In 1942 Jałbrzykowski was arrested by the Nazis, and Father Sopoćko and other professors went into hiding near Vilnius for about two years.
1942年にはヤウブルジコフスキ大司教がナチスに捕らえられ、そしてソポチコ神父や他の大学教授はヴィリニュスの近くに2年ほど避難をしていた。