Notwithstanding the above, it was observed that in the aftermath of the fall of Soeharto in 1998, religion as a factor for Aceh separatism began to subside even if there had been a proliferation of Muslim student unions and other groups in Aceh.
Kendati hal di atas, terlihat bahwa pada masa setelah jatuhnya Soeharto pada tahun 1998, agama Islam sebagai faktor pendorong separatisme Aceh mulai mereda, bahkan setelah terjadi proliferasi munculnya serikat mahasiswa Muslim dan kelompok-kelompok ormas Islam lainnya di Aceh.