قائمة الخلافات التي تورطت فيها وكالة المخابرات المركزية
مخاوف حقوق الإنسان

تم استدعاء وكالة المخابرات المركزية،في بعض الأحيان،لاستخدام التعذيب والتمويل والتدريب للجماعات والمنظمات التي ستشارك لاحقًا في قتل المدنيين وغيرهم من غير المقاتلين وستحاول أو تنجح في الإطاحة بالحكومات المنتخبة ديمقراطياً والتجارب البشرية واغتيالات واغتيالات مستهدفة.كما تم اتهام وكالة المخابرات المركزية بعدم وجود ضوابط مالية وضوابط المبلغين عن المخالفات مما أدى إلى التبذير والاحتيال.
خلال عام بوش الذي تولى فيه مسؤولية وكالة المخابرات المركزية،دعمت أجهزة الأمن القومي الأمريكية بشكل فعال عمليات كوندور والديكتاتوريات العسكرية اليمينية في أمريكا اللاتينية.وفقًا لجون دينجز،مؤلف كتاب سنوات كوندور،كشفت الوثائق الصادرة في عام2015 عن تقرير لوكالة المخابرات المركزية الأمريكية بتاريخ 28أبريل1978 أظهر أن الوكالة كانت تعلم في ذلك الوقت أن الدكتاتور التشيلي أوغستو بينوشيه المدعوم من الولايات المتحدة أمر باغتيال أورلاندو ليتيلير،معارض سياسي بارز يعيش في المنفى في الولايات المتحدة.
قام معهد الطب كمهنة ومنظمة مؤسسات المجتمع المفتوح غير الهادفة للربح بمراجعة السجلات العامة المتعلقة بالمهن الطبية بدعوى التواطؤ في إساءة معاملة السجناء المشتبه في ارتكابهم أعمال إرهابية والذين احتُجزوا في حجز الولايات المتحدة خلال السنوات التي تلت أحداث 11سبتمبر". ووجدت التقارير أن المهنيين الصحيين "ساعدوا في الاستجوابات القاسية والمهينة ؛ وساعدوا في ابتكار وتنفيذ ممارسات مصممة لتعظيم الارتباك والقلق لجعل المحتجزين أكثر مرونة للاستجواب؛ وشاركوا في تطبيق الأساليب المؤلمة بشكل مؤلم لإطعام ذوي الكفاءة العقلية بالإكراه المحتجزون الذين اضربوا عن الطعام "ليست كلها مفاجأة.تم استخدام المهنيين الطبيين في بعض الأحيان في المواقع السوداء لمراقبة صحة المحتجزين.ما إذا كان الأطباء مضطرين أم لا هو سؤال مفتوح.
تشمل قضايا حقوق الإنسان الأخرى المثيرة للجدل قضية إدوارد سنودن.ومع ذلك،فإن أهمية حقوق الإنسان لا تندرج في هذه القضية فيما يتعلق بما إذا كان سنودن قد تلقى محاكمته العادلة أم لا.وبدلاً من ذلك،فإن حقوق الإنسان المرتبطة بتسريبات سنودن تتعلق بأنواع الوثيقة التي أصدرها سنودن.أصدر سنودن قدرًا كبيرًا من المعلومات حول برنامج مراقبة الحكومة الأمريكية لمواطنيهاإلى الواشنطن بوست بالإضافة إلى مراسلي الأخبار الأجانب.
على وجه الخصوص،"في الفترة ما بين 5حزيران(يونيو)2013 أو 9حزيران(يونيو)2013 أو نحو ذلك التاريخ،تم نشر معلومات سرية على الإنترنت وطباعتها عدة صحف،بما في ذلك واشنطن بوست و الغارديان.تضمنت المقالات والمنشورات على الإنترنت من قبل الواشنطن بوست والجارديان وثائق سرية تم تمييزها بـسري للغاية.كشفت الواشنطن بوست والجارديان في وقت لاحق أن إدوارد سنودن كان المصدر الرئيسي للمعلومات السرية في 9 يونيو 2013 أو حوالي ذلك،في مقابلة مسجلة بالفيديو مع الحارس،اعترف بأنه الشخص الذي قدم هذه الوثائق بشكل غير قانوني إلى المراسلين.تشير الأدلة إلى أن إدوارد سنودن كان له حق الوصول إلى الوثائق السرية المعنية ؛ الوصول إلى تلك الوثائق ؛ وبعد ذلك،قدم هذه المستندات لوسائل الإعلام دون إذن وفي انتهاك لقانون الولايات المتحدة ".
علاوة على ذلك،تضمنت التسريبات وثائق على عدة مستويات لأنشطة المراقبة الإلكترونية لوكالة الأمن القومي (NSA)."لقد ولدت تسريبات سنودن نقاشًا عامًا واسعًا حول قضايا الأمن والخصوصية والشرعية المتأصلة في مراقبة وكالة الأمن القومي للاتصالات من قبل المواطنين الأمريكيين.تشمل السجلات: جهود البيت الأبيض ومدير الاستخبارات القومية لشرح وتبرير والدفاع عن البرامج.المراسلات بين النقاد الخارجيين ومسؤولي السلطة التنفيذية؛ صحائف الوقائع والأوراق البيضاء التي وزعتها الحكومة (وسحبت في بعض الأحيان) ؛ القوانين الرئيسية وقرارات المحاكم (المحكمة العليا ومحكمة مراقبة الاستخبارات الأجنبية) ؛ وثائق حول برنامج الوعي المعلوماتي الكلي (لاحقًا حول الوعي بالإرهاب عن المعلومات،أو نوبة نقص تروية عابرة)،وهو اقتراح سابق لكتيبات جمع البيانات الضخمة حول كيفية استغلال الإنترنت لأغراض الاستخبارات."