Thompson was instrumental in the design and implementation of the Plan 9 from Bell Labs, a new operating system utilizing principles of Unix, but applying them more broadly to all major system facilities.
Ο Τόμσον ήταν συντελεστικός στο σχεδιασμό και υλοποίηση του Plan 9 από τα Εργαστήρια Μπελ, ένα νέο λειτουργικό σύστημα που χρησιμοποιούσε τις αρχές του Unix, αλλά τις εφάρμοζε περισσότερο ευρέως σε όλα τις μεγάλες συστημικές υποδομές.