In cpDNA, ci sono diversi gradienti di deaminazione A-G. Il DNA diventa suscettibile a eventi di deaminazione quando è single stranded. Quando le forchette di replica si formano, il filo che non viene copiato è a filo unico, e quindi a rischio per la deaminazione A. G. Pertanto, i gradienti di deaminazione indicano che le forcelle replicative erano molto probabilmente presenti e la direzione in cui si aprivano inizialmente (il gradiente più elevato è molto probabilmente più vicino al sito di partenza, perchè è stato incagliato per il periodo di tempo più lungo). Questo meccanismo è ancora oggi la teoria principale; tuttavia, una seconda teoria suggerisce che la maggior parte cpDNA è in realtà lineare e si replica attraverso la ricombinazione omologa. Sostiene inoltre che solo una minoranza del materiale genetico è conservato in cromosomi circolari, mentre il resto è in strutture ramificate, lineari o altre strutture complesse.
Dove la teoria secondaria dice che la maggior parte dei geni sono conservati?
in strutture ramificate, lineari o altre strutture complesse strutture ramificate, lineari o altre strutture complesse in strutture ramificate, lineari o altre strutture complesse