Margarete, Ratu Bohemia

Setahun kemudian, pada tanggal 23 September 1253, Raja Václav I mangkat. Ottokar menjadi Raja Bohemia sebagai Ottokar II dan Margaret menjadi Permaisurinya. Akan tetapi, pada saat itu, terbukti bahwa Margarete (yang telah berusia 50 tahun), mandul. Raja Ottokar II mencoba untuk mendapatkan izin dari Paus untuk mengakui anak haramnya yang ia miliki dari salah satu pelayan Margarete sebagai pewaris sahnya. Setelah Paus menolak hal tersebut, pada tahun 1261 Raja mendapatkan pembatalan pernikahannya dengan Margarete. Ratu yang diabaikan itu meninggalkan Bohemia dan kembali ke Austria, ia tinggal di Krumau am Kamp dan selama musim dingin di Krems.