Stasiun Bojonegoro

Dahulu ke arah timur dari jalur 2 stasiun ini terdapat jalur rel yang berakhir di Rembang, namun kini jalur itu sudah tidak dioperasikan lagi. Jalur ini juga bercabang di Rembang menuju Blora dan Cepu yang juga sudah dinonaktifkan. Terakhir jalur ini dipakai untuk mengangkut pasir kuarsa dari Stasiun Jatirogo, sebelum layanan ini dihentikan tahun 2001 silam. Stasiun Bojonegoro dahulu juga mempunyai dipo lokomotif di sebelah barat laut dan pernah melayani kereta api angkutan pasir kuarsa ke Cilacap. Sisa-sisa dari dipo lokomotif tersebut yang masih dapat dilihat dengan jelas hanyalah dua gerbong bergandar dua dan empat yang kini ditumpuk di sebelah jalur 7 (sebelumnya disimpan di sepur badug antara jalur 2 dan 3 yang sekarang sudah tidak punya akses keluar lagi karena weselnya yang berada di jalur 2 sudah dicabut) serta jembatan rel tua bekas ke arah dipo di sebelah barat stasiun.