Bioinformatika

"Sequence alignment" merupakan metode dasar dalam analisis sekuens. Metode ini digunakan untuk mempelajari evolusi sekuens-sekuens dari leluhur yang sama ("common ancestor"). Ketidakcocokan ("mismatch") dalam "alignment" diasosiasikan dengan proses mutasi, sedangkan kesenjangan ("gap", tanda "–") diasosiasikan dengan proses insersi atau delesi. "Sequence alignment" memberikan hipotesis atas proses evolusi yang terjadi dalam sekuens-sekuens tersebut. Misalnya, kedua sekuens dalam contoh "alignment" di atas bisa jadi berevolusi dari sekuens yang sama "ccatgggcaac". Dalam kaitannya dengan hal ini, "alignment" juga dapat menunjukkan posisi-posisi yang dipertahankan ("conserved") selama evolusi dalam sekuens-sekuens protein, yang menunjukkan bahwa posisi-posisi tersebut bisa jadi penting bagi struktur atau fungsi protein tersebut.