जेजेएम के तहत पानी की गुणवत्ता की निगरानी के एक भाग के रूप में रासायनिक मापदंडों के लिए हर स्रोत का परीक्षण करने और बैक्टीरियलॉजिकल संदूषण (मानसून पूर्व और बाद में) के लिए एक वर्ष में दो बार परीक्षण करने का प्रावधान किया गया है।