MEXT is led by the Minister of Education, Culture, Sports, Science and Technology, who is a member of the Cabinet and is chosen by the Prime Minister, typically from the members of the Diet.
MEXT đang được dẫn dắt bởi một Bộ trưởng Bộ Giáo dục, Văn hóa, Thể thao, Khoa học và Công nghệ, là một thành viên của nội các và là lựa chọn của Thủ tướng, thông thường là từ các thành viên của Quốc hội.