Like many ciliates, T. thermophila has a surprisingly complex genome that consists of a germline micronucleus and a somatic macronucleus that function and replicate independently of one another.
Como moitos outros ciliados, T. thermophila ten un xenoma sorprendentemente complexo situado nun micronúcleo de liña xerminal e un macronúcleo somático, que funcionan e se replican independentemente.