shintaro-ozaki/entity-explanation huggingface dataset:
Title: P-セレクチン (P-selectin)
Section: 薬剤標的として

クリザンリズマブは、P-セレクチンに対するモノクローナル抗体である。クリザンリズマブはノバルティスによって開発され、2019年11月15日に鎌状赤血球症患者の血管閉塞症に対してFDAの承認を受けた。
Title: グルタチオンジスルフィドレダクターゼ (Glutathione reductase)
Section: abstract

グルタチオンジスルフィドレダクターゼ（glutathione-disulfide reductase）は、グルタチオン代謝酵素の一つで、次の化学反応を触媒する酸化還元酵素である。2 グルタチオン + NADP+                     ⇌              {\displaystyle \rightleftharpoons }   グルタチオンジスルフィド + NADPH + H+反応式の通り、この酵素の基質はグルタチオンとNADP+、生成物はグルタチオンジスルフィドとNADPHとH+である。補因子としてFADを用いる。組織名はglutathione:NADP+ oxidoreductaseで、別名にglutathione reductase、glutathione reductase (NADPH)、NADPH-glutathione reductase、GSH reductase、GSSG reductase、NADPH-GSSG reductase、glutathione S-reductase、NADPH:oxidized-glutathione oxidoreductaseがある。なお、グルタチオンジスルフィドレダクターゼは、グルタチオンレダクターゼとも呼ばれており、グルタチオン-アスコルビン酸回路を構成している酵素の一つである。
Title: EZH2 (EZH2)
Section: abstract

EZH2（enhancer of zeste homolog 2）はEZH2遺伝子にコードされるヒストンメチルトランスフェラーゼ（EC 2.1.1.43）である。ヒストンのメチル化を行い、最終的には転写の抑制に関与する。EZH2は補因子としてS-アデノシル-L-メチオニンを利用して、ヒストンH3のリジン27番へのメチル基の付加を触媒する。EZH2のメチル化活性はヘテロクロマチン形成を促進し、それによって遺伝子の機能をサイレンシングする。EZH2による染色体のヘテロクロマチンのリモデリングは有糸分裂時にも必要となる。EZH2はPRC2（Polycomb repressive complex 2）のメチル化活性を担う構成要素であり、PRC2は発生と分化の調節を担う遺伝子のエピジェネティック状態を維持することで正常な胚発生を担う。PRC2には他にも最適な機能のために必要なタンパク質（EED、SUZ12、JARID2、AEBP2、RbAp46/48、PCL1）が含まれている。EZH2の変異や過剰発現は、多くのがんと関連付けられている。EZH2はがんの発生の抑制を担う遺伝子を阻害するため、EZH2活性の阻止によって腫瘍の成長が遅くなる可能性がある。EZH2は乳がん、前立腺がん、悪性黒色腫、膀胱がんを含む複数のがんでアップレギュレーションされているため、抗がん剤の阻害標的となっている。また、EZH2遺伝子の変異は稀少先天性疾患であるウィーバー症候群と関係しており、EZH2は毛細血管拡張性運動失調症の神経変性症状にも関与している。
Title: EZH2 (EZH2)
Section: 機能

EZH2はPRC2の触媒サブユニットである。EZH2の触媒活性は、少なくとも他の2つのPRC2構成要素、SUZ12とEEDとの複合体形成に依存している。EZH2はヒストンメチルトランスフェラーゼであり、EZH2の主な機能はヒストンH3のリジン27番（H3K27）のメチル化である。EZH2は補因子S-アデノシル-L-メチオニン（SAM）からメチル基を転移する。EZH2は、H3K27のモノ-、ジ-、トリメチル化が可能であり、造血、発生、細胞分化における転写調節など、さまざまな生物学的機能と関係している。近年の研究では、EZH2はヒストン以外のタンパク質のメチル化も可能であることが示唆されている。
Title: EZH2 (EZH2)
Section: 機能
Subsection: 転写抑制

EZH2はPRC2の一部としてH3K27のトリメチル化（H3K27me3）を触媒する。H3K27me3はヒストンコードの一部として特徴づけられているヒストン修飾である。ヒストンコードは、ヒストンタンパク質のメチル化、アセチル化、ユビキチン化などの化学修飾が遺伝子の転写のエピジェネティックな調節にそれぞれ特有の役割を果たしているという仮説である。EZH2を介したH3K27me3の触媒は、長期の転写抑制と関係している。EZH2は他のポリコーム群タンパク質と同様に、細胞分裂を通して遺伝子の抑制を確立し維持する過程に関与している。この転写抑制状態は、PRC2/EZH2-EEDを介したH3K27のメチル化と、その後にクロマチン凝縮とヘテロクロマチン形成を促進するPRC1のリクルートによって確立されると考えられている。ヘテロクロマチンは固くパッキングされたクロマチンであり、DNAへの転写装置のアクセスを制限することで転写を抑制する。細胞分裂の過程では、ヘテロクロマチンの形成は適切な染色体分離のために必要である。PRC2/EED-EZH2複合体はDNAメチルトランスフェラーゼのリクルートにも関与している可能性があり、他のエピジェネティックな転写抑制機構であるDNAメチル化の増加をもたらす。EZH2を介した転写抑制の標的として同定されている具体的な遺伝子としては、HOXA9、HOXC8、MYT1、CDKN2A、レチノイン酸標的遺伝子がある。
Title: EZH2 (EZH2)
Section: 機能
Subsection: 転写活性化

がんにおいては、EZH2はPRC2非依存的に転写の活性化に関与している可能性がある。乳がん細胞では、EZH2はNF-κB標的遺伝子を活性化することが示されている。この活性の機能的役割とその機構については未解明である。
Title: EZH2 (EZH2)
Section: 機能
Subsection: 発生と細胞分化

EZH2は発生に必要不可欠な役割を果たす。特に、EZH2は細胞分化を調節する遺伝子の転写抑制の制御を助ける。胚性幹細胞では、発生遺伝子を含む領域でのEZH2を介したH3K27のトリメチル化は、正常な細胞分化の維持に重要であるようである。またH3K27me3は、メスの発生時にX染色体の一方をサイレンシングする、X染色体の不活性化の駆動にも重要である。X染色体の不活性化時には、EZH2はH3K27のトリメチル化によってヘテロクロマチン形成の開始に関与しており、サイレンシング状態の維持には他のヒストンメチルトランスフェラーゼや他のヒストン修飾も関係している可能性があると考えられている。さらに、EZH2はB細胞とT細胞の発生と分化に関与する必須のタンパク質としても同定されている。H3K27me3は分化を促進する遺伝子の抑制に関与しており、そのためEZH2はB細胞とT細胞を未分化状態に維持し、造血の調節に重要な役割を果たす。
Title: EZH2 (EZH2)
Section: 機能
Subsection: EZH2の活性の調節

EZH2の活性は、セリン・スレオニン残基のリン酸化による翻訳後修飾によって調節されている。具体的には、T350のリン酸化はEZH2活性の増加と関連付けられており、一方T492とS21のリン酸化はEZH2活性の低下と関連付けられている。T492のリン酸化はEZH2とPRC2複合体中の結合パートナーとの間の接触を阻害し、その触媒活性を妨げることが示唆されている。リン酸化に加えて、PRC2/EZH2-EEDの活性は、H3K27のアセチル化（H3K27ac）やH3K36のメチル化（H3K36me）などの転写活性化ヒストン修飾と拮抗することが示されている。
Title: EZH2 (EZH2)
Section: 酵素活性

EZH2の機能はPRC2複合体へのリクルートに高度に依存している。特に、EEDとSUZ12はEZH2とヒストン基質との相互作用の安定化に必要である。近年、ヒトでは、EZH2は2つのアイソフォーム（EZH2αとEZH2β）が選択的スプライシングによって形成されることが明らかにされている。核局在化シグナル、EEDとSUZ12への結合部位、保存されたSETドメインといったEZH2の機能に重要なエレメントは、どちらのアイソフォームにも含まれている。これまでほとんどの研究は長いアイソフォームであるEZH2αに焦点を当てていたが、エクソン4と8を欠くEZH2βにも活性があることが示されている。さらに、PRC2/EZH2β複合体はPRC2/EZH2αとは異なる遺伝子に作用し、各アイソフォームがそれぞれ特異的な遺伝子セットに作用している可能性が示唆される。また、EZH2は高度にアップレギュレーションされている場合、PRC2との結合に依存せずにリジンのメチル化を行う可能性がある。
Title: EZH2 (EZH2)
Section: 酵素活性
Subsection: リジンのメチル化

生物学においてはメチル化は典型的には酵素によって触媒され、メチル基はタンパク質または核酸のいずれかに付加される。EZH2によって触媒されるメチル化反応では、ヒストンH3のリジン残基がメチル化される。このアミノ酸の末端のアンモニウム基は最大3回メチル化することができる。こうしたメチル化リジンは哺乳類の遺伝子発現の制御に重要であり、ヘテロクロマチン形成、X染色体の不活性化、転写調節に機能する。哺乳類の染色体では、ヒストンのリジンのメチル化は、部位に応じて遺伝子発現の活性化または抑制のいずれかを行う。近年の研究からは、EZH2複合体のサイレンシング機能の少なくとも一部はヒストンH3のリジン27番残基のメチル化によるものであることが示されている。メチル化修飾はヒストンへのタンパク質の結合に影響を与え、転写を活性化または阻害する。
Title: EZH2 (EZH2)
Section: 酵素活性
Subsection: 触媒機構

 EZH2はリジンメチルトランスフェラーゼ、SETドメインファミリーのメンバーであり、基質タンパク質のリジン側鎖にメチル基を付加する。SETメチルトランスフェラーゼは補因子S-アデノシルメチオニン（SAM）に依存しており、SAMはメチル基の供与体として作用する。SETドメインタンパク質は、基質とSAMが酵素の活性部位にそれぞれ反対側から結合する点で他のSAM依存的メチルトランスフェラーゼとは異なる。この基質と補因子の配向によって、基質との結合を壊すことなくSAMが解離することが可能となり、基質を解離することなく複数回のリジンメチル化を行うことが可能となる。EZH2に基質やSAMが結合した結晶構造は決定されていないが、ヒトSET7/9メチルトランスフェラーゼとのSTAMPによるアラインメントからは、EZH2の推定活性部位には保存されたチロシン残基がほぼ同一な位置に存在していることが示されている。 EZH2の活性部位のY726は以前は基質のリジンを脱プロトン化する一般塩基として作用することが示唆されていたが、速度論的同位体効果からは活性部位の残基はメチル基転移反応の化学に直接的には関与していないことが示されている。代わりにこれらの実験からは、活性部位残基は基質のリジン残基のpKaを低下させ、同時に水分子が活性部位内のリジン側鎖にアクセスするチャネルを提供するという機構が支持される。その後、バルク溶媒の水分子は容易にリジン側鎖を脱プロトン化して活性化し、SN2様反応によるSAM補因子への求核攻撃によって、SAMからリジン側鎖へのメチル基の転移を引き起こす。 EZH2は主にH3K27のモノメチル化とジメチル化を触媒するが、臨床的関連のあるY641F変異によって高いH3K27トリメチル化活性がもたらされる。Y641からのヒドロキシル基の除去によって立体障害がなくなり、基質のリジンへの3つ目のメチル基の収容が可能となることが提唱されている。
Title: EZH2 (EZH2)
Section: 臨床的意義
Subsection: がん

EZH2はがん細胞の分裂と増殖を助けるため、抗がん剤治療の魅力的な標的である。EZH2は乳がん、前立腺がん、膀胱がん、子宮がん、腎臓がん、悪性黒色腫や悪性リンパ腫を含む広範囲のがんにおいて、正常細胞よりも多量に存在することが知られている。EZH2は遺伝子発現の抑制因子であるため、過剰発現時には通常発現している多くのがん抑制遺伝子が抑制される。EZH2の機能の阻害によってがん抑制遺伝子がサイレンシングされなくなるため、悪性腫瘍が縮小することが一部の症例では報告されている。EZH2は健康な成人では通常発現しておらず、胎児の発生時など活発に分裂している細胞にのみ存在する。こうした特性のため、EZH2の過剰発現はがんや一部の神経変性疾患の診断マーカーとして利用可能である。しかしながら、EZH2の過剰発現が疾患の原因であるのか、それとも単に他の要因による結果であるのかを判断することが難しい症例が存在する。もしEZH2の過剰発現が結果にすぎない場合、EZH2の阻害を標的とすることは疾患の治癒にはつながらない。EZH2が関与するがん経路の1つは、Rb-E2F経路である。EZH2はRb-E2F経路の下流に位置し、この経路からのシグナルはEZH2の過剰発現を引き起こす。EZH2の他の重要な特徴は、過剰発現している場合、PRC2を形成することなく遺伝子を活性化することができるという点である。このことは酵素のメチル化活性が複合体形成を介さないため問題となる。乳がん細胞では、EZH2は細胞増殖と生存を促進する遺伝子を活性化する。また、Wntシグナル経路の因子と相互作用することで、c-mycやサイクリンD1などの調節遺伝子の活性化も行う。重要なことに、SETドメインのY641が多数の異なるアミノ酸へ変異していることは一部のB細胞リンパ腫に一般的な特徴である。
Title: EZH2 (EZH2)
Section: 臨床的意義
Subsection: 阻害剤

EZH2の阻害剤の開発とそれによるがん抑制遺伝子の望まないヒストンメチル化の防止は、がん研究の有望な領域である。EZH2の阻害剤の開発はタンパク質のSETドメインの活性部位を標的としたものに焦点が当てられている。2015年時点で、3-デアザネプラノシンA（DZNep）、EPZ005687、EI1、GSK126、UNC1999といった、いくつかのEZH2阻害剤が開発されている。DZNepは、乳がんと大腸がんの細胞でEZH2のレベルを低下させてアポトーシスを誘導するため、抗ウイルス、抗がん作用を有する可能性がある。DZNepはS-アデノシル-L-ホモシステイン（SAH）の加水分解を阻害する、すべてのタンパク質メチルトランスフェラーゼに対する反応産物ベースの阻害剤である。DZNepはSAHの細胞内濃度の上昇を引き起こすことでEZH2を阻害するが、EZH2に対して特異的ではないため、他のDNAメチルトランスフェラーゼなども阻害する。2012年、Epizyme社はDZNepよりも選択性の高い、S-アデノシル-L-メチオニン（SAM）競合型阻害剤EPZ005687を発表した。この薬剤はEZH1と比較してEZH2に対する選択性が50倍高い。薬剤は酵素のSETドメインの活性部位に結合することでEZH2の活性を遮断する。EPZ005687はEZH2のY641やA677の変異体も阻害することができるため、非ホジキンリンパ腫の治療への適用の可能性がある。2013年、Epizyme社は他のEZH2阻害剤タゼメトスタット（EPZ-6438）のB細胞リンパ腫の患者に対する第I相臨床試験を開始した。2020年、タゼメトスタット（商標名Tazverik）は転移性または局所進行性の類上皮肉腫の治療に対してFDAの承認を受け、その年には再発性濾胞性リンパ腫に対する承認も行われた。シネフンギン（sinefungin）は他のSAM競合的阻害剤であるが、DZNep同様EZH2に対する特異性はない。メチルトランスフェラーゼの補因子結合ポケットに結合することで作用し、メチル基の転移を防ぐ。EI1はノバルティス社によって開発された阻害剤で、Y641変異型細胞も含め、リンパ腫細胞でEZH2阻害活性を示す。この阻害剤の作用機序も、SAMのEZH2への結合に対する競合である。GSK126はグラクソスミスクライン社によって開発された強力なSAM競合型EZH2阻害剤で、EZH1と比較して150倍の選択性があり、Kiは0.5–3 nMである。UNC1999はGSK126のアナログとして開発され、経口投与で活性を示す最初のEZH2阻害剤である。しかしながら、GSK126と比較して選択性は低く、EZH1にも同様に結合するため、オフターゲット効果の可能性が高くなっている。一次治療が奏効しなくなった際の治療法として併用療法が研究されている。トポイソメラーゼの阻害剤であるエトポシドは、EZH2阻害剤を併用した際に、BRG1とEGFRに変異を有する非小細胞性肺がんに対する効果が高まる。しかしながら、EZH2とリジンメチル化は腫瘍抑制作用を持つ場合もあるため（例としては骨髄異形成症候群）、EZH2の阻害がすべての症例に対して有効なわけではない可能性がある。
Title: EZH2 (EZH2)
Section: 臨床的意義
Subsection: ウィーバー症候群

EZH2遺伝子の変異はウィーバー症候群と関連付けられている。ウィーバー症候群は、骨年齢の促進、大頭症、両眼隔離症によって特徴づけられる稀少疾患である。ウィーバー症候群と診断された患者では、EZH2の活性部位のヒスチジン残基がチロシンに変異している。この変異は補因子の結合を阻害し、タンパク質の正常な機能は失われている可能性が高い。
Title: EZH2 (EZH2)
Section: 分類学上の分布

Enhancer of zeste（E(z)）はもともとキイロショウジョウバエDrosophila melanogasterで同定され、その後に哺乳類ホモログが同定されてEZH1（enhancer of zeste homolog 1）、EZH2（enhancer of zeste homolog 2）と命名された。EZH2は進化を通じて高度に保存されている。EZH2とそのホモログは、植物、昆虫、魚類、そして哺乳類で、発生、細胞分化、細胞分裂に必要不可欠な役割を果たしている。系統樹ではさまざまな生物種におけるEZH2の分布が示されている。
Title: ガストリン (Gastrin)
Section: abstract

ガストリン（英: gastrin）は、主に胃の幽門前庭部に存在するG細胞から分泌されるホルモン。胃主細胞からのペプシノゲン分泌促進作用、胃壁細胞からの胃酸分泌促進作用、胃壁細胞増殖作用、インスリン分泌促進作用などが認められている。ガストリン分泌はプログルミドやセクレチンなどによって抑制される。ガストリノーマ(英: gastrinoma)とはガストリンを分泌する腫瘍。ゾリンジャー・エリソン症候群(en)の原因となることがある。主に膵臓や十二指腸で認められる。
Title: アミロイド前駆体タンパク質 (Amyloid-beta precursor protein)
Section: abstract

アミロイド前駆体タンパク質（アミロイドぜんくたいタンパクしつ、英: amyloid precursor protein、略称: APP）またはアミロイドβ前駆体タンパク質は、多くの組織で発現している内在性膜タンパク質で、神経細胞のシナプスに濃縮されている。主要な機能は未知であるが、シナプス形成、神経可塑性、抗菌活性、鉄排出の調節因子であると示唆されている。APPは、タンパク質分解によって形成されるアミロイドβ（Aβ）の前駆体として最もよく知られている。Aβは37–49アミノ酸残基からなるポリペプチドで、アミロイド型のAβはアルツハイマー病患者の脳に存在するアミロイド斑の主要な構成要素である。
Title: アミロイド前駆体タンパク質 (Amyloid-beta precursor protein)
Section: 遺伝子

APPは進化的に古くから存在し、高度に保存されたタンパク質である。ヒトのAPPをコードする遺伝子は21番染色体に位置し、290 kbにわたる18のエクソンからなる。ヒトでは、選択的スプライシングによるアイソフォームがいくつか観察されており、アミノ酸長は639–770アミノ酸の範囲である。神経細胞では特定のアイソフォームが選択的に発現しており、アイソフォームの比率の変化はアルツハイマー病と関係している。APPに相同なタンパク質は、ショウジョウバエDrosophila、線虫Caenorhabditis elegans、そしてすべての哺乳類で同定されている。タンパク質のAβ領域は膜貫通ドメインに位置し、種間での保存性ははっきりせず、APPの天然状態での生物学的機能との明確な関係もみられない。Aβ生成領域を含むAPPの重要領域の変異は、アルツハイマー病に対する家族性の感受性を引き起こす。例えば、Aβ領域の外側のいくつかの変異は家族性アルツハイマー病と関係しており、Aβの産生が劇的に増加することが判明している。APP遺伝子のA673T変異はアルツハイマー病に対する保護効果がある。この置換はβ-セクレターゼ切断部位に近接しており、in vitroではAβの形成は40%減少する。
Title: アミロイド前駆体タンパク質 (Amyloid-beta precursor protein)
Section: 構造

APPの配列には、大部分が独立してフォールディングを行う、明確な構造ドメインが多数同定されている。細胞外領域は細胞内領域よりもずっと大きく、E1ドメインとE2ドメインに分けられ、両者は酸性ドメイン（AcD）によって連結されている。E1は成長因子様ドメイン（GFLD）と銅結合ドメイン（CuBD）の2つのサブドメインからなり、両者は密接に相互作用している。セリンプロテアーゼ阻害因子ドメインがAcDとE2ドメインの間に存在するが、脳で発現しているアイソフォームには存在しない。APPの完全な結晶構造は解かれていないが、個々のドメインの結晶化には成功しており、GFLD、CuBD、完全なE1ドメインとE2ドメインの構造が得られている。
Title: アミロイド前駆体タンパク質 (Amyloid-beta precursor protein)
Section: 翻訳後のプロセシング

APPは、グリコシル化、リン酸化、シアル酸化、チロシン硫酸化を含む広範囲の翻訳後修飾を受けるとともに、多くのタイプのタンパク質分解によるプロセシングによってペプチド断片が作り出される。一般的に切断はセクレターゼファミリーのプロテアーゼによって行われ、α-セクレターゼとβ-セクレターゼはともに細胞外ドメインをほぼ完全に切除する。その結果、アポトーシスと関係している可能性のある、膜に固定されたC末端フラグメントが生じる。β-セクレターゼによる切断後、γ-セクレターゼによって膜貫通ドメイン内で切断されることでAβフラグメントが形成される。γ-セクレターゼは複数のサブユニットからなる巨大複合体であり、その構成要素は完全には特定されていないものの、アルツハイマー病の主要な遺伝性危険因子として同定されているプレセニリンが含まれている。APPのアミロイド形成性プロセシングは脂質ラフトの存在と関係している。APP分子が膜の脂質ラフト領域に存在するときにはβ-セクレターゼがAPPにアクセスしやすくそのため切断を行いやすくなるが、APPが脂質ラフト外に存在するときには非アミロイド形成性のα-セクレターゼによって切断されやすい。γ-セクレターゼの活性も脂質ラフトと関係している。コレステロールに脂質ラフトを維持する役割があることは、高コレステロールとアポリポプロテインEの遺伝子型がアルツハイマー病の主要な危険因子であるという観察結果の説明となる。
Title: アミロイド前駆体タンパク質 (Amyloid-beta precursor protein)
Section: 生物学的機能

APPの天然状態での生物学的役割はアルツハイマー病研究において関心が高いものの、未解明の部分が多い。
Title: アミロイド前駆体タンパク質 (Amyloid-beta precursor protein)
Section: 生物学的機能
Subsection: シナプス形成と修復

APPの役割として最もよく実証されているのは、シナプスの形成と修復である。APPの発現は神経細胞の分化の過程そして神経損傷後にアップレギュレーションされる。細胞シグナル伝達、長期増強、細胞接着における役割が提唱されているが、それらを支持する研究は限られている。特に、翻訳後のプロセシングの類似性から、Notchシグナリングとの比較が行われている。APPのノックアウトマウスは生存可能であり、一般的な神経消失を伴わない長期増強の障害と記憶消失を含む、比較的軽微な表現型を示す。一方、APPの発現をアップレギュレーションしたトランスジェニックマウスも長期増強の障害を示すことが報告されている。論理的な推論としては、アルツハイマー病ではAβが過剰に蓄積しているため、その前駆体であるAPPも同様に増加していると考えられる。しかしながら、アミロイド斑に近接する神経細胞体のAPPの含有量は少ない。このAPPの欠乏は、切断の増加よりむしろ産生の減少によるものであることがデータからは示唆される。神経細胞におけるAPPの喪失は、認知症に寄与する生理学的な機能欠損に影響を与えている可能性がある。
Title: アミロイド前駆体タンパク質 (Amyloid-beta precursor protein)
Section: 生物学的機能
Subsection: 体細胞組換え

ヒトの脳の神経細胞では、APPをコードする遺伝子で高頻度の体細胞組換えが生じている。孤発性アルツハイマー病患者の神経細胞では、健康な人の神経細胞よりも、体細胞組換えによるAPP遺伝子の多様性が増大している。
Title: アミロイド前駆体タンパク質 (Amyloid-beta precursor protein)
Section: 生物学的機能
Subsection: 順行性軸索輸送

神経細胞の細胞体で合成された分子は、末端のシナプスへ輸送を行う必要がある。この輸送は、速い順行性輸送（fast anterograde transport）によって行われる。APPは積み荷とキネシンとの相互作用を媒介し、この輸送を促進することが示されている。具体的には、細胞質側のC末端側の15アミノ酸の短いペプチド配列がモータータンパク質との相互作用に必要とされる。APPとキネシンの間の相互作用はAPPのペプチド配列特異的であり、ペプチドを付加した蛍光ビーズを用いた輸送実験では、APPの15アミノ酸が付加されたビーズは輸送されたが、代わりにグリシンのみが付加されたビーズや他のペプチドが付加されたビーズは運動性を持たなかった。
Title: アミロイド前駆体タンパク質 (Amyloid-beta precursor protein)
Section: 生物学的機能
Subsection: 鉄排出

マウスでの研究によってアルツハイマー病の異なる面が明らかにされた。APPはセルロプラスミンに似たフェロキシダーゼ活性を持ち、フェロポーチンとの相互作用によって鉄の排出を促進することが判明した。この活性は、アルツハイマー病では蓄積したAβにトラップされた亜鉛によってブロックされるようである。APPのmRNAの5'UTRには鉄応答性エレメント（IRE）が存在し、一塩基多型によって翻訳に異常が生じることが示されている。一方、APPのE2ドメインがフェロキシダーゼ活性を持ち、Fe(II)の排出を促進するという仮説は、E2ドメインに提唱された部位はフェロキシダーゼ活性を持たないことから、不正確である可能性がある。APPはE2ドメイン内でフェロキシダーゼ活性を持たないため、APPによって調節されるフェロポーチンからの鉄の排出機構に対して精査が行われている。あるモデルは、APPは鉄排出タンパク質フェロポーチンの細胞膜中での安定化作用をもち、それによって膜中のフェロポーチンの総数が増加していることを示唆している。鉄輸送体はその後、哺乳類の既知のフェロキシダーゼ（セルロプラスミンやヘファエスチン）によって活性化される。
Title: アミロイド前駆体タンパク質 (Amyloid-beta precursor protein)
Section: 生物学的機能
Subsection: ホルモンによる調節

APPとそれに関係するすべてのセクレターゼが発生初期に発現しており、生殖内分泌に重要な役割を果たしている。セクレターゼによるプロセシングの差によって、ヒト胚性幹細胞（hESC）の増殖や、神経前駆細胞（NPC）への分化が調節されている。妊娠ホルモンであるヒト絨毛性ゴナドトロピン（hCG）はAPPの発現とhESCの増殖を増加させるが、プロゲステロンはAPPのプロセシングを非アミロイド形成性経路へ差し向け、hESCのNPCへの分化を促進する。APPやその切断産物が、分裂期を過ぎたの神経細胞の増殖や分化を促進することはない。むしろ、分裂期を過ぎた神経細胞での野生型または変異型APPの過剰発現は、細胞周期の再進行後にアポトーシスによる細胞死を誘導する。男女ともに更年期における性ホルモン（プロゲステロンを含む）の喪失と黄体形成ホルモン（成人でhCGに相当する）の上昇は、アミロイドβの産生を駆動し、分裂期を過ぎた神経細胞の細胞周期を再進行させると考えられている。
Title: アミロイド前駆体タンパク質 (Amyloid-beta precursor protein)
Section: 相互作用

アミロイド前駆体タンパク質は次に挙げる因子と相互作用することが示されているAPPは、アルツハイマー病を含む多数の脳疾患に関係しているタンパク質であるリーリンとも相互作用する。
Title: CD45 (PTPRC)
Section: abstract

CD45またはPTPRC（英: protein tyrosine phosphatase receptor type C）は、ヒトではPTPRC遺伝子にコードされる酵素である。当初は、白血球共通抗原（leukocyte common antigen、LCA）と呼ばれていた。
Title: CD45 (PTPRC)
Section: 機能

PTPRC遺伝子によってコードされるタンパク質産物はCD45として最もよく知られており、プロテインチロシンホスファターゼ（PTP）ファミリーのメンバーである。PTPは、細胞成長、分化、有糸分裂サイクル、発がん性形質転換を含む、さまざまな細胞過程を調節するシグナル伝達分子である。CD45は細胞外ドメイン、1本膜貫通セグメント、2つのタンデムな細胞内触媒ドメインを含み、受容体型PTPファミリーに属する。CD45はI型膜貫通タンパク質で、赤血球と形質細胞を除く、分化したすべての造血系細胞にさまざまなアイソフォームで存在する。CD45はT細胞受容体やB細胞受容体を介したシグナル伝達に必須の調節因子である。その機能は、細胞外ドメインを介した抗原受容体複合体の構成要素との直接的な相互作用（一種の共刺激）、または細胞内ドメインを介した抗原受容体シグナル伝達に必要なさまざまなSrcファミリーキナーゼの活性化である。また、CD45はJAKキナーゼを抑制し、そのためサイトカイン受容体シグナル伝達の負の調節因子としても機能する。この遺伝子には選択的スプライシングによる転写産物バリアントが多く存在し、それぞれ異なるアイソフォームをコードしていることが報告されている。CD45のさまざまなアイソフォームに対する抗体は、免疫組織化学的な免疫細胞種の区別やリンパ腫や癌腫の組織断片の鑑別のために一般的に利用されている。
Title: CD45 (PTPRC)
Section: アイソフォーム

CD45タンパク質ファミリーは複数のメンバーから構成されるが、全てPTPRC遺伝子の産物である。この遺伝子は34個のエクソンからなり、細胞外ドメインと細胞内ドメインの双方が非常に大きい、巨大なタンパク質を産生する。エクソン4、5、6（タンパク質のA、B、C領域に対応する）は選択的スプライシングを受け、この3つのエクソンの全ての組み合わせによって最大で8種類の異なるタンパク質が産生されうる。CD45の巨大な細胞外ドメインは高度にグリコシル化されており、これらのアイソフォームの側鎖の構造には大きな多様性が存在する。アイソフォーム間の差異はタンパク質のN末端領域に生じる。この領域は細胞から直線的に伸び、O結合型糖鎖が存在している。 CD45のアイソフォームは細胞種と分化段階に特異的な発現を示し、そのパターンは哺乳類できわめてよく保存されている。これらのアイソフォームは、免疫細胞の種類を同定し区別するマーカーとしてよく利用されている。ナイーブT細胞は、通常A領域のみを含むCD45RAを発現している。最も短いアイソフォームでA、B、C領域を全て欠くCD45ROは、活性化されたメモリーT細胞や一部のB細胞、活性化された単球やマクロファージ、顆粒球で発現している。B細胞は3つのエクソンをすべて含むCD45R（CD45RABC）を発現しており、B220とも呼ばれている。B220の発現はB細胞に限らず、一部の樹状細胞などでも発現している。
Title: CD45 (PTPRC)
Section: 相互作用

PTPRC（CD45）は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。GANABLYNLCKSKAP1CD45はHCMVのUL11タンパク質と相互作用することが近年示された。この相互作用はT細胞の機能的麻痺を引き起こす。さらに、CD45はD種アデノウイルス19a型のE3/49Kタンパク質がNK細胞とT細胞の活性化を阻害するための標的であることも示されている。
Title: CD45 (PTPRC)
Section: 臨床的重要性

CD45はすべての白血球に存在するチロシンホスファターゼ活性を持つタンパク質で、造血系のシグナル伝達の調節に関与している。マウスやヒトの非形質転換型造血系細胞ではCD45と脂質ラフトとの共局在は見られないが、急性骨髄性白血病（AML）への発がん性形質転換によってCD45は脂質ラフト内へ位置するようになる。AML細胞でのCD45の脂質ラフトへの共局在は、白血病細胞の増殖に関与するGM-CSFシグナル強度の増加に寄与する。
Title: CD45 (PTPRC)
Section: コンジェニックマーカーとしての利用

マウスには、CD45.1とCD45.2（歴史的にそれぞれLy5.1、Ly5.2とも呼ばれる）という2つの区別可能なアレルが存在する。これらCD45の2つのタイプは機能的には同一であると考えられている。そのため、これらは細胞を区別するためのコンジェニックマーカーとして科学研究で一般的に利用されている。例えば、CD45.1を持つ供与体マウスの白血球をCD45.2を持つ宿主マウスへ移植することで、その後CD45.1の発現によって移植された白血球に由来する細胞を同定することができる。この技術はキメラを作製する際に一般的に利用されている。他のシステムとして、CD90（Thy1）のアレル（CD90.1/CD90.2）もCD45.1/CD45.2と同様に利用されている。
Title: ジヒドロリポイルリシン残基アセチルトランスフェラーゼ (Dihydrolipoyl transacetylase)
Section: abstract

ジヒドロリポイルリシン残基アセチルトランスフェラーゼ（英：Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase、別名：ジヒドロリポイルトランスアセチラーゼ、ジヒドロリポアミドアセチルトランスフェラーゼ、EC:2.3.1.12）は、ピルビン酸デヒドロゲナーゼ複合体（PDC）の中心的な触媒作用を持つ構造で、複合体の中でも重要な役割を担う。ジヒドロリポイルリシン残基アセチルトランスフェラーゼは3つのリポイルドメインと相互作用ドメイン、触媒作用ドメインから構成され、すべてのドメインは複雑に結合している。触媒作用ドメインはまとまって三量体（トリマー）を形成しており、いくつかの生物では8つの三量体が、先端が切り取られた中空の立方体構造を取っている。その活性部位はサブユニットの境界面に位置する。
Title: CCL5 (CCL5)
Section: abstract

CCL5（C-C motif chemokine ligand 5）もしくはRANTES（regulated on activation, normal T cell expressed and secreted）は、ヒトではCCL5遺伝子にコードされるタンパク質である。CCL5遺伝子は1990年にin situハイブリダイゼーションによって発見され、染色体上では17q11.2-q12に位置している遺伝子である。RANTESという名称は最初に記載を行ったTom Schallによって命名されたもので、アルゼンチン映画「南東からきた男」で精神病棟に現れたRantésという名の宇宙人から取ったものである。
Title: CCL5 (CCL5)
Section: 機能

CCL5はケモカインのCCサブファミリーに属し、N末端近傍にシステイン残基が並んでいる。古典的な走化性サイトカイン（ケモカイン）として作用する、68アミノ酸からなる8 kDaのタンパク質である。CCL5は炎症性ケモカインであり、炎症部位に白血球をリクルートする。T細胞、好酸球、好塩基球に対する走化性因子であるが、単球、NK細胞、樹状細胞、マスト細胞も誘引する。また、T細胞から放出される特定のサイトカイン（IL-2とIFN-γ）の助けを借りて、特定のNK細胞の増殖と活性化によってCHAK（CC chemokine-activated killer）細胞の形成を誘導する。CD8+T細胞から放出されるHIV抑制因子でもある。CCL5は主にT細胞と単球に発現しているが、B細胞での発現は示されていない。さらに、上皮細胞、線維芽細胞、血小板でも豊富に発現している。7回膜貫通型Gタンパク質共役受容体（GPCR）ファミリーに属する受容体CCR1、CCR3、CCR4、CCR5に結合するが、最も親和性が高いのはCCR5である。CCR5はT細胞、平滑筋細胞、内皮細胞、上皮細胞、実質細胞やその他の細胞種の表面に発現している。CCL5がCCR5に結合するとPI3Kがリン酸化され、リン酸化されたPI3KはプロテインキナーゼB（Akt/PKB）のSer473をリン酸化する。Akt/PKBはGSK-3をリン酸化し、不活性化する。CCL5/CCR5の結合後には、その他のタンパク質も同様に調節される。Bcl-2は発現が高まり、アポトーシスを誘導する。β-カテニンはリン酸化され、分解される。細胞周期に重要なタンパク質であるサイクリンDはGSK-3の不活性化に伴って阻害される。CCL5はT細胞の活性化の「後期」（3–5日後）に発現している遺伝子の探索から同定された。その後、CCケモカインであることや、ヒトの疾患100種類以上で発現していることが明らかにされた。T細胞でのCCL5の発現はKLF13によって調節されている。CCL5遺伝子はTCRを介したT細胞の活性化から3–5日後に活性化される。このことは、他のケモカインの大部分が細胞刺激の直後に放出されることと異なっている。CCL5は炎症の維持に関与している。また、細胞の炎症部位への遊走に重要なマトリックスメタロプロテアーゼの発現も誘導する。CCL5はNK細胞でも発現している可能性がある。SP1転写因子はCCL5遺伝子の近傍に結合し、恒常的なmRNA転写を媒介している。この転写因子はJNK/MAPK経路によって調節されている。メモリーCD8+T細胞はTCR刺激の直後にCCL5を分泌することができるが、それは細胞質に多数のCCL5 mRNAが存在し、分泌を翻訳のみに依存しているためである。RANTES（CCL5）は関連ケモカインであるMIP-1α、MIP-1βと共に、活性化されたCD8+T細胞やその他の免疫細胞から分泌されるHIV抑制因子として同定されている。RANTESはラクトバシラス属の細菌でのin vivo産生のための改変が行われており、HIVの進入を阻害する、生きた局所的抗ウイルス薬としての開発が行われている。
Title: CCL5 (CCL5)
Section: 相互作用

CCL5はCCR3、CCR5、CCR1と相互作用することが示されている。また、CCL5はGタンパク質共役受容体GPR75を活性化する。CCL5にはその濃度によって2通りの作用機序が存在する。低濃度では、CCL5は単量体もしくは二量体として作用する。CCR5への結合には二量体化は必要ではない。CCL5はnM濃度では古典的ケモカインとして作用し、受容体に結合する。古典的ケモカインとしての作用と二量体化には、分子のN末端領域が重要である。高濃度では、CCL5は細胞表面のグリコサミノグリカンへ結合し、自己凝集体を形成する。この作用には、Glu66とGlu26が重要である。これらの残基はタンパク質の表面に位置し、イオン間相互作用を行う。これらの残基をセリンに置換した分子では、自己凝集は起こらない。In vitroでは、この自己凝集体は白血球の強力な活性化因子となる。分裂促進因子として作用し、その作用は受容体への結合には依存していない。活性化されたT細胞（や単球や好中球などその他の細胞）は増殖もしくはアポトーシスのいずれかを起こし、IL-2、IL-5、IFN-γなどの炎症性サイトカインを放出する。T細胞でのCCL5を介したアポトーシスには、細胞質へのシトクロムcの放出、カスパーゼ-9とカスパーゼ-3の活性化などが伴う。アポトーシスは細胞表面のグリコサミノグリカンへの結合に依存しており、アポトーシスの誘導には少なくとも4分子のCCL5が結合が必要である。
Title: CCL5 (CCL5)
Section: 臨床的意義

CCL5は臓器移植、抗ウイルス免疫、腫瘍形成のほか、ウイルス性肝炎やCOVID-19など多数の疾患と関係している。一例として、腎移植の拒絶反応としてCCL5が上昇する。CCL5の重要性は、微生物がそのケモカイン活性を回避するさまざまな戦略をとっていることから裏付けられる。例えば、ヒトサイトメガロウイルスはウイルス性受容体アナログUS28を発現することで、CCL5を隔離する。CCL5はウイルス特異的に活性化されたCD8+T細胞からパーフォリンやグランザイムAとともに放出される。Fas/FasL相互作用を介して他の細胞を死滅させる細胞傷害性T細胞では、CCL5はHIV特異的な細胞傷害性を高める。さらに、低濃度のCCL5はHIVの複製を阻害する可能性がある。CCL5は（他の2種類のケモカインとともに）CD4＋T細胞表面のCCR5に結合する。CCR5はHIVが細胞へ進入するために利用される受容体である。逆に、高濃度ではCCL5はHIVの複製を高める可能性がある。CCL5は他のウイルスに対する抗ウイルス応答にも関与している。一例として、リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルスに感染したマウスではCCL5が高度に発現していることが示されている。CCL5ノックアウトマウスでは、ウイルス特異的CD8+T細胞の細胞傷害活性の低下、サイトカイン産生の減少、阻害分子の産生の亢進がみられる。このことはウイルスの慢性感染時のCCL5の重要性を強調している。また、乳がん、肝細胞がん、胃がん、前立腺がん、膵臓がんなど、多くのがんでCCL5の上昇が観察される。その他、CCL5はCOVID-19、SARS、アトピー性皮膚炎、気管支喘息、糸球体腎炎、アルコール性肝疾患、急性肝不全、ウイルス性肝炎など、さまざまな疾患で重要な役割を果たしている。
Title: MSH2 (MSH2)
Section: abstract

MSH2（mutS homolog 2）は、ヒトでは2番染色体に位置するMSH2遺伝子にコードされるタンパク質である。MSH2はがん抑制遺伝子であり、より具体的にはDNAミスマッチ修復（MMR）タンパク質MSH2をコードするケアテイカー遺伝子である。MSH2はMSH6とヘテロ二量体を形成し、MutSαミスマッチ修復複合体を形成する。MSH2はMSH3とも二量体化し、MutSβ DNA修復複合体を形成する。MSH2は、転写共役修復、相同組換え、塩基除去修復など、多くの異なる様式のDNA修復機構に関与している。MSH2遺伝子の変異はマイクロサテライト不安定性、そして一部のがん、特に遺伝性非ポリポーシス大腸癌（HNPCC）と関係している。この遺伝子には、疾患の原因となる変異が少なくとも114種類発見されている。
Title: MSH2 (MSH2)
Section: 臨床的意義

遺伝性非ポリポーシス大腸癌（HNPCC）はリンチ症候群とも呼ばれる疾患であり、常染色体優性遺伝、すなわち変異遺伝子を1コピー遺伝することで疾患表現型が引き起こされる疾患である。MSH2遺伝子変異はこの疾患と関係した遺伝的変化の約40%を占め、MLH1遺伝子の変異と共にこの疾患の主要な原因となっている。HNPCCと関係した変異はMSH2の全てのドメインに広く分布しており、MutSαの結晶構造から推定されるこれらの変異の機能は、タンパク質間相互作用、安定性、アロステリック調節、MSH2-MSH6間相互作用、DNA結合への影響など多岐にわたる。MSH2や他のミスマッチ修復遺伝子の変異の結果、DNA損傷は未修復のままとなり、変異頻度の上昇が引き起こされる。こうした変異はDNAが適切に修復されていれば生じることがなかったものであり、生涯にわたって蓄積される。
Title: MSH2 (MSH2)
Section: マイクロサテライト不安定性

MSH2を含むMMR遺伝子が適切に機能しているかどうかは、マイクロサテライト不安定性解析によって追跡することができる。マイクロサテライト不安定性検査は、ミスマッチ修復系が機能していない場合には複製が極めて困難な短い反復配列を解析するバイオマーカー検査である。こうした配列は集団内で多様性がみられるため、その実際のコピー数は問題とならず、ただその患者が保有するコピー数が組織間や経時的に一定であることが重要である。DNA複製複合体がこうした配列でエラーを起こしやすいためにマイクロサテライト不安定性は生じ、ミスマッチ修復遺伝子の機能によって修復を行う必要がある。ミスマッチ修復遺伝子が機能していない場合、こうした配列には経時的に重複や欠失が蓄積し、同じ患者内でコピー数の変化が引き起こされる。HNPCC患者の71%はマイクロサテライト不安定性を示す。マイクロサテライト不安定性を検出する手法にはポリメラーゼ連鎖反応（PCR）や免疫組織化学（IHC）的手法があり、PCRはDNA配列を検査し、IHCはミスマッチ修復タンパク質レベルを検査するものである。現在のところ、IHCまたはPCRによるマイクロサテライト不安定性検査は、費用対効果、感度、特異性が高く、一般的に広く受け入れられている。
Title: MSH2 (MSH2)
Section: ミスマッチ修復における役割

酵母からヒトまでの真核生物ではMSH2はMSH6と二量体化してMutSα複合体を形成し、この複合体は塩基のミスマッチや短い挿入/欠失ループの修復に関与している。MSH6はN末端のディスオーダードメインのために不安定であり、MSH2とのヘテロ二量体化によって安定化される。MSH2は核局在配列を持たないため、MSH2とMSH6は細胞質で二量体化し、その後ともに核へ移行すると考えられている。MutSα二量体においては、MSH6がミスマッチの認識のためにDNAと相互作用し、一方MSH2はMSH6が必要とする安定性をもたらしている。MSH2はMSH6と二量体化せずとも核へ移行することがあり、この場合にはおそらくMSH3と二量体化してMutSβ複合体を形成している。MSH2にはMutSαヘテロ二量体内でMSH6と相互作用する2つのドメインが存在し、1つはDNA相互作用ドメイン、もう1つはATPaseドメインである。MutSα二量体は核内で二本鎖DNAをスキャンし、ミスマッチ塩基を探索する。ミスマッチ塩基が見つかった場合には、変異はATP依存的に修復される。MutSα内でMSH2はATPよりもADPを選択的に結合し、MSH6はその逆である。MutSαはMSH2がADPを結合しているときにのみDNAをスキャンし、一方MSH6にはADPとATPのいずれかが結合していることが研究から示唆されている。その後、MutSαは損傷DNAを修復するためにMLH1と結合する。MutSβは、MSH2とMSH3との複合体である。この二量体はMutSαよりも長い挿入/欠失ループを修復する。DNAの大きな挿入や欠失によってDNA二重らせんには屈曲が生じ、MSH2/MSH3二量体はこのトポロジーを認識して修復を開始する。変異を認識する機構も異なり、MutSβはDNAの二本鎖を分離するが、MutSαは分離しない。
Title: MSH2 (MSH2)
Section: 相互作用

MSH2は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。ATRBRCA1CHEK2EXO1MAXMSH3MSH6p53
Title: MSH2 (MSH2)
Section: がんにおけるMSH2のエピジェネティックな欠乏

DNA損傷はがんの主要な根本原因の1つとなっているようであり、多くの種類のがんの根底にはDNA修復遺伝子の発現の欠乏があるようである。DNA修復が不十分となると、DNA損傷は蓄積する傾向がある。こうした過剰なDNA損傷は、エラーが起こりやすい過程である損傷乗り越え合成（translesion synthesis）やマイクロホモロジー媒介末端結合による変異を増加させる可能性がある。また、DNA損傷の増加はDNA修復のエラーによるエピジェネティックな変化も増加させる可能性がある。こうした変異やエピジェネティックな変化はがんの発生につながる可能性がある。非小細胞肺癌（NSCLC）におけるMSH2遺伝子に関する研究では、MSH2遺伝子の変異は見られない一方、NSCLCの29%ではMSH2の発現のエピジェネティックな減少が見られている。急性リンパ性白血病（ALL）では、MSH2遺伝子に変異は見られない一方で他の4つの遺伝子に変異がみられ、これらはMSH2タンパク質を不安定化する。これらの遺伝子は小児ALL患者の11%、成人患者の16%に欠陥が生じている。また、ALL患者の43%ではMSH2のプロモーターのメチル化が生じており、再発ALLの患者では86%にまで高まる。食道癌、非小細胞肺癌、大腸癌において、MSH2遺伝子のプロモーター領域のメチル化はMSH2タンパク質の発現の欠如と相関している。これらの相関は、MSH2遺伝子のプロモーター領域のメチル化がMSH2タンパク質の発現を低下させていることを示唆している。こうしたプロモーターのメチル化はMSH2が関与する4つのDNA修復経路、すなわちDNAミスマッチ修復、転写共役修復、相同組換え、塩基除去修復を低下させると考えられる。こうした修復の低下は過剰なDNA損傷の蓄積をもたらし、発がんに寄与している可能性が高い。いくつかのがんにおけるMSH2プロモーターのメチル化の頻度を下の表に示す。
Title: TGF-β1 (TGF beta 1)
Section: abstract

TGF-β1（transforming growth factor beta 1）は、TGF-βスーパーファミリーに属するサイトカインの1つであり、細胞成長、細胞増殖、細胞分化、アポトーシスの制御など、多くの細胞機能を発揮する分泌タンパク質である。ヒトでは、TGF-β1はTGFB1遺伝子にコードされる。
Title: TGF-β1 (TGF beta 1)
Section: 機能

TGF-βは、多くの細胞種において増殖、分化やその他の機能を制御する多機能型ペプチド群である。形質転換の誘導においては、TGF-βはTGF-αと相乗的に機能する。また、成長を負に制御する自己分泌型成長因子でもある。TGF-βの活性化やシグナル伝達の調節不全によって、アポトーシスが引き起こされる可能性がある。多くの細胞がTGF-βを合成し、そのほぼ全てで対応する特異的受容体が発現している。TGF-β1、TGF-β2、TGF-β3は全て同じ受容体を介して機能する。TGF-β1は、ヒトの血小板において創傷治癒に関与している可能性のある25 kDaのタンパク質として最初に同定された。その後、大きな前駆体タンパク質（390アミノ酸）がタンパク質切断によって112アミノ酸の成熟ペプチドへとプロセシングされたものであることが明らかにされた。TGF-β1は免疫系の制御に重要な役割を果たしており、細胞の種類やその発生段階によって異なる活性を示すことが示されている。大部分の免疫細胞（白血球）がTGF-β1を分泌していることが知られている。
Title: TGF-β1 (TGF beta 1)
Section: 機能
Subsection: T細胞

一部のT細胞（制御性T細胞など）はTGF-β1を放出して他のT細胞の作用を阻害している。具体的には、TGF-β1は活性化されたT細胞のIL-1とIL-2に依存的な増殖や、静止状態のヘルパーT細胞や細胞傷害性T細胞の活性化を阻害する。同様にTGF-β1は、IFN-γ、TNF-αなど他の多くのサイトカインやさまざまなインターロイキンの分泌と活性を阻害する。また、IL-2受容体などのサイトカイン受容体の発現レベルを低下させ、免疫細胞の活性をダウンレギュレーションする。一方でTGF-β1は、特に未成熟なT細胞に対しては、特定のサイトカインの発現上昇をもたらし、その増殖を促進する場合もある。
Title: TGF-β1 (TGF beta 1)
Section: 機能
Subsection: B細胞

TGF-β1はB細胞にも同様の影響を及ぼし、この作用もまた細胞の分化状態によって異なる。B細胞の増殖を阻害してアポトーシスを刺激し、また未成熟型・成熟型B細胞上への抗体、トランスフェリン、MHCクラスII分子の発現を制御する。
Title: TGF-β1 (TGF beta 1)
Section: 機能
Subsection: 骨髄系細胞

マクロファージや単球へのTGF-β1の作用は、主に抑制的なものである。このサイトカインはこれらの細胞の増殖を阻害し、活性酸素種（スーパーオキシド（O2−）など）や活性窒素種（一酸化窒素（NO）など）の産生を阻害する。また、TGF-β1は骨髄由来の細胞に対して反対の作用を及ぼす場合もある。例えば、TGF-β1は化学誘引物質として作用し、特定の病原体に対する免疫応答を指示する。同様に、マクロファージや単球は低濃度のTGF-β1に対する走化性応答を示す。さらに、単球のサイトカインの発現（IL-1α、IL-1β、TNF-αなど）やマクロファージの食作用はTGF-β1の作用によって増大する。TGF-β1はアストロサイトや樹状細胞のMHCクラスII分子の発現を低下させ、それによってヘルパーT細胞集団の活性化を低下させる。
Title: TGF-β1 (TGF beta 1)
Section: 相互作用

TGF-β1は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。
Title: 血清応答因子 (Serum response factor)
Section: abstract

血清応答因子（けっせいおうとういんし、英: serum response factor、略称: SRF）は、転写因子として機能するタンパク質である。
Title: 血清応答因子 (Serum response factor)
Section: 機能

血清応答因子はMADSボックススーパーファミリーに属する転写因子である。このタンパク質は、標的遺伝子のプロモーター内の血清応答エレメント（serum response element; SRE）に結合する。このタンパク質はc-fosを含む多くの最初期遺伝子の活性を調節しており、それによって細胞周期の調節、アポトーシス、細胞成長、細胞分化に関与している。SRFは多くのシグナル伝達経路の下流の標的となっており、一例としてMAPK経路はTCFファミリー（ternary complex factor）を介してSRFの転写活性を調節する。SRFは胚発生時に重要であり、中胚葉の形成と関連づけられている。完全に発達した哺乳類では、SRFは骨格筋の成長に重要である。SRFとステロイドホルモン受容体などとの相互作用は、ステロイドによる筋成長の調節に寄与している可能性がある。またELK1などのTCFとミオカルディンはSRFをめぐって競合し、それぞれ平滑筋遺伝子の発現を抑制、促進する。