The clock genes are expressed in many parts of the nervous system as well as many peripheral organs, but in mammals, all of these "tissue clocks" are kept in synchrony by signals that emanate from a master timekeeper in a tiny part of the brain called the suprachiasmatic nucleus.
Gen jam ini diekspresikan dalam berbagai bagian sistem saraf sebagaimana banyak organ periferal, tetapi dalam mamalia seluruh "jam jaringan" ini dipertahankan dalam sinkronisasi oleh sinyal yang keluar dari sebuah penjaga waktu utama dalam bagian kecil dalam otak yang disebut inti suprakiasmatik.