S'ha descobert també que la incineració de residus no perillosos és la major font coneguda d'emissions de dioxines i furans a l'atmosfera; la Directiva representarà una reducció d'emissions procedents de tots els incineradors de la Comunitat per a aquestes substàncies de 2.400 grams anuals en 1995 a només 10 grams després de la seva plena execució en 2005.