श्री मुखर्जी के पास व्यापक राजनयिक अनुभव है और उन्होंने अंतर्राष्ट्रीय मुद्रा कोष (आईएमएफ) विश्व बैंक एशियाई विकास बैंक एवं अफ्रीकी विकास बैंक जैसे बहुपक्षीय संस्थाओं के बोर्ड ऑफ गवर्नर के रूप में कार्य किया है।