Paus Aleksander VI

Sebagai alternatif, telah diperdebatkan bahwa ayah Rodrigo adalah Jofré de Borja y Escriva, membuat Rodrigo a Borja dari sisi ibunya dan ayahnya. [5] Namun, anak-anaknya diketahui berasal dari silsilah ayah Llançol. Beberapa revisionis menunjukkan bahwa kebingungan tersebut disebabkan oleh upaya untuk menghubungkan Rodrigo sebagai ayah Giovanni (Juan), Cesare, Lucrezia dan Gioffre (Jofré di Valencia), yang bermarga Llançol i Borja. [6]