As her son Douglas had died of pernicious anaemia at the age of 29 in 1910, and her only grandchild, Margaret Isabel Sheppard, had died of tuberculosis at the age of 19 in 1930, Sheppard left no living direct descendants.
Ketika putranya Douglas meninggal karena anemia kekurangan vitamin B12 pada usia 29 tahun pada 1910, dan satu-satunya cucunya, Margaret Isabel Sheppard, meninggal karena tuberkulosis pada usia 19 tahun pada 1930, Sheppard tidak meninggalkan satupun keturunan langsung yang hidup.