Several versions of control systems have been used, including: v2 TWCS – Tomahawk Weapon Control System (1983), also known as "green screens," was based on an old tank computing system. v3 ATWCS – Advanced Tomahawk Weapon Control System (1994), first Commercial Off the Shelf, uses HP-UX. v4 TTWCS – Tactical Tomahawk Weapon Control System, (2003). v5 TTWCS – Next Generation Tactical Tomahawk Weapon Control System.
Nhiều phiên bản của các hệ thống điều khiển đã được sử dụng, bao gồm: v2 TWCS – Hệ thống Điều khiển Vũ khí Tomahawk (1983), cũng được gọi là "green screens," dựa trên một hệ thống máy tính xe tăng cũ. v3 ATWCS – Hệ thống Điều khiển Vũ khí Tomahawk Tiên tiến (1994), hệ thống thương mại đầu tiên, sử dụng HP-UX. v4 TTWCS – Hệ thống Điều khiển Vũ khí Tomahawk Chiến thuật, (2003). v5 TTWCS – Hệ thống Điều khiển Vũ khí Tomahawk Chiến thuật Thế hệ Tiếp sau.