Maleficent

Setahun setelah Kingdom Hearts, Diablo mengambil sisa pakaian Maleficent di menara Yen Sid. Ingatan ketiga peri membuatnya hidup kembali. Maleficent segera bersatu dengan Pete, karena di game sebelumnya Pete melakukan perjalanan ke berbagai dunia untuk membuatkan Maleficent sebuah pasukan Heartless yang sangat kuat. Masih dengan rencana yang sama untuk mengambil Kingdom Hearts, Maleficent membangun dasar operasi yang baru, juga dendamnya terhadap Sora, Donal, & Gufi. Rencana Maleficent di sini ia akan mengambil alih Timeless River (Disney Castle versi masa lalu), mengirim Pete ke berbagai dunia untuk merekrut Disney Villains, lama & baru, seperti Jafar, Ursula, Hades, Scar, Captain Barbossa, & Oogie Boogie.