He put his affairs in order circa 1551, renounced his titles in favour of his eldest son Carlos de Borja-Aragon y de Castro-Melo, and became a Jesuit priest.
Dia menempatkan urusannya dalam rangka sekitar tahun 1551, meninggalkan gelarnya untuk mendukung putra tertuanya Carlos de Borja-Aragon y de Castro-Melo, dan menjadi imam Yesuit.