Alyson Hannigan

Hannigan menikahi rekan aktornya di "Buffy the Vampire Slayer", Alexis Denisof, di Two Bunch Palms Resort, Desert Hot Springs, California, pada tanggal 11 Oktober 2003. Keduanya dikaruniai dua putri, Satyana Marie Denisof (l. 24 Maret 2009) dan Keeva Jane Denisof (l. 23 Mei 2012).
Hannigan dan suaminya adalah orang tua baptis Arden, putra Joss Whedon.