The Second Coming

Sementara itu Hiro Nakamura, yang telah menjadi pemimpin atas perusahaan yang diwariskan ayahnya, merasa bosan karena tidak merasakan petualangan. Ando menemui Hiro untuk menyerahkan surat wasiat dari Kaito, ayah Hiro. Surat itu berisi pernyataan Kaito kepada Hiro supaya tidak pernah membuka sebuah brankas dengan rahasia penting yang dapat membahayakan kehidupan dunia. Akan tetapi Hiro berusaha membuka brankas untuk mendapat sebuah petualangan. Hiro mendapat rekaman lain dari brankas tentang sebuah tulisan molekular yang tiba-tiba dirampas oleh seorang wanita dengan kekuatan kecepatan super. Hiro berusaha menghentikan wanita itu namun gagal. Hiro memutuskan pergi ke masa depan dan melihat apa yang akan terjadi dengan tulisan itu. Di masa depan, Hiro melihat Ando dan dirinya sedang berebut tulisan itu, namun Ando berkhianat dan menyerangnya. Langit seketika menjadi gelap dan ada ledakan besar muncul, akan tetapi Hiro berhasil kembali dari masa depan.