Kualifikasi Piala Dunia FIFA 2006 – Babak Ketiga Zona Asia

Pada babak ini, 8 tim yang berhak melaju dari Babak Kedua dibagi ke dalam 2 grup secara acak, yang terdiri dari 4 tim di setiap grup, untuk bermain satu sama lain dua kali. Pertandingan dimainkan di negara yang bertindak sebagai tuan rumah dalam setiap pertandingan. Pemenang masing–masing grup mendapatkan tiket langsung ke putaran final di Jerman, sementara peringkat ketiga setiap grup akan bermain satu sama lain kandang–tandang dalam suatu pertandingan "play-off", dan pemenangnya akan mewakili AFC dalam pertandingan play-off melawan wakil dari CONCACAF untuk selanjutnya melaju ke putaran final.
Sejumlah 4 tim berhasil melaju ke Putaran Final Piala Dunia FIFA 2006 di Jerman.