Marvel: Avengers Alliance

Di musim pertama, permainan berputar di sekitar kejadian galaksi yang disebut "The Pulse" menabrak Bumi. Kejadian ini melepaskan senyawa aneh yang disebut "Iso-8". Beberapa penjahat dan organisasi kriminal (yang terdiri dari A. I. M., Brotherhood of Mutants, the Hand, HYDRA, dan Maggia), dan pihak dari dimensilain mencoba untuk mengambil keuntungan dari kejadian tersebut dan berbuntut terbentuknya aliansi penjahat yang disebut "The Syndicate". Musim ini dibagi menjadi dua belas bab, yang masing-masing terdiri dari enam misi. Pada misi ke-enam dari setiap bab memerlukan karakter tertentu untuk membuka. Musim ini berakhir dengan kehancuran The Syndicate, kebangkitan Red Skull, dan perang saudara dalam tubuh HYDRA.