Institut Agama Islam Sultan Muhammad Syafiuddin Sambas

Badan Penyelenggara (BP) IAIS Sambas adalah Yayasan Akhlakul Karimah.
Dewan Penyantun merupakan perwakilan tokoh-tokoh masyarakat, pemerintah pusat, dan daerah, yang terdiri dari:
Senat beranggotakan Guru Besar, Rektor, Wakil Rektor, Dekan Fakultas/Direktur Pascasarjana, dan Perwakilan Dosen Fakultas. Rektor adalah Ketua Senat dengan dibantu seorang Sekretaris Senat yang dipilih dari anggota senat.
Rektor merupakan pimpinan tertinggi yang bertanggung jawab atas penyelenggaraan pendidikan di IAIS Sambas. Rektor IAIS Sambas dibantu oleh 3 orang wakil rektor sebagai berikut:
Berikut ini adalah daftar ketua/rektor IAIS Sambas sejak awal berdirinya: