shintaro-ozaki/entity-explanation huggingface dataset:
Title: マチン (Strychnos nux-vomica)
Section: abstract

マチン（馬銭、番木鼈、学名: Strychnos nux-vomica）は、マチン科マチン属の常緑高木。アルカロイドのストリキニーネを含み、有毒植物もしくは薬用植物として知られる。種小名（ヌックス-フォミカ）から、フォミカともいう。
Title: マチン (Strychnos nux-vomica)
Section: 形態

樹高15m以上になることもありマチン属では中型種。キンカンのようなオレンジ色の実を付ける。種子は硬貨のような形をしており色は茶色である。
Title: マチン (Strychnos nux-vomica)
Section: 生態

落葉樹である。
Title: マチン (Strychnos nux-vomica)
Section: 人間との関係

マチンの種子には猛毒のアルカロイドであるストリキニーネが含まれることから毒性や薬効を期待して利用されてきた。
Title: マチン (Strychnos nux-vomica)
Section: 人間との関係
Subsection: 毒物として

矢毒として利用された。
Title: マチン (Strychnos nux-vomica)
Section: 人間との関係
Subsection: 薬用として

漢方では生薬としてマチンの種子を馬銭子（まちんし）、蕃木鼈子（ばんぼくべつし、蕃は草冠に番）、またはホミカ子と称して苦味健胃薬として用いられる。インドでは、木部を熱病、消化不良の薬に用いる。日本薬局方ではホミカの名で収録されている。ただし、前述の通り毒性は強く、素人による処方は慎むべきである。
Title: マチン (Strychnos nux-vomica)
Section: 名称

学名の種小名nux-vomicaは｢嘔吐を起こさせる木の実」という意味だが、マチンの種子には催嘔吐作用は無いとされている。
Title: ナナホシテントウ (Coccinella septempunctata)
Section: abstract

ナナホシテントウ（七星瓢虫、七星天道、学名：Coccinella septempunctata）は、テントウムシ科の昆虫の1種。和名のとおり、赤色の鞘翅に7つの黒い紋がある。最も普通に見られるテントウムシの一つ。
Title: ナナホシテントウ (Coccinella septempunctata)
Section: 概要

ナナホシテントウ Coccinella septempunctata L. は日本で良く見られる普通種のテントウムシの一つ。ナミテントウの方がより普通種ではあるが、本種もそれほど負けておらず、より多く見られる場合もある。幼虫、成虫共にアブラムシを食べる益虫であり、天敵としての利用も含めてよく研究されてもいる。また、一般的なテントウムシのイメージとしてよく親しまれている。真っ赤な派手な前翅に黒い斑点という目立つ姿もこれに役立っているが、これは生物学的には警告色と考えられており、さわると黄色い体液を出すのもその一環である。
Title: ナナホシテントウ (Coccinella septempunctata)
Section: 特徴

体長は5-9mm。ほぼ円に近い楕円形で、背面は浅い半球形に盛り上がって滑らか、腹面はほぼ扁平。触角と歩脚は腹面に収まる。活動中は触角と足先くらいしか上からは見えない。体色は黒で、前翅のみが赤い。頭部は表面に密な点刻があり、複眼の近くにいくつか黄色い斑紋がある。前胸の前端はえぐり込まれたようになり、その内側は端直。左右の前に大きな淡黄色の斑紋があり、これが肉眼的にはまるで眼のように見える。小楯板は小さく、三角で黒い。前翅は赤いものと黄色みを帯びたものがある。いずれの場合もそこに黒くて丸い斑紋があり、その模様はかなり安定している。黒斑はそれぞれの前翅の前方内側に一つ、中央に一つ、それを挟んで外側の前後に一つずつ、計四個あるが、前翅を閉じると前方内側のものが互いに接して一つになるため、普通の状態では七つの斑紋があるように見える。なお、旧北区のものはより斑紋が小さく、また小楯板のそばの前翅に淡黄色の斑紋がある。そのために日本のものを変種としたこともある。
Title: ナナホシテントウ (Coccinella septempunctata)
Section: 習性

素早くはないが、活発によく動く。枝先まで登っていって、そこから羽を広げて飛び立つのがよく見かけられる。触れると擬死に入るが、この時に歩脚の関節から黄色い、いやな臭いの体液を出す。これは幼虫も同じである。なお、体内にはアルカロイドが含まれるため、鳥はこれを食わないという。見かけの派手な色は警告色と考えられる。成虫、幼虫ともに肉食で、アブラムシ類を食べる。ハダニを食べる例も知られる。幼虫は共食いもよくする。これは若齢幼虫に多く、飼育下の実験では、一齢や二齢は同種の卵塊だけを食べても次の齢に成長することが可能で、三齢では幼虫同士の共食いも見られるが、アブラムシを与えると起こらなくなるという。また、三齢以上ではアブラムシを与えないと成長が進まなかった。ちなみに、蛹はほとんど幼虫から攻撃されることがないという。中牟田はこの種の卵への共食いを、ある程度習性として定着しており幼虫の生存率を高める意味があると考えている。成虫は集団で冬眠する。ナミテントウは物陰に大群をつくって越冬するのでよく知られるが、本種はそれとは異なり、小さな集団で草の根元などに潜る。ただし温暖な地域では一部個体が活動することが知られている。また、夏にも同様な場所で夏眠をすることが知られている。このような休眠にススキの株がよく使われることから、天敵の保護のためにススキの刈り取りに配慮すべき、との指摘もある。
Title: ナナホシテントウ (Coccinella septempunctata)
Section: 習性
Subsection: 餌の探索行動

捕食性のテントウムシ類の多くで、餌を探す際の行動に「広域型」と「地域集中型」の二つの形があり、活動中にそれらが切り替えられることが知られており、本種でもそれが見られる。前者は広い範囲を直線的に進んでゆくもので、後者は頻繁に向きを変えながら狭い区域を探し回るものであり、まず広域型で探索し、餌を見つけると近距離探索型に切り替わってその周囲をくまなく探し回る。一定時間のあいだ餌が見つからないと、再び広域型に切り替わる。アブラムシは雌親が定着した場所で単為生殖を行い、集中した群れを作ることから、このような餌探索の行動は餌発見の効率を高める適応とされている。本種の場合、近距離探索型への切り替えはアブラムシに接触することで起こり、必ずしも餌を食べることを必要としない。また、その持続する時間はアブラムシを食べた時間によって変化し、長く摂食するほど長くなる。また、広域探索についてはアブラムシに寄生された宿主植物の臭いが、地域集中型においてはアブラムシの警報フェロモンが手がかりになっているとの示唆がある。なお、アブラムシの種によってはテントウムシの成長に栄養が不足する例があるが、本種については、特に餌の選択性は見られないようである。なお、キョウチクトウアブラムシは宿主植物の毒を体内に持つため、これを本種が食べると中毒死するが、他のテントウムシには耐性のあるものもある。
Title: ナナホシテントウ (Coccinella septempunctata)
Section: 生活史

関東地方付近では年2化。孵化から羽化までは20日前後、成虫の寿命は活動状態で2ヶ月ほどである。秋に羽化した成虫は越冬する。春にアブラムシが活動を始めるころに産卵が行われ、それを食べた最初の世代が晩春にあらわれる。二世代目は夏に出現する。卵は黄色の楕円形で、30個程度をまとめて産みつける。雌個体は散発的に二ヶ月にもわたって産卵を続け、その総数は1600にも達し、時には2600にもなる。幼虫は細長く、腹背にやや扁平で、幅広い頭部と軟らかい体、それに長く発達した三対の胸脚を持つ。背面は白っぽい紫で、黒い斑点が並ぶ。蛹は後方が狭い涙滴型で、尾端で基物に付着する。色は赤くて黒い斑紋がある。羽化直後の成虫は前翅が黄色く、次第に本来の色に変わる。
Title: ナナホシテントウ (Coccinella septempunctata)
Section: 分布と生育環境

アジア、ヨーロッパ、北アフリカに広く分布する。日本には全土に分布し、ごく普通の種である。明るいところを好み、日当たりのいい草原などに見られる。畑地の周辺などに見ることも多い。なお、ナミテントウはほぼ同じ大きさで同じようにアブラムシを食べ、同じところに混生してみられる。一般にはナミテントウの方が数が多いとされるが、ナナホシテントウの方がよく見られることも珍しくなく、特に春にはナナホシが多い傾向がある。これはナナホシの方が繁殖を早く始めるため、新成虫の出現が早いためらしい。また、ナミテントウの幼虫はナナホシテントウの幼虫や蛹を食うことがある。
Title: ナナホシテントウ (Coccinella septempunctata)
Section: 人間との関係

農業上重要な害虫であるアブラムシ類の重要な天敵としてよく知られており、農業的に天敵として利用することも多く検討されている。テントウムシ科の昆虫としてはナミテントウ(またはテントウムシ)の方がよく見られるが、テントウムシといえばこの種の印象であるという指摘がある。
Title: ナナホシテントウ (Coccinella septempunctata)
Section: 分類

同属のものとしては他に数種あり、中でアイヌテントウ C. ainu Lewis、ココノホシテントウ C. explana Miyatake が色彩、斑紋等よく似ているが、前翅前の斑紋の前にもう一つ小さな黒斑がある。
Title: コモンシギ (Buff-breasted sandpiper)
Section: abstract

コモンシギ（小紋鴫、学名：Calidris subruficollis）は、チドリ目シギ科に分類される鳥類の一種である。以前はコモンシギ属（Tryngites）に分類されていたが、最近の研究によりオバシギ属（Calidris）に分類された。
Title: コモンシギ (Buff-breasted sandpiper)
Section: 分布

北アメリカ北部の北極圏で繁殖し、冬期は南アメリカ（主にアルゼンチン）に渡りをおこない越冬する。日本では迷鳥として、北海道、本州、奄美大島での観察記録がある。本来は小さい群れを作り活動するが、日本での記録は単独での飛来しかない。
Title: コモンシギ (Buff-breasted sandpiper)
Section: 形態

体長約20cm。頭から頸にかけては黄褐色で黒斑がある。背中から羽、尾は黒褐色。体の下面は薄い黄褐色。一見は、エリマキシギの幼羽に似ている。
Title: コモンシギ (Buff-breasted sandpiper)
Section: 生態

汽水湖、干潟、水田、河口等に生息する。貝類、甲殻類、ゴカイ等を捕食する。「プリリリリ」と鳴く。鳴き声の違いで、エリマキシギと区別できる。
Title: アメリカナデシコ (Dianthus barbatus)
Section: abstract

アメリカナデシコ（亜米利加撫子、Dianthus barbatus）は、別名ヒゲナデシコ（髭撫子）あるいはビジョナデシコ（美女撫子）とも呼ばれるナデシコ科ナデシコ属の草本植物。ヨーロッパの主にバルカン半島、ロシア西部などに自生する。
Title: アメリカナデシコ (Dianthus barbatus)
Section: 概要

苞の先端が長いひげのように伸びているので、ヒゲナデシコともいい、2cmほどの小さな花が枝の先端に十数輪咲く。多年草であるが、初夏に播種し翌春に開花させることができるため、一年草として扱われることもある。日本では大正時代から暖地で切り花栽培が始まった。ヨーロッパに自生しアメリカには自生していないことから、本種が最初にアメリカ経由で日本に導入されたものと考えられている。高性種は草丈 40 - 60 cm となり、主に切り花用に栽培され一部は花壇にも植栽される。わい性種は草丈 15 - 20 cm 、花壇用に栽培される。在来種（一般種）は一定の大きさに生長した枝が、低温に遭遇してから開花する。これに対し、低温に遭遇する必要が無い品種群があり、これを四季咲き性の品種として区別している。
Title: アメリカナデシコ (Dianthus barbatus)
Section: 栽培

9月上中旬に播種する。発芽は容易で比較的強健な植物なので、直まきでもよい。播いた後2ミリほど覆土しておけば、一週間ほどで発芽する。間引くか移植して、株間を20cmくらいにしてやる。冬でも半日以上日が当たる排水のよい土地であれば、十分に開花させることができる。
Title: アメリカナデシコ (Dianthus barbatus)
Section: 利用法

花壇・切り花用に、家庭園芸で栽培されるが、エディブル・フラワーとして開花したばかりの花を摘んでサラダなどに入れて食べることができる。
Title: ヨーロッパトウネン (Little stint)
Section: abstract

ヨーロッパトウネン（ヨーロッパ当年、学名：Calidris minuta）は、チドリ目シギ科に分類される鳥類の一種である。ニシトウネンとも呼ばれる。
Title: ヨーロッパトウネン (Little stint)
Section: 分布

スカンジナビア半島からシベリアにかけての北極圏で繁殖し、冬はヨーロッパ南部の地中海沿岸、アフリカ中南部、西南アジアの海岸部に渡りをおこない越冬する。日本へは数少ない旅鳥または冬鳥として、少数が渡来する。
Title: ヨーロッパトウネン (Little stint)
Section: 形態

全長約14cm。トウネンとよく似ているが、わずかに小型であり、脚がより細長く見える。冬羽では上面は灰色で、下面は白色。夏羽は上面と頭頂から胸側は赤褐色。幼羽は背と肩羽上列の境界に、白いはっきりとしたV字模様がある。喉は白い。嘴はやや短めで、わずかに下に曲がっている。雌雄同色である。
Title: ヨーロッパトウネン (Little stint)
Section: 生態

非繁殖期は、干潟や、内陸の湿地や水田、川などに生息し群れで行動するが、日本では単独か数羽での渡来がほとんどである。トウネンの群れに混じっていることが多い。繁殖期にはツンドラに生息する。水辺を歩き回りながら、昆虫やゴカイなどを食べる。地上に巣をつくり、普通4卵を産む。「チッ」「ピッ」と鳴く。
Title: ヒゲイノシシ (Bornean bearded pig)
Section: abstract

ヒゲイノシシ (学名:Sus barbatus)は鯨偶蹄目イノシシ科に属する種である。長いあごひげが特徴で、尻尾が房状になっている個体も見られる。東南アジアのスマトラ島やボルネオ島、マレー半島およびスールー諸島などその周辺の島々の熱帯雨林やマングローブに生息している。家族で生活し、生後18カ月から繁殖が可能となり、イノシシ科の他種との交雑種が見られることもある。
Title: ヒゲイノシシ (Bornean bearded pig)
Section: 亜種

現在、2種類の亜種が確認されている。S. b. barbatusS. b. oiボルネオ島に生息する個体は主に原名亜種のヒゲイノシシ(S. b. barbatus)と呼ばれ、スマトラ島に生息する個体はニシヒゲイノシシ(S. b. oi)と呼ばれている。マレー半島に生息する個体はかつてはニシヒゲイノシシであると考えられていたが、遺伝学的な研究により、ボルネオ島に生息する個体と同種であるとされるようになった。 バンカ島では2亜種の中間種が生息している。パラワンヒゲイノシシはかつてヒゲイノシシの亜種として分類されていたが、遺伝学的かつ形態学的に別種であることが示され、系統学的種概念の下で１つの種とされるようになった。ただし、系統学的種概念は他の種の概念よりその明確さに欠けるため、別種とするためにさらに情報が必要とされている。
Title: ヒゲイノシシ (Bornean bearded pig)
Section: 飼育されている動物園

サンディエゴ動物園ロンドン動物園ベルリン動物園キャピタル・オブ・テキサス動物園グラディス・ポーター動物園タイピン動物園シンガポール動物園マレーシア国立動物園
Title: ヒゲイノシシ (Bornean bearded pig)
Section: 飼育されている動物園
Subsection: かつて飼育されていた動物園

ヘラブルン動物園サウスウィックズ動物園
Title: ミヤマキンポウゲ (Ranunculus acris)
Section: abstract

ミヤマキンポウゲ（深山金鳳花、学名:Ranunculus acris var. nipponicus）は、キンポウゲ科キンポウゲ属の多年草の高山植物。
Title: ミヤマキンポウゲ (Ranunculus acris)
Section: 概要

北海道～中部地方以北の亜高山帯～高山帯の湿り気のある場所に生え、雪渓周辺に大群落をつくることが多い。高さは10～50 cm。雪解けとともに芽出しが始まり、葉が展開する。葉は3裂し、さらに細かく裂けてモミジの葉のような形をしている。7～8月には中心から花芽を伸ばして開花する。花は黄色い直径2 cmほどの5弁花で、丸みを帯びている。地下では根茎が広がり、次々とわき芽が伸び出す。花後には金平糖のような痩果（そうか）ができ、種をつける。やがて葉は黄変して落ち、冬芽の状態で長い冬を過ごす。基準標本は、木曽駒ヶ岳のもの。田中澄江が『新・花の百名山』の著書で、ミヤマキンポウゲなどの高山植物と北ノ俣岳を紹介した。秋田県版レッドリスト２０１４（維管束植物）では、絶滅危惧II類に指定されている。
Title: ミヤマキンポウゲ (Ranunculus acris)
Section: 近縁種

以下の似た種がある。
Title: モリムシクイ (Wood warbler)
Section: abstract

モリムシクイ(Wood warbler)は、北ヨーロッパ、温帯ヨーロッパからロシアの極西、ウラル山脈南まで、広く分布するメボソムシクイ属の鳥である。大規模な渡りを行い、ほとんどは熱帯アフリカで越冬する。
Title: モリムシクイ (Wood warbler)
Section: 名前

属名Phylloscopusは、古代ギリシア語で「葉」という意味のphullonと「探す者」という意味のskoposに由来する。種小名sibilatrixは、ラテン語で「口笛を吹く者」の意味である。19世紀末には、"wood-wren"という英名でも呼ばれるようになった。
Title: モリムシクイ (Wood warbler)
Section: 生息域

この鳥は、営巣のためのまばらな地被植物があり、カバやフユナラ等の開放的であるが日陰多い木からなる森林に生息する。ドーム型の巣は、低木の地面に近いところに作られ、5月には、6個か7個の卵が産まれる。旧世界のアメリカムシクイの大部分と同様に、食虫性である。ポーランドのビャウォビエジャの森に生息するモリムシクイの巣の主な捕食者は哺乳類、特に中型の肉食動物で、主に夜間に音や匂いを頼りに巣を襲う。そのため、恐らく雛が成長し鳴き声が大きくなると捕食者に見つかる確率が上がるため、時間がたつにつれて、巣の生存率は徐々に低下する。
Title: モリムシクイ (Wood warbler)
Section: 記載

体長は11-12.5cmで、外見は典型的なメボソムシクイであり、上部は緑色、下部は白色、胸はレモンに似た黄色である。眉、喉、上胸の黄色、三列風切羽の端の淡い色、初列風切羽が長いこと、尾が短く太いこと等で、チフチャフやキタヤナギムシクイ等の類似種と区別できる。イギリスには、4月から8月頃に夏の鳥として渡ってくるが、近年その数は減っている。アイルランドでは滅多に見られないが、ウィックロー県では非常に少ないながら確かに繁殖している。傾斜、被覆、広葉樹の割合、林冠の高さ、林縁の長さ等、森林の構造に関する様々な要因がこの種の占有率に影響を与える。そのため、保存のためには、モリムシクイが好む森林の構造を維持する取組が重要である。また、繁殖期以外の森林の好みもあるが、ガーナなどの越冬地ではこのような生息地は減少している。森林の生息域は減少しているが、モリムシクイは木の多い農場等でも生息できるため、数自体はあまり変わっていない。しかし、さらに森林が減少すると、将来的にこの種にとって良くない影響を与える可能性がある。
Title: モリムシクイ (Wood warbler)
Section: 鳴き声

2種類の鳴き声があり、それを交互に繰り返すことが多い。金属が震えるような甲高い ピチチチチという声がテンポが速くなりつつ2-3秒続き、その後、より低い管楽器のようなピューピューという音が3-5秒続く。仲間と連絡を取り合う時には、後者に似た柔らかい音で、短く「ピュー」と鳴く。
Title: グリーンバシリスク (Plumed basilisk)
Section: abstract

グリーンバシリスク（Basiliscus plumifrons）は爬虫綱有鱗目トカゲ亜目イグアナ科（バシリスク科とする説もあり）バシリスク属に分類されるトカゲ。
Title: グリーンバシリスク (Plumed basilisk)
Section: 分布

コスタリカ、パナマ、ニカラグア、ホンジュラスなど、主に赤道付近の国に生息している。
Title: グリーンバシリスク (Plumed basilisk)
Section: 形態

全長60-70cm。和名の通り他の同属種と違い、成体は体色が青味がかった緑色になる。幼体は体色がくすんでいるが、成長につれ鮮やかになる。尾は長く全長の半分以上を占める。成体のオスに頭頂部や背面、尾にトサカや帆びれが発達する。頭頂部には帆びれが2つある。成長するにつれて帆が発達していく。メスや幼体は帆びれが発達しない。
Title: グリーンバシリスク (Plumed basilisk)
Section: 生態

水辺の森林に生息し、水上に張り出した木の上にいることが多い。驚くと水中に飛びこんだり、後肢だけで立ちあがり走って逃げる。その際に短距離であれば浮力などを利用し水面を走り抜けることもある。動く水しか水と認識しない。食性は肉食性の強い雑食性で昆虫類(トンボやバッタ)、小型爬虫類(自分より小さなトカゲ)、小型両生類(カエルなど)、小型鳥類、コウモリやネズミを含む小型哺乳類、果実等を食べる。繁殖形態は卵生で、15-20個の卵を産む。卵は2ヶ月程で孵化する。
Title: グリーンバシリスク (Plumed basilisk)
Section: 人間との関係

同属他種と違い目立つ体色のためか、TV等で単にバシリスクと紹介されるのは本種であることが多い。ペット用として流通されることがあり、日本にも輸入されている。主に繁殖個体が流通する。属内ではノギハラバシリスクと共に流通量は多く、他種と異なる体色や知名度もあるため人気が高い。飼育された個体はあまり帆びれが発達しないとされる。驚くとケージ内を走り回り吻端を潰してしまうため、飼育には広いケージと落ち着いた環境が必要。幼体から飼育すれば人や環境に慣れることもあるが、場合によってはケージを暗幕で覆う等の対処をして外部から刺激を受けないようにする。また水辺の高温多湿の環境を好むため全身が浸かる事の出来る水容器や、ケージ全体を保温する設備も必要になる。
Title: ヒメコウテンシ (Greater short-toed lark)
Section: abstract

ヒメコウテンシ（姫告天子、学名：Calandrella cinerea）は、スズメ目ヒバリ科に分類される鳥類の一種である。以前はカラフトコヒバリとも呼ばれていた。
Title: ヒメコウテンシ (Greater short-toed lark)
Section: 分布

ヨーロッパ南部からトルコ、中央アジア、モンゴル、中国北部にかけての地域と、アフリカ東北部から南部で繁殖し、冬季は地中海沿岸、アフリカ、アラビア半島、パキスタン、インド西北部に渡って越冬する。日本では数の少ない旅鳥または冬鳥として渡来する。日本海側の島嶼では、ほぼ毎年観察されるが、それ以外の地域では少ない。越冬例もある。
Title: ヒメコウテンシ (Greater short-toed lark)
Section: 形態

全長約14cm。スズメよりもやや小さい。背中や翼の上面はやや濃い褐色で、胸の両脇に黒褐色の斑がある。眉斑は淡色。体の下面は淡い褐色。雌雄同色である。
Title: ヒメコウテンシ (Greater short-toed lark)
Section: 生態

草地や農耕地、海岸などに生息する。食性は雑食で、地上で昆虫類や草の実を食べる。繁殖形態は卵生。草の根元などの地上に枯れ草や茎、根などを使って浅い椀状の巣を作る。内部には動物の毛や、鳥類の羽毛を敷いてある。1腹3-5個の卵を産み、抱卵期間は約16日である。抱卵は雌雄で行う。地鳴きは「ジュンジュン」「チュンチュン」など。
Title: シロガオリュウキュウガモ (White-faced whistling duck)
Section: abstract

シロガオリュウキュウガモ (白顔琉球鴨、学名 Dendrocygna viduata) は、鳥類カモ目カモ科に分類される鳥類の一種。
Title: シロガオリュウキュウガモ (White-faced whistling duck)
Section: 形態

全長38-48センチメートル。重502-820グラム。首と脚が長く、胸は栗色、首と頭は黒、顔は白、足は灰色。
Title: シロガオリュウキュウガモ (White-faced whistling duck)
Section: 分布

南アメリカ・サブサハラアフリカ・マダガスカル・コモロでは、普通に見られる。
Title: シロガオリュウキュウガモ (White-faced whistling duck)
Section: 亜種

単型種である。
Title: シロガオリュウキュウガモ (White-faced whistling duck)
Section: 生態

湿地に生息する。水の利用可能性による数百キロ移動する可能性が示されている。植物（草・種・米）や動物（軟体動物・甲殻類・昆虫）を通常夜に食べる。地面や草やヨシ原に植物の巣作り。産卵数は4-13個で抱卵日数は26-28日である。
Title: シロガオリュウキュウガモ (White-faced whistling duck)
Section: 生態
Subsection: 音声データ

 シロガオリュウキュウガモの鳴き声。 : 再生時間: 00:00:04、ファイルサイズ: 224KB
Title: ホタルイカ (Firefly squid)
Section: abstract

ホタルイカ（螢烏賊／蛍烏賊、学名Watasenia scintillans (Berry, 1911)）は、ツツイカ目（開眼目）ホタルイカモドキ科に属するイカの一種である。軟体動物類の深海性発光動物。「コイカ」あるいは「マツイカ」ともよばれ、胴長は雄4cm・雌6cm、重さ10gと小さい。後述のように食用とされる。富山県滑川市の『滑川市のさかな』に指定されている（1991年7月30日より）。
Title: ホタルイカ (Firefly squid)
Section: 名称について

ホタルイカの属名Watasenia は1905年に和名を「ホタルイカ」と命名した明治期の生物学者渡瀬庄三郎にちなんで1913年に石川千代松によりつけられている。富山の方言では「マツイカ」と呼ばれることが多かった。これはホタルイカが松の肥料として利用されることが多かったからとされる。英名の一つであるfirefly squidは和名と同じく「ホタルのようなイカ」の意味で、toyama squidは日本の代表的な産地である富山湾に因む。米『ウェブスター辞典』のfirefly squidの項目には"a brilliantly luminescent squid (Watseonia scintillans) caught in great quantities off the western coast of Japan where it is used for fertilizer"と記載されている。冷蔵・運送が近代化される前は、地元での食用以外は、流通前に肥料として多く利用されたためである。“ほたるいか”は「晩春」を表す季語の一つである。
Title: ホタルイカ (Firefly squid)
Section: 分布と生態

世界にはホタルイカの仲間が40種類ほど生息している。日本近海では日本海全域と太平洋側の一部に分布しており、富山湾に面する滑川市を中心とする富山県と、兵庫県の日本海側で多く水揚げされている。特に、数十万匹の大群で海岸近くまで押し寄せるのは富山湾独特の珍しい現象で、世界でも他に見られない。この為、生息海面が特別天然記念物に指定されている。漁獲量は兵庫県の浜坂漁港が日本一（2017年で2734トン）で、富山県全体（同1299トン）を上回る。富山湾ではホタルイカの雌が産卵のため深海200～600mの谷間から浮上して浅瀬に密集し、翌未明には沖へ帰っていく。晩春から初夏までが産卵期で、1回当たり数千個から1万個の卵を産む。交尾と産卵は同時ではない。ホタルイカが発光する理由は、外敵に対する威嚇・幻惑・仲間とのコミュニケーション・餌寄せのためなどとされている。発光器は3種類、すべて腹側に付いている。いちばん大きくて強く光る発行器は、一対の腕の先に3個ずつあって青白く光る。皮膚にある発光器は、 ひれを除く全身に700～1,000個あって青と緑の光を満天の星のように放つ。そして両眼の周りに5個ずつある。触手の先には、それぞれ3個の発光器が付いている。何かに触れると発光するため、敵を脅すものではないかと考えられているが、光によって敵を誘導し、ただちに消灯してその場から逃げるという、いわば囮としての機能があるともされている。体表の海底側（腹側）には細かい発光器があり、これは海底側にいる敵が海面側にいるホタルイカを見ると、海面からの光に溶け込み姿が見えなくなるカウンターイルミネーション効果の役割を果たしている。海面側から海底に向かって見た場合はこの効果が働かないため、体表の海面側（背中側）には発光器はほとんど存在しない。
Title: ホタルイカ (Firefly squid)
Section: 分布と生態
Subsection: 発光物質

発光反応の全容は未解明である。しかし、仕組みは 発光素（ルシフェリン）・発光酵素（ルシフェラーゼ）などが化学反応を起こすことによる。「セレンテラジンジサルファイト化合物（coelenterazine disulfate、二硫化セレンテラジン化合物、ルシフェリンの一種）によると考えられており、アデノシン三リン酸（ATP）とマグネシウム（Mg）が大きく関与している」。また、「発光反応の最適温度は、5℃でホタルイカの生息適温と対応している」などが判明している。
Title: ホタルイカ (Firefly squid)
Section: 見学

ホタルイカは春の風物詩として知られており、「富山湾の神秘」といわれている。ホタルイカ大群遊のときに見られる青緑の宝石のようで幻想的な光の帯は「海の銀河」にも例えられる。富山県の滑川市を跨いで富山市から魚津市にかけて水揚げされる富山湾沿岸は、ホタルイカの群遊海面として有名である。富山湾に流入する常願寺川の河口左岸から魚津港までの約15km、満潮時の沖合1,260mまでの海域は1922年（大正11年）に国の天然記念物に指定され、1952年（昭和27年）3月29日には「ホタルイカ群遊海面」の名称で特別天然記念物に格上げし、生息海面を保護している。天然記念物指定を「ホタルイカ」とすると食用利用が出来なくなるために、「群遊海面」を指定して保護したものである。富山湾でのホタルイカ定置網漁の様子は観光船から観察できる。4-5月の富山湾沿岸では、発光しつつ砂浜に打ち上げられ「ホタルイカの身投げ」といわれる光景が出現することもある。大量のホタルイカが波によって浜に打ち寄せられる現象が、風がなく比較的暖かい、新月前後の夜中から夜明け前の暗がりの中で幻想的に見られることがある。富山県滑川市の「ほたるいかミュージアム」でホタルイカの様子を観察できる。兵庫県浜坂漁港では毎春「浜坂みなとほたるいか祭り」を開いている。ホタルイカは1966年（昭和41年）7月1日発売の35円普通切手の意匠になった。
Title: ホタルイカ (Firefly squid)
Section: 利用

主に食用となるほか、養殖マグロの飼料用途への研究がされている。
Title: ホタルイカ (Firefly squid)
Section: 利用
Subsection: 漁法

漁期は2月から5月頃、主な産地は日本海側の兵庫県、富山県、鳥取県、福井県などである。富山県（富山湾）では、定置網漁により夜間に沿岸に浮上してくる個体を明け方前に捕獲する。富山湾沿岸での定置網漁であるため、漁獲資源が保護され、且つ、ホタルイカを傷つけずに捕獲できることで鮮度が良いことが特徴である。また、この漁を観察するための観光船が漁期のみの期間限定で滑川市で運航されている。兵庫県（山陰沖）での底引き網漁は昭和60年（1985年）頃に開始され、深さ200m程度を回遊している個体を捕獲する。年間2000tから3000t程度を捕獲しており捕獲量は、富山県より多い。
Title: ホタルイカ (Firefly squid)
Section: 利用
Subsection: 食用

富山県では古くから食用とされ、炒め物、佃煮を含む煮物、酢味噌和え、沖漬け、素干し、天ぷら、唐揚げ、足だけを刺身にした竜宮そうめんなどがある。腐敗が早いため冷凍・冷蔵での高速輸送手段が発達するまで、産地以外での食用は困難だった。現代では、首都圏など水揚げ漁港から遠い地域の食品スーパーマーケットや鮮魚店で販売されるほか、居酒屋や回転寿司店などで提供される。傷みやすいことによる食中毒や、後述するような寄生虫の虞があるため、古くより食してきた地元でも生では食べなかった。平成になってから、冷凍などの処理をしたものが生食用として春先の店頭に並ぶことが多くなっている（生食の注意点については後述）。食味や旬の漁獲高が多いことだけでなく、近年は栄養面でも評価されている。富山短期大学教授の竹内弘幸（食品機能学）の分析によると、ビタミンAやビタミンB12、タウリンを多く含む。
Title: ホタルイカ (Firefly squid)
Section: 利用
Subsection: 食用

=漫画『美味しんぼ』第37巻収録の「生きた宝石」で、ホタルイカについて生きたまま食べる描写（ホタルイカの踊り食い）がなされている。作中では肝のおいしさが絶賛されているが、ホタルイカには旋尾線虫亜目に属する旋尾線虫( Crassicauda giliakiana )が寄生しているため、生食の際は厚生労働省が指定した方法で処理を行う必要がある。未処理品の「踊り食い」や処理が不完全な物を食用とした場合、後述の寄生虫症を発症することがある。厚生労働省による通知、（衛食第110号 衛乳第125号 平成12年6月21日）生食を行う場合には、次の方法によること。-30℃で4日間以上、もしくはそれと同等の殺虫能力を有する条件で凍結すること。（同等の殺虫能力例：-35℃（中心温度）で15時間以上、または-40℃で40分以上）なお、凍結処理を行った場合、製品にその旨表示を行うこと。内臓を除去すること、または、内臓除去が必要である旨を表示すること。生食用以外の場合には、加熱処理（沸騰水に投入後30秒以上保持、もしくは中心温度で60℃以上の加熱）を行うこと。販売者、飲食店等関係営業者に対し、生食用としてホタルイカを販売等を行う場合には、1.にある方法により処理したものを販売するよう指導すること。一般消費者に対し、ホタルイカを生食する場合の寄生虫感染の可能性について情報提供を行うとともに、生食する場合には1.にある方法による旨を啓発すること。
Title: ホタルイカ (Firefly squid)
Section: 利用
Subsection: 食用

=生食により寄生虫症を発症し、急性腹症として腸閉塞、皮膚爬行症、眼球移行症などを起こすことがある。国立感染症研究所によれば、最初の症例報告は1974年の秋田県での腸閉塞の疑い例とされている。その後、報告は1987年まで途絶えるが以降1994年までに約50例が報告され注目された。診断は摘出虫体の病理組織学的同定（とり出して調べる）。治療法は今のところ外科的摘出（広い目にメスを入れて引っ張りだす）のみ。症状急性腹症 - 潜伏期間：1 - 3日程度。嘔気、嘔吐、下痢、腹痛、腸閉塞。皮膚爬行症 - 潜伏期間：2週間程度。皮膚にミミズバレなど、眼球移行も報告されている。
Title: オグロイワワラビー (Brush-tailed rock-wallaby)
Section: abstract

オグロイワワラビー（Petrogale penicillata）は、二門歯目カンガルー科イワワラビー属に分類される有袋類。
Title: オグロイワワラビー (Brush-tailed rock-wallaby)
Section: 分布

オーストラリア（クイーンズランド州南東部、ニューサウスウェールズ州南部、ビクトリア州東部）
Title: オグロイワワラビー (Brush-tailed rock-wallaby)
Section: 形態

体長オス52.9-58.6cm、メス51-57cm。尾長51-70cm、50-63cm。体重オス5.5-10.9kg、メス4.9-8.2kg。尾の先端は体毛が伸長し房状になり、英名（brush-tailed=ブラシのような尾のある）の由来になっている。また尾は大部分が黒い体毛で被われ、和名の由来になっている。頬には明色の帯が入る。肩の後部に黒い帯が入る。
Title: オグロイワワラビー (Brush-tailed rock-wallaby)
Section: 生態

岩場に生息する。2-30頭の群れを形成し生活し、群れの規模は分布や生息地によって変異がある。オスは縄張りを形成する。夜行性で、昼間は岩の隙間などで休む。薄明時には日光浴を行うこともある。食性は植物食で、樹皮、木の葉、草およびその根などを食べる。水分は食物から摂取する。繁殖形態は胎生。幼獣は生後約200日は母親の育児嚢の中で生活し、さらに3か月後に乳離れする。
Title: オグロイワワラビー (Brush-tailed rock-wallaby)
Section: 人間との関係

開発による生息地の破壊、毛皮目的の乱獲、人為的に移入されたアナウサギ、ヒツジ、ヤギなどとの競合、およびアカギツネやディンゴなどによる捕食などにより生息数は激減している。
Title: スズメノカタビラ (Poa annua)
Section: abstract

スズメノカタビラ（雀の帷子、学名：Poa annua）は、単子葉植物イネ科イチゴツナギ属の一年草である。冬を越して越年草となることもある。
Title: スズメノカタビラ (Poa annua)
Section: 特徴

身近にごく普通に見られる雑草である。稈は株立ちし、高さ5～30センチメートル、軟弱でざらつかない。地下茎はなく、数本が株立ちになっている。全株黄緑色で柔らかい。茎は葉の基部の鞘に包まれ、葉は平らで短めの線形、真っすぐに出るが、先端がやや窪んで受けた形になっており、長さ4～10センチメートル。時折り葉の縁が波打つようになる。花序は円錐花序で、季節を問わずに出るが主に春に開花する。花序の枝が横に広がるのが特徴の1つ。小穂は卵形、長さ3～5ミリメートル、ときに紫色を帯び、左右から偏平で小花は3～5個。護穎は先が鈍くとがり長さ約3ミリメートル、縁は透明な膜質で、背面の中間部以下に綿毛を密生する。内穎の竜骨に綿毛がある。名は、葉鞘や護穎の縁が膜質で、薄い単衣を思わせることによる。
Title: スズメノカタビラ (Poa annua)
Section: 成育環境

非常に広範囲に生育している。道端、庭の隅、畑など、おおよそ雑草の生える場所ならどこにでも生えている。しかし、どちらかと言えば湿った所を好み、水田の田植え前には一面に出る。分布も広く、国内は全土に、国外では南極大陸にも帰化している。ヨーロッパ近辺が原産とも言われるが、不明。アメリカ大陸は、比較的近年の帰化だと考えられている。
Title: スズメノカタビラ (Poa annua)
Section: 変種

本種は異なる二倍体植物を起源とする複二倍体植物と考えられ、極めて変異に富む。そのため、Poa annuaに属する分類群として多数の亜種・変種群が記載されてきたが、一般的には、狭義のスズメノカタビラ(P. annua L. var. annua)とツルスズメノカタビラ (P. annua L. var. reptans)の二群のみを認める見解が多数である。両者の相違点は、var. annua は1年生または越年性であり直立する、var. reptans は匍匐し、多年生である、とされる。また両者は種子の休眠期間に違いがあるとする報告もある。日本では、両者の区別点として、主に基部以外の節から発根するか否かという点が取り上げられ、発根するものをツルスズメノカタビラとしている。大井(1965)は、日本産スズメノカタビラの中に叢生しないものがあることを認め、これをvar. reptans と考え、和名を「ツルスズメノカタビラ」とし、その特徴として梢が伸長、倒伏し、節から発根することを指摘した。『神奈川県植物誌2001』では、ツルスズメノカタビラは匍匐性を示し、走出枝が数センチに渡って伸長し、栄養繁殖するとされる。日本のツルスズメノカタビラはヨーロッパ原産の帰化種とも考えられている。
Title: スズメノカタビラ (Poa annua)
Section: 近縁種

近縁種としてはツクシスズメノカタビラ P. crassinervis が西日本にあり、やや背が高く、穂が上に向いて立つ。確実に同定するには小穂を見る必要がある。属は異なるが、やや似た姿で、似た所に生育する小型のイネ科植物としてはニワホコリ Eragrostis multicaulis があり、育ち具合によっては紛らわしいことがある。
Title: マシアカサウルス (Masiakasaurus)
Section: abstract

マシアカサウルス（学名：Masiakasaurus）は、約7000万年前から約6600万年前にかけてマダガスカル島に棲息していた竜盤目獣脚亜目ノアサウルス科の恐竜。マハジャンガ州の中央部にあるマハジャンガ盆地 (Mahajanga Basin) のベリヴォトラ村〈Berivotra〉近郊のマエヴァラーノ累層から産出する。食性は肉食性、特に魚食性。
Title: マシアカサウルス (Masiakasaurus)
Section: 名称

属名 Masiakasaurus（マシアカサウルス）の "Masiaka" は、現地語であるマダガスカル語で "vicious（悪意ある、危険な、獰猛な）" を意味する "masiaka（マシーアカ）"から採っている。"saurus" は、「トカゲ」を意味する古代ギリシア語普通名詞 "σαῦρος（サウロス）" に由来する分類学用新ラテン語名詞接尾辞 "-saurus（サウルス）" である。種小名 knopfleri（［ラテン語発音準拠］クノプフレーリー、クノフレーリー、［長音省略形］クノプフレリ、クノフレリ、［由来名準拠］ノップラーイー、［ちゃんぽん読み］ノップレリ、［英語読み音写例］ノップフレアーイー）は、イギリスのロックバンドであるダイアー・ストレイツのギタリスト兼ヴォーカリストなどとして有名で大英帝国勲章受章者でもある Mark Knopfler（マーク・ノップラー）の名から採られている。これは、古生物学者スコット・D・サンプソンらが現場の採石場で本種の化石の発見に繋がる発掘調査に励んでいた際、ノップラーの音楽を聴きながら作業していた時に本種の骨格化石を発見しており、他の音楽を聴いていた時には何も発見できなかったという事実にちなんでの献名である。ノップラーはイギリスの日刊タブロイド紙『ザ・サン』のインタビューの中で、「私は本当に嬉しい。これは非常に特別な名誉だ。」「（私が）恐竜だというのは確かに適切な見立てだが、少しも悪質ではないことを（このインタビューを通じて）報告できて嬉しい。」と語っている。
Title: マシアカサウルス (Masiakasaurus)
Section: 名称
Subsection: 惡龍

中国語圏の分類学では、「悪意ある恐竜」「凶暴な恐竜」などといった語意をもつ Masiakasaurus を「惡龍」と漢訳し、knopfleri には "Mr. Knopfler" の漢訳名である「諾弗勒氏」の省略形「諾氏」を当てている。このことから、Masiakasaurus knopfleri は「諾氏惡龍（簡体字: 诺氏恶龙）」と綴る。また、「諾弗勒惡龍（簡体字: 诺弗勒恶龙）」という異表記も見られる。
Title: マシアカサウルス (Masiakasaurus)
Section: 分類
Subsection: 系統分類

サンプソンら（サンプソン、カッラーノ、フォースター）による2001年の最初の記述では、本種はラエヴィスクスとノアサウルスの間に系統分類されるべきアベリサウルス上科の1属と位置付けられた (Sampson et al. 2001) 。2002年に、カッラーノら（カッラーノ、サンプソン、フォースター）は、本種をラエヴィスクスおよびノアサウルスと共にノアサウルス科に配置し直した (Carrano et al. 2002) 。カッラーノらは、本種の知見を加えたアベリサウルス上科の系統発生分析を行い、以下のように更新したクラドグラムを発表した。
Title: マシアカサウルス (Masiakasaurus)
Section: 特徴

全長は約 5 - 6 ft（約1.5 - 1.8 m）。推定体重は約 80 lb（約36.3 kg）。ジャーマン・シェパード・ドッグ程度の大きさという説明がされることもある。下顎骨の先端が下方に反り返っており、それに合わせて前方の歯が前に突き出している。前方の歯は小さな物を咥えるのに向く曲がった形であり、魚などの小さな動物を捕食していたと考えられる。後方の歯は多くの肉食恐竜と同じようなタイプである。マシアカサウルスの棲息環境では、中型獣脚類のマジュンガサウルス（全長約8m）を頂点捕食者とする生態ピラミッドが形成されていたと考えられる。
Title: マシアカサウルス (Masiakasaurus)
Section: 関係者

主要な研究者Scott D. Sampson (Scott Donald Sampson)（スコット・D・サンプソン、スコット・ドナルド・サンプソン）(1961- )  カナダ人。古生物学者、科学コミュニケーター。2001年に本種を記載（筆頭著者）。学名の命名者。記載当時からユタ自然史博物館所属。カリフォルニア科学アカデミー会員（事務局長）。Scott D. Sampson - WikispeciesMatthew T. Carrano（マシュー・T・カッラーノ）(1961- )  カナダ人。古生物学者。2001年に本種を記載（共著者）。スミソニアン博物館所属。Matthew T. Carrano - WikispeciesCatherine Ann Forster（キャサリン・A・フォースター、キャサリン・アン・フォースター）アメリカ人。古生物学者、分類学者。2001年に本種を記載（共著者）。ジョージ・ワシントン大学教授。Catherine A. Forster - Wikispecies
Title: シュードモナス・プチダ (Pseudomonas putida)
Section: abstract

シュードモナス・プチダ（Pseudomonas putida）はグラム陰性桿菌であり、腐生栄養性の土壌微生物である。分子遺伝学的分類手法が登場する前の形態学的分類手法に基づく狭義のシュードモナス属である。16S rRNA系統解析によりシュードモナス属の種がいくつかのグループに分類されたとき、P. putidaグループが設けられてそのグループの代表的な種に位置づけられた。
Title: シュードモナス・プチダ (Pseudomonas putida)
Section: 分布

Pseudomonas putidaは、酸素がある環境一般(土壌及び水圏)で見られる。生育至適温度は25 - 30℃である。KT2440株などの菌株は根圏でコロニーを形成する。根の表面は細菌に栄養素を供給し、これに対してP. putidaは病原体が根に繁殖することを防ぐことで寄主植物の生長に寄与する。この植物生長促進効果のためにP. putida菌株は生物農薬としての利用が期待され、研究開発されている。
Title: シュードモナス・プチダ (Pseudomonas putida)
Section: 遺伝学的特性

1995年に、ドイツのThe Institute for Genomic ResearchがPseudomonas putidaの完全なゲノム配列を決定した。それ以降、30菌株のゲノム配列が決定され、他の75菌株がシークエンシングの途上にある(2002年現在)[4]。P. putidaのゲノムは約620万bpである。F1株は5,959,964bpであり、GC含量が61%である。KT2440株は6,181,863bpである。P. putida KT2440の染色体は、DNAストランド内における相補的なオリゴヌクレオチドの等量性と鎖の対称性が特徴である。KT2440株において各ヌクレオチド4量体(テトラヌクレオチド)は2つの鎖で同じ頻度で出現する。P. putida株の分類において、ゲノムにおける最も一般的な繰り返し配列である種特異的遺伝子外パリンドローム配列が利用されている。P. putidaにコードされた配列において、LLL(リジンの3量体)が最も多量なトリペプチドである。
Title: シュードモナス・プチダ (Pseudomonas putida)
Section: 代謝特性

P. putidaは、環境中の基質の分解に関与する酸化還元酵素遺伝子を少なくとも80個有している。また、遺伝子の大部分は環境中の化学的状態を検出することに役立ち、このため毒素にすぐに応答することができる。また、TOLやOCTプラスミドなどの、汚染物質の分解能力を与える多くのプラスミドを有している。一方で、例えばプラスミドR68-45などは有益な機能を与えず、むしろ増殖率を減少させる。P. putidaは、タンパク質に関する様々な調節機構(タンパク質やペプチドの分泌及び輸送、タンパク質の修飾、修復、折りたたみ、安定化、タンパク質やペプチドや糖タンパク質の分解など)により環境ストレスに対する耐性を有している。P. putidaが有するシグナル伝達の調節タンパク質は、シグナルの受信のみに依存せずにその経路の特異的なプロモーターやレギュレイターもコントロールし、非常に複雑な代謝経路を構築している。また、シグナルを受信すると、酸素や栄養素の利用可能性の情報を細胞に伝達する。他の重要な調節タンパク質として、Crcタンパク質は炭素代謝を調節するシグナル伝達経路に関わり、バイオフィルムの形成にも関与する。P. putidaは他のシュードモナス属と同様に、環境中から鉄を獲得する鉄キレート剤のシデロホアを有している。また、シデロホアに鉄錯体が輸送されることを助ける外膜受容体タンパク質も有している。獲得された鉄は、酸素が電子受容体である代謝過程で利用される。酸素は電子受容体として優れているが、このときに過酸化物や活性酸素種などの細菌に対して有毒な副産物も生成される。これに応答して、P. putidaは副産物から細胞を保護するためにカタラーゼを産生している。P. putidaは、脂肪酸の飽和度、シクロプロパン脂肪酸の合成量、及びこれらのシス-トランス異性化の程度を、環境に適応するように変更することができる。対数増殖期から定常期への移行の際に、基質の摂取を効率的にするために脂肪酸の飽和度と膜流動性が高くなる。P. putidaのこれらの特徴は、致死的な毒に対して生存できるようにし、毒で汚染された土壌で生育することを可能にする。また、P. putidaは、生物に対して有害な有機溶媒を無害な物質に変換する能力も持ち、バイオレメディエーションに利用することができる。P. putidaはエネルギーを獲得する手段としてエントナー-ドウドロフ経路を利用している。エントナー-ドウドロフ経路では、グルコースやグルコン酸などのヘキソースを分解し、グルコース1分子につきATPを正味1分子獲得する(解糖系では、グルコース分子1分子につきATPを2分子獲得する)。P. putidaはエネルギー獲得のための多数の代替経路を利用することができるが、それらを主要に利用せず、エントナー-ドウドロフ経路に依存している。
Title: シュードモナス・プチダ (Pseudomonas putida)
Section: バイオレメディエーションへの利用

P. putidaのいくつかの株は「多プラスミド炭化水素分解シュードモナス菌」[ 英: multi-plasmid hydrocarbon-degrading Pseudomonas ]と呼ばれ、非常に多様な代謝特性を持ち、トルエンやナフタレンのような有機溶媒を分解するなどの能力を有する。また、燃料、石炭、タバコ、その他の有機物質の燃焼時に生じる有害な芳香族または脂肪族炭化水素の分解に関与するほとんどの遺伝子を持つ。このため、P. putidaの多く株は油分などに対するバイオレメディエーションに利用されている。
Title: シュードモナス・プチダ (Pseudomonas putida)
Section: バイオレメディエーションへの利用
Subsection: 石油の分解

P. putida PB4は、石油の分解を目的としたバイオレメディエーションに有用である。PB4株はベンゼンと、C1からC4の側鎖を持つアルキルベンゼンを分解できる。PB4株とAcinetobacter sp. T4の混合付加は、原油の飽和画分の40％および芳香族画分の21％を10日間で分解した；この分解率は、原油の分解に寄与する微生物が特に多様かつ豊富な共同体による場合と同程度である。この2菌株共同体において、T4株は飽和画分と芳香族画分の両方で分解活性を示し、PB4株の成長を助ける代謝物を産生する。PB4株はこの代謝物を用いて増殖し、芳香族化合物を分解する。
Title: シュードモナス・プチダ (Pseudomonas putida)
Section: バイオレメディエーションへの利用
Subsection: スチレンの分解

P. putidaはスチレンを生分解性プラスチックのポリヒドロキシアルカノエート[ 英: Polyhydroxyalkanoates（英語版） ](PHA)に変換できる。このため、生分解とは異なる方法での、発泡ポリスチレンの効率的なリサイクルに用いることができる可能性がある。P. putida CA-3(NCIMB 41162)は2つの経路（1）ビニル側鎖の酸化、2）分子の芳香族核の攻撃）でスチレンを分解する。2006年に発表されたCA-3株を用いた試みでは、ポリスチレン(スチロール樹脂)を熱分解してスチレン油に変換し、続いてCA-3株で生成スチレンをPHAへ変換することが試みられた。熱分解プロセスでのスチレンへの変換効率は82.8%(w/w)であり、発酵プロセスでは生成スチレン1g当たり62.5mgのPHAが得られた。結果、ポリスチレン64gは6.4gのスチレンに変換された。