Pondok Pesantren Modern Al-Muttaqien Balikpapan

Sejak awal berdirinya, Pondok Pesantren Modern Al-Muttaqien Balikpapan memadukan sistem pendidikan pesantren dan sistem pendidikan pemerintah, baik dinas pendidikan maupun kementerian agama. Pendidikan formal yang berada dibawah Kementerian Agama adalah Raudlatul Athfal Al-Muttaqien, MI Al-Muttaqien dan MTs. Al-Muttaqien. Sedangkan pendikan formal yang berada dibawah dinas pendidikan adalah SMK Nahdlatul Ulama Balikpapan.