Academia Fútbol Club appeared at first as a training school for players between 18 and 25 years of Compensar in 1999, under the name of Escuela de Fútbol Compensar – MasterCard.
Η ομάδα πρωτοεμφανίστηκε σαν προπονητικό σχολείο για ποδοσφαιριστές μεταξύ 18 και 25 ετών το 1999, με το όνομα Escuela de Fútbol Compensar - MasterCard.