On 10 December 2008, as the member of the Federal Council that hasn't been its president for the longest time, Merz was elected President of the Confederation for 2009.
Pada tanggal 10 Desember 2008, sebagai anggota Dewan Federal yang belum menjadi presiden untuk waktu yang lama, Merz terpilih menjadi Presiden Konfederasi untuk tahun 2009.