Rantai samping

Dalam protein, yang tersusun dari residu asam amino, rantai samping melekat pada atom karbon-alfa dari tulang punggung amida. Rantai samping yang terhubung ke karbon-alfa spesifik untuk setiap asam amino dan bertanggung jawab untuk menentukan muatan dan polaritas kimia dari asam amino. Rantai samping asam amino juga bertanggung jawab untuk banyak interaksi yang mengarah kepada pelipatan protein yang tepat dan fungsinya. Asam amino dengan polaritas yang sama biasanya tertarik satu sama lain, sementara rantai samping nonpolar dan polar biasanya saling menolak. Interaksi nonpolar/polar masih dapat memainkan peran penting dalam menstabilkan struktur sekunder karena jumlah yang relatif besar dari mereka terjadi di seluruh protein.