From his studies of comparative embryology, Baer had believed in the transmutation of species but rejected later in his career the theory of natural selection proposed by Charles Darwin.
Από τις μελέτες του στην συγκριτική ανατομία, ο Μπάερ πίστευε στην μετάλλαξη των ειδών, αλλά αργότερα στη σταδιοδρομία του απέρριψε τη θεωρία της φυσικής επιλογής που πρότεινε ο Κάρολος Δαρβίνος.