No obstant això, malgrat els progressos realitzats, les regions espanyoles de l'objectiu núm. 1 mostren encara importants manques i febleses derivades de factors com ara la petita dimensió del sistema « Ciència-Tecnologia-empresa», l'escassa transferència de resultats dels centres de recerca a les empreses, la falta d'adequació entre el sistema públic de recerca, desenvolupament i innovació i les necessitats del sistema productiu, l'insuficient desenvolupament de les fonts de finançament innovadores, la necessitat de millorar els procediments d'avaluació i de seguiment, en poques paraules, de la feblesa de la cultura científic i tècnica.