A number of similarity metrics are possible; the original definition of the CE method included only structural superpositions and inter-residue distances but has since been expanded to include local environmental properties such as secondary structure, solvent exposure, hydrogen-bonding patterns, and dihedral angles.
Son posibles varias métricas de similitude; a definición orixinal do método de extensión combinatoria incluía soamente superposicións estruturais e distancias inter-residuos, pero ampliouse desde entón para incluír propiedades locais do contorno tales como a estrutura secundaria, exposición ao disolvente, patróns de pontes de hidróxeno, e ángulos diedros.