Mertelj started his career playing for Triglav Kranj and stayed there until he was acquired by Slovenian top division club, Koper.
Mertelj khởi đầu sự nghiệp thi đấu cho Triglav Kranj và duy trì ở đó cho đến khi anh được sở hữu bởi câu lạc bộ ở hạng cao nhất Slovenia, Koper.