On 29 August 2012, after Bayern Munich paid the buyout clause of €40 million in his contract, Martínez signed a five-year contract with the German club.
Më 29 gusht 2012, pasi Bayern Munich pagoi klauzolën e lirimit të kontratës për 40 milion €, Martínez nënshkroi një kontratë pesë vjeçare me klubin gjerman.