Institut Agama Islam Sultan Muhammad Syafiuddin Sambas

Cikal bakal IAIS Sambas adalah kelas jauh Program Studi Bimbingan dan Penyuluhan Islam (BPI) Jurusan Dakwah STAIN Pontianak yang dibuka pada tahun 2003 atas kerjasama Jurusan Dakwah STAIN Pontianak dengan Kantor Departemen Agama dan Pemerintah Kabupaten Sambas. Tahun pertama jumlah mahasiswanya hanya 26 orang dan tahun kedua meningkat menjadi 60 orang. Dengan adanya respon positif dari masyarakat, Bupati Sambas Ir. Burhanuddin A. Rasyid dan Ketua Jurusan Dakwah STAIN Pontianak kemudian membentuk Tim Khusus Persiapan Pembentukan STAI Sambas pada tahun 2003. Setahun kemudian, tim khusus tersebut menyelenggarakan "Semiloka Pendirian Perguruan Tinggi Islam dengan nama STAIN Basuni Imran Sambas" pada 8 Maret 2004 di Sambas. Kegiatan tersebut menyepakati pendirian sebuah perguruan tinggi Islam dengan nama STAI Sultan Muhammad Syafiuddin Sambas (STAIS Sambas) dibawah naungan Yayasan Pendidikan Islam Syafiuddin (YAPIS) Pontianak sebelum nantinya menjadi perguruan tinggi negeri. Pada 1 Juli 2004, STAIS Sambas resmi berdiri dengan keluarnya SK Ketua YAPIS Pontianak dan terdaftar berdasarkan Rekomendasi Kopertais Wilayah XI Nomor Kop.Wil.XI/PP.03.2/48k/2004. STAIS Sambas terselenggara dengan Drs. Munawar, M.Si., sebagai Ketua STAIS Sambas; Drs. H. Suyadi Widjaya sebagai Ketua Badan Penyelenggara Pendidikan; Ir. Burhanuddin A. Rasyid sebagai Pelindung; dan H. Hasan Kamaruddin, S.H., sebagai Ketua Pengawas dari pihak yayasan.
Pada tahun 2006, STAIS Sambas berubah nama menjadi Sekolah Tinggi Ilmu Tarbiyah (STIT) Sultan Muhammad Syafiuddin Sambas. Perubahan ini mengikuti SK Direktorat Jenderal Pendidikan Islam Kementerian Agama RI Nomor DJ.II/197/2006 terkait izin operasional Program Studi Pendidikan Agama Islam Jurusan Tarbiyah. Ditahun yang sama, Dr. H. Jamiat Akadol, M.Si., ditunjuk sebagai Ketua STIT Sambas menggantikan Drs. Munawar, M.Si.
Pada tahun 2010, STIT Sambas kembali berubah nama menjadi STAIS Sambas dikarenakan adanya rencana penambahan program studi. Program Studi S1 Qur'an Hadits dan S1 Sejarah dan Kebudayaan Islam (SKI) resmi dibuka pada tahun 2011. Program studi D3 Perbankan Syariah dan S1 Hukum Ekonomi Syariah dibuka pada tahun 2012.
STAIS Sambas kembali mengalami perubahan nama seiring dengan peningkatan statusnya menjadi institut. STAIS Sambas resmi menjadi Institut Agama Islam Sultan Muhammad Syafiuddin Sambas (IAIS Sambas) dengan terbitnya SK Dirjen Pendis Kemenag RI Nomor 3178 Tahun 2014. Ditahun yang sama, Program Studi S1 Pendidikan Guru Madrasah Ibtidaiyah (PGMI), S1 Pendidikan Guru Raudatul Athfal (PGRA), S1 Komunikasi dan Penyiaran Islam (KPI), dan S1 Bimbingan dan Konseling Islam (BKI) resmi dibuka dengan terbitnya SK Dirjen Pendis Kemenag RI Nomor 3536 Tahun 2014.