In May 2006, Agüero joined Spanish club Atlético Madrid for a fee reported to be around €20 million, breaking the club's previous transfer record.
Në maj 2006 Agüero nënshkruar për spanjoll Madrid klubi Atletico për një tarifë të pazbuluar, raportohet të jetë rreth 23.000.000 €, thyer e mëparshme rekordin e klubit transferimit.