The simplest is POA (Partial-Order Alignment); a similar but more generalized method is implemented in the packages SAM (Sequence Alignment and Modeling System). and HMMER.
En basit olanı POA (Partial-Order Alignment Kısmî dereceli hizalama); , Benzer ama daha genelleştirilmiş bir yöntem SAM (Sequence Alignment and Modeling System Dizi hizalama ve modelleme sistemi)'dır. ve HMMER'dir.