shintaro-ozaki/entity-explanation huggingface dataset:
Title: KHDRBS1 (KHDRBS1)
Section: 臨床的意義
Subsection: がん

Sam68は多数のがん関連遺伝子の選択的スプライシングを調節する。Sam68が選択的スプライシングに関与しているという直接的証拠は、CD44のエクソンv5の組み込みを促進することから得られた。エクソンv5の組み込みは、細胞遊走能と相関している。CD44は細胞表面タンパク質で、その発現は多数の腫瘍のタイプにおいて予後の予測に利用されている。前立腺がんでは、Sam68はスプライシング複合体タンパク質KHDRBS3（T-STAR）、メタドヘリン（MTDH）とも相互作用し、これらもCD44のスプライシングを変化させる。後に、Sam68のノックダウンによってLNCaP前立腺がん細胞の増殖が遅れることが示された。さらに、Sam68はhnRNP A1とともにBcl-xの選択的5'スプライス部位の選択に影響を与え、生存促進経路とアポトーシス経路を調節する。Sam68のRNA結合活性は翻訳後修飾によって調節されている。成長因子やSrcファミリーキナーゼなどの可溶性チロシンキナーゼからのシグナルを受けて選択的スプライシングなどの細胞内RNA過程を調節する作用を示すため、STAR（Signal Transduction Activator of RNA）タンパク質と呼ばれることも多い。例えば、CD44のSam68依存的なエクソンv5の選択的スプライシングはERKによるSam68のリン酸化によって調節され、Bcl-xの選択的スプライシングはp59-FYN依存的なリン酸化によって調節される。また、Sam68は上皮成長因子受容体（EGFR）、肝細胞増殖因子（HGF）/Met受容体（c-Met）、レプチン、腫瘍壊死因子（TNF）受容体の下流因子である。これらの過程におけるSam68の役割は少しずつ明らかになりつつあるが、大部分は未解明である。Sam68は細胞質の細胞膜近傍に再局在することも示されており、そこでは特定のmRNAを輸送して翻訳を調節し、細胞遊走を調節する。がんにおけるSam68の多様な役割についてはBielliらによる総説にまとめられている。
Title: KHDRBS1 (KHDRBS1)
Section: 遺伝子ノックアウト研究

Sam68欠損マウスは、sam68遺伝子のKHドメインの機能的領域をコードするエクソン4–5を破壊することによって作製された。ヘテロ接合型マウスの交配による仔の遺伝子型は、E18.5の時点ではメンデル型の分離パターンを示す。目に見える奇形は存在しないにもかかわらず、 Sam68-/-マウスの多くは不明な原因によって出生時に死亡する。Sam68+/-マウスの表現型は正常であり、周産期を生存したSam68-/-マウスも変わらず老齢まで生存する。Sam68-/-マウスは同時に生まれたSam68+/+マウスよりも体重が軽く、若いSam68-/-マウスは肥満度が大きく低下していることがMRIによって確認されているが、両者の摂食行動は同程度である。さらに、Sam68-/-マウスは食餌誘発性肥満から保護される。Sam68欠損脂肪前駆細胞（3T3-L1細胞）ではアディポジェネシスが損なわれ、Sam68-/-マウスの白色脂肪組織の間質血管細胞群（SVF）中の成体幹細胞（ADSC）は45%減少していた。
Title: KHDRBS1 (KHDRBS1)
Section: 遺伝子ノックアウト研究
Subsection: In vivoでの腫瘍形成

Sam68-/-マウスでは腫瘍形成はみられず、免疫疾患や他の主要な疾患もみられない。しかし、Sam68-/-マウスは雄性不妊とメスの低受胎のために繁殖が困難である。Sam68欠損マウスは協調運動障害がみられ、野生型と比較してより低速でより早く回転ドラムから脱落する。Sam68-/-マウスは加齢による骨粗鬆症から保護される。マウス乳癌ウイルス-ポリオーマミドルT抗原（MMTV-PyMT）による乳房腫瘍形成マウスモデルにおいては、Sam68の発現の低下によって腫瘍量が減少し転移が低下することが示されている。カプラン・マイヤー生存曲線からは、1つのsam68アレルの喪失（PyMT; Sam68+/-）が触知腫瘤の発生の有意な遅れや腫瘍の多発性（multiplicity）の有意な減少と関係していることが示されている。これらの発見は、Sam68がPyMT誘導性の乳房腫瘍形成に必要であることを示唆している。胸腺欠損マウスにおいて、PyMT形質転換乳房細胞でのSam68の発現のノックダウンは肺腫瘍の病巣数を減少させることから、Sam68が乳房腫瘍の転移にも必要であることが示唆されている。
Title: シグナル伝達兼転写活性化因子5B (STAT5B)
Section: abstract

シグナル伝達兼転写活性化因子5B（signal transducer and activator of transcription 5B、STAT5B）は、ヒトではSTAT5B遺伝子によってコードされるタンパク質である。STAT5Bのオルソログは、全ゲノムデータが利用可能な有胎盤類の生物種の大部分で同定されている。
Title: シグナル伝達兼転写活性化因子5B (STAT5B)
Section: 機能

STAT5B遺伝子にコードされるSTAT5Bタンパク質は、STATファミリーの転写因子である。STATファミリーのメンバーは、サイトカインや成長因子に応答して受容体関連キナーゼによってリン酸化され、その後ホモ二量体化またはヘテロ二量体化して細胞核へ移行し、そこで転写アクチベーターとして作用する。このタンパク質はIL-2、IL-4、CSF1や成長ホルモンなど、さまざまなリガンドによって開始されるシグナル伝達を媒介する。TCRシグナル伝達、アポトーシス、成体の乳腺の発達、肝臓での遺伝子発現の性的二型など、多様な生物学的過程に関与していることが示されている。急性前骨髄球性白血病の一部では、この遺伝子はレチノイン酸受容体α遺伝子（RARA）と融合していることが知られている。このタンパク質によって媒介されるシグナル伝達経路の調節異常が急性前骨髄球性白血病の原因である可能性がある。
Title: シグナル伝達兼転写活性化因子5B (STAT5B)
Section: 相互作用

STAT5Bは次に挙げる因子と相互作用することが示されている。グルココルチコイド受容体ヤヌスキナーゼ1ヤヌスキナーゼ2PTPN11
Title: 血管拡張因子刺激リン酸化タンパク質 (Vasodilator-stimulated phosphoprotein)
Section: abstract

血管拡張因子刺激リン酸化タンパク質（Vasodilator-stimulated phosphoprotein）とは、ヒトのVASP遺伝子にコードされているタンパク質である。
Title: 血管拡張因子刺激リン酸化タンパク質 (Vasodilator-stimulated phosphoprotein)
Section: 機能

血管拡張因子刺激リン酸化タンパク質(VASP)はEna-VASPタンパク質ファミリーのメンバーの一つである。Ena-VASPファミリーのメンバーはN末端にEVH1ドメインを有し、このドメインはE/DFPPPPD/Eモチーフを有するタンパク質に結合し、Ena-VASPタンパク質が焦点接着細胞膜を標的とするように仕向ける。中間領域には、SH3およびWWドメイン含有タンパク質に結合するプロリンリッチ領域を持つ。C末端のEVH2ドメインは四量体化を媒介し、GアクチンおよびFアクチンの両方に結合する。VASPは糸状アクチン形成に関連し、細胞接着や運動性において広範な役割を果たすと思われている。また、インテグリンと細胞外マトリックスとの相互作用を調節する細胞内シグナル伝達経路に関与している可能性がある。VASPは、環状ヌクレオチド依存性キナーゼのPKAおよびPKGによって調節される。
Title: 血管拡張因子刺激リン酸化タンパク質 (Vasodilator-stimulated phosphoprotein)
Section: 相互作用

血管拡張因子刺激リン酸化タンパク質はZyxin、プロフィリン1、 PFN2と相互作用することが確認されている。
Title: アグマチナーゼ (Agmatinase)
Section: abstract

アグマチナーゼ(Agmatinase, EC 3.5.3.11)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。アグマチン + 水                     ⇌              {\displaystyle \rightleftharpoons }   プトレシン + 尿素従って、この酵素の基質はアグマチンと水の2つ、生成物はアグマチンと尿素の2つである。この酵素は、特にペプチド結合以外の炭素-窒素結合、特に鎖状アミジンに作用する加水分解酵素に分類される。系統名は、アグマチン アミジノヒドロラーゼ(Agmatine amidinohydrolase)である。アグマチンウレオヒドロラーゼ(agmatine ureohydrolase)やSpeBと呼ばれることもある。尿素回路の一部を構成している。
Title: アグマチナーゼ (Agmatinase)
Section: 遺伝子

ヒトでは、この酵素はAGMAT遺伝子でコードされている。
Title: アグマチナーゼ (Agmatinase)
Section: 構造

2007年5月時点で、5つの三次構造が解明されている。蛋白質構造データバンクのアクセッションコードは、1GQ6、1GQ7、1WOG、1WOH及び1WOIである。
Title: アグマチナーゼ (Agmatinase)
Section: 阻害剤

ピペラジン-1-カルボキシアミジン
Title: 核内受容体コアクチベーター4 (NCOA4)
Section: abstract

核内受容体コアクチベーター4（NCOA4: nuclear receptor coactivator 4）は、ヒトのNCOA4遺伝子によってコードされるタンパク質である。フェリチノファジーにおいて重要な役割を果たし、カーゴ受容体として作用し、フェリチン重鎖に結合し、オートファゴソームの表面のATG8に係留される。
Title: 核内受容体コアクチベーター4 (NCOA4)
Section: 相互作用分子

NCOA4は以下の生体分子と相互作用する。アンドロゲン受容体ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体ガンマフェリチンATG8（オートファジー関連タンパク質8）
Title: CAMKK2 (CAMKK2)
Section: abstract

CAMKK2（Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2）は、ヒトではCAMKK2遺伝子によってコードされる酵素である。
Title: CAMKK2 (CAMKK2)
Section: 機能

CAMKK2遺伝子の産物であるCAMKK2はセリン/スレオニンキナーゼファミリー、Ca2+/カルモジュリン依存性プロテインキナーゼ（CAMK）サブファミリーに属する。このタンパク質はCa2+/カルモジュリン依存性キナーゼカスケードに関与し、下流のキナーゼであるCAMK1とCAMK4をリン酸化することで、これらのキナーゼの総活性の増大をもたらす。CAMK1とCAMK4はThr177、Thr196がそれぞれリン酸化される。CAMKK2は、視床下部において食欲刺激ホルモンであるニューロペプチドY（NPY）の産生を調節し、AMPKに対するキナーゼとして機能する。また、下流のシグナル伝達経路やμオピオイド受容体のダウンレギュレーションによって、痛覚過敏の発生やオピオイド系鎮痛剤に対する耐性の獲得に重要な役割を果たす。マウスでは、Camkk2の阻害は食欲を低下させ、体重の減少を促進する。CAMKK2は脳で多くの重要な機能を担っている。海馬ではCAMKK2/CAMK1カスケードは記憶の形成に必要であり、学習によって誘導される神経細胞の細胞骨格の構造的変化を調節する。海馬の樹状突起スパインの形態変化は記憶形成の主要な構造的基盤であり、CA1錐体神経細胞のシナプス可塑性の開始と維持に必要である。小脳に関しては、CAMKK2/CAMK4/CREBシグナル伝達カスケードは出生後の小脳の発達過程と関係している。CAMKK2の欠失によって小脳に最も豊富に存在する細胞である小脳顆粒細胞の発生が損なわれるが、それは顆粒細胞前駆細胞が外顆粒層での増殖を停止して内顆粒層へ移動する能力が阻害されるためである。この表現型は、BDNFの発現低下とCREBのリン酸化の低下とも結びつけられている。CAMKK2/CAMK4/CREBカスケードは、出生後の小脳における小脳顆粒細胞の発生段階を完結するためのBDNFの産生に必要である。視床下部においては、CAMKK2はAMPKα/βとCa2+/カルモジュリンとシグナル伝達複合体を形成し、中枢を介したエネルギー恒常性の維持に関与している。CAMKK2遺伝子の除去は視床下部でのAMPK活性を低下させ、NPYニューロンでのNPYとアグーチ関連ペプチド（AgRP）の遺伝子発現をダウンレギュレーションし、マウスを食餌誘発性の肥満、高血糖症、インスリン抵抗性から保護することが示されている。さらに、CAMKK2は視床下部内側野における交感神経活動の最適化に必要な遺伝子の調節に関与しており、そのため交感神経の緊張と負の関係にあるとされる骨量とも関係している。
Title: CAMKK2 (CAMKK2)
Section: アイソフォーム

この遺伝子には6種類の異なるアイソフォームをコードする7種類の転写産物が同定されている。他のスプライスバリアントも記載されているが、その全長の性質は明らかにされていない。同定されたアイソフォームは自己リン酸化や下流のキナーゼのリン酸化の活性が異なる。
Title: Β-ディフェンシン2 (Beta-defensin 2)
Section: abstract

β-ディフェンシン2（beta defensin 2、BD-2、特にヒトのものはhBD-2）またはSAP1（skin antimicrobial peptide 1）は、ヒトではDEFB4A、DEFB4B遺伝子によってコードされているペプチドである。hBD-2はシステインに富むカチオン性低分子量抗菌ペプチドであり、病変部位の皮膚にみられる。
Title: Β-ディフェンシン2 (Beta-defensin 2)
Section: 構造

hBD-2は、64アミノ酸からなる一次構造を有するタンパク質である。2.4 mM以下の濃度では、hBD-2は単量体である。正電荷が不均等に表面に分布した両親媒性構造を有し、3本のストランドからなるβシートなど、いくつかの重要な構造エレメントが存在する。βシートのストランド2と3はβヘアピン型構造をとる。他の構造エレメントは構造決定の手法に依存しており、X線結晶構造解析ではタンパク質のN末端にαヘリックスが観察されているが（PDB: 1fd3​, 1fd4​, 6cs9​）、NMRではこのヘリックスは観察されていない（PDB: 1e4q​）。しかしながら、このNMR構造では最初の4アミノ酸を欠いたタンパク質を用いて構造決定が行われているため、このことが構造の差異の理由となっている可能性もある。
Title: Β-ディフェンシン2 (Beta-defensin 2)
Section: 機能

ディフェンシンは、好中球などで産生される抗微生物・細胞傷害性ペプチドのファミリーである。ディフェンシンファミリーのメンバーのアミノ酸配列は高度に類似している。hBD-2は炎症によって局所調節されている抗菌ペプチドである。hBD-2はいくつかの上皮細胞によって産生され、グラム陰性菌やカンジダに対して強力な微生物活性を示すが、グラム陽性菌である黄色ブドウ球菌Staphylococcus aureusに対する活性は弱い。hBD-2は、緑膿菌Pseudomonas aeruginosaなどの微生物との接触や、TNF-α、IL-1βなどのサイトカインによる上皮細胞の刺激後に産生されるディフェンシンである。hBD-2は炎症皮膚病変と関連したケラチノサイトによって局所的に発現している。hBD-2は、皮膚や気道において表面を感染から保護する役割を担う、局所的上皮防御システムの動的構成要素であり、皮膚や肺組織におけるグラム陰性菌感染の頻度の低さに寄与している可能性がある。このタンパク質の黄色ブドウ球菌に対する抗菌活性は低いが、表皮ブドウ球菌Staphylococcus epidermidisの一部の株から分離されるタンパク質と相乗的に作用して殺菌作用を示すことが報告されている。
Title: メチルクロトニルCoAカルボキシラーゼ (Methylcrotonyl-CoA carboxylase)
Section: abstract

メチルクロトニルCoAカルボキシラーゼ(Methylcrotonyl-CoA carboxylase、MCC)は、ミトコンドリアに存在するビオチン要求性の酵素である。MCCは、炭酸水素塩を用いてロイシン生合成の第4段階でのカルボキシル基の隣接炭素原子のカルボキシル化を触媒する。
Title: メチルクロトニルCoAカルボキシラーゼ (Methylcrotonyl-CoA carboxylase)
Section: 機能

分枝鎖アミノ酸の分解の際、MCCはロイシンをアセチルCoAとアセト酢酸にまで分解する反応の一段階に関わる。MCCは、3-メチルクロトニルCoAの3-メチルグルタコニルCoAへのカルボキシル化の作用を触媒する。3-メチルグルタコニルCoAはその後水和され、3-ヒドロキシ-3-メチルグルタリルCoAとなり、アセト酢酸とアセチルCoAの2分子に分解される。MCCをコードする遺伝子の部位突然変異または欠失突然変異は、代謝の先天異常であるMCC欠損症を引き起こし、嘔吐、代謝アシドーシス、血漿中グルコース濃度の低下、血漿中カルニチン濃度の低下等の症状を伴う。
Title: メチルクロトニルCoAカルボキシラーゼ (Methylcrotonyl-CoA carboxylase)
Section: 機構

ATPの付加により炭酸水素塩が活性化し、反応性が高まる。炭酸水素塩が活性化すると、MCCのビオチン結合部位が求核剤として働き、酵素の結合したカルボキシビオチンを形成する。MCCのカルボキシビオチン結合部位は続いてさらに求核剤として基質にカルボキシル基を移し、3-メチルクロトニルCoAを3-メチルグルタコニルCoAに変換する。
Title: メチルクロトニルCoAカルボキシラーゼ (Methylcrotonyl-CoA carboxylase)
Section: 制御

MCCは小分子、食物、ホルモン因子等による制御を受けない。
Title: Γ-グルタミルヒドロラーゼ (Gamma-glutamyl hydrolase)
Section: abstract

γ-グルタミルヒドロラーゼ(Gamma-glutamyl hydrolase)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。γ-グルタミル結合を加水分解する。リソソーム型または分泌型のチオール依存性ペプチダーゼであり、酸性で最も活性が高い。ヒトでは、GGH遺伝子でコードされ、γ-結合ポリグルタミン酸やグルタミン酸を除去することで、ポリグルタミン酸型葉酸やポリグルタミン酸化された葉酸拮抗薬を加水分解する。
Title: Γ-グルタミルヒドロラーゼ (Gamma-glutamyl hydrolase)
Section: 相互作用経路

遺伝子、蛋白質、代謝物の名称をクリックすると其々の項目（主に英語版）が開きます。
Title: Chimerin_2 (Chimerin 2)
Section: abstract

β-chimaerin（ベータ-キメリン、ベータ-カイメリン）はヒトにおいてCHN2遺伝子にコードされているタンパク質である。この遺伝子はchimerinファミリーのメンバーであり、ホルボールエステル/DAGタイプ亜鉛フィンガー、Rho-GAPドメイン、SH2ドメインを持つタンパク質をコードしている。このタンパク質は、リン脂質結合およびジアシルグリセロール (DAG) の結合が誘導するタンパク質の細胞質ゾルからゴルジ体膜への移行によって制御されているGTPアーゼ活性化タンパク質活性を有する。このタンパク質は平滑筋細胞の増殖および移動に役割を果たしている。この遺伝子の発現の減少は悪性度の高い神経膠腫および乳がんと関連しており、この遺伝子の発現の上昇はリンパ腫と関連している。この遺伝子の変異は、ヒトの統合失調症と関連している。異なるアイソフォームをコードしている選択的転写スプライシングバリアントが同定されている。
Title: MALAT1 (MALAT1)
Section: abstract

MALAT1（metastasis associated in lung adenocarcinoma transcript-1）またはNEAT2は2003年に転移性肺癌で高発現しているRNAとして発見された8,000塩基長程度の非常に発現の多い長鎖ノンコーディングRNA（lncRNA）である。その後、がん細胞だけではなく様々な正常組織でも発現することが明らかにされている。神経系などにおいてはRNAポリメラーゼIIによって転写される遺伝子の中では最も発現量を示す遺伝子である。またMALAT1は哺乳類で広く保存されていることが知られている。チンパンジー、アカゲザル、マウスではオルソログが見つかっている。
Title: MALAT1 (MALAT1)
Section: 生合成と構造

mRNAと同様にRNAポリメラーゼⅡによって転写される。mRNAと同様に3’末端にポリA尾部をもつ。mRNAのポリA尾部は、まずmRNAの新生鎖がポリAシグナルと呼ばれる配列の近傍で切断され、次いで切断により生じた3’末端がポリAポリメラーゼによってポリアデニル化されることで形成される。MALAT1ではmRNAとは異なる経路でポリA尾部が形成される。MALAT1の3’末端形成にtRNAのプロセッシング因子が関与している。MALAT1の新生鎖の3’末端側にはtRNAに類似したクローバー葉構造をとる配列がコードされている。この配列をmascRNA(MALAT1-assosiated small cytoplasmic RNA)という。RNase PはtRNAのプロセッシングと同様にmasc RNAの5’末端側を切断し、新生鎖からMALAT-1が産出される。その後、同じくtRNAのプロセッシング因子であるRNase ZによってmascRNAの3’末端側が切断され、mascRNAが切り出される。切り出されたmascRNAの3’末端にはtRNAと同様にCCA付加酵素によりCCA配列が付加され、その後mascRNAは細胞質へ輸送される。mascRNAの機能は明らかではない。一方、切り出されたMALAT1はその3’末端がAにと富む配列で構成されており、上流にあるUを富む2箇所の配列とともに三重らせん構造を形成する。三重らせん構造はヌクレアーゼによる分解から3’末端を保護することでMAALT1の安定化に寄与する。MALAT1は核内に局在するが、特に核スペックルに局在する。試験管内翻訳では蛋白質は合成されず、目立った蛋白質読み取り枠（ORF）もない。
Title: MALAT1 (MALAT1)
Section: 機能

様々な細胞を用いた解析からMALAT1は多様な機能をもつことが示唆されている。例えば、MALAT1がスプライシング因子であるSR蛋白質のリン酸化を調節して選択的スプライシングを制御することや、転写の活性化した遺伝子へのSR蛋白質のリクルートを制御すること、またポリコーム抑制複合体1（polycomb repressive complex 1、PRC1）の構成因子であるPc2とともに細胞増殖を制御する遺伝子を核スペックルへ移行させて活性化させることが指摘されている。さらに神経細胞でシナプス形成を制御する。核スペックルは核質のクロマチン間に存在し、前駆体mRNAスプライシング因子を多く含む核内構造体であり、主にスプライシング因子群の貯蔵・会合・修飾の場と考えられている。TripahiらはMALAT1にスプライシング因子を核スペックルに局在される機能があり、選択的スプライシングを調節しているという学説を提唱している。
Title: MALAT1 (MALAT1)
Section: 悪性腫瘍との関連

MALAT1に関連する疾患を調べてみるとその91.7％が悪性腫瘍である。臓器別にみると最も多いのが肺癌であり、肝細胞癌、乳癌、膀胱癌、子宮頸癌、子宮体癌、骨肉腫、大腸癌が続く。肺癌では予後パラメータである。ゲノム編集によって作成されたMALAT1ノックアウト肺癌細胞はマウス移植モデル実験において肺組織への転移が抑制された。ノックアウトマウスでは表現型を示さないことからMALAT1の機能は細胞が特殊な条件におかれた時にみに顕在化するのかもしれない。MALAT1のノックダウンは肺癌の転移抑制への治療応用に使える可能性がある。またMALAT1が遺伝子発現の制御を通じて細胞運動性を促進することが示されていた。Rosenfeldのグループは2011年にMALAT1が遺伝子ポジショニング制御を担うことを報告した。
Title: MALAT1 (MALAT1)
Section: 神経変性疾患との関連

MALAT1はTDP43と相互作用する。TDP43はALSやFTLDとの関連が指摘されている。
Title: MALAT1 (MALAT1)
Section: ノックアウトマウス

MALAT1は多彩な分子機能が報告されているがノックアウトマウスに明瞭な表現型が認められずその生理機能については謎が多い。ノックアウトマウスは核スペックルの形態にも変化が認められない。しかしノックアウトマウスで脳梗塞モデルである中大脳動脈閉塞（MCAO）を行うと梗塞範囲、神経症状ともに悪化した。脳梗塞という特殊な条件下ではMALAT1のノックアウトマウスは表現型を示すことが明らかになった。
Title: サイクリンC (CCNC (gene))
Section: abstract

サイクリンC（英: cyclin C）は、ヒトではCCNC遺伝子にコードされるタンパク質である。CCNC遺伝子にコードされるサイクリンCは、サイクリンファミリーに属するタンパク質である。サイクリンCはサイクリン依存性キナーゼ8と相互作用し、RNAポリメラーゼIIの大サブユニットのC末端ドメインのリン酸化を誘導する。この遺伝子のmRNAレベルは細胞周期のG1期にピークに達する。この遺伝子には異なるアイソフォームをコードする2つの転写バリアントが見つかっている。
Title: サイクリンC (CCNC (gene))
Section: 相互作用

サイクリンCはエストロゲン受容体α、サイクリン依存性キナーゼ8と相互作用することが示されている。
Title: ΑI-スペクトリン (Spectrin, alpha 1)
Section: abstract

αI-スペクトリン（αI-spectrin）、スペクトリンα1（spectrin α1）またはSPTA1（spectrin alpha, erythrocytic 1）は、ヒトではSPTA1遺伝子にコードされるタンパク質である。スペクトリンはアクチンを架橋する足場タンパク質であり、アクチン細胞骨格を細胞膜へ連結している。また、細胞の形状の決定、膜貫通タンパク質の配置やオルガネラの構成といった機能も果たしている。スペクトリンはα-スペクトリンとβ-スペクトリンからなる二量体同士が向かい合うように連結され、四量体を形成する。αI-スペクトリンは主に22個のスペクトリンリピートから構成され、これらはβ-スペクトリンとの二量体形成に関与している。αI-スペクトリンは赤血球の細胞膜上の構成要素を形成する。SPTA1遺伝子の変異は遺伝性楕円赤血球症2型、遺伝性熱変形赤血球症、遺伝性球状赤血球症3型など、赤血球と関係したさまざまな遺伝疾患の原因となる。
Title: ΑI-スペクトリン (Spectrin, alpha 1)
Section: 相互作用

SPTA1はAblと相互作用することが示されている。
Title: TXNIP (TXNIP)
Section: abstract

チオレドキシン相互作用タンパク質（英: Thioredoxin-interacting protein, TXNIP）は、ヒト TXNIP 遺伝子にコードされているタンパク質である。チオレドキシン結合タンパク質2（英: Thioredoxin-binding protein 2, TBP-2）やビタミンD3上向き制御タンパク質1（英: Vitamin D3 up-regulated protein 1, VDUP-1）としても知られている。
Title: TXNIP (TXNIP)
Section: 相互作用

TXNIPは、チオレドキシンおよびZBTB32と相互作用することが示されている。
Title: グルタリルCoAデヒドロゲナーゼ (Glutaryl-CoA dehydrogenase)
Section: abstract

グルタリルCoAデヒドロゲナーゼ(glutaryl-Coenzyme A dehydrogenase)は、グルタリルCoAをクロトニルCoAに変換する酵素である。脂肪酸代謝、リシン分解、トリプトファン代謝に関与する酵素で補因子としてFADを用いる。
Title: グルタリルCoAデヒドロゲナーゼ (Glutaryl-CoA dehydrogenase)
Section: 病理学

この酵素の異常により、神経学的疾患であるグルタル酸尿症1型を発症する。
Title: 3-ヒドロキシイソ酪酸デヒドロゲナーゼ (3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase)
Section: abstract

3-ヒドロキシイソ酪酸デヒドロゲナーゼ（3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase）は、次の化学反応を触媒する酸化還元酵素である。3-ヒドロキシイソ酪酸 + NAD+                     ⇌              {\displaystyle \rightleftharpoons }   2-メチル-3-オキソプロパン酸 + NADH + H+反応式の通り、この酵素の基質は3-ヒドロキシイソ酪酸とNAD+、生成物は2-メチル-3-オキソプロパン酸とNADHとH+である。組織名は3-hydroxy-2-methylpropanoate:NAD+ oxidoreductaseで、別名にβ-hydroxyisobutyrate dehydrogenaseがある。
Title: Cdc25 (Cdc25)
Section: abstract

Cdc25は、細胞周期に欠陥を有する変異体として分裂酵母Schizosaccharomyces pombeから最初に単離された二重特異性ホスファターゼである。Cdc2やCdc4などの他の細胞周期関連タンパク質や遺伝子と同様、"cdc"は"cell division cycle"を意味している。このホスファターゼはプロテインチロシンホスファターゼのサブクラスを構成するとみなされている。Cdc25は標的となるサイクリン依存性キナーゼ（Cdk）から阻害的なリン酸基を除去することで、M期やS期など細胞周期のさまざまな段階への移行と通過を制御する。
Title: Cdc25 (Cdc25)
Section: Cdk1の活性化機能

Cdc25は、Cdkの活性部位の残基からリン酸基を除去することでCdkを活性化する。また、M-Cdk（Cdk1とサイクリンBの複合体）によるリン酸化はCdc25を活性化する。Cdc25はWee1とともに、M-Cdkのスイッチ様の挙動を可能にする。こうしたスイッチ様の挙動によって、M期への迅速かつ不可逆的な移行が強制される。ヒトではCdc25ファミリーの酵素CDC25A、CDC25B、CDC25CがG1期からS期への移行やG2期からM期への移行を制御することが知られている。
Title: Cdc25 (Cdc25)
Section: 構造

Cdc25の構造は2つの主要な領域に分けられる。N末端領域は多様性が高く、リン酸化とユビキチン化の部位が存在し、ホスファターゼ活性を調節する。C末端領域は相同性が高く、触媒部位が存在する。
Title: Cdc25 (Cdc25)
Section: 進化と種分布

Cdc25は進化の過程でよく保存されており、酵母などの菌類から、ヒトを含む、これまで研究が行われた全ての後生動物で単離されている。一方、真核生物の中でも植物は例外である可能性がある。植物のCdc25と推定されるタンパク質は、触媒にカチオンを利用することなど、二重特異性ホスファターゼよりもセリン/スレオニンホスファターゼに近い特徴を持ち、他の生物のCdc25ホスファターゼと同様の機能を有しているかに関しては疑問が呈されている。Cdc25ファミリーは、高等動物の細胞周期や生活環の複雑性と関連して拡大しているようである。酵母は1つのCdc25（と遠い関係にあるIbp1 [Itsy-bitsy phosphatase 1]）を持つ。キイロショウジョウバエDrosophila melanogasterは、それぞれ有糸分裂と減数分裂を制御するstringとtwineと呼ばれる2つのCdc25を持つ。他の大部分のモデル生物は、Cdc25A、Cdc25B、Cdc25Cと呼ばれる3つのCdc25を持つ。例外的に線虫Caenorhabditis elegansは、4つのCdc25（Cdc-25.1からCdc-25.4）を持つ。
Title: Cdc25 (Cdc25)
Section: ノックアウトマウス

Cdc25の高度な保存性は細胞生理における重要性を示唆しているが、Cdc25BとCdc25Cのノックアウトマウスは（各々の変異体と二重変異体の双方が）生存可能であり、細胞周期に大きな変化は見られない。このことは他のCdk調節酵素（Wee1やMyt1など）やCdc25Aの活性が機能的な補償を行っていることを示唆している。一方で、Cdc25Aのノックアウトマウスは致死となる。
Title: Cdc25 (Cdc25)
Section: ヒトの疾患において

Cdc25をコードする遺伝子、特にCDC25AとCDC25Bはヒトのがん原遺伝子であり、多数のがんで過剰発現していることが示されている。細胞周期においてCdc25が果たす中心的な役割は、新たな化学療法（抗がん剤）の標的として製薬業界から大きな注目を集めている。しかしながら現時点では、これらの酵素を標的とした臨床使用が可能な化合物は報告されていない。活性部位に結合する強力な低分子Cdc25阻害剤は、天然物、親油性の酸、キノノイド、求電子剤、スルホニル化アミノチアゾール、リン酸生物学的等価体など、さまざまな分類のものが多数同定されている。タンパク質基質との配列相同性に基づいたペプチド由来の阻害剤の開発も可能であるが、こうした化合物は適切なADME特性を持たないため、医薬品としての利用には困難を伴う。
Title: ベータトゥロフィン (ANGPTL8)
Section: abstract

ベータトゥロフィン（Betatrophin、β-trophin）は、ヒトなどで見られるタンパク質の1種である。例えば、マウスでは第9染色体にコードされており、ヒトでは第19染色体にコードされている。なお、ベータトゥロフィンにはANGPTL8と言う別名も存在する。後述のように、かつては膵臓でβ細胞を増殖させる機能を持っているのではないかと話題になったものの、それは後に否定された。
Title: ベータトゥロフィン (ANGPTL8)
Section: 構造

ベータトゥロフィンは約22 (kDa)のタンパク質である。特徴的な構造として、N末端の特殊構造（？、N-terminal secretion signal）、2つのコイルドコイル、そして、幾つかのアンジオポエチンに似た構造を持っている。ただし、一般的なアンジオポエチンに似た構造の部分とは違って、ベータトゥロフィンの場合は、そのC末端にフィブリノゲンに似た構造が存在していない。
Title: ベータトゥロフィン (ANGPTL8)
Section: 機能

既述の通り、ベータトゥロフィンの構造中には、アンジオポエチンと似た構造の部分が存在するものの、他のアンジオポエチンとは違って、そのC末端にフィブリノゲンに似た構造が存在していない。そうであるにもかかわらず、ベータトゥロフィンは、アンジオポエチン類の中のアンジオポエチン3とアンジオポエチン4が持っている機能と同じ機能、すなわち、リポタンパク質リパーゼの阻害作用を有している。ところで、ベータトゥロフィンは、マウスにおいては、肝臓から分泌されているタンパク質であることが知られている。このベータトゥロフィンをマウスの肝臓で過剰発現させると、マウスにおいてはトリアシルグリセロールの量を減らすことができることが判明した。結局、マウスにおいてベータトゥロフィンは、血糖のコントロールには直接関わっていないものの、中性脂肪の代謝には大きな影響を与えていることが判明した。
Title: ベータトゥロフィン (ANGPTL8)
Section: 歴史的経緯
Subsection: β細胞に作用すると考えられた時期

2010年代に入った頃、マウスにおいてベータトゥロフィンは膵臓のランゲルハンス島にあるβ細胞を、細胞分裂させることによって増殖させる作用を持ったホルモンとして機能しているのではないかと勘違いされた。と言うのも、ベータトゥロフィンのcDNAをマウスに注入してみたところ、どうやら膵臓に影響を与えることで血糖が低下したように見えたからである。このために、もしかしたら糖尿病の治療に使えるかもしれないと期待された。
Title: ベータトゥロフィン (ANGPTL8)
Section: 歴史的経緯
Subsection: その後

しかしながら、ヒトに対してベータトゥロフィンを使っても、ランゲルハンス島のβ細胞に細胞分裂を引き起こして増殖させるといったことは不可能であった。その上、ベータトゥロフィンをノックアウトしたマウスを作成してみたところ、別段ベータトゥロフィンが膵臓のランゲルハンス島のβ細胞の増殖を制御しているといった結果が得られなかったばかりか、ベータトゥロフィンは血糖ではなく、むしろ、中性脂肪の1種であるトリアシルグリセロールの濃度調節に関わっていることが明らかであるという結果が得られた。これらの結果から、ベータトゥロフィンには膵臓のランゲルハンス島のβ細胞を分裂させて増殖させる作用は無いと結論付けられた。したがって、糖尿病の治療のためにβ細胞を増やすといった使い方は絶望視された。ただ、中性脂肪の代謝に影響を与える作用がベータトゥロフィンには認められたことから、2014年現在、脂質異常症の形態の1種である高トリグリセリド血症（血中の中性脂肪が異常高値になっている状態）の治療に、ベータトゥロフィンを応用できる可能性はあるだろうと考えられている。
Title: PPM1D (PPM1D)
Section: abstract

Protein phosphatase 1D はヒトppm1d遺伝子によってコードされる酵素である。PPM1DはPPMファミリーに分類されるSer/Thrホスファターゼである。PPMファミリーは細胞ストレス応答経路のネガティブレギュレイターとして知られている。PPM1Dは、当初tumor suppressor protein TP53/p53依存的な様々な環境ストレスに応答して誘導されるホスファターゼとして同定された。p53やp38 MAPキナーゼ (MAPK/p38) の直接的な脱リン酸化によって、それらの活性を負に制御し、細胞周期停止やアポトーシスを抑制する。このことからp53のフィードバック制御因子であると考えられている。また、細胞周期制御因子の脱リン酸化によってp53非依存的に細胞周期を制御することが知られている。この遺伝子は乳癌由来細胞株および、初期乳癌組織において増幅が報告されており、このことは癌発生におけるppm1d遺伝子の役割を示唆している。
Title: PPM1D (PPM1D)
Section: 相互作用

PPM1DはCDC5Lと相互作用することが報告されている。
Title: DP1受容体 (Prostaglandin DP1 receptor)
Section: abstract

DP1受容体（DP1 receptor）は、ヒトなどに存在するGタンパク質共役受容体の1種である。プロスタグランディンD2を主なリガンドとする。全身の様々な細胞に発現しており、様々な生理反応に関与している他、病理学の分野では炎症やアレルギーに関係する受容体の1つとして知られる。
Title: DP1受容体 (Prostaglandin DP1 receptor)
Section: 構造

DP1受容体はGタンパク質共役受容体の中でも、Gs受容体に分類される。ヒトのDP1受容体は、14番染色体の長腕「14q22.1」と番号が付与された場所にコードされている。リボソームで翻訳されたヒトのDP1受容体は、359個のアミノ酸から成り、その分子量は約40271 (Da)である。なお、例えばマウスのDP1受容体は、357個のアミノ酸から成り、その分子量は約40005 (Da)であるなど、種差が見られる。
Title: DP1受容体 (Prostaglandin DP1 receptor)
Section: 生理作用

DP1受容体は、プロスタグランディンD2を主なリガンドとしている。この受容体にプロスタグランディンD2のようなアゴニストが結合すると、全身の細胞に広く発現している受容体なだけに、様々な生理反応を引き起こす。例えば、気管支平滑筋に対しては気管支を拡張させ、血管平滑筋に対しては血管を拡張させ、樹状細胞に対してはサイトカインの産生を抑制させ、血小板に対しては凝集を妨げる。なお、これらの作用の中に存在する、一見、抗炎症作用を示すかのような効果は、白血球の活動などのために、結局のところ抗炎症作用としては現れてこない。そして、結局のところアレルギー反応を促進する。この他、DP1受容体は中枢神経系にも発現しており、どうやら中枢神経系においては、睡眠や痛みの知覚に関わっているようだと考えられている。
Title: プロテアーゼ活性化受容体3 (F2RL2)
Section: abstract

プロテアーゼ活性化受容体3（プロテアーゼかっせいかじゅようたい3、英: protease-activated receptor 3、略称: PAR3）は、ヒトではF2RL2遺伝子にコードされるタンパク質である。F2RL2（coagulation factor II receptor-like 2）、thrombin receptor-like 2という名称でも知られる。
Title: プロテアーゼ活性化受容体3 (F2RL2)
Section: 機能

PAR3はGタンパク質と共役した7回膜貫通受容体ファミリーに属する。また、プロテアーゼ活性化受容体ファミリーのメンバーでもあり、トロンビンによって活性化される。PAR3は細胞外のN末端領域のタンパク質分解切断によって活性化され、新たに形成されたN末端がテザードリガンドとして受容体を活性化する。PAR3はトロンビンによるPAR4の切断と活性化のコファクターとしても機能する。
Title: WRAP53 (WRAP53)
Section: abstract

WRAP53（WD40-encoding RNA antisense to p53）は、がんの発生への関与が示唆されている遺伝子である。この遺伝子はp53がん抑制遺伝子を調節するアンチセンスRNAをコードするとともに、DNA修復、テロメアの伸長、カハール体の維持に関与するタンパク質をコードする、という二重の役割を持つ。
Title: WRAP53 (WRAP53)
Section: 遺伝子

WRAP53遺伝子は17番染色体の17p13.1に位置し、13個のエクソンを含む。3つの選択的エクソン（1α、1β、1γ）が存在し、少なくとも3種類の遺伝子産物が産生される。WRAP53遺伝子はp53遺伝子と向かい合い、両遺伝子の一部の領域は重複している。
Title: WRAP53 (WRAP53)
Section: 機能

p53の最初のエクソンと重複するWRAP53の転写産物（WRAP53α）は、p53のｍRNAとタンパク質のレベルを調節する。WRAP53γ転写産物はp53の最初のイントロンと重複しており、このイントロンに位置するHp53int1転写産物のアンチセンス鎖である。しかしながら、WRAP53γの機能は不明である。WRAP53遺伝子はWRAP53β（WRAP53、WDR79、TCAB1）と呼ばれるタンパク質もコードし、このタンパク質はWD40タンパク質ファミリーに属する。WRAP53βはタンパク質間、タンパク質-RNA間の相互作用を促進し、相互作用因子をカハール体や、テロメア、DNA二本鎖切断部位へリクルートする。WRAP53βの助けを借りてカハール体に局在する因子には、SMNタンパク質、scaRNAやテロメラーゼなどがある。また、WRAP53βはユビキチンリガーゼRNF8をDNA二本鎖切断部位へ標的化する。因子を適切な部位へ局在させる役割に加えて、WRAP53βはカハール体の構造的完全性の維持にも関与しており、WRAP53βがなければカハール体は崩壊し、再形成されることはない。
Title: WRAP53 (WRAP53)
Section: ドメイン

WRAP53βタンパク質は進化的に高度に保存されており、ホモログ（WD40リピートに限定される）は脊椎動物、無脊椎動物、植物、酵母に存在する。WRAP53βはN末端のプロリンリッチ領域、中心部のWD40ドメイン、C末端のグリシンリッチ領域から構成され、幅広い分子間の複数の相互作用の足場として機能する。
Title: WRAP53 (WRAP53)
Section: 臨床的意義
Subsection: 先天性角化不全症

WRAP53βの生殖細胞系列変異は、先天性角化不全症と呼ばれる疾患を引き起こす。この疾患は骨髄不全、早老、がんの素因となるほか、口腔白板症、皮膚色素沈着の異常、爪の変形という皮膚粘膜に関する3つの特徴を持つ。WRAP53βの変異は常染色体劣性形式で遺伝し、WD40ドメインの高度保存領域の変異はより重症となる。こうした変異によってWRAP53βの核内レベルは低下し、テロメラーゼのテロメアへの輸送が異常となってテロメア短縮の進行が引き起こされる。WRAP53βが正しくフォールディングするためには、シャペロニンCCT/TRiCが重要であり、この疾患ではこのフォールディングの異常がみられる。
Title: WRAP53 (WRAP53)
Section: 臨床的意義
Subsection: 脊髄性筋萎縮症

脊髄性筋萎縮症の最も重症型（I型、ウェルドニッヒ・ホフマン病）の患者では、WRAP53βを介したSMNの輸送の欠陥がみられる。この疾患は脊髄の前角のα運動ニューロンの進行性変性によって特徴づけられる。乳児死亡率の主要な遺伝的要因であり、6000出生につき1件の割合で生じる。
Title: WRAP53 (WRAP53)
Section: 臨床的意義
Subsection: がん

WRAP53βは由来の異なるさまざまながん細胞株で過剰発現している。こうした過剰発現は発がん性形質転換を促進することから、このタンパク質が発がん性を有することが示唆される。WRAP53βは原発性鼻咽頭癌、食道扁平上皮癌、直腸がんで過剰発現している。さらに、がん細胞でWRAP53βをノックダウンすることでマウスに移植した際に形成される腫瘍のサイズは低下し、またがん細胞ではミトコンドリア依存的なアポトーシスが引き起こされる。反対にWRAP53βの双方のアレルを不活性化する変異が先天性角化不全症の原因となることは、このタンパク質が発がん性因子ではなくむしろがん抑制因子として作用することを示唆している。また頭頸部がんでは、核内におけるWRAP53βの喪失は患者の生存期間の短縮や放射線治療に対する抵抗性とも相関している。WRAP53βは多数の細胞過程において複雑な役割を果たしており、特定の条件下ではがん抑制因子として、そして他の条件下ではがん遺伝子として作用している可能性がある。WRAP53遺伝子の一塩基多型（SNP）は、乳がんと卵巣がんのリスクの増加と関連付けられている。これらのSNPの1つは、ベンゼン曝露作業者におけるDNA修復の欠陥や血液毒性とも関係している。
Title: プロテアーゼ活性化受容体4 (F2RL3)
Section: abstract

プロテアーゼ活性化受容体4（プロテアーゼかっせいかじゅようたい4、英: protease-activated receptor 4、略称: PAR4）は、ヒトではF2RL3遺伝子にコードされるタンパク質である。F2RL3（coagulation factor II receptor-like 3）、thrombin receptor-like 3という名称でも知られる。
Title: プロテアーゼ活性化受容体4 (F2RL3)
Section: 機能

PAR4はGタンパク質と共役した7回膜貫通受容体ファミリーに属する。また、プロテアーゼ活性化受容体ファミリーのメンバーでもある。細胞外のN末端領域のタンパク質分解切断によって活性化され、切断によって新たに形成されたN末端がテザードリガンドとして機能して受容体を活性化する。
Title: プロテアーゼ活性化受容体1 (Proteinase-activated receptor 1)
Section: abstract

プロテアーゼ活性化受容体1（プロテアーゼかっせいかじゅようたい1、英: protease-activated receptor 1、略称: PAR1）は、ヒトではF2R遺伝子によってコードされるタンパク質である。トロンビン（凝固第II因子）受容体という語がこのタンパク質を指して用いられることもある。PAR1はGタンパク質共役受容体であり、4種類のプロテアーゼ活性化受容体の1つである。血小板と内皮細胞で高度に発現しており、血液凝固と炎症の連携を媒介する重要な役割を果たし、炎症性肺疾患や線維性肺疾患の発症に重要である。また、トロンビンまたは活性化プロテインCとの相互作用を介して、血管内皮のバリアの完全性の破壊と維持にそれぞれ関与している。
Title: プロテアーゼ活性化受容体1 (Proteinase-activated receptor 1)
Section: 構造

PAR1は膜貫通Gタンパク質共役受容体（GPCR）であり、425アミノ酸残基からなる。その構造の特徴は他のプロテアーゼ活性化受容体と多くが共通しており、7本の膜貫通αヘリックスを持ち、3つの細胞外ループと3つの細胞内ループを持つ。N末端へは細胞外に位置し、トロンビンの結合に適した配置をしている。C末端は細胞内側に位置し、細胞質テールの一部をなしている。
Title: プロテアーゼ活性化受容体1 (Proteinase-activated receptor 1)
Section: シグナル伝達経路
Subsection: 活性化

PAR1はN末端の41アミノ酸がトロンビンによって切断されることで活性化される。トロンビンはN末端のLys-Asp-Pro-Arg-Ser配列を認識し、Arg41とSer42の間のペプチド結合を切断する。PAR1の特異的切断部位に対するトロンビンの親和性は、トロンビンのexositeと呼ばれる領域とPAR1のSer42のC末端側に位置するアミノ酸からなる酸性領域との二次的相互作用によってさらに強化される。このタンパク質分解による切断は不可逆的で、切断されたペプチド（parstatinとも呼ばれる）はその後、細胞外へ放出される。切断によって生じた新たなN末端は、PAR1の2つ目の細胞外ループの結合領域に結合するテザードリガンド（係留リガンド）として作用し、PAR1を活性化する。この結合はタンパク質のコンフォメーション変化を促進し、PAR1の細胞内領域へのGタンパク質の結合を可能にする。
Title: プロテアーゼ活性化受容体1 (Proteinase-activated receptor 1)
Section: シグナル伝達経路
Subsection: シグナル伝達

PAR1は切断を受けると、細胞内ループのいくつかの部位に結合したGタンパク質を活性化する。例えば、PAR1はPAR4とともに、G12/13型Gタンパク質と共役して活性化し、RhoとRhoキナーゼを活性化する。この経路はアクチンの収縮による血小板の形状の迅速な変化を引き起こして血小板に可動性をもたらすとともに、顆粒の放出を引き起こす。どちらも血小板の凝集に必要な過程である。さらに、PAR1とPAR4の双方がGqと共役し、細胞内のカルシウムイオンの移動を刺激する。カルシウムは血小板活性化のセカンドメッセンジャーとして機能する。また、この経路はプロテインキナーゼCも活性化し、血小板の凝集を促進し、血液凝固経路をさらに進行させる。
Title: プロテアーゼ活性化受容体1 (Proteinase-activated receptor 1)
Section: シグナル伝達経路
Subsection: 終結

PAR1の細胞質テールのリン酸化とその後のアレスチンの結合は、PAR1をGタンパク質シグナル伝達から脱共役させる。リン酸化されたPAR1はエンドソームを介して細胞内へ送り返され、ゴルジ体へ送られる。その後、切断されたPAR1は選別されてリソソームへ輸送され、分解される。このインターナリゼーションと分解は、受容体シグナル伝達を終結させるために必要な過程である。細胞がトロンビンに対する応答性を再獲得するためには、PAR1が細胞膜へ再補充されなければならない。細胞膜の未切断のPAR1には、細胞内のC末端のチロシンモチーフにAP2アダプタータンパク質複合体が結合し、エンドサイトーシスが促進される。これらはその後、細胞質のクラスリン被覆小胞に貯蔵され、タンパク質分解から保護される。未切断のPAR1は再合成に依存しない形でこうした小胞から細胞膜へ定常的に供給され、細胞は再びトロンビンに対して感作状態となってシグナル伝達経路が再設定される。
Title: プロテアーゼ活性化受容体1 (Proteinase-activated receptor 1)
Section: リガンド
Subsection: アゴニスト

PAR1に対する選択的アゴニストの探索は、研究者の関心事となっている。合成SFLLRNペプチドはPAR1のアゴニストとして作用することが知られている。SFLLRNペプチドは活性化PAR-1のN末端テザードリガンドの最初の6残基を模倣し、2つ目の細胞外ループ上の同じ結合部位に結合する。そのため、トロンビンが存在しない場合でも、SFLLRNの結合によってPAR1の切断に伴う応答をもたらすことができる。
Title: プロテアーゼ活性化受容体1 (Proteinase-activated receptor 1)
Section: リガンド
Subsection: アンタゴニスト

PAR1の選択的アンタゴニストは抗凝固薬として開発されている。 SCH-79797ボラパキサルはZontivityの商品名で販売されており、心筋梗塞や末梢動脈疾患の病歴がある患者の心疾患の治療に利用される、ファースト・イン・クラス（画期的医薬品）抗血小板薬である。ボラパキサルは近年、IL-1βなどの炎症性サイトカインやCXCL1、CCL2、CCL7などのケモカインのレベルを低下させることにより、肺炎球菌Streptococcus pneumoniaeに対する好中球の炎症応答を弱めることが明らかにされた。ボラパキサルはPAR1の細胞外ループ2と3の間の結合ポケットに結合することで阻害を行う。ボラパキサルの結合はPAR1の不活性構造を安定化し、活性化型コンフォメーションへの切り替えを防ぐ。