Although the museum has a considerable collection, it does not contain all of the items found in Delos: a large quantity are on display in Athens at the National Archaeological Museum.
Αν και το μουσείο κατέχει μια σημαντική συλλογή, δεν περιέχει όλα τα αντικείμενα που βρέθηκαν στη Δήλο: μια μεγάλη ποσότητα αρχαιολογικών ευρημάτων εκτίθεται στην Αθήνα στο Εθνικό Αρχαιολογικό Μουσείο .