Throughout the 1990s and 2000s, Pahor remained an outspoken supporter of Slovenia's entry in this military alliance, which was opposed by several left wing sectors of the society.
Sepanjang tahun 1990-an dan 2000-an, Pahor tetap pendukung yang vokal atas masuknya Slovenia dalam aliansi militer, yang ditentang oleh beberapa sektor sayap kiri masyarakat.