علم الجينوم الوظيفي
مراجع

↑  "On the immortality of television sets: "function" in the human genome according to the evolution-free gospel of ENCODE". Genome Biology and Evolution. ج. 5 ع. 3: 578–90. 20 فبراير 2013. DOI:10.1093/gbe/evt028. PMC:3622293. PMID:23431001.
↑  A primer of genome science (ط. 3rd). Sunderland, MA: Sinauer Associates. 2004.
↑  Bioinformatics and functional genomics (ط. 2nd). Hoboken, NJ: Wiley-Blackwell. 2009.
↑  "RNA-Seq methods for transcriptome analysis". Wiley Interdisciplinary Reviews. RNA. ج. 8 ع. 1: e1364. يناير 2017. DOI:10.1002/wrna.1364. PMC:5717752. PMID:27198714.
↑  "High-throughput functional testing of ENCODE segmentation predictions". Genome Research. ج. 24 ع. 10: 1595–602. أكتوبر 2014. DOI:10.1101/gr.173518.114. PMC:4199366. PMID:25035418.
↑  "Massively parallel functional dissection of mammalian enhancers in vivo". Nature Biotechnology. ج. 30 ع. 3: 265–70. فبراير 2012. DOI:10.1038/nbt.2136. PMC:3402344. PMID:22371081. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط |إظهار المؤلفين=6 غير صالح (مساعدة)
↑  "Genome-wide quantitative enhancer activity maps identified by STARR-seq". Science. ج. 339 ع. 6123: 1074–7. مارس 2013. Bibcode:2013Sci...339.1074A. DOI:10.1126/science.1232542. PMID:23328393.
↑  "A novel genetic system to detect protein-protein interactions". Nature. ج. 340 ع. 6230: 245–6. يوليو 1989. Bibcode:1989Natur.340..245F. DOI:10.1038/340245a0. PMID:2547163.
↑  "Genome-wide CRISPR screens for Shiga toxins and ricin reveal Golgi proteins critical for glycosylation". PLoS Biology. ج. 16 ع. 11. e2006951. 27 نوفمبر 2018. DOI:10.1371/journal.pbio.2006951.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
↑  "High-Resolution CRISPR Screens Reveal Fitness Genes and Genotype-Specific Cancer Liabilities". Cell. ج. 163 ع. 6: 1515–26. ديسمبر 2015. DOI:10.1016/j.cell.2015.11.015. PMID:26627737. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط |إظهار المؤلفين=6 غير صالح (مساعدة)
↑  "Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells". Science. ج. 343 ع. 6166: 84–87. يناير 2014. Bibcode:2014Sci...343...84S. DOI:10.1126/science.1247005. PMC:4089965. PMID:24336571. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط |إظهار المؤلفين=6 غير صالح (مساعدة)
↑  "Genome-Scale CRISPR-Mediated Control of Gene Repression and Activation". Cell. ج. 159 ع. 3: 647–61. أكتوبر 2014. DOI:10.1016/j.cell.2014.09.029. PMC:4253859. PMID:25307932. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط |إظهار المؤلفين=6 غير صالح (مساعدة)
↑  "Compact and highly active next-generation libraries for CRISPR-mediated gene repression and activation". eLife. ج. 5. سبتمبر 2016. DOI:10.7554/eLife.19760. PMC:5094855. PMID:27661255. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط |إظهار المؤلفين=6 غير صالح (مساعدة)صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
↑  Gasperini، Molly؛ Findlay، Gregory M.؛ McKenna، Aaron؛ Milbank، Jennifer H.؛ Lee، Choli؛ Zhang، Melissa D.؛ Cusanovich، Darren A.؛ Shendure، Jay (أغسطس 2017). "CRISPR/Cas9-Mediated Scanning for Regulatory Elements Required for HPRT1 Expression via Thousands of Large, Programmed Genomic Deletions". The American Journal of Human Genetics. ج. 101 ع. 2: 192–205. DOI:10.1016/j.ajhg.2017.06.010. PMC:5544381.
↑  "Gene set enrichment analysis: a knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 102 ع. 43: 15545–50. أكتوبر 2005. Bibcode:2005PNAS..10215545S. DOI:10.1073/pnas.0506580102. PMC:1239896. PMID:16199517. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط |إظهار المؤلفين=6 غير صالح (مساعدة)
↑  "Ingenuity Systems". مؤرشف من الأصل في 1999-01-25. اطلع عليه بتاريخ 2007-12-31.
↑  "Ariadne Genomics: Pathway Studio". مؤرشف من الأصل في 2013-02-12. اطلع عليه بتاريخ 2007-12-31.
↑  "Protein complex-based analysis framework for high-throughput data sets". Science Signaling. ج. 6 ع. 264: rs5. فبراير 2013. DOI:10.1126/scisignal.2003629. PMC:3756668. PMID:23443684. مؤرشف من الأصل في 2019-06-01.
↑  "phydms: software for phylogenetic analyses informed by deep mutational scanning". PeerJ. ج. 5: e3657. 2017. DOI:10.7717/peerj.3657. PMC:5541924. PMID:28785526.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
↑  "The genetic landscape of a physical interaction". eLife. ج. 7. أبريل 2018. DOI:10.7554/eLife.32472. PMC:5896888. PMID:29638215.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
↑  Schmiedel، Jörn M.؛ Lehner، Ben (17 يونيو 2019). "Determining protein structures using deep mutagenesis". Nature Genetics. DOI:10.1038/s41588-019-0431-x.
↑  Rollins، Nathan J.؛ Brock، Kelly P.؛ Poelwijk، Frank J.؛ Stiffler، Michael A.؛ Gauthier، Nicholas P.؛ Sander، Chris؛ Marks، Debora S. (17 يونيو 2019). "Inferring protein 3D structure from deep mutation scans". Nature Genetics. DOI:10.1038/s41588-019-0432-9.
↑  "Enhanced regulatory sequence prediction using gapped k-mer features". PLoS Computational Biology. ج. 10 ع. 7: e1003711. يوليو 2014. Bibcode:2014PLSCB..10E3711G. DOI:10.1371/journal.pcbi.1003711. PMC:4102394. PMID:25033408.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
↑  "Genome-wide prediction of cis-regulatory regions using supervised deep learning methods". BMC Bioinformatics. ج. 19 ع. 1: 202. مايو 2018. DOI:10.1186/s12859-018-2187-1. PMC:5984344. PMID:29855387.{{استشهاد بدورية محكمة}}:  صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
↑  "Genetic effects on gene expression across human tissues". Nature. ج. 550 ع. 7675: 204–213. 12 أكتوبر 2017. DOI:10.1038/nature24277.
| ع ن أوميكس | ع ن أوميكس |
| --- | --- |
علم الجينوم:  علم الجينوم المعرفي  علم الجينوم الحاسوبي  علم الجينوم المقارن  علم الجينوم الوظيفي  مشروع الجينوم مشروع الجينوم البشري  علم الجينوم المتبدل  علم الجينوم الشخصي  علم الجينوم الاجتماعي  علم الجينوم البنيوي 
أخرى:  معلوماتية حيوية  معلوماتية كيميائية  علم الجينوم الكيميائي  غلايكوميات  إميونوميات  ليبيدوميات  ميتابولوميات  ميكروبيوميات  تأثير التغذية على الجينات  تعدد الصيغ الكرموسومية البدائية  علم الصيدلة الجيني  علم الصيدلة الجيني  بروتيوميات مشروع البروتيوم البشري  علم أنظمة الأحياء  علم الجينوم السمومي  ترانسكربتوميات 
بوابة طب
المصفوفات الدقيقة للحمض النووي
مثال على شاشة فقدان وظيفة كريسبر.
نظرة عامة على سير عمل phydms
العينات المستخدمة و eQTLs المكتشفة في GTEx v6