A comparison of genes within a species or between different species can show similarities between protein functions, or relations between species (the use of molecular systematics to construct phylogenetic trees).
Споредбата на гените во рамките на еден вид или помеѓу различни видови може да укаже на сличности помеѓу функциите на протеините, или сродствените односи помеѓу видовите (употреба на молекуларна систематика за изградба на филогенетски дрва).