Babak gugur Liga Eropa UEFA 2016–17

dari babak grup Liga Eropa, juara grup otomatis berada di pot unggulan sedangkan runner-up grup berada di pot non-unggulan.
dari babak grup Liga Champions
Undian dilangsungkan pada tanggal 12 Desember 2016. Pertandingan pertama akan dimainkan pada tanggal 16 Februari, dan dan pertandingan kedua dimainkan pada tanggal 22 dan 23 Februari 2017.
"APOEL menang dengan agregat 4–3."