In the first few matches, Müller was a regular substitute, and on 12 September 2009, he was brought on against Borussia Dortmund and scored two goals in a 5–1 victory.
Dalam beberapa pertandingan pertama, Müller merupakan pemain pengganti tetap, dan pada 12 September 2009, dia dimainkan dalam pertandingan melawan Borussia Dortmund dan mencetak dua gol dalam kemenangan 5–1.