She participated in the massive RCN deployment for the Cuban Missile Crisis in 1962; Nootka was assigned a patrol area off the northern tip of Cuba during the crisis.
Nó tham gia vào đợt huy động rộng rãi lực lượng Hải quân Hoàng gia Canada trong cuộc Khủng hoảng tên lửa Cuba vào năm 1962; Nootka được phân công một khu vực tuần tra mũi phía Bắc của Cuba trong cuộc khủng hoảng.