Fernandez was ordained as a priest on 10 December 1966, and served as president of the Catholic Bishops' Conference of Malaysia, Singapore and Brunei from 1987–1990 and 2000–2003.
Fernandez diangkat menjadi pendeta pada 10 Desember 1966, dan menjabat sebagai presiden Konferensi Waligereja Malaysia, Singapura dan Brunei dari 1987-1990 dan 2000-2003.