Babak gugur Piala AFC 2012

Undian pada babak 16 besar dilakukan berdasarkan babak grup, sedangkan untuk perempat-final, semifinal dan final akan diadakan pengundian baru. PAda pengundian ini, peraturan "proteksi negara" dilakukan, yaitu: jika terdapat dua klub dari negara yang sama, maka mereka tidak boleh bertemu pada perempta-final, namun jika terdapat lebih dari dua klub dari negara yang sama, mereka boleh bertemu pada babak perempat-final.