Using the example above, one possible alignment candidate might be: 12345678 GCATG-CU G-ATTACA The letters may match, mismatch, or be matched to a gap (a deletion or insertion (indel)): Match: The two letters at the current index are the same.
Употребувајќи го горниот пример, едно можно порамнување е: 12345678 GCATG-CU G-ATTACA Буквите (знаците) може да се совпаѓаат, да не се совпаѓаат, или да формираат празнина (делеција или инсерција (индел)): Совпаѓање: двете букви во тековниот индекс се исти.