While most of the early studies of Type VI secretion focused on its role in the pathogenesis of higher organisms, more recent studies suggested a broader physiological role in defense against simple eukaryotic predators and its role in inter-bacteria interactions.
Aínda que a maioría dos estudos recentes da secreción de tipo VI están enfocados ao seu papel na patoxénese de organismos superiores, estudos máis recentes suxiren un papel fisiolóxico máis amplo na defensa contra predadores eucarióticos simples e o seu papel nas interaccións entre bacterias.