Karşıt boyama
ile gram-pozitif şarbon bakterisi]]
Karşıt boyama, counterstaining veya kontrast boyama, mikroskop altında yapıları daha net görülebilmesi için preparatı kullanılan ana boyaya zıt renkte boyayarak kontratı arttıran boyama tekniğidir. Gimenez boyama tekniğinde fuksin boyasının karşıt boyası olan Malahit yeşili ve H&E boyasında hematoksilinin karşıt boyası olan eozin, karşıt boyalara örnektir. Gram boyama tekniğinde kristal viyole boyası sadece Gram pozitif bakterleri boyarken karşıt boya olan ve tüm hücreleri boyayan safranin boyası da kullanılır ve böylece Gram negatif bakterilerin tespiti mümkün olur.