Aksara paku

Kuneiform mempunyai format khusus untuk alihaksarakan atau transliterasi. Karena tulisan ini berbentuk , transliterasinya membutuhkan pilihan tertentu bagi para pakar transliterasi, yang harus memutuskan kasus-kasus setiap huruf di mana ada beberapa makna yang mungkin dimaksudkan oleh dokumen aslinya. Misalnya tanda DINGIR pada teks Hitit dapat melambangkan suku kata Hitit "an" atau merupakan bagian dari suatu frasa Akkadia, melambangkan suku kata "il", dapat pula merupakan sebuah Sumerogram, melambangkan makna Sumeria asli, 'allah' atau suatu determinative bagi sesosok dewa. Dalam transliterasi, berbagai rendisi glif yang sama dipilih berdasarkan perannya pada konteks tersebut.
Tabel berikut menunjukkan tanda-tanda yang dipakai untuk suku kata sederhana dalam bentuk CV atau VC. Sebagaimana dipakai untuk bahasa Sumeria, tulisan kuneiform pada prinsipnya mampu membedakan paling sedikit 16 konsonan, yang dialihaksarakan sebagai
serta empat kualitas vokal, "a, e, i, u".
Bahasa Akkadia tidak menggunakan huruf "g̃" atau "ř" tetapi perlu untuk membedakan "emphatic series", "q, ṣ, ṭ", mengambil berbagai tanda Sumeria "superfluous" untuk maksud itu (misalnya "qe"=KIN, "qu"=KUM, "qi"=KIN, "ṣa"=ZA, "ṣe"=ZÍ, "ṭur"=DUR dsb.)
Orang Hitit mengadopsi kuneiform Akkadia dan selanjutnya memperkenalkan tanda-tanda untuk glide "w", misalnya "wa"=PI, "wi"=GEŠTIN) serta suatu ligature I.A untuk "ya".