In January 2006, Ivanschitz transferred to Red Bull Salzburg and then to Greek Super League club Panathinaikos in August 2006 on a two-year loan.
Pada bulan Januari 2006, Ivanschitz ditransfer ke klub Red Bull Salzburg dan kemudian ke klub Liga Super Yunani, Panathinaikos pada bulan Agustus 2006 dengan status pinjaman selama dua tahun.