Kukishin-ryū

Saat ini ada beberapa cabang yang lebih tua dan yang lebih modern dari ryū tersebut yang masih berjalan. Keluarga Kuki menjaga silsilah utama, yang disebut "Kukishinden Tenshin Hyoho", dipimpin oleh Eichoku Takatsuka dibawah pengawasan Soke ke-28 terkini, Ietaka Kuki. Perguruan Bujinkan mengajarkan cabang dari silsilah utama bernama Kuki Shinden-Ryū Happō Biken dibawah Masaaki Hatsumi dan Unsui Manaka dari Jinenkan juga Shoto Tanemura dari Genbukan yang masing-masing dapat dirunut dari silsilah utama. Sebuah garis silsilah juga muncul di dalam Hontai Yoshin-ryu dibawah Munenori Kyoichi Inoue. Cabang-cabang ini memelihara silsilah mereka sendiri, teknik-teknik dan sejarah, yang biasanya mengakar keluar dari silsilah utama.