After returning to Istanbul in 1968, he took a position at the Patriarchal Theological Seminary of Halki, where he was ordained a priest in 1969, by Ecumenical Patriarch Athenagoras I. When Demetrius I became Ecumenical Patriarch in 1972 and established the Patriarchal Office, he selected Bartholomew as its director.
Setelah kembali ke Istanbul pada 1968, ia memegang sebuah jabatan di Seminari Teologi Patriarkh Halki, dimana ia diangkat menjadi pendeta pada 1969, oleh Patriarkh Ekumenikal Athenagoras I. Ketika Demetrius I menjadi Patriarkh Ekumenikal pada 1972 dan mendirikan Pusat Patriarkhal, ia memilih Bartolomeus sebagai direkturnya.