ترميز الحمض النووي للطحالب
المصادر

↑  Lobo, Eduardo A.; Heinrich, Carla Giselda; Schuch, Marilia; Wetzel, Carlos Eduardo; Ector, Luc (2016), Necchi JR, Orlando (ed.), "Diatoms as Bioindicators in Rivers", River Algae (بالإنجليزية), Springer International Publishing, pp. 245–271, DOI:10.1007 / 978-3-319-31984  -1_11, ISBN:9783319319834 {{استشهاد}}: تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  {ref>  {الاقتباس | الأخير = ستيفنسون | الأول = R.  Jan | title = تقييم الظروف البيئية في الأنهار والجداول ذات الدياتومات | date = 2010 | work = The Diatoms | pages = 57–85 | editor-last = Smol | editor-first = John P. | edition = 2 | publisher = Cambridge  مطبعة الجامعة | doi = 10.1017 / cbo9780511763175.005 | isbn = 9780511763175 | last2 = Pan | first2 = Yangdong | last3 = van Dam | first3 = Herman | editor2-last = Stoermer | editor2-first = Eugene F.}}
↑  Taberlet, Pierre; Bonin, Aurélie; Zinger, Lucie; Coissac, Eric (22 Mar 2018). Environmental DNA (بالإنجليزية). مطبعة جامعة أكسفورد. Vol. 1. DOI:10.1093 / oso / 9780198767220.001.0001. ISBN:9780198767220. {{استشهاد بكتاب}}: تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  Zimmermann, Jonas; Glöckner, Gernot; Jahn, Regine; Enke, Neela; Gemeinholzer, Birgit (2015). "Metabarcoding vs.phidical Identification لتقييم تنوع المشطورة في الدراسات البيئية". Molecular Ecology Resources (بالإنجليزية). 15: 526–542. DOI:10.1111 / 175  5-0998.12336. PMID:25270047. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |المسألة= تم تجاهله (help) and تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
1 2 3 4  Kermarrec, Lenaïg; Franc, Alain; Rimet, Frédéric; Chaumeil, Philippe; Frigerio, Jean-Marc; Humbert, Jean-François; Bouchez, Agnès (2014). "نهج تسلسل الجيل التالي  إلى المراقبة الحيوية للنهر باستخدام الدياتومات القاعية". Freshwater Science (بالإنجليزية). 33: 349–363. DOI:10.1086 / 675079. ISSN:2161-9549. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |المسألة= تم تجاهله (help) and تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
1 2  Hamsher, Sarah E.; Evans, Katharine M.; Mann, David G.; Poulíčková, Aloisie; Saunders, Gary W. (2011). "Barcoding Diatoms: استكشاف بدائل لـ COI-5P". Protis  t (بالإنجليزية). 162: 405–422. DOI:10.1016 / j.protis.2010.09.005. PMID:21239228. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |problem= تم تجاهله (help) and تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
1 2 3 4 5  Zimmermann, Jonas; Jahn, Regine; Gemeinholzer, Birgit (2011). "Barcoding diatoms: assessment  من المنطقة الفرعية V4 الفرعية على الجين 18S rRNA ، بما في ذلك البادئات والبروتوكولات الجديدة". الكائنات الحية التنوع والتطور (بالإنجليزية). 11: 173–192. DOI:10.1007 / s13127-011-0050  -6. ISSN:1439-6092. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |المشكلة= تم تجاهله (help) and تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  Apothéloz-Perret-Gentil, Laure; Cordonier, Arielle; Straub, François; Iseli, Jennifer; Esling, Philippe; Pawlowski, Jan (2017). "مؤشر الدياتوم الجزيئي الخالي من التصنيف لـ hig  h-throughput eDNA biomonitoring". Molecular Ecology Resources (بالإنجليزية). 17: 1231–1242. DOI:10.1111 / 1755-0998.12668. PMID:28296259. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |المسألة= تم تجاهله (help) and تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  Pawlowski, J.; Lejzerowicz, F.; Apotheloz-Perret-Gentil, L.; Visco, J.; Esling, P. (2016). "التحويل البروتيني البروتوني والرصد البيولوجي البيئي: Time for change". European Journal of Protistology (بالإنجليزية). 55: 12–25. DOI:10.1016 / j.ejop.2016.02  .003. {{استشهاد بدورية محكمة}}: تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  Almeida, Salomé FP; Elias, Carmen; Ferreira, João; Tornés, Elisabet; Puccinelli, Camilla; Delmas, François; Dörflinger, Gerald; Urbanič, Gorazd; Marcheggiani, Stefania (2014). "تقييم جودة المياه لـ  الأنهار التي تستخدم مقاييس المشطورة عبر أوروبا المتوسطية: تمرين معايرة الطرق". Science of the Total Environment (بالإنجليزية). 476–477: 768–776. DOI:10.1016 / j.scitotenv.2013.11.144. {{استشهاد بدورية محكمة}}: تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  Lavoie, Isabelle; Campeau, Stéphane; Darchambeau, François; Cabana, Gilbert; Dillon, Peter J. (2008). [http: //orbi.ulg.ac.be/handle/2268/62412 "هل الدياتومات تكامل جيد للتغير الزمني في جودة المياه المتدفقة؟"]. Freshwater Biology (بالإنجليزية). 53: 827–841. DOI:10.1111 /  j.1365-2427.2007.01935.x. ISSN:0046-5070. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |المسألة= تم تجاهله (help), تأكد من صحة قيمة |doi= (help), and تحقق من قيمة |مسار= (help)
↑  Martin, Gonzalo; Reyes Fernandez, Maria de los (16 May 2012), Voudouris, Kostas (ed.), "Diatoms as Indicators of  جودة المياه والحالة البيئية: أخذ العينات والتحليل وبعض الملاحظات البيئية", جودة المياه البيئية - معالجة المياه وإعادة استخدامها (بالإنجليزية), InTech, DOI:10.5772 / 33831, ISBN:9789535105084 {{استشهاد}}: تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  Rimet, Frédéric; Bouchez, Agnès (2012). "المراقبة الحيوية للنهر الدياتومات: آثار القرار التصنيفي". Ecological Indicators (بالإنجليزية). 15: 92–99. DOI:10.1016  /j.ecolind.2011.09.014. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |المسألة= تم تجاهله (help) and تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  Vasselon, Valentin; Domaizon, Isabelle; Rimet, Frédéric; Kahlert, Maria; Bouchez, Agnès (2017). [https: //pub.epsilon.slu  .se / 14206/1 / vasselon_v_et_al_170328.pdf "تطبيق الترميز عالي التسلسل (HTS) على المراقبة الحيوية المشطورة: هل استخراج الحمض النووي  هل الأساليب مهمة؟"] (PDF). Freshwater Science (بالإنجليزية). 36: 162–177. DOI:10.1086 / 690649. ISSN:2161-9549. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |المسألة= تم تجاهله (help), تأكد من صحة قيمة |doi= (help), and تحقق من قيمة |مسار= (help)
↑  Stoeck, Thorsten; Behnke, Anke; Christen, Richard; Amaral-Zettler, Linda; Rodriguez-  Mora, Maria J; Chistoserdov, Andrei; Orsi, William; Edgcomb, Virginia P (2009). "تسلسل العلامات الموازية بشكل كبير يكشف عن تعقيد مجتمعات البروتستان البحرية اللاهوائية". BMC Biology (بالإنجليزية). 7: 72. DOI:10.1186 / 1741-7007-7-72. ISSN:1741-7007. PMC:2777867. PMID:19886985. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |المسألة= تم تجاهله (help) and تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
1 2 3 4 5  Pawlowski, Jan; Kelly-Quinn, Mary; Altermatt, Florian; Apothéloz  -Perret-Gentil, Laure; Beja, Pedro; Boggero, Angela; Borja, Angel; Bouchez, Agnès; Cordier, Tristan (2018). [http: //repositori.irta.cat/bitstream/20.500.12327/138/1/Pawlowski_Future_2018.pdf "مستقبل المؤشرات الحيوية في العصر الإيكولوجي: دمج (e) استقلاب الحمض النووي في التقييم البيولوجي للأنظمة البيئية المائية"] (PDF). Science of the Total Environment (بالإنجليزية): 1295–1310. DOI:10.1016 / j.scitotenv.2018.05.002. PMID:29801222. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |حجم= تم تجاهله (help), تأكد من صحة قيمة |doi= (help), and تحقق من قيمة |مسار= (help)
↑  Visco, Joana Amorim; Apothéloz-Perret-Gentil, Laure; Cordonier, Arielle; Esling, Philippe; Pillet, Loïc; Pawlowski, يناير (7 Jul 2015). "المراقبة البيئية: استنتاج مؤشر المشطورة من بيانات تسلسل الجيل التالي". Environmental Science & Technology (بالإنجليزية). 49 (13): 7597–7605. DOI:10.1021 / es506158m. ISSN:0013-936X. PMID:26052741. {{استشهاد بدورية محكمة}}: تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  Shaw, Jennifer LA; Weyrich, Laura; Cooper, Alan (2017). "استخدام تسلسل الحمض النووي البيئي (e) لمسوحات التنوع البيولوجي المائي: دليل المبتدئين". Marine and Freshwater Research (بالإنجليزية). 68: 20. DOI:10.1071 / MF15361. ISSN:1323-1650. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |المسألة= تم تجاهله (help) and تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  Vasselon, Valentin; Bouchez, Agnès; Rimet, Frédéric; Jacquet, Stéphan; Trobajo, Rosa; Corniquel, Méline; Tapolczai, Kálmán; Domaizon, Isabelle (2018). Mahon, Andrew (ed.). "تجنب التحيز الكمي في metabarcoding:  تطبيق عامل تصحيح الكتلة الحيوية للخلية في المراقبة الحيوية الجزيئية المشطورة". طرق في علم البيئة والتطور (بالإنجليزية): 1060–1069. hdl:20.500.12327 / 161. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |المشكلة= تم تجاهله (help), الوسيط غير المعروف |حجم= تم تجاهله (help), الوسيط غير المعروف |دوى= تم تجاهله (help), and تأكد من صحة قيمة |hdl= (help)
↑  Evans, Katharine M.; Wortley, Alexandra H.; Mann, David G. (2007). "تقييم جينات "الباركود" المشعة المحتملة (cox1، rbcL،  18S و ITS rDNA) وفاعليتهما في تحديد العلاقات في Sellaphora (Bacillariophyta)". Protist (بالإنجليزية). 158: 349–364. DOI:10.1016 / j.protis.2007.04.001. PMID:17581782. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |المسألة= تم تجاهله (help) and تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
1 2  Moniz, Mónica BJ; Kaczmarska, Irena (2010). "تشفير الدياتومات: مراجعة ITS المشفرة النووية". Protist (بالإنجليزية). 161: 7–34. DOI:10.1016 / j.pr  otis.2009.07.001. PMID:19674931. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |المسألة= تم تجاهله (help) and تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  Scicluna, Stephanie M.; Tawari, Blessing; Clark, C.  Graham (2006). "DNA Barcoding of Blastocystis". Protist (بالإنجليزية). 157: 77–85. DOI:10.1016 / j.protis.2005.12.001. PMID:16431158. {{استشهاد بدورية محكمة}}: النص "Issue 1" تم تجاهله (help) and تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  Utz, Laura RP; Eizirik, Eduardo (2007). "Phylogenetics of Subclass Peritrichia (Ciliophora: Oligohymenophorea) بناءً على التوسيع  تحليلات تسلسل 18S rRNA". مجلة علم الأحياء الدقيقة حقيقية النواة (بالإنجليزية): 303–305. DOI:10.1111 / j.1550-7408.2007.00260.x. ISSN:1066-5234. PMID:17552986. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |المسألة= تم تجاهله (help), الوسيط غير المعروف |حجم= تم تجاهله (help), and تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  Jahn، R. (11 ديسمبر 2007). [http: //www.bgbm.org/bgbmpress/otherpubl/cediatom/contents.htm "Diatoms and DNA barcoding: a pilot  دراسة عن عينة بيئية"]. وقائع الاجتماع الأول لوسط أوروبا دياتوم 2007. حديقة نباتية ومتحف نباتي برلين-داهلم: 63–68. DOI:10.3372 / cediatom.113. ISBN:9783921800638. {{استشهاد بدورية محكمة}}: تأكد من صحة قيمة |doi= (مساعدة) وتحقق من قيمة |مسار= (مساعدة)
↑  Nickrent, Daniel L.; Sargent, Malcolm L. (1991). "نظرة عامة على البنية الثانوية لمنطقة V4 من حقيقيات النوى الصغيرة الريبوسية الصغرى RNA". Nucleic Acids Research (بالإنجليزية). 19. DOI:10.1093 / nar / 19.2.227. ISSN:0305-1048. PMC:333584. PMID:2014163. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |المسألة= تم تجاهله (help), الوسيط غير المعروف |عدد الصفحات= تم تجاهله (help), and تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  Wilde، Erik (1999)، Wilde's WWW، Springer Berlin Heidelberg، ص. 53–135، DOI:10.1007 / 978-3-642-95855-7_4، ISBN:9783642958571 {{استشهاد}}: الوسيط غير المعروف |Chapter= تم تجاهله يقترح استخدام |chapter= (مساعدة) وتأكد من صحة قيمة |doi= (مساعدة)
↑  [http: //data.europa.eu/eli/dir/2000/60/oj/eng Directive 2000/60 / EC للبرلمان الأوروبي ومجلس 23  أكتوبر 2000 وضع إطار عمل المجتمع في مجال السياسة المائية] (بالإنجليزية), vol. OJ  L, 22 Dec 2000, Retrieved 2019-03-28 {{استشهاد}}: الوسيط غير المعروف |problem= تم تجاهله (help) and تحقق من قيمة |مسار= (help)
↑  Rimet, Frédéric (1 Mar 2012). "المشاهدات الأخيرة حول تلوث الأنهار والدياتومات". Hydrobiologia (بالإنجليزية). 683 (1): 1–24. DOI:10.1007 / s10750-011-0949-0. ISSN:1573-5117. {{استشهاد بدورية محكمة}}: تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  Kermarrec, L.; Franc, A.; Rimet, F.; Chaumeil, P.; Humbert, J.  F.; Bouchez, A. (2013). "تسلسل الجيل التالي لجرد التنوع التصنيفي في المجتمعات حقيقية النواة: اختبار لذوات المياه العذبة". Molecular Ecology Resources (بالإنجليزية). 13: 607–619. DOI:10.1111 / 1755-0998.12105. PMID:23590277. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |iss= تم تجاهله (help) and تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  [https: //assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/684493/A_DNA_based_metabarcoding_approach_to_assess_divers_to_assess_inivers_to_assess_inivers_to_assess_inivers  -_report.pdf "Kelly et al"] (PDF). {{استشهاد ويب}}: تحقق من قيمة |مسار= (مساعدة)
↑  Vasselon, Valentin; Domaizon, Isabelle; Rimet, Frédéric; Kahlert, Maria; Bouchez, Agnès (2017). [https: //pub.epsilon.slu.se/14206/1/vasselon_v_et_al_170328.pdf "تطبيق كود التعريف للتسلسل عالي الإنتاجية (HTS) على المراقبة الحيوية المشطورة: هل طرق استخراج الحمض النووي مهمة؟"] (PDF). علوم المياه العذبة (بالإنجليزية) (1): 162–177. DOI:10.1086 / 690649. ISSN:2161-9549. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |الحجم= تم تجاهله (help), تأكد من صحة قيمة |doi= (help), and تحقق من قيمة |مسار= (help)
↑  Vasselon, Valentin; Rimet, Frédéric; Tapolczai, Kálmán; Bouchez, Agnès (2017). "تقييم الحالة البيئية باستخدام كودات الحمض النووي الدياتومات: التوسع في شبكة رصد WFD (جزيرة مايوت ، فرنسا)". Ecological Indicators (بالإنجليزية). 82: 1–12. DOI:10.1016 / j.ecolind.  طبقت 2017.06.024. {{استشهاد بدورية محكمة}}: تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
1 2  Rimet, Frédéric; Vasselon, Valentin; A.-Keszte, Barbara; Bouchez, Agnès (2018). "هل نقوم بالمثل بتقييم التنوع مع الفحص المجهري والتسلسل عالي الإنتاجية؟  حالة الطحالب الدقيقة في البحيرات". Organisms Diversity & Evolution (بالإنجليزية). 18 (1): 51–62. DOI:10.1007 / s13127-018-0359-5. ISSN:1439-6092. {{استشهاد بدورية محكمة}}: تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  Hering, Daniel; Borja, Angel; Jones, J.Iwan; Pont, Didier; Boets, Pieter; Bouchez, Agnes; Bruce, Kat; Drakare, Stina; Hänfling, Bernd (2018). [http: //qmro.qmul.ac.uk/xmlui/handle/123456789/36293 "خيارات التنفيذ للتحديد المستند إلى الحمض النووي في تقييم الحالة البيئية بموجب التوجيه الإطاري الأوروبي للمياه"]. Water Research (بالإنجليزية). 138: 192–205. DOI:10.1016 / j.watres.2018.03.003. PMID:29602086. {{استشهاد بدورية محكمة}}: تأكد من صحة قيمة |doi= (help) and تحقق من قيمة |مسار= (help)
↑  Seo, Yasuhisa; Ichida, Daisuke; Sato, Shingo; Kuroki, Kohji; Kishida, Tetsuko (2014). "طريقة محسنة لاختبار الدياتوم باستخدام DNA Binding Ability of Silica". Journal of Forensic Sciences (بالإنجليزية): 779–784. DOI:10.1111 / 1556-4029.12390. PMID:24502836. {{استشهاد بدورية محكمة}}: النص "Issue 3" تم تجاهله (help) and تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
1 2  Saunders, Gary W (29 Oct 2005). "تطبيق الرمز الشريطي DNA على الطحالب الكبيرة الحمراء: التقييم الأولي يبشر بالخير للتطبيقات المستقبلية". المعاملات الفلسفية للمجتمع الملكي B: العلوم البيولوجية (بالإنجليزية). 360 (1462): 1879–1888. DOI:10.1098 / rstb.2005.1719. ISSN:0962-8436. PMC:1609223. PMID:16214745. {{استشهاد بدورية محكمة}}: تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  Leliaert, Frederik; Verbruggen, Heroen; Vanormelingen, Pieter; Steen, Frederique; López-Bautista, Juan M.; Zuccarello, Giuseppe C  .; De Clerck, Olivier (3 Apr 2014). "تحديد الأنواع المستندة إلى الحمض النووي في الطحالب". European Journal of Phycology (بالإنجليزية). 49: 179–196. DOI:10.1080 / 09670262.2014.904524. ISSN:0967-0262. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |المسألة= تم تجاهله (help) and تأكد من صحة قيمة |doi= (help) </  المرجع> الجين SSU rDNA هو رمز شريطي شائع الاستخدام لدراسات السلالات حول الطحالب الكبيرة.<ref name = ": 4">Harper & Saunders (2001). "تطبيق تسلسلات الستروزون الريبوزومي على علم اللاهوت النظامي وتصنيف الطحالب الحمراء florideophyte (Florideophyceae، Rhodophyta)". Cahiers de Biologie Marine. 42 (1/2): 25–38. {{استشهاد بدورية محكمة}}: يحتوي الاستشهاد على وسيط غير معروف وفارغ: |بواسطة= (مساعدة)صيانة الاستشهاد: أسماء عددية: قائمة المؤلفين (link)
↑  McDevit, Daniel C.; Saunders, Gary W. (2009). "حول فائدة تشفير الحمض النووي لتمييز الأنواع بين الطحالب الكبيرة البنية (Phaeophyceae) بما في ذلك بروتوكول استخراج جديد". Phycological Research (بالإنجليزية). 57 (2): 131–141. DOI:10.1111 / j.1440-1835.2009.00530.x. {{استشهاد بدورية محكمة}}: تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
↑  Saunders & Kucera  (2010). "تقييم rbcL و tufA و UPA و LSU و ITS كعلامات للباركود DNA للطحالب الخضراء البحرية". Cryptogamie Algologie. ج. 31. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |المسألة= تم تجاهله (مساعدة)صيانة الاستشهاد: أسماء عددية: قائمة المؤلفين (link)
↑  Valero، Myriam؛ Küpper، Frithjof C.؛ Tsiamis، Konstantinos؛ Couceiro، Lucía؛ Peters، Akira F. (2015). "الرمز الشريطي للمراحل المشفرة لما  الطحلب البني المعزول من طبقة تحتية محتضنة يكشف عن تنوع كبير في Acinetosporaceae". ISSN:0181-1568. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الاستشهاد بدورية محكمة يطلب |دورية محكمة= (مساعدة)
1 2  Saunders، Gary W.؛ McDevit، Daniel C. (2012)، Kress، W.  John؛ Erickson، David  L. (المحررون)، "طرق لـ DNA Barcoding Photosynthetic Protists التي تؤكد على الطحالب الكبيرة و  Diatoms"، DNA Barcodes، Humana Press، ج. 858، ص. 207–222، DOI:10.1007 / 978-1-61779-591-6_10، ISBN:9781617795909، PMID:22684958 {{استشهاد}}: تأكد من صحة قيمة |doi= (مساعدة)
↑  Baldauf, S.  L. (13 Jun 2003). "جذور حقيقيات النوى". Science (بالإنجليزية). 300: 1703–1706. DOI:10.1126 / science.1085544. ISSN:0036-8075. PMID:12805537. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |المسألة= تم تجاهله (help) and تأكد من صحة قيمة |doi= (help)
بوابة تقانة
بوابة علم الأحياء
Diatom DNA barcoding
مورفولوجيا الدياتوم
(هـ) ترميز استقلاب الحمض النووي في التقييم البيولوجي للأنظمة البيئية المائية