Babak ketiga kualifikasi Liga Champions UEFA 2012–13

Babak ketiga kualifikasi ini dibagi menjadi dua bagian yaitu satu untuk para juara liga disebut "Jalur Juara" dan peserta yang lolos namun bukan juara liga disebut "Jalur Liga", kedua jalur tersebut dipisah dalam proses pengundian babak ketiga dan play off. Klub yang kalah pada kedua jalur akan mengikuti Babak play off Liga Eropa UEFA 2012–13.