For 2006, Hayden was charged with spearheading Repsol Honda's championship aspirations, and was the only rider to be handed the full 2006 Honda bike during pre-season testing.
Untuk 2006, Hayden menjadi ujung tombak aspirasi kejuaraan untuk Repsol Honda, dan merupakan satu-satunya pembalap yang diberikan penuh motor Honda 2006 selama tes pra-musim.