Despite this, the type saw only limited service during the war, as all of the 235 Bf 109Ds still in Luftwaffe service at the beginning of the Poland Campaign were rapidly taken out of service and replaced by the Bf 109E, except in some night fighter units where some examples were used into early 1940.
Dù vậy, phiên bản này chỉ có những hoạt động hạn chế trong chiến tranh, vì tất cả 235 chiếc Dora đang phục vụ lúc bắt đầu chiến dịch Ba Lan đã nhanh chóng được rút khỏi phục vụ ở tuyến đầu và được thay thế bởi phiên bản Bf 109E, ngoại trừ một số đơn vị tiêm kích bay đêm, nơi mà một số chiếc tiếp tục hoạt động cho đến đầu năm 1940.