Seminari Petrus Kanisius Mertoyudan

Pada bulan Mei 1925 dimulailah Seminari Kecil ("Klein Seminarie"), menempati gedung yang dibangun di sebelah barat Kolese St. Ignatius Yogyakarta tanggal 19 Desember 1927 dan diberkati oleh Vikaris Apostolik Batavia Mgr. Anton Pieter Franz van Velsen, SJ. Kursus diadakan bagi mereka yang baru tamat Sekolah Dasar "Hollands Inlandse School" (HIS) dan "Europese Lagere School" (ELS). Sejalan dengan itu kursus di Muntilan, bagi mereka yang sudah memiliki ijasah guru Kweekschool juga tetap berlangsung. Sekitar tahun 1927 kedua kursus ini digabungkan menjadi Seminari Kecil di Yogyakarta, dengan tujuh jenjang kelas. Yang terendah adalah kelas yang disebut "Candidatus Probatus" (CP) setara kelas VII dalam sistem pendidikan sekarang, kemudian kelas "Figura Minor" (setara kelas VIII), kelas "Figura Maior" (setara kelas IX), kelas "Grammatica" (setara kelas X), kelas "Sintaxis" (setara kelas XI), kelas "Poesis" (setara kelas XII) dan kelas "Rhetorica". Lulusan sekolah lanjutan tingkat pertama diterima dan dimasukkan dalam kelas khusus yang diberi nama "By Cursus" (BC), yang jika lulus, melanjutkan pendidikan dalam kelas Grammatica. Begitu juga lulusan sekolah lanjutan tingkat atas, yang selanjutnya bergabung dengan kelas "Rhetorica". Karena jumlah siswa meningkat hingga 100 orang lebih, seminari ini kemudian dipindah ke Mertoyudan Magelang. Pelajaran pertama di tempat baru ini dimulai pada 13 Januari 1941.