Babak gugur Liga Champions Wanita UEFA 2016–17

Undian untuk babak 32 besar dilaksanakan pada 1 September 2016, 13:30 CEST, di kantor pusat UEFA di Nyon, Swiss.Pertandingan pertama dilangsungkan tanggal 5 dan 6 Oktober, sedangkan pertandingan kedua dilangsungkan tanggal 12 dan 13 Oktober 2016.