El miércoles 3 de mayo de 1600, fiesta de la Santa Vera Cruz, llegó la noticia de que el arzobispo don Alonso Fernández de Bonilla había muerto en Perú, y enseguida todas las campanas comenzaron a tocar a muerto; siguieron tocando por algunos días, y luego se dijo misa por él en la iglesia mayor.
Miércoles a III de mayo de 1600 años, huel ipan yn Sancta Vela Cruz ylhuitzin, yquac acico yn itlahtollo arçobispo don Alonso Fernández Bonilla ynic ompa omomiquilli Perú, auh niman yc peuh in nohuian tzillin campana yn miccatepoztli; achi quezquilhuitl in tlatzillin, auh çatepan missa ypan mito yn iglesia mayor.