Eppstein served as the program chair for the theory track of the ACM Symposium on Computational Geometry in 2001, the program chair of the ACM-SIAM Symposium on Discrete Algorithms in 2002, and the co-chair for the International Symposium on Graph Drawing in 2009.
Eppstein từng là chủ tịch chương trình cho việc theo dõi lý thuyết của ACM Symposium on Computational Geometry vào năm 2001, chủ tịch chương trình của Hội nghị ACM-SIAM trên Discrete thuật toán trong năm 2002, và các đồng chủ tịch cho Hội thảo quốc tế về vẽ đồ thị vào năm 2009.