However, with the absence of playmaker Diego from the final against Shakhtar Donetsk, Pizarro could not save the team from a 2–1 defeat after extra time to Ukrainian champions Shakhtar Donetsk on 20 May 2009 at the Şükrü Saracoğlu Stadium in Istanbul.
Megjithatë, në mungesë të mesfushorit Diego në finalen kundër Shakhtar Donetsk, Pizarro nuk mundi dot të shpëtojë skuadrën nga humbja 2–1 pas kohës shtesë kundër kampionëve ukrainas më 20 maj 2009 në finalen e madhe në stadiumin Şükrü Saracoğlu në Stamboll.