Penaklukan Altishahr oleh Zunghar

Raja Chagatai ʿAbdur Rashid Khan II dipilih sebagai penguasa boneka oleh Galdan, tetapi, Afaq Khoja segera menimbulkan masalah dan perselisihan antara Afaq dan ʿAbdur Rashid berujung pada pengasingan Afaq kedua kalinya. ʿAbdur Rashid juga diasingkan di Ili setelah terjadi kekerasan di Yarkand tahun 1682 dan ia digantikan oleh Muhammad Amin yang merupakan adiknya. Qing Tiongkok menerima upeti dari Muhammad Amin melalui Turpan dua kali, tahun 1690-an Sang Mughal menerima utusan Amin, dan tahun 1691 Muhammad Amin meminta tebusan pembebasan dari "orang-orang kafir Qirghiz" (orang-orang Zungjar) ketika Khan Subhān Quli dari Bukhara menerima utusannya, ini adalah upaya Muhammad Amin meminta negara-negara asing itu (Qing Tiongkok, Mughal India, dan Bukhara) untuk membantu melawan pemberontakan Zunghar untuk mendapatkan kembali kemerdekaan mereka.