During the Mexican–American War, Baker briefly dropped out of politics and was commissioned as a Colonel of the Fourth Regiment of the Illinois Volunteer Infantry, on July 4, 1846.
Trong Chiến tranh México-Mỹ, Baker một thời gian ngắn đã bỏ chính trị và được đưa như một Đại tá Trung đoàn Thứ tư của các tình nguyện binh Illinois, vào ngày 04 tháng 7 năm 1846.