By the middle of 2008 it was strongly suspected by fans, media, and the MotoGP paddock already, and later supported by Hayden's own admission during a press conference that he would be leaving Honda, that Hayden would be joining the Ducati Marlboro Team to ride alongside Casey Stoner for the 2009 MotoGP season.
Pada pertengahan 2008 telah diduga kuat oleh para fans, media, dan pedok MotoGP, dan kemudian didukung oleh pengakuan Hayden sendiri saat konferensi pers bahwa dia akan meninggalkan Honda, bahwa Hayden akan bergabung dengan Ducati Marlboro Team untuk membalap bersama Casey Stoner untuk musim MotoGP 2009.