Sistem modifikasi restriksi

Bakteri memiliki enzim restriksi (juga disebut endonuklease restriksi) yang memotong DNA beruntai ganda di titik tertentu menjadi potongan-potongan yang akan semakin terdegradasi oleh endonuklease-endonuklease lainnya. Dengan ini infeksi dapat dicegah, karena DNA asing yang dibawa oleh agen infeksi (seperti bakteriofag) dapat dihancurkan. Sekitar seperempat bakteri memiliki sistem modifikasi restriksi dan sekitar setengah memiliki lebih dari satu jenis sistem semacam itu.