Biologi sistem

COPASI adalah simulator model independen yang bekerja untuk "file" yang terkode dalam format SBML. COPASI mampu mensimulasikan model yang didasarkan pada "Ordinary Differential Equation" (ODESs) dan model stokastik mengunakan algoritme Gillespie. COPASI menyediakan perangkat untuk analisis visual data simulasi dan juga mampu menjalanankan analisis kontrol metabolisme pada keadaan steady state.