El segundo inquisidor fue el licenciado don Alonso Fernández de Bonilla, quien fue obispo electo del Nuevo Reino de Galicia o Jalisco, y después partió como visitador al reino del Perú.
Auh yehuatl ycome inquisidor mochiuhtzino yn licenciado don Alonso Fernández de Bonilla, ca onixquetzalloca ompa obispo mochiuhtzinozquia in yancuic yn motenehua del Nuevo Reyno de Galicia Xalixco, yhuan çatepan mohuicac ynic visitador mochiuhtzinoto yn ipan tlahtocaaltepetl Pirú.