Pokémon Ruby dan Sapphire

Selain hal diatas, Ruby dan Sapphire juga memperkenalkan dua sindikat kriminal yang baru, yaitu Team Aqua dan Team Magma. Perbedaannya, jika kita memainkan versi Sapphire, maka yang akan menjadi sindikat kriminal adalah Team Aqua, dan Team Magma akan menjadi aliansi kita, sebaliknya jika kita memainkan versi Ruby, maka yang akan menjadi musuh adalah Team Magma, dan Team Aqua akan menjadi sekutu kita.