These errors can arise because of unique insertions into one or more regions of sequences, or through some more complex evolutionary process leading to proteins that do not align easily by sequence alone.
Estes erros poden orixinarse a causa de insercións únicas nunha ou máis rexións das secuencias, ou a través dalgúns procesos evolutivos máis complexos que orixinan proteínas que non se aliñan facilmente só pola súa secuencia.