एससीओ का सहयोग को लेकर व्यापक एजेंडा है जिसमें आतंकवाद अलगाववाद एवं उग्रवाद से मुकाबला करने से लेकर संपर्क वाणिज्य कस्टम कानून स्वास्थ्य एवं कृषि में सहयोग बढ़ाने पर्यावरण की सुरक्षा करने एवं आपदा जोखिम के न्यूनीकरण और लोगों के बीच आपसी संपर्क को बढ़ावा देना शामिल है।