Umat Katolik Mangalore

Berbagai serangan dari Kemaharajaan Maratha atas Goa sepanjang pertengahan abad ke-16 memicu gelombang besar migrasi yang ketiga. Tahun 1664 Shivaji, pendiri Kemaharajaan Maratha, menyerang Kudal, sebuah kota di utara Goa, dan memulai operasinya atas Goa. Setelah kematian Shivaji pada 3 April 1689, anaknya Sambhaji naik takhta. Gempuran Sambhaji di sepanjang wilayah utara Goa mendorong hampir semua umat Kristen untuk meninggalkan daerah asal mereka dan bermigrasi ke Kanara Selatan. Arus migrasi meningkat seiring dengan jatuhnya "Provinsi Utara" Portugis (yang mana termasuk Bassein, Chaul dan Salsette) dan merupakan ancaman langsung terhadap keberadaan Goa pada tahun 1738–1740.