Over the course of the program, this raised operational costs, though the consolidation of the US aerospace industry in the 1990s meant the majority of the Shuttle was now with one company: the United Space Alliance, a joint venture of Boeing and Lockheed Martin.
V priebehu programu sa tým zvýšili prevádzkové náklady, aj keď konsolidácia amerického leteckého priemyslu v 90-tych rokoch znamenala, že väčšina raketoplánu sa dostala jednu spoločnosť: United Space Aliance, spoločný podnik spoločností Boeing a Lockheed Martin.