Babak kedua kualifikasi Liga Eropa UEFA 2012–13

Babak kedua kualifikasi ini diikuti oleh 80 klub. terdiri atas 37 pemenang babak pertama dan 43 klub yang langsung lolos ke babak kedua. 40 klub pemenang babak kedua akan mengikuti babak ketiga kualifikasi bergabung dengan 18 klub lain yang langsung lolos ke babak ketiga.