Muneyoshi thus became the second headmaster of Shinkage-ryū in 1566, and subsequently founded his own school, the Yagyū Shinkage-ryū.
Muneyoshi kemudian menjadi kepala perguruan kedua Shinkage-ryū pada tahun 1566, dan selanjutnya mendirikan perguruannya sendiri, Yagyū Shinkage-ryū.