Utilizzando macchie istologiche su campioni espettorati di flemma (detto anche "espettorato"), gli scienziati possono identificare la MTB al microscopio. Dato che MTB conserva alcune macchie anche dopo essere stato trattato con una soluzione acida, è classificato come bacillo acido-veloce. Le tecniche di colorazione più comuni sono la macchia Ziehl-Neelsen e la colorazione Kinyoun, che colorano i bacilli acidi-veloci di un rosso brillante che spicca su uno sfondo blu. Sono anche utilizzati colorazione di auramine-rodamina e microscopia fluorescenza.
Se uno scienziato non voleva usare una tecnica di colorazione rapida e acida, che tipo di microscopia potrebbe invece usare?
fluorescenza