semvec/pypi-packages huggingface dataset:
lockdown-protocol-extra-bot 0.0.4
Telegram bot for camera access.
Requires Python: >=3.7

# lockdown_protocol_extra_bot

**ABANDONED**.
 
Let u to add some extra challenges for players of lockdown protocol with telegram bot.

# Installation and start

``` bash
pip install --upgrade pip
pip3 install lockdown_protocol_extra_bot
```

Then create file `settings.json` with content:

``` json
{
    "telegram-config": {
        "token": "{YOUR_TELEGRAM_TOKEN}",
        "password": "{YOUR_PASSWORD}"
    }
}
```

You can get token from `@BotFather` (it is telegram bot). With `{YOUR_PASSWORD}` you can restart bot. Only with this password bot can be restarted from telegram chat.

And run:

``` bash
lockdown_protocol_extra_bot start settings.json
```

# Adding your challanges

Just change file `./lockdown_protocol_extra_bot/gen_challenges.py` (add yours to function `get_challenges`). Or `venv/lib64/pythonX.XX/site-packages/lockdown_protocol_extra_bot/gen_challenges.py` if installed from `pip`.
melopro 0.1.2
A tool for protein structure analysis using DSSP.
Requires Python: >=3.7

MELO: Protein Structure Scoring and Analysis
MELO 是一个用于计算蛋白质结构分数和分析的工具包，集成了 DSSP 的功能，可快速处理蛋白质对的结构特性并生成评分结果。

功能
使用 DSSP 分析蛋白质结构。
提供 VSS 和 SPS 两种分数计算方法。
多线程支持，处理效率更高。
自动保存结果到指定文件夹。
安装
1. 环境要求
Python >= 3.8
操作系统：支持 Windows、Linux 和 macOS
DSSP 可执行文件
2. 安装步骤
安装 Python 包
克隆项目：

bash
复制代码
git clone https://github.com/your-repo/MELO.git
cd MELO
安装依赖：

bash
复制代码
pip install -r requirements.txt
安装 MELO 包：

bash
复制代码
pip install .
安装 DSSP
如果使用 Ubuntu/Debian，可以运行以下命令：
bash
复制代码
sudo apt-get install dssp
如果使用其他操作系统，请参考 DSSP 官方安装指南。
使用方法
安装完成后，可以直接在 Python 环境中调用 melo 函数。

python
复制代码
from melo import melo

# 定义输入参数
protein_file = "path/to/protein_pairs.csv"  # 蛋白质对文件
pdb_file = "path/to/pdb_folder"           # PDB 文件所在文件夹
save_folder = "path/to/output_folder"     # 结果保存文件夹
threads = 4                               # 线程数

# 运行 MELO
melo(protein_file, pdb_file, save_folder, threads)
示例输入文件
protein_pairs.csv 示例文件格式（分隔符为分号 ;）：

csv
复制代码
protein1;protein2;chain1;chain2
1abc;2def;A;B
3ghi;4jkl;A,C;B,D
protein1 和 protein2：蛋白质的 ID，对应的 PDB 文件名应为 {protein1}.pdb 和 {protein2}.pdb。
chain1 和 chain2：可选字段，指定需要分析的链 ID（多个链以逗号分隔）。
输出结果
程序会生成一个 MELO_score.csv 文件，保存以下字段：

Protein1 和 Protein2：蛋白质对的 ID。
VSS 和 SPS：计算得到的结构分数。
贡献
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