In 1998, Sheikh Muszaphar worked at Hospital Seremban, followed by a move to Kuala Lumpur General Hospital in 1999, and was on staff at Hospital Selayang from 2000 through 2001.
In 1998, Sheikh Muszaphar đã làm việc tại Bệnh viện Seremban, sau đó là tại Bệnh viện đa khoa Kuala Lumpur năm 1999, và tại Bệnh viện Selayang từ 2000 đến 2001.