Ćustić started his professional career with his youth club NK Zadar in 2000 and also spent two seasons playing for NK Zagreb between 2005 and 2007, before returning to Zadar in the summer of 2007 on a four-year contract.
Ćustić bắt đầu sự nghiệp với của mình tại câu lạc bộ trẻ NK Zadar trong 2000 và cũng đã trải qua hai mùa chơi cho NK Zagreb giữa năm 2005 và năm 2007, trước khi trở về Zadar trong mùa hè năm 2007 với một bản hợp đồng 4 năm.