Divisi Utama Liga Indonesia 1998–99

1 tim terbawah grup 1,2,3 dan 4 bertanding pada Play Off degradasi, tim terbawah grup 5 langsung terdegradasi ke divisi 1; 2 tim pemuncak setiap grup berhak melaju ke babak 10 besar yang terbagi atas dua grup, terdiri atas 5 tim di setiap grup. 2 tim pemuncak setiap grup melaju ke babak semifinal. Pemenang pertandingan semifinal bertemu pada pertandingan final.Tim Pemenang Final tampil pada piala Champions Asia 1999/2000 ; Tim kalah di final tampil pada piala Winners Asia 1999/2000.