Universitas Janabadra

1. Pusat Studi Kebangsaan
2. Pusat Studi Kewirausahaan
3. Pusat Studi Lingkungan
4. Pusat Studi Pemikiran Sistem & Komputasi Lunak
5. Pusat Studi Pengembangan Daerah
6. Pusat Studi Pengembangan Teknologi
7. Pusat Studi Transportasi
8. Pusat Studi Wanita