The simplest is POA (Partial-Order Alignment); a similar but more generalized method is implemented in the packages SAM (Sequence Alignment and Modeling System). and HMMER.
ساده‌ترین این برنامه‌ها POA(partial-order alignment) است؛ یک روش مشابه اما کلی تر در بسته‌های SAM (Sequence Alignment and Modeling System).]