Kerapatan elektron

Perangkat lunak pemodelan molekuler sering menyediakan citra grafis kerapatan elektron. Misalnya, pada anilin (lihat gambar di kanan). Model grafis, termasuk kerapatan elektron adalah alat yang umum digunakan dalam pendidikan kimia. Perhatikan pada gambar anilin paling kiri, kerapatan elektron tinggi dikaitkan dengan karbon dan nitrogen, namun hidrogen yang hanya memiliki satu proton di dalam intinya, tidak terlihat. Inilah alasan mengapa difraksi sinar-X memiliki waktu sulit untuk menentukan posisi hidrogen.