shintaro-ozaki/entity-explanation huggingface dataset:
Title: RBM10 (RBM10)
Section: abstract

RBM10（RNA-binding motif 10）はRBM10遺伝子にコードされたタンパク質。ヒトの遺伝子はX染色体上のXp11.23に位置する。RBM10は選択的スプライシングを調節する因子である。選択的スプライシングは転写後のpre-mRNAに作用して単一遺伝子から複数のタンパク質アイソフォームを生成する遺伝子発現の調節機構であり、細胞に機能的多様性と複雑性を作り出す。RBM10は多数の遺伝子の発現に組み込まれ、細胞増殖やアポトーシスなどさまざまな細胞過程に関与する。RBM10遺伝子の変異は、出生前後に多くが致死となるX連鎖型先天異常のTARP症候群を引き起こし、成人でのさまざまながんなどの疾病に関わる。
Title: RBM10 (RBM10)
Section: 遺伝子とタンパク質

RBM10遺伝子の長さは約41.6 kb、24個のエクソンを含む。メスの細胞ではX染色体不活性化の制御を受け、2つの遺伝子のうちの1つがヘテロクロマチン形成によりその発現（転写）が抑制（サイレンシング）される。RBMタンパク質はRNA結合タンパク質の大きなファミリーを成し、ヒトでは52種類のRBMタンパク質が同定されている。それぞれはRNA認識モチーフ（RNA recognition motif: RRM）と呼ばれるRNA結合ドメインを1つまたは複数含む。RBM10は2つのRRM（RRM1とRRM2）を含み、さらに2つのジンクフィンガー（ZnF）、オクタマーリピート（OCRE）、3つの核局在化シグナル（NLS）、グリシンリッチドメイン（Gパッチ）などのドメインから成る。RBM10のアミノ酸配列は哺乳類間で保存され、ヒトとマウスの配列はアイソフォーム1で96%が同一であり、RBM10の分子機能がヒトと齧歯類で本質的に同じであることが示唆される。RBM10は一次転写産物に起こる選択的スプライシングにより複数のアイソフォームが作り出される。主要アイソフォームの1から4は、エクソン4のアミノ酸配列とエクソン10の最後のコドンのバリン残基の有無で異なる。アイソフォーム1（930残基）はエクソン4の配列とこのバリン残基を含む。アイソフォーム4（929残基）はこのバリンを含まない。アイソフォーム3（853残基）はエクソン4の配列を含まず、アイソフォーム2（852残基）はこのバリン残基をも含まない。アイソフォーム5（995残基）は、アイソフォーム1のN末端に65のアミノ酸残基が付加した形となる。
Title: RBM10 (RBM10)
Section: 機能

RBM10は、ほぼすべての細胞種に、そして増殖中と静止期の双方の細胞に発現が見られ、一般に、転写の活発な細胞でより強く発現する。選択的スプライシングの調節では、RBM10は標的pre-mRNAから成熟mRNAを生成する過程においてカセットエクソンまたは選択的エクソンと呼ばれる特定のエクソンのスキッピング（非取込み）反応に与る。また、低頻度ながら5'スプライス部位の選択やその他の選択的スプライシング反応に与ることがある。エクソンスキッピングの過程では、RBM10はカセットエクソン両端の3'スプライス部位と5'スプライス部位に近接して結合し、これらスプライス部位のそれぞれの対合とスプライシング複合体による認識を妨げてカセットエクソンから離れたスプライス部位の対合を促進する。その結果、カセットエクソンは隣接する上流と下流のイントロンとともにmRNAには取り込まれずに切り出される、と示唆されている。RBM10が標的とするRNAの多様性は、RBM10が酸化的リン酸化などの代謝過程や、細胞増殖、アポトーシス、細胞接着、アクチン/細胞骨格の再構成などに関連したさまざまな経路、そしてがんや神経変性疾患など多様な疾患に関わることを示唆する。こうしたデータやRBM10の普遍的発現は、RBM10は細胞の基本的構成要素でありさまざまな細胞過程に関わることを示している。選択的スプライシングの調節に加え、RBM10は他の反応にも関与する。例えば心臓の抗肥大調節因子pre-mRNAのポリアデニル化反応におけるSTARポリ(A)ポリメラーゼの共調節因子としての作用、あるいはアンジオテンシンII受容体（ATR）mRNAの3' UTRへの結合によるATR mRNAの安定化、let-7g miRNA前駆体への会合によるlet-7g miRNA生合成の調節、p53の負の調節因子であるMDM2との結合によるp53の安定化、細胞周期の停止、そして抗ウイルス反応への関与などが示されている。RBM10は細胞核内で転写とスプライシングが起こる核質とS1-1 nuclear body（S1-1 NB）と呼ばれる膜を持たない核区画に局在する。S1-1 NBは核当たり10個から40個程度、サイズは約0.5 µmであり、細胞種や細胞条件でこれらの数値は変わる。RNAポリメラーゼIIによる転写が低下すると、S1-1 NBは核質のRBM10を隔離して大きくなり、転写の回復でRBM10とS1-1 NBは元の状態に戻る。S1-1 NBは核スペックルと部分的に重なりあうことが多く、これら核区画化領域間にスプライシング反応における密接な機能的関係性のある事を示唆する。
Title: RBM10 (RBM10)
Section: 調節

メスの細胞では、2本のX染色体の1つにおいてその大部分の遺伝子がヘテロクロマチン構造となり、転写は抑制された状態になる。RBM10遺伝子にもこのX染色体の不活性化が起こる。加えて、RBM10にはその細胞内レベルを制御するその他の機構がいくつか存在する。選択的スプライシングによりRBM10はエクソン6または12を除去し、過剰発現時にpre-mRNAレベルを自己調節する。ここではこれらエクソンの除去（スキッピング）に伴い、翻訳終止コドンが転写体内部に導入され、生じた転写産物はNMD（nonsense-mediated mRNA decay）の機構で分解・処理される。また、RNAポリメラーゼIIの転写減少時にはRBM10はS1-1 NBへ隔離される。さらに、RBM10は翻訳後修飾を受ける。さまざまな刺激や細胞環境の変化に応答して多くの部位がリン酸化される（UniProtKB-P98175; PhosphoSitePlus RBM10）。またユビキチン化や、アセチル化、そしてメチル化も起こる。
Title: RBM10 (RBM10)
Section: 臨床的意義

RBM10の変異はヒトのさまざまな疾患に関連する。RBM10の変異が引き起こす表現型は発生段階や組織によって異なる。その典型的な例は多様な発生奇形を特徴とする新生児のTARP症候群や成人の肺腺がんや膀胱がんなどのさまざまながんに見られる。これらの疾患は女性よりも男性に一般的である。細胞内のRBM10遺伝子のコピー数の違い（男性は1つ、女性は2つ）がその理由の1つと考えられる。RBM10の変異は分子全体にわたって生じ、疾病に関わるそれらの多くは分子機能が欠落あるいは減少するヌル変異であることが多い。TARP症候群は一般的に出生前後に致死となるが、11歳、14歳、28歳の患者も報告されている。RBM10の変異は腎臓がん、膵臓がん、大腸がん、甲状腺がん、乳がん、胆管がん、前立腺がん、そして髄膜腫やアストロブラストーマの脳腫瘍などのがんでも同定されている。NUMBは、最もよく研究されたRBM10の下流エフェクターである。RBM10はNUMB転写産物のエクソン9のスキッピングを促進し、生じたNUMBアイソフォームはNotch受容体のユビキチン化とこれに続くプロテアソームによる分解を誘導してNotchシグナリング（細胞増殖経路）を阻害する。さまざまながんにおいて、RBM10の選択的スプライシング調節活性が不活性化したり低下する変異では、NUMBはエクソン9の配列の残ったアイソフォームとなり、その結果Notch経路は阻害されずにがん細胞の増殖が促進する。RBM10は細胞増殖を抑制し、アポトーシスを促進する。したがって、RBM10は一般的にがん抑制因子と考えられる。しかしながら、細胞の構成要素や細胞経路の活性の異なる細胞環境下に、RBM10は発がんプロモーターまたは増殖促進因子として作用する可能性がある。この典型例は膵管腺がん（PDAC）患者に見られる。このがんの一般的な5年生存率は7–8%未満であるが、RBM10に変異を有する患者では、顕著に高い生存率が示されている。
Title: RBM10 (RBM10)
Section: パラログとスプライシングネットワーク

RBM5とRBM6はRBM10のパラログ（ゲノム進化の過程で遺伝子重複によって生じた遺伝子群）である。これらは一般的にがん抑制因子として機能し、変異は肺がんにしばしば同定される。RBM5、RBM6、RBM10はいずれも選択的スプライシングを調節し、一般的に異なるRNAに作用する。しかしながら特定のケースでは、同じRNAに作用し、相乗的または拮抗的な作用をつくり出す。RBM5とRBM10には交差調節（crossーregulation）が働き、RBM10は選択的スプライシングとこれに共役したNMDによってRBM5転写体のレベルを減少させる。さらに、RBM10レベルの変動（ノックダウンや過剰発現）は、RBM5を含む複数のスプライシング調節因子に起こるスプライシングに変化を引き起こし、またRBM10自身を含む他のスプライシング調節因子の発現にも大きく影響する。さらにRBM10の一次転写体は、未同定のスプライシング調節因子によるいくつかの選択的スプライシングを受け、複数のアイソフォームを作り出す。これらのデータは、RBM5、RBM6、RBM10、そしてその他のスプライシング調節因子の間に選択的スプライシング反応のネットワークが作動することを示している。
Title: RRM2B (RRM2B)
Section: abstract

RRM2B (リボヌクレオシド二リン酸レダクターゼ サブユニットM2 B、英：Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B) はヒトのRRM2B 遺伝子がコードしている酵素である。RRM2Bタンパク質をコードしている遺伝子は8番染色体、8q23.1に位置している。この遺伝子および遺伝子産物は別名MTDPS8A、MTDPS8B、p53R2でも知られている。
Title: RRM2B (RRM2B)
Section: 機能

リボヌクレオシド二リン酸レダクターゼはリボヌクレオシド二リン酸を還元してデオキリボヌクレオシド二リン酸に変換することで、DNA複製に必要なヌクレオチド前駆体を産生する酵素であり、RRM2B 遺伝子はこのリボヌクレオチドレダクターゼの2種類あるR2サブユニットの内の片方をコードしている。RRM2B 遺伝子がコードしている方のR2サブユニットはp53によって誘導され、増殖してない細胞における正常なDNA修復とミトコンドリアDNA合成に必須である。R2サブユニットのもう1種類は分裂細胞でのみ発現する。
Title: RRM2B (RRM2B)
Section: 相互作用

RRM2BはMdm2およびATMとタンパク質間相互作用を示す。
Title: RRM2B (RRM2B)
Section: 臨床との関係

この遺伝子の異常はミトコンドリアDNA枯渇症候群 (MDDS)の原因の1つである。この遺伝子の変異は新生児の筋緊張低下、成長の遅れ、脳症と関連しており、てんかんの発作、難聴、乳酸アシドーシスを伴う。この症候群は致死的であり、幼年期早期に呼吸不全を起こして死亡する。この遺伝子はまた小児急性肝不全のいくつかの症例とも関連していた。この遺伝子の変異は進行性の外眼筋麻痺を引き起こすことが示されている。RRM2Bの発現増加は胆管癌細胞においてゲムシタビン耐性とも関連しており、ヒトのがんにおいてゲムシタビンの臨床的利益がえられないかもしれないと予測されている。
Title: β-マンノシダーゼ (Β-Mannosidase)
Section: abstract

β-マンノシダーゼ(Beta-Mannosidase、EC 3.2.1.25)は、β-D-マンノシドの非還元末端からβ-D-マンノースを切り出す酵素である。系統名は、β-D-マンノシド マンノヒドロラーゼ(beta-D-mannoside mannohydrolase)。である。マンナナーゼ(mannanase)、マンナーゼ(mannase)等とも言う。ヒトでは、MANBA遺伝子がコードする。この遺伝子は、GHファミリー2の酵素をコードする。コードされた蛋白質はリソソームに局在し、ここで、N-結合オリゴ糖の異化経路の最後のエキソグリコシダーゼとして働く。この遺伝子の変異は、幅広い神経障害を引き起こすリソソーム蓄積症であるβ-マンノシドーソスを引き起こす。
Title: インボルクリン (Involucrin)
Section: abstract

インボルクリン（英: involucrin）は、ヒトの皮膚のタンパク質構成要素であり、IVL遺伝子にコードされる。ロリクリンと結合し、角質細胞を保護するコーニファイドエンベロープ（cornified envelope）の形成に寄与する。
Title: インボルクリン (Involucrin)
Section: 遺伝子

IVL遺伝子は、カルパクチンI軽鎖、トリコヒアリン、プロフィラグリン、ロリクリン、カルサイクリンをコードする遺伝子とともに、1q21領域にマッピングされている。
Title: インボルクリン (Involucrin)
Section: 機能

インボルクリンは表皮のケラチノサイトや他の重層扁平上皮に存在し、トランスグルタミナーゼの基質となる、きわめて反応性が高い可溶性のタンパク質である。まず細胞質基質で合成されるが、トランスグルタミナーゼによって膜タンパク質と架橋され、細胞膜の下で不溶性のエンベロープの形成を補助する。このようにコーニファイドエンベロープの組み立て過程において、グルタミン残基の供与体として機能する。
Title: インボルクリン (Involucrin)
Section: 臨床的意義

インボルクリンはコーニファイドエンベロープの前駆体タンパク質の1つであるため、乾癬などの炎症性皮膚疾患において顕著に増加している。葉状魚鱗癬は、インボルクリンの発現低下を伴う。レチノイド治療による臨床的改善はインボルクリンの発現上昇を伴うため、この発現低下が疾患でみられる落屑過程の変化に寄与している可能性がある。アピゲニンと呼ばれる植物由来のフラボノイドは皮膚がんの化学的予防薬として有望視されているが、インボルクリンを抑制することにより正常なケラチノサイトの分化を調節していることが示されている。この効果は、アポトーシスを伴わない細胞増殖の低下と関連している。
Title: インボルクリン (Involucrin)
Section: 構造

インボルクリンは、約75アミノ酸の保存されたN末端領域と、そしてグルタミンに富むタンデムリピートを含む、長さがきわめて多様な2つの断片がそれに続く構成をしている。タンデムリピート内のグルタミン残基はトランスグルタミナーゼによる架橋反応の基質となる。タンパク質の全長は、285アミノ酸（イヌ）から835アミノ酸（オランウータン）まで多様である。
Title: TOP1 (TOP1)
Section: abstract

TOP1またはDNAトポイソメラーゼI（英: DNA topoisomerase I）は、ヒトではTOP1遺伝子にコードされる酵素である。DNAトポイソメラーゼであり、DNA一本鎖の一過的な切断と再結合を触媒する。
Title: TOP1 (TOP1)
Section: 機能

TOP1遺伝子は、転写時のDNAのトポロジーを制御し変化させる酵素である、DNAトポイソメラーゼをコードする。この酵素はDNA一本鎖の一過的な切断と再結合を触媒し、切断鎖を非切断鎖の周りに回転させ、それによってDNAのトポロジーを変化させる。この遺伝子は20番染色体に位置し、1番染色体と22番染色体に偽遺伝子が存在する。
Title: TOP1 (TOP1)
Section: 機構

TOP1を含むIB型トポイソメラーゼは、活性部位のチロシンが切断鎖の3'リン酸末端に結合した共有結合中間体を形成する。真核生物のI型トポイソメラーゼは、-4位から-1位の配列が5'-(A/T)(G/C)(A/T)T-3'となる地点を好んでDNAにニックを入れる。酵素は-1位のT残基と共有結合的に結合するが、-1位はC残基であることもある。ヒトのTOP1タンパク質は4つの領域に分割される。N末端の214アミノ酸はin vitroでのスーパーコイル構造の緩和活性には不要であり、4つの核局在化シグナルと他のタンパク質との相互作用部位が存在する。N末端ドメインに続いて高度に保存された421アミノ酸からなるコアドメインが存在し、活性部位のチロシン残基を除くすべての触媒残基はこの領域に含まれている。これに続いて77アミノ酸からなる保存性の低いリンカードメインが存在する。53アミノ酸からなるC末端ドメインには活性部位となるTyr723が存在する。TOP1は、活性部位のチロシンをDNAのホスホジエステル骨格を攻撃する求核剤として用いるエステル交換反応によって、DNAを切断する。TOP1は切断鎖の3'末端に共有結合的に結合した後、DNAを非切断鎖の周りに回転させることによってDNAのスーパーコイル構造を緩和する。その後、切断鎖の5'ヒドロキシル末端はリン酸-チロシン結合を切断し、TOP1の遊離とDNAの再ライゲーションを行う。ニックを形成して閉じる反応は速く、1秒間に約100サイクルの反応が行われる。
Title: TOP1 (TOP1)
Section: 阻害

切断された一本鎖DNAの3'末端に対しTOP1が一過的に共有結合的に結合した構造は、TOP1-DNA cleavage complex（TOP1cc）と呼ばれる。TOP1ccはTOP1阻害剤の特異的標的である。TOP1を標的とすることが最初に示された阻害剤の1つが、イリノテカンである。イリノテカンは、細胞毒性を持つ天然アルカロイドであるカンプトテシンのアナログである。カンプトテシンはカンレンボクCamptotheca acuminataから得られる。イリノテカンはその代謝産物であるSN-38を介して特に有効性を示す。イリノテカンとSN-38はTOP1ccの一部、+1位のDNA配列がグアニンである複合体を捕捉することで作用する。イリノテカンまたはSN-38は、トポイソメラーゼによって誘導された切断部位に隣接する塩基対に対してスタッキングし、TOP1酵素を不活性化する。
Title: TOP1 (TOP1)
Section: がん

TOP1は1985年からヒトのがんの治療標的として知られている。カンプトテシンのアナログであるイリノテカンやトポテカンはTOP1を阻害し、FDAに承認され、臨床現場で用いられている抗がん化学療法剤の中で最も効果が高い。TOP1はKRAS変異非小細胞肺がんで高発現しており、また生存と相関していることから、TOP1阻害剤はKRAS変異腫瘍の患者に対して投与することでより高い効果が得られることが示唆される。
Title: TOP1 (TOP1)
Section: がん
Subsection: 合成致死性

合成致死性とは、2つまたはそれ以上の遺伝子の発現の欠乏が組み合わさることで細胞死が引き起こされるが、これらの遺伝子のうちの1つだけが欠けた場合には引き起こされない、という現象である。欠乏は変異、エピジェネティックな変化、または遺伝子発現の阻害によって生じる。イリノテカンによるTOP1の不活性化は、一部の特定のDNA修復遺伝子の発現の欠乏との組み合わせによって合成致死となるようである。イリノテカンによるTOP1の不活性化は、結腸がん患者において、DNA修復遺伝子WRNの発現の欠乏とともに合成致死となる。2006年の研究では、WRN遺伝子のプロモーターが高メチル化（WRNの発現がサイレンシング）された45人の大腸がん患者と、メチル化されておらずWRNの発現が高い43人の患者の比較が行われ、イリノテカンは非メチル化群（20.7ヶ月生存）よりも高メチル化群（39.4ヶ月生存）に対してより強い効果を示した。WRN遺伝子プロモーターの高メチル化は大腸がんの約38%でみられる。イリノテカンによるTOP1の不活性化は、DNA修復遺伝子MRE11の発現の欠乏と合成致死となる可能性がある。ステージIII結腸がんの1264人の患者に対して行われた近年の研究では、術後の補助療法として5-フルオロウラシル/ロイコボリン（FU/LV）の毎週ボーラス投与またはイリノテカン+FU/LVの投与が行われ、8年間の追跡が行われた。腫瘍の11%では、MRE11遺伝子のDNA配列中の一連のチミジン配列の欠失のためにDNA修復酵素MRE11が欠乏していた。治療プロトコルのFU/LVにイリノテカンを加えることで、MRE11欠乏患者では野生型MRE11患者よりも（効果は小さいものの）良い長期無病生存率がみられ、イリノテカンによるTOP1の不活性化とMRE11の欠乏との間にはある程度の合成致死性が存在することが示唆されている。多数の臨床前段階の研究により、がんで一般的な他の遺伝的またはエピジェネティックなDNA修復の欠乏とイリノテカンとの合成致死性も示唆されている。例えば、DNA修復遺伝子ATMは多くのがんで高頻度で高メチル化（サイレンシング）されている。2016年の研究では、胃がん細胞（in vitro）またはマウスモデルでのATMの発現低下は、ATMが高発現している細胞と比較して、イリノテカンによる不活性化に対する感受性の増大を引き起こすことが示されている。このことは、ATMの欠乏とイリノテカンを介したTOP1の欠乏との合成致死性を示唆している。NDRG1遺伝子の発現の欠乏との合成致死性を示す化合物を探索するスクリーニング研究では、3360の化合物のスクリーニングから、イリノテカンを介したTOP1の欠乏（もう1つの化合物は臭化セトリモニウム）が前立腺がん細胞でのNDRG1の欠乏との合成致死性を示すことが明らかにされた。NDRG1は前立腺がんにおける転移抑制遺伝子であり、DNA修復に関与しているようである。
Title: TOP1 (TOP1)
Section: DNA修復

ヒトHeLa細胞に対するUVB照射は、トポイソメラーゼIとDNAとの間の共有結合型複合体の形成を特異的に促進する。トポイソメラーゼIは、UVB照射や他の要因によるDNA損傷を除去する過程である、ヌクレオチド除去修復に直接的に関与しているようである。
Title: TOP1 (TOP1)
Section: 相互作用

TOP1は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。
Title: エナメリン (Enamelin)
Section: abstract

エナメリンは歯のエナメル質に見られるタンパク質の一種。エナメル質のうち、タンパク質は5%未満であるが、そのうち2%がエナメリンである。エナメルタンパクの一種であり、ameloproteases-Iとして知られる。その機能はまだ完全には理解されていないが、歯の発生時にアメロゲニンを破壊すると信じられている。他のエナメルタンパクとしては、アメロゲニン、アメロブラスチン、tuftelins等がある。
Title: CDKN2C (CDKN2C)
Section: abstract

CDKN2C（cyclin dependent kinase inhibitor 2C）は、ヒトではCDKN2C遺伝子によってコードされるタンパク質である。p18INK4cの名称でも知られる。
Title: CDKN2C (CDKN2C)
Section: 機能

CDKN2C遺伝子にコードされるタンパク質は、サイクリン依存性キナーゼ阻害因子のINK4ファミリーのメンバーである。このタンパク質はCDK4またはCDK6と相互作用してCDKの活性化を妨げることで、細胞周期のG1期の進行を制御する細胞成長調節因子として機能する。この遺伝子の異所性発現は、野生型のRB1の機能の存在と相関するような形で、ヒト細胞の成長を抑制することが示されている。ノックアウトマウスを用いた研究からは、この遺伝子は精子形成を調節する役割とともに、腫瘍形成を抑制する役割が示唆されている。この遺伝子には選択的スプライシングによる2種類の転写産物が存在するが、同一のタンパク質をコードしている。
Title: CDKN2C (CDKN2C)
Section: 相互作用

CDKN2CはCDK4、CDK6と相互作用することが示されている。
Title: GMPシンターゼ (GMP synthase)
Section: abstract

GMPシンターゼ(GMP synthase, GMPS)はGMPの合成に関わる酵素である。以下の2つの化学反応を触媒する。L-グルタミン + H2O                     ⇌              {\displaystyle \rightleftharpoons }   L-グルタミン酸 + NH3ATP + XMP + NH3                     ⇌              {\displaystyle \rightleftharpoons }   AMP + 二リン酸 + GMP
Title: HLA-E (HLA-E)
Section: abstract

HLA-E（HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E）は、ヒトではHLA-E遺伝子にコードされるタンパク質である。ヒトのHLA-Eは、多型が限られており、古典的MHCクラスI分子と比較して細胞表面での発現が低いという特徴を持つ非古典的MHCクラスI分子である。マウスの機能的ホモログはQa-1b（公式にはH2-T23）と呼ばれる。
Title: HLA-E (HLA-E)
Section: 構造

他のMHCクラスI分子と同様、HLA-Eは重鎖（α鎖）と軽鎖（β2-ミクログロブリン）からなるヘテロ二量体である。重鎖は約45 kDaで、膜に固定されている。HLA-E遺伝子は8つのエクソンから構成され、エクソン1がシグナルペプチド、エクソン2と3がペプチドを結合するα1、α2ドメイン、エクソン4がα3ドメイン、エクソン5が膜貫通領域、エクソン6と7が細胞質テールをコードする。
Title: HLA-E (HLA-E)
Section: 機能

HLA-Eは、NK細胞による認識において特別な役割を果たす。HLA-EはMHCクラスI分子（HLA-A、B、C、G）のシグナルペプチドに由来する、限られたセットのペプチドを結合する。これらのペプチドはシグナルペプチドペプチダーゼによって小胞体膜から放出され、細胞質基質のプロテアソームによってトリミングされる。抗原処理関連トランスポーター（TAP）によって小胞体内腔へ輸送され、これらのペプチドはHLA-E分子の溝に結合する。その結果HLA-Eは正しく組み立てられ、細胞表面に発現する。NK細胞は、ヘテロ二量体型受容体CD94-NKG2A/B/Cを用いてHLA-Eとペプチドの複合体を認識する。CD94/NKG2AもしくはCD94/NKG2BがHLA-Eに結合した場合には、NK細胞の細胞傷害活性に対する阻害効果が生じ、細胞溶解が防がれる。一方、CD94/NKG2CがHLA-Eに結合した場合には、NK細胞の活性化が引き起こされる。この相互作用は抗ウイルス応答において一部のNK細胞集団の増殖を開始することが示されており、CD94/NKG2Cを発現しているadaptive NK cellはヒトサイトメガロウイルス由来のペプチド抗原を特異的に認識する。
Title: CENP-F (CENPF)
Section: abstract

CENP-F（centromere protein F）は、ヒトではCENPF遺伝子にコードされるタンパク質である。細胞分裂時の染色体分離のほか、繊毛形成のための微小管配向にも関与している。
Title: CENP-F (CENPF)
Section: 機能

CENP-Fは、細胞周期のG2期（有糸分裂に備えて迅速にタンパク質合成を行う段階）には核マトリックスの一部を構成している。G2期の終盤には、CENP-Fはキネトコアの一部を形成する。キネトコアは円盤型のタンパク質複合体であり、姉妹染色分体のセントロメアを微小管へ接着し、紡錘体を形成する。細胞分裂の過程で、姉妹染色分体は微小管によって引き離される。有糸分裂後期（染色分体が分離される段階）の序盤まで、CENP-Fはキネトコアの一部となっている。後期の終盤にはCENP-Fは紡錘体の中央帯（midzone）に局在し、終期（細胞分裂段階）には細胞間橋（intercellular bridge）に局在する。その後は分解されると考えられている。CENPF遺伝子の変異は発生初期段階で細胞分裂の異常をもたらす。この遺伝子が変異している場合、有糸分裂はより長時間かかることが知られている。微小管は細胞骨格の一部を構成するタンパク質構造であり、細胞が多様で複雑な形状と遊走能を持つために必要である。微小管は中心体から形成され、中心体には互いに直交した一対の円筒形の中心小体が含まれている。細胞分裂前には、CENP-Fは中心小体の1つ（母中心小体）の末端に局在し、繊毛と呼ばれる細い細胞突起を形成するよう微小管を適切に配向させる役割を果たしている。繊毛の大部分は一次繊毛（primary cilia）であり、遊走、分裂や分化を開始するための細胞シグナル伝達に関与している。CENPF遺伝子の変異はこの繊毛形成能力を破壊し、繊毛は少なくそして短くなることが知られている。
Title: CENP-F (CENPF)
Section: 臨床的意義

CENPF遺伝子の両コピーが変異した場合、Strømme症候群の原因となる。この疾患は、小頭症、眼球異常、apple-peel型空腸閉鎖によって特徴づけられる。がんや移植片対宿主病の患者では、CENP-Fに対する自己抗体がみられる。
Title: RNF8 (RNF8)
Section: abstract

RNF8（ring finger protein 8）は、ヒトではRNF8遺伝子にコードされる酵素である。RNF8は免疫系の機能とDNA修復の双方に活性を有する。
Title: RNF8 (RNF8)
Section: 機能

RNF8タンパク質はRINGフィンガーモチーフとFHAドメインを持つ。このタンパク質は、UBE2E1/UBCH6、UBE2E2、UBE2E3などいくつかのクラスIIユビキチン結合酵素（E2）と相互作用することが示されており、特定の核内タンパク質をユビキチン化するユビキチンリガーゼ（E3）として作用する可能性がある。RNF8遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする選択的スプライシングによる転写産物が報告されている。RNF8は、相同組換え修復（HRR）、非相同末端結合（NHEJ）、ヌクレオチド除去修復（NER）の3つのDNA修復経路によるDNA損傷の修復を促進する。DNA損傷はがんの主要因であると考えられており、DNA修復の欠如はがんにつながる変異を引き起こす場合がある。マウスでは、RNF8の欠乏はがんの素因となる。
Title: RNF8 (RNF8)
Section: クロマチンリモデリング

DNAに二本鎖切断が生じた後、HRRまたはNHEJによるDNA修復を行うためにはクロマチン構造の緩和が必要である。クロマチン構造の緩和には2つの経路があり、1つはPARP1によって、もう1つはγH2AX（H2AXのリン酸化型）によって開始される（クロマチンリモデリングを参照）。γH2AXによって開始されるクロマチンリモデリングはRNF8に依存している。ヒストンバリアントH2AXはヒトのクロマチン中のH2Aヒストンの約10%を占める。DNA二本鎖切断部位では、γH2AXを持つクロマチンが約200万塩基対にわたって広がる。γH2AXはそれ自身がクロマチンの脱凝縮を引き起こすわけではないが、放射線照射によるDNA損傷後1秒以内にはMDC1タンパク質がγH2AXに特異的に結合する。この結合は、MDC1に結合しているRNF8やDNA修復タンパク質NBS1の蓄積も同時に引き起こす。RNF8は、ヌクレオソームのリモデリングと脱アセチル化を担う複合体NuRDの構成要素であるCHD4タンパク質との相互作用によって、広範囲のクロマチンの脱凝縮を媒介する。
Title: RNF8 (RNF8)
Section: 相同組換え修復

DNA末端の削り込み（DNA end resection）はHRRの重要な過程であり、HRRに関与するタンパク質をリクルートするためのプラットフォームとなる3'オーバーハングが形成される。MRE11、RAD50、NBS1からなるMRN複合体は、この過程の初期段階を実行する。RNF8はNBS1をユビキチン化し（この反応はDNA損傷前にも損傷後にも行われる）、このユビキチン化は効率的なHRRに必要である。一方RNF8によるNBS1のユビキチン化は、エラーが起こりやすい他のDNA修復過程であるマイクロホモロジー媒介末端結合過程には必要ではない。RNF8はHRRにおいて他の役割も持つようである。RNF8はユビキチンリガーゼとしてγH2AXをモノユビキチン化し、DNA修復分子をDNA損傷部位に固定する。特に、RNF8の活性はHRRのためのBRCA1のリクルートに必要である。
Title: RNF8 (RNF8)
Section: 非相同末端結合

Kuタンパク質はKu70とKu80からなるヘテロ二量体型タンパク質複合体であり、リング構造を形成する。NHEJによる二本鎖切断修復の初期段階では、破壊されたDNAの各末端へKuタンパク質のリング構造が滑って移動し、各末端に結合した2つのKuタンパク質は互いに結合してブリッジを形成する。これによってDNAの末端は保護され、さらにDNA修復酵素が作用するためのプラットフォームが形成される。末端が再結合された後も2つのKuタンパク質は完全な形となったDNAを取り囲んでおり、末端から滑り落ちることはない。このままKuタンパク質が除去されなければ、細胞の生存は損なわれる。Kuタンパク質の除去は、RNF8によってKu80がユビキチン化されてKuタンパク質のリング構造から解離するか、もしくはNEDD8によるKuタンパク質のユビキチン化によってDNAから解離するかのいずれかの方法で行われる。
Title: RNF8 (RNF8)
Section: ヌクレオチド除去修復

UV照射によるピリミジン二量体の形成は、修復されない場合には細胞死をもたらす。こうした損傷の大部分は、NERによって修復される。UV照射後、RNF8はDNA損傷部位にリクルートされ、クロマチン中のヒストンH2Aをユビキチン化する。こうした応答は、UV照射に対する防御機構の一部となっている。
Title: RNF8 (RNF8)
Section: 精子形成の異常

精子形成過程では、有糸分裂と減数分裂によって精原幹細胞から精子が形成される。RNF8はDNA二本鎖切断の存在時のシグナル伝達に必要不可欠な役割を果たす。RNF8をコードする遺伝子をノックアウトしたオスのマウスでは精子形成の異常がみられ、その原因は相同組換え修復の欠陥であるようである。
Title: RNF8 (RNF8)
Section: 相互作用

RNF8はレチノイドX受容体αと相互作用することが示されている。
Title: ミクロソームトリグリセリド輸送タンパク質 (Microsomal triglyceride transfer protein)
Section: abstract

ミクロソームトリグリセリド輸送タンパク質大サブユニット（ミクロソームトリグリセリドゆそうタンパクしつだいサブユニット、英: microsomal triglyceride transfer protein large subunit、略称: MTP、MTTP）は、ヒトにおいてMTTP遺伝子にコードされるタンパク質である。MTPは、ヘテロ二量体ミクロソームトリグリセリド輸送タンパク質の大サブユニットをコードしている。タンパク質ジスルフィドイソメラーゼ (PDI) によって完成されたヘテロ二量体ミクロソームトリグリセリド輸送タンパク質は、リポタンパク質の会合において中心的な役割を果たしていることが示されている。MTPの変異は無βリポタンパク質血症を引き起こす。カイロミクロン上のアポタンパク質B48およびLDL、IDL、VLDL上のアポタンパク質B100はMTPの結合において重要である。
Title: ミクロソームトリグリセリド輸送タンパク質 (Microsomal triglyceride transfer protein)
Section: 相互作用経路マップ

以下の遺伝子、タンパク質、代謝はそれぞれの記事をリンクされている
Title: ミクロソームトリグリセリド輸送タンパク質 (Microsomal triglyceride transfer protein)
Section: 薬理学

MTPを阻害する薬剤は、アポB含有リポタンパク質の会合を妨げ、ゆえにカイロミクロンおよびVLDLの合成を阻害し、LDL-Cの血漿中濃度を低下させる。ロミタピド (Juxtapid) はホモ接合性家族性高コレステロール血症の補助療法として米国FDAに承認された。ジルロタピド (Slentrol) およびミトラタピド (Yarvitan) は、イヌの肥満を制御するための獣医用医薬品である。
Title: ミエロブラスチン (Proteinase 3)
Section: abstract

ミエロブラスチン(Myeloblastin、EC 3.4.21.76)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。エラスチンなどのタンパク質を-Ala- > -Val-の特異性で加水分解する。この酵素は、多形核の白血球に存在する。
Title: ULK1 (ULK1)
Section: abstract

ULK1（unc-51 like autophagy activating kinase 1）は、ヒトではULK1遺伝子によってコードされる酵素である。オートファジーに関与するキナーゼであり、特にアミノ酸の除去に対して応答する。ヒトにはULK1とともにULK2と呼ばれるホモログが存在する。両者の比較研究は多くは行われていないが、いくつかの差異が存在することが記載されている。
Title: ULK1 (ULK1)
Section: 機能

ULK1/2は哺乳類細胞におけるオートファジーに重要なタンパク質であり、酵母のAtg1と相同である。オートファゴソーム生合成の初期段階に必要な、ULK1複合体の一部を構成する。ULK1複合体には、他にFIP200（RB1CC）、HORMA（Hop/Rev7/Mad2）ドメイン含有タンパク質ATG13とATG101も含まれる。ULK1はオートファジーに最も必要不可欠であり、栄養素枯渇条件下においていくつかの上流シグナルによって活性化され、オートファジーの開始をもたらす。ULK1には下流のリン酸化標的が多く存在し、膜の単離やオートファゴソームの誘導を補助する。活性化されたULK1はベクリン1のセリン14番を直接リン酸化してオートファージ促進性クラスIII PI3キナーゼであるVPS34複合体を活性化し、オートファジーの誘導と成熟を促進する、というモデルが提唱されている。ULK1/2は、同化型の環境シグナル下で活性化されるmTORC1の活性によって負に調節される。対照的に、ULK1/2は飢餓シグナル下でAMPKの活性によって活性化される。
Title: ULK1 (ULK1)
Section: 相互作用

mTORC1は、活性化時にはULK1とATG13の双方をリン酸化し、ULK1のキナーゼ活性を低下させることによりオートファジーを阻害する。飢餓条件下ではmTORC1は阻害されてULK1から解離するため、ULK1の活性化が可能となる。AMPKは、飢餓条件下で生じる細胞内のAMP濃度の上昇によって活性化され、ｍTORC1を不活性化し、そして直接ULK1を活性化する。AMPKはULK1のキナーゼドメインとC末端ドメインの間のリンカー領域の複数の部位を直接リン酸化する。タンパク質毒性ストレス下では、ULK1はアダプタータンパク質p62をリン酸化し、p62のユビキチン結合親和性を増加させることが示されている。ULK1はRaptor、ベクリン1、クラスIII PI3キナーゼ、GABARAP、GABARAPL2、SYNGAP1、SDCBPと相互作用することが示されている。
Title: ULK1 (ULK1)
Section: 構造

ULK1は112 kDaのタンパク質である。ULK1はN末端にキナーゼドメイン、C末端にEAT（early autophagy targeting/tethering）ドメインが存在する。ドメイン間領域には、ULK1活性のそれぞれ負と正の調節因子である、mTORC1とAMPKによるリン酸化部位が位置する。EATドメインには3ヘリックスバンドルからなるMIT（microtubule-interacting and transport）ドメインが2つ並んでおり、ATG13と結合するほか、膜との相互作用も媒介している可能性がある。N末端のセリン/スレオニンキナーゼドメインには、正に帯電した大きな活性化ループが存在する。このループは高度に類似したULK1とULK2の間で最も保存性が低い領域であり、ULK1特異的な役割に寄与していることが示唆される。
Title: ULK1 (ULK1)
Section: 翻訳後修飾

ULK1はAMPKによってセリン317番とセリン777番がリン酸化され、オートファジーが活性化される。一方、mTORはセリン757番に対して阻害的なリン酸化を行う。さらに、ULK1はスレオニン180番に対して自己リン酸化を行い、自身の活性化を促進する。ウイルスはULK1を標的として、宿主のオートファジーを妨げているようである。コクサッキーウイルスB3型のプロテアーゼ3CはULK1をグルタミン524番の後で切断し、N末端のキナーゼドメインとC末端のEATドメインを分離する。
Title: ULK1 (ULK1)
Section: 関連する疾患

ULK1のオートファジーにおける役割からは、がん、神経変性疾患、神経発達障害、クローン病など多くの疾患がオートファジーの調節不全に起因している可能性が示唆される。オートファジーは細胞生存形質として作用するため、形成された腫瘍はエネルギーの枯渇や化学療法などの他のストレス下でも生存することが可能となる。そのため、オートファジーの阻害はがん治療に有益である可能性があり、ULK1を標的とした阻害剤が試みられている。
Title: NEDD4L (NEDD4L)
Section: abstract

NEDD4L（Neural precursor cell expressed developmentally downregulated gene 4-like）またはNEDD4-2は、NEDD4ファミリーに属する酵素（ユビキチンリガーゼ）である。ヒトではNEDD4L遺伝子にコードされる。マウスでは、NEDD4-2、Nedd4-2遺伝子として一般的に知られている。NEDD4-2は、腎臓の集合管において上皮性ナトリウムチャネル（ENaC）をユビキチン化してダウンレギュレーションし、アルドステロンの作用に拮抗して塩類の排出を増加させることが示されている。リドル症候群ではNEDD4LはENaCに結合することができず、塩類の貯留と高血圧が引き起こされる。NEDD4Lは、E3HECTドメインユビキチンリガーゼのNEDDファミリーに属する。NEDD4Lは、このファミリーのプロトタイプであるNEDD4に最も近縁なホモログであり、おそらく遺伝子重複の結果生じたものである。NEDD4のオルソログはすべての真核生物に存在する一方、NEDD4Lタンパク質は脊椎動物に限られている。NEDD4Lタンパク質は、多くの膜タンパク質のユビキチン化とエンドサイトーシスを介した調節に関与していることが知られている。NEDD4Lタンパク質は広く発現している。NEDD4-2の主要な標的にはENaC、Na+/Cl-共輸送体（NCC）、電位依存性ナトリウムチャネル（Nav）が含まれるが、他の標的はin vitroでの研究から予測されたものである。マウスのNedd4-2遺伝子は生存に必須であり、ヒトではNEDD4Lの多型は高血圧と関係している。
Title: NEDD4L (NEDD4L)
Section: タンパク質構造

NEDD4Lタンパク質は、N末端のC2ドメイン（Ca2+-リン脂質結合ドメイン）、4つのWWドメイン（タンパク質-タンパク質相互作用ドメイン）、C末端のHECTドメイン（ユビキチンリガーゼドメイン）から構成される。WWドメインが基質、調節タンパク質、アダプタータンパク質との結合を担う。これらのドメインは一般的に標的タンパク質のPPxY（またはそれに類似した）モチーフを認識する。
Title: NEDD4L (NEDD4L)
Section: 発現

ヒトのNEDD4L遺伝子は染色体上18q12.31に位置し、38個のエクソンからなり、複数のスプライスバリアントが転写される。脳、肺、腎臓で発現するタンパク質はC2ドメインを含んでいる。NEDD4Lには3つの主要なアイソフォームが存在する。アイソフォームIはエクソン1の開始コドンから始まる新奇C2ドメインを含む。アイソフォームIIは保存された完全なC2ドメインを含み、アイソフォーム1の開始コドンよりも上流の代替的開始コドンから始まる。アイソフォームIIIはエクソン2a-3のスプライシングのためC2ドメインを含まない。アイソフォームIは腎臓と副腎で多く発現している一方、アイソフォームIIは肺で支配的ある。NEDD4-2特異的抗体はほとんどの組織で110-115 kDaの2種類を認識するが、そのうちの1つは組織によって大きさが異なる。
Title: NEDD4L (NEDD4L)
Section: 機能

NEDD4LはE3ユビキチンリガーゼであり、ユビキチン結合酵素からチオエステルの形でユビキチンを受け取り、その後特異的基質へと転移する。In vivoでは、NEDD4-2は肺と腎臓でENaCを、腎臓でNCCといくつかのNavを調節する。また、EGFR、TGFβ受容体、そしてWntシグナル経路を調節することが示されている。NEDD4Lは、ウイルスタンパク質のユビキチン化を介してウイルスの出芽や潜伏過程へ関与することが示唆されている。In vitroのデータではNEDD4-2はいくつかのイオンチャネルや輸送体など他の多くのタンパク質に調節に関与することが示唆されているが、これらの結果のほとんどはin vivoでの検証は行われていない。
Title: NEDD4L (NEDD4L)
Section: 調節

NDFIP1、NDFIP2タンパク質はNEDD4-2に結合し、その活性および/または基質との相互作用を調節する。キナーゼSGK1とAKTによる、インスリンとアルドステロンシグナルに応答したNEDD4-2のリン酸化は14-3-3タンパク質との結合をもたらす。NEDD4-2への14-3-3の結合は、基質（ENaCのサブユニットなど）に結合してユビキチン化を行う活性を阻害する。NEDD4-2の自己ユビキチン化とUSP2-45による脱ユビキチン化によってNEDD4-2タンパク質の安定性が調節されていることが知られている。
Title: NEDD4L (NEDD4L)
Section: 臨床的意義

NEDD4Lは腎臓のENaCとNCCの重要な調節因子であり、この経路の機能不全は高血圧と関連している。リドル症候群では、ENaCのサブユニットの遺伝子変異によってNEDD4Lが結合できなくなっているため、このような症状がみられる。マウスでは、NEDD4-2の欠失は肺でのENaCの細胞表面での発現と活性を増加させ、肺水の早期除去、気道の乾燥、肺の炎症、周産期致死が引き起こされる。マウスの尿細管特異的なNEDD4-2の欠失は、ENaCとNCCの発現上昇を引き起こす。ENaCとNCCの調節における重要な機能を有していることと一致して、NEDD4Lの多型は特定の人口集団において本態性高血圧と関連している。マウスでの神経特異的なNEDD4-2の欠失は軸索の分枝の欠陥を引き起こす。NEDD4-2ノックアウトマウスから単離された胎児皮質ニューロンは電位依存性ナトリウムチャネルによる電流の調節に欠陥を示し、神経障害性疼痛の動物モデルではNEDD4-2の発現がダウンレギュレーションされていることが判明している。またNEDD4-2の欠乏は、後根神経節ニューロンの過興奮を引き起こし、神経障害性疼痛に寄与する。
Title: NEDD4L (NEDD4L)
Section: 相互作用

NEDD4LはSCNN1Aと相互作用することが示されている。
Title: BUB3 (BUB3)
Section: abstract

BUB3（budding uninhibited by benzimidazoles 3）は、ヒトではBUB3遺伝子にコードされるタンパク質である。BUB3は紡錘体チェックポイント（SAC）の調節に関与するタンパク質であり、酵母では必須ではないが、高等真核生物では必須である。チェックポイントタンパク質の1つとして、BUB3は前中期の間に他のタンパク質のキネトコアへの局在を指揮し、後期の不可逆的開始を防いでいる。BUB3はキネトコア-微小管間の相互作用を指揮することで、後期が開始される前に染色体が適切な二方向型（biorientation）の接着を行うよう保証している。BUB3とその関連タンパク質は紡錘体チェックポイントを構成して後期促進複合体（APC/C）の作用を阻害し、時期尚早な後期の開始と有糸分裂の終結を防いでおり、染色体分離の正確性を高める機構として機能している。
Title: BUB3 (BUB3)
Section: 機能

BUB3は、有糸分裂期の紡錘体の組み立てに関与する複合体の重要な構成要素であり、他の重要なタンパク質と複合体を形成する。染色体が適切に分離されるためには、各染色体のキネトコアが適切な形で紡錘体に接着していることが必要である。この過程は紡錘体チェックポイント複合体によって制御されており、この複合体はフィードバック応答として作動する。接着の欠陥を示すシグナルが存在する場合には有糸分裂は停止し、全ての染色体が紡錘体に対してアンフィテリックな（二方向性の）結合を行うよう保証している。欠陥が解消されると、細胞は後期の過程へと進行する。細胞周期の停止を調節するタンパク質複合体には、BUB1、BUB2、BUB3、Mad1、Mad2、Mad3（BubR1）、MPS1などが含まれる。
Title: BUB3 (BUB3)
Section: 紡錘体チェックポイントにおける役割

未接着状態のキネトコアでは、BubR1、Bub3、Cdc20からなる複合体がMad2-Cdc20複合体と相互作用してAPCを阻害し、それによって活性型APCCdc20の形成は阻害されている。Bub3はBubR1と恒常的に結合しており、阻害複合体の形成という点でSACの重要な構成要素として機能している。また、後期への移行前にはセキュリンとサイクリンBも未接着のキネトコアによって安定化されている。このサイクリンとセキュリンの安定化によって分解が防がれることで、姉妹染色分体の迅速かつ不可逆的な分離が防がれている。こうした阻害複合体の形成や各段階は、セパラーゼ活性化前の「待て」というシグナルとなる。後期への移行前の段階では、セキュリンはセパラーゼ活性を阻害し、コヒーシン複合体を維持している。キネトコアの接着が完了すると、紡錘体チェックポイント関連複合体（BubR1-Bub3複合体を含む）の濃度は低下する。
Title: BUB3 (BUB3)
Section: 構造

Bub3の結晶構造からはWD40リピートを持つ7枚のブレードからなるβプロペラ構造が示されており、4本の逆平行βシートからなる各ブレードが先細った形状のチャネルの周囲に配置された形状となっている。SACの形成のための相互作用に重要な表面が変異解析から示唆されており、特にブレード1、3の保存されたトリプトファン残基、ブレード5の保存されたWAVEは配列の重要性が示唆されている。WD40タンパク質がファミリーの他のメンバーであるRae1（mRNA核外搬出因子）は、Bub3と高度な配列保存性を示す。どちらもGLEBS（Gle2p binding sequence）モチーフに結合し、Bub1に対するBub3とRae1の相互作用の類似性が示唆されるが、Bub3はMad3とBub1に対して特異的に結合するのに対し、Rae1はより曖昧性が高く、核膜孔複合体とBub1の双方に結合する。
Title: BUB3 (BUB3)
Section: 相互作用

BUB3はBUB1B、HDAC1、HDAC2と相互作用することが示されている。Bub3はMad1-Bub1、そしてCdc20（この相互作用はキネトコアを必要としない）と複合体を形成することが示されている。さらに、Mad2、Mad3と結合することも示されており、Mad3のMad2への結合に影響を与える調節因子としても作用する。Bub3はBub1のキネトコアへの局在を指揮し、SACを活性化する。出芽酵母Saccharomyces cerevisiaeと後生動物の双方で、Bub3はBubR1とBub1に結合することが示されている。
Title: サイクリンD3 (Cyclin D3)
Section: abstract

サイクリンD3（英: cyclin D3）は、ヒトではCCND3遺伝子にコードされるタンパク質である。
Title: サイクリンD3 (Cyclin D3)
Section: 機能

CCND3遺伝子によってコードされるサイクリンD3は、高度に保存されたサイクリンファミリーに属する。このファミリーのメンバーは、細胞周期を通じてタンパク質の存在量に劇的な周期的変化が生じることで特徴づけられる。サイクリンはサイクリン依存性キナーゼの調節因子として機能する。さまざまなサイクリンはそれぞれ異なる発現と分解のパターンを持ち、有糸分裂の各イベントの時間的調整に寄与する。このサイクリンはCDK4またはCDK6と複合体を形成し、これらの調節サブユニットとして機能する。これらの活性はG1期からS期への移行に必要である。このタンパク質は、がん抑制因子であるRbタンパク質と相互作用し、そのリン酸化に関与していることが示されている。このサイクリンと関係したCDK4の活性は、紫外線照射後の細胞周期のG2期から有糸分裂への進行に必要であることが報告されている。
Title: サイクリンD3 (Cyclin D3)
Section: 臨床的意義

CCND3遺伝子の変異は、乳がん症例との関係が示唆されている。
Title: サイクリンD3 (Cyclin D3)
Section: 相互作用

サイクリンD3は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。
Title: セリンラセマーゼ (Serine racemase)
Section: abstract

セリンラセマーゼ(Serine racemase)は、L-セリンからD-セリンを生成する酵素である。D-セリンは、脳内でNMDA型グルタミン酸受容体を活性化させることで神経シグナル伝達分子として働く。ヒトでは、セリンラセマーゼタンパク質は、SRR遺伝子でコードされている。哺乳類のセリンラセマーゼは、ピリドキサールリン酸依存性の酵素であり、L-セリンからD-セリンへの異性化及びL-セリンから脱水してピルビン酸とアンモニアを生成する反応の両方を触媒する。この酵素は、マグネシウムなどの2価のカチオンで生理的に活性化され、またマグネシウム/ATP複合体によってアロステリックに活性化される。
Title: Isl1 (ISL1)
Section: abstract

Isl1（islet 1）はLIMホメオドメインを持つ転写因子で、インスリン遺伝子の発現調節領域（プロモーター領域）に作用する因子として発見された。現在ではIsl1は膵臓の他、心臓や神経系の発生において重要な役割を担っている。