मुखर्जी यांनी 10 मे 1953 रोजी एक देश में दो विधान दो प्रधान आणि दो निशान नहीं चलेंगे (एका देशात दोन राज्यघटना दोन पंतप्रधान आणि दोन झेंडे असू शकत नाही) असा नारा देत जम्मूकाश्मीर सीमेवर सरकारच्या प्रवेशपरवान्याच्या आदेशाचा भंग केला होता आणि या घटनेनंतर त्यांना अटक अटक करण्यात आली होती