Dahagi di HMS Bounty

Kapten Bligh menakhodai HMS "Director" dalam Pertempuran Camperdown pada bulan Oktober 1797 dan HMS "Glatton" dalam Pertempuran Kopenhagen pada bulan April 1801. Pada 1805, ketika menakhodai HMS "Warrior", ia dihadapkan ke sidang mahkamah militer akibat berkata-kata kasar kepada para perwiranya, dan diberi surat peringatan resmi. Pada 1806, ia diangkat menjadi Gubernur New South Wales di Australia; setelah dua tahun bertugas, ia dibekuk dan didepak dari jabatannya oleh sekelompok perwira militer dalam peristiwa Pemberontakan Rum. Sekembalinya ke Inggris, Kapten Bligh dinaikkan pangkatnya menjadi laksamana muda pada 1811 dan kemudian menjadi laksamana madya pada 1814, namun tidak pernah lagi diberi tugas berlayar. Ia wafat saat berusia 63 tahun, pada bulan Desember 1817.