Fafner in the Azure

Pada awal cerita, sebagian besar dunia telah dihancurkan oleh Festum dan pulau terpencil Jepang Tatsumiyajima (竜 宮 島, artinya Pulau Dragon Palace) hanya tetap tanpa cedera berdasarkan suatu cloaking perisai canggih. orang-orang muda di pulau itu melanjutkan kehidupan sehari-hari mereka tidak menyadari peristiwa ini, tapi setelah bertahun-tahun perdamaian festum tunggal menemukan Tatsumiya dan serangan. Orang-orang dewasa mengaktifkan Tatsumiya sistem pertahanan tersembunyi dan mencoba untuk mengusir penyerang tetapi tidak berhasil. Banyak dari mereka yang dibunuh oleh festum dalam proses asimilasi. Dalam keputusasaan, mereka memesan penyebaran mecha disebut Fafner Mark Elf, namun pilot tewas dalam perjalanan ke hanggar. Waktu dengan tidak ada pilihan lagi, mereka mengirimkan seorang anak muda bernama Kazuki Makabe sebagai pilot pengganti dibantu oleh Soshi Minashiro dari dalam Sistem Siegfried.