Shinji is also a playable character in the popular cross-over video game franchise Super Robot Wars where he and other Evangelion characters work with characters from various other mecha series.
Shinji juga merupakan karakter yang dapat dimainkan dalam waralaba permainan video cross-over terkenal, Super Robot Wars, di mana ia dan tokoh Evangelion lainnya bekerja sama dengan berbagai tokoh dari seri mecha lainnya.