Pembantaian pesantren Walisongo 2000

Pertumbuhan yang signifikan ini pada populasi relatif antara warga Muslim dengan penduduk Kristen menciptakan ketegangan atas perwakilan politik, terutama ketika sebagian besar dari ekonomi Poso dikendalikan oleh pendatang Muslim. Produksi yang menguntungkan dan ekspor kakao, khususnya, telah didominasi oleh pendatang dari Bugis dan Tionghoa. Setelah devaluasi rupiah, budidaya tanaman oleh kaum pendatang meningkat dan beberapa kelompok transmigran mendirikan perkebunan di daerah pedalaman hutan yang sebelumnya dianggap sebagai tanah milik warga Kristen. Marjinalisasi penduduk asli yang memimpin ini membuat penduduk Kristen takut, bahwa jika tidak tertulis, tentang struktur pembagian kekuasaan di Kabupaten Poso, yang memisahkan administrasi antara Kristen dan Muslim, mungkin terancam.