On October 8, 1999, Clarkson was sworn in as the 26th Governor General of Canada, and was soon actively participating in her role, becoming immediately instrumental in the final stages of the repatriation of Canada's unknown soldier from France.
ב-8 באוקטובר 1999 הושבעה קלרקסון לתפקיד מושל הכללי של קנדה ה-26, והייתה פעילה עד מהרה בתפקידה, והפכה מיד לכלי משחק בשלבים האחרונים של החזרת החיילים האלמוניים מצרפת.