shintaro-ozaki/entity-explanation huggingface dataset:
Title: MSH6 (MSH6)
Section: 機能

一般的に、DNAのミスマッチはDNA複製のエラー、遺伝的組換えやその他の化学的・物理的因子によって生じる。こうしたミスマッチの認識と修復は細胞にとって極めて重要であり、適切に行われない場合にはマイクロサテライト不安定性、変異率の上昇（mutator phenotype）、HNPCCに対する感受性が生じる。MSH6はMSH2と共にMutSαと呼ばれるタンパク質複合体を形成する。この複合体によるミスマッチの認識はADP結合型からATP結合型への変換によって調節されており、MutSα複合体が分子的スイッチとして機能していることの証拠となっている。正常なDNAでは、アデニン（A）はチミン（T）と結合し、シトシン（C）はグアニン（G）と結合している。しかし時としてミスマッチが生じることがあり、TがGと結合している場合にはG/Tミスマッチと呼ばれる。G/Tミスマッチが認識されるとMutSα複合体が結合し、ADPがATPへ交換される。ADPからATPへの交換はコンフォメーション変化を引き起こし、MutSαはDNA骨格に沿って移動するスライディングクランプへと変化する。ATPは複合体のミスマッチDNA部位からの解放を誘導し、スライディングクランプのようなDNAに沿った移動を可能にする。この変換は損傷DNA修復のための下流のイベントの開始を補助する。
Title: MSH6 (MSH6)
Section: がん

MSH2の変異は強力なmutator phenotypeを引き起こすのに対し、MSH6の変異は弱いmutator phenotypeを引き起こすだけである。MSH6の変異は主に一塩基置換変異を引き起こすことが知られており、このことはMSH6の役割が主に一塩基置換変異の修正であり、そしてより小規模で一塩基挿入/欠失変異を修正していることを示唆している。MSH6遺伝子の変異は機能を喪失した、もしくは部分的にしか活性を持たないタンパク質の産生をもたらし、DNAのエラーを修正する能力を低下させる。MSH6の機能喪失は1ヌクレオチドリピートの不安定性をもたらす。HNPCCはMSH2やMLH1の変異によって引き起こされるのが最も一般的であるが、MSH6の変異も非定型HNPCCと関連している。MSH6の変異の場合には大腸癌の浸透率は低いようであり、このことはMSH6変異の保因者の中で症状が生じる割合が低いことを意味している。一方で、女性の変異保因者にとっては子宮体癌がより重要な臨床症状であるようである。MSH6に変異を有する家系における子宮体癌や大腸癌の発症年齢は約50歳であり、MSH2関連腫瘍の発症年齢が44歳であることと比較すると遅い。
Title: MSH6 (MSH6)
Section: がんにおけるMSH6のエピジェネティックな制御

2つのmiRNA、miR-21とmiR-155はDNAミスマッチ修復遺伝子MSH6、MSH2を標的とし、これらのタンパク質発現の低下を引き起こす。これら2つのmiRNAのどちらか一方でも過剰発現した場合には、MSH2、MSH6タンパク質が過少発現状態となり、DNAミスマッチ修復の減少とマイクロサテライト不安定性の増大が引き起こされる。miR-21の発現は、2つのプロモーター領域のCpGアイランドのエピジェネティックなメチル化状態によって調節されている。プロモーター領域の低メチル化は、miRNAの発現の上昇と関係している。miRNAの高発現はその標的遺伝子の抑制を引き起こす。結腸癌の66％から90%ではmiR-21が過剰発現しており、一般的にMSH2レベルが低下している（そしてMSH6はMSH2が存在しない場合には不安定である）。miR-155はプロモーター領域のCpGアイランドのエピジェネティックなメチル化と、プロモーター領域のヒストンH2AとH3のエピジェネティックなアセチル化の双方によって調節されている（このアセチル化は転写を増加させる）。2つの異なる手法での測定により、散発性大腸癌の22%もしくは50%でmiR-155が過剰発現していることが示されており、miR-155の発現はMSH2の発現と逆相関を示す。
Title: MSH6 (MSH6)
Section: 相互作用

MSH6は、MSH2、PCNA、BRCA1と相互作用することが示されている。
Title: BCR_(タンパク質) (BCR (gene))
Section: abstract

BCR（breakpoint cluster region protein）は、ヒトではBCR遺伝子によってコードされているタンパク質である。BCR遺伝子は、フィラデルフィア染色体と関係したBCR-ABL融合遺伝子を構成する2つの遺伝子のうちの一方である。BCR遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2種類の転写バリアントが見つかっている。
Title: BCR_(タンパク質) (BCR (gene))
Section: 機能

BCR-ABL融合タンパク質に関しては多くの研究がなされている一方で、正常なBCR遺伝子産物の機能はいまだ明確ではない。BCRタンパク質はセリン/スレオニンキナーゼ活性を持ち、またRhoAに対するグアニンヌクレオチド交換因子、Racに対するGTPアーゼ活性化タンパク質として機能する。
Title: BCR_(タンパク質) (BCR (gene))
Section: 臨床的意義

22番染色体と9番染色体との間の相互転座によって形成されるフィラデルフィア染色体は、慢性骨髄性白血病の患者にみられることが多い。この転座における22番染色体上の切断点はBCR遺伝子内に位置している。この転座によって、BCR遺伝子と9番染色体上の切断点に位置するABL遺伝子の双方に由来する配列からBCR-ABL融合タンパク質が産生されるようになる。
Title: BCR_(タンパク質) (BCR (gene))
Section: 構造

BCR-ABLがんタンパク質のオリゴマー化ドメインはBCRのN末端に位置し、この融合タンパク質の発がん性に必要不可欠である。オリゴマー化ドメインはN末端の短いヘリックス（α1）、柔軟なループ、そしてC末端の長いヘリックス（α2）から構成される。これらはN字型構造を形成し、2つのヘリックスは平行な向きに並ぶ。2つの単量体ドメインは、α2ヘリックスの間での逆平行コイルドコイルの形成、そしてα1ヘリックス間のドメインスワッピングによって一方のα1ヘリックスがもう一方のα2ヘリックスに対してパッキングすることで二量体を形成する。その後、2つの二量体が四量体へと結合する。BCR-ABLがんタンパク質の逆平行コールドコイルドメイン（BCR30-65）を開始構造とした構造ベースの改変によって、pH感受性のホモ二量体逆平行コイルドコイルが作出されている。
Title: BCR_(タンパク質) (BCR (gene))
Section: 相互作用

BCRは次に挙げる因子と相互作用することが示されている。
Title: メバロン酸キナーゼ (Mevalonate kinase)
Section: abstract

メバロン酸キナーゼ（Mevalonate kinase）は、イソプレノイド生合成経路の一つであるメバロン酸経路の4番目の酵素である。ヒトにおいてMVK遺伝子でコードされる。細菌から哺乳類まで幅広い生物で見られる。この酵素は、以下の化学反応を触媒する。
Title: メバロン酸キナーゼ (Mevalonate kinase)
Section: 機能

メバロン酸は、イソプレノイド及びステロールの生合成において鍵となる中間体であり、メバロン酸キナーゼは初期段階の鍵となる酵素である。メバロン酸をリン酸化して、5-ホスホメバロン酸を産生する。メバロン酸キナーゼ活性の5–10%の低下はメバロン酸キナーゼ欠損症と関係しており、メバロン酸経路の中間体であるメバロン酸が蓄積する。メバロン酸キナーゼはメバロン酸経路の5番目および6番目の酵素とはアミノ酸配列が相同であり、いずれも共通祖先から分岐したと考えられる（GHMPファミリー）。
Title: メバロン酸キナーゼ (Mevalonate kinase)
Section: 臨床上の重要性

この酵素の異常は、発熱を繰り返す高IgD症候群と関連がある。メバロン酸キナーゼ欠損症はこの遺伝子の変異によって生じ、精神運動発達遅滞、発育不良、肝脾腫、貧血、再発性の発熱などで特徴づけられる、メバロン酸尿症を引き起こす。また、この遺伝子の欠損は周期性発熱を伴う高IgD症候群を引き起こし、この疾患はリンパ節腫脹、関節痛、胃腸の異常、皮膚の発疹を伴う再発性の発熱によって特徴づけられる。疾患の症状は典型的には幼児期から始まり、ストレスや細菌感染によってさらに活発になる。メバロン酸キナーゼ欠損症を正確に診断するための十分な科学的データが現時点ではないため、長い間診断がなされていない状態となっている可能性がある。
Title: CBL_(遺伝子) (CBL (gene))
Section: abstract

Cbl（Casitas B-lineage Lymphoma）は、細胞シグナリングとタンパク質のユビキチン化に関与するE3ユビキチンリガーゼ、CBLタンパク質をコードする遺伝子である。この遺伝子の変異は、ヒトの多くの種類のがん、特に急性骨髄性白血病と関係している。
Title: CBL_(遺伝子) (CBL (gene))
Section: 発見

1989年に発見されたウイルスにコードされたマウスCbl遺伝子の断片が、Cblファミリーの最初のメンバーである。その断片は、正常なマウスのCbl（c-Cbl）と区別するためにv-Cblと名付けられた。実験で用いられたウイルスは、カリフォルニア州・カシータス湖で捕獲されたマウスの脳から単離されたマウス白血病ウイルスのマウス指向性株（Cas-Br-M）であり、注入されたマウスからc-Cbl遺伝子の約1/3を切り出していることが判明した。シーケンシングによって、レトロウイルスが保持している断片はチロシンキナーゼ結合ドメインをコードしていることが明らかとなった。この断片に発がん性があり、全長のc-Cblを保持しているレトロウイルスは腫瘍形成を誘導しなかった。形質転換されたレトロウイルスは、感染したマウスに対しCasitas B-lineage lymphomaとして知られるpre-B細胞リンパ腫の一種を常に誘導することが判明した。
Title: CBL_(遺伝子) (CBL (gene))
Section: 構造

全長のc-Cblは、機能的に異なるドメインをコードする複数の領域から構成されている。N末端のチロシンキナーゼ結合ドメイン（TKBドメイン）: タンパク質の結合相手を決定するRINGフィンガードメイン: ユビキチン化に関与する酵素をリクルートするプロリンリッチ領域: CblとCblのアダプター機能に関与する細胞質タンパク質との相互作用部位C末端のユビキチン結合ドメイン（UBAドメイン）: ユビキチンの結合部位このドメイン構造とタンパク質産物のチロシンとセリンに富む構成は、細胞シグナリング経路で利用される「アダプター分子」に典型的なものである。
Title: CBL_(遺伝子) (CBL (gene))
Section: ホモログ

哺乳類では3つのホモログが同定されており、それらはC末端のUBAドメインの長さが異なるためにアダプタータンパク質としての機能が異なる。c-Cbl: 普遍的に発現、ヒトでは906アミノ酸、マウスでは913アミノ酸。Cbl-b: 普遍的に発現、982アミノ酸。Cbl-c: UBAドメインが欠失しており、474アミノ酸。主に上皮細胞で発現しているが、その機能は未解明。c-CblとCbl-bにはキイロショウジョウバエ Drosophila melanogaster（D-Cbl）と線虫 Caenorhabditis elegans（Sli-1）にオルソログが存在し、これらのタンパク質の長い進化的経路が示唆される。
Title: CBL_(遺伝子) (CBL (gene))
Section: 機能
Subsection: ユビキチンリガーゼ

ユビキチン化とはタンパク質にユビキチンを化学的に結合させる過程であり、それに伴ってタンパク質は分解の標的となる。この過程は複数段階からなり、いくつかの酵素が関与している。最後に関与するのがE3ファミリーのリガーゼである。CblはE3リガーゼとして機能し、ユビキチンとCblのタンパク質基質（典型的には受容体型チロシンキナーゼ）の間の共有結合の形成を触媒する。RINGフィンガードメインはこの転移を媒介するが、他のRING型E3リガーゼと同様、ユビキチンとRINGフィンガードメインとの間に中間体となる共有結合は形成されない。基質となる受容体型チロシンキナーゼへのユビキチンの結合によって、受容体型チロシンキナーゼは細胞膜から除去され、その後の分解のためにリソソームへ輸送される。
Title: CBL_(遺伝子) (CBL (gene))
Section: 相互作用

Cblは次に挙げる因子と相互作用することが示されている。
Title: プロテアーゼ活性化受容体2 (Protease-activated receptor 2)
Section: abstract

プロテアーゼ活性化受容体2（プロテアーゼかっせいかじゅようたい2、英: protease-activated receptor 2、略称: PAR2）は、ヒトではF2RL1遺伝子にコードされるタンパク質である。F2RL1（coagulation factor II (thrombin) receptor-like 1）、GPR11（G-protein coupled receptor 11）とも呼ばれる。PAR2は炎症応答、肥満、代謝、がんを調節し、感染時に産生されるタンパク質分解酵素のセンサーとしても機能する。ヒトでは、PAR2は表皮の顆粒層のケラチノサイトや、好酸球、好中球、単球、マクロファージ、樹状細胞、マスト細胞、T細胞などいくつかの免疫細胞でも発現している。
Title: プロテアーゼ活性化受容体2 (Protease-activated receptor 2)
Section: 遺伝子

F2RL1遺伝子には2つのエクソンが含まれ、ヒトの組織で広く発現している。ヒトのPAR2のアミノ酸配列はマウスの配列と83%同一である。
Title: プロテアーゼ活性化受容体2 (Protease-activated receptor 2)
Section: 活性化機構

PAR2は、Gタンパク質共役受容体ファミリーのメンバーであり、プロテアーゼ活性化受容体（PAR）ファミリーのメンバーでもある。PAR2はいくつかの異なる内在性・外因性プロテアーゼによる切断によって活性化される。PAR2は、細胞外のN末端領域に位置するアルギニンとセリンの間で切断されることで活性化される。切断によって新たに露出したN末端は、活性化テザードリガンド（係留リガンド）として機能し、細胞外ループ2（ECL2）内の保存された領域に結合して受容体を活性化する。受容体は、テザードリガンドの末端のアミノ酸を模倣したペプチド配列によって、タンパク質分解とは無関係に活性化される。また、シグナル伝達と関係していないプロテアーゼによる他の部位での切断によって、受容体はプロテアーゼへの曝露に応答しなくなる。トリプシンはPAR2を切断して炎症性シグナル伝達を開始する主要な酵素である。トロンビンも高濃度ではPAR2を切断することが示されている。PAR2を切断する他の酵素としてはマスト細胞の主要なプロテアーゼであるトリプターゼがあり、PAR2のタンパク質分解によってカルシウムシグナルの伝達と増殖を誘導する。PARはカリクレインの基質としても同定されており、カリクレインはさまざまな炎症過程や腫瘍形成過程に関係している。PAR2の場合、カリクレイン-4、-5、-6、-14が特に重要である。疾患条件下では、PAR2によってTLR4やEGFRがトランス活性化されることが知られている。
Title: プロテアーゼ活性化受容体2 (Protease-activated receptor 2)
Section: 機能

さまざまな細胞や組織でPARの機能の解明するために多くの研究が行われている。ヒトの気道と肺実質では、PAR2は線維芽細胞の増殖の増大とIL-6、IL-8、PGE2、カルシウムレベルの上昇を担う。マウスでは、血管拡張に関与する。PAR1ともに、PAR2の調節異常はがん細胞の浸潤性に関与している。
Title: プロテアーゼ活性化受容体2 (Protease-activated receptor 2)
Section: アゴニストとアンタゴニスト

PAR2の強力かつ選択的な低分子アゴニストとアンタゴニストが発見されている。PAR2には機能的選択性（functional selectivity）が生じることがあり、異なるプロテアーゼが異なる部位でPAR2を切断することでbiased signaling（バイアスのあるシグナル伝達）が生じる。合成低分子リガンドもbiased signalingを調節し、異なる機能的応答をもたらす。これまでに、PAR2は2つの異なるアンタゴニストとの共結晶構造が得られており、変異導入や構造ベースのドラッグデザインによるアゴニスト（内在性リガンドであるSLIGKV）結合状態のモデリングが行われている。
Title: カテリシジン (Cathelicidin antimicrobial peptide)
Section: abstract

カテリシジンまたはカセリサイディン（cathelicidin, cathelicidin antimicrobial peptide, CAMP）は、ヒトではCAMP遺伝子にコードされる抗菌ペプチドである。活性型はLL-37と呼ばれる。ヒトでは、CAMP遺伝子はペプチド前駆体であるCAP-18（18 kDa）をコードしており、プロテイナーゼ3による細胞外での切断などのプロセシングを受け、活性型であるLL-37となる。カテリシジンファミリーのメンバーは約30種類が知られており、LL-37はヒトにみられる唯一のカテリシジンである。カテリシジンは好中球やマクロファージの分泌顆粒に貯蔵され、白血球による活性化後に放出される。カテリシジンは両親媒性分子と呼ばれる、二重の性質を併せ持った分子である。すなわち、分子の一方の端は水分子に親和性があり、脂肪やタンパク質に反発する。もう一方の端は脂肪やタンパク質に親和性があり、水分子に反発する。こうした性質のため、このファミリーのメンバーは病原体に対し、細胞膜の崩壊、損傷、穿孔といった反応を示すこととなる。カテリシジンは哺乳類において、侵入細菌の感染に対する自然免疫に重要な役割を果たしている。カテリシジンはディフェンシンなどとともに、抗菌ペプチドに分類される。ディフェンシン類は共通した構造的特徴を有するのに対し、カテリシジン関連ペプチドはきわめて多様である。カテリシジンファミリーは、cathelinドメインと呼ばれる高度に保存された領域と、きわめて多様なカテリシジンペプチドドメインによって特徴づけられる。カテリシジンは、有袋類を含む、多くの哺乳類から単離されている。カテリシジンは主に好中球、単球、マスト細胞、樹状細胞、マクロファージにおいて、細菌、ウイルス、真菌、寄生虫による活性化、または活性型ビタミンDであるビタミンD3によって誘導される。上皮細胞やケラチノサイトなど、他の一部の細胞にも存在することが知られている。
Title: カテリシジン (Cathelicidin antimicrobial peptide)
Section: 名称

カテリシジン（cathelicidin）という名称は、特徴的なcathelin様ドメインが存在することから1995年に命名された。Cathelin自体は1989年に命名されたもので、カテプシンLインヒビター（cathepsin L inhibitor）に由来する。
Title: カテリシジン (Cathelicidin antimicrobial peptide)
Section: 抗微生物活性の機序

カテリシジンの作用機序は、他の抗菌ペプチドと同様、標的生物の細胞膜構造の破壊（損傷や穿孔）を伴う。マクロファージにおいて、カテリシジンはファゴソームに取り込まれた微生物の脂質とタンパク質からなる膜をリソソームとの融合後に迅速に破壊する。そのため、細菌のバイオフィルムの形成を阻害する役割を果たす。
Title: カテリシジン (Cathelicidin antimicrobial peptide)
Section: その他の活性

LL-37は細胞増殖や遊走の活性化に関与し、創傷閉鎖過程に寄与している。こうした機構の全てが、組織の恒常性や再生過程に必須の役割を果たしている。また、FPRL1、P2X7、EGFR、IGF1Rといったさまざまな受容体に対してアゴニストとして作用する。さらに、LL-37は血管新生を誘導し、アポトーシスを調節する。
Title: カテリシジン (Cathelicidin antimicrobial peptide)
Section: 特徴

カテリシジンは12–80アミノ酸から構成され、さまざまな構造をとる。大部分のカテリシジンは23–37アミノ酸残基からなり、両親媒性のαヘリックスへとフォールディングする。さらに、1つもしくは2つのジスルフィド結合によって安定化されたβヘアピン構造を持つ小さな分子（12–18残基）である場合もある。より大きなサイズ（39–80残基）のものも存在し、こうしたものはプロリンの反復モチーフを持ち、伸長したポリプロリン型構造を形成する。1995年Gudmundssonらによって、あるORFのC末端の39残基から抗微生物活性を有するペプチド（FALL-39と命名された）が形成されることが推定された。その1年後、実際にはFALL-39よりも2アミノ酸だけ短い、現在LL-37と呼ばれているペプチドが活性を有することが明らかにされた。カテリシジンファミリーは、シスタチンファミリーのシステインプロテアーゼインヒビターとアミノ酸配列の相同性を示す。しかしながら、プロテアーゼ阻害に重要であると考えられているアミノ酸残基は通常失われている。
Title: カテリシジン (Cathelicidin antimicrobial peptide)
Section: 特徴
Subsection: オルソログ

カテリシジンファミリーのペプチドは、ヒト、サル、マウス、ラット、ウサギ、モルモット、パンダ、ブタ、ウシ、カエル、ヒツジ、ヤギ、ニワトリ、ウマ、ワラビーで見つかっている。有袋類でのカテリシジン様ペプチドの発見には、ヒトLL37/hCAP-18に対する抗体が用いられた。これまでに哺乳類では約30種類のメンバーが記載されているが、ヒトで見つかっているのはLL-37のみである。現在同定されているカテリシジンには次のようなものがある。
Title: カテリシジン (Cathelicidin antimicrobial peptide)
Section: 臨床的意義

酒さの患者では、カテリシジンとカリクレイン5（SCTE）が増加している。カテリシジンはカリクレイン5とカリクレイン7の双方によってLL-37へと切断される。LL-37の過剰産生は酒さの全てのサブタイプにおいて、病因に寄与していると考えられている。テトラサイクリン系が他の抗菌剤よりも酒さに対する効果が高いのは、これらのセリンプロテアーゼに対する間接的な阻害作用のためである可能性がある。血漿中のカテリシジン濃度の低下は、下痢患者の感染症による死亡リスクを有意に高めるようである。カテリシジンの産生はビタミンDによってアップレギュレーションされる。SAAP-148（synthetic antimicrobial and antibiofilm peptide）は、抗微生物活性が高められた改変型LL-37である。SAAP-148は生理的条件下でより効率的な殺菌作用を示す。さらに、SAAP-148は薬剤耐性菌やそのバイオフィルムに対し、ハリシンと相乗的作用を示す。LL-37は（他の抗菌ペプチドとともに）乾癬の病因にも関係していると考えられている。乾癬においては、損傷したケラチノサイトから放出されたLL-37は自己の遺伝物質（DNAまたはRNA）と複合体を形成する。この複合体は樹状細胞（抗原提示細胞の一種）を刺激し、樹状細胞はIFN-α、βを放出してT細胞の分化と炎症の持続に寄与する。LL-37は乾癬における一般的な自己抗原として知られており、中等症から重症の患者の約2/3で血中にLL-37特異的T細胞がみられる。LL-37は、アルツハイマー病に関係するペプチドであるアミロイドβに結合する。LL-37とアミロイドβの間のバランスの異常は、アルツハイマー病と関係したフィブリルやプラークの形成に影響を及ぼしている因子の1つである可能性がある。口内での慢性的なポルフィロモナス・ジンジバリスPorphyromonas gingivalisの感染や、ヘルペスウイルス（HSV-1）の感染は、アルツハイマー型認知症の進行に寄与している可能性がある。
Title: カテリシジン (Cathelicidin antimicrobial peptide)
Section: 応用

抗菌ペプチドに関する研究、特にその作用機序に関する研究は20年近く行われている。抗菌ペプチドの臨床応用は関心を集め続けている一方で、いくつかの理由のため広く利用される状態とはなっていない。まず、ペプチドはプロテアーゼによって迅速に分解されるため、抗菌ペプチド由来の薬剤のバイオアベイラビリティは限定的なものとなる。次に、ペプチド型の薬剤は低分子よりも生産コストが高く、酵素による迅速な分解に対抗するために高用量で投与する必要があるため問題となる。また、こうした性質のため、一般的に注射、持続注入、徐放性製剤といった投与経路に限定される。
Title: CDC20 (CDC20)
Section: abstract

CDC20（cell division cycle 20）は、ヒトではCDC20遺伝子にコードされる、細胞分裂の調節に必須のタンパク質である。現在知られている最も重要な機能は後期促進複合体（APC/C）の活性化である。APC/Cは11個から13個のサブユニットからなる巨大な複合体であり、染色体分離と後期への移行を開始する。APC/CCdc20タンパク質複合体には主要な標的が2つ存在する。まず、APC/CCdc20はセキュリンを分解標的とし、最終的にコヒーシンの分解と姉妹染色分体の分離を可能にする。また、S/M期サイクリンも分解標的とし、S/M期サイクリン依存性キナーゼを不活性化して有糸分裂の終結を可能にする。CDC20と密接に関連したタンパク質であるCdh1は、細胞周期においてCDC20と相補的な役割を果たす。CDC20は細胞周期の複数の時点で他の多くのタンパク質と相互作用し、調節タンパク質しての作用を果たしているようである。後期以前の段階での核内での移動と染色体分離という2つの微小管依存的過程に必要とされる。
Title: CDC20 (CDC20)
Section: 発見

CDC20は、リーランド・ハートウェルらによる細胞周期の主要なイベントを完結することができない出芽酵母Saccharomyces cerevisiae変異体の作製を通じて、他のいくつかのCdcタンパク質と共に1970年代初頭に発見された。後期へ移行せず、そのため有糸分裂を完了できない変異体の解析からCDC20遺伝子が突き止められた。しかしながら、タンパク質の生化学的性質が明らかにされた後も、1995年にAPC/Cが発見されるまでCDC20の分子的役割は不明のままであった。
Title: CDC20 (CDC20)
Section: 構造

CDC20はヘテロ三量体型Gタンパク質のβサブユニットと関連している。C末端近傍には7つのWD40リピートが含まれている。WD40リピートは約40アミノ酸の短い構造モチーフ複数によって構成され、より大きなタンパク質複合体との結合に関与していることが多い。CDC20の場合、WD40リピートは7枚のブレードからなるβプロペラ型に配置されている。ヒトのCDC20タンパク質は約499アミノ酸長であり、N末端近傍には少なくとも4つのリン酸化部位が含まれている。これらのリン酸化部位は調節的役割を果たしているが、これらの間にはC-box、KEN-box、Mad2相互作用モチーフ、Cry boxなどが位置している。KEN-boxやCry boxはAPC/CCdh1複合体による認識と分解に重要な領域となっている。
Title: CDC20 (CDC20)
Section: 相互作用

CDC20は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。ANAPC7BUB1BCDC16CDC27サイクリンA1FBXO5HDAC1HDAC2MAD2L1一方で、CDC20にとって最も重要なのはAPC/Cとの相互作用である。APC/Cは巨大なE3ユビキチンリガーゼであり、特定のタンパク質に分解のための標識を付加することで、中期から後期への移行を開始する。APC/Cの2つの主要な標的はS/M期サイクリンとセキュリンであり、S/M期サイクリンはサイクリン依存性キナーゼ（CDK）を活性化する。CDKには有糸分裂の進行を導くために機能する多数の下流の標的が存在し、有糸分裂の終結にはこれらのサイクリンの分解が必要である。セキュリンはセパラーゼを阻害する。セパラーゼは姉妹染色分体を結び付けているコヒーシンを切断するタンパク質であり、後期が進行するためには、セパラーゼによるコヒーシンの切断が起こるよう、セキュリンを阻害することが必要となる。これらの過程は、APC/CとCDC20の双方に依存している。CDKがAPC/Cをリン酸化すると、CDC20が結合して活性化を行えるようになり、その結果CDKの不活性化とコヒーシンの切断が引き起こされる。CDC20はAPC/Cの基質に直接結合することが多く、APC/Cの活性はCDC20（やCdh1）に依存している。CDC20とCdh1は基質上に存在するKEN-boxやD-boxモチーフの受容体となっていると考えられている。一方で、通常はこれらの配列だけではユビキチン化と分解には不十分であり、CDC20がどのように基質を結合しているかに関しては未解明のことが多く残されている。
Title: CDC20 (CDC20)
Section: 調節

APC/CCdc20複合体は、細胞周期の適切な時期に存在するよう、自己調節を受けている。CDC20がAPC/Cに結合するためには、APC/Cの特定のサブユニットがCDK1（や他のCDK）によってリン酸化されていなければならない。そのため、有糸分裂中にCDK活性が高い場合や、後期への移行や有糸分裂の終結に備える必要がある場合に、APC/CCdc20複合体は活性化される。APC/CCdc20複合体は活性化されると、S/M期サイクリンを分解してCDKの不活性化を促進する。CDKの不活性化はAPC/Cのリン酸化速度の低下をもたらし、それによってCDC20の結合速度を低下させる。このようにして、APC/CCdc20複合体は有糸分裂の終結までに自身を不活性化する。CDKは、G1期にはCDK阻害タンパク質の発現やサイクリン遺伝子の発現のダウンレギュレーションなど、複数の異なる機構によって阻害されている。また、サイクリンの蓄積はCdh1によっても阻害される。
Title: CDC20 (CDC20)
Section: Cdh1

Cdh1は細胞周期の進行において、CDC20と相補的な役割を果たしている。APC/CCdc20が活性化されている間はCdh1はリン酸化されており、APC/Cに結合することができない。しかしながら、中期以降にS/M期サイクリン-CDK複合体がAPC/CCdc20によって不活性化されると、Cdh1は非リン酸化状態で存在し、APC/Cに結合することができるようになる。その結果、APC/Cは次のS期に再び必要となるまで、S/M期サイクリンを分解し続ける。一方でAPC/CCdh1はG1/S期サイクリンは認識しないため、G1/S期サイクリンの濃度はG1期に上昇してG1/S期CDKを活性化し、これがCdh1をリン酸化することでS/M期サイクリンに対する阻害は次第に緩和される。
Title: CDC20 (CDC20)
Section: 紡錘体チェックポイント

CDC20は紡錘体チェックポイント（SAC）の一部を構成し、またSACによる調節を受けている。SACは、全ての姉妹染色分体のセントロメアが中期板（metaphase plate）上に整列し、そして適切に微小管へ接着された場合にのみ、後期への移行が行われるよう保証する機構である。未接着のセントロメアが1つでも存在すると、このチェックポイントは活性化状態に維持され、全てのセントロメアが接着された場合にのみ後期が開始される。APC/CCdc20はSACの重要な標的の1つである。SACはMad2、Mad3（BubR1）、Bub3などいくつかのタンパク質から構成されるが、これら3つのタンパク質はCDC20とともにMCC（mitotic checkpoint complex）と呼ばれる複合体を形成し、後期の尚早な開始を防ぐよう、APC/CCdc20を阻害している。さらに、Bub1はCDC20をリン酸化して直接的に阻害し、また酵母のMad2とMad3はCDC20に結合した際にCDC20の自己ユビキチン化を開始させる。
Title: CDC20 (CDC20)
Section: がん

CDC20は多くの種類のがん組織で発現上昇している。乳がんではaggressivenessとの相関がみられ、高レベルの発現は予後不良と関係している。CDC20の過剰発現は肺がん、胃がん、膵臓がんでも報告されている。胃がんと膵臓がんに関しては、発現レベルの高さは腫瘍のサイズ、組織学的グレード、リンパ節への転移と相関している。大腸がんや非小細胞肺がんではがんのステージと関係しており、そのためこれらのがんの患者の予後を予測するためのバイオマーカーとしての利用が提唱されている。
Title: NFAT5 (NFAT5)
Section: abstract

NFAT5（nuclear factor of activated T-cells 5）またはTonEBP（tonicity-responsive enhancer binding protein）は、浸透圧ストレスに関与する遺伝子の発現を調節する転写因子であり、ヒトではNFAT5遺伝子にコードされる。NFAT5は転写因子のNFATファミリーのメンバーである。このファミリーに属するタンパク質は、免疫応答時の遺伝子の転写誘導に中心的役割を果たす。NFAT5は、哺乳類細胞で浸透圧ストレスによって誘導される遺伝子の発現を調節する。このタンパク質はホモ二量体として存在し、DNAエレメントと安定な複合体を形成する。NFAT5遺伝子には異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが存在する。
Title: NFAT5 (NFAT5)
Section: 浸透圧ストレス

腎臓、皮膚、そして目を構成する組織は、しばしば浸透圧ストレスにさらされる。細胞外環境が高浸透圧の場合、細胞は水分を喪失して収縮する。細胞はこれに対抗して水分の喪失を少なくするために、ナトリウムの取り込みを増加させる。しかしながら、細胞内のイオン濃度の増大は細胞にとって有害である。その代わりに、細胞は有機オスモライトの細胞内濃度を増加させる酵素やトランスポーターの合成によって対処を行うこともできる。有機オスモライトは過剰なイオンの蓄積よりも毒性が低く、同様に水分の保持を助けることができる。高浸透圧条件下では、NFAT5が合成されて核内に蓄積する。NFAT5は、アルドースレダクターゼ（AR）、塩化ナトリウム/ベタイン 共輸送体（SLC6A12）、ナトリウム/myo-イノシトール共輸送体（SLC5A3）、タウリントランスポーター（SLC6A6）、神経障害標的エステラーゼの遺伝子の転写を促進する。これらは、有機オスモライトの産生や取り込みに関与している。さらに、NFAT5は熱ショックタンパク質、Hsp70、浸透圧ストレスタンパク質を誘導する。NFAT5はサイトカインの産生への関与も示唆されている。腎細胞や免疫細胞でNFAT5が阻害されると、これらの細胞の浸透圧トスレスに対する感受性が大きく高まることが示されている。NFAT5を欠くマウスでは、腎髄質で大規模な細胞喪失がみられる。さらに、目でドミナントネガティブ型のNFAT5を発現しているマウスは細胞外が高浸透圧の環境下での生存が低下する。
Title: NFAT5 (NFAT5)
Section: 構造

NFATファミリーは、NFATc1、NFATc2、NFATc3、NFATc4、NFAT5の5つのメンバーからなる。このファミリーのタンパク質は体中のほぼすべての組織で発現しており、サイトカイン発現の転写調節因子として知られる。その中でも、NFAT5は高浸透圧ストレス応答系の重要な構成要素である。NFAT5のcDNAは、ヒト脳cDNAライブラリから初めて単離された。その後の解析により、NFAT5はRelファミリーのメンバーであることが明らかにされた。このファミリーには、NF-κBやNFATタンパク質が含まれる。他のRelタンパク質と同様、NFAT5には保存されたDNA結合ドメインであるRel相同ドメイン（RHD）を持つ。RHDを除くと、NFAT5とNF-κBや他のNFATタンパク質との類似性は見られない。他の差異としてはカルシニューリンのドッキング部位が存在しないことが挙げられ、この部位は他のNFATタンパク質の核内輸送に必要である。その代わりにNFAT5は常に核内に存在し、その活性と局在はカルシニューリンを介した脱リン酸化には依存していない。
Title: NFAT5 (NFAT5)
Section: 活性化機構

細胞が浸透圧ストレスを検知する正確な機構は不明であるが、浸透圧ストレスによって、細胞膜付近に局在するグアニンヌクレオチド交換因子（GEF）であるBrxが細胞骨格構造の変化を介して活性化されることが示唆されている。また、Brxは細胞膜に位置する浸透圧センサー分子との相互作用の変化によって活性化されている可能性もある。Brxの活性化に伴って、BrxのGEFドメインはRhoファミリーGタンパク質を不活性なGDP結合型から活性型であるGTP結合型へ変換する。さらに、活性化されたBrxはp38 MAPK特異的足場タンパク質であるJIP4をリクルートして物理的に相互作用する。JIP4は下流のキナーゼであるMKK3とMKK6に結合する。その後、この複合体はp38 MAPKを活性化する。p38 MAPKの活性化はCDC42とRAC1によって調節される。p38 MAPKの活性化はNFAT5の発現に必要な段階である。高浸透圧後のNFAT5の発現は、p38 MAPKに依存している。p38 MAPKの阻害剤の添加は、浸透圧ストレスシグナルが存在しない場合でも、NFAT5の発現の低下と相関している。p38 MAPKのリン酸化による活性化はc-Fosとインターフェロン制御因子（IRF）を活性化すると考えられており、これらはそれぞれAP-1結合部位とISRES（interferon stimulated response element）に結合する。これらの部位への結合によって、標的遺伝子の転写が活性化される。
Title: NFAT5 (NFAT5)
Section: その他の役割

NFAT5は細胞増殖にも関与している。NFAT5のｍRNAの発現は増殖中の細胞で特に高い。胎児線維芽細胞でのNFAT5の阻害は、細胞周期の停止を引き起こす。
Title: グルクロン酸転移酵素 (UDP glucuronosyltransferase 1 family, polypeptide A1)
Section: abstract

グルクロン酸転移酵素(または、グルクロノシルトランスフェラーゼ、英: Glucuronosyl transferase)は、肝臓においてグルクロン酸抱合を行う酵素。基質の１つであるUDP-グルクロン酸からグルクロノシル基(グルクロン酸)をもう一つの基質へと転移する化学反応を触媒する。名称グルクロン酸転移酵素グルクロノシルトランスフェラーゼグルクロノシル基転移酵素グルクロニルトランスフェラーゼ (英: Glucuronyl transferase)グルクロニドトランスフェラーゼ（英: Glucuronide transferase）UDP-～ウリジン二リン酸～略称UGTUDPGTUGATUDPGUTF
Title: グルクロン酸転移酵素 (UDP glucuronosyltransferase 1 family, polypeptide A1)
Section: 関連疾患

クリグラー・ナジャール症候群ジルベール症候群
Title: グルクロン酸転移酵素 (UDP glucuronosyltransferase 1 family, polypeptide A1)
Section: ヒト遺伝子

en:B3GAT1, en:B3GAT2, en:B3GAT3en:UGT1A1, en:UGT1A3, en:UGT1A4, en:UGT1A5, en:UGT1A6, en:UGT1A7, en:UGT1A8, en:UGT1A9, en:UGT1A10en:UGT2A1, en:UGT2A2, en:UGT2A3, en:UGT2B4, en:UGT2B7, en:UGT2B10, en:UGT2B11, en:UGT2B15, en:UGT2B17, en:UGT2B28
Title: APOBEC3G (APOBEC3G)
Section: abstract

APOBEC3G（apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3G）は、ヒトのAPOBEC3G遺伝子によってコードされる酵素であり、APOBECファミリータンパク質の一種である。APOBECファミリータンパク質は抗ウイルス自然免疫において重要な役割を果たすことが示唆されている。APOBEC3Gはシチジンデアミナーゼの一種であり、一本鎖DNAに作用してシチジンをウリジンに変換（脱アミノ化）する反応を触媒する。APOBEC3GのC末端ドメインが触媒活性を付与しており、いくつかのNMR構造やX線結晶構造によって基質特異性や触媒活性が明らかにされている。   APOBEC3Gはウイルス複製を阻害することによりレトロウイルス（特にHIV）に対して抗ウイルス自然免疫活性を示す。しかし、HIVなどのレンチウイルスはこの作用に対抗するためにVif（viral infectivity factor）と呼ばれるタンパク質を進化させている。VifはAPOBEC3Gと相互作用し、プロテアソーム経路によるAPOBEC3Gのユビキチン化と分解を引き起こす。一方、フォーミーウイルスはアクセサリータンパク質Bet（P89873）を産生し、APOBEC3Gの細胞質における可溶性の喪失を引き起こす。BetとVifは異なる分子機序であるが、APOBEC3Gを抑制するという点は同じである。そのため、フォーミーウイルスのBet遺伝子をVif遺伝子に置き換えたウイルスを作成すると、Betの代わりにVifが働いてAPOBEC3Gを抑制し、組み換えウイルスは感染複製能を維持する。
Title: APOBEC3G (APOBEC3G)
Section: 発見

APOBEC3Gは2002年にJarmuzらによって、22番染色体上のタンパク質APOBEC3Aから3Gまでからなるファミリーの一員として初めて発見された。その後ウイルスアクセサリータンパク質Vifを欠くHIV-1の複製を制限することができる細胞性因子であると分かった。そしてその後すぐに、APOBEC3GはシチジンデアミナーゼAPOBEC1との相同性が認められたため、同じAPOBECファミリータンパク質の一員であることが明らかとなった。
Title: APOBEC3G (APOBEC3G)
Section: 構造

APOBEC3Gは対称構造を持っており、2つの相同な触媒ドメイン、N末端ドメイン（CD1）とC末端ドメイン（CD2）からなる。CD1、CD2のそれぞれに亜鉛イオンの配位部位が含まれている。また各ドメインは、シチジンデアミナーゼの典型的なHis/Cys-X-Glu-X23–28-Pro-Cys-X2-Cysモチーフを有している。しかし、典型的なシチジンデアミナーゼとは異なり、APOBEC3Gは触媒内の2つのβシートの間に固有のαヘリックスを有している。このαヘリックスが補酵素結合部位となる可能性がある。CD2は触媒活性を持ち、脱アミノ化と基質結合部位（モチーフ）の構造的特異性に不可欠である。CD1は触媒的に不活性であるが、DNAおよびRNAへの結合にとって非常に重要であり、APOBEC3G脱アミノ化の3'→5'方向のプロセシビティを決定している。また、CD2はCD1が存在しない場合にはデアミナーゼ活性を持たない。生体内のAPOBEC3Gは、単量体、二量体、三量体、四量体、および高次のオリゴマーで構成されている。APOBEC3Gは二量体として機能すると考えられているが、実際には単量体とオリゴマーの混合物として機能している可能性がある。CD1に位置するD128残基はAPOBEC3GとVifとの相互作用に特に重要であるようであり、この残基がリジンに変異 (D128K) したAPOBEC3GはVifによる除去を防ぐ。さらに、128–130番残基は負に帯電したモチーフを形成し、Vifとの相互作用およびAPOBEC3G-Vif複合体の形成に重要である。また124–127番残基は、APOBEC3GのHIV-1ビリオン内への取り込みおよびその結果として生じる抗レトロウイルス活性にとって重要である。
Title: APOBEC3G (APOBEC3G)
Section: 作用機序

APOBEC3Gは広く研究されており、HIV-1複製に悪影響を及ぼすいくつかのメカニズムが同定されている。
Title: APOBEC3G (APOBEC3G)
Section: 作用機序
Subsection: シチジンの脱アミノ化と超変異

APOBEC3Gおよび同じファミリーの他のタンパク質は、活性化誘導（シチジン）デアミナーゼ（AID）として機能することができる。APOBEC3Gは、主に相補的DNA（cDNA）として発現したHIVのマイナス鎖DNAに対し、デオキシシチジンからデオキシウリジンへの変異を3'→5'方向のプロセシビティをもって無数に導入することで逆転写に干渉する。APOBEC3GはAPOBECスーパーファミリーに属しており、AIDとして機能するため、APOBEC3Gを介したシチジン脱アミノ化のメカニズムは、大腸菌のシチジンデアミナーゼのメカニズムと類似している可能性が高い。大腸菌のシチジンデアミナーゼはヌクレオチドと亜鉛結合領域周辺でAPOBEC1やAIDと高い相同性を持つことが知られている。現在予測されている脱アミノ化反応の機序は、亜鉛が配位した酵素によるシチジンピリミジン環の4位への直接的な求核攻撃によって駆動される。水は、水素原子とヒドロキシル基供与体の双方の供給源として必要である。4位の脱アミノ化（および結果として生じる酸化）によりカルボニル基が生成され、シチジンからウリジンへの変化が起こる。脱アミノ化活性は最終的に、プロウイルスDNAの「ホットスポット」でG→Aの超変異をもたらす。このような超変異は、最終的にウイルスの遺伝コードおよび複製能力を破壊し、結果として多くの生存不可能なビリオンが形成される。APOBEC3Gは、その活性部位が変異してもはやレトロウイルスDNAを変異誘導できなくなった場合には、抗ウイルス効果は激減する。APOBEC3Gが介在する脱アミノ化は、変異した残基に引き付けられたDNA修復系によって、間接的にウイルスDNAの分解をもたらすと当初は考えられていた。しかし、ヒトAPOBEC3Gは、DNA修復酵素UNGおよびSMUG1とは独立してウイルスのcDNAレベルを低下させるため、この考えは誤りであると見なされるようになった。
Title: APOBEC3G (APOBEC3G)
Section: 作用機序
Subsection: 逆転写への干渉

APOBEC3GはDNA脱アミノ化とは無関係にHIV-1の逆転写を阻害する。tRNA3Lysは通常、HIV-1のプライマー結合部位に結合して逆転写を開始する。APOBEC3GはtRNA3Lysのプライミングを阻害し、それによってウイルスのssDNA産生およびウイルス感染を妨げることができる。逆転写は、APOBEC3GがウイルスRNAに結合し、立体的変化を引き起こすことによっても悪影響を受けると予測されている。
Title: APOBEC3G (APOBEC3G)
Section: 作用機序
Subsection: ウイルスDNAの組み込みへの干渉

APOBEC3Gは、機能的な触媒領域とデアミナーゼ活性に依存する形で、ウイルスDNAの宿主ゲノムへの組み込みの干渉と関連していた。Mbisaらは、APOBEC3GがDNAマイナス鎖からのプライマーtRNAのプロセシングと除去に干渉し、その結果として異常なウイルスの3' LTR（long terminal repeat）DNA末端が形成されることを発見した。これらのウイルスDNA末端は、組み込みやプラス鎖DNA転移をするのには非効率的な基質である。その結果、HIV-1プロウイルスの形成が阻害される。
Title: APOBEC3G (APOBEC3G)
Section: 生物学的機能

APOBEC3G mRNAが発現している細胞はnon-permissive（非感染許容性）であり、HIV-1はVifの機能なしには正常に感染複製できない。APOBEC3Gを発現する非感染許容性細胞としては生理的環境下における初代CD4陽性T細胞とマクロファージが挙げられる。APOBEC3GのHIV-1ビリオンへの取り込みはAPOBEC3Gの拡散と抗ウイルス作用の発揮のために極めて重要である。APOBEC3Gのウイルスビリオン内への取り込みの機序としては、1. APOBEC3Gの非特異的な詰め込み、2. APOBEC3Gと宿主RNAとの相互作用、3. APOBEC3GとウイルスRNAとの相互作用、4. APOBEC3GとHIV-1 Gagタンパク質との相互作用などが考えられるが、実験的に強く支持されるのは後者2つである。ウイルスビリオンへのAPOBEC3Gの取り込み量は、ビリオンを産生している細胞内でのAPOBEC3G発現レベルに依存する。ある末梢血単核球を用いた研究においては、Vif非存在下におけるAPOBEC3G取り込み量はウイルスビリオン1個当たり平均7±4分子であり、それはHIV複製を阻止しうる量であった。APOBEC3Gの役割は外因性レトロウイルスの複製阻害にとどまらず、ヒト内在性レトロウイルスにも作用しており、内在性レトロウイルスのDNA配列には超変異の痕跡が残されている。
Title: APOBEC3G (APOBEC3G)
Section: 疾患との関連性

APOBEC3G は非感染許容性細胞におけるHIV-1複製と感染性の重要な阻害因子であるが、VifはAPOBEC3Gの抗ウイルス機能に対抗し、APOBEC3Gが発現している細胞においても感染性HIV-1粒子の形成を可能にしている。VifはHIV-1の他のあらゆるタンパク質から独立して機能し、単独でAPOBEC3GのHIV-1粒子内取り込みを防いでいる。APOBEC3Gは一般にHIV-1に対する抗ウイルス因子として研究されているが、最近の研究ではAPOBEC3Gが誘導する変異がHIV-1の感染伝播の成立を助けている可能性が見いだされている。まず、APOBEC3Gの標的DNA領域において脱アミノ化される塩基数は1塩基から多数の塩基まで様々であるが、APOBEC3Gに曝露される時間に依存している可能性がある。さらに、細胞内のAPOBEC3Gの濃度とウイルス超変異の程度との相関が報告されている。APOBEC3Gにより変異導入されたHIV-1プロウイルスの中には、ホットスポットおける変異数が少ないために感染性を失わずに生き残るものもあり、またAPOBEC3Gにより致命的変異を受けたプロウイルスと感染性のプロウイルスとの間の組換えが生じることにより生き残るものもある。そのようなウイルスの不活化に至らない程度の変異は逆にHIV-1集団の遺伝的多様性に貢献することになるため、APOBEC3Gが実はHIV-1の環境適応と感染伝播を促進している可能性がある。
Title: プロテインS (Protein S)
Section: abstract

プロテインS（Protein S; PROS）は、肝臓で合成されるビタミンK依存性の血漿糖蛋白質である。循環系では、プロテインSは“遊離型”と補体蛋白質であるC4b結合蛋白質（C4BP）と結合した“複合型”の2つの形態で存在する。ヒトでは、プロテインSはPROS1遺伝子によってコードされている。プロテインSは血液凝固に関与している。
Title: プロテインS (Protein S)
Section: 構造

大きさは77kDa、長さは635アミノ酸である。PROS1 遺伝子は第3染色体（3q11.1）に位置している。プロテインSは、プロテインCや第VII、IX、X因子などの他のビタミンK依存性血漿凝固蛋白質と部分的に相同である。これらと同様にGlaドメイン1つとEGF様ドメイン（2つでなく4つ）を持つが、セリンプロテアーゼドメインは持たない。その代わり、性ホルモン結合グロブリンやコルチコステロイド結合グロブリンなどの血漿ステロイドホルモン結合蛋白質と相同な大きなC末端ドメインが存在する。このドメインは、活性化プロテインC（APC）の補因子として、あるいはC4BPとの結合において、蛋白質の機能に寄与している可能性がある。さらに、プロテインSはGlaドメインとEGF様ドメインの間にトロンビンにより切断されるペプチドを有する。GlaドメインとEGF様ドメインは切断後もジスルフィド結合によって結合したままであるが、プロテインSはこのペプチドの切断かC4BPとの結合のいずれかの後に、APC補因子としての機能を失う。
Title: プロテインS (Protein S)
Section: 機能

プロテインSの最も特徴的な機能は、抗凝固経路における役割であり、そこではプロテインCの補因子として第Va因子と第VIIIa因子の不活性化に関与する。遊離型のみが補酵素活性を持つ。プロテインSはカルボキシル化されたGlaドメインを介して負電荷を帯びたリン脂質に結合する。この性質により、プロテインSはアポトーシスを起こしている細胞の除去を促進する。健康な細胞では、ATP（アデノシン三リン酸）依存性酵素が細胞膜の外葉（外部表面）からホスファチジルセリンのようなマイナスに帯電したリン脂質を除去している。一方で、アポトーシスを起こしている細胞では、外葉のリン脂質の分布が維持できなくなり、細胞表面に負に帯電したリン脂質が出現し始める。これらの負に帯電したリン脂質は、マクロファージなどの食細胞に認識される。プロテインSは負に帯電したリン脂質に結合し、アポトーシス細胞と食細胞の橋渡し役として機能する。この橋渡しによって貪食が促進され、炎症等の組織損傷の徴候を示すことなく細胞を除去できる。プロテインSは発生期の補体複合体C5,6,7に結合しない。補体に作用する「S-protein」は、VTN 遺伝子によって作られる別の蛋白質（ビトロネクチン）である。
Title: プロテインS (Protein S)
Section: 発見

プロテインSは1977年に発見され、精製された場所であるワシントン州シアトルにちなんで命名された。
Title: プロテインS (Protein S)
Section: 臨床的意義

PROS1遺伝子に変異があると、血栓症のリスクを高める稀な血液疾患であるプロテインS欠乏症になる可能性がある。
Title: プロテインS (Protein S)
Section: 相互作用

プロテインSは第V因子と相互作用することが知られている。
Title: ブラキウリ (T-box transcription factor T)
Section: abstract

ブラキウリ (英: Brachyury) はヒトではT 遺伝子にコードされたタンパク質である。ブラキウリはTボックスファミリーに属する転写因子である。これまで調べられたすべての左右相称動物で見つかっており、刺胞動物にも存在している。