أينزاتسغروبن
غزو بولندا

ردا على خطة أدولف هتلر لغزو بولندا في 1 سبتمبر 1939، أعاد هايدريش تشكيل أينزاتسغروبن للتحرك خلف الجيوش الألمانية.  تم اختيار أعضاء أينزاتسغروبن في هذه المرحلة من شوتزشتافل والشرطة الأمنية الألمانية، والشرطة والغيستابو. قام هيدريش بتعيين إس إس- أوبر غروبن فوهرر فيرنر بيست لقيادتها، والذي عيّن Hans-Joachim Tesmer  لاختيار أفراد فرق العمل ومجموعاتها الفرعية، المسماة اينساتسكوماندو، من بين ذوي الخبرة العسكرية والالتزام الإيديولوجي القوي بالنازية. كان بعضهم سابقًا أعضاء في مجموعات شبه عسكرية مثل فرايكوربس. أمر هيدريش فاجنر في اجتماعات في أواخر يوليو أن أينزاتسغروبن يجب أن يقوموا بعملياتهم بالتعاون مع أوربو (شرطة النظام) والقادة العسكريين في المنطقة. كانت مخابرات الجيش على اتصال دائم مع أينزاتسغروبن لتنسيق أنشطتها مع الوحدات الأخرى.
كان عددهم في البداية 2,700 الرجال (وأصبح في نهاية المطاف 4250 في بولندا)، وكانت مهمة وحدات القتل المتنقلة لقتل أعضاء القيادة البولندية التي تم تحديدها بشكل أكثر وضوحا مع الحفاظ على الهوية الوطنية البولندية: المثقفين، ورجال الدين، والمعلمين والنبلاء. كما ذكر هتلر: «... يجب ألا يكون هناك قادة بولنديون؛ حيث وجدتم قادة بولنديون فلابد من قتلهم». إس إس- بريغيجاديه فوهرر لوثار بيتل قائد أينزاتسغروبن IV، شهد في وقت لاحق أن هيدريش أعطى الأمر لعمليات القتل هذه في سلسلة من الاجتماعات في منتصف شهر أغسطس. كتاب الإدعاء الخاص - بولندا - قوائم الأشخاص الذين سيتم قتلهم - تم إعدادها من قبل شوتزشتافل في وقت مبكر من مايو 1939، باستخدام الملفات التي جمعتها الشرطة الأمنية الألمانية من عام 1936 فصاعدًا. قامت أينزاتسغروبن بتنفيذ هذه الجرائم بدعم من فولكسدويتشر سيلبستشوتز وهي مجموعة شبه عسكرية تتكون من الألمان العرقيين الذين يعيشون في بولندا. أعضاء شوتزشتافل، والفيرماخت، وشرطة النظام قتلت أيضا مدنيين خلال الحملة البولندية. ما يقرب من 65000 مدنيا قتلوا بحلول نهاية 1939. بالإضافة إلى قادة المجتمع البولندي، قتلوا اليهود، والبغايا، والغجر، والمرضى العقليين والنفسيين. وقتل المرضى النفسيون في بولندا في البداية بإطلاق النار عليهم، ولكن بحلول ربيع عام 1941 تم استخدام شاحنات الغاز على نطاق واسع.
عملت سبعة كتائب أينزاتسغروبن (حوالي 500 رجل) في بولندا. تم تقسيم كل منها إلى خمسة سريات اينساتسكوماندو (حوالي 100 رجل).
أينزاتسغروبن I، بقيادة إس إس- شتاندارتن فوهرر برونو ستريكنباخ، تصرف مع الجيش الرابع عشر
أينزاتسغروبن II، إس إس- أوبرستورمبانفورر إيمانويل شيفر، تصرف مع الجيش العاشر
أينزاتسغروبن III، إس إس- أوبرستورمبانفورر und Regierungsrat هربرت فيشر، مع الجيش الثامن
أينزاتسغروبن IV، إس إس- بريغيجاديه فوهرر لوثار بيتل، مع الجيش الرابع
أينزاتسغروبن V ، إس إس- شتاندارتن فوهرر إرنست دامزوج، مع الجيش الثالث
أينزاتسغروبن VI، إس إس- أوبرفورر إريك ناومن، في بولندا الكبرى
أينزاتسغروبن VII، إس إس-أوبر غروبن فوهرر أودو فون وويرش وإس إس- غروبنفهرر أوتو راش، عملت في سيليزيا العليا وسيزين سيليزيا
على الرغم من أنهم كانوا رسميًا تحت قيادة الجيش، إلا أن أينزاتسغروبن تلقت أوامرها من هايدريش وتصرف معظمهم بشكل مستقل عن الجيش. العديد من كبار ضباط الجيش سعداء للغاية بترك عمليات الإبادة الجماعية هذه لفرق العمل، لأن عمليات القتل انتهكت قواعد الحرب على النحو المنصوص عليه في اتفاقيات جنيف. ومع ذلك، فقد قرر هتلر أنه سيتعين على الجيش تحمل وحتى تقديم الدعم اللوجستي إلى أينزاتسغروبن عندما كان من الممكن من الناحية التكتيكية القيام بذلك. اشتكى بعض قادة الجيش من عمليات إطلاق النار والنهب والاغتصاب غير المصرح بها التي ارتكبها أعضاء من أينزاتسغروبن وفولكسدويتشر سيلبستشوتز دون تأثير يذكر. على سبيل المثال، عندما أرسل غنرال أوبرست يوهانس بلاسكويتز مذكرة شكوى إلى هتلر بشأن الفظائع، رفض هتلر مخاوفه على أنها «طفولية»، وتم إعفاء بلاسكوفيتز من منصبه في مايو 1940. واصل الخدمة في الجيش ولكن لم تلقى ترقية إلى رتبة مشير ميداني.
كانت المهمة الأخيرة لأينزاتسغروبن في بولندا هي جمع ما تبقى من اليهود وتركيزهم في الأحياء اليهودية داخل المدن الكبرى ذات خطوط السكك الحديدية الجيدة. كان القصد هو في نهاية المطاف إبادة جميع اليهود في بولندا، ولكن في هذه المرحلة لم يتم تحديد وجهتهم النهائية بعد. قام كل من الفيرماخت وأينزاتسغروبن معًا بقيادة عشرات الآلاف من اليهود شرقاً إلى الأراضي الخاضعة للسيطرة السوفيتية.