Paus biru

Paus biru biasanya diklasifikasikan sebagai salah satu dari delapan spesies paus dalam genus "Balaenoptera". Ada pula ahli yang menempatkan paus ini dalam genus "Sibbaldus", walaupun pengklasifikasian ini tidak disetujui. Analisis rangkaian asam deoksiribonukleat (ADN) menunjukkan bahwa paus biru secara filogenetik lebih dekat dengan paus sei ("Balaenoptera borealis") dan paus bryde ("Balaenoptera brydei") daripada spesies "Balaenoptera" lainnya, dan lebih dekat dengan paus bungkuk ("Megaptera") dan paus abu-abu ("Eschrichtius") daripada paus minke ("Balaenoptera acutorostrata" dan "Balaenoptera bonaerensis"). Jika penelitian lebih lanjut memastikan hubungan ini, mungkin famili Balaenopteridae perlu direklasifikasi.
Paling tidak tercatat sebelas kasus persilangan antara paus biru dengan paus sirip di alam. Menurut Arnason dan Gullberg, jarak genetik antara paus biru dengan paus sirip kurang lebih mirip dengan jarak antara manusia dan gorila. Sementara itu, beberapa peneliti yang bertugas di Fiji melaporkan bahwa mereka telah mengabadikan citra paus hasil persilangan antara paus biru dan paus bungkuk.