The most basic possible comparison between protein structures makes no attempt to align the input structures and requires a precalculated alignment as input to determine which of the residues in the sequence are intended to be considered in the RMSD calculation.
A comparación máis sinxela posible entre estruturas de proteínas non intenta aliñar as estruturas de entrada, senón que necesita un aliñamento precalculado como input para determinar que residuos da secuencia deben considerarse para o cálculo da RMSD.