Muhammad bin Yahya

Di Batavia, dia mengunjungi pamannya dari pihak ibu, Habib Abu Bakar Bin Thahir. Setalah melanjutkan perjalanan ke Surabaya, di Boto Putih dia belajar agama kepada Habib Syekh Bafaqih. Selain itu, dia juga menemui saudara sepupunya yang bernama Habib Abdullah bin Ali bin Abdurrahman bin Thahir yang berada di Ambon.