After the death of Tuđman in December 1999 and the defeat of the Croatian Democratic Union in the Croatian elections of 2000, Abdić was eventually arrested and convicted for war crimes against civilian Bosniaks loyal to the Republic of Bosnia and Herzegovina.
Μετά τον θάνατο του Τούτζμαν τον Δεκέμβριο του 1999 και την ήττα της Δημοκρατικής Ένωσης της Κροατίας στις εκλογές της Κροατίας το 2000, ο Αμπντίς συνελήφθη και καταδικάστηκε για εγκλήματα πολέμου κατά πολιτικών Βόσνιων πιστών στη Δημοκρατία της Βοσνίας και Ερζεγοβίνης.