पूर्वोत्तर के विभिन्न राज्यों में ट्रकों के आवागमन में नियमित रूप से सामने आने वाली चुनौतियों के अलावा एफसीआई को राज्यों की सीमाओं और देशव्यापी लॉकडाउन के कारण विभिन्न मार्गों पर लगाए गए प्रतिबंधों से भी जूझना पड़ा।