Kereta api Malioboro Ekspres

KA Malioboro juga dapat dipakai sebagai moda transportasi penghubung dari Malang ke objek wisata yang ada di Yogyakarta dan sebaliknya. Untuk kemudian meneruskan perjalanan ke Gambir dengan Taksaka P/M (51/53) dan sampai di Jakarta pada sore hari (51) dan pagi hari (53), maupun ke Pasar Senen dengan Senja Utama Yogya (119) ataupun Fajar Utama Yogya (117) dan sampai di Jakarta pada dini hari (119) dan pada siang hari (117).