Karakter-karakter dan Faksi dalam seri Modern Warfare

Antagonis dalam permainan ini disebut sebagai 'The Four Horsemen/4 Penungang Kuda'. Mereka adalah:
5 tahun kemudian, Ultranasionalis menang, Amerika dan Rusia terlibat perang dingin baru. Makarov menghasut Amerika Serikat dan Rusia sehingga mereka berperang. Apakah Task Force 141 berhasil menghentikan perang dan mengungkap konspirasi dibaliknya?
Disini terungkap kalau Shepherd adalah komandan dari 30.000 pasukan USMC yang tewas dalam ledakan nuklir saat melawan OpFor. Marah dan kecewa atas kekuatan Amerika Serikat yang lemah dan dunia internasional yang tidak menghiraukan ancaman dari Rusia yang dikuasai Ultranasionalis, Ia segera membangun unit militernya yang hanya loyal kepadanya, Shadow Company untuk memburu Vladimir Makarov, teroris Rusia dan pemimpin Partai Ultranasionalis sayap Ekstremis dan Task Force 141 buatannya sendiri. Ia mengutus Allen melalui CIA dengan nama samaran "Alexei Borodin" untuk mengikuti Makarov yang telah terikat suatu perjanjian dengannya. Dalam sepanjang permainan, terungkap bahwa Shepherd yang bertanggung jawab atas pembunuhan massal di Bandara Internasional Zakhaev. Misinya adalah untuk membuat Amerika Serikat sekali lagi menjadi kekuatan global yaang tak tertandingi dan membuat dirinya sendiri pahlawan yang membuat semua itu. Akhirnya, Price menyelamatkan Soap dari Shepherd, tetapi saat Price sendiri pingsan, Soap menyelamatkan Price dengan melempar pisau tepat ke mata kiri Shepherd, otomatis membunuhnya. Hanya Price, Nikolai dan Soap yang tahu tetapi mereka sudah diburu terlebih dahulu oleh SC sebelum kebenarannya diungkap. Salah satu ciri khas Shepherd yang diingat oleh Dunn dan Price adalah "Since when does Shepherd care about danger close?"