Gli antenati dei batteri moderni erano microrganismi unicellulari che furono le prime forme di vita a comparire sulla Terra, circa 4 miliardi di anni fa. Per circa 3 miliardi di anni, la maggior parte degli organismi sono stati microscopici, e batteri e arcaie sono state le forme dominanti di vita. Nel 2008 sono stati scoperti fossili di macroorganismi, chiamati biota Francevilliani. Sebbene esistano fossili batterici, come gli stromatolite, la loro mancanza di morfologia distintiva impedisce che vengano utilizzati per esaminare la storia dell' evoluzione batterica, o fino ad oggi il tempo di origine di una particolare specie batterica. Tuttavia, le sequenze geniche possono essere utilizzate per ricostruire la filogenesi batterica, e questi studi indicano che i batteri si sono prima discostati dal lignaggio archeale/eukariotico. I batteri furono coinvolti anche nella seconda grande divergenza evolutiva, quella degli arcaici e degli eucarioti. Qui, gli eucarioti sono il risultato dell' ingresso di batteri antichi in associazioni endosimbiotiche con gli antenati delle cellule eucariotiche, che erano a loro volta legati all' Arcaea. Ciò ha comportato l' ingerimento da parte di cellule proto-eukaryotiche di simbiotici alfaproteobatterici per formare mitocondri o idrogenosomi, che si trovano ancora in tutti gli Eukarya conosciuti (talvolta in forma molto ridotta, ad esempio). in antichi "amitochondrial" protozoi). Più tardi, alcuni eucarioti che già contenevano mitocondri inghiottirono anche organismi cianobatterici simili. Ciò ha portato alla formazione di cloroplasti in alghe e piante. Ci sono anche alcune alghe che hanno avuto origine da eventi endosingotici anche più tardi. Qui gli eucarioti inghiottirono un' alga eucariotica che si sviluppò in una plastide di "seconda generazione". Questa è nota come endosimbiosi secondaria.
Quando sono comparsi sulla Terra i primi antecedenti di batteri?
4 miliardi di anni fa