Makam Santo Petrus

Kuburan yang diklaim oleh Gereja sebagai milik Santo Petrus terletak di kaki aedicula di bawah lantai. Bekas jenazah empat orang dan beberapa hewan ternak telah ditemukan di kuburan ini. Pada tahun 1953, setelah upaya arkeologi awal telah selesai, satu set tulang yang ditemukan itu dikatakan telah dipindahkan tanpa sepengetahuan para arkeolog dari ceruk ("loculus") di sisi utara dinding (dinding grafiti) yang berbatasan dengan dinding merah di sebelah kanan aedicula. Pengujian berikutnya menunjukkan bahwa ini adalah tulang laki-laki berusia 60-70 tahun. Margherita Guarducci berpendapat bahwa ini adalah sisa-sisa Santo Petrus dan bahwa tulang-tulang itu telah dipindahkan ke sebuah ceruk di dinding grafiti dari kubur di bawah aedicula "pada zaman Constantine, setelah perdamaian gereja" (313). Antonio Ferrua, arkeolog yang memimpin penggalian yang mengungkap apa yang dikenal sebagai Makam Santo Petrus, mengatakan bahwa dia tidak yakin bahwa tulang yang ditemukan orang-orang itu adalah dari Santo Petrus.