She of Little Faith

Freiberger membawa alur kedua yang melibatkan roket model di awal dari episode ini. Ia membuatnya berdasarkan pengalaman nyatanya saat kecil di mana ia dengan tidak sengaja meluncurkan sebuah roket model ke sebuah jendela di rumahnya. Sebuah adegan dari alur kedua ini dihapus dari episode setelah penyerangan menara kembar WTC 11 September 2001. Adegan tersebut menampilkan seseorang bernama Hassan Jay Salam yang ditahan oleh polisi yang beranggapan bahwa roket yang diluncurkan oleh Bart dan Homer diluncurkan oleh Salam (roket tersebut memiliki tulisan HJS, yang merupakan singkatan Homer J Simpson). Setelah penyerangan tersebut, adegan ini dinilai terlalu ofensif oleh pihak sensor Fox sehingga dihapus. Aslinya, alur keduanya juga akan melibatkan Marge mendorong agar Homer membuat roket model bersama Bart. Homer tidak ingin melakukannya pada awalnya, namun setelah Marge meyakinkannya, ia kemudian lebih serius mengerjakannya daripada Bart. Ide alur tersebut didukung oleh beberapa penulis yang menganggap bahwa Marge "memiliki peran sedikit" selama ini dan menurut Freiberger, Marge akan memiliki "peran yang sangat besar untuk mendukung cerita" jika alur tersebut tidak dihapus.
Gereja hasil renocasi dalam episode ini dibangun seperti pusat perbelanjaan dengan beberapa toko di dalamnya dan Pendeta Lovejoy memasukkan produk dan program televisi pada ceramahnya. Adegan tersebut digunakan untuk menyindir ""megachurch"" dan komersialisasi yang terkadang terkait dengan lembaga-lembaga tersebut. Episode ini juga menjelaskan bahwa, walaupun Natal telah kehilangan banyak dari arti intinya, Natal tetap penting untuk "menjaga pikiran-pikiran tersebut di dalam diri sendiri untuk membuat keluarga bahagia." Walaupun "She of Little Faith" adalah episode Natal, kata "holiday" tidak disebutkan hingga sesi ketiga. Jean menyebutkan dalam komentar di DVD mengenai episode ini bahwa para penulis tidak ingin membuat sebuah episode Natal yang biasan dan menginginkan "meluncur menuju" subjek episodenya.