The album was titled Systematic Chaos after Portnoy and Petrucci picked phrases from song lyrics that they felt would be a fitting title, in similar fashion to previous albums like Images and Words (1992) or Awake (1994).
Album ini berjudul Systematic Chaos setelah Portnoy dan Petrucci memilih frase dari lirik lagu yang mereka rasa akan menjadi judul yang pas, cara yang sama dengan album-album sebelumnya seperti Images and Words (1992) atau Awake (1994).