stanford-oval/wikipedia huggingface dataset:
فيروس كورونا
علم الفيروسات > استجابة الخلية المضيفة > المناعة التكيفية

بعد إصابة المضيف، يمكنه تطوير مناعة تكيفية ضد فيروس كورونا عبر تنشيط خلايا تائية وخلايا بائية محددة. يمكن أن تستمر مناعة الأشخاص الأصحاء ضد فيروسات كورونا الأربعة (229E وOC43 وNL63 وHKU1) التي تسبب الزكام لنحو نصف عام إلى عام فقط، وبعد ذلك يمكن أن يصابوا بنفس الفيروس مرة أخرى. يتم إنتاج الأجسام المضادة ضد بروتين الشوكة الخاص بسارس-كوف في غضون ثلاثة أسابيع، وقد يكون الوقت اللازم لإنتاجها في سارس-كوف-2 أقصر. عيار الأجسام المضادة لمرضى السارس سوف يتغير بمرور الوقت، تتبعت بعض الدراسات المرضى في حدث السارس ووجدت أن استجابات الأجسام المضادة وخلايا البائية الذاكرة في المرضى انخفضت بشكل ملحوظ بعد عدة سنوات. في المقابل، يمكن أن يحافظ الجسم على خلايا التائية الذاكرة لفترة أطول. مع ذلك، قد تختلف مدة المناعة من شخص لآخر حيث وُجد أنه لا يزال بالإمكان اكتشاف الأجسام المضادة لدى بعض المرضى بعد إصابتهم بالسارس منذ أكثر من عشر سنوات. تختلف مدة بقاء الأجسام المضادة التي تنتجها الإصابة بفيروس ميرس-كوف تبعا لشدة الأعراض، فعيار الأجسام المضادة بعد سنتين من الإصابة أكبر بكثير لدى مرضى الحالات الحادة منه لدى مرضى الحالات المتوسطة.
يدوم مفعول التطعيم ضد فيروس التهاب الشعب الهوائية المعدي في الدجاج حوالي 9 أسابيع فقط وكان فعالا ضد بعض السلالات فقط . يشبه فيروس كورونا التنفسي الخنزيري (PRCV) إلى حد كبير فيروس التهاب المعدة والأمعاء الساري الخنزيري، ويمكن للخنازير المصابة به اكتساب مناعة ضده فقط وليس لكليهما، لكن المناعة المخاطية ضده (الغلوبولين المناعي أ) تضعف بمرور الوقت، الأبقار المصابة بفيروس كورونا البقري تضعف مناعتها بمرور الوقت كذلك. تؤدي الاستجابة المناعية الناتجة عن الإصابة بسلالة JHM من فيروس التهاب الكبد الفأري إلى إزالة الميالين من الخلايا العصبية في الدماغ مع القضاء على الفيروس.
علم الفيروسات > استجابة الخلية المضيفة > آليات مقاومة الفيروس للمناعة

تمتلك فيروسات كورونا مجموعة متنوعة من الآليات لمجابهة الاستجابة المناعية للخلايا المضيفة. فضلا عن وظائفها البنيوية أو التحفيزية، تملك العديد من بروتينات فيروس كورونا وظائف تهرب ومقاومة للاستجابة المناعية. ومقارنة بفيروسات الرنا الأخرى لا يسبب فيروس كورونا قدرا كبيرا من التعبير عن الإنترفيرونات من النوع الأول، مما يوحي بأن لديه آليات لمنع التعبير عنها. يملك البروتين اللابنيوي 3 (بروتياز PLpro) الخاص بفيروسات: سارس-كوف، ميرس-كوف، IBV، كورونا الفأري، NL63 البشري -زيادة على وظيفة القص الذاتي- وظيفة إزالة اليوبيكويتين من بروتينات المضيف، ويملك نفس البروتين في سارس-كوف وميرس-كوف وظيفة إضافية هي إزالة وسم ISG15 من بروتينات المضيف. ولكون إضافة كلٍّ من اليوبيكويتين وISG15 تلعب دورا مهما في مسارات التأشير الخاصة بالاستجابة المناعية الخلوية، فإن إزالة هذه الوسوم تثبط الاستجابة المناعية وتخفض من التعبير عن الإنترفيرونات وهي الطريقة التي يقاوم بها البروتين اللابنيوي 3 الاستجابة المناعية، فضلا عن آليات المقاومة بالقص هذه يملك نفس البروتين في سارس-كوف آلية لتثبيط تخليق الإنترفيرون 1 مستقلة عن القص بالبروتياز. يمكن لكل من البروتين اللابنيوي 3 والبروتين اللابنيوي1 وORF3b وبروتين القفيصة النووية في سارس-كوف أن يثبطوا تنشيط مسار RIG-I لمنع الرنا الفيروسي مزدوج السلسلة من إثارة استجابة مناعية، ويمكن لـORF6 أن يثبط تنشيط مسار JAK/STAT بحيث تثبط كلا الآليتين تخليق الإنترفيرون 1. يمنع البروتين اللابنيوي 1 الكثير من جزيئات الرنا الرسول الخاصة بالمضيف -ومن بينها الرنا الرسول الخاص بالإنترفيرونات- من الترجمة ويسبب تفككها، أما الرنا الرسول الخاص بالفيروس في حد ذاته فهو لا يتأثر بوظيفة البروتين اللابنيوي 1 بفضل تسلسل خاص في المنطقة غير المترجمة 5'.
فضلا عن تنشيط RIG-I، يمكن للرنا الفيروسي مزدوج السلسلة أن ينشط 2'-5' مخلقة قليل الأدينيلات لتخليق 2'-5' قليل الأدينيلات وبعدها تنشيط الريبونوكلياز L، وفي سبيل مقاومة هذه الاستجابة يقوم البروتين اللابنيوي 4B‏ (ns4b) في ميرس-كوف والبروتين اللابنيوي 2 في فيروس التهاب الكبد الفأري بتفكيك 2'-5' قليل الأدينيلات لمنعه من تنشيط الريبونوكلياز L وبالتالي منع الرنا الفيروسي من التفكك. يمكن لبروتين الغلاف في سارس-كوف أن يثبط مسار ERN1 الذي يُحفز بواسطة استجابة إجهاد الشبكة الإندوبلازمية وبالتالي يمنع الاستماتة وتخليق السيتوكينات. وربما هذه الآلية قد تكون مرتبطة بوظيفة بروتينات الغلاف في تشكيل فيروبورينات (قنوات آيونية). يقوم بروتين القفيصة النووية بتكوين تكثفات مع الرنا ويستخدم بروتين لب حبيبة إجهاد G3BP1 وبالتالي يحرم الخلية من استخدامه في تكوين حبيبات الإجهاد ويمنع الاستجابات المناعية الفطرية المعتمدة على G3BP1.
التصنيف

فيروسات كورونا هي عائلة فرعية تنتمي إلى عائلة الفيروسات التاجية، التي تنتمي إلى الرتبة الفرعية «كورنيدوفرينيات» (Cornidovirineae) التي تنتمي إلى رتبة الفيروسات العشية. تنقسم عائلة الفيروسات التاجية إلى ثلاث فروع: الكورونافيرينات المستقيمة (Orthocoronavirinae) والتي تعرف بالاسم الشهير فيروسات كورونا،  الليتوفيرينات، والعائلة الفرعية الجديدة البيتوفيرينات (Pitovirinae). تنقسم عائلة فيروسات كورونا الفرعية إلى أربع أجناس (فيروس كورونا ألفا، فيروس كورونا بيتا، فيروس كورونا غاما، فيروس كورونا دلتا) وتصيب أجناس ألفا وبيتا الثدييات فقط، أما غاما ودلتا فيصيب معظمها الطيور بشكل رئيسي مع أنواع قليلة تصيب الثدييات. ينتمي فيروسا سارس-كوف وسارس-كوف-2 إلى نوع الفيروسات المرتبطة بالسارس التي تنتمي إلى الجنس الفرعي الفيروسات الساربيكوية التي تنتمي إلى جنس فيروسات بيتا. يعتمد تصنيف فيروسات كورونا على سبع تسلسلات محفوظة في جين ORF1ab فإذا كانت تسلسلات الأحماض الأمينية الناتجة من هذه التسلسلات السبع متماثلة بين سلالتين من الفيروس بنسبة تزيد عن 90% تعتبر السلالتين من نفس النوع.
التصنيف > فيروس كورونا ألفا

النوع النموذجي لفيروس كورونا ألفا هو فيروس كورونا ألفا 1 (ألفا-كوف-1)، الذي ينقسم إلى 14 جنسا فرعيا منها: فيروس كورونا ألفا 1 (فيروس كورونا الكلبي، فيروس كورونا القططي، فيروس التهاب المعدة والأمعاء الساري الخنزيري)، فيروس كورونا ألفا 2 (فيروس كورونا ابن مقرض، فيروس كورونا المنك)، فيروس كورونا الألبكة، فيروس كورونا البشري 229E، فيروس كورونا البشري NL63، فيروس كورونا خفاش الحذوة الكبير HuB-2013 ‏(BtRf-AlphaCoV/HuB2013)، فيروس كورونا الخفاش محني الجناح نوع 1 (Bat-CoV MOP1)، فيروس كورونا الخفاش محني الجناح HKU8 ‏(Bat-CoV HKU8)، فيروس كورونا خفاش مايوتيس ريكيتي Sax-2011 ‏(BtMr-SAX2011)، فيروس كورنا الخفاشي CDPHE15 ‏(BtCoV CDPHE15)، فيروس كورنا الخفاشي 3398 (PK-BatCoV 3398)، فيروس كورونا خفاش نيكتالوس فيلتينوس SC-2013 ‏(BtNv-SC2013)، فيروس كورونا زبابات T14 ‏(Sa-CoV T14)، فيروس كورونا خفاش إلف الظلام 512 (Bat-CoV 512)، فيروس الإسهال الوبائي الخنزيري (PEDV)، فيروسات خفاش الأقحوان مثل فيروس كورونا خفاش حدوة الفرس الصيني HKU2 ‏(Bat-CoV HKU2)، فيروس كورونا متلازمة الإسهال الحاد الخنزيري (SADS-CoV)، فيروس كورونا زبابة ونتشنغ (WESV) وفيروس كورونا الجرذ البني لوتشنغ (LRNV).
فيما يلي الشجرة التطورية لكل مجموعة رئيسية من فيروس كورونا ألفا (راجع أمبر بابينو وزملائها، تشيتشيانغ وو وزملائه):
التصنيف > فيروس كورونا بيتا

النوع النموذجي لجنس فيروس كورونا بيتا هو فيروس كورونا الفأري (م-كوف) الذي ينقسم إلى 5 أجناس فرعية منها: فيروس كورونا بيتا 1 (فيروس كورونا البشري OC43، فيروس كورونا البقري، فيروس كورونا الخيلي، فيروس التهاب الدماغ والنخاع الشوكي الراصي الخنزيري)، فيروس كورونا الأرنبي HKU14 ‏(RbCoV HKU14)، فيروس كورونا الجرذ الصيني HKU24 ‏(ChRCoV HKU24)، فيروس كورونا البشري HKU1، فيروس كورونا الفأري، فيروس كورونا ميودس 2JL14 ‏(MrufCoV 2JL14)، فيروس كورونا خفاش أيدولون C704 ‏(Ei-BatCoV C704)، فيروس كورونا خفاش بيبيسترالوس HKU5 ‏(Bat-CoV HKU5)، فيروس كورونا خفاش راوستوس HKU9 ‏(HKU9-1)، فيروس كورونا خفاش راوستوس GCCDC1 ‏(Ro-BatCoV GCCDC1)، فيروس كورونا خفاش تيلونيكترايس HKU4 ‏(Bat-CoV HKU4)، فيروس كورونا المرتبط بمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية (ميرس-كوف)، فيروس كورونا القنفذ البري (EriCoV)، فيروس كورونا خفاش زاريا (ZBCoV)، فيروس كورونا خفاش برات مستدير الورق جيجيانغ2013 (BtHp- BetaCoV/ZJ2013)، وفيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة (سارس-كوف، سارس-كوف-2 والسلالات المرتبطة) والعديد من الفيروسات الأخرى.
فيما يلي الشجرة التطورية للمجموعات الرئيسية من فيروس كورونا بيتا (راجع أمبر بابينو وزملائها ، تشيتشيانغ وو وزملائه):
التصنيف > فيروس كورونا غاما

النوع النموذجي لجنس فيروس كورونا غاما هو فيروس كورونا الطيري (AvCoV) وينقسم إلى ثلاثة أجناس فرعية منها: فيروس كورونا الحوتي، فيروس كورونا الطيري، فيروس كورونا الطيري 9203 (AvCoV 9203)، فيروس كورونا الإوزي CB17 ‏(BcanCoV CB17)، فيروس كورونا البطي 2714 (DuCoV 2714)، وفيروسات أخرى.
فيما يلي الشجرة التطورية للمجموعات الرئيسية من فيروس كورونا غاما (راجع أمبر بابينو وزملائها ، ميشال ويلي وزملائها):
التصنيف > فيروس كورونا دلتا

النوع النموذجي لجنس فيروس كورونا دلتا هو فيروس كورونا البلبلي HKU11 ‏(Bulbul-CoV HKU11) وينقسم إلى ثلاث أجناس فرعية منها: فيروس كورونا ودجون HKU20 ‏(WiCoV HKU20)، فيروس كورونا البلبلي HKU11، فيروس كورونا الخنزيري HKU15 ‏(PorCoV HKU15)، فيروس كورونا دجاج الماء الشائع HKU21 ‏(CMCoV HKU21)، فيروس كورونا مونيا HKU13 ‏(MuCoV HKU13)، فيروس كورونا أبيض العين HKU16 ‏(WeCoV HKU16) فيروس كورونا العقعق روبن HKU18 ‏(MRCoV HKU18)، فيروس كورونا بلشون الليل HKU19 ‏(NHCoV HKU19)، فيروس كورونا الصقري HKU27 ‏(FalCoV UAE-HKU27)، فيروس كورونا الحبارى الإفريقي HKU28 ‏ (HouCoV UAE-HKU28)، فيروس كورونا الحمام HKU29 ‏ (PiCoV UAE-HKU29)، فيروس كورونا السمان HKU30 ‏(QuaCoV-HKU30) وفيروسات أخرى.
فيما يلي الشجرة التطورية للمجموعات الرئيسية من فيروس كورونا دلتا (راجع أمبر بابينو وزملائها، وميشال ويلي وزملائها):
التطور

تستخدم بعض الدراسات بوليميراز الرنا المعتمد على الرنا كساعة جزيئية وتقدر أن أحدث سلف مشترك لجميع فيروسات كورونا برز إلى الوجود بين 8000-10000 سنة قبل الميلاد، وأن أحدث سلف مشترك لفيروسات كورونا ألفا يعود إلى 2400 سنة قبل الميلاد ولفيروسات بيتا إلى سنة 3300 سنة قبل الميلاد ولفيروسات غاما إلى 2800 سنة قبل الميلاد ولفيروسات دلتا إلى 3000 سنة قبل الميلاد. لكن بعض العلماء يعتقدون أن هذه الدراسات تبالغ في تقدير معدل التطفر لفيروسات كورونا وتتجاهل تأثير اصطفاء التنقية ويقترحون نموذجا يزعم أن أحدث سلف مشترك لفيروسات كورونا ظهر منذ 55 مليون سنة وخضع إلى تطور مشترك طويل الأمد في الخفافيش والطيور. الخفافيش والطيور مستودع طبيعي مثالي لجينات فيروس كورونا لكونها فقاريات طائرة من ذوات الدم الحار (مع كون الخفافيش مستودعا لفيروسات ألفا وبيتا، والطيور مستودعا لفيروسات غاما ودلتا). مكّن العدد الكبير لأنواع الخفافيش والطيور التي تستضيف الفيروسات والنطاق العالمي لانتشارها من تطور كثيف وانتشار كبير لفيروسات كورونا.
يرجع أصل العديد من فيروسات كورونا البشرية إلى الخفافيش. اشترك فيروس كورونا البشري NL63 في سلف مشترك مع فيروس كورونا الخفاشي(ARCoV.2) بين 1190-1449 م. وتشارك فيروس كورونا البشري 229E مع فيروس كورنا الخفاشي (GhanaGrp1 Bt CoV) في سلف مشترك بين 1686-1800 م. حديثا، تشعب فيروس كورونا الألبكة عن فيروس 229E في وقت ما قبل عام 1960. انتقل ميرس-كوف إلى البشر من الخفافيش عبر الجمال كمضيف وسيط. ومع أن ميرس-كوف له صلة بالعديد من فيروسات كورونا، يبدو أنه تشعب عن هذه الأخيرة منذ عدة قرون. تشعب سارس-كوف عن أقرب فيروسات كورنا الخفاشية صلة به سنة 1986. أصاب أسلاف سارس-كوف أول مرة خفاش الأنف الورقي من عائلة الهيبوسيدرديات ثم انتشرت إلى خفاش حدوة الفرس في عائلة خفاشيات حدوة الفرس، ثم إلى زباد النخيل الآسيوي وأخيرا إلى البشر.
خلافا لغيره من فيروسات كورونا بيتا، يرجع أصل فيروس كورونا البقري الذي ينحدر من النوع فيروس كورونا بيتا 1 والجنس الفرعي فيروس أمبيكو إلى القوارض وليس إلى الخفافيش. في عقد 1790 تشعب فيروس كورونا الخيلي عن فيروس كورونا البقري بعد انتقال عبر الأنواع. ولاحقا في العقد 1890 تشعب فيروس كورونا البشري OC43 عن فيروس كورونا البقري بعد حادثة انتقال أخرى عبر الأنواع. افتُرض أن جائحة الإنفلونزا 1890 قد يكون سببها حادثة انتقال عبر الأنواع، وليس فيروس الإنفلونزا بسبب توقيت حدوثها، الأعراض العصبية والمسبب غير المعروف للجائحة. فضلا عن التسبب في عداوى تنفسية، اشتُبه أن فيروس كورونا البشري OC43 لعب دورا في الأمراض العصبية. في عقد 1950 بدا فيروس OC43 في التشعب إلى أنماطه الجينية الحالية. في علم تطور السلالات، فيروس التهاب الكبد الفأري الذي يصيب كبد الفأر والجهاز العصبي المركزي، له صلة بفيروس كورونا البشري OC43 وفيروس كورونا البقري. فيرروس كورونا البشري HKU1 -كغيره من الفيروسات المذكورة سابقا- له أصول ترجع إلى القوارض كذلك.
إصابة البشر

|  | ميرس-كوف | سارس-كوف | سارس-كوف-2 |
| --- | --- | --- | --- |
| المرض | ميرس | سارس | كوفيد 19 |
| التفشيات | 2012، 2015،  2018 | 2002-2004 | جائحة 2019-2021 |
الوبائيات: الوبائيات
| تاريخ أول  حالة محددة | يونيو 2012 | نوفمبر 2002 | ديسمبر 2019 |
| مكان أول  حالة محددة | جدة، السعودية | غوانغدونغ،  الصين | ووهان، الصين |
| متوسط العمر | 56 | 44 | 56 |
| نسبة الجنس (ذ:إ) | 3.3:1 | 0.8:1 | 1.6:1 |
| الحالات المؤكدة | 2494 | 8096 | 668٬843٬945  |
| الوفيات | 858 | 774 | 6٬739٬355  |
| نسبة الحالات المتوفية | 37% | 9.2% | 1٫01%  |
الأعراض: الأعراض
| الحمى | 98% | 99–100% | 87.9% |
| السعال الجاف | 47% | 29–75% | 67.7% |
| ضيق النفس | 72% | 40–42% | 18.6% |
| الإسهال | 26% | 20–25% | 3.7% |
| التهاب الحلق | 21% | 13–25% | 13.9% |
| استخدام التنفس الاصطناعي | 24.5% | 14–20% | 4.1% |
ملاحظات  ↑  استنادا لبيانات من هونغ كونغ.  1 2   البيانات محدثة بتاريخ 22 يناير 2023. ع ن : ملاحظات  ↑  استنادا لبيانات من هونغ كونغ.  1 2   البيانات محدثة بتاريخ 22 يناير 2023. ع ن 
تختلف فيروسات كورونا اختلافا ملحوظا في عامل الخطر حيث يمكن لبعضها أن يقتل أكثر من 30٪ من المصابين مثل ميرس-كوف، والبعض الآخر غير ضار نسبيا ويسبب زكاما خفيفا. يمكن أن تسبب فيروسات كورونا زكاما مصحوبا بأعراض حادة مثل: مثل الحمى والتهاب الحلق بسبب الزوائد الأنفية المنتفخة. يمكن أن تسبب فيروسات كورونا ذات الرئة (إما ذات الرئة الفيروسي المباشر أو ذات رئة بكتيري ثانوي) والتهاب القصبات (إما التهاب قصبات فيروسي مباشر أو التهاب قصبات بكتيري ثانوي). فيروس كورونا البشري المكتشف عام 2003 -سارس-كوف- الذي يسبب متلازمة تنفسية حادة وخيمة (سارس) ، له إمراضية فريدة لأنه يسبب التهابات الجهاز التنفسي العلوي والسفلي.
توجد ستة أنواع معروفة من فيروسات كورونا البشرية، وينقسم نوع واحد إلى سلالتين مختلفتين، ما يجعل العدد الكلي سبع سلالات يمكنها إصابة البشر. أربع سلالات من بين هذه السلالات السبع تتسبب في أعراض خفيفة عموما، ورغم تكيف البشر معها، ربما كانت هذه الفيروسات أكثر حدة في الماضي:
فيروس كورونا البشري OC43 ‏(HCoV-OC43).
فيروس كورونا البشري HKU1 ‏(HCoV-HKU1).
فيروس كورونا البشري 229E ‏(HCoV-229E).
فيروس كورونا البشري NL63 ‏(HCoV-NL63).
ثلاث فيروسات كورونا يمكن أن تسبب أعراضا حادة:
فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 1 (سارس-كوف) ويسبب المتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة (سارس).
فيروس كورونا المرتبط بمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية (ميرس-كوف) ويسبب متلازمة الشرق الأوسط التنفسية (ميرس).
فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 2 (سارس-كوف-2) ويسبب مرض فيروس كورونا 2019 (كوفيد 19).
إصابة البشر > الزكام

يمكن أن تتسبب فيروسات كورونا البشرية (229E ،OC43 ،NL63 ،HKU1) في الإصابة بالزكام، وتنتشر هذه الفيروسات الأربعة على نطاق واسع بين السكان، وتتسبب في ظهور أعراض خفيفة. تشير الإحصائيات إلى أن 15٪ من حالات الزكام تسببها هذه الفيروسات الأربعة (وتشير بيانات أخرى إلى 20٪-30٪ ) في حين أن 50% من الحالات يسببها الفيروس الأنفي. في المناطق ذات المناخ المعتدل، تحدث الإصابة بهذه الفيروسات غالبا في فصل الشتاء، ولا يوجد فرق كبير في أوقات الإصابة في مناطق المناخ المداري. قد تتنافس فيروسات كورونا الأربعة مع بعضها البعض ويكون انتشارها بين السكان دوريا. مع أن فيروسات كورونا هذه تسبب الزكام فقط، فقد افتُرض أنها ربما تسببت في أوبئة حادة عندما ظهرت لأول مرة منذ قرون أو عقود مضت، ثم تطورت بمرور الوقت وتأقلم عليها البشر وأصبحت هذه السلالات أقل إمراضا. مثل فيروس كورونا البشري OC43 وفيروس كورونا البقري اللذان تشعبا عن النوع فيروس كورونا بيتا 1 في العقد 1890، حيث انتقل الفيروس البقري عبر الأنواع واكتسب القدرة على إصابة البشر،  وعلى هذا الأساس افترض بعض العلماء أن جائحة الإنفلونزا (1889–1890) قد يكون سببها فيروس OC43 الناتج من هذا الانتقال عبر الأنواع وليس فيروس الأنفلونزا.
إصابة البشر > المتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة (سارس)

في نهاية عام 2002 ظهرت ذات رئة غير نموذجية في مقاطعة غوانغدونغ بالصين، وتطورت لاحقا إلى تفشي السارس 2002-2004 الذي استمر حوالي عام تقريبا. انتشر الوباء إلى 29 دولة وأصاب أزيد من 8000 شخص توفي منهم 774 فردا. في مارس 2003 سمت منظمة الصحة العالمية بشكل رسمي المرض باسم السارس، ووجد العديد من العلماء أن الوباء سببه أحد فيروس كورونا وكان أول فيروس كورونا يسبب مرضا خطيرا. أرجع العلماء مصدر الفيروس المباشر إلى زباد النخل الذي بيع في الأسواق، وكان تماثل التسلسل بين فيروس سارس-كوف زباد النخل وفيروس السارس البشري 99.8%، لكن المستودع الطبيعي لهذا الفيروس يُفترض أن يكون أحد الخفافيش مثل: خفاش حدوة الحصان الصيني الأصهب أو خفاش الحذوة الكبير. فترة حضانة فيروس السارس حوالي 4 إلى 6 أيام وبعدها تظهر أعراض مماثلة للإنفلونزا والالتهاب الرئوي. في الحالات الحادة يمكن أن يعاني المرضى من صعوبات في التنفس وقد يتطور الأمر إلى متلازمة الضائقة التنفسية الحادة (ARDS). تصبح أعراض الإصابة أكثر حدة بعد أن يبدأ جهاز المناعة في محاربة الفيروس حيث تبين أن بعض الأعراض يسببها فرط الاستجابة المناعية الخاصة بالمريض. بعض مرضى السارس مازالوا يعانون من العديد من المضاعفات مثل: التليف الرئوي، هشاشة العظام والنخر اللاوعائي بعد الشفاء، وتطور لدى مرضى آخرين اضطراب الكرب التالي للصدمة النفسية أو اضطراب مزاجي.
إصابة البشر > متلازمة الشرق الأوسط التنفسية (ميرس)

في 2012 ظهر فيروس كورونا جديد سُمي لاحقا بفيروس كورونا متلازمة الشرق الأوسط التنفسية (ميرس-كوف)، حيث تم عزله من رئة مريض مصاب بأعراض تنفسية حادة في المملكة العربية السعودية. ويُعتقد أنه انتقل إلى البشر من الجمال، حيث وجدت دراسة أن فيروس كورونا الذي أصاب الجمال العربية البالغة وصغارها مطابق بنسبة 99.9% لجينومات ميرس-كوف البشرية. أما أصل هذا الفيروس ومستودعه الطبيعي فيُعتقد أنه يرجع إلى الخفافيش، وأن له صلة وثيقة بفيروس كورونا خفاش تيلونيكترايس HKU4 وفيروس كورونا خفاش بيبيسترالوس HKU5. اعتبارا من يناير 2021، أُبلغ عن 2500 حالة منها 45 حالة في 2020. وتوفي حوالي 35% من الأفراد الذين أصيبوا بالفيروس. وفضلا عن التفشي الأول عام 2012 حدثت تفشيات أخرى أحدها في كوريا الجنوبية عام 2015 وآخر في السعودية عام 2018. فترة حضانة فيروس ميرس حوالي 5.5 يوم، ويسبب أعراضا منها الحمى، السعال، الإسهال وضيق التنفس. بعض المرضى لا تظهر عليهم الأعراض، والحالات الخطيرة يمكن أن تسبب ذات رئة وخيمة ومتلازمة الضائقة التنفسية الحادة. الفيروس معدي نسبيا، وفي الغالب يصيب الأفراد الذين هم في اتصال مباشر مع المرضى، ولا ينتقل غالبا خارج المستشفى.
إصابة البشر > مرض فيروس كورونا 2019 (كوفيد 19)

في ديسمبر 2019، حدث تفشي التهاب رئوي جديد في مدينة ووهان بمقاطعة خوبي بالصين. ووجد العلماء في 31 ديسمبر أن التفشي سببه سلالة جديدة من فيروسات كورونا، والتي سميت لاحقا سارس-كوف-2 بواسطة اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات. يملك سارس-كوف-2 تماثل تسلسل قدره 79% مع سارس-كوف. ويُعتقد أن الخفافيش هي المستودع الطبيعي الأرجح له، حيث يملك فيروس كورونا الخفافيش RaTG13 تسلسلا متماثلا بنسبة 96.1% والفيروس الجديد المكتشف في اللاوس BANAL-52 نسبة 96.8%، توحي نسبة التماثل بين هذه الفيروسات الخفاشية وسارس-كوف-2 بأن البشر قد أصيبوا بالفيروس عبر مضيف وسيط، لكن بقي هذا الوسيط وهو المصدر المباشر لإصابة البشر غير معروف.
اعتبارا من 22 يناير 2023 يوجد على الأقل 6٬739٬355  حالة وفاة مؤكدة وأزيد من 668٬843٬945  إصابة مؤكدة بسبب جائحة كوفيد 19، التي كان لها تأثير كبير على المجتمع والإقتصاد العالمي وسببت أسوء ركود اقتصادي منذ الكساد الكبير في عقد 1930. أعراض كوفيد 19 متنوعة وتختلف من فرد لآخر، ومدة حضانة فيروس سارس-كوف-2 تتراوح بين 1 إلى 14 يوما. على الأقل ثلث الأفراد المصابين لا تظهر عليهم الأعراض، لكن بإمكانهم نقل الفيروس، معظم أعراض كوفيد 19 خفيفة أو متوسطة ومن بينها: الحمى، السعال، الإعياء، فقدان الشم المؤقت وذات الرئة الخفيفة. تعاني نسبة صغيرة من المرضى من أعراض حادة منها: ضيق التنفس ونقص التأكسج، أما الحالات الخطرة فقد تعاني من فشل تنفسي، صدمة وفشل الأعضاء المتعدد. بعض المرضى تبقى لديهم أعضاء متضررة بعد الشفاء تفشل في التعافي التام، ويعانون من مضاعفات ما بعد الإصابة لأمد طويل.
إصابة الحيوانات

عُرِف أن فيروسات كورونا تسبب حالات مرضية في الطب البيطري منذ ثلاثينيات القرن الماضي، وهي تصيب مجموعة متنوعة من الحيوانات منها: الخنازير والأبقار والخيول والجمال والقطط والكلاب والقوارض والطيور والخفافيش. تصيب معظم فيروسات كورونا المرتبطة بالحيوانات السبيل الهضمي بواسطة الطريق الفموي الشرجي. تم تركيز جهود بحثية معتبرة لمعرفة الإمراضية الفيروسية الخاصة بفيروسات كورونا الحيوانية هذه، وخاصة من قبل علماء الفيروسات المهتمين بالأمراض البيطرية والحيوانية.
إصابة الحيوانات > الدواجن والماشية

يمكن لفيروسات كورونا أن تصيب أنواعا مختلفة من الدواجن والماشية. فيروس التهاب الشعب الهوائية المعدي (IBV) هو فيروس كورونا غاما يصيب الدواجن عبر الهباء الجوي أو الطريق الفموي الشرجي، ويسبب التهابا شعبيا معديا ويصيب الجهاز البولي التناسلي فضلا عن السبيل التنفسي. يملك فيروس التهاب الشعب المعدي معدل نفوق مرتفع، وانتشارا سريعا، ويؤثر على إنتاج البيض ويسبب خسائر اقتصادية كبيرة، وتوجد العديد من اللقاحات للوقاية منه. بعض السلالات الشبيهة بـIBV يمكنها أن تصيب الدجاج الرومي وتسبب التهاب الأمعاء منها فيروس كورونا الدجاج الرومي (TCV). يُصنف فيروس التهاب الشعب المعدي إلى جانب مختلف سلالات الدجاج الرومي وبعض الفيروسات التي تصيب الطيور البرية إلى نوعين: فيروس كورونا الطيري، وفيروس كورونا الطيري 9203 تحت جنس فيروسات كورونا غاما.
تصاب الماشية مثل الخنازير والأبقار والأحصنة بفيروسات كورونا كذلك. من بين فيروسات كورونا التي تصيب الخنازير: فيروس الإسهال الوبائي الخنزيري (PEDV)، فيروس التهاب المعدة والأمعاء الساري الخنزيري (TGEV)، فيروس كورونا دلتا الخنزيري (PdCV)، فيروس التهاب الدماغ والنخاع الشوكي الراصي الخنزيري (PHEV) وفيروس كورونا متلازمة الإسهال الحاد الخنزيري (SADS-CoV). باستثناء PHEV الذي يصيب النسيج العصبي كذلك، تصيب فيروسات كورونا الخنزيرية الجهاز الهضمي وتسبب القيء والإسهال وأعراضا أخرى. فيروسا TGEV وPHEV متنشران بين الخنازير لأزيد من 10 سنوات أما SADS-CoV وPdCV فهما فيروسان حديثا النشأة، ورغم أن PEDV متواجد منذ 1970 إلا أن سلالة شديدة الإمراض ظهرت في 2010 وسببت خسائر ملحوظة في تربية الخنازير في بلدان مختلفة. من بين الفيروسات الناشئة، تسلسل SADS-CoV مماثل جدا لفيروس كورونا خفاش حدوة الفرس الصيني HKU2، وتسلسل PEDV مماثل لفيروس كورونا خفاش إلف الظلام 512 وقد يرجع أصلهما إلى انتقال عبر الأنواع من الخفافيش. ربما يرجع أصل PdCV إلى فيروسات كورونا الطيرية فتسلسله متماثل جدا مع فيروس كورونا الدوري HKU17 وفيروس كورونا السمان HKU30 ويُفترض أنهما ينتميان إلى نفس النوع.
فيروس كورونا البقري الذي يصيب الأبقار قريب الصلة بفيروس كورونا البشري OC43، ويسبب أعراضا مثل الإسهال لدى العجول. يسبب فيروس كورونا الفرسي الذي يصيب الخيول الإسهال كذلك، ونادرا ما يكون قاتلا.
إصابة الحيوانات > الحيوانات الأليفة

تصاب الحيوانات الأليفة مثل: القطط والكلاب وابن مقرض بفيروسات كورونا كذلك. ينتمي فيروس كورونا السنوري إلى فيروسات ألفا ويمكن أن يُقسم إلى نوعين: فيروس كورونا القططي المعوي (FECV) الذي يصيب الأمعاء ويسبب أعراضا خفيفة، وفيروس التهاب البريتون المعدي السنوري (FIPV) الذي يمكن أن يسبب التهاب البريتون المعدي السنوري الحاد. ينتقل FECV عبر الطريق الشرجي الفموي ويمكن أن يتطفر إلى FIPV بعد الإصابة، ثم ينتقل لإصابة مختلف أعضاء القطط. معدل النفوق بالتهاب البريتون المعدي السنوري مرتفع وعادة ما تموت القطط خلال عام واحد من ظهور الأعراض.
معروف بأن اثنين من فيروسات كورونا تصيب الكلاب: فيروس كورونا الكلبي (CCoV) وفيروس كورونا التنفسي الكلبي (CRCoV). الأول من فيروسات كورونا ألفا ويسبب أعراضا معدية معوية خفيفة، أما الثاني فهو من فيروسات كورونا بيتا ويصيب الجهاز التنفسي وهو أحد الممرضات التي تسبب سعال الكلاب. يوجد كذلك نوعان من فيرووسات كورونا التي تصيب ابن مقرض: فيروس كورونا ابن مقرض ويسبب التهاب الأمعاء، وفيروس كورونا جهازي ابن مقرضي (FSC) وهو أشد خطرا ويسبب مرض جهازي مماثل لالتهاب البريتون المعدي السنوري.
إصابة الحيوانات > الحيوانات المختبرية

يمكن لفيروسات كورونا أن تصيب العديد من الحيوانات المستخدمة في المختبرات. فيروس التهاب الكبد الفأري (MHV) كان أكثر فيروس كورونا تمت دراسته حيويا ومخبريا وعلى المستوى الجزيئي قبل اكتشاف سارس-كوف، ويصيب صغار فئران التجارب مسببا معدلات نفوق عالية، بينما يسبب أعراضا خفيفة قابلة للعكس لدى الفئران البالغة، لكنه يثير استجابة مناعية يمكن أن تؤثر على تفسير النتائج التجريبية. ينقسم MHV إلى عدة سلالات وتتنوع الأنسجة التي يصيبها وحدة الأعراض التي يسببها. يسبب MHV-1 أعراضا تنفسية وتسبب السلالتان A59 وMHV-3 التهاب الكبد ويسبب JHV التهاب الدماغ. يحفز الفيروس الأخير استجابات مناعية لدى الفئران تسبب أضرارا لأغمدة الميالين في العصبونات، لذلك يُستخدم كنموذج حيواني لدراسة التصلب المتعدد. من فيروسات كورونا التي تصيب الجرذان: فيروس التهاب الغدد اللعابية والدمعية (SDAV) وفيروس كورونا باركر الجرذي (RCoV-P)، يمكن أن تصيب السلالة الأولى الأعين والغدد الدمعية والغدد اللعابية ويمكن كذلك أن تؤثر على تكاثر الجرذان وتسبب تغيرات سلوكية وهي أحد أهم الممرضات لجرذان التجارب. تصنف هاتان السلالتان الجرذيتان مع مختلف سلالات MHV الفأرية كنوع واحد ويشار إليهم جميعا باسم فيروس كورونا الموريني.
يوجد فيروس كورونا يمكن أن يصيب الأرانب ويسبب التهاب الأمعاء مع معدلات نفوق عالية، ويسمى فيروس كورونا المعوي الأرنبي (RECV) وينتقل عبر الطريق الشرجي الفموي. فضلا عن ذلك، تُصاب الأرانب المستخدمة لزراعة اللولبية الشاحبة بممرضات غير معروفة يفترض أن تكون فيروس كورونا، وتوجد حالات قليلة فقط لإصابة الأرانب بهذين النوعين من فيروس كورونا. في 2012، وجد بعض الباحثين فيروس كورونا الأرنبي HKU14 في الأرانب التي بيعت في الأسواق، وهو فيروس بيتا يصيب الأرانب من دون أعراض ظاهرة. توجد كذلك تقارير حول إصابة فيروس كورونا للكابياء الخنزيرية وتسببه في أعراضٍ مثل الإسهال والتهاب الأمعاء، لكن مدى انتشار الفيروس في أوساط الكابياء الخنزيرية وعلاقته بفيروسات كورونا الأخرى مازالت غير معروفة.