From the beginning of the 19th century, the viceroyalty fell into crisis, aggravated by the Peninsular War, and its direct consequence in the viceroyalty, the political crisis in Mexico in 1808, which ended with the government of viceroy José de Iturrigaray and, later, gave rise to the Conspiracy of Valladolid and the Conspiracy of Querétaro.
Desde principios do século XIX o vicerreinado caeu en crise, agravada pola Guerra da Independencia española, e a súa consecuencia directa no vicerreinado, a crise política de 1808, que acabou co goberno de José de Iturrigaray e máis adiante deu pé á Conxura de Valladolid e á conspiración de Querétaro.