Perancangan cerdas

Sains empiris menggunakan metode ilmiah untuk menciptakan pengetahuan "a posteriori" yang didasarkan pada pengamatan dan pengujian hipotesis dan teori secara berulang-ulang. Para pendukung perancangan cerdas berusaha mengubah dasar fondasi ilmiah ini dengan menghilangkan "naturalisme metodologis" dari sains dan menggantikannya dengan apa yang disebut oleh Phillip E. Johnson sebagai "realisme teistik". Beberapa pihak telah menyebut pendekatan ini sebagai "supranaturalisme metodologis", yang berarti kepercayaan akan realitas transeden di luar dimensi alam yang dihuni oleh dewa transeden yang non-natural pula. Para pendukung perancangan cerdas berargumen bahwa penjelasan naturalistik gagal dalam menjelaskan fenomena-fenomena tertentu, manakala penjelasan supranatural dapat memberikan penjelasan yang sangat sederhana dan intuitif mengenai asal usul kehidupan dan alam semesta. Mereka mengatakan pula bahwa bukti-bukti argumen ini terdapat dalam bentuk kerumitan tak tersederhanakan dan kerumitan spesifik yang tidak dapat dijelaskan oleh proses-proses alam.