Pokémon Mystery Dungeon: Blue Rescue Team dan Red Rescue Team

Pemain bangun suatu hari menemukan bahwa mereka telah berubah menjadi Pokémon, tanpa memori masa lalu mereka. Dalam dunia hancur oleh banyak bencana alam - yang hanya mulai terjadi baru-baru ini pemain dan Partner baru dibuat bergabung dan membentuk tim penyelamat. Tim bertemu tim penyelamat lainnya, termasuk tim penyelamat peringkat atas yang terdiri dari Alakazam, Charizard dan Tyranitar, bernama Tim ACT. Tim membuat musuh tanpa disadari dengan tim penyelamat lain, Tim meanies, yang terdiri dari Gengar, Ekans, dan Medicham, yang mencari dominasi dunia bawah penyamaran tim penyelamat. Tidak jauh ke dalam alur cerita, pemain ini menceritakan tentang sebuah legenda tentang Ninetales mengutuk pada seorang manusia yang sengaja menyentuh ekor Ninetales ini. Ninetales meramalkan bahwa manusia pada akhirnya akan terlahir kembali sebagai Pokémon, dan bahwa keseimbangan alam dunia akan marah. Dalam upaya untuk menemukan memori yang hilang pemain dan tujuan sebagai Pokémon, pencarian tim ke tempat peramal Xatu berada. Xatu cepat menyadari bahwa pemain pernah menjadi manusia, dan mengatakan bahwa pemain transformasi manusia ke Pokemon. Percakapan ini terdengar oleh Tim meanies 'Gengar, yang mengungkapkan rahasia pemain kepada warga kota dan mengatakan bahwa menghilangkan manusia (yang) berubah-Pokémon dalam legenda akan membawa semuanya kembali normal.