As an active member of religious and cultural dissent during Communist era, Halík was appointed by Pope John Paul II as an advisor to the Pontifical Council for Dialogue with Non-Believers in 1992.
Karena peranan aktifnya dalam ketidaksepakatan kultural dan keagamaan pada era Komunis, Halík ditunjuk Paus Yohanes Paulus II sebagai penasihat Dewan Kepausan untuk Dialog dengan Orang Tak Beragama pada tahun 1992.