Estudio de las interacciones químicas presentes en el tratamiento de muestras clínicas para el desarrollo y validación de un método para la detección del SARSCoV2 
Autor: Dalia Stephanie Aguirre Maldonado
Año: 2021
Carrera: Química Farmaceútico Biológica

SARSCoV2 y COVID19 En diciembre de 2019 en Wuhan, China, se registraron cuadros clínicos de “neumonías atípicas” que más adelante se identificaron como una enfermedad infecciosa denominada COVID19 (por sus siglas en inglés Coronavirus Disease y su origen en el año 2019), cuyo agente causante se encontró al Coronavirus 2 a quien se le denominó síndrome respiratorio agudo severo (SARSCoV2). En la actualidad, el brote se ha caracterizado por ser una pandemia, que se ha propagado en 188 países de todo el mundo, con más de 148 millones de casos confirmados (a09:00hdel28deabrilde2021) y con una tasa de recuperación del ∼97. 6% y demortalidad del ∼2. 4% de acuerdo a la Organización Mundial de la Salud (OMS, WHO por sus siglas en inglés “World Health Organization”); considerándose una emergencia de salud pública de importancia internacional (WHO Coronavirus (COVID19), 2021). En México se han presentado más de 900 mil casos, con una tasa de recuperación del ∼90. 7% y de mortalidad del ∼9. 3%, constituyéndose como un evento histórico de suma importancia para la salud pública en diversos campos (WHO Coronavirus(COVID19), 2021). La pandemia ha representado un desafío científico y social muy importante especial mente en lo que se refiere a establecer cercos sanitarios que nos permitan reducir de manera eficiente la propagación mundial del SARSCoV2. Los gobiernos se han visto obligados a tomar medidas de aislamiento y prevención de contagios, deteniendo las actividades no esenciales y limitando las esenciales, afectando así la economía mundial. Una de las principales causas de la dificultad de establecer cercos sanitarios efectivos, es que existe un alto índice de pacientes asintomáticos, lo que retrasa la detección y tratamiento de los enfermos. Sin contar conque, dado que dichas medidas de contención tienen repercusiones importantes en la salud mental y emocional de la población, las personas con síntomas leves o nulos encuentran difícil permanecer aislados (Jayamohan et al. , 2020; Mathuria et al. , 2020; Weissleder et al. , 2020). Durante la pandemia, la comunidad científica ha trabajado sin descanso para conocer más sobre la enfermedad y la respuesta fisiológica, psicológica y social de los seres humanos a esta infección. Uno de los primeros avances importantes fue la genotipificación y descripción del SARSCoV2, posteriormente y aún en ello, la comprensión del mecanismo de patogenicidad. Estructura y mecanismo de patogenicidad del SARSCoV2 ElSARSCoV2 pertenece a la familia de los coronavirus(CoV). La secuenciación de genes de los CoV y los estudios de su zoonosis (cuando enfermedades infecciosas pasan de animales a humanos) hasta ahora han permitido reconocer cuatro géneros, Alpha coronavirus, Beta coronavirus, Gamma coronavirus y Delta coronavirus. Los CoV Alfa y Beta se originan en los murciélagos e infectan únicamente a los mamíferos, mientras que los CoV Gamma y Delta infectan principalmente a las aves (Barik, 2021). En particular, siete de estos virus están relacionados con la enfermedad humana, denominada coronavirus humano (HCoV). Cuatro HCoV (los AlfaCoVHCoV229EyHCoVNL63 y los beta coronavirus HCoVHKU1 y HCoVOC43) suelen causar infecciones leves y autolimitadas de las vías respiratorias con altas tasas de morbilidad. Los otros tres HCoV categóricamente dañinos son el SARSCoV, el coronavirus del síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERSCoV) y el SARSCoV2. El SARSCoV ya no circula en humanos. El MERSCoV persiste en humanos en Oriente Medio, mientras que el SARSCoV2 sigue haciendo estragos en humanos en todo el mundo y ha causado un impacto perjudicial en la salud y sociedad mundial (Rezaei, 2021). El SARSCoV2 es un virus de RNA que contiene aproximadamente de 27 a 32 kb de RNA monocatenario de sentido positivo (+ssRNA). Los beta CoVs tienen al menos seis marcos abiertos de lectura (ORF) y muchos otros genes accesorios. El número, la ubicación y la identidad de los ORFs son variables entre los diversos géneros y virus. En el extremo 5’ terminal, dos tercios del genoma consta de dos ORF; ORF1 y ORF2. Estos ORF codifican para dos poliproteínas, Pp1a y Pp1ab, y se esconden adicionalmente en 11 y 16 proteínas, respectivamente. En el extremo 3’ terminal se encuentran los genes que codifican para diversas proteínas estructurales, como la nucleocápside(N), la proteína de membrana(M), la proteína de la envoltura (E) y la proteína espiga (S), que a su vez son esenciales para el mecanismo viral de patogenicidad (Barik, 2021; Jayamohan et al. , 2020;Mathuria et al. , 2020). A través de la secuenciación del genoma viral del SARSCoV2 se ha revelado información importante con la que se identificaron las variaciones genómicas que diferencian al SARSCoV2 de otros CoVs. El SARSCoV2 posee un 80% de similitud con el SARSCoV en su secuencia genómica, porcentaje que disminuye al compararlo con otros CoV (Rezaei, 2021). La identificación de dichas variaciones, ha permitido el desarrollo de cebadores y sondas utilizados para la detección específica del SARSCoV2, causante de la pandemia actual (Barik, 2021; Jayamohanetal. , 2020; Mathuria et al. , 2020).