shintaro-ozaki/entity-explanation huggingface dataset:
Title: NUMB_(タンパク質) (NUMB (gene))
Section: 哺乳類のNumb
Subsection: 増殖や分化を補助する選択的スプライシング

Numb変異型マウス胚では、初期神経は正常な空間的・時間的パターンで出現するものの、増殖を行う前駆細胞のプールが十分に維持されず、神経発生開始直後に分裂細胞集団はほぼ枯渇する。こうした胚では、前脳の神経発生の早期進行や神経管閉鎖の欠陥が生じ、胎生11.5日前後で死に至る。これらの研究は、哺乳類のNumbが神経発生時の前駆細胞運命決定に機能的役割を果たしている、すなわち無脊椎動物において提唱されているものとは反対の役割であることを示唆している。一方他の研究では、哺乳類の神経堤のMONC-1細胞株でのNumbの過剰発現によって神経分化が促進されるという、ショウジョウバエで観察されたものと一致する結果が得られている。無脊椎動物のNumb遺伝子とは異なり、哺乳類のNumb遺伝子には選択的スプライシングが生じ、少なくとも4種類の機能的に異なるアイソフォームが産生される。ショウジョウバエでは非対称分裂だけによって十分な神経集団が生み出されるが、哺乳類の脳はより高度であり、非対称分裂だけでは確立することができない、より大きな神経集団を必要とする。そのため、哺乳類の皮質前駆細胞はまず対称分裂によって前駆細胞のプールを拡大し、それから非対称分裂によって神経形成を行う必要がある。哺乳類の脳は、神経分化を補助するNumbのアイソフォームに加えて、前駆細胞集団を維持するNumbのアイソフォームを産生することで、これを達成している。マウス胚P19細胞株を用いた研究では、短いプロリンリッチ領域（PRR）を持つアイソフォームは神経分化を促進し、長いPRRを持つものは分化を阻害することが示されている。また、長いアイソフォームであるp71やp72は主に活発に分裂している組織で発現しており、分化時にダウンレギュレーションされることから、これらのアイソフォームは細胞増殖を促進していることが示唆される。一方、哺乳類の短いPRRを持つアイソフォームはショウジョウバエの66 kDaのNumbタンパク質と同様に細胞分化を促進する。
Title: NUMB_(タンパク質) (NUMB (gene))
Section: がんや腫瘍形成における役割

いくつかの種類のがんでは、NUMBの発現喪失が示されている。乳がんでは、NUMBの喪失が予後不良と関係していることは明確に示されている。また、NUMBの喪失は非小細胞肺がん、唾液腺腫瘍、慢性骨髄性白血病でも示されている。NUMBの機能の回復、もしくはユビキチン化機構に関与する酵素の操作は、特定種のがんの治療のための研究の方向性となる可能性がある。
Title: NUMB_(タンパク質) (NUMB (gene))
Section: がんや腫瘍形成における役割
Subsection: 乳がんにおける役割

ヒトの乳がんの約半数では、NUMBがユビキチン化によるプロテアソーム分解の標的となっており、NUMBを介したNotchシグナルの抑制が失われている。NUMBはがん抑制因子として機能し、Notchシグナルを抑制することで腫瘍細胞の増殖を阻害する。NUMBの活性が失われた腫瘍細胞ではNotchシグナルの増大が観察され、こうした腫瘍ではレトロウイルスによるNUMBの一過的過剰発現によってNotchシグナルは基底レベルとなり、コロニー形成能が大きく低下する。このように、多くの細胞系統で増殖と分化のバランスを制御しているNotchとNumbの生物学的拮抗作用は、乳がんの発生、そしておそらくその他の腫瘍の発生にも関与しているようである。Notchシグナルの薬理的阻害またはNumbシグナルの増強は将来的にはがん治療法となる可能性がある。NUMBはNotchとp53を調節する能力を持つため、腫瘍抑制効果を持つと考えられている。NUMBはp53のユビキチン化と分解を担うE3リガーゼMDM2に結合して阻害する。細胞内のNUMBの除去はp53の減少をもたらし、アポトーシスや細胞周期チェックポイント応答の機能不全を引き起こす。NUMBを回復することでp53の発現や腫瘍抑制能力も回復する。
Title: NUMB_(タンパク質) (NUMB (gene))
Section: 細胞遊走における役割

増殖帯で生み出された神経前駆細胞は、目的の位置に移動し、そこで成熟過程を経て機能的な神経細胞となる。ショウジョウバエのNumb変異体は軸索路に沿ったグリア細胞の移動に欠陥を示したため、Numbが細胞遊走に関与している可能性が示唆された。その後、Numbは走化性シグナル伝達受容体に結合し、受容体複合体へaPKCをリクルートするための足場を形成する、という機構が発見された。aPKCは活性化されるとNumbをリン酸化し、Numbの走化性受容体への結合とその後のエンドソーム複合体形成を増強するフィードフォワード応答が促進される。エンドサイトーシスによって走化性受容体の細胞前面への再局在が補助され、受容体活性化に応答した指向性を持った遊走が促進される。BDNFは、細胞遊走時のNumbを介した走化性を刺激する因子の1つである。BDNFはTrkB受容体を活性化することで、遊走中の神経前駆細胞に対する走化性因子として機能する。NumbはTrkB受容体に結合し、足場タンパク質としてTrkBのエンドサイトーシスの調節、そしてaPKCの活性化を促進する機能を果たす。aPKCによるNumbのリン酸化はTrkBへの結合効率を高め、それによって前駆細胞のBDNFに対する感受性が促進される。
Title: NUMB_(タンパク質) (NUMB (gene))
Section: 相互作用

NUMBは、AP2A1、MDM2、L1CAM、DPYSL2、SIAH1、p53、LNX1と相互作用することが示されている。
Title: N-カドヘリン (Cadherin-2)
Section: abstract

N-カドヘリン（neural cadherin, NCAD）またはカドヘリン2（cadherin-2, CDH2）は、ヒトではCDH2遺伝子にコードされるタンパク質である。CD325（cluster of differentiation 325）とも表記される。N-カドヘリンは複数の組織で発現している膜貫通タンパク質であり、細胞間接着を媒介する機能を果たす。心筋においては、N-カドヘリンは介在板に位置するアドヘレンスジャンクションの重要な構成要素である。介在板は、隣接する心筋細胞との機械的・電気的に共役する機能を果たす。N-カドヘリンタンパク質の発現や完全性の変化は、拡張型心筋症などさまざまな疾患で観察される。CDH2遺伝子の変異は症候群性神経発達障害を引き起こすことも特定されている。
Title: N-カドヘリン (Cadherin-2)
Section: 構造

N-カドヘリンは99.7 kDa、906アミノ酸からなるタンパク質である。N-カドヘリンはカドヘリンスーパーファミリーに属する古典的（classical）カドヘリンであり、細胞外の5つのカドヘリンリピート、膜貫通領域、高度に保存された細胞質テールから構成される。他のカドヘリンと同様、N-カドヘリンは隣接する細胞上のN-カドヘリンと逆平行型の相互作用を行い、細胞間に線形で接着性の「ジッパー」を形成する。
Title: N-カドヘリン (Cadherin-2)
Section: 機能

N-カドヘリンという名称はその神経組織（neural tissue）における役割に由来し、神経細胞、そして後に心筋やがんの転移においても役割を果たしていることが発見された。N-カドヘリンは膜貫通タンパク質で、ホモフィリック（同種分子親和性）結合を行う糖タンパク質であり、カルシウム依存性細胞接着分子ファミリーに属する。こうしたタンパク質には隣接細胞間のホモフィリック相互作用を媒介する細胞外ドメインが存在し、またC末端にはカテニンとの結合を媒介する細胞質テールが存在する。カテニンはアクチン細胞骨格との相互作用を行う。
Title: N-カドヘリン (Cadherin-2)
Section: 機能
Subsection: 発生における役割

N-カドヘリンはカルシウム依存性細胞間接着糖タンパク質として発生に関与しており、原腸形成時に機能する。また左右非対称性の確立にも必要である。N-カドヘリンは着床後の胚で広く発現しており、中胚葉での高レベルでの発現は成体でも維持される。発生時のN-カドヘリンの変異は原始心臓での細胞接着に最も大きな影響を与え、筋細胞の解離や異常な心臓管の発生が引き起こされる。N-カドヘリンは脊椎動物の心臓発生において、上皮細胞の肉柱への転換や緻密層の形成に関与している。ドミナントネガティブ型N-カドヘリン変異体を発現する筋細胞では筋細胞の分布や心内膜方向への移動に重大な異常が生じ、心筋内での肉柱の形成に欠陥が生じる。
Title: N-カドヘリン (Cadherin-2)
Section: 機能
Subsection: 心筋における役割

心筋においては、N-カドヘリンは介在板構造に位置する。介在板は隣接する心筋細胞間の末端の連結を行い、機械的・電気的共役を促進する構造である。介在板内にはアドヘレンスジャンクション、デスモソーム、ギャップジャンクションの3種類の接着構造が存在する。N-カドヘリンはアドヘレンスジャンクションの必須の構成要素であり、細胞間接着と筋鞘間の力の伝達を可能にしている。カテニンと複合体を形成したN-カドヘリンは、介在板の機能のマスターレギュレーターである。N-カドヘリンはギャップジャンクションの形成に先立って細胞間結合部に出現し、正常な筋線維の形成に重要な役割を果たす。細胞外ドメインに大きな欠失を抱える変異型N-カドヘリンの発現は成体の心室心筋細胞の内在性N-カドヘリンの機能を阻害し、隣接する心筋細胞は細胞間接触やギャップジャンクションプラークを喪失する。心筋におけるN-カドヘリンの機能の重要性は、遺伝子導入を行ったマウスモデルによって明らかにされている。N-カドヘリンやE-カドヘリンの発現が変化したマウスは拡張型心筋症の表現型を示し、おそらくこれは介在板の機能不全が原因である。心臓特異的タモキシフェン誘導性Cre-N-カドヘリン導入遺伝子によって成体の心臓でN-カドヘリンを除去したマウスでは、介在板の組み立ての異常、拡張型心筋症、心機能不全、サルコメアの長さの減少、Z帯の厚さの増加、コネキシン43の減少、そして筋張力の喪失がみられる。導入遺伝子を発現したマウスは、主に心室頻拍のために2か月以内に死に至る。N-カドヘリンノックアウトマウスを用いたさらなる解析によって、不整脈はイオンチャネルのリモデリングとKv1.5の機能の異常を原因とする可能性が高いことが明らかにされている。これらのマウスモデルでは、活動電位の持続期間の伸長、内向き整流カリウムチャネルの密度の低下、Kv1.5、KCNE2、コルタクチンの発現の低下、筋鞘におけるアクチン細胞骨格の破壊がみられる。
Title: N-カドヘリン (Cadherin-2)
Section: 機能
Subsection: 神経における役割

中枢神経系におけるシナプス前後の接着は、少なくともその一部はN-カドヘリンによって媒介されている。N-カドヘリンはカテニンと相互作用して学習と記憶に重要な役割を果たしている。N-カドヘリンの喪失はヒトの注意欠陥・多動性障害（ADHD）、シナプスの機能不全とも関係している。
Title: N-カドヘリン (Cadherin-2)
Section: 機能
Subsection: がんの転移における役割

N-カドヘリンはがん細胞にも広く存在し、経内皮移動の機構となっている。がん細胞が血管の内皮細胞に接着するとSrcキナーゼ経路がアップレギュレーションされ、N-カドヘリンとE-カドヘリンの双方に結合するβ-カテニンのリン酸化が行われる。その結果、2つの隣接する内皮細胞間の連結が解かれ、がん細胞がすり抜けることができるようになる。
Title: N-カドヘリン (Cadherin-2)
Section: 臨床的意義

CDH2遺伝子の変異は脳梁、軸索、心臓、目、生殖器の欠陥によって特徴づけられる症候群性神経発達障害を引き起こすことが特定されている。強迫性障害とトゥレット障害の遺伝的基礎に関する研究では、CDH2の変異はそれ単独では疾患を引き起こす可能性は低いことが示されているが、関連する細胞間接着遺伝子群の一部としてリスク因子となる可能性がある。この点について明確にするためには、より大規模なコホート研究が必要である。ヒトの拡張型心筋症では、N-カドヘリンの発現が亢進しており、配置が乱雑なものとなっていることが示されている。このことは、心疾患におけるN-カドヘリンタンパク質の組織化の異常が心臓リモデリングの構成因子となっている可能性を示唆している。
Title: N-カドヘリン (Cadherin-2)
Section: 相互作用

N-カドヘリン（CDH2）は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。
Title: 崩壊促進因子 (Decay-accelerating factor)
Section: abstract

崩壊促進因子（Decay-accelerating factor：DAF）は、CD55またはDAFとしても知られる。ヒトではCD55遺伝子によってコードされるタンパク質である。DAFは細胞表面で起こる補体系の活性化を制御する。C4 (古典経路またはレクチン経路) または C3 (副経路)の活性化の際に生成されるC4bやC3bを、DAFは認識する。（古典経路およびレクチン経路により）細胞表面に結合したC4bとDAFは相互作用し、C2からC2bへの変換を妨げ、それによってC4b2a(C3転換酵素)の形成を妨げる。また、DAFとC3b(副経路)との相互作用は、C3bとBbとの結合を妨げ、それによって副経路のC3bBb (C3転換酵素)の形成を妨げる。したがって、補体カスケードを増幅する転換酵素を制限することにより、DAFは膜侵襲複合体(Membrane-Attack Complex :MAC)の形成を間接的にブロックする。この糖タンパク質は造血細胞と非造血細胞に広く分布している。これは、Cromer式血液型の決定因子である。
Title: 崩壊促進因子 (Decay-accelerating factor)
Section: 構造

DAFは、グリコホスファチジルイノシトール(GPI) アンカーを介して細胞膜に結合する70kDaの膜タンパク質である。DAF には4つの補体制御タンパク質(CCP) リピートが含まれており、CCP1 と CCP2 の間に単一の N 結合型グリカンが位置している。CCP2、CCP3、CCP4、およびCCP2とCCP3の間の正に帯電したポケット内の3つの連続するリジン残基は、副補体経路の阻害に関与しています。CCP2 と CCP3 のみが古典経路の阻害に関与している。
Title: 崩壊促進因子 (Decay-accelerating factor)
Section: 病理学
Subsection: 発作性夜間血色素尿症（発作性夜間ヘモグロビン尿症）

DAFはGPIアンカータンパク質であり、発作性夜間血色素尿症(PNH)などでは、DAFなどがGPIアンカーで赤血球膜に結合できなくなる。PNHでは、赤血球膜上のDAFとCD59が非常に低くなり、赤血球が補体による溶血を受ける。症状には、赤血球数の低下 (貧血)、疲労、暗色の尿やその他の合併症が含まれる。
Title: 崩壊促進因子 (Decay-accelerating factor)
Section: 病理学
Subsection: 感染症

DAF は、一部のコクサッキーウイルスや他のエンテロウイルスによって受容体として使われる。 組換えられた、可溶性のDAF- Fc融合タンパク質は、心臓損傷に対する抗コクサッキーウイルス療法としてマウスで試験されている。  ヒトHIV-1のウイルスはヒトの補体によって溶解されないが、他の動物の補体によって容易に不活性化される。ヒトHIV-1のウイルスが感染細胞の表面から出芽するときに、DAFがヒトHIV-1に結合することにより、補体による溶解からHIV-1が保護される。
Title: 崩壊促進因子 (Decay-accelerating factor)
Section: 参照

List of human clusters of differentiationCD59
Title: APAF1 (APAF1)
Section: abstract

APAF1（apoptotic peptidase activating factor 1）はアポトーシスに関与するタンパク質で、線虫Caenorhabditis elegansのCED-4のヒトホモログである。
Title: APAF1 (APAF1)
Section: 機能

APAF1遺伝子は、アポトーシス調節ネットワークの中心的なハブの1つを形成する細胞質タンパク質をコードする。APAF1タンパク質は（N末端から）CARDドメイン、ATPアーゼドメイン（NB-ARC）、短いヘリカルドメイン、そして数個のWD40リピートドメインを含む。シトクロムcとdATPの結合に伴って、オリゴマーからなるアポトソームを形成する。アポトソームはカスパーゼ-9前駆体を結合して切断し、成熟した活性化型として放出する。この反応の正確な機構については未だ議論があるが、アポトソームはカスパーゼ-9の二量体化を誘導し、その後に自己触媒が行われることが示唆されている。活性化されたカスパーゼ-9はその後カスパーゼカスケードを刺激し、細胞をアポトーシスに従事させる。選択的スプライシングによって、異なるアイソフォームをコードする7種類のバリアントが産生される。
Title: APAF1 (APAF1)
Section: 構造

APAF1は6本のヘリックスからなるグリークキーモチーフを持つCARDドメイン、ロスマンフォールド型のヌクレオチド結合ドメイン、短いヘリカルモチーフ、ウィングドヘリックス（winged-helix）ドメインを含む。
Title: APAF1 (APAF1)
Section: 相互作用

APAF1は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。APIPBCL2L1CASP9HSPA4NLRP1
Title: 核内受容体コアクチベーター1 (Nuclear receptor coactivator 1)
Section: abstract

核内受容体コアクチベーター1 （NCOA1: nuclear receptor coactivator 1）は、いくつかの核内受容体相互作用ドメインと固有のヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性を含む転写共調節タンパク質である。 NCOA1は、リガンドで活性化される核内受容体によってDNAプロモーター部位に動員される。次に、NCOA1はヒストンをアシル化し、下流のDNAを転写しやすくする。したがって、NCOA1はDNA発現の上方調節において核内受容体を援助する。NCOA1は、ステロイド受容体コアクチベーター1（SRC-1: steroid receptor coactivator-1）と同一である。
Title: 核内受容体コアクチベーター1 (Nuclear receptor coactivator 1)
Section: 相互作用分子

NCOA1は、塩基性ヘリックスループヘリックス（bHLH）ドメインを有しており、以下の生体分子と相互作用することができる。アンドロゲン受容体C-FosC-junCIITACREB結合タンパク質サイクリンD1DDX17DDX5エストロゲン受容体α糖質コルチコイド受容体NFKB1PCAFPPARGC1Aペルオキシソーム増殖因子活性化受容体αSNW1STAT3STAT6TRIP4甲状腺ホルモン受容体β
Title: 神経型一酸化窒素合成酵素 (NOS1)
Section: abstract

神経型一酸化窒素合成酵素（しんけいがたいっさんかちっそごうせいこうそ、英: neuronal nitric oxide synthase、略称: nNOS）または一酸化窒素合成酵素1（nitric oxide synthase 1、NOS1）は、ヒトではNOS1遺伝子にコードされる酵素である。
Title: 神経型一酸化窒素合成酵素 (NOS1)
Section: 機能

一酸化窒素合成酵素（NOS、EC 1.14.13.39）は、L-アルギニンからの一酸化窒素（NO）の産生を触媒する合成酵素（シンターゼ）のファミリーである。NOは体内で多様な機能を持つ化学的メッセンジャーであり、その機能は産生源となる酵素や組織への局在に依存している。NOS1が主に存在する脳や末梢神経系では、NOは神経伝達物質として多くの役割を果たし、長期増強に関与している可能性がある。他にも発作や神経変性疾患と関連した神経毒性、蠕動や括約筋弛緩など平滑筋の神経調節、陰茎の勃起などに関与が示唆されている。関連する酵素であるNOS3から産生されるNOは、血圧を調節する内皮由来弛緩因子活性を担う。マクロファージでは、関連する酵素であるNOS2によって産生されるNOは抗腫瘍作用や抗微生物作用を媒介する。特定の遺伝子を不活性化した動物モデルによって個々のNOSの機能が明らかにされている。神経型NOS（nNOS、NOS1）、内皮型NOS（eNOS、NOS3）、誘導型NOS（iNOS、マクロファージNOS、NOS2）は異なるアイソザイムである。
Title: 神経型一酸化窒素合成酵素 (NOS1)
Section: 臨床的意義

NOS1は気管支喘息、統合失調症、むずむず脚症候群、精神刺激薬による神経毒性への関与が示唆されている。双極性障害や大気汚染物質への曝露との関係も研究が行われている。
Title: 神経型一酸化窒素合成酵素 (NOS1)
Section: 相互作用

NOS1はDLG4、NOS1APと相互作用することが示されている。
Title: 亜硫酸オキシダーゼ (Sulfite oxidase)
Section: abstract

亜硫酸オキシダーゼ（ありゅうさんオキシダーゼ、sulfite oxidase）は、すべての真核生物のミトコンドリアに存在する酵素である。亜硫酸が硫酸に酸化されることにより発生した電子は、シトクロムcを経由して電子伝達系へ移され、酸化的リン酸化によるATP合成に使われる。これは硫黄を含む化合物の代謝の最終ステップであり、硫酸は排泄されることとなる。亜硫酸オキシダーゼはモリブデンとヘムを補酵素として利用する金属酵素である。この酵素はシトクロムb 5の一つであり、DMSOレダクターゼ、キサンチンオキシダーゼおよび亜硝酸還元酵素を含むオキソトランスフェラーゼのスーパーファミリーに属する。哺乳類では、亜硫酸オキシダーゼの発現量は肝臓、腎臓および心臓で高く、脾臓、脳、骨格筋および血液で低い。
Title: 亜硫酸オキシダーゼ (Sulfite oxidase)
Section: 構造

亜硫酸オキシダーゼはN末端とC末端とで2個の等しいサブユニットからなるホモダイマーである。それぞれ2個のサブユニットはループを形成する10個のアミノ酸残基によって結合している。N末端ドメインはヘムを含む3つの隣接した逆平行のβシートと5つのαヘリックスからなる。C末端ドメインは13個のβシートと3個のαヘリックスとそれに囲まれたモリブドプテリン補因子からなる。モリブドプテリンはMo(VI)中心を持ち、これはシステイン由来の硫黄と、ピラノプテリン由来のエン-ジチオレート、そして2つの末端酸素により結合している。このモリブドプテリン中心は亜硫酸の触媒酸化の場所となる。
Title: 亜硫酸オキシダーゼ (Sulfite oxidase)
Section: 活性部位と機構

亜硫酸オキシダーゼの活性部位にはモリブドプテリンがあり、モリブデンの最高酸化数（+6）を支えている。酵素が酸化状態のときモリブデンはシステインチオラートとモリブドプテリンのジチオレン基、および2個の末端酸素原子に配位されている。亜硫酸と反応するとき酸素原子の一つが亜硫酸に転移し硫酸となり、モリブデンの酸化数は+4になる。そして、水が硫酸と置き換わり、2個のプロトンと2個の電子が活性部位から遊離し、活性部位は元の状態に戻る。特筆すべき点はこの酵素反応で使われる酸素原子は酸素分子由来ではなく、水分子由来という点である。
Title: ウロキナーゼ受容体 (Urokinase receptor)
Section: abstract

ウロキナーゼ受容体（ウロキナーゼじゅようたい、英: urokinase receptor）、ウロキナーゼ型プラスミノゲンアクチベータ受容体（英: urokinase-type plasminogen activator receptor、略称: uPAR）またはCD87は、ヒトではPLAUR（plasminogen activator, urokinase receptor）遺伝子にコードされるタンパク質である。複数のドメインからなる糖タンパク質であり、GPIアンカーによって細胞膜に係留されている。細胞表面に位置する、ウロキナーゼ（uPA）の飽和性の結合部位として、uPARは同定された。
Title: ウロキナーゼ受容体 (Urokinase receptor)
Section: 構造

uPARは3つのタンデムなLUドメインから構成される。ULドメインはthree-fingerドメインファミリーに属するドメインである。uPARの構造はX線結晶構造解析によって、ペプチドアンタゴニストとの複合体、そして天然リガンドであるウロキナーゼとの複合体の構造が解かれている。
Title: ウロキナーゼ受容体 (Urokinase receptor)
Section: 生理的意義

uPARはプラスミノーゲン活性化システムの一部を構成している。健康な体内においてこの系は、乳腺の退縮や創傷治癒など組織の再構成のイベントに関与している。組織の再構成を行うためには、古い組織の分解が必要である。この分解において重要な機構が、プラスミノーゲン活性化システム（plasminogen activation system: PAS）によって開始されるタンパク質分解カスケードである。uPARはウロキナーゼに結合し、プラスミノーゲンの活性化を細胞膜のすぐ近傍に限定している。ウロキナーゼが受容体に結合するとuPARとGPIアンカーの間で切断が生じ、suPARと呼ばれる可溶性タンパク質が放出される。
Title: ウロキナーゼ受容体 (Urokinase receptor)
Section: 臨床的意義

suPARは炎症のバイオマーカーとなることが知られている。suPAR値の上昇は、慢性閉塞性肺疾患（COPD）、気管支喘息、肝不全、心不全、心血管疾患、関節リウマチで観察される。喫煙者は非喫煙者と比較して、suPAR値が有意に高い。uPARは老化細胞で高度に発現しており、uPARを標的としたCAR-T細胞を用いて老化細胞を除去する試みがマウスで行われている。PASの構成要素は多くの悪性腫瘍で高度に発現しており、腫瘍がこのシステムをハイジャックして転移に利用していることが示されている。そのため、このシステムのさまざまな構成要素に対する阻害剤が、抗がん剤としての探索が行われている。
Title: ウロキナーゼ受容体 (Urokinase receptor)
Section: 相互作用

ウロキナーゼ受容体は、LRP1と相互作用することが示されている。
Title: Ku80 (Ku80)
Section: abstract

Ku80はXRCC5遺伝子でコードされているタンパク質である。Ku80はKu70とヘテロ二量体を形成して、DNA修復のための非相同末端結合（NHEJ）経路に必要なKu自己抗原となる。また、NHEJ経路を利用して哺乳類の免疫系の抗原多様性を増大させるV(D)J遺伝子再構成にも要求される。また、NHEJ経路が関与しない、テロメア長の維持とサブテロメア遺伝子サイレンシングにも不可欠な役割を果たす。Kuは、全身性エリテマトーデスの患者がタンパク質に対して高レベルの自己抗体を持っていることが判明したときに最初に同定された。
Title: Ku80 (Ku80)
Section: 別名

Ku70は、以下で記述するいくつかの別名でも呼ばれる。ループスKu自己抗原タンパク質p80（Lupus Ku autoantigen protein p80）ATP依存性DNAヘリカーゼ2サブユニット2（ATP-dependent DNA helicase 2 subunit 2）X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5X線修復交差補完タンパク質5（XRCC6: X-ray repair cross-complementing 5）
Title: Ku80 (Ku80)
Section: エピジェネティックな抑制

Ku80のタンパク質発現レベルは、それをコードする遺伝子XRCC5のプロモーター領域のエピジェネティックな高メチル化によって抑制される。非小細胞肺癌の原発腫瘍と近辺の正常な肺組織の87個のマッチドペアの研究では、腫瘍の25％がXRCC5遺伝子座でヘテロ接合性を失い、同様の割合の腫瘍がXRCC5のプロモーター領域の高メチル化を示した。Ku80の発現レベル低下は、mRNAの発現レベル低下およびXRCC5プロモーターの高メチル化と有意に相関しており、一方で遺伝子のヘテロ接合性欠失とは関連していなかった。
Title: Ku80 (Ku80)
Section: 老化との関連

Ku80にホモ接合性欠陥がある変異マウスは、老化の早期発症を経験する。Ku80-/-マウスは、加齢に関連した7つの病状を示し、寿命と体長を著しく減少させる。Ku-/+ヘテロ接合マウスでKu80対立遺伝子が1つだけ失われると、出生後の成長は正常となるが、骨格筋の老化が加速する。ヒト、ウシ、及びマウスの研究では、Ku80の発現レベルは種間で劇的に異なり、これらのレベルが種の寿命と強く相関していることが示された。これらの結果は、野生型Ku70遺伝子によるDNA二本鎖切断を修復する能力の低下が早期老化を引き起こし、この遺伝子が寿命の保証に重要な役割を果たしていることを示唆する。
Title: Ku80 (Ku80)
Section: 臨床

この遺伝子の稀少なマイクロサテライト多型は、さまざまな放射線感受性患者の発癌に関連する。
Title: Ku80 (Ku80)
Section: 臨床
Subsection: 癌の抑制

一般に、DNA修復関連遺伝子の発現が不足すると発癌のリスクが高まる。Ku80及びKu70の発現の喪失は黒色腫の進行の初期段階と関連しており、Ku70及びKu80による調節不全は黒色腫の転移の拡散に関連していることが判明している。さらに、Ku80の低発現は、腺癌タイプの15％および扁平上皮細胞タイプの非小細胞肺癌の32％で見られ、これはXRCC5プロモーターの高メチル化と相関していた。Ku80は、さまざまな癌においてエピジェネティックに抑制される26種類のDNA修復タンパク質の1つである。
Title: Ku80 (Ku80)
Section: 相互作用分子

Ku80は以下の生体分子と相互作用する。
Title: GRIA2 (GRIA2)
Section: abstract

GRIA2またはGluA2、GluR2（glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2、ionotropic glutamate receptor 2）は、ヒトではGRIA2遺伝子によってコードされるタンパク質である。
Title: GRIA2 (GRIA2)
Section: 機能

グルタミン酸受容体は哺乳類の脳における主要な興奮性神経伝達物質受容体であり、さまざまな正常な神経生理学的過程で活性化される。GRIA2遺伝子の産物は、α-アミノ-3-ヒドロキシ-5-メチル-4-イソキサゾールプロピオン酸（AMPA）に対する感受性を持ち、リガンド依存性カチオンチャネルとして機能するグルタミン酸受容体ファミリーに属する。これらのチャネルは4つの関連するサブユニット、GluA1–4から組み立てられている。GRIA2遺伝子にコードされるサブユニット（GRIA2、GluA2、GluR2）の2番目の膜貫通ドメイン内の領域でRNA編集によってグルタミン（Q）がアルギニン（R）に変化し、チャネルはCa2+に対する透過性を失うと考えられている。ヒトと動物での研究からは、pre-mRNAの編集は脳の機能に必要不可欠であり、Q/R部位でのRNA編集の編集の欠陥は、筋萎縮性側索硬化症（ALS）の原因となる可能性が示唆されている。この遺伝子には選択的スプライシングによるバリアントが記載されており、シグナル伝達性質の異なるflip型、flop型と呼ばれるアイソフォームが含まれている。
Title: GRIA2 (GRIA2)
Section: 相互作用

GluA2はSPTAN1、GRIP1、PICK1と相互作用することが示されている。
Title: GRIA2 (GRIA2)
Section: RNA編集

いくつかのイオンチャネルと神経伝達物質受容体のpre-mRNAがADARの基質となり、pre-mRNAのアデノシン（A）がイノシン（I）へ編集される。その標的には、AMPA型グルタミン酸受容体のサブユニット（GluA2、GluA3、GluA4）とカイニン酸型グルタミン酸受容体のサブユニット（GluK1、GluK2）が含まれている。ADARはpre-mRNAの二本鎖領域内のアデノシンを認識し、イノシンへの脱アミノ化を行う。イノシンは翻訳装置によってグアノシン（G）として認識されるため、コードされるアミノ酸が変化する場合がある。グルタミン酸作動性イオンチャネルは4つのサブユニットから構成され、各サブユニットがポアのループ構造に寄与している。ポアループ構造はK+チャネル（ヒトKv1.1チャネルなど）にみられるものと関係しており、Kv1.1チャネルもまたAからIへのRNA編集を受ける。
Title: GRIA2 (GRIA2)
Section: RNA編集
Subsection: 位置

GluA2のpre-mRNA中のQ/R編集部位は607番目のアミノ酸残基である。この残基はイオンチャネルのポアループ領域、タンパク質の2番目の膜貫通セグメントに位置する。編集によってグルタミン（Q）コドンはアルギニン（R）コドンに変化する。また、R/G編集部位は764番目のアミノ酸残基で、アルギニン（R）からグリシン（G）へ変化する。グルタミン酸受容体の全ての編集は二本鎖RNA領域に行われ、これらはエクソン中の編集部位ととイントロン中のECS（editing complementary site）との相補的な塩基対形成によって生じたものである。
Title: GRIA2 (GRIA2)
Section: RNA編集
Subsection: 調節

脳のGluA2の転写産物ではQ/R部位の編集は100%の頻度で生じており、これは100%の頻度で編集される既知の唯一の例である。しかしながら、線条体と皮質の一部の神経細胞では編集頻度は低下しており、これらの特定の神経細胞で高レベルの興奮毒性が生じる理由であると示唆されている。R/G部位は発生過程で調節されており、胚の脳ではほぼ編集されていないが、出生後に編集レベルが上昇する。
Title: GRIA2 (GRIA2)
Section: 編集の影響
Subsection: 構造

Q/R部位での編集によって、グルタミンをコードするCAGコドンがCIGへ変化することでアルギニンとして翻訳されるようになる。この編集部位は2価カチオンの透過性を制御する領域であることが知られている。他のイオンチャネル型AMPAグルタミン酸受容体はグルタミン残基をコードしているが、GluA2ではアルギニンとなる。
Title: GRIA2 (GRIA2)
Section: 編集の影響
Subsection: 機能

Q/R部位でのRNA編集はチャネルの透過性を変化させ、Ca2+を透過させないようにすると考えられている。Q/R部位の編集は、カイニン酸受容体のサブユニットであるGluK1とGluK2にも生じる。GluA2のQ/R部位の編集はチャネルのカルシウム透過性を決定し、編集されたサブユニットを含むチャネルはカルシウム透過性が低くなる。一方、GluK1のQ/R部位の編集は、I/V部位とY/C部位が共に編集されている場合にはチャネルのカルシウム透過性を増加させる可能性がある。このように、編集の主な機能はチャネルの電気生理の調節である。線条体と皮質の神経細胞の一部では興奮毒性に対する感受性が高く、それはこうした神経細胞では編集頻度が100％よりも低下していることが原因であると考えられている。編集によって、いくつか他の影響も生じる。編集はチャネルの成熟と組み立てに変化が生じる。未編集型のGluA2は四量体化しシナプスへ輸送される傾向がある。しかし、編集型のGluA2は単量体として主に小胞体に位置しており、GluA2のポアループのアルギニン残基が小胞体保持シグナルとなっていると考えられる。そのため、編集はこのサブユニットの受容体への組み込みを調節している。
Title: GRIA2 (GRIA2)
Section: 調節異常
Subsection: 筋萎縮性側索硬化症

ヒトと動物での多くの研究により、GluA2のpre-mRNAのRNA編集は正常な脳機能に必要であることが明らかにされている。編集の欠陥は、筋萎縮性側索硬化症（ALS）などいくつかの疾患と関係している。ALSは2000人に1人が発症し、多くの場合1–5年で致死となる。症例の大部分は孤発性で、家族性のものは少数である。これらの疾患では、運動神経細胞の変性によって最終的には麻痺と呼吸不全が引き起こされる。グルタミン酸の興奮毒性が孤発性症例において疾患の拡大に寄与していることが知られている。グルタミン酸レベルは40%上昇し、グルタミン酸受容体の活性化によるカルシウムの流入の増加とその後の神経細胞死の原因となっていることが示唆される。Q/R部位の編集の低下や喪失はカルシウムの透過性を増加させるが、疾患の影響を受けた運動神経細胞ではGluA2の編集レベルが低下していることが判明している（62-100%）。編集の異常はこの疾患に特異的であると考えられ、球脊髄性筋萎縮症では編集レベルの低下はみられない。
Title: GRIA2 (GRIA2)
Section: 調節異常
Subsection: てんかん

マウスモデルでは、編集の欠陥はてんかん発作を引き起こし、出生後3週間以内に死に至る。ほぼ100%の転写産物が編集されるものの、なぜゲノムにアルギニンとしてコードするのではなく、グルタミンコドンからの編集を行うのかは不明である。
Title: GRIA2 (GRIA2)
Section: 調節異常
Subsection: がん

Q/R部位の編集の低下は、ヒトの一部の脳腫瘍でもみられる。ADAR2の発現の減少は、悪性神経膠腫におけるてんかん発作と関係していると考えられている。
Title: GRIA2 (GRIA2)
Section: 免疫組織化学診断における利用

GRIA2は孤立性線維性腫瘍（SFT）の免疫組織化学的診断マーカーとして、他の類似疾患との鑑別に利用される。他のCD34陽性腫瘍と同様、GRIA2は隆起性皮膚線維肉腫（DFSP）でも発現している。しかし、臨床的、組織学的特徴を鑑別に利用できる。GRIA2は他の軟部組織腫瘍ではわずかな分布しかみられない。
Title: エメリン (Emerin)
Section: abstract

エメリンアレクセイ・エメリン - ロシアのアイスホッケー選手(Alexei Emelin)。エメリン・パンクハースト - イギリスの婦人参政権活動家(Emmeline Pankhurst)。エメリン (タンパク質) (Emerin)
Title: EIF4EBP1 (EIF4EBP1)
Section: abstract

EIF4EBP1（eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1）または4E-BP1は、ヒトではEIF4EBP1遺伝子にコードされるタンパク質である。4E-BP1は翻訳開始因子eIF4Eに結合することでキャップ依存的翻訳を阻害する。4E-BP1はリン酸化によってeIF4Eから放出され、その結果キャップ依存的翻訳が継続されてタンパク質合成速度が高まる。
Title: EIF4EBP1 (EIF4EBP1)
Section: リン酸化

リン酸化された4E-BP1は、上流のシグナル伝達（mTORシグナル）の活性化のマーカーとなると考えられている。4E-BP1には7カ所のリン酸化部位が存在し、中でも重要なのはリン酸化の開始部位であるThr37/Thr46、2番目の部位であるThr70、そして最終部位であるSer65である。しかしながら、Ser65とThr70のリン酸化だけでは4E-BP1による翻訳阻害の遮断には不十分であり、複数のリン酸化イベントが組み合わさることでタンパク質合成速度の上昇が引き起こされていることが示唆されている。
Title: EIF4EBP1 (EIF4EBP1)
Section: 機能

4E-BP1はeIF4Eと直接相互作用する。eIF4Eは、リボソーム40SサブユニットをmRNAの5'末端へリクルートするタンパク質複合体（eIF4F）の限定因子となっている。4E-BP1とeIF4Eの相互作用により、この複合体の組み立てが阻害され、翻訳は抑制される。4E-BP1のリン酸化は紫外線照射やインスリンシグナルなどさまざまなシグナルに応答して生じ、eIF4Eからの解離を引き起こしてキャップ依存的翻訳を活性化する。4E-BP1の高レベルのリン酸化はヒトのがんで幅広く報告されており、そのいくつかでは予後不良と関係している。
Title: EIF4EBP1 (EIF4EBP1)
Section: 相互作用

4E-BP1は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。eIF4ERPTORmTOR
Title: フマリルアセトアセターゼ (Fumarylacetoacetate hydrolase)
Section: abstract

フマリルアセトアセターゼまたはフマリルアセト酢酸加水分解酵素(Fumarylacetoacetate hydrolase)は、ヒトではFAH遺伝子でコードされる酵素である。この酵素は、チロシン異化経路の最後の酵素である。FAH遺伝子の欠損や変異は、1型の遺伝性チロシン血症と関連する。この酵素は、4-フマリルアセト酢酸のフマル酸とアセト酢酸への加水分解を触媒する。
Title: KCNA1 (Kv1.1)
Section: abstract

KCNA1（potassium voltage-gated channel subfamily A member 1）もしくはKv1.1は、ヒトではKCNA1遺伝子にコードされるShaker型電位依存性カリウムチャネルである。アイザックス症候群は、Kv1.1イオンチャネルに対する自己免疫反応によって引き起こされる。
Title: KCNA1 (Kv1.1)
Section: 遺伝子

KCNA1遺伝子は12番染色体短腕（12p13.32）に位置する。この遺伝子の長さは8,348塩基対で、495アミノ酸（予測分子量56,466）からなるタンパク質をコードする。
Title: KCNA1 (Kv1.1)
Section: 構造

Kv1.1カリウムチャネルの各サブユニットは6つの膜貫通領域（S1からS6）を持ち、S5とS6の間のループがチャネルの透過孔を形成すると考えられている。この領域には保存された選択性フィルターモチーフも含まれている。機能的なチャネルはホモ四量体である。タンパク質のN末端はβサブユニットと結合している。βサブユニットはチャネルの不活性化や細胞膜への発現を調節している。C末端は、チャネルの標的化に関与するPDZドメイン含有タンパク質と結合している。
Title: KCNA1 (Kv1.1)
Section: 機能

Kv1.1チャネルはカリウム選択性チャネルとして機能し、電気化学的勾配に従ってカリウムイオンが透過する。これらのチャネルは膜の再分極化に関与している。
Title: KCNA1 (Kv1.1)
Section: RNA編集

このタンパク質のpre-mRNAはアデニン（A）からイノシン（I）へのRNA編集を受ける。編集を受ける部位は、タンパク質の400番残基に相当する部位である。この残基は6番目の膜貫通領域、透過孔のinner vestibuleと呼ばれる領域に位置している。RNA編集は、pre-mRNAのこの部分でのステムループ構造の形成によって媒介される。この部位（I/V部位）を選択的に編集する酵素はADAR2である可能性が高い。編集によってコドンはATTからGTTに変化し、コードされるアミノ酸はイソロイシン（I）からバリン（V）に変化する。ｍFOLDプログラムによって編集に最低限必要な領域が予測されており、不完全な逆向き反復配列がヘアピン構造を形成すると考えられている。この領域は114塩基対から構成される。同様の領域は、マウスやラットでも同定されている。編集を受けるアデノシンは6塩基対の二本鎖領域内に位置する。この6塩基対二本鎖領域近傍の変異実験により、編集が行われるために必要不可欠な塩基が同定されている。この領域は、エクソン配列のみによって形成されるヘアピン構造であるという点で他のものとは異なっている。AからIへの編集が起こるために必要な相補的配列（editing complementary sequence、ECS）は、イントロンに位置しているものが大部分である。編集はイカ、ショウジョウバエ、マウス、ラットで観察されており、高度に保存されている。編集頻度は組織によって異なり、尾状核では17%、脊髄では68%、延髄では77％である。
Title: KCNA1 (Kv1.1)
Section: RNA編集
Subsection: 影響

編集によって、編集部位のアミノ酸はイソロイシンからバリンに変化する。この部位はチャネルの高度に保存されたイオン透過孔に位置しており、チャネルの速い不活性化過程に影響を及ぼしている可能性がある。電位依存性カリウムチャネルは、電位に応答してカリウム選択性透過孔を開閉することで興奮性を調節する。カリウムイオンの流れは、不活性化を担う領域との相互作用によって妨げられる。ヒトのKv1.1チャネルではこうした相互作用は補助タンパク質によって担われているが、他の種ではチャネル内の部分によって行われている。IからVへの変化は不活性化領域と透過孔の内壁との相互作用を妨げると考えられている。その結果、速い不活性化過程が妨げられる。活性化の速度論はRNA編集の影響を受けない。不活性化の速度論的変化は、活動電位の持続と頻度に影響を与える。編集を受けたチャネルは不活性化領域がイオン透過孔と相互作用できないため、未編集型と比較してより多くの電流を流し、活動電位は低くなる。このことは電気生理学的解析によって明らかにされている。膜の脱分極の持続時間は減少し、神経伝達物質の放出効率も低下する。編集はチャネルを構成する四量体のいずれにも生じうるため、チャネルの不活性化には広い範囲の影響が生じる場合がある。速い不活性化過程の変化は、行動的・神経学的影響を及ぼすことが知られている。
Title: アデニロコハク酸リアーゼ (Adenylosuccinate lyase)
Section: abstract

アデニロコハク酸リアーゼ(adenylosuccinate lyase, ADSL)はプリン代謝のうちイノシン酸およびアデニル酸の合成に関わる酵素で、以下の2つの化学反応を触媒する。N6-(1,2-ジカルボキシエチル)AMP                      ⇌              {\displaystyle \rightleftharpoons }   フマル酸 + AMP(S)-2-[5-アミノ-1-(5-ホスホ-D-リボシル)イミダゾール-4-カルボキサミド]スクシナート                     ⇌              {\displaystyle \rightleftharpoons }   フマル酸 + 5-アミノ-1-(5-ホスホ-D-リボシル)イミダゾール-4-カルボキサミド
Title: CD14 (CD14)
Section: abstract

CD14 はヒトやマウスなどにみられる遺伝子、もしくはそれがコードするタンパク質である。CD14タンパク質は自然免疫系の構成要素の一つである。CD14は2種類の形態を取り得る。1つはグリコシルホスファチジルイノシトールアンカーによって細胞膜上に固定された膜貫通型タンパク質で (mCD14) 、もう1つは可溶性タンパク質である (sCD14) 。sCD14はmCD14の細胞膜からの脱落 (48 kDa) 、あるいは細胞内輸送によって直接分泌されることによって生じる (56 kDa)  。X線結晶構造解析により、CD14の構造が明らかになった。これによると、CD14は単量体の折れ曲がったコイル状の構造を持ち、アミノ末端には疎水性のポケットを持つ 。CD14は最初に発見されたパターン認識受容体でもある。
Title: CD14 (CD14)
Section: 機能

CD14は共受容体として（TLR4あるいはMD-2と共に）働き、細菌に由来するリポ多糖 (LPS) を認識する。CD14とLPSの結合はリポ多糖結合タンパク質 (LBP) に依存し、LBPの存在下でのみCD14とTLR4はLPSと結合しうる。LPSはCD14の主要なリガンドであるが、CD14は他にも細菌由来の病原体関連分子パターンを認識することができる 。また、CD14はTLR4のみならずTLR2やTLR3のリガンド結合にも関わる。
Title: CD14 (CD14)
Section: 組織分布

CD14は単球、マクロファージ、顆粒球などの骨髄系細胞に発現している。
Title: RAB7A (RAB7A)
Section: abstract

RAB7AもしくはRAB7は、ヒトではRAB7A遺伝子にコードされるタンパク質である。RAB7Aは、細胞内へ物質を取り込む過程の1つである、エンドサイトーシスに関与している。エンドサイトーシス過程は、細胞外側に位置する物質（タンパク質など）の周囲の細胞膜が折り込まれて小胞が形成されることで進行する。その後、小胞は細胞膜から切り離され、細胞内へ移行する。RAB7Aは小胞の細胞内への移行や小胞の輸送に重要な役割を果たしている。RAB7Aのさまざまな変異が遺伝性感覚性自律神経性ニューロパチー1C型（HSAN1C）と関係している。この疾患はシャルコー・マリー・トゥース病2B型（CMT2B）としても知られる。
Title: RAB7A (RAB7A)
Section: 機能

Ras関連GTP結合タンパク質であるRabファミリーのメンバーは小胞輸送の重要な調節因子であり、それぞれ特定の細胞内区画に位置している。RAB7Aは後期エンドソームに局在し、エンドサイトーシス経路の後期過程に重要であることが示されている。さらに、ピロリ菌Helicobacter pyloriの毒素VacAによって誘導される空胞化にも基礎的な役割を果たしている。また、メラノソームの成熟など、一部の特殊なエンドソーム膜輸送の調節にも関与している。
Title: RAB7A (RAB7A)
Section: 組織分布

RAB7Aはさまざまな組織で広く発現している。特に骨格筋で高発現しており、軸索におけるシグナル伝達エンドソームの長距離逆行性輸送に関与している。
Title: RAB7A (RAB7A)
Section: 遺伝子

RAB7A遺伝子はヒトでは3番染色体長腕（q）に位置する。遺伝子マッピングによる位置の特定は1997年にDaviesらによって初めて行われ、PCR解析によって3番染色体にマッピングされた。またマウスでは1995年にBarbosaらによって9番染色体にマッピングされた。最終的に、1997年にヒトRAB7A遺伝子は蛍光in situハイブリダイゼーションによって3q21領域にマッピングされた。RAB7Aは、ラットRab7のcDNAを用いてヒトcDNAライブラリのスクリーニングからクローニングされた。RAB7AのcDNAは207アミノ酸の長さのタンパク質をコードし、その配列はマウス、ラット、イヌのホモログと99%、また酵母ホモログと61%同一であった。1996年のVitelliらによるノーザンブロット解析により、RAB7Aは調査された全ての細胞株で1.7 kbと2.5 kbの転写産物として発現しているが、そのmRNAの総量は細胞株によって大きく異なっていることが明らかにされた。
Title: RAB7A (RAB7A)
Section: 調節

メラノーマ細胞ではRAB7Aの選択的な高発現がみられるが、RAB7Aの発現レベルと機能はMITFには依存しておらず、SOX10（神経外胚葉のマスターレギュレーター）とMYC（がん遺伝子）が主要な調節因子であることが近年の研究で示されている。RAB7Aは細胞系統特異的にSOX10とMYCの調節下に置かれている。RAB7AはMITF非依存的にアップレギュレーションされており、SOX10やMYCの変化によって腫瘍の増殖に影響を与える。アンチセンスRNAを用いた研究では、HeLa細胞でのRAB7Aのダウンレギュレーションによって重大な空胞化がみられ、その表現型はチェディアック・東症候群の患者の線維芽細胞でみられるものと類似している。マウスpro-B細胞では、Rab7の阻害は成長因子が存在する場合には栄養素トランスポーターの発現に影響を与えない。しかし成長因子枯渇細胞では、Rab7の機能の遮断によってグルコーストランスポーターやアミノ酸トランスポーターの細胞表面からのクリアランスが阻害される。Rab7が阻害された場合には、成長因子枯渇細胞ではミトコンドリア膜電位が維持され、成長因子非依存的、栄養素依存的な細胞生存の延長がみられる。そのため、RAB7Aは細胞自律的な栄養素の取り込みを制限する、アポトーシス促進タンパク質として機能すると考えられている。
Title: RAB7A (RAB7A)
Section: 相互作用

RAB7AはRILP、CHMと相互作用することが示されている。RILPはRAB7Aとともに分解区画への輸送の制御に重要な役割を果たしており、RAB7Aの機能と細胞骨格とを関連付けている可能性がある。RILPはRAB7Aの下流のエフェクターとしての役割を果たし、これらは共に後期エンドサイトーシス輸送を調節する作用を示す。RAB7AはGTP結合時にルビコンと直接相互作用する。ルビコンはオートファジーの負の調節因子である。他の相互作用パートナーとしては、RAC1、NTRK1/TRKA、C9orf72、PSMA7、RNF115、FYCO1、PIK3C3/VPS34-PIK3R4複合体、OSBPL1A、CLN3がある。またRAB7Aは、おそらくVPS35サブユニットを介して、レトロマー複合体と相互作用する。
Title: RAB7A (RAB7A)
Section: 臨床的意義

RAB7Aは、25種類以上の腫瘍の悪性化を引き起こす可能性がある低分子量GTPアーゼである。RAB7Aはメラノーマにおいて初期に誘導されるドライバー遺伝子であり、その発現レベルによって転移リスクが決定される場合がある。RAB7AはRABファミリーに属し、RABファミリーはRASファミリーに属する。RABファミリーの遺伝子は、小胞輸送のためのタンパク質の合成に必要な指示を与えている。RABファミリーのタンパク質はGTPアーゼであり、GTP分子とGDP分子によってオン・オフが切り替えられるスイッチのように機能する。