पारंपरिक फ्लोरोफोरस की तुलना में क्वांटम डॉट्स में क्वांटम दक्षता फोटो और रासायनिकस्थिरता के संदर्भ में फायदे हैं और उनकी विषाक्तता को एक सतह कोटिंग से निपटा जा सकता है। यह मल्टीस्पेक्ट्रल बायोइमेजिंग के दौरान विभिन्न ऑर्गेनेल को लक्षित करते हुए विभिन्न बायोमार्करों के संयुग्मन की संभावना को बढ़ाता है।