The virus was first isolated in April 1947 from a rhesus macaque monkey placed in a cage in the Ziika Forest of Uganda, near Lake Victoria, by the scientists of the Yellow Fever Research Institute.
Ο ιός Ζίκα απομονώθηκε για πρώτη φορά τον Απρίλιο του 1947 από έναν πίθηκο μακάκο (rhesus macaque) που βρισκόταν μέσα σε κλουβί στο δάσος Ζίκα της Ουγκάντα, κοντά στη Λίμνη Βικτόρια, από επιστήμονες του Ερευνητικού Ινστιτούτου για τον Κίτρινο Πυρετό.