Indonesia Soccer Championship B 2016

53 klub Peserta akan dibagi ke dalam delapan grup di babak awal yang menggunakan format kandang dan tandang. Setiap grup diisi enam sampai tujuh tim. Kendati demikian, direktur utama PT GTS Joko Driyono mengatakan, ada grup yang mesti bermain di tempat netral, lantaran letak klub yang berasal dari Kalimantan, Sulawesi, dan Papua, tersebut berjauhan satu dengan lainnya.