shintaro-ozaki/entity-explanation huggingface dataset:
Title: サイクリンA1 (Cyclin A1)
Section: 機能

CCNA1遺伝子にコードされるサイクリンA1タンパク質は、高度に保存されたサイクリンファミリーに属する。このファミリーのメンバーは、細胞周期を通じてタンパク質の存在量に劇的な周期性がみられることで特徴づけられる。サイクリンはサイクリン依存性キナーゼ（CDK）の調節因子として機能する。さまざまなサイクリンはそれぞれ異なる発現と分解のパターンを示し、細胞周期のイベントの時間的調整に寄与する。サイクリンA1は精巣と脳のほか、いくつかの白血病細胞株で発現していることが示されており、主に減数分裂の制御に機能すると考えられている。このサイクリンはCDK1とCDK2の双方に結合する。S期とG2期に異なるキナーゼ活性を示し、細胞周期の異なる機能を調節する。このサイクリンは、Rbファミリータンパク質、転写因子E2F1、Kip/CipファミリーのCDK阻害タンパク質など、重要な細胞周期調節因子に結合することが知られている。
Title: サイクリンA1 (Cyclin A1)
Section: 相互作用

サイクリンA1は次に挙げる因子と相互作用する。
Title: クローディン1 (CLDN1)
Section: abstract

クローディン1（英: claudin-1）は、約23 kDa（キロダルトン）の膜タンパク質である。細胞膜を4回貫通しており、N末端とC末端は細胞質にある。C末端のチロシン-バリンを含む保存されたPDZ結合モチーフを介してタイトジャンクション裏打ちタンパク質のZO-1と結合する。
Title: クローディン1 (CLDN1)
Section: 機能と疾患

クローディン1は、クローディンファミリーの一つでタイトジャンクションの主要構成成分である。特に、皮膚や肝臓に発現が多い。クローディン1のノックアウトマウスは、皮膚のタイトジャンクションのバリア機能異常により生後1日以内に脱水で死亡する。また、オクルディンとともにC型肝炎ウイルスの受容体として知られる。
Title: クローディン1 (CLDN1)
Section: 発見の経緯

クローディン1は1998年に京都大学の月田承一郎らのグループによって報告された。
Title: RASGRP1 (RASGRP1)
Section: abstract

Rasグアニル放出タンパク質1（Rasグアニルほうしゅつタンパクしつ1、RAS guanyl-releasing protein 1、RasGRP1）は、ヒトのRASGRP1遺伝子にコードされているタンパク質である。
Title: RASGRP1 (RASGRP1)
Section: 機能

RASグアニルヌクレオチド放出タンパク質 (AS guanyl nucleotide-releasing protein, RASGRP) は、Rasスーパーファミリーグアニンヌクレオチド交換因子 (GEF) ドメインの存在によって特徴付けられる遺伝子ファミリーのメンバーである。RASGRPは、ジアシルグリセロール (DAG)-制御ヌクレオチド交換ファクターとして機能し、結合したGDPをGTPに交換することによってRasタンパク質を特異的に活性化する。RASGRPは、Erk/MAPキナーゼカスケードを活性化し、T細胞およびB細胞の発達、ホメオスタシス、分化を制御する。
Title: RASGRP1 (RASGRP1)
Section: 遺伝子

異なるアイソフォームをコードしているオルタナティブスプライシング転写変種が同定されている。5'側エキソンを欠損している対応するラット遺伝子rbv7は、90-kDタンパク質をコードする通常のラット転写産物の5'および3'が切り取られた変種である。この短い転写産物はヒトでは発見されていない。
Title: RASGRP1 (RASGRP1)
Section: 臨床的重要性

このタンパク質の異なるアイソフォームの発現の変化は、全身性エリテマトーデス (SLE) 感受性の原因と考えられる。
Title: ラディキシン (Radixin)
Section: abstract

ラディキシン(Radixin)は、ヒトではRDX遺伝子によりコードされるタンパク質である。モエシン、エズリンとともにERMファミリーを構成する。ラディキシンは細胞骨格タンパク質で、アクチンと細胞膜の結合に重要な役割を果たしている可能性がある。エズリンやモエシンと高度の配列類似性がみられる。RDX遺伝子は11q23に位置することが蛍光 in situ ハイブリダイゼーションにより特定されている。不完全なものをコードする偽遺伝子(RDXP2)がXp21.3に、イントロンを欠く別の偽遺伝子(RDXP1)が11pに存在する。
Title: ラディキシン (Radixin)
Section: 相互作用

ラディキシンは、GNA13とタンパク質間相互作用する。
Title: サイクリンD2 (Cyclin D2)
Section: abstract

サイクリンD2（英: cyclin D2）は、ヒトではCCND2遺伝子によってコードされるタンパク質である。
Title: サイクリンD2 (Cyclin D2)
Section: 機能

CCND2遺伝子によってコードされるサイクリンD2は、高度に保存されたサイクリンファミリーに属する。このファミリーのメンバーは、細胞周期を通じてタンパク質の存在量に劇的な周期的変化が生じることで特徴づけられる。サイクリンはサイクリン依存性キナーゼの調節因子として機能する。さまざまなサイクリンはそれぞれ異なる発現と分解のパターンを持ち、有糸分裂の各イベントの時間的調整に寄与する。このサイクリンはCDK4またはCDK6と複合体を形成し、これらの調節サブユニットとして機能する。これらの活性はG1期からS期への移行に必要である。このタンパク質は、がん抑制因子であるRbタンパク質と相互作用し、そのリン酸化に関与していることが示されている。マウスの相同遺伝子のノックアウト研究からは、この遺伝子が顆粒膜細胞と生殖細胞の増殖に必要不可欠であることが示唆されている。この遺伝子の高レベルでの発現は、卵巣腫瘍や精巣腫瘍で観察されている。
Title: サイクリンD2 (Cyclin D2)
Section: 臨床的意義

CCND2遺伝子の変異は、Megalencephaly-Polymicrogyria-Polydactyly-Hydrocephalus（MPPH）症候群と関係している。
Title: 誘導型一酸化窒素合成酵素 (Nitric oxide synthase 2 (inducible))
Section: abstract

誘導型一酸化窒素合成酵素（ゆうどうがたいっさんかちっそごうせいこうそ、英: inducible nitric oxide synthase、略称: iNOS）または一酸化窒素合成酵素2（nitric oxide synthase 2、NOS2）は、ヒトではNOS2遺伝子にコードされる酵素である。
Title: 誘導型一酸化窒素合成酵素 (Nitric oxide synthase 2 (inducible))
Section: 遺伝子

NOS2遺伝子は17番染色体に位置する。この染色体のスミス・マゲニス症候群関連領域内には、NOD2に関連する3つの偽遺伝子が位置している。この遺伝子からは選択的スプライシングによって、異なるアイソフォームをコードする2つの転写バリアントが産生される。
Title: 誘導型一酸化窒素合成酵素 (Nitric oxide synthase 2 (inducible))
Section: 局在

NOS2は肝臓で発現しており、またリポ多糖と特定のサイトカインとの組み合わせによって誘導される。
Title: 誘導型一酸化窒素合成酵素 (Nitric oxide synthase 2 (inducible))
Section: 機能

一酸化窒素は、神経伝達や抗微生物活性、抗腫瘍活性などいくつかの過程において、生物学的メディエーターとして作用する反応性フリーラジカルである。多くのウイルス、細菌、真菌、寄生虫に対する免疫におけるマウスのNos2の機能は良く特徴づけられているが、ヒトでのNOS2の機能には未解明の部分や議論のある部分が多い。Nos2はサイトメガロウイルス（CMV）に対する免疫防御に重要である。NOS2はカベオリン1、RAC2と相互作用することが示されている。
Title: 誘導型一酸化窒素合成酵素 (Nitric oxide synthase 2 (inducible))
Section: 欠損症

常染色体劣性型NOS2欠損症がマウスで報告されている。Nos2をコードする遺伝子を欠損したマウスは、マウスCMV感染に対する感受性が高い。2020年2月には、同じ常染色体劣性型のNOS2完全欠損症がヒトでも記載された。それまで健康であった51歳の人物が、進行性のCMV感染の29か月後にCMV肺炎、CMV脳炎、血球貪食性リンパ組織球症に続発した呼吸不全によって死亡した。血液試料中のゲノムDNAを用いた全ゲノムシーケンシングから、患者には5つの遺伝子にホモ接合型変異があることが判明した。唯一の機能喪失型変異は、NOS2のホモ接合型フレームシフト変異であった。この疾患は非常に稀で、100万人に1人以下の割合で発生する。
Title: DNMT3L (DNMT3L)
Section: abstract

DNMT3L（DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like）は、ヒトではDNMT3L遺伝子によってコードされるタンパク質である。
Title: DNMT3L (DNMT3L)
Section: 機能

CpGのメチル化は、胚発生、インプリンティング、X染色体の不活性化に重要なエピジェネティック修飾である。マウスでの研究では、DNAのメチル化は哺乳類の発生に必要であることが実証されている。DNMT3L遺伝子は、DNAメチルトランスフェラーゼに類似した核内タンパク質をコードする。このDNMT3Lタンパク質はメチルトランスフェラーゼ活性に必要なアミノ酸残基を持たないため、DNAメチルトランスフェラーゼとしては機能しないと考えられている。しかしながら、このタンパク質はDNMT3Aによるde novoメチル化を促進し、母親由来のゲノムインプリンティングの確立に必要であると考えられている。また、このタンパク質はHDAC1との相互作用を介して転写抑制を媒介する。この遺伝子からは選択的スプライシングによって、2種類の転写バリアントが生じる。他のスプライシングバリアントも記載されているが、その生物学的妥当性は明らかではない。
Title: DNMT3L (DNMT3L)
Section: 相互作用

DNMT3LはHDAC1と相互作用することが示されている。
Title: SMUG1 (SMUG1)
Section: abstract

SMUG1（single-strand-selective monofunctional uracil-DNA glycosylase 1）は、ヒトではSMUG1遺伝子にコードされる酵素である。SMUG1は核内のクロマチン中の一本鎖・二本鎖DNAからウラシルを除去するグリコシラーゼであり、塩基除去修復に寄与する。
Title: SMUG1 (SMUG1)
Section: 機能

SMUGはDNA中のウラシルをプロセシングする、重要なウラシルDNAグリコシラーゼの1つである。SMUG1の機能は、DNAからウラシルやその誘導体を除去することである。SMUG1は一本鎖・二本鎖DNAの双方からウラシルを除去することができる。ウラシルの除去に関与する他のDNAグリコシラーゼにはUNG、TDG、MBD4がある。ウラシルを除去する修復は変異からの保護に必要不可欠である。現在得られている証拠からは、U:Gミスペアの修復を担う主要な酵素はUNGとSMUG1であることが示唆されている。ウラシルは抗体遺伝子の多様化の過程でもDNAに導入され、その除去は抗体の多様性に重要な役割を果たしている。UNGはウラシル除去の主要な因子であることが知られているが、UNGが欠失した場合にはSMUG1が抗体多様化過程におけるUNGのバックアップとして機能する。SMUG1はウラシル以外にもいくつかのピリミジン酸化産物を除去し、チミジンの酸化産物である5-ヒドロキシメチルウラシルをDNAから除去する特異的機能を持つ。
Title: SMUG1 (SMUG1)
Section: がんにおける役割

SMUG1転写産物の減少はDNA修復不全をもたらし、変異率や染色体不安定性が高まることで、よりアグレッシブな悪性度の高いクローンの選択が促進される。マウスでは、Smug1の喪失によってがん易罹患性が高まることが示されている。乳がんでは、SMUG1の転写産物の少なさは予後の悪さと相関している可能性があり、アグレッシブな表現型と関連していることが示されている。また、SUMG1の低発現はBRCA1、ATM、XRCC1の喪失と関係しており、SMUG1低発現腫瘍におけるゲノム不安定性との関係が示唆されている。臨床前研究では、SMUG1の欠失によって5-フルオロウラシル（5-FU）治療に対する感受性が生じることが示されている。一方で、胃がんではSMUG1の高発現が悪い臨床病理所見と関係している。この説明の1つとしては、胃がんでは炎症が発がんのドライバーとなっており、そのためSMUG1の高発現によって酸化損傷塩基（炎症環境では広くみられる）が効率的に修復されることでがん細胞の生存に有益となっていることが考えられる。このように、SMUG1は発がんにおいて複雑な役割を果たしており、がんの種類やその性質によって異なる作用を果たしている可能性がある。
Title: SMUG1 (SMUG1)
Section: がんにおける役割
Subsection: 薬剤応答における役割

5-FUは一般的ながんの治療に広く利用されており、2つの機構でDNA損傷を引き起こす。5-FUの代謝産物はチミジル酸シンターゼの阻害によってDNA複製時にチミジン三リン酸（TTP）を枯渇させ、DNAへのウラシルの導入をもたらすことで新生DNA鎖の断片化を引き起こす。また、5-FU自体がDNAに組み込まれることもある。複製時におけるウラシルや5-FUのゲノムへの組み込みに対処しているのはUNGやSMUG1である可能性が最も高い。現在の研究では、5-FUに対する感受性の上昇に関係しているのはUNGではなくSMUG1であることが示唆されている。SMUG1は薬剤応答を予測するバイオマーカーとして利用できる可能性があり、また特定種の腫瘍における抵抗性の獲得機構となっている可能性がある。SMUG1は酸化損傷塩基を修復する重要な酵素である。胃がんにおけるSMUG1の発現の解析からは、SMUG1の過剰発現が患者の生存期間の短さと相関していることが示されている。胃がんでは、炎症が発がんのドライバーとなっている。そのため可能性の1つとして、がん細胞は正常な細胞と比較してかなりの酸化ストレスにさらされており、SMUG1が調節を受けずに発現することががん細胞の酸化損傷塩基の修復と生存に必要不可欠となっていることが考えられる。
Title: SMUG1 (SMUG1)
Section: 相互作用

SMUG1はRBPMS、DKC1と相互作用することが示されている。
Title: EEF2K (EEF2K)
Section: abstract

eEF2K（eukaryotic elongation factor 2 kinase）は、ヒトではEEF2K遺伝子によってコードされる酵素である。CAMKIII（calmodulin-dependent protein kinase III）などの名称でも知られる。
Title: EEF2K (EEF2K)
Section: 機能

eEF2Kはカルモジュリンを介したシグナル伝達経路に関与する、高度に保存されたプロテインキナーゼであり、上流の複数のシグナルをタンパク質合成の調節と関連付ける。eEF2KはeEF2をリン酸化し、その機能を阻害する。
Title: EEF2K (EEF2K)
Section: 活性化

eEF2Kの活性は、カルシウムとカルモジュリンに依存している。eEF2Kの活性化は、連続的な2段階の機構で進行する。まず、カルシウム-カルモジュリンが高い親和性で結合してキナーゼドメインを活性化し、Thr348の自己リン酸化を迅速に開始する。次の段階では、Thr348の自己リン酸化がキナーゼのコンフォメーション変化を引き起こす。この過程はキナーゼドメインのアロステリックなリン酸結合ポケットへのリン酸化Thr348の結合によって行われていると考えられている。その結果、eEF2Kの基質であるeEF2に対する活性が増大する。eEF2KはSer500の自己リン酸化によって、カルシウム非依存的な活性を獲得する。しかし、その活性が維持されるためにはカルモジュリンが酵素に結合したままでなければならない。
Title: EEF2K (EEF2K)
Section: 臨床的意義

eEF2Kの活性は多くのがんで増大しており、抗がん治療の有効な標的である可能性がある。eEF2Kは、神経のタンパク質合成の調節を介して、ケタミンの迅速な抗うつ効果に関与している可能性がある。
Title: EEF2K (EEF2K)
Section: がん

eEF2Kの発現は乳がんや膵臓がんなどのがん細胞でアップレギュレーションされていることが多く、細胞の増殖、生存、運動性/遊走、浸潤性や腫瘍形成を促進する。
Title: NXF1 (NXF1)
Section: abstract

NXF1（nuclear RNA export factor 1）は、ヒトではNXF1遺伝子によってコードされるタンパク質で、TAP（tip associating protein）という名称でも知られる。
Title: NXF1 (NXF1)
Section: 機能

NXF1は核と細胞質を往復し、ポリアデニル化されたRNAにin vivoで結合して核外搬出を媒介する。NXF1は酵母のMex67pのホモログである。NXF1はNXF（nuclear RNA export factor）ファミリーに属する。このファミリーに共通するドメイン構造は、非典型的RNP型RNA結合ドメイン（RBD）、4つのロイシンリッチリピート（LRR）、NTF2様ドメイン、UBA（ubiquitin-associated）ドメインである。NTF2様ドメインはNXT1とのヘテロ二量体化を可能にし、UBAドメインはヌクレオポリンとの相互作用を媒介する。C末端のUBAドメインを含む領域は、FGリピートを含む核膜孔タンパク質（FGヌクレオポリン）との結合に重要であり、核との往復の媒介に十分である。このC末端領域は互いにパッキングした4本のαヘリックスから構成され、ヘリックス1、2、3の配置はUBAフォールドと類似している。隣接するモジュールとはプロリンに富む柔軟な12残基のリンカーで連結されている。LRRとNTF2様ドメインは核外搬出活性に必要である。NXF1には選択的スプライシングによるバリアントが存在する。NXF1は飽和量のD型レトロウイルスCTE（constitutive transport element）RNAの存在によって引き起こされるmRNA核外輸送阻害に打ち勝つことができる。マウスのNxf1遺伝子の特定のアレルは、内在性レトロウイルス（intracisternal A particle）のイントロンへの組み込みによって引き起こされる変異を抑制する。
Title: NXF1 (NXF1)
Section: 相互作用

NXF1は、TNPO2、MAGOH、U2AF1、DHX9、HuD、NUP214と相互作用することが示されている。
Title: サイクリンF (CCNF)
Section: abstract

サイクリンF（英: cyclin F）は、ヒトではCCNF遺伝子にコードされるタンパク質である。
Title: サイクリンF (CCNF)
Section: 機能

サイクリンFはサイクリンファミリーのメンバーである。サイクリンはサイクリン依存性キナーゼに結合して活性化することで、細胞周期の移行の調節に重要な役割を果たす。サイクリンFはFボックスタンパク質ファミリーにも属し、このファミリーは約40アミノ酸からなるFボックスモチーフを有することで特徴づけられる。Fボックスタンパク質はSCF複合体（SKP1-Cullin-F-box）と呼ばれるユビキチンリガーゼ複合体の4つのサブユニットの1つを構成しており、WD40ドメインを有するFbxw、ロイシンリッチリピートを有するFbxl、そしてこれらとは異なるタンパク質相互作用モジュールを有する、もしくは識別可能なモチーフを持たないFbxoの3つのクラスに分類される。サイクリンFはFbxoに分類され、またFボックスモチーフが最初に同定されたタンパク質の1つである。
Title: サイクリンF (CCNF)
Section: 発見と特性

CCNF遺伝子は1994年に、スティーブン・エレッジの研究室によって出芽酵母Saccharomyces cerevisiaeを用いた実験から最初に発見された。同時期に、Anna-Maria Frischaufの研究室による多発性嚢胞腎の新規候補遺伝子の探索の過程で、新たなサイクリンとしてサイクリンFが同定された。CCNF遺伝子はヒトゲノム上では16p13.3に位置し、17個のエクソンから構成される。この遺伝子にコードされるサイクリンFタンパク質は786アミノ酸から構成され、予測分子量は87kである。サイクリンFはFボックスタンパク質ファミリーの主要なメンバーであり、このファミリーのタンパク質には約40アミノ酸からなるFボックスと呼ばれるモチーフが存在する。配列や発現パターンの面では、サイクリンFはサイクリンAと最もよく類似している。さらに、PEST配列の存在、タンパク質の量や局在、細胞周期による調節を受けるmRNA、細胞周期やその進行に影響を及ぼすことなど、サイクリンに共通した他の特徴もみられる。サイクリンFはサイクリン依存性キナーゼを必要とせずに細胞周期を監視し、調節することができるという点で、他のサイクリンとは異なる。その代わりにサイクリンFはSCF複合体の基質受容体として機能し、疎水的パッチを介してCP110やRRM2といった下流標的と直接相互作用することがMichele Paganoの研究室によって示されている。
Title: サイクリンF (CCNF)
Section: 発現パターン

サイクリンFのmRNAはヒトの全ての組織で発現しているが、発現量は組織によって異なる。細胞内では核内に最も豊富に存在し、その量は細胞周期の段階によって変動する。発現パターンはサイクリンAとよく類似しており、S期に上昇が始まり、G2期にピークに達する。
Title: サイクリンF (CCNF)
Section: 役割

サイクリンFは、中心体の複製、遺伝子の転写、DNAの合成や安定性、修復に重要なタンパク質と相互作用する。
Title: サイクリンF (CCNF)
Section: 役割
Subsection: RRM2

RRM2はリボヌクレオチドレダクターゼであり、リボヌクレオチドからデオキシリボヌクレオチドへの変換を担う酵素である。デオキシリボヌクレオシド三リン酸（dNTPs）はDNA複製や修復時のDNA合成に必要不可欠である。サイクリンFはRRM2と相互作用して細胞内でのdNTPsの産生を制御し、ゲノム不安定性や変異を回避する。
Title: サイクリンF (CCNF)
Section: 役割
Subsection: CP110

中心体に局在するサイクリンFは、中心体複製に関与するタンパク質CP110の濃度調節に必要である。CP110はG2期にユビキチン化を介した分解によって調節されており、この調節は中心体の複製が細胞周期に1度だけ行われるよう保証しており、有糸分裂の異常の防止に寄与している。
Title: サイクリンF (CCNF)
Section: 役割
Subsection: NuSAP

NuSAPはサイクリンFの基質であり、細胞分裂に関与している。NuSAPは紡錘体の組み立て過程に必要な微小管結合タンパク質であり、その機能は微小管やクロマチンと相互作用して安定化や架橋を形成することである。NuSAPの欠損は有糸分裂中期の染色体整列の異常による変異の増加と関連しており、また過剰なNuSAPは有糸分裂の停止と微小管バンドルの形成をもたらす。サイクリンFはNuSAPの存在量を制御し、適切な細胞分裂に必要不可欠な役割を果たしている。
Title: サイクリンF (CCNF)
Section: 役割
Subsection: SLBP

SLBPは典型的ヒストンやH2A.XをコードしているmRNAを制御するタンパク質であり、ヒストンの代謝を細胞周期と同期させている。G2期にはSLBPはサイクリンFを介して分解され、遺伝毒性ストレス後のH2A.Xの蓄積を制御している。
Title: サイクリンF (CCNF)
Section: 役割
Subsection: E2F

E2F1、E2F2、E2F3aは、E2Fファミリー転写因子の中の典型的アクチベーターである。G2期には、サイクリンFはこれら3つアクチベーター全てを分解の標的とし、それによって細胞周期の進行をもたらす主要な転写エンジンをオフにする。
Title: サイクリンF (CCNF)
Section: 臨床的意義
Subsection: 神経変性疾患

CCNF遺伝子の変異は、前頭側頭型認知症（FTD）、筋萎縮性側索硬化症（ALS）、また両者の合併であるALS-FTDといった神経変性疾患との関連が示されている。全ゲノム連鎖解析やゲノム配列解析によって、家族性・孤発性双方のALS患者においてCCNFとの関連が特定されている。CCNFのALS関連変異を用いたin vitroやin vivoでの研究も行われており、特定のCCNF変異ではサイクリンFのユビキチン化活性の増大が引き起こされ、タンパク質の異常なユビキチン化がもたらされていることが明らかにされている。ゼブラフィッシュでは、CCNF変異体は運動神経の軸索変性症や運動応答の低下を示す。CCNF変異型ALS患者由来iPS細胞から作製された運動神経ではユビキチン化タンパク質が増大しており、運動神経のタンパク質廃棄物を除去するための分解経路に必要不可欠な、遊離ユビキチンのプールが減少している可能性が高い。
Title: サイクリンF (CCNF)
Section: 臨床的意義
Subsection: がん

サイクリンFの正常な発現は細胞周期のG2期での停止と有糸分裂の防止を誘導するため、がん抑制因子としての役割を持っている。さらに、サイクリンFはRRM2やCP110を介し、中心小体の複製を制御やゲノムの変異頻度の低下をもたらしている。これまでに、ヒトのいくつかのがんでCCNFの変異とRRM2の発現上昇が同定されている。
Title: LIG1 (DNA ligase 1)
Section: abstract

LIG1またはDNAリガーゼI（英: DNA ligase 1）は、ヒトではLIG1遺伝子にコードされる酵素である。DNAリガーゼIは、DNA複製と修復に関与している既知の唯一の真核生物型DNAリガーゼであり、そのため最もよく研究されているリガーゼとなっている。
Title: LIG1 (DNA ligase 1)
Section: 発見

DNA複製がDNA二本鎖の切断を介して行われることは知られていたが、その鎖をライゲーションして元に戻す酵素や、その作用機序は不明であった。Lehman、Gellert、Richardson、Hurwitzらの研究室の大きな貢献によって、1967年になってDNAリガーゼは発見された。
Title: LIG1 (DNA ligase 1)
Section: リクルートと調節

LIG1遺伝子は 120 kDa、919残基からなる、DNAリガーゼIと呼ばれる酵素をコードする。DNAリガーゼIはN末端の複製工場標的化配列（replication factory-targeting sequence、RFTS）、続いて核局在化配列、3つの機能的ドメインからなる。3つの機能的ドメインはN末端側からDNA結合ドメイン（DBD）、触媒を行うヌクレオチジルトランスフェラーゼ（NTase）ドメイン、C末端のオリゴヌクレオチド/オリゴ糖結合（OB）ドメインである。N末端部分は触媒活性を持たず、細胞内での活性には必要ないが、RFTSを含んでおり複製工場（replication factory）と呼ばれるDNA複製部位へのリクルートに利用される。DNAリガーゼIの活性化とリクルートには、翻訳後修飾が関係しているようである。N末端の4か所のセリン残基に対しリン酸化が行われ、Ser51、Ser76、Ser91のリン酸化はサイクリン依存性キナーゼ（CDK）によって、Ser66のリン酸化はカゼインキナーゼ2（CK2）によってそれぞれ行われる。Rossiらは、Ser66が脱リン酸化されているときにRFTSはPCNAと相互作用すると提唱しており、Tomらによってin vitroでの確証が行われている。どちらのデータもDNAリガーゼIのN末端領域がin vivoで核内での酵素機能を調節する役割を果たすことに対する妥当なエビデンス提供している。さらに、触媒を行うC末端ドメインにはサイクリン結合モチーフ（Cyモチーフ）が同定されており、変異体解析からSer76とSer91のリン酸化に関与していることが示された。N末端の複数のセリンがCDKとCK2の基質となり、DNAリガーゼIが細胞周期のS期に複製工場へリクルートされた際にRFTSとPCNAとの相互作用を調節しているようである。
Title: LIG1 (DNA ligase 1)
Section: 機能と機構

DNAリガーゼIは、DNA複製と塩基除去修復過程で機能する。真核生物のDNAリガーゼIが触媒する反応は、化学的にはすべてのリガーゼと共通である。DNA複製と修復の双方で、DNAリガーゼIはエネルギー的に有利なライゲーション反応を行うために、アデノシン三リン酸（ATP）を利用する。DNA複製は、真核生物の細胞周期のS期の間に起こる。DNAリガーゼIは、DNAのラギング鎖でDNAポリメラーゼδによってRNAプライマーヌクレオチドがDNAヌクレオチドに置き換えられた後、非連続的なDNA合成によって形成された岡崎フラグメントの連結を担う。岡崎フラグメントのライゲーションが適切に行われずニックを含むDNAでは、容易に二本鎖切断が起こり、遺伝的変異が引き起こされる可能性がある。これらのフラグメントのライゲーションは、3つの段階を経て進行する。酵素へのアデノシン一リン酸（AMP）基の付加（アデニリル化と呼ばれる）AMPのDNAへの転移ホスホジエステル結合の形成によってニックを閉じる（ニックシーリング）アデニリル化の際、ATPのαリン酸基は触媒リジン残基からの求核攻撃を受け、DNAリガーゼIの活性部位のリジンとAMPが共有結合した中間体と無機ピロリン酸が形成される。AMPの転移段階では、DNAリガーゼIはDNAと結合してニック部分に位置し、ニックの5'-リン酸部位での反応を触媒する。ニックの5'-リン酸のアニオン性酸素が求核剤として機能し、リジンに共有結合しているAMPのαリン酸基を攻撃し、AMPがDNAに共有結合した中間体（DNA-AMP中間体）が形成される。ホスホジエステル結合を形成するためには、DNA-AMP中間体は除去されなければならない。5'-リン酸基は上流の3'-OH基からの求核攻撃を受け、それによってホスホジエステル結合が形成される。この求核攻撃の間、AMP基は5'-リン酸基を脱離基として押し出し、ニックは閉じられてAMPは解離し、DNAライゲーションの1サイクルが完結する。最適では無い条件下では、反応が完結する前にリガーゼがDNAから解離してしまう場合がある。例えばマグネシウム濃度が低い条件下では、ニックシーリングの過程が遅くなり、リガーゼはアデニリル化中間体を残してDNAから解離してしまう。こうした中間体はホスホジエステラーゼの助けを借りなければ修復できない。ホスホジエステラーゼのアプラタキシンは、こうした中断されたDNA中間体に作用してAMP-リン酸結合を加水分解し、リガーゼが反応する前の初期状態を回復することが示されている。
Title: LIG1 (DNA ligase 1)
Section: 損傷塩基修復における役割

DNAリガーゼIは、塩基除去修復（BER）経路の最終段階で、一本鎖DNA切断のライゲーションを行う。DNAの窒素含有塩基が活性酸素種、毒素、電離放射線などの環境の危険因子によって損傷することはよく起こる。BERは損傷した塩基の除去と置換を担う主要な修復経路である。リガーゼIはlong patch BER（LP-BER）経路に関与しており、一方リガーゼIIIはshort patch BER（single nucleotide BER、SN-BER）経路に関与している。LP-BERは4つの段階を経て進行する。まず、DNAグリコシラーゼがN-グリコシド結合を切断して損傷塩基を解離させ、プリンまたはピリミジン塩基が存在しないAP部位が作り出される。次の段階では、APエンドヌクレアーゼがAP部位の5'末端側にニックを形成し、AP部位はデオキシリボースリン酸（dRP）残基となる。LP-BER経路ではその後、DNAポリメラーゼが5'から3'方向へ新たな塩基をいくつか合成し、5'末端にdRPが存在するDNAフラップが形成される。このフラップはフラップエンドヌクレアーゼによって切断される。この切断によってニックを含むDNA鎖が残され、DNAリガーゼIによる検知とライゲーションが行われる。リガーゼIの作用は、LP-BER経路の他の酵素、特にAPエンドヌクレアーゼとDNAポリメラーゼによって促進される。
Title: LIG1 (DNA ligase 1)
Section: 臨床的意義

DNAリガーゼI欠乏を引き起こすLIG1の変異は、免疫不全やDNA損傷剤に対する感受性の増加につながる。DNAリガーゼI欠乏を示す患者の確定症例は1つだけ存在しており、遺伝性の変異アレルによるものである。この欠乏症の症状は発育不全と免疫不全である。患者由来の細胞株に基づいて作製されたマウスモデルでは、変異体リガーゼによってゲノム不安定性につながる複製エラーが生じることが確認された。特に、変異体マウスでは腫瘍形成の増加も示された。リガーゼIは、良性腫瘍細胞や正常細胞ではなく、増殖中の腫瘍細胞でアップレギュレーションされていることも判明している。さらに、これらの細胞でリガーゼIの発現を阻害すると細胞毒性効果が生じることが示されており、リガーゼI阻害剤の化学療法薬としての可能性が示唆される。DNAリガーゼIが反応を中断した際のアデニリル化DNAの除去を担うホスホジエステラーゼであるアプラタキシンの欠損は、神経変性と関係している。このことは、DNAはリガーゼのエラーを修正する他のバックアップ機構がなければ再び修復経路へ入ることができないことを示唆している。DNAの構造はよく解明され、また、その操作、修復、利用に必要な構成要素の多くが同定され、特徴づけられているため、病気を治療したり、がんと闘ったり、生物学的刺激に基づいて薬剤を放出したりする能力を持つナノスケールの装置の開発の検討が行われている。DNAリガーゼは、こうした装置に組み込まれる可能性が高い。
Title: HSPA1L (HSPA1L)
Section: abstract

HSPA1L（heat shock protein family A (Hsp70) member 1 like）は、ヒトでは6番染色体に位置するHSPA1L遺伝子にコードされるタンパク質である。Hsp70ファミリーの一員そしてシャペロンタンパク質として、新たに翻訳されたタンパク質や誤ったフォールディングをしたタンパク質が適切にフォールディングするよう促進するとともに、変異タンパク質の安定化や分解を促進する。その機能は、シグナル伝達、アポトーシス、タンパク質恒常性、細胞成長や分化などの生物学的過程に寄与する。HSPA1Lは、幅広い種類のがん、神経変性疾患、細胞老化や加齢、移植片対宿主病と関係している。
Title: HSPA1L (HSPA1L)
Section: 構造

HSPA1L遺伝子はHsp70タンパク質をコードしており、この遺伝子はMHCクラスIII遺伝子領域に、2つの密接に関連した遺伝子（これらもHsp70タンパク質をコードする）とともにクラスターとして存在している。この遺伝子にコードされるHSPA1Lタンパク質は、HSPA1A、HSPA1Bと90%が相同性を示す。Hsp70タンパク質であるため、C末端に基質結合ドメイン、N末端にATP結合ドメインという構成をしている。基質結合ドメインは、2層のβサンドイッチサブドメイン（SBDβ）とαヘリカルサブドメイン（SBDα）という2つのサブドメインから構成され、両者はループLα,βによって連結されている。SBDβにはペプチド結合ポケットが存在し、SBDαは基質が結合する溝を覆うふたとして機能する。ATP結合ドメインは4つのサブドメインから構成され、中心部のATP/ADP結合ポケットによって2つのローブへと分けられる。N末端ドメインとC末端ドメインはループLL,1と呼ばれる保存された領域によって連結されており、この領域はアロステリック調節に重要である。最もC末端に位置する構造をとらない領域は、コシャペロンのドッキング部位となっていると考えられている。この遺伝子に由来するcDNAの5' UTRにはゲノム上で連続していない119 bpの領域が含まれており、そのためHSPA1L遺伝子はHSPA1AやHSPA1Bとは異なり、5' UTRに少なくとも1つのイントロンが含まれている可能性が高い。
Title: HSPA1L (HSPA1L)
Section: 機能

一般的に、HSPA1Lは幅広い組織に低濃度で存在するが、精巣では恒常的かつ豊富に発現している。HSPA1Lは他の熱ショックタンパク質とともに、既存のタンパク質を凝集から保護し、また細胞質基質やオルガネラで新たに合成されたタンパク質のフォールディングを媒介する。非ネイティブタンパク質を適切にフォールディングさせるため、HSPA1LはATPによって制御された形でタンパク質の疎水的ペプチド断片と相互作用する。その正確な機構は不明であるものの、kinetic partitioningそしてlocal unfoldingと呼ばれる、少なくとも2種類の作用様式が存在する。Kinetic partitioning機構では、Hsp70は基質の結合と放出のサイクルを繰り返し、遊離状態の基質を低濃度に維持する。この機構は凝集を効果的に防ぎ、遊離分子のネイティブ状態へのフォールディングを可能にする。Local unfolding機構では、結合と放出のサイクルによって基質のフォールディングが局所的にほどかれ、ネイティブ状態へのフォールディングの速度論的障壁を乗り越えるよう補助する。HSPA1Lはタンパク質のフォールディング、輸送、分解過程に加えて、変異タンパク質の機能を維持する役割も果たす。しかしながら、Hsp70のシャペロン能力を凌駕するようなストレス条件下では変異の影響が表出する。このタンパク質は、細胞傷害性T細胞への効率的な抗原提示を促進することで、抗原特異的腫瘍免疫を高める。HSPA1LはHSPA1AやHSPA1Bと密接な相同性を有するが、その調節は異なっており、熱誘導性ではない。
Title: HSPA1L (HSPA1L)
Section: 臨床的意義

Hsp70ファミリーのメンバーは、カスパーゼ依存的経路に作用したり、TNF-α、スタウロスポリン、ドキソルビシンなどのアポトーシス誘導因子に対抗したりすることで、アポトーシスを阻害する。こうした役割は、発がん、神経変性、老化など多くの病理過程と関係している。腫瘍細胞におけるHsp70濃度の上昇は、癌胎児蛋白を複合体形成によって安定化し、これらを細胞内の部位へ輸送することで、腫瘍の悪性度や治療抵抗性を高め、腫瘍細胞の生存を促進している可能性がある。そのため、Hsp70を標的としたがんワクチン戦略は動物モデルで高い成功を収めており、臨床試験へと進行している。反対に、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病、脊髄小脳変性症などの神経変性疾患や、加齢や細胞老化に対しては、Hsp70の過剰発現によってその影響は緩和される。また、百寿者では熱ショックフォにHsp70産生の強力な誘導が観察される。HSPA1Lは、損傷ミトコンドリアへのParkinの輸送を調節し、その除去を促進することで、抗パーキンソン病作用を示す可能性がある。HSPA1Lは移植片対宿主病にも関与しており、診断/予後マーカーとして機能する可能性がある。HSPA1L遺伝子の多型、特に基質結合ドメインに位置するものがこの疾患と関連している。
Title: HSPA1L (HSPA1L)
Section: 相互作用

HSPA1LはPARK2と相互作用することが示されている。
Title: HNRNPA1 (HNRNPA1)
Section: abstract

HNRNPA1（heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1、hnRNP A1）は、ヒトではHNRNPA1遺伝子にコードされるタンパク質である。hnRNP A1の変異は、筋萎縮性側索硬化症や多系統蛋白質症の原因となる。
Title: HNRNPA1 (HNRNPA1)
Section: 機能

hnRNP A1は、普遍的に発現しているヘテロ核リボヌクレオタンパク質（hnRNP）のA/Bサブファミリーに属する。hnRNPはRNA結合タンパク質であり、ヘテロ核RNA（hnRNA）と複合体を形成する。これらのタンパク質は核内でpre-mRNAと結合し、pre-mRNAのプロセシングやｍRNA代謝・輸送の他の側面に影響を及ぼしているようである。hnRNPは全て核内に存在するが、一部は核と細胞質の間を移行しているようである。hnRNPには明確な核酸結合特性がみられる。HNRNPA1遺伝子にコードされるhnRNP A1は、N末端ドメインに2つのquasi-RRMリピートを持ち、これらはRNAへの結合と特異性に重要である。hnRNP A1にはRGGボックスと呼ばれるグリシンに富む領域も存在し、これもRNAへの結合を可能にしている。hnRNP A1は、転写、転写後、翻訳、翻訳後段階で代謝経路を制御している重要な遺伝子の多くに影響を及ぼす。hnRNP A1はhnRNP複合体のコアタンパク質の中で最も豊富に存在するものの中の1つであり、核質に局在する。このタンパク質は他のhnRNPとともに、おそらくmRNAに結合した形で核外へ搬出され、すぐに核内へ再移行する。RGGボックスの下流のグリシンに富む領域に位置するM9核局在化配列は、核局在と核外搬出の双方のシグナルとして作用する。hnRNP A1はpre-mRNAからhnRNP粒子へのパッケージングや核から細胞質へのポリアデニル化mRNAの輸送に関与しており、またスプライシング部位の選択を調節している可能性がある。HNRNPA1遺伝子には複数の選択的スプライシング転写産物が見つかっており、複数の転写開始部位やポリアデニル化部位が存在する。翻訳後修飾がhnRNP A1の機能に影響を及ぼすことが知られている。RGGボックスのアルギニン残基のメチル化はRNA結合活性を調節している可能性がある。PKC、MAPK、S6KなどのキナーゼはN末端とC末端のセリン残基をリン酸化し、その機能を調節する。C末端領域のリン酸化はhnRNP A1の細胞質への蓄積を引き起こす。セリンもしくはスレオニン残基に対して行われるO-GlcNAc化は広くみられる可逆的修飾であり、カリオフェリンβ（トランスポーチン1）への結合を妨げ、hnRNP A1の核局在を引き起こす。
Title: HNRNPA1 (HNRNPA1)
Section: 相互作用

hnRNP A1は、BAT2、FEN1、IκBαと相互作用することが示されている。
Title: HNRNPA1 (HNRNPA1)
Section: ウイルス複製における役割

hnRNP A1は、感染後に複数のステージが存在するDNAウイルス、＋鎖RNAウイルス、-鎖RNAウイルスの生活環に関与している。ウイルスの生活環におけるこのタンパク質の役割はウイルスごとに異なり、相反する役割を果たしている場合もある。hnRNP A1は一部のウイルスではウイルスの複製を促進し、他のウイルスでは阻害する役割を果たす。hnRNP A1の抗ウイルス作用は、HTLV-1細胞培養モデルで観察される。hnRNP A1は、ウイルスRNAの3' LTRに存在する応答エレメントに対するRexタンパク質の結合を阻害する。hnRNP A1の異所性発現はRexと競合することでその転写後活性に対抗し、ウイルス複製に負の影響を及ぼしてHTLV-1の感染に対する抗ウイルス効果を示す。＋鎖RNAウイルスであるC型肝炎ウイルス（HCV）の場合、hnRNP A1は"cis-acting replication element"と呼ばれる、ウイルスのORFの3'末端付近に存在する重要な領域と相互作用する。hnRNP A1がアップレギュレーションされている場合にはHCVの複製は低下し、ダウンレギュレーションされている場合には増加する。hnRNP A1のウイルスに対する促進作用は、シンドビスウイルス（＋鎖RNAウイルス）感染モデルで観察される。hnRNP A1はウイルスRNAの5' UTRに結合し、ウイルス複製が行われる細胞質部位へ再分布して-鎖RNAの合成を促進する。hnRNP A1はブタ流行性下痢ウイルス（PEDV）の感染時にも同様の役割を果たしており、hnRNP A1はPEDVのヌクレオカプシドタンパク質と共免疫沈降される。hnRNP A1はウイルスの効率的な複製に重要な、末端のリーダー配列や遺伝子間配列にも結合する。同様の傾向はライノウイルス（HRV）、エンテロウイルス71（EV-71）、トリレオウイルス（ARV）の感染時にも観察される。HIV-1など一部のウイルスでは、研究によって相反する結果が得られている。ある研究では、HIV-1の感染後にhnRNP A1は内因性発現が増加ており、またhnRNP A1のダウンレギュレーションがウイルス複製に影響を及ぼすことから、hnRNP Aの発現上昇はウイルスに好都合となることが報告されている。一方で他の研究では、in vitroでのhnRNP A1の過剰発現がウイルス複製に悪影響を与えることが報告されている。このように、HIV-1の生活環におけるhnRNP A1の役割には議論がある。
Title: HNRNPA1 (HNRNPA1)
Section: その他の疾患における役割

hnRNP A1の変異は筋萎縮性側索硬化症や多系統蛋白質症の原因となる。hnRNP A1はOct-4やサーチュイン1のmRNAを安定化し、細胞老化や細胞老化随伴分泌現象の誘導に対抗する。
Title: TFF3 (Trefoil factor 3)
Section: abstract

TFF3またはトレフォイル因子3（英: trefoil factor 3）は、ヒトではTFF3遺伝子によってコードされるタンパク質である。
Title: TFF3 (Trefoil factor 3)
Section: 機能

トレフォイルファミリーのメンバーは、少なくとも1つのトレフォイルモチーフを持つことで特徴づけられる。トレフォイルモチーフは約40アミノ酸からなり、3つの保存されたジスルフィド結合が存在する。トレフォイルファミリーは胃腸粘膜で発現する安定な分泌タンパク質である。機能は多様であり、粘膜の保護、粘液の増粘、上皮の治癒の促進などがある。TFF3遺伝子は小腸や結腸の杯細胞などさまざまな組織で発現している。TFF3遺伝子と他の2つのトレフォイルファミリーのメンバーの遺伝子は21番染色体にクラスターとして存在する。
Title: TFF3 (Trefoil factor 3)
Section: 機能
Subsection: 糖鎖への結合

ヒトの3つのトレフォイル因子（TFF）はすべてレクチンであり、GlcNAc-α-1,4-Galの二糖に対して特異的に相互作用する。この二糖は、粘膜の高度にグルコシル化されたムチンにのみ存在することが知られている糖鎖エピトープ（glycotope）である。TFFは2つの糖鎖エピトープに結合してムチンを架橋し、粘液の厚さと粘度を可逆的に調節する。
Title: TFF3 (Trefoil factor 3)
Section: 機能
Subsection: 母乳

TFFは、TFF1（gastric peptide）、TFF2（spasmolytic peptide）、そしてTFF3（intestinal trefoil factor）からなる。TFFはムチン産生細胞から分泌され、口腔粘膜表面の完全性の維持とrestitutionと呼ばれる過程による胃腸粘膜の治癒の増強に重要な役割を果たしている。また、ヒトの母乳にもかなりの量のTFFが存在する。乳から単離されたTFF3とヒト腸管上皮細胞におけるIL-6およびIL-8のダウンレギュレーションとの強い相関関係の証拠が示されている。一方、TFF3は培養上皮細胞を活性化してβ-ディフェンシン2（hBD2）とβ-ディフェンシン4（hBD4）の産生を引き起こす。これらの結果から、TFFは腸管上皮細胞を活性化し、ディフェンシンなどの自然免疫に関連するペプチドの産生を誘導することで、授乳中の乳児の免疫系に積極的に関与している可能性が示唆された。
Title: TFF3 (Trefoil factor 3)
Section: 機能
Subsection: PAR2受容体の活性化

PAR2の活性化には2つの主要な機構が記載されている。1つは、プロテアーゼによるPAR2のN末端の細胞外領域の特異的切断によって受容体活性化ペプチドを露出させ、露出したテザードリガンドと受容体本体との相互作用によって細胞シグナル伝達を引き起こすものである。もう1つは、SLIGKVなど、受容体に結合する合成ペプチドによって、プロテアーゼによる作用を模倣するものである。授乳期間中、ヒトの乳に分泌されたTFF3はPAR2受容体を介して腸管上皮細胞を活性化することで、hBD2やhBD4の発現やサイトカインの調節を誘導している可能性がある。
Title: TFF3 (Trefoil factor 3)
Section: 臨床的意義

バレット食道の検出やスクリーニングの精度と許容性を向上させるため、摂取可能な食道サンプリングデバイス（Cytosponge）とTFF3を円柱上皮のマーカーとして利用した免疫細胞染色を組み合わせたプロセスが開発されている。しかし、こうした検査の臨床的有用性は、胃の噴門部でTFF3が頻繁に染色されることや、それに伴う偽陽性のリスクという限界が存在する可能性がある。
Title: フクチン (Fukutin)
Section: abstract

フクチン(Fukutin)は、筋肉の統合性維持、皮質の組織形成、正常な眼球の発達に不可欠な真核生物の持つタンパク質である。フクチン遺伝子の変異は、福山型先天性筋ジストロフィーの原因となる。ヒトではこのタンパク質は、染色体9q31に位置するFCMD（またはFKTN）遺伝子によりコードされている。ヒトのフクチンは461アミノ酸長で、分子量は53.7kDaである。
Title: フクチン (Fukutin)
Section: 機能

機能の大部分は未知であるが、フクチンはおそらく遍在的に発現している膜タンパク質である。ただし骨格筋、心臓、脳には多く存在する。cis-ゴルジ体部分に局在し、骨格筋ではα-ジストログリカンのグリコシル化に関わっている可能性がある。コードされるタンパク質はグリコシルトランスフェラーゼであり脳の発達に関わっていると考えられている。
Title: フクチン (Fukutin)
Section: 臨床的意義

この遺伝子の異常は、福山型先天性筋ジストロフィー、ウォーカー・ワールブルク症候群、肢帯型筋ジストロフィー2M 型、拡張型心筋症1X型等の原因となる。
Title: KHDRBS1 (KHDRBS1)
Section: abstract

KHDRBS1（KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 1）またはSam68（Src-associated substrate in mitosis of 68 kDa）は、ヒトではKHDRBS1遺伝子にコードされるタンパク質である。このタンパク質は多くの機能を持っているようであり、選択的スプライシング、細胞周期の調節、RNAの3'末端の形成、腫瘍形成、HIVの遺伝子発現の調節など、多様な細胞過程に関与している可能性がある。
Title: KHDRBS1 (KHDRBS1)
Section: 機能

Sam68は公式にはKHDRBS1と呼ばれる。Sam68はKHドメインを持つRNA結合タンパク質で、U(U/A)AAの定方向リピートを比較的高い親和性で認識する。Sam68は主に核に存在し、核内での主要な機能は、選択的スプライシングにおいて選択的エクソンに隣接するRNA配列を認識し、スプライシングを調節することである。
Title: KHDRBS1 (KHDRBS1)
Section: 臨床的意義

Sam68は神経発生やアディポジェネシスなどの過程や、脊髄性筋萎縮症やがんなどの疾患過程に中心的な役割を果たしている多数の遺伝子に対し、選択的スプライシングによって調節を行う。
Title: KHDRBS1 (KHDRBS1)
Section: 臨床的意義
Subsection: 神経発生

選択的スプライシングを検出可能なマイクロアレイによって、正常な神経発生に関係するmRNAの選択的スプライシングにSam68が関与していることが示されている。また、Sam68はSF2/ASFの選択的スプライシングを調節することで、上皮間葉転換に関与していることが示されている。Sam68は中枢神経系において、神経活動依存的にニューレキシン1の選択的スプライシングを調節することが示されており、神経発達障害と関係していることが示唆されている。
Title: KHDRBS1 (KHDRBS1)
Section: 臨床的意義
Subsection: アディポジェネシス

Sam68はmTORキナーゼの選択的スプライシングに影響を与え、Sam68欠損マウスで観察される痩せ表現型に寄与している。
Title: KHDRBS1 (KHDRBS1)
Section: 臨床的意義
Subsection: 脊髄性筋萎縮症

Sam68は脊髄性筋萎縮症と関係するSMN2遺伝子のエクソン7のスキッピングを促進し、機能的でないSMN2タンパク質の産生をもたらす。