Persma Manado 1960 musim 2016

Di Liga Nusantara 2016 zona Sulawesi Utara, Persma Manado 1960 tergabung dalam grup A1 bersama PS Manado, PS Bank Sulut, dan Persis Sangihe. Semua pertandingan diadakan di Stadion Klabat Manado. Persma Manado 1960 berhasil menjadi pimpinan klasemen grup A1 dengan 2 kali menang dan 1 kali imbang. Di babak kedua (6 Besar) Persma Manado 1960 tergabung dalam satu grup yang berisikan Persmin Minahasa dan Bintang Muda Matali Bolaang Mongondow dan berhasil memborong 2 kemenangan.