Bayezid II

Di sisi lain, Bayezid menyaksikan kebangkitan Dinasti Safawiyah di Iran dan sekitarnya, menggeser kepemimpinan negara Aq Qoyunlu yang semula menjadi penguasa di kawasan tersebut. Pendiri dinasti ini, Ismail I, adalah putra Martha (Halima Begum), putri Uzun Hasan dan Theodora. Uzun Hasan sendiri adalah pemimpin Aq Qoyunlu yang berkuasa pada 1453 sampai 1478, sedangkan Theodora adalah putri Yohanes (Ioannes) IV Komnenos, Kaisar Trebizond. Pada masa Ismail, Islam Sunni mulai tersingkir dari Persia karena para pemeluknya dipaksa berpindah ke Syi'ah, diusir, atau dihukum mati. Daniel W. Brown menyatakan bahwa Ismail adalah "penguasa Syi'ah paling berhasil dan tidak toleran setelah jatuhnya Fatimiyah." Kebenciannya pada Sunni dikenal tanpa batas dan siksaannya atas mereka sangat kejam. Bayezid memberikan nasihat secara kebapakan kepada Ismail untuk menghentikan kebijakan anti-Sunni yang dia lakukan, tetapi Ismail mengabaikannya dan melanjutkan penyebaran Syi'ah dengan pedang. Alasan penyebaran Syiah secara paksa oleh Ismail di antaranya untuk memberikan jati diri yang khas bagi Safawiyah untuk membedakan mereka dengan negara-negara tetangga mereka yang merupakan negara-negara militer Turki-Sunni seperti Utsmani.