Kereta rel listrik Tokyo Metro seri 5000

Keberadaan KRL ini mulai tergeser seiring waktu dengan diluncurkannya KRL Tokyo Metro seri 05 dan 05N, dimana produksi KRL seri 05N ini selesai pada tahun 2004 dan membuat KRL seri 5000 pun semakin tergeser posisinya. KRL ini pensiun pada tahun 2006, dan penarikan KRL ini dari Tozai Line bersamaan dengan KRL Tōyō Rapid 1000 yang juga pensiun karena KRL tersebut pada dasarnya adalah modifikasi dari Tōkyō Metro 5000. Akhirnya, sisa rangkaian yang masih utuh diboyong ke Indonesia dan tersisa 2 set di Jepang dengan rincian 3 kereta per set dan dijalankan di jalur Tokyo Metro Chiyoda Branch Line untuk melayani perjalanan KA jalur cabang antara stasiun Ayase dan stasiun Kita-Ayase. Saat ini KRL tersebut telah digantikan oleh sisa KRL Tokyo Metro seri 05 yang tidak diboyong ke Indonesia dan dirucat, dengan formasi 3 kereta dalam 1 rangkaian.