185...45A. DOI:10.1016/s0167-2789(03)00174-x.
↑  Drossel، Barbara؛ Greil، Florian (4 أغسطس 2009). "Critical Boolean networks with scale-free in-degree distribution". Physical Review E. ج. 80 ع. 2: 026102. arXiv:0901.0387. Bibcode:2009PhRvE..80b6102D. DOI:10.1103/PhysRevE.80.026102. PMID:19792195.
↑  Harvey، Imman؛ Bossomaier، Terry (1997). Husbands، Phil؛ Harvey، Imman (المحررون). Time out of joint: Attractors in asynchronous random Boolean networks. MIT Press. ص. 67–75. ISBN:9780262581578. مؤرشف من الأصل في 2020-05-16. {{استشهاد بكتاب}}: |صحيفة= تُجوهل (مساعدة)
↑  Gershenson، Carlos (2002). Standish، Russell K؛ Bedau، Mark A (المحررون). Classification of Random Boolean Networks. Artificial Life. Cambridge, Massachusetts, USA. ج. 8. ص. 1–8. arXiv:cs/0208001. Bibcode:2002cs........8001G. ISBN:9780262692816. مؤرشف من الأصل في 2020-05-17. اطلع عليه بتاريخ 2016-01-12. {{استشهاد بكتاب}}: |صحيفة= تُجوهل (مساعدة)صيانة الاستشهاد: مكان بدون ناشر (link)
↑  Gershenson، Carlos؛ Broekaert، Jan؛ Aerts، Diederik (14 سبتمبر 2003). Contextual Random Boolean Networks [7th European Conference, ECAL 2003]. Lecture Notes in Computer Science. Dortmund, Germany. ج. 2801. ص. 615–624. arXiv:nlin/0303021. DOI:10.1007/978-3-540-39432-7_66. ISBN:978-3-540-39432-7. {{استشهاد بكتاب}}: |صحيفة= تُجوهل (مساعدة)صيانة الاستشهاد: مكان بدون ناشر (link)
↑  Imani، M.؛ Braga-Neto، U. M. (1 يناير 2017). "Maximum-Likelihood Adaptive Filter for Partially Observed Boolean Dynamical Systems". IEEE Transactions on Signal Processing. ج. 65 ع. 2: 359–371. arXiv:1702.07269. Bibcode:2017ITSP...65..359I. DOI:10.1109/TSP.2016.2614798. ISSN:1053-587X.
↑  Imani, M.; Braga-Neto, U. M. (2015). "Optimal state estimation for boolean dynamical systems using a boolean Kalman smoother". 2015 IEEE Global Conference on Signal and Information Processing (GlobalSIP) (بالإنجليزية الأمريكية). pp. 972–976. DOI:10.1109/GlobalSIP.2015.7418342. ISBN:978-1-4799-7591-4.
↑  Imani, M.; Braga-Neto, U. M. (2016). 2016 American Control Conference (ACC) (بالإنجليزية الأمريكية). pp. 227–232. DOI:10.1109/ACC.2016.7524920. ISBN:978-1-4673-8682-1.
↑  Imani، M.؛ Braga-Neto، U. (1 ديسمبر 2016). Point-based value iteration for partially-observed Boolean dynamical systems with finite observation space. ص. 4208–4213. DOI:10.1109/CDC.2016.7798908. ISBN:978-1-5090-1837-6. {{استشهاد بكتاب}}: |صحيفة= تُجوهل (مساعدة)
↑  Hajiramezanali, E. & Imani, M. & Braga-Neto, U. & Qian, X. & Dougherty, E.. Scalable Optimal Bayesian Classification of Single-Cell Trajectories under Regulatory Model Uncertainty.  ACMBCB'18. https://dl.acm.org/citation.cfm?id=3233689 نسخة محفوظة 22 مارس 2021 على موقع واي باك مشين.
Dubrova, E., Teslenko, M., Martinelli, A., (2005). *Kauffman Networks: Analysis and Applications,  in "Proceedings of International Conference on Computer-Aided Design", pages 479-484.