The Emajõgi is sometimes called the Suur Emajõgi ("Great Emajõgi"), in contrast with the Väike Emajõgi ("Little Emajõgi"), another river which flows into the southern end of Lake Võrtsjärv.
Emajõgi đôi khi được gọi là Suur Emajõgi ("Đại Emajõgi"), để phân biệt với Väike Emajõgi ("Tiểu Emajõgi"), một con sông khác, chảy vào nam hồ Võrtsjärv.