Contamination poses a frequent challenge depending on the method of collection used, thus a cutoff of 105 CFU/mL is used for a "clean-catch" mid stream sample, 104 CFU/mL is used for catheter-obtained specimens, and 102 CFU/mL is used for suprapubic aspirations (a sample drawn directly from the bladder with a needle).
Kontaminasi sering merupakan tantangan yang dihadapi tergantung pada metode pengumpulan yang dilakukan, sehingga batas 105 CFU/mL digunakan untuk sampel aliran tengah “tangkapan bersih”, 104 CFU/mL digunakan untuk spesimen yang diperoleh dari kateter, dan 102 CFU/mL digunakan untuk aspirasi suprapubik (sampel diambil langsung dari kandung kemih dengan menggunakan jarum).