Perkecambahan

Kehadiran air di dalam sel mengaktifkan sejumlah enzim perkecambahan awal. Fitohormon asam absisat menurun kadarnya, sementara giberelin meningkat. Berdasarkan kajian ekspresi gen pada tumbuhan model "Arabidopsis thaliana" diketahui bahwa pada perkecambahan lokus-lokus yang mengatur pemasakan embrio, seperti "ABSCISIC ACID INSENSITIVE 3" ("ABI3"), "FUSCA 3" ("FUS3"), dan "LEAFY COTYLEDON 1" ("LEC1") menurun perannya ("downregulated") dan sebaliknya lokus-lokus yang mendorong perkecambahan meningkat perannya ("upregulated"), seperti "GIBBERELIC ACID 1" ("GA1"), "GA2", "GA3", "GAI", "ERA1", "PKL", "SPY", dan "SLY". Diketahui pula bahwa dalam proses perkecambahan yang normal sekelompok faktor transkripsi yang mengatur auksin (disebut Auxin Response Factors, ARFs) diredam oleh miRNA.