As of February 2013, the public version of InterProScan (v4.x) is Perl-based, however, a new Java-based architecture is under development which will form the core of InterProScan v5.
En febreiro de 2013, a versión pública de InterProScan (v4.x) estaba baseada en Perl, aínda que unha nova arquitectura baseada en Java está baixo desenvolvemento, e formará o núcleo de InterProScan v5.