اتفاقية الصداقة والتعاون بين البوسنة والهرسك وكرواتيا
فيما بعد

المقالة الرئيسة: الحرب الكرواتية البوسنية
بلاج كرالييفيتش خلال احتفال في تشابليينا في 19 يوليو 1992
في صيف عام 1992 بدأت مجلس الدفاع الكرواتي في تطهير أعضائه البوسنيين. في نفس الوقت بدأت الحوادث المسلحة تحدث بين الكروات في البوسنة والهرسك بين مجلس الدفاع الكرواتي وقوات الدفاع الكرواتية. كانت قوات الدفاع الكرواتية مخلصة للحكومة البوسنية وقبلوا التبعية لجيش جمهورية البوسنة والهرسك الذي تم تعيين كرالييفيتش عضوا فيه. في 9 أغسطس اغتيل كرالييفيتش وثمانية من موظفيه على يد جنود مجلس الدفاع الكرواتي تحت قيادة ملادين ناليتيليتش الذي دعم الانقسام بين الكروات والبوشناق بعد أن هاجمت قوات الدفاع الكرواتية بقيادة كرالييفيتش جيش جمهورية صرب البوسنة بالقرب من تريبينيي. أدى تقدم قوات الدفاع الكرواتية إلى شرق الهرسك واحتلال تريبينيي إلى غضب بوبان الذي أكد لكاراديتش أن القوات الكرواتية غير مهتمة بالمنطقة. تم حل قوات الدفاع الكرواتية وترك مجلس الدفاع الكرواتي باعتباره القوة الكرواتية الوحيدة. اشتبه المسؤولون البوسنيون في تورط حكومة تودجمان. ووفقا لمانوليتش أصدر شوشاك الأمر بقتل كرالييفيتش ووافق عليه تودجمان. صرح بوجيدار فوتشوريفيتش عمدة مدينة تريبينيي وقت الحرب أنه قام بحماية السجلات التي تظهر أن أشخاص من الحزب الديمقراطي الصربي والاتحاد الديمقراطي الكرواتي اعتبروها «مهمة» يجب تنفيذها.
في أواخر سبتمبر التقى عزت بيغوفيتش وتودجمان مرة أخرى وحاولا إنشاء تنسيق عسكري ضد جيش جمهورية صرب البوسنة لكن دون جدوى. بحلول أكتوبر انهارت الاتفاقية وبعد ذلك قامت كرواتيا بتحويل مسار تسليم الأسلحة إلى البوسنة والهرسك من خلال مصادرة كمية كبيرة لنفسها. كان بوبان قد تخلى عن تحالف الحكومة البوسنية وأوقف جميع الأعمال العدائية مع كاراديتش. انهار الدفاع الكرواتي البوسني المهيمن عن بوسافينا بعد أن أمر تودجمان و/أو غويكو شوشاك بسحب الجيش الكرواتي مما مكن الصرب من السيطرة على الممر وربط أراضيهم التي تم الاستيلاء عليها في الغرب وشرق البوسنة. في 8 أكتوبر تم التخلي عن بلدة بوسانسكي برود من قبل مجلس الدفاع الكرواتي وتركها لجيش جمهورية صرب البوسنة. بحلول ذلك الوقت تكبد الجيش الكرواتي ومجلس الدفاع الكرواتي خشائر بشريى بلغت ما يقرب من 7500 ضحية من أصل 20000 جندي ملتزمون بمعركة السيطرة على بوسافينا. يبدو أن الانسحاب كان بمثابة مقايضة لانسحاب جيش يوغوسلافيا الشعبي من المناطق النائية في دوبروفنيك الذي حدث في يوليو. ومع ذلك خلص تحليل أجرته وكالة المخابرات المركزية إلى أنه لا يوجد دليل مباشر على مثل هذه الترتيبات. في 9 أكتوبر وقع مجلس الدفاع الكرواتي وقف إطلاق النار مع جيش جمهورية صرب البوسنة في يايتسي مقابل توفير الكهرباء.
تصاعدت العلاقات المتوترة بسرعة وأدت إلى اشتباك مسلح بين القوتين في نوفي ترافنيك في 18 أكتوبر. انتشرت صراعات منخفضة النطاق في المنطقة واشتبكت القوتان مع بعضهما البعض على طول طريق الإمداد إلى يايتسي بعد ثلاثة أيام في 21 أكتوبر نتيجة لوضع حاجز طريق باسم جيش جمهورية البوسنة والهرسك الذي وضع في اليوم السابق من قبل «اللجنة التنسيقية لحماية المسلمين» من دون أخذ موافقة قيادة جيش جمهورية البوسنة والهرسك. ومثلما تم تفكيك الحاجز وقعت مناوشة جديدة في بلدة فيتيس في اليوم التالي. في 29 أكتوبر استولى جيش جمهورية صرب البوسنة على يايتسي بسبب عدم قدرة قوات جيش جمهورية البوسنة والهرسك ومجلس الدفاع الكرواتي على بناء دفاع تعاوني ضد جيش جمهورية صرب البوسنة الذي يتمتع بميزة في حجم القوات وقوة النيران وكان عمل الموظفين والتخطيط أفضل بكثير من المدافعين عن يايتسي. قبل ستة أيام من اندلاع المعركة الكبرى الأولى في حرب كروات–البوسنة الوشيكة عندما دفع مجلس الدفاع الكرواتي جيش جمهورية البوسنة والهرسك من بروزور وطرد السكان البوسنيين بعد تنفيذ عمليات اغتصاب ومهاجمة مسجد محلي وإحراق ممتلكات البوشناق. أشارت التقارير الأولية إلى مقتل أو جرح 300 بوسني في الهجوم لكن التقارير اللاحقة من قبل جيش جمهورية البوسنة والهرسك في نوفمبر 1992 أشارت إلى مقتل 11 جندي وثلاثة مدنيين. تقرير آخر لجيش جمهورية البوسنة والهرسك تم إعداده في مارس 1993 راجع الأرقام قائلا أن ثمانية مدنيين وثلاثة جنود من جيش جمهورية البوسنة والهرسك قتلوا بينما أصيب 13 جندي و 10 مدنيين.