Pembantaian pesantren Walisongo 2000

Pada bulan Juli, tiga militan yang berasal dari Nusa Tenggara Timur, yang diduga sebagai pembunuh, yaitu Tibo, Dominggus da Silva dan Marinus Riwu Don, ditangkap karena dicurigai mengatur pembantaian. Pada tahun 2001, dalam tiga kali pengadilan setelah mendengar kesaksian dari 28 saksi, hakim menyatakan bahwa Tibo sebagai pemimpin milisi Kristen yang disebut Pasukan Merah, dan menemukan bahwa da Silva adalah salah satu komandan dan juga bahwa Marinus Riwu mengambil bagian dalam pembunuhan. Meskipun para pembela mengklaim Tibo mungkin hanya sedikit dari preman yang disewa, ketiganya dijatuhi hukuman mati oleh regu tembak dan dieksekusi pada bulan September 2006 atas kejahatan mereka.