Front Pembebasan Nasional Farabundo Martí

Pada pemilihan presiden 1999, FMLN mencalonkan Facundo Guardado sebagai kandidat mereka. Ini adalah suatu keputusan yang kontroversial dan banyak di kalangan FMLN yang tidak mendukung Guardado, karena mereka percaya bahwa politiknya sedang beralih ke kanan. Dari konflik internatl ini, muncul dua kecenderungan terorganisir di dalam FMLN - Renovadores dan Coriente Revolucionario y Socialista (Arus Sosialis Revolusioner). Dua pemimpin utama CRS adalah tokoh-tokoh pemimpin histories FMLN Schafik Handal dan Salvador Sanchez Ceren. Pemimpin utama dari Renovadores adalah Facundo Guardado. Sebagai bekas komandan FPL yang karismatis, Guardado mempunyai basis pendukung dalam FMLN. Ia mengkritik kepemimpinan historis dan menganggapnya terlalu komunis dan menyerukan suatu ideology yang diperbaru. CRS mengkritik Guardado karena menganjurkan politik sosial demokrasi dan karena tidak jelas-jelas menentang neoliberalisme. Setelah beberapa tahun pergolakan internal, di mana Arus Sosialis Revolusioner memenangi sebagian besar pemilihan internal dalam organisasi ini, Guardado menjadi lebih frustrasi, menyerang para pemimpin FMLN yang tidak disetujuinya, dan melakukan tindakan-tindakan yang berlawanan dengan keputusan-keputusan yang telah diambil oleh partai. Akhirnya ia dipecat dan beberapa pendukungnya meninggalkan FMLN. Guardado berusaha membentuk Renovadores sebagai partai politiknya sendiri, namun mereka mendapatkan sedikit sekali dukungan pada pemilu 2003 dan kemudian bubar.