Title: ぷよぷよBOX (Puyo Puyo Box)
Section: ぷよBOXモード
Subsection: ごちゃまぜぷよぷよ

=試合開始前に4つのスタイル（ルール）から選択し、「ぷよぷよ〜んスタイル」を選んだ場合は続けて使用特技も選択する。カーソルのデフォルトは「ぷよぷよ通スタイル」。「ひとり」では一度コンティニューするまで、「ふたり」「みんな」では設定本数を消化して試合に決着をつけるまで、スタイルおよび使用特技の途中変更はできない。それぞれが使用しているスタイルはNEXTぷよの付近に表示され、「ぷよぷよ〜んスタイル」の場合は特技ゲージも同時に表示される。ぷよぷよスタイル全消しボーナスが存在せず、相殺も行われない。このため、自分のフィールドにおじゃまぷよの予告がある状態でも、それを貫通して相手におじゃまぷよを送り込むことができる。ただし、自分が他のスタイルの相手に送ったおじゃまぷよは相手の攻撃で普通に相殺される。また、同じ連鎖数でも他のスタイルと比べてより多くのおじゃまぷよが発生するように設定されている（レートが低く、攻撃力が高い）。初代『ぷよぷよ』の時点では存在しなかったNEXT2ぷよやクイックターンは、「ぷよぷよスタイル」では他のスタイルと同様に使えるようになっている。ぷよぷよ通スタイル相手からのおじゃまぷよ予告を自分の連鎖で発生させたおじゃまぷよで相殺できる。相殺しきれなかった分のおじゃまぷよはぷよを消した直後にすぐ落下する。また、自分のフィールド内のぷよをすべて消すと「全消し!」の文字が次にぷよを消すまで表示され続け、次回の攻撃に全消しボーナスとしておじゃまぷよの発生量が上乗せされる。ぷよぷよSUNスタイル相殺すると日輪相殺が起こり、自分のフィールドに予告されたおじゃまぷよが残っていても、その代わりに相殺した回数分の太陽ぷよが自分のフィールドに降ってくる。このため、相殺すればおじゃまぷよの落下を1手分保留できる。原作『ぷよぷよSUN』とは違い、「自分が相殺した」場合のみ自フィールドのみに太陽ぷよが発生し、「相手に相殺された」場合は太陽ぷよが発生しない（「ぷよぷよSUNスタイル」同士の対戦でも同様）。発生タイミングもアーケード版及びアーケード版準拠で移植された機種とは異なり、ゲームボーイ版『ぽけっとぷよぷよSUN』と同じく相殺に対して即座に反応するようになっており、落下位置の予告（光の柱）は出なくなっている。太陽ぷよの落下位置はアーケード版などの『ぷよぷよSUN』同様、左から1列目より規則性を持って順番に降る（一方で、おじゃまぷよの落下位置には規則性が無い）。全消しをした時のおじゃま上乗せボーナスはアーケード版同様に無いが、代わりに全消し完了時の連鎖数と相殺数に応じた太陽ぷよが自分のフィールドに落下する（発生量こそ異なるが、ゲームボーイ版のように相殺分も合算される）。太陽ぷよは得点ぷよに類似した性質だが、より大きな連鎖に絡めて消すほどおじゃまぷよの発生量が増加する。ただし太陽ぷよの威力は原作に比べて弱く調整されている。ぷよぷよ〜んスタイル相殺と全消しボーナスは「ぷよぷよ通スタイル」と同様だが、スタイル選択時に様々な特技からいずれか1つを選択し、ゲージを消費して試合中にその特技を発動できる。特技のシステムは、ドリームキャスト・NINTENDO64・PlayStation版の『ぷよぷよ〜ん』（以下、DC版）のシステムとゲームボーイカラー版『ぽけっとぷよぷよ〜ん』（以下、GBC版）のシステムを双方混ぜ合わせたようなものとなっており、どちらとも内容が異なる。また、このスタイルでは組ぷよの落下アニメーションが他のスタイルと異なり、ぷよの移動がスムーズになっており、組ぷよ操作時やぷよをちぎった場合の落下速度が他のスタイルより少し遅めになっている。試合中にぷよを消すと特技を使うためのSPゲージが貯まり、最大3本分までゲージがストックされる（GBC版と同様のゲージ型だが、最大値はDC版と同じくSP3.0相当）。ゲージが1本以上貯まっている状態で、組ぷよを操作中に特技発動ボタンを押すと、落下中の組ぷよが画面外へ切り捨てられる（DC版同様にその組ぷよは消滅）と同時にゲージを1つ消費して特技が発動する。GBC版と同じく、特技によって試合開始時に貯まっているゲージの量とぷよを消した時の貯まり具合が異なり、効果の大きい特技ほどゲージが貯まりにくい。原作とは異なり、試合終了時のゲージの蓄積量は次の試合にそのまま持ち越され、1試合中に特技を何度使ってもゲージの貯まる割合が減少することはない。なお、相手フィールドに効果を及ぼす特技の場合は相手が組ぷよを設置した直後に発動するが、予告ぷよや日輪相殺の太陽ぷよがあった場合はそれに割り込む形で特技の発動のみが行われ、そのターンには相手のおじゃまぷよが降らなくなる（相手の組ぷよ設置 →特技効果発動→組ぷよ（→日輪相殺で太陽ぷよ落下→組ぷよ）→おじゃまぷよ落下、のようになる）。GBC版では「フリーズ」などフィールドのみに効果が及ぶ特技の場合はおじゃまぷよ落下と同時に発動していたが、本作では全て割り込みで単体発動するように変更されている。また、特技によって発動した連鎖は攻撃力が弱く調整されている。本作に用意されている27種類の特技は、従来のDC版（N64版・PS版含む）やGBC版とは異なる内容となっており、特技の内容や名称自体は主にGBC版のものがベースだが、他機種版の要素も混ぜたものとなっており、本作独自のラインナップとなっている。また、GBC版で同名の特技がある場合も効果が若干異なり、本作での変化系の特技はぷよの無い空間には一切効果を及ぼさず、特技の効果の及ぶ「おじゃまぷよ」には固ぷよも含まれるが、太陽ぷよは含まれない。テレポート・トランスファー・ネオトランスファーといった転送系の特技については、相手がこれらの特技を使ってきた際、降らされた色ぷよは同色4個以上並んでもそのターンでは消えず、1回組ぷよを設置して初めて連結して消える(既にあった色ぷよと合わせて同色4個以上並んだ場合も同様)。またGBC版で特技により登場していた鉄ぷよ・壁・びっぐぷよ及び組ぷよの代わりに登場していたお助けキャラとしてのカーバンクルは、このぷよぷよBOXでは一切登場しない。スラッシュ他のプレイヤーのフィールド内のどこか横1段にあるぷよをすべておじゃまぷよに変える。ネオスラッシュ他のプレイヤーのフィールド内のどこか横1段にあるぷよをすべて固ぷよに変える。シェゾ・ウィグィィが使用。ブレイク他のプレイヤーのフィールド内で一番低い列にあるぷよを縦1列すべておじゃまぷよに変える。ネオブレイク他のプレイヤーのフィールド内で一番高い列にあるぷよを縦1列すべておじゃまぷよに変える。ルルーが使用。フリーズ他のプレイヤーのフィールド内にあるおじゃまぷよをすべて固ぷよに変える。ドラゴンが使用。GBC版における「フリーズ」とほぼ同様の特技内容。ソリチュード他のプレイヤーのフィールド内で孤立している色ぷよをすべておじゃまぷよに変える。ブラックキキーモラが使用。ピンポイント自分を含む全プレイヤーのフィールドに、特技使用時に自分の組ぷよ（軸ぷよ）があった列へおじゃまぷよを1個降らせる。アーちゃんが使用。ソーラーレイ自分を含む全プレイヤーのフィールドに、特技使用時に自分の組ぷよ（軸ぷよ）があった列へ太陽ぷよを1個降らせる。ストライク他のプレイヤーのフィールドに相殺不可のおじゃまぷよを6個降らせる。ダブルストライク他のプレイヤーのフィールドに相殺不可のおじゃまぷよを12個降らせる。ハードストライク他のプレイヤーのフィールドに相殺不可の固ぷよを6個降らせる。インキュバスが使用。テレポート自分のフィールド内のぷよを各列上から3個ずつ、他のプレイヤーのフィールドにそのまま転送する。パノッティが使用。トランスファー自分のフィールド内の色ぷよを各列上から2個ずつ、他のプレイヤーのフィールドにそのまま転送し、その色ぷよの上に乗っていたおじゃまぷよをすべて消す。サタンが使用。ネオトランスファー自分のフィールド内の色ぷよを各列上から4個ずつ、他のプレイヤーのフィールドにそのまま転送し、その色ぷよの上に乗っていたおじゃまぷよをすべて消す。バリア自分のフィールドに予告されたおじゃまぷよの落下を5秒間防ぐ。アルル・ナジャが使用。DC版における「るいぱんこ」に類似（おじゃま落下防止時間は異なる）。ハイパーバリア自分のフィールドに予告されたおじゃまぷよの落下を20秒間防ぐ。ドッペルゲンガーアルルが使用。DC版における「ヴォイドホール」に類似（おじゃま落下防止時間は異なる）。レジスト10ターン（組ぷよを10組落とすまで）の間、自分のフィールドに予告されたおじゃまぷよが1個ずつしか降らなくなる。スプリット自分のフィールド内の中央縦2列のぷよをすべて消す。ドラコが使用。スライス自分のフィールド内の奇数段のぷよを1段おきに横7段分すべて消す。ラグナス・ビシャシが使用。ヒーリング自分のフィールド内の各列上から5個ずつまでのおじゃまぷよを消す。スイープ自分のフィールド内にあるおじゃまぷよをすべて消す。キキーモラが使用。DC版における「お掃除大作戦」とほぼ同様の特技内容。カット自分のフィールド内の5段目以上にあるぷよをすべて消す。ミノタウロスが使用。ワイルドカード自分のフィールド内にあるおじゃまぷよをすべてランダムな色ぷよに変える。ハーピーが使用。DC版における「変わるわよ〜」に類似した特技内容。シンパシー自分のフィールド内で孤立している色ぷよをすべて同じ色ぷよに変える（どの色に変わるかはランダム）。セリリが使用。DC版における「みんな仲良くしてね」及びGBC版における「シンパシー」とほぼ同様の特技内容。サンダー自分のフィールド内で、特技使用時に組ぷよ（軸ぷよ）があった列のぷよを縦1列分すべて同じ色ぷよに変える。ウィッチが使用。パラレルウェーブ自分のフィールド内のどこか横2段にあるぷよを各1段ずつすべて同じ色ぷよに変える（各段ごとに色はランダム）。のほほが使用。トリプルウェーブ自分のフィールド内のどこか横3段にあるぷよを各1段ずつすべて同じ色ぷよに変える（各段ごとに色はランダム）。チコが使用。