Actualización del alineamiento y comparación de la estructura primaria de la subunidad zeta como inhibidor de la F1Foatpasa de ÃŽÂ±proteobacterias 
Autor: Erick Enrique Herrera Romo
Año: 2021
Carrera: Química Farmaceútico Biológica

La existencia de cualquier forma de vida depende intrínsecamente de la cantidad de energía que tenga disponible para llevar a cabo sus funciones vitales, siendo autótrofos si generan su propia energía (como las plantas al hacer fotosíntesis) o heterótrofos si la obtienen al consumir otros seres vivos. Es en este sentido que la generación de energía a nivel interno de un organismo es uno de los procesos más importantes para el buen funcionamiento del mismo. Además de la glucólisis o la fermentación, la manera por la cual los seres vivientes obtienen la mayoría de su energía es por medio de la fosforilación oxidativa ofotofosforilación. Fue Mitchell en 1961 quien propuso en su Teoría Quimiosmótica que la difusión de iones (más específicamente un gradiente de protones) a través de la membrana interna mitocondrial y la membrana de los tilacoides de los cloroplastos, podría proveerlaenergía para sintetizar ATP. Debido a esto sería galardonado con el premio Nobel de Química en 1978 (Mitchell, 1961). No obstante, el mecanismo central de estos procesosfue durante mucho tiempo un misterio para la Bioquímica hasta que en1997 finalmente fue dilucidadoel mecanismo de la síntesis del ATP(Gresser etal, 1982; Boyer, 1997). El Dr. Paul D. Boyer fue quien propuso el mecanismo rotacional de catálisis de laATPsintasa denominándolo de “cambio de unión” o de “sitios alternantes”, mientras que John Walker aportó la evidencia estructural (Abrahams, 1994) que apoyó, mas no comprobó, la hipótesis de los ciclos alternantesde Boyer. El ATP como molécula energéticaAlgo que todaslas células de todos los seres vivos conocidos tienen en común es que absolutamente todas utilizan al adenosíntrifostato, mejor conocido como ATP, como fuente de energía para realizar sus funciones, desde proveer energía para la síntesis de metabolitos, hasta suministrar energía para la replicación(Dunn & Grider, 2020). Tal como se muestra en la Figura 1, una molécula de ATP está constituida por la unión de una base nitrogenada (adenina), un azúcarde cinco carbonos(ribosa) y tres grupos fosfatodenominados α, βy γ, en orden del más cercano al más lejanocon respectoa la ribosa. A la unión de adenina y ribosa se le conoce como adenosina. Los enlances fosfoanhídrido del ATP constituyen la fuente de energía de la célula, siempre y cuando se acumule suficiente concentración de ATP intracelular (respecto a las de ADP y Pi) para que su hidrólsis pueda proveer de energía a las células; no obstante, no todos los enlaces que unen a los fosfatos (enlaces de fosfoanhídrido) proporcionan la misma cantidad de energiaal hidrolizarse. Enla célula, hay gran diferencia de concentración entre el ATP yel ADP(y el fosfato inorgánico Pi), superando el ATP unas 3000 veces la del ADPy el Pi. Desde que en 1929 se descubrió que el ATP es el sustrato para la contracción muscular, el conocimiento que se posee sobre esta molécula se ha expandido considerablemente. Ahora se sabe que el ATP sirve para mantener procesos dependientes de energía tales como la síntesis de macromoléculas, transporte de iones, etc. Esto ocurre debido a procesos de oxidación de “combustibles metabólicos” tales como carbohidratos, lípidos y proteínas. Estos procesos de oxidación culminan con la producción de energía libre que se almacena en enlaces de alta energía de fosfoanhídrido en moléculas como el ADP, el ATP, fosfoenolpiruvato, 2, 3bisfosfoglicerato y otros fosfágenos como la fosfoarginina y la fosfocreatinina (Bonora et al, 2012).