Kualifikasi Piala Dunia FIFA 2018 – Babak Ketiga AFC

Pengundian grup untuk babak ketiga dilaksanakan pada tanggal 12 April 2016, pukul 15.30 WIB, bertempat di Hotel Mandarin Oriental, Kuala Lumpur, Malaysia.
Pengundian didasarkan pada peringkat dunia FIFA April 2016. Ke-12 tim di-"seeded" ke dalam 6 pot:
Setiap grup akan berisi 1 tim dari masing-masing pot.