Huston has an older brother, Tony, a younger maternal half-sister named Allegra, whom she called "Legs", a younger paternal half-brother, actor Danny Huston, and an adopted older brother, Pablo.
Huston memiliki saudara laki-laki yang lebih tua, Tony, saudara tiri ibu yang lebih muda bernama Allegra, yang dia sebut "Kaki", saudara tirinya yang lebih muda, aktor Danny Huston, dan saudara laki-laki angkat, Pablo.