Insiden penyerempetan kapal Indonesia dan Malaysia 2005

Pemimpin Redaksi Kompas, Suryopratomo kemudian membuat permohonan maaf dalam sebuah berita yang dilaporkan di halaman depan harian tersebut pada 4 Mei 2005, di bawah judul "Kompas dan Deputi Perdana Menteri Malaysia Sepakat Berdamai".