At the cellular level, piRNAs have been found within both nuclei and cytoplasm, suggesting that piRNA pathways may function in both of these areas and, therefore, may have multiple effects.
Hücresel seviyede, hem hücre çekirdeğinde hem de sitoplazmada piRNAlar bulunmuştur, bu da piRNA yollarının bu alanların her ikisinde de işlev görebileceğini ve dolayısıyla birden fazla etkiye sahip olabileceğini düşündürmektedir.