Daftar ekoregion di Indonesia

Di sebelah timur Garis Wallacea adalah bioregion Wallacea yang terdiri atas pulau-pulau yang tidak pernah terhubung dengan sebuah benua, tetapi terdorong ke utara oleh pergerakan benua Australia. Wallacea adalah kawasan transisi antara Asia dan Australia. Kawasan ini memiliki flora yang kebanyakan berciri khas Indomalaya dengan sedikit campuran Australasia dan fauna reptil dan burung yang kebanyakan berciri khas Australia tanpa mamalia besar.