L'objectiu de les mesures de coexistència en les zones en les quals es conreen OMG és impedir la presència accidental de OMG en altres productes, evitant les possibles pèrdues econòmiques així com l'impacte de les restes de cultius modificats genèticament en els cultius d'un altre tipus, com ara els cultius convencionals i els ecològics.