MA Negeri Yogyakarta 2

Tahun 1950 sekolah Guru Agama Islam Putri (SGAIP) berdiri dan bertempat di Gedung SD Netral, Jalan Malioboro yang dipimpin oleh Ibu Sri Atinah (alm). Melalui SK Menteri Agama No.162/A/C9, tanggal 25 Agustus 1950 SGAIP resmi menjadi sekolah Negeri. Tahun 1954 SGAIP berubah menjadi Pendidikan Guru Agama Atas (PGAA) bertempat di Jalan K.H.Ahmad Dahlan No.130, Ngampilan,Yogyakarta. Pada tahun 1971, PGAA berubah menjadi PGAN Putri 6 tahun.
Pada tahun 1978, PGAN 6 tahun berubah menjadi Madrasah Tsanawiyah Negeri (MTsN) dan Madrasah Aliyah Negeri (MAN).
MTsN menepati gedung sendiri di daerah Giwangan, Umbulharjo yang kini menjadi MTsN Yogyakarta II, dan MAN sendiri kini disebut dengan MAN Yogyakarta II, masih menepati gedung lama. Gedung lama tersebut merupakan gedung yang bersejarah karena pada masa pemerintahan Indonesia pindah di Yogyakarta gedung tersebut menjadi Kantor Menteri Agama.