Paleo-Indian

Haploid yang paling sering dikaitkan dengan genetika penduduk asli Amerindian adalah Haploid jenis Q-M3. Y-DNA, seperti DNA mitokondria, berbeda dari kromosom nukleus lainnya, sebagian besar dari kromosom Y bersifat unik dan tidak mengalami rekombinasi kembali selama meiosis. Hal ini memungkinkan pola historis dari mutasi genetik dapat dengan mudah dipelajari. Pola ini menunjukkan penduduk Amerindians mengalami dua peristiwa genetik yang sangat khas; peristiwa pertama berkaitan dengan awal menetapnya mereka di benua Amerika, dan peristiwa kedua terjadi saat kolonisasi Eropa di Amerika. Peristiwa pertama adalah faktor penentu dari jumlah gen keturunan dan "haplotype" yang ditemukan pada DNA populasi masyarakat asli Amerindian saat ini.