Gereja Ortodoks Indonesia

Pada tahun-tahun 1990-1997, paroki-paroki GOI berada di bawah naungan Metropolitanate Hong Kong and Southeast Asia yang baru dibentuk. Pada tahun 2000, Pater Daniel mengajukan permohonan kepada "Moscow Patriarchate" agar Gereja Ortodoks Rusia ("Russian Orthodox Church") membantu pendirian komunitas Ortodoks di Indonesia. Enam orang Indonesia dilatih di seminari-seminari Rusia. Salah satunya adalah "Hieromonch" Iosaf (Tandibilang), yang belum sampai menyelesaikan studinya di seminari Belgorod, sudah ditahbiskan dalam "Russian Orthodox Church" dalam bulan April 2003. Dalam bulan Desember 2003, Metropolitan Kirill dari Smolensk dan Kaliningrad mengunjungi Indonesia. Selama kunjungan itu dibicarakan hal permohonan Pater Daniel untuk memindahkan GOI ke bawah yurisdiksi Gereja Ortodoks Rusia. Hasilnya ialah suatu keputusan untuk mengizinkan Archimandrite Daniel melayani di bawah yurisdiksi "Russian Orthodox Church Outside Russia" (ROCOR). Dalam bulan Februari 2005, sehubungan dengan kurangnya tenaga, ia memanggil beberapa mahasiswa seminari Rusia ke Indonesia, dan segera ditahbiskan menjadi imam oleh Archbishop Sydney, Australia dan New Zealand (sekarang "primate" dari Russian Orthodox Church Outside Russia).