To Aru Majutsu no Index

Cerita ini mengambil tempat di , sebuah kota berteknologi maju terletak di barat kota Tokyo yang dikenal sebagai pusat pendidikan dan penelitian. Toma Kamijo adalah salah satu siswa di Academy City yang memiliki kemampuan Imagine Breaker tangan kanannya, yakni kemampuan untuk menetralkan kekuatan supranatural yang dilakukan oleh Magicican dan Esper, namun tidak pada keberuntunganya maka dari itu ia sering mengalami kesialan. Toma bertemu dengan seorang gadis muda bernama Index, seorang biarawati dari necessarius, cabang sihir rahasia gereja inggris. Otak Index telah ditanamkan "Index Librorum Prohibitorum", yakni 103.000 buku sihir yang telah dihapus dan dilarang peredaraannya oleh Gereja. Pertemuan Toma dengan Index membuatnya berada di tengah konflik antara Magician dan Esper di Academy City yang mencoba untuk mengungkap rahasia gelap dari kota itu.