Title: イレギュラーハンターX (Mega Man Maverick Hunter X)
Section: 登場キャラクター
Subsection: ボスキャラクター

=斜体は異名。性格や設定、細部のデザインがオリジナル版から一部変更されている。多くはオリジナル版にはない攻撃が存在する。シグマパレスでは破壊されたボディを至急復元され、人格などが不完全の状態で再登場する。雪原の皇帝 アイシー・ペンギーゴ（Icy Penguigo）声 - 石野竜三ペンギン型レプリロイド。元々第13極地部隊所属。語尾に「クワッ」と付けて喋る。その異名通り吹雪や氷を使った攻撃方法を得意とする。変化のない極地暮らしに退屈しきっていたが、シグマの応援要請を受け、第17精鋭部隊と行動を共にするようになる。そのためエックスとも顔馴染みで、彼の甘さには苛立ちを覚えていた。自分の能力を高く評価して招き入れたシグマを"様"付けするなど慕っており、それゆえ反乱時にもシグマ側につくこととなる（オリジナル版のように第13部隊の隊長を殺害した上で反乱に加わったかどうかは不明）。小さい体で任務がこなせるように思考回路は柔軟に作られているらしいが、それが周囲にはひねくれ者と思われる原因となっている。パワーばかりを誇るナウマンダーとは犬猿の仲だった。またエックスに対し抱いた感情はヴァヴァのそれと似通っている。ノーマルモードではオリジナル版と変わらないが、ハードでは新たに大ジャンプしながら反対側の壁に（Xの特殊武器と同様の性能の）ショットガンアイスを3発撃つ攻撃が追加され、オリジナル版より格段に強くなっている。。なお、上述の設定からOVAでもエックスやゼロ、自身が指揮するP中隊らと共同作戦を行う場面があり、エックスの甘さが原因で危うく作戦が失敗しそうになったことで不満を見せる場面がある。深海の武装将軍 ランチャー・オクトパルド（Launcher Octopuld）声 - 太田哲治タコ型レプリロイド。元第6艦隊所属。銃火器で全身を武装し、狙った獲物は決して逃さず、常に「手数の多さ」でイレギュラーたちを圧倒していた。性格が原作と異なって軍事の知識に長けた頭脳派になっており、口調も丁寧。作戦や戦闘に美しさを求め、美しく戦うことに至上の喜びを感じ、エックスとの会話では自らを「水中戦闘のアーティスト」と称している。長らく周囲に理解されてこなかったが、シグマにその美意識を認められたことから、反乱に加わることとなる。蜂起後は海上都市を襲い、海路を遮断していた。本作ではブーメル・クワンガーに代わって彼がボスラッシュの第一番手を務めている。幽林の妖撃手 スティング・カメリーオ（Sting Chameleao）声 - 下崎紘史カメレオン型レプリロイド。第9特殊部隊「別名：レンジャー部隊」の元副隊長。「にににに」という口癖がある。いかなる場所にも適応可能な保護色能力を持つ部隊きっての実力者だが、任務遂行のためには手段を選ばず、その行き過ぎた合理主義思想から卑怯者扱いを受けていた。シグマにその実力を純粋に買われ協力を持ちかけられたことから、シグマの反乱軍へ身を投じることとなる。密林の前線基地の警備を担当していた。オリジナル版から新たに地上でカメレオンスティングを撃つ攻撃が追加された。また、戦闘時にあった天井のトゲは降らせる時だけ発生し、降らせ方も異なっている。VAVAモードにて、ヴァヴァを一応は尊敬していたらしいが、ヴァヴァは「お調子者」と一蹴する会話が見られる。鋼鉄の甲弾闘士 アーマー・アルマージ（Armor Armarge）声 - 三宅健太アルマジロ型レプリロイド。元第8機甲部隊隊長。鉄壁の防御力を誇る装甲を纏う。武人肌の堅物で、イレギュラーハンター部隊の指揮権を全てシグマに掌握されたことから、彼を上官と判断。「上官の命令は絶対」として反乱に参加する。「上官の判断に対する責任は上官にあり、上官の命令について部下が疑念を挟むことは間違っている」と考えている（ただ、エックスにイレギュラーだといわれた際「我々はどちらも間違っていないということだ」と発言しており、エックスの考えにも理解は示している）。蜂起後は兵器の原料の採れる鉱山を占拠した。デザインはほぼオリジナル版そのままだが、腕の装甲が籠手から手持ちの盾に変更された。オリジナル版から新たに突進中に四方に弾を撃つ攻撃が追加された。また、突進の軌道も「壁や地面を反射する」「壁沿いや地上を時計周りに周回する」2種類となり、前者は反射角度も数パターン存在する。灼熱のオイルタンク バーニン・ナウマンダー（Burnin' Noumander）声 - 三宅健太ナウマン象型レプリロイド。反乱以前は第4陸上部隊の隊長として中東で戦っていた。動きこそ鈍重だが、圧倒的な火力を有し、その武力を以って第4陸上部隊を束ねていた。その実力を今まで以上に試す機会だと判断し、シグマの反乱に加わり、工場地帯を大規模な兵器生産工場にしようとした。トボけた外見とは裏腹に、自分より力の劣る相手は徹底的に潰すという残虐な面を持っている。そのため部下にも嫌われていたらしく、反乱の際には誰一人として共に反乱へ加わることはなかった。彼のみ倒した際の爆発エフェクトが異なっている。オリジナル版から新たに、着弾時に画面上端まで届く火柱を発生させる炎を撃つ攻撃が追加された。天空の貴公子 ストーム・イーグリード（Storm Eagleed）声 - 佐々木大輔（現：景浦大輔）鷲型レプリロイド。第7空挺部隊の隊長を務めていた。人望と正義感に厚く、当初は反乱を起こしたシグマとも対立していたが、直接対決で敗れ、その軍門に降ってしまう（エックスがカメリーオと対峙した時の発言から、その際に部下を人質に取られた可能性がある）。その後、第7部隊旗艦であり彼の乗艦であるデスログマーは反乱軍の空中要塞となり、空路を遮断するため空港を制圧、エックスらの前に立ちはだかる。エックスはイーグリードのことを尊敬していたようで、敵の中で唯一「あなた」と呼んだり反乱の加担に動揺していたが、ヴァヴァは「したり顔が気に入らない」とイーグリードに対し嫌悪を見せている。オリジナル版から新たに羽ばたきの最中に羽のようなものを上空から複数個落下させる攻撃が追加された。また、上空からの突撃の軌道が、下まで突き抜けず甲板スレスレで急上昇するように変更されている。OVAではゼロと親しく会話を交わす場面がある。豪速拳の雷王 スパーク・マンドリラー（Spark Mandriller）声 - 長嶝高士マンドリル型レプリロイド。元々第17部隊所属。隊長であったシグマに従う形で反乱に参加し、その圧倒的な戦闘力で巨大発電所を占拠した。拠点制圧は部下に任せ自分はごろ寝を決め込んで好物の電気を貪り食っている。会話では気だるそうにゆっくりと喋る。難しいことを考えるのは苦手で、シグマに賛同した動機も単に「間違っているようには見えなかったから」と短絡的なものだった。一方でシグマが狂っていると思うかエックスに質問し、イレギュラーと返答された際に「隊長が正しくてお前が間違ってると思ったことはないか？」と問いかけ（エックスは答えられていない）、答えは戦いで分かるかもしれないと話している。オリジナル版ではその異名通り、高速のダッシュパンチを得意技としていたが、本作では腕を巨大なドリルに変形させてからパンチを繰り出すようになっており、技の出も遅くなっている。時空の斬鉄鬼 ブーメル・クワンガー（Boomer Kuwanger）声 - 泉尚摯（現：いずみ尚）第17精鋭部隊所属のクワガタ型レプリロイドであり、エックスの同僚である。ランチャー・オクトパルドと同じ、丁寧な口調で話す。行動が素早く、人間はおろかレプリロイドでさえ目に見えない速さで動き、イレギュラーたちから恐れられていた。また、頭部のハサミで相手を捕まえてそのまま天井に投げ上げるなど、細身の体に似合わぬ怪力の持ち主でもある。蜂起後は都市のシンボルになるはずだったタワーを制圧して、侵入者を迎え撃つ要塞に作り変えた。頭部のブーメランカッターのデザインが、実際のクワガタの顎同様の形状になっている。オリジナル版とは違い、性格が気分屋から正義や悪といった概念を持たない頭脳派に変更されており、それに伴ってシグマの反乱に参加した動機も「どちらがレプリロイドの未来のためとなるか、冷静な分析の結果判断した」ということになっている。発言の内容から、シグマと同じようにエックスの無限の可能性に気付いていることが分かる。