Penaklukan Altishahr oleh Zunghar

Ketika Afaq Khoja melarikan diri ke Lhasa, ia meminta Dalai Lama Ke-5 untuk membantu faksinya mengambil alih kekuasaan Cekungan Tarim (Kashgaria). Pemimpin Zunghar, Galdan, kemudian diminta oleh Dalai Lama untuk mengembalikan posisi Afaq Khoja sebagai penguasa Kashgaria. Afaq Khoja berkolaborasi dengan Zunghar Galdan untuk menaklukkan Cekungan Tarim tahun 1678-1680 dan menempatkan Afaq Khoja sebagai penguasa boneka. Dalai Lama ke-5 mendukung penaklukan Galdan atas Cekungan Tarim dan Turpan. Dalai Lama Ke-5 memperoleh rampasan perang yang disita dari orang-orang Muslim dari Galdan Khan Zunghar. Orang-orang Muslim itu disebut "sesat" oleh mereka.