Militer Australia dalam konfrontasi Indonesia–Malaysia

AU Australia juga terlibat dalam Konfrontasi Indonesia-Malaysia. Selama tahun 1960-an empat skuadron terbang Australia berbasis di Pangkalan Butterworth di Malaysia sebagai bagian dari FESR. Unit terbesar adalah Sayap Nomor 78, yang terdiri atas Skuadron Sabre No. 3 dan Skuadron No. 77. Unit lainnya yaitu Skuadron No. 2, yang mengoperasikan pesawat pembom Canberra dan beberapa pesawat angkut Dakota, serta Skuadron No. 5 yang dilengkapi helikopter UH-1 Iroquois. Sayap Nomor 78 dan Skuadron No. 2 telah berbasis di Butterworth sejak tahun 1958. Skuadron No. 5 tiba pada 1964, sebagai respons atas salah satu permintaan bantuan dari Pemerintah Malaysia.