Entre les modificacions del funcionament de l'Agència figuren la publicació d'un informe quinquennal en lloc de triennal sobre Estat del Medi Ambient, recolzat per informes d'indicadors sobre qüestions concretes; major obligació dels Estats membres de cooperar amb l'Agència en la seva recollida de dades i desenvolupament d'una col·laboració intensificada amb altres organismes internacionals i institucions de tercers països.