IAIN Malikussaleh

Pada tahun 1996-2001 STIS Malikussaleh mendapat penghargaan dari Departemen Agama R.I yaitu peningkatan status menjadi diakui dan penambahan 1 (satu) jurusan yakni jurusan Tarbiyah dengan status terdaftar berdasarkan SK Menteri Agama R.I No.181 tahun 1996. Pada tahun ini juga terjadi perubahan nama lembaga menjadi Sekolah Tinggi Agama Islam Malikussaleh (STAIM) dengan 2 (dua) Jurusan yaitu jurusan Syariah dan jurusan Tarbiyah.
Setelah berakhir periode kepemimpinan Drs. H.A. Muthalib Hasan pada bulan Juni 2001 maka Sekolah Tinggi Agama Islam Malikussaleh Lhokseumawe dipimpin oleh Drs. Hafifudin untuk periode 2001–2005 berdasarkan Keputusan hasil rapat senat STAIM bulan Juli 2001.