His presidency was interrupted by his arrest under the Internal Security Act in 1965 and subsequent imprisonment for one year on charges of plotting to overthrow the Malaysian government and install an Indonesian-friendly replacement.
Kepemimpinannya terpotong oleh penangkapan "Akta Keselamatan Dalam Negeri" pada tahun 1965, dan selanjutnya dipenjara selama satu tahun atas tuduhan berkomplot untuk menggulingkan pemerintah Malaysia, dan membangun sebuah pemerintah pengganti yang lebih ramah kepada Indonesia.