योजना को लागू करने के शुरूआती स्तर पर पांच राष्ट्रीय आयुष संस्थानों तथा 42 आयुष संस्थानों को इस काम में मदद करने की जिम्मेदारी सौंपी गई है जिसके तहत इन संस्थानों को आयुष की दवाओं का लिखित रिकॉर्ड बनाने उनका विश्लेषण करने ऐसे दवाओं के दुष्प्रभावों का आकलन कर उनका रिकॉर्ड तैयार करने तथा आयुष दवाओं के सेवन से जुड़ी अन्य गतिविधियों का रिकॉर्ड भी रखने का काम करना है।