Gereja Baru Theotokos

Dalam interior gereja, nave berakhir pada apse besar yang diapit oleh dua kamar kecil simetris dengan apse tertulis di dinding timur. Tidak jelas apakah nave dari "Nea" memiliki tiga atau lima lorong, tapi karena dimensi yang besar gereja ini belum pernah terjadi sebelumnya (sekitar 100 m panjangnya dan 52 m lebarnya), arkeolog Yoram Tsafrir dan Nahman Avigad sepakat bahwa meskipun hanya dua baris kolom interior yang telah ditemukan, dua baris tambahan tetap diperlukan untuk mendukung struktur atap.
Selain menjadi basilika terbesar yang dikenal di Palestina, "Nea" juga meliputi biara, asrama, dan rumah sakit, seperti yang dicatat oleh Antoninus dari Piacenza, yang mengunjungi basilika St. Mary pada tahun 570, "dengan adanya jemaat biarawan yang besar, dan tempat penginapan tamu untuk laki-laki dan perempuan. Untuk menarik para wisatawan mereka memiliki sejumlah besar meja, dan lebih dari tiga ribu tempat tidur untuk orang sakit." Tidak jelas di mana bangunan lainnya ini berada. Berdasarkan temuan arkeologis dari tembok revetment selatan kompleks gereja "Nea", dan dengan asumsi bahwa kompleks itu simetris, para arkeolog memperkirakan lebar keseluruhan yang kompleks itu 105 m.