Anche se meno comuni rispetto ai periodi precedenti, nei tempi moderni, le accuse formali di eresia all' interno delle chiese cristiane si verificano ancora. Le questioni nelle chiese protestanti hanno incluso la moderna critica biblica e la natura di Dio. Nella Chiesa cattolica, la Congregazione per la Dottrina della Fede critica gli scritti per "ambiguità ed errori" senza usare la parola "eresia".
Quale credo della Chiesa cattolica critica gli scritti senza usare la parola eresia?
Congregazione per la Dottrina della Fede