The film tells the story of Eggs, a human boy raised by trash-collecting trolls, known as "Boxtrolls", as he attempts to save them from Archibald Snatcher, a pest exterminator.
Film tersebut mengisahkan kisah Eggs, seorang bocah manusia yang dibesarkan oleh para troll pengumpul sampah, yang dikenal sebagai "Boxtroll", saat ia berupaya untuk menyelamatkan mereka dari Archibald Snatcher, seorang pembasmi pes.