Pembantaian pesantren Walisongo 2000

Kesaksian untuk Human Rights Watch menunjukkan bahwa modus operandi para militan mirip dengan kota-kota lain yang dihuni oleh warga Muslim; lebih lanjut 8 warga Muslim menghilang dari desa Tabalu setelah penyerang menyuruh penduduk setempat berkumpul dan berjalan ke kelurahan Kasiguncu. Setidaknya 14 transmigran Muslim dari Lombok dan Jawa kemudian menghilang setelah diculik dari kota lain oleh sekitar 100 militan bertopeng yang telah memerintahkan penduduk setempat berkumpul di balai desa. Para saksi menggambarkan bahwa para militan memiliki daftar nama orang untuk diculik dan beberapa truk untuk mengangkut mereka.