shintaro-ozaki/entity-explanation huggingface dataset:
Title: アッカーマンシア・ムシニフィラ (Akkermansia muciniphila)
Section: ヒトの代謝

アッカーマンシア・ムシニフィラはヒトにおいて抗炎症作用を有すると考えられており、研究はアッカーマンシア・ムシニフィラの定着と虫垂炎または過敏性腸症候群、炎症性腸疾患(IBD)などの炎症状態との間に逆相関を示している。ある研究では、アッカーマンシア・ムシニフィラの存在の減少は、虫垂炎の重症度の増加と相関していた。別の研究では、過敏性腸症候群や炎症性腸疾患(IBD)の患者は、これらの病気を有しない者よりも、腸管でアッカーマンシア・ムシニフィラの存在が少ないことが判明した。研究者らは、アッカーマンシア・ムシニフィラが肥満及び2型糖尿病に対抗するために利用できる可能性があることを見出した。この研究は、痩せたマウスよりも3倍多くの脂肪がつくように飼育されたマウスで行われた。肥満マウスにこの細菌を与えて飼育したところ、餌を変更することなく肥満マウスの脂肪量を半減させることが示された。2015年6月に発表された研究では、過体重あるいは肥満の成人におけるアッカーマンシア・ムシニフィラの存在量とインスリン感受性及びより健康な代謝状態との関連性が示された。アッカーマンシア・ムシニフィラを豊富に有し腸内微生物の豊富さを有する被験者がより健康であった。さらに、この研究は、基本的にアッカーマンシア・ムシニフィラの存在量を増やすことは、体重減少とその後のより大きな健康上の利点と関連することを示していた。この細菌は通常はヒトの消化管に3-5％存在するが、肥満している場合にはこの比率が低下していることが判明している。この細菌が腸内で繁殖すると、腸の壁の厚さが増し、ムチンが増え、食物が身体に吸収されることが妨げられると考えられている。2015年8月には、食物の脂肪の種類が、消化器官の他の細菌と比較してアッカーマンシア・ムシニフィラの成長に影響を及ぼすことが示された。研究者らは、マウスに脂肪の種類が異なる食餌を与えたが、それ以外の点では同一の食餌を与えた研究を行った。一方の群はラードを摂取し、他方の群は魚油を摂取した。11週間後、魚油食を摂取した群はアッカーマンシア・ムシニフィラ及びラクトバシラス属の細菌が増加したが、ラード食を与えた群はアッカーマンシア・ムシニフィラ及びラクトバシラス属のレベルが低下した。本来の腸内細菌を抗生物質で根絶して魚油食またはラード食で飼育したマウスから糞便移植を行い、新しい群のマウスで試験を行った。これら両方のマウスの全てにラード食を与えた。同じ量のラード食を3週間与えたにもかかわらず、ラード食飼育マウスの糞便移植を受けたマウスは乳酸菌のレベルが上昇し、炎症レベルが上昇したが、魚油食飼育マウスの糞便移植を受けたマウスはアッカーマンシア・ムシニフィラが増加し炎症のレベルが低下した。研究者らは、アッカーマンシア・ムシニフィラの増加は、摂取した脂肪の種類、腸内細菌の組成及び炎症レベルと関連した炎症の減少に対応すると結論付けた。
Title: ラクノスピラ科 (Lachnospiraceae)
Section: abstract

ラクノスピラ科（Lachnospiraceae）は、様々な植物由来の多糖類を短鎖脂肪酸（酪酸、酢酸）及びエタノールに発酵させるクロストリジウム綱に属する嫌気性の芽胞形成の細菌の科である。これらの細菌は、ウシの第一胃 及びヒトの腸内細菌叢で最も豊富な細菌群の1つである。この科に属する菌は、酪酸を生産することによってヒトの結腸癌を防止する可能性がある。ラクノスピラ科は、無菌マウスに移殖することで糖尿病を引き起こすことがわかっている。
Title: ウリミバエ (Bactrocera cucurbitae)
Section: abstract

ウリミバエ（瓜実蠅、学名: Bactrocera cucurbitae）は、ハエ目（双翅目）ミバエ科に属するハエの一種。東南アジア原産。日本では南西諸島に外来種として侵入して重要な農業害虫となったが、不妊虫放飼法により根絶された。日本の侵略的外来種ワースト100に選定されている生物で、唯一根絶に成功した種である。
Title: ウリミバエ (Bactrocera cucurbitae)
Section: 分布

東南アジア原産。アフリカの一部、インド、オーストラリア、ミクロネシア、ハワイといった広い地域に分布が拡大している。
Title: ウリミバエ (Bactrocera cucurbitae)
Section: 特徴

体長7-8mm。孵化してから20 - 30日ほどで成虫になり、10日ほどで交尾を行い、メスは腹の先にある産卵管を果実に突き刺し、その中に卵を産み付ける。一生（2 - 3箇月）で1000個以上の卵を産むといわれている。その名のとおりスイカやキュウリなどのウリ類を食べるが、他にもツルレイシ（ゴーヤー）、トマトやピーマン、パパイヤといった様々な植物へ加害する。野生植物も宿主とし、沖縄ではオキナワスズメウリがよく宿主となる。
Title: ウリミバエ (Bactrocera cucurbitae)
Section: 外来種問題

日本では、1919年に八重山列島で初めて存在が確認され、その後も1929年に宮古列島、1970年に久米島、1972年に沖縄本島、1973年に与論島と沖永良部島、1974年に奄美群島、1977年に大東諸島と分布が拡大していった。ウリミバエはウリ類などの農作物に深刻な被害を発生させる。日本生態学会では、本種を日本の侵略的外来種ワースト100に選定している。これ以上の分布拡大を阻止するため、植物防疫法によって発生地から本種の寄生植物の移動が規制されている。ウリミバエを防除する方法として、不妊虫放飼と呼ばれる手段がとられた。これは、羽化2日前にガンマ線を照射して不妊化した飼育個体を大量に野外へ放虫し野生個体の繁殖を阻止する方法で、個体数を減らし、最終的に根絶を目指すものである。繁殖力が高く、世代交代が早いハエ類だからこそ効果を発揮する方法で、ウリミバエに対するこの技術はマリアナ諸島で1963年に確立された。不妊雌は繁殖能力がないものの、交尾行動は正常に行う。また、不妊雌は産卵管を果実に挿入して被害を出すことは極めて少ない。しかし、マリアナ諸島での根絶以後は世界50の地域で試されたものの、一度も成功していなかった。原因は個体数の把握ができなかった事にあり、そこで採用されたのがマーキング法（一区画に仕掛けられたトラップに入ったマークしたオスと野生のオスの割合に基づき、その区画の個体数を割り出し、最終的に島全体のウリミバエの数を推定する）と呼ばれる調査方法である。その結果、実験地に選ばれた久米島では約250万匹のオス（メスも同数として約500万匹）が生息しているのをはじめ、沖縄全体では最終的に3億匹まで増殖した。不妊虫の生産は石垣島にあった増殖施設で始められ、当初は週100万匹の生産だったが、後に大規模な増殖工場が建設されて週に1-2億匹を生産できる体制を整えた。久米島ではバケツに入れた蛹が羽化して放飼する方法を採ったが、沖縄諸島等では米軍基地の敷地内を含め、ヘリコプターなどを使って週に250-400万匹が放虫された。その結果、1978年（昭和53年）に久米島、1987年（昭和62年）に宮古群島で根絶が確認され、さらに沖縄群島でも根絶が確認されて1990年（平成2年）に沖縄群島ウリミバエ根絶記念式典が開催された。沖縄県全域での根絶が確認され、1993年10月30日に沖縄県ウリミバエ根絶宣言が発表された。根絶までの累計放虫数は625億匹、経費は全体で204億円に上る。これによりゴーヤーの本土への出荷が可能になった。根絶に成功した現在でも、再侵入の危険性が高いと予想される地域では、不妊虫放飼が継続されている。2001年（平成13年）11月13日、このウリミバエ根絶の様子を描いたNHK「プロジェクトX〜挑戦者たち〜」「8ミリの悪魔 VS 特命班 〜最強の害虫・野菜が危ない〜」が放映された。奄美群島での防除沖縄の北に位置する奄美群島では、沖縄本島に定着した翌年の1973年に群島南部の与論島、沖永良部島、1974年には残りの北部三島に定着したため、1975年には群島全体がウリミバエ発生地域に指定され、農産物の移動禁止・制限措置が取られた。そこで鹿児島県では1979年から不妊虫放飼法による防除を開始した。防除効果を高めるため、喜界島、奄美大島（と周辺離島）、南3島（徳之島、沖永良部島、与論島）の3地域ごとに、まず農薬散布によって野生の個体密度をできる低減させ（密度抑圧防除）、その後不妊虫放飼を行った。1981年に群島北部の喜界島を皮切りに、1985年９月から奄美大島で、1987年5月からは南部3島で不妊虫放飼を開始した。放虫にあたり奄美大島では平坦部48203～50703haに対しては毎週2240～3264万匹を基準に地上放飼を、地上放飼の困難な山間部や離島の31250～34650haに対しては毎週500～800万匹を基準にヘリコプターによる放飼を行った。徳之島の山間部の放飼でもヘリコプターが使われた。その結果、喜界島では放飼開始から15か月後、奄美大島では9か月後、南3島では10か月後から寄生果実が発見されなくなり、沖縄県に先駆けて、それぞれ1985年、1987年、1989年にウリミバエ発生地域指定が順次解除された。なお解除後も再侵入を警戒して不妊虫放飼は引き続いて行われ、1993年までで群島全体の放飼虫数は119億匹であった。
Title: メタスプリッギナ (Metaspriggina)
Section: abstract

メタスプリッギナ（学名：Metaspriggina）は、脊索動物の属の1つ。最初にカンブリア紀中期のバージェス頁岩から2個、2012年にカナダ西部ブリティッシュコロンビア州クートニー国立公園のマーブルキャニオン単層から44個の標本が発見された。
Title: メタスプリッギナ (Metaspriggina)
Section: 形態

エディアカラ生物群のスプリッギナにちなんで命名されたが、無関係であることが後の研究により示された。メタスプリッギナは原始的な脊索動物を代表すると考えられており、頭索動物と最古の脊椎動物の中間であるとみられている。ただしメタスプリッギナは有頭動物の持つ特徴の大半も示すため、この見解を疑問視する声もある。鰭はなく、頭蓋骨もあまり発達していないが、眼は上向きによく発達し、その後方には鼻孔が存在した。最大の標本は全長10センチメートル。軟骨で形成されたと考えられる脊索が7対の咽頭弓に沿って存在した。脊索は単一の骨ではなく複数の分かれた骨から形成されており、前方の2本は鰓を支えていなかったとみられる他の骨と比較して大型であった。これらの特徴は、メタスプリッギナと顎口上綱が縁遠い関係であったことを示唆している。当初は海中を自由に泳いでいたと考えられたが、後に海底に位置する標本が発見された。マーブルキャニオン単層に由来する標本からは眼の存在が示されているが、その目の位置を鑑みるに、海底のすぐ上を泳ぐ濾過摂食者として生活していたことが示唆されている。咽頭弓（鰓弓）が確認されていることから、メタスプリッギナは咽頭弓を持つ最古の動物となった。第1咽頭弓は後に脊椎動物の上下の顎へ、第2咽頭弓は舌弓（舌の基盤である舌骨と顎の支持）の形態に進化した。
Title: メタスプリッギナ (Metaspriggina)
Section: 系統

メタスプリッギナの発見は、おおよそ同時代に生息していたピカイアと共に、顎口上綱の起源に関する学説を混乱させる原因となった。ブランキオストマと違ってピカイアには鰓弓が存在しないため、系統について以下の2通りの解釈ができる。1つは、メタスプリッギナ以前に脊索動物門が4つに分岐し、メタスプリッギナと他の有頭動物（顎口上綱と無顎類の両方）をブランキオストマや頭索動物とともに1つのグループにし、ピカイアをその外の枝に置くものである。ここにおいてメタスプリッギナは全ての顎口上綱の直系の祖先であり、無顎類の最も近縁なグループになる。この説明ではピカイアは有頭動物と頭索動物に全く近縁でなく、それらよりもさらに原始的な動物になる。この場合、有頭動物と頭索動物は鰓弓により定義づけられる。もう1つは、メタスプリッギナを全ての顎口上綱の祖先かつ再び無顎類と近縁とし、脊索動物門を形成するものである。しかし、ピカイアは非常に原始的な親戚ではなく全ての頭索動物の祖先として扱われ、ピカイアとブランキオストマの間のどこかで鰓弓が集中的に進化したとされる。これにより、ブランキオストマが脊索動物（あるいは少なくともその胚）と異なる数の鰓弓を持つ理由が説明できる可能性がある。
Title: ヒシクイ (Bean goose)
Section: abstract

ヒシクイ（菱喰、Anser fabalis）は、鳥綱カモ目カモ科マガン属に分類される鳥類。
Title: ヒシクイ (Bean goose)
Section: 分布

夏季にユーラシア大陸北部で繁殖し、冬季になるとヨーロッパや中央アジア、朝鮮半島、黄河や長江流域へ南下し越冬する。A. f. fabalisニシヒシクイ夏季にウラル山脈以西のヨーロッパ北部で繁殖し、冬季になるとヨーロッパへ南下する。A. f. brachyrhynchusコザクラバシガン夏季にアイスランド、グリーンランドで繁殖し、冬季になるとヨーロッパ西部やイギリスへ南下する。A. f. middendorffiiオオヒシクイ夏季にシベリア東部で繁殖し、冬季になると中国や日本へ南下する。A. f. rossicusロシアヒシクイ夏季にロシア北西部で繁殖し、冬季になるとヨーロッパ、中華人民共和国西部、トルキスタンへ南下する。A. f. serrirostrisヒシクイ夏季にシベリア北部で繁殖し、冬季になると中国や日本へ南下する。
Title: ヒシクイ (Bean goose)
Section: 形態

全長78-100センチメートル。翼開張142-175センチメートル。頸部は長い。上面の羽衣は羽毛の外縁（羽縁）が淡色の暗褐色、体下面の羽衣は白い。尾羽基部を被う羽毛（上尾筒、下尾筒）は白い。尾羽は黒く、外側尾羽や先端が白い。嘴の色彩は黒く、先端にオレンジ色やピンク色の帯模様が入る。幼鳥は雨覆の羽縁が白い。A. f. fabalisニシヒシクイ嘴基部はわずかに白い羽毛で被われる。嘴にオレンジ色の斑紋が入る。A. f. brachyrhynchusコザクラバシガン嘴にピンク色の斑紋が入る。後肢の色彩はピンク色。A. f. middendorffiiオオヒシクイ全長90-100センチメートル。体型や頸部が長い。嘴は細長い。A. f. serrirostrisヒシクイ全長78-89センチメートル。体型は太短く、頸部も短い。嘴は太くて短い。
Title: ヒシクイ (Bean goose)
Section: 分類

亜種コザクラバシガンを独立種とする説もある。一方で嘴の斑紋や後肢の色彩がピンク色の個体がサクラバシガンA. neglectusとして記載されたこともあるが、亜種ロシアヒシクイの多型の1つとされ、シノニムとされる。Anser fabalis fabalis(Latham, 1787)ニシヒシクイWestern bean gooseAnser fabalis brachyrhynchusコザクラバシガンPink-footed gooseAnser fabalis curtusヒメヒシクイLonnbergs bean goose（ロシアヒシクイとヒシクイの中間型、ロシアヒシクイの東部個体群とする説もあり）Anser fabalis middendorffiiオオヒシクイMiddendorf's bean gooseAnser fabalis johanseniニシシベリアヒシクイJohansen's bean gooseAnser fabalis rossicusロシアヒシクイRussian bean gooseAnser fabalis serrirostrisヒシクイThick-belled bean goose
Title: ヒシクイ (Bean goose)
Section: 生態

湖沼、池、湿原、河川、水田、海岸などに生息する。夜間は大きな水場の中央に集まり休む。食性は植物食で、草、茎、根、果実、種子などを食べる。和名はヒシの果実を食べることが由来。種小名fabalisは「豆の」の意で、豆を食べることが由来で英名（bean＝豆）と同義。繁殖形態は卵生。タイガ（亜種コザクラバシガン、亜種ヒシクイ、亜種ヒメヒシクイ、亜種ロシアヒシクイ）やツンドラ（基亜種、亜種オオヒシクイ、亜種ニシシベリアヒシクイ）で繁殖する。4-5個の卵を産む。抱卵期間は25-29日で、ツンドラで繁殖する個体の方が短い傾向がある。
Title: ヒシクイ (Bean goose)
Section: 人間との関係

開発による生息地やそれに伴う食物の減少、乱獲などにより生息数は減少している。日本では1971年（昭和46年）に国の天然記念物に指定されている。福島潟（新潟市北区）や霞ヶ浦（茨城県）では越冬地を守るために水田の保全が行われており、ここで収穫された米はヒシクイ米として販売され、収益が保全事業へと還元されている。福島潟や霞ヶ浦南側の稲波干拓地は、越冬に飛来するオオヒシクイなどを対象としたバードウオッチングで訪れる人も多い。このうち霞ヶ浦地区では、軽飛行機などの音に驚いた場合は、約30キロメートル離れた鹿島灘海上に一時避難することが観察されている。また周辺の水田では、収穫時期が遅い飼料米の作付けが増え、稲刈り後に生えてヒシクイの餌となる二番穂が減ることによる餌不足の問題が指摘されている。A. f. middendorffiiオオヒシクイ準絶滅危惧（NT）（環境省レッドリスト）A. f. serrirostrisヒシクイ絶滅危惧II類 (VU)（環境省レッドリスト）
Title: ハロクアドラトゥム・ワルスビイ (Haloquadratum)
Section: abstract

ハロクアドラトゥム・ワルスビイ (ハロクアドラタム・ウォルズビイ、Haloquadratum walsbyi) は、特徴的な形状を持つ高度好塩菌の一種。薄っぺらい四角形のタイル状の細胞形状を持つ。高濃度のNaCl環境に適応し、世界中の塩湖や潮にまみれた砂に分布する。1980年にシナイ半島の紅海沿岸の塩湖より発見された。特徴的な形状から顕微鏡下で比較的簡単に見つけられるが、培養は困難を極め、2004年に初めて培養に成功するまで生態は20年以上にわたって不明であった。2007年に正式に記載され、生育環境と形状、発見者に因み、Halo+quadratum（塩+正方形） Walsbyi（発見者Anthony Walsby）と命名された。生育環境は中性の高塩環境（至適NaCl濃度3.3M）。塩湖などで比較的広く見つけられる。加えて高濃度（最高2M）の塩化マグネシウム環境にも耐性が有り、塩田などで海水が濃縮され、完全に無菌になる直前まで繁殖する。形状は郵便切手にも例えられる、厚み0.1-0.2μm、一辺2-5μmの正方形。鞭毛があり、運動性を持つ。複数の細胞が集まり碁盤の目のようになったシート状の群体を形成することがある。細胞内には泡のようなものが見えるが、これは光化学反応を効率よく起こすための浮力調整用ガス胞と、蓄積したPHB（ポリ-3-ヒドロキシ酪酸）である。ゲノムサイズ - 3,179,361bp（主ゲノム3,132,494bp、プラスミド46,867bp）。ORFは2,646箇所。
Title: 二本鎖RNAウイルス (Double-stranded RNA viruses)
Section: abstract

二本鎖RNAウイルス（にほんさRNAウイルス、英: double-stranded RNA virus、略称: dsRNAウイルス）は、二本鎖のリボ核酸（RNA）のゲノムを持つウイルスからなる多系統群である。二本鎖RNAゲノムは、ウイルスのRNA依存性RNAポリメラーゼ（RdRp）を用いて転写と複製が行われる。プラス鎖RNAはmRNAとしても利用され、宿主のリボソームを用いてウイルスタンパク質が翻訳される。二本鎖RNAウイルスは、デュプロルナウイルス門とピスウイルス門 （デュプロピウイルス綱）という2つの門に分類され、どちらもリボウイルス域オルソルナウイルス界に属する。この2つのグループは共通のdsRNAウイルス祖先に由来するのではなく、一本鎖プラス鎖RNAウイルス（+ssRNAウイルス）から個別に進化したものである。ボルティモア分類体系では、dsRNAは第III群に属する。このグループのウイルスの宿主の範囲（動物、植物、菌類、細菌）、ゲノムの分節数（1から12）、ビリオン構成（カプシドの対称性、層、突起（タレット、turret）の存在）は多岐にわたる。dsRNAウイルスには、幼児の胃腸炎の原因として世界的に知られているロタウイルス、ウシやヒツジに感染する経済的影響の大きい病原体であるブルータングウイルスなどが含まれる。レオウイルス科はこのグループで最大の科であり、宿主の範囲の点で最も多様性の高い科である。
Title: 二本鎖RNAウイルス (Double-stranded RNA viruses)
Section: 分類

dsRNAウイルスには、デュプロルナウイルス門とデュプロピウイルス綱の2つの分類群が存在し、デュプロピウイルス綱はピスウイルス門に属する。どちらもリボウイルス域オルソルナウイルス界に含められている。RdRpの系統遺伝学的解析に基づくと、この2つの分類群は共通のdsRNA型祖先を持つわけではなく、実際にはそれぞれ異なる+ssRNAウイルスの子孫である。mRNAの合成様式に基づいてウイルスを分類するボルティモア分類体系では、dsRNAは第III群に分類される。
Title: 二本鎖RNAウイルス (Double-stranded RNA viruses)
Section: 分類
Subsection: デュプロルナウイルス門

デュプロルナウイルス門には大部分のdsRNAウイルスが含まれ、幅広い真核生物に感染するレオウイルスや、原核生物に感染する既知の唯一のdsRNAウイルスであるシストウイルスなどが含まれる。デュプロルナウイルス門のウイルスはRdRpの他に、60個のホモまたはヘテロ二量体カプシドタンパク質からなる擬T=2対称性の二十面体形カプシドを持つ点も共通している。この門は3つの綱に分類され、Chrymotiviricetesには主に菌類や原生動物のウイルス、Resentoviricetesにはレオウイルス、Vidaverviricetesにはシストウイルスが含まれる。
Title: 二本鎖RNAウイルス (Double-stranded RNA viruses)
Section: 分類
Subsection: デュプロピウイルス綱

デュプロピウイルス綱はピスウイルス門に属する。ピスウイルス門には他に+ssRNAウイルスも含まれる。デュプロピウイルス綱のウイルスの大部分は植物や菌類のウイルスであり、アマルガウイルス科、ハイポウイルス科、パルティティウイルス科、ピコビルナウイルス科の4つの科が含まれる。
Title: 二本鎖RNAウイルス (Double-stranded RNA viruses)
Section: 特定の種に関する注記
Subsection: レオウイルス科

レオウイルス科は現在9つの属に分類されている。これらのウイルスのゲノムは10から12個のdsRNA断片から構成され、そのそれぞれに1つのタンパク質がコードされているのが一般的である。成熟型ビリオンはエンベロープを持たない。カプシドは複数のタンパク質から形成され、二十面体形の対称性を持ち、一般的に同心層を形成している。科に関わらず、dsRNAウイルスの特徴はdsRNA断片を転写する能力であり、適切な条件下でカプシド内で行われる。そのため、内因性転写に必要な酵素はビリオン構造の一部となっている。
Title: 二本鎖RNAウイルス (Double-stranded RNA viruses)
Section: 特定の種に関する注記
Subsection: レオウイルス科

=オルソレオウイルス属（単にレオウイルスとも）はレオウイルス科の典型的メンバーである。また、タレットを持つ代表的なウイルスであり、属の約半数を占める。科の他のメンバーと同様、レオウイルスはエンベロープを持たず、分節化したdsRNAゲノムを内包した同心層からなるカプシドによって特徴づけられる。特に、レオウイルスは8つの構造タンパク質と10個のdsRNA断片から構成される。哺乳類レオウイルス（MRV）のタンパク質はほぼすべてについて高分解能構造が知られており、最もよく研究されているものとなっている。MRVの2つの系統、type 1 Lang（T1L）とtype 3 Dearing（T3D）に関しては、クライオ電子顕微鏡（cryo-EM）解析とX線結晶構造解析により豊富な構造情報が得られている。
Title: 二本鎖RNAウイルス (Double-stranded RNA viruses)
Section: 特定の種に関する注記
Subsection: レオウイルス科

=細胞質多角体ウイルス（CPV）はレオウイルス科サイポウイルス属を構成する。CPVはゲノム断片の電気泳動プロファイルに基づいて14種に分類されている。サイポウイルスは1層のみからなるカプシドを持ち、その構造はオルソレオウイルスの内殻に類似している。CPVはカプシドの安定性が非常に高く、また内因性のRNA転写とプロセシングを完全に行うことができる。CPVのタンパク質の全体的なフォールドは他のレオウイルスのものと類似している。しかしながら、CPVのタンパク質には挿入ドメインや固有の構造が存在し、これらが広範囲にわたる分子間相互作用に寄与している。CPVのタレットタンパク質には、高度に保存されたヘリックスペア/βシート/ヘリックスペアサンドイッチフォールドを持つ2つのメチラーゼドメインが存在するが、オルソレオウイルスλ2タンパク質に存在するβバレルフラップ構造は存在しない。mRNAの放出経路に沿ったタレットタンパク質の機能ドメインのスタッキング、狭窄部やAスパイクの存在は、RNAの転写、プロセシング、放出というきわめて協調的な段階の調節にポアとチャネルを利用する機構が用いられていることを示唆している。
Title: 二本鎖RNAウイルス (Double-stranded RNA viruses)
Section: 特定の種に関する注記
Subsection: レオウイルス科

=ロタウイルスは、世界中で新生児や幼児の急性胃腸炎の最も一般的な原因となっている。このウイルスはdsRNAゲノムを持ち、レオウイルス科に属する。ロタウイルスのゲノムは11個のdsRNA断片から構成される。各ゲノム断片には1つのタンパク質がコードされているが、セグメント11のみには2つのタンパク質がコードされている。この12種類のタンパク質のうち、6つが構造タンパク質、残りの6つが非構造タンパク質である。
Title: 二本鎖RNAウイルス (Double-stranded RNA viruses)
Section: 特定の種に関する注記
Subsection: レオウイルス科

=レオウイルス科のオルビウイルス属に属するウイルスは節足動物媒介ウイルスであり、反芻動物で高い罹患率と致死率を示す。家畜（ヒツジ、ヤギ、ウシ）の疾患の原因となるブルータングウイルス（BTV）はここ30年、分子的研究の最前線にあり、分子・構造レベルで最も理解が進んだオルビウイルスとなっている。BTVはレオウイルス科の他のメンバーと同様、複雑な非エンベロープ型ウイルスであり、7種類の構造タンパク質と、さまざまなサイズの10個のdsRNA断片からなるRNAゲノムを持つ。
Title: 二本鎖RNAウイルス (Double-stranded RNA viruses)
Section: 特定の種に関する注記
Subsection: レオウイルス科

=ファイトレオウイルス（フィトレオウイルス）はタレットを持たないレオウイルスで、特にアジアで農業に大きな影響を及ぼしている病原体である。この属のウイルスの1つイネ萎縮ウイルス（RDV）は、電子顕微鏡とX戦結晶構造解析によって広く研究が行われている。これらの解析からは、カプシドタンパク質の原子モデルとカプシドの組み立てのモデルが得られている。RDVの構造タンパク質は他のタンパク質と配列レベルでの類似性は見られないものの、そのフォールドとカプシドの全体構造はレオウイルス科の他のウイルスと類似している。
Title: 二本鎖RNAウイルス (Double-stranded RNA viruses)
Section: 特定の種に関する注記
Subsection: 出芽酵母L-Aウイルス

出芽酵母のL-Aウイルスは、メジャーコートタンパク質Gag（76 kDa）とリボソーム-1フレームシフトによって形成されるGag-Pol融合タンパク質（180 kDa）をコードする、1本の4.6 kbのゲノムを持つ。L-Aは、M dsRNAと呼ばれるいくつかのサテライトdsRNAのウイルス粒子の複製とカプシドへの詰め込みを補助する。M dsRNAには分泌型タンパク質毒素（キラートキシン）とその毒素に対する免疫がコードされている。L-AとMは酵母の接合過程で生じる細胞質の混合によって細胞から細胞へ伝播する。自然に細胞から放出されたり、その他の機構で細胞へ進入したりすることはないが、酵母の高頻度で接合を行う性質のため、これらのウイルスは自然分離株に広く分布している。これらのdsRNAは哺乳類のdsRNAウイルスと構造的・機能的類似性を示すため、ウイルスとみなすことが有用である。
Title: 二本鎖RNAウイルス (Double-stranded RNA viruses)
Section: 特定の種に関する注記
Subsection: 伝染性ファブリキウス嚢病ウイルス

伝染性ファブリキウス嚢病ウイルス（IBDV）は、ビルナウイルス科の中で最もよく特性解析がなされたウイルスである。これらのウイルスは二分節されたdsRNAゲノムを持ち、T=13l対称性を持つ1層の二十面体形カプシドに内包されている。IBDVはその他の多くの二十面体形dsRNAウイルスと共通した機能的戦略や構造的特徴を有するが、レオウイルス科、シストウイルス科、トティウイルス科に共通したT=1（もしくは擬T=2）コアを持たない。IBDVのカプシドタンパク質は、ノダウイルス科、テトラウイルス科など一部の+ssRNAウイルスのカプシドタンパク質、レオウイルス科のT=13型外殻タンパク質との相同性を示す。IBDVカプシドのT=13型の殻はVP2の三量体によって形成される。このタンパク質は前駆体タンパク質pVP2からC末端ドメインが除去されることで生成される。pVP2のトリミングは未成熟型粒子において、成熟過程の一部として行われる。その他の主要な構造タンパク質であるVP3はT=13型の殻の下部に位置する多機能型構成要素であり、pVP2の構造的多型に影響を与える。ウイルスにコードされるRdRpであるVP1はVP3との結合を介してカプシドに組み込まれる。また、VP3はウイルスのdsRNAゲノムとも広範囲で相互作用している。
Title: 二本鎖RNAウイルス (Double-stranded RNA viruses)
Section: 特定の種に関する注記
Subsection: バクテリオファージφ6

バクテリオファージφ6はシストウイルス科に属する。このウイルスはシュードモナス（一般的には植物の病原体であるPseudomonas syringae）に感染する。3分節されたdsRNAゲノムを持ち、その全長は約13.5 kbである。φ6とその近縁株はヌクレオカプシドの周囲に脂質膜を持ち、これはバクテリオファージの中では稀な形質である。溶菌性ファージであるが、特定の条件下では溶菌を遅らせることが観察されており、"carrier state"として記載されることがある。
Title: 二本鎖RNAウイルス (Double-stranded RNA viruses)
Section: 抗ウイルス作用

細胞は正常な核酸代謝過程ではdsRNAを産生することはないため、接触したdsRNAを破壊する酵素の進化が自然選択されてきた。この種の酵素で最も有名なものはDicerである。dsRNAウイルスのこうした脆弱性を利用した、広域抗ウイルス薬の合成が期待されている。
Title: Encephalitozoon_cuniculi (Encephalitozoon cuniculi)
Section: abstract

Encephalitozoon cuniculi（エンセファリトゾーン・クニクリ）は、哺乳類に感染する病原性微胞子虫であり、世界中に分布する。E. cuniculiはウサギにおける神経疾患および腎疾患の重要な原因であるが、免疫不全の人にも疾患を引き起こす可能性がある。
Title: Encephalitozoon_cuniculi (Encephalitozoon cuniculi)
Section: 分類と細胞構造

E. cuniculiは、胞子を形成する細胞内寄生性の単細胞生物で、微胞子虫門に属する。微胞子虫は偏性細胞内寄生真菌であり、多くの動物種に感染する。これらの単細胞真核生物はミトコンドリアとペルオキシソームを欠くため、当初、ミトコンドリアの起源と考えられている細胞内共生が起こるより前に分化した原生生物の系統と考えられていた。後にミトコンドリア型シャペロン遺伝子が発見され、分子系統学的手法と組み合わせることで、微胞子虫が進化の過程でミトコンドリアを失った非定型真菌であることが示唆された。そのゲノムサイズは約2.9メガベース（Mbp）で11本の染色体に含まれており、タンパク質をコードしている可能性がある遺伝子が合計1,997個含まれる。遺伝子間スペーサーが少なく、真核生物の相同遺伝子と比較して多くのタンパク質をコードする領域が短いことにより、ゲノムは高度に圧縮されている。ある種の生合成経路およびクエン酸回路の遺伝子が欠如していることにより、強い宿主特異性を示す。系統解析により、微胞子虫が真菌に属する可能性が高まった。E. cuniculiのゲノムにはいくつかのミトコンドリア機能（鉄硫黄クラスターの合成など）に関連する遺伝子が含まれているため、微胞子虫がミトコンドリア由来の細胞内小器官を保持している可能性があると考えられた。
Title: Encephalitozoon_cuniculi (Encephalitozoon cuniculi)
Section: 生活環と病態発生

微胞子虫（ E. cuniculi ）の感染形態は、環境で長期間生存可能な抵抗力のある胞子である。 胞子は極管（polar tubule）を伸長し、宿主細胞に感染する。 胞子は、極管よりスポロプラズム（sporoplasm）を真核生物宿主細胞へ注入する。 細胞内で、スポロプラスムは広範囲に増殖する。 この増殖は、 メロゴニー （二分裂）またはシゾゴニー （多分裂）のいずれによっても起こる。 微胞子虫は、スポロゴニーにより細胞質内または寄生体胞内で成熟する。 スポロゴニーの過程で、胞子の周りに厚い壁が形成される。 この厚い壁が形成されることで、不利な環境条件に対する抵抗力が得られる。 胞子の数が増加し、宿主細胞の細胞質が完全に胞子で埋め尽くされると、細胞膜が破れ、胞子が周囲に放出される。 これらの遊離した成熟胞子は新たな細胞に感染する能力を有しており、上記のサイクルが続く。
Title: Encephalitozoon_cuniculi (Encephalitozoon cuniculi)
Section: 疫学

E. cuniculi感染はウサギで最初に確認されたが、今までにヒトを含む20種以上の哺乳類での感染が世界中で報告されている。 ペットのウサギの有病率は高く、23〜75％がE. cuniculiに対する抗体を持つとされる。 健康な犬の研究では、有病率は0〜38％であった。 猫はE. cuniculiに対して比較的耐性があると思われるが、 猫白血病ウイルスに感染した子猫への実験的感染は報告されている。 E. cuniculiはげっ歯類にも感染し、さらにペットの鳥の13%では糞から検出されている。 健康な人のごく一部もE. cuniculiに対する抗体を有しており、以前暴露したのではないかと考えられている。 免疫不全の人、および熱帯の国に住んでいる、または訪れた人では、血清陽性率は高い。 しかし、ほとんどの感染では臨床的疾患にまでは至らない 。 E. cuniculiの胞子は通常尿中に排泄されるが、感染した動物の糞便や呼吸器の分泌物にも見られることがある。 胞子は、感染後38〜63日の間尿中で検出され、その後も断続的に排出される。 主な伝播経路は胞子の経口摂取だが、胞子の吸入も起こり得る。 ウサギでは経胎盤および子宮内感染が報告されている。
Title: Encephalitozoon_cuniculi (Encephalitozoon cuniculi)
Section: ウサギでの感染
Subsection: 臨床所見

米国およびヨーロッパのウサギの最大80％がE. cuniculiに対して血清学的に陽性を示すが、すなわちこれはE. cuniculiに既に曝露されたことを示している。 これらの動物の多くは無症候性であり、病気の症状を示すことはない。 感染したウサギのごく一部のみがエンセファリトゾーン症を発症する。この疾患により引き起こされる臨床徴候としては、中枢神経症状、眼症状、および腎臓疾患が一般的である。  神経学的徴候のある多くのウサギは、 前庭機能障害のみを示す。 症状はしばしば突然発症し、 斜頸 、 運動失調 、 眼振 、および旋回が見られる。 このような症状が出ていてもウサギは周囲を認識しており、バランスを失いながらも食事はできる。より重篤な症状を示し、 食事すらできなくなったウサギの予後は不良である。  眼のE. cuniculi感染では、 白内障、眼内の白いしこり、 ブドウ膜炎がみられる。 症状は通常若いウサギでみられ、一般的に片目のみが影響を受ける。 エンセファリトゾーン症に関連する眼病変を有していても、ウサギは通常健康であり、視力を喪失しても生活に支障はない 。 E. cuniculiには腎臓に感染しやすい傾向があり、慢性または急性の腎不全を引き起こす可能性がある。 腎機能障害の症状には、飲水量の増加、尿量の増加、食欲不振、体重減少、嗜眠、脱水などがある。 軽度の症例は症状を引き起こさず、感染の徴候は剖検時に偶発的に発見されることもある。
Title: Encephalitozoon_cuniculi (Encephalitozoon cuniculi)
Section: ウサギでの感染
Subsection: 診断

現在のところ、ウサギのE. cuniculi感染を生前に確定診断することは難しい。 暫定診断は、多くの場合、臨床徴候に矛盾がなく、抗体値が高いことに基づいて行われる。 IgG抗体を検出するための血清検査はしばしば実施され、陰性の場合は除外診断の根拠となる。 ただし、IgG抗体価が陽性だったとしても、今まさに感染している状態と、以前の感染または無症候性キャリアの状態と区別することはできない  。IgM抗体検査も利用可能だが、同じく陽性結果は活動性感染と潜伏感染とを区別できない 。 ポリメラーゼ連鎖反応 （PCR）は、ヒトにおいて微胞子虫の検出のための標準的な方法として昔から確立されており、これをウサギに適用しようとする試みがある。 液化した水晶体材料のPCRはウサギのE. cuniculiによるブドウ膜炎を診断する上で信頼できる手段だが、ウサギの尿と脳脊髄液の PCR結果は信頼できないことが研究により知られている。
Title: Encephalitozoon_cuniculi (Encephalitozoon cuniculi)
Section: ウサギでの感染
Subsection: 治療

ベンズイミダゾール系薬剤であるフェンベンダゾールが 、自然発症例および実験感染によるE. cuniculi感染を予防および治療できるといくつかの研究が示している。 残念ながら、中枢神経系からの胞子を取り除いても、必ず臨床徴候が改善するとは限らない。 ウサギでは、小腸や骨髄障害などの、ベンズイミダゾール系薬物に対する副反応が報告されています。 臨床医は、推奨される投与量と治療間隔を厳守し、治療中の動物の血液検査（CBC）のモニタリングを検討すべきである。
Title: Encephalitozoon_cuniculi (Encephalitozoon cuniculi)
Section: ヒトの感染

E. cuniculiは、免疫不全（特にHIV / AIDS 、 臓器移植 、またはCD4 + Tリンパ球の欠乏による）の人々において重要な日和見病原体である。 E. cuniculiは人間よりも動物で多くみられるため、人獣共通感染症である可能性がある。 E. cuniculiには 3つの異なる系統が特定されており、I（ウサギ）、II（マウス）、およびIII（犬）に分類されている  。ヒトからヒトへの伝播は、感染したドナーからの臓器移植により引き起こされる可能性がある 。
Title: イヨカン (Iyokan)
Section: abstract

イヨカン（伊予柑）は、日本列島の在来種の柑橘類であり、タンゴールの1種である。果実の皮が濃いオレンジ色で、果汁と香りが豊かで、甘く濃厚な味わいがある。山口県の原産で、主に愛媛県で栽培されている品種であり、21世紀初頭における日本で栽培されている柑橘類では、ウンシュウミカンに次ぐ収穫量であった。
Title: イヨカン (Iyokan)
Section: 特徴

イヨカンは、比較的果汁を多く含み、甘味も感じられる。果皮はウンシュウミカンに比べ厚めだが、手でむくことは可能である。しかし、厚い皮を手でむくわずらわしさから、日本では近年若干敬遠されがちである。
Title: イヨカン (Iyokan)
Section: 遺伝子解析

イヨカンは、ウンシュウミカンとオレンジ、あるいは、ウンシュウミカンとブンタンの交雑種などと考えられていたが、柑橘類のゲノム解析により、カイコウカン（海紅柑）とダンシー（大紅みかん）の交配種だったと判明した。
Title: イヨカン (Iyokan)
Section: 産地

日本におけるイヨカンの収穫量は、2005年が107,500 トン、2010年が53,886 トンであり、その約9割が愛媛県で収穫された物だった。なお、愛媛県内における主産地は、興居島（松山市）、中島（同）、北条（同）、保内（八幡浜市）などだが、近年は他品種への転換が進みつつある。また、21世紀初頭における日本の果樹栽培は、減少傾向にあり、イヨカンの栽培面積も、2005年までの10年間で約35％減少し、収穫量は同じく45％減少した。
Title: イヨカン (Iyokan)
Section: 歴史

1885年に山口県阿武郡東分村（現：萩市）の蚕業指導員・中村正路が発見した。当初は紅みかん、穴門みかん（あなとみかん）などと呼ばれていた。中村所有の苗木を、1888年に愛媛県温泉郡持田村（現：松山市）の養蚕家・果樹園芸家であった三好保徳が購入し、愛媛県でも栽培を開始した。これを愛媛県から出荷を開始した当初は、かつての令制国の名であった伊予国にちなんで「伊予ミカン」として販売したものの、それでは従前から愛媛県で栽培してきたウンシュウミカンなどと紛らわしく混同される恐れが有ったため、結局「イヨカン（伊予柑）」という名称に変っていった。1955年に松山市平田町の宮内義正によって発見された「宮内伊予柑」は、従来のイヨカンと比べて、成熟が早く、実付きも良く、また皮が薄く、酸味が少なくて食べ易いとして普及が進み、1970年代以降は、愛媛県で栽培される柑橘類の主力品種の1つとして出荷量を大きく伸ばした。その後も「大谷伊予柑」や「勝山伊予柑」といった、優れたイヨカンの品種の発見が相次いでいった。
Title: イヨカン (Iyokan)
Section: ブランド

宮内伊予柑弥生紅（やよいべに） - 愛媛で栽培され3月まで成熟させた宮内伊予柑で、糖度11.5度以上の高品質の物を「弥生紅」と名付けて2003年から毎年出荷している。3月のみ市場に出回る。大谷伊予柑 - 覗き込めば顔が写り込む程に、その果皮がツルツルであるため、ダイヤ柑の異名を持つ。勝山伊予柑沢田伊予柑山田伊予柑野本伊予柑
Title: イヨカン (Iyokan)
Section: その他

毎年受験シーズンに「いい予感」との語呂合せで、産地PRも兼ねて受験生が、よく祈願に来る神社などでのイヨカンの配布が行われる。愛媛県は、毎年「愛媛いよかん大使」を主に愛媛県出身者の中から任命し、全国各地を行脚して愛媛のイヨカンをPRする活動を行っている。さらに愛媛県は、国内外の愛媛県ゆかりの著名人に、愛媛県のイメージ向上と観光PRのために「伊予観光大使」（通称：いよかん大使）としてボランティアでの活動を依頼してもいる。
Title: ハフニア属 (Hafnia (bacterium))
Section: abstract

ハフニア属はグラム陰性の非芽胞形成通性嫌気性桿菌。30℃までは運動性があるが、それを超える温度では運動性を失うことが多い。腸内細菌科に属し、名称はコペンハーゲンの古名に因む。基準種はハフニア・アルベイで、GC含量は48から49。土壌や水中、動物の腸内で見られ、ヒトにおける日和見感染の原因菌のひとつ。フォーゲスプロスカウエル試験陽性、フェニルメチルレッド試験陰性であるが温度によって代謝特性が変わる。また、シアン化カリウムとクエン酸を代謝することができる。
Title: サクラエビ (Sakura shrimp)
Section: abstract

サクラエビ（桜海老、桜蝦、十脚、学名：Lucensosergia lucens）は、サクラエビ科に属するエビの一種。深海に生息する小型のエビである。
Title: サクラエビ (Sakura shrimp)
Section: 特徴

成体は体長40mm前後。体は透明だが甲に赤い色素を多く保持し、生体は透き通ったピンク色に見える。「桜海老」の和名はここに由来する。2対の触角のうち第2触角は体長以上の長さがあるが、額角は短い。5対の歩脚のうち、第2・第3歩脚が鋏脚に変化し、第4・第5歩脚が短い。体表には約160個の発光器が並んでいる。発光器（とされていた器官）が実際に光を放つことは未確認であったが、ストロボを当てるなどの刺激による微弱な発光の測定に成功している。産卵期は5月から11月で、メスは交尾後に800 - 2300個程の卵を水深20 - 50mの海中に放出する。寿命は15か月ほどで、孵化後1年で成熟し、産卵後2 - 3か月で死ぬとされる。シラエビ Pasiphaea japonica は外見・生態・利用法までサクラエビに似るが、エビの分類上ではまったく別の系統に分けられる。
Title: サクラエビ (Sakura shrimp)
Section: 分布

日本では駿河湾および近接の遠州灘・東京湾・相模灘、さらに長崎県の五島列島沖に分布するが、漁獲対象となっているのは駿河湾のみである。五島列島沖での生息は、2019年2月22日に、日本と台湾の研究グループの調査などで公表された。見つかった場所は、福江島の南約40 km (深さ約380 m)地点。2017年5月に偶然発見された。西日本での発見はこれが初めて。また、台湾東方沖、西南沖にも生息し、中国語で「櫻花蝦」、「發光(正)櫻蝦」、台湾語で「Hoe-khak-á(花殻仔)」の名で呼ばれ、近年は漁獲対象となり、日本へも輸出されている。深海の中層を群れで遊泳する。昼間は水深200 - 300 mほどにいるが、夜には水深20 - 50 mぐらいまで浮上する日周鉛直運動を行う。海中を浮遊するプランクトンやデトリタスを捕らえて食べる。一方、天敵は、外洋性のハダカイワシやイカなどがいる。
Title: サクラエビ (Sakura shrimp)
Section: 漁業

日本国内の水揚げ量の100 %は駿河湾産で、主要な漁期は4月から6月まで（春漁）と10月から12月（秋漁）。6月11日から9月30日までは繁殖期にあたり禁漁、冬はエビが深くにいるため休漁である。産地偽装を防ぐため、静岡県桜海老加工組合連合会（静岡市・焼津市の加工業者で構成）は2020年に「駿河湾産サクラエビ」の認証ラベルを導入した。駿河湾でのサクラエビ漁の歴史は浅く、1894年（明治27年）に由比（現・静岡市清水区）の漁師、望月平七と渡辺忠兵衛が、アジの網引き漁をしていたときに網が深く潜ってしまい、そのとき偶然にも大量のサクラエビが捕れたことが始まりとされている。本格的な漁業は翌1895年に由比で、1896年には蒲原（同）で始まった。由比港漁協の由比・蒲原（42組84隻）と大井川港漁協の大井川（18組36隻）、計3か所の基地に100隻の許可証を持つ漁船がある。当時静岡の魚の一大消費地だった山梨県甲府市で「さくらえび」と名付けられたいう。サクラエビ資源を守るため、静岡県サクラエビ漁業組合所属のすべての漁船が一緒に漁に出て漁獲調整を行い、水揚代金を全船でプールして利益を分け合う「プール制」が1977年に完成し、現在に至っている。静岡県静岡市清水区の由比漁港では、期間限定で、漁港内でかき揚げ丼などが食べられる。サクラエビ・シラスなどの関連商品を取り扱う直売所も併設され、毎年5月3日にサクラエビ祭りが行われる。静岡県焼津市の大井川港では、1940年（昭和15年）に蒲原町（現・静岡市清水区）の加工業者が大井川町（現・焼津市）に工場を建設。地域団体商標として、由比サクラエビと駿河湾サクラエビが登録されている。「輸送中、水槽が酸欠になりやすい」「輸送のストレスで有毒なアンモニアを発生しやすい」などの理由で、静岡県外などで生きたサクラエビを入手するのは困難だったが、「酸素のナノバブルを水中に増やす」、また「アンモニアを分解して窒素を取り除く微生物を利用する」などの対策によって、試験段階ではあるが、数日間程度なら生かしたまま輸送することが近年では可能になってきている。台湾でも小規模な漁がされている。1980年代に日本で不漁となったことから、代替産地を探した結果、漁獲対象となった。主に台湾南西の屏東県小琉球周辺海域と東部の宜蘭県の亀山島周辺海域、台東県大武郷沖の3か所が漁場となっている。
Title: サクラエビ (Sakura shrimp)
Section: 漁業
Subsection: 2018年から駿河湾で続く不漁

2018年、春漁（4月10日〜6月3日）の19日間の出漁での水揚げ量は、記録が残る1986年以降で最低の約312トンとなったため、予定より早く打ち切った。不漁の原因は、2017年に水温の高い黒潮が大蛇行して湾に流れ込まなかったため、産卵する親エビが減少した、と考えられていた。同年秋漁（11月12日 - ）は、12月10日の資源調査で水揚げに適さない体長35ミリメートル以下の稚エビ（0歳エビ）が63 - 76 %を占めたため、12月13日に打ち切られた。史上初めて一度も出漁しないまま秋漁を終えた。2019年の春漁は、3月24日から6月5日の予定を早めて5月31日に打ち切られた。31日夜に水揚げされたサクラエビは、産卵エビがこれまでより明らかに多く含まれていることを目視で確認したことに因る。この春の漁獲量は約85トンで、不漁の昨年をさらに大きく下回った。由比港漁協は、サクラエビの不漁に富士川水系の濁りが関係していて、富士川上流の早川上流にあり、堆砂が進む雨畑ダムが濁りの主因、と指摘。駿河湾に流れ出る放水路の懸濁物を静岡県が調査したところ、基準値25 mgを超える427 mgだった。1967年に完成した雨畑ダム（山梨県早川町）は民間が管理する発電用のダムで、堆砂率は93 %となり、国土交通省は「堆砂による上流部の河床上昇により浸水被害が発生しているため。」「ダムの安全性及び機能への影響が認められ、直ちに措置を講じる必要がある。」としている。静岡県が設置した有識者による「『森は海の恋人』水の循環研究会」では、日本軽金属が管理する雨畑ダムの水は複数の水力発電施設で使われた後、同社蒲原製造所（静岡市清水区）の放水路から駿河湾に流れ出て、堆砂が海底湧水の出口をふさいでいる、という仮説が提唱され、播磨灘のように海洋生態系に影響が出ている可能性が指摘された。同研究会は今後3年かけて不漁の原因などを探ることを確認した。これに対して山梨県の富士川漁業協同組合は「原因を究明しない」と回答したが、静岡新聞は富士川漁業協同組合が日本軽金属から多額の補償金を受け取っていることを指摘している。富士川の問題が主に静岡新聞によって提起される一方で、2020年には自主規制による禁漁区での操業が行われていたことが露呈し、2021年には禁漁区を保護区として調査を目的とする試験操業を行っている。これら禁漁区の設定については、資源回復の科学的根拠もなく取り締まりも無い『身内の談合』に近いものであることが露呈したとされ、拘束力のある漁業調整規則で乱獲を規制しない県の責任が指摘されている。2023年4月の初漁では一転して豊漁となり、取引値は大幅に下がった。ただし、由比漁協や循環研究会、静岡新聞が指摘していた雨畑ダムの土砂堆積について、撤去はいまだ行なわれていない。
Title: サクラエビ (Sakura shrimp)
Section: 漁業
Subsection: 産地偽装

日本国内では2018年の出漁を取りやめ、2019年の不漁により国産サクラエビの流通量が減り、台湾産の流通量が増えている。これに伴い景品表示法で定められた原産地表示の偽装も起きており、静岡県内の業者の手により「駿河湾産サクラエビ」の統一認証ラベルの策定が進められ、2020年2月の小売分から貼付されつつある。
Title: サクラエビ (Sakura shrimp)
Section: 利用

産地近くでは、軽く塩ゆでした釜揚げサクラエビとして鮮魚店に出ることもある。一般には生サクラエビ（冷凍）や干しエビ（干物）として流通する。生でワサビ醤油で食べたり、釜揚げ、素揚げ、かき揚げ（かき揚げ丼・天丼）などにしたりして食べる。干しエビには独特の食感と味わいがあり、お好み焼きやかき揚げなどに使われる。また、干しサクラエビをかき揚げなどの具に使う際、使用前にフライパンで軽く炒ると格段に香りが増すといわれる。サクラエビの漁が行われる漁師町近辺では「沖あがり」と呼ばれる、サクラエビと豆腐とネギをすき焼き風のだしでさっと煮た漁師料理がある。他のエビ同様にうま味成分（グリシン、タウリン）が多いうえ、チアルジンを含む殻ごと食べることで香ばしさが感じられる。なお、一般に安価で出回っている干しエビの多くはアキアミなど、別の種が多い。静岡県を代表する水産物の1つであるが、静岡県のプライドフィッシュには選ばれていない。台湾の屏東県東港鎮では「東港三宝」と称する名産品の一つに挙げられ、天日干ししたものが様々な方法で食されており、地元料理としては、サクラエビ炒飯（「櫻花蝦炒飯」）が名物となっている他、「肉粿」と呼ばれる米で作る点心の一種の具の一つとして欠かせず、白菜の煮物に加えたり、焼きビーフン、焼きそばに加えたりもする。他に、ゴマ、海苔、アーモンドなどと合わせたスナック菓子やふりかけに加工されて流通している。
Title: ピュロバクルム属 (Pyrobaculum)
Section: abstract

ピュロバクルム（パイロバキュラム、Pyrobaculum） は、テルモプロテウス科に属す古細菌の一属。100°C付近でよく増殖する偏性又は通性嫌気性の超好熱菌である。陸上の硫黄孔や浅瀬の熱水域に分布する。属名はギリシャ語の「炎」を由来とするpyro- + ラテン語で「棒・杖」を意味するbaculumより。