Not all regions within a protein mutate at the same rate; functionally important areas mutate more slowly and amino acid substitutions involving similar amino acids occurs more often than dissimilar substitutions.
Non todas as rexións dunha proteína mutan coa mesma taxa; as áreas funcionalmente importantes mutan máis lentamente e as substitucións de aminoácidos que implican aminoácidos similares ocorren máis a miúdo que as substitucións non semellantes.