एनएचआरसी का शासनादेश मानव अधिकारों की सुरक्षा व प्रचार के लिए काम करना और ऐसी शिकायतों का संज्ञान लेना है जहां सरकारी अधिकारियों के कार्यों अकर्मण्यता या गलतियों की वजह से प्रथम दृष्टतया या कथित तौर पर मानव अधिकार का उल्लघंन हुआ है।