Mission control for SAMPEX was handled by the Goddard Space Flight Center until October 1997, after which it was turned over to the Bowie State University Satellite Operations Control Center (BSOCC).
Kiểm soát nhiệm vụ cho SAMPEX đã được Trung tâm bay không gian Goddard xử lý cho đến tháng 10 năm 1997, sau đó nó được chuyển sang Trung tâm điều khiển hoạt động vệ tinh đại học bang Bowie (BSOCC).