Transkripsiya
-------------

GOLGA8Hning izoformlari mavjud emas.

Bir nechta ketma-ketlikni tekislash
-----------------------------------

### Paraloglar

Clustal Omeg yordamida GOLGA8H hamda uning eng yaxshi yettita paralogining bir nechta ketma-ketlik hizalamasi (MSA) yaratilgan. Golgin kichik oilasi Aʼzosi 8 guruhidagi barcha sakkizta gen uzunligi 632 aminokislotadan iborat edi. GOLGA8Hning barcha 632 ta aminokislotalari va uning eng yaxshi yettita paralogi tahlil qilindi. Clustal Omega yordamida solishtirildi va Golgin Subfamily Aʼzosi 8H, GOLGA8H, alohida shaxs ekanligini tushunish uchun tahlil qilindi va taqqoslandi. Ikkita aminokislota GOLGA8H ni noyob qiladi: aminokislota 32tada valin va 169 aminokislotadagi sistein Barcha yetti paralog uchun 32-pozitsiyadagi aminokislotalar izolosin va 169-pozitsiyadagi aminokislotalar arginindir

Protein
-------

GOLGA8Hning taxminiy molekulyar ogʻirligi, uchta muhim raqamga yaxlitlangan holda, 71,3kDani tashkil qiladi. Bu nazariy qiymat; bashorat qilingan molekulyar ogʻirliklar faqat protein tarkibidagi aminokislotalarga asoslanadi. GOLGA8H ning nazariy izoelektrik nuqtasi bitta muhim raqamga yaxlitlanadi, pI8ga teng.

### Tarkibi

Boshqa inson oqsillari bilan solishtirganda, GOLGA8H yarim glutamin va glutamat bilan boyitilgan. Aksincha, GOLGA8H treonin, fenilalanin va tirozinda kamaygan.

 Protein ketma-ketligini statistik tahlil qilish (SAPS) orqali olingan GOLGA8H tarkibidagi aminokislota koʻpaytmalari
GOLGA8H oqsilida zaryad oqimi, hidrofobik segmentlar yoki transmembran domenlari mavjud emas. Protein uchun 62 ta aminokislota multipleti mavjud. Bu kutilgan diapazondan yuqori. Shuningdek, u yuqori davriylikka ega boʻlgan aminokislota naqshlariga ega.

### Motiflar

GOLGA8Hda 11 ta motif mavjud. Yagona eksperimental tasdiqlangan motiv 323-416 aminokislotalar hududida joylashgan glutaminga boy oqsildir.

GOLGA8H motivlari | **Motif #** | **Motif haqida maʼlumot** |
| 1 | N-glikozillanish joyi |
| 2 | cAMP- va cGMP-ga bogʻliq protein kinaz fosforillanish joyi |
| 3 | Kazein kinaz II fosforillanish joyi |
| 4 | N-miristillanish joyi |
| 5 | Protein kinaz C fosforillanish joyi |
| 6 | Alaninga boy mintaqa profili |
| 7 | Glutaminga boy hudud profili (eksperimental tasdiqlangan) |
| 8 | K-box domen profili |
| 9 | Ikki tomonlama yadroviy lokalizatsiya signali profili |
| 10 | HCaRG oqsili |
| 11 | Involukrin takrorlanadi |

### Ikkilamchi tuzilma

Phyre2 yordamida 284ta qoldiq (GOLGA8Hning 45%) yagona eng yuqori ball shabloniga 97,8% ishonch bilan modellashtirildi. Ushbu struktura alfa spirallarining juda yuqori qismini koʻrsatadi:

 284 qoldiq (45% GOLGA8H) 97,8% ishonch bilan yagona eng yuqori ball shablonida modellashtirilgan. N-terminus qizil tomondan boshlanadi va kamalakdan C-terminusga (koʻk tomon) tushadi.
### Uchinchi darajali tuzilma

GOLGA8Hning uchinchi darajali tuzilishi uchun bashorat qilingan model I-TASSER yordamida yaratildi.

 I-TASSER GOLGA8Hning bashorat qilingan uchinchi darajali tuzilishi. N-terminus qizil tomondan boshlanadi va kamalakdan C-terminusga (koʻk tomon) tushadi.

Transkript darajasini tartibga solish
-------------------------------------

### Promouter

GOLGA8Hgeni uchun bitta promotor mavjud, GXP\_2235212, uzunligi 1197 nt. U musbat ipda 30,603,030 dan 30,604,226 gacha boʻlgan asosiy juftliklardan yotadi.

### Transkripsiya faktorini ulash joylari

Bir qancha transkripsiya omillari promotor ketma-ketligiga bogʻlanishi taxmin qilinadi. Baʼzi misollar:

* Miyoblastni belgilovchi omillar
* MAF va AP1 bilan bogʻliq omillar
* GATA bogʻlovchi omillar
* E-box bogʻlovchi omillar
* AP4 va tegishli oqsillar
* Braxyuri geni, mezoderma rivojlanish omili
* Peroksizoma proliferatori tomonidan faollashtirilgan retseptor
* CCAAT bogʻlovchi omillar

 GOLGA8H uchun normal inson toʻqimalarining ifodasi profili. Har bir toʻqima turi uchun ikkita namunadan foydalaniladi. Qizil chiziqlar sonni, koʻk kvadratlar esa namunadagi nisbiy foizli darajani ifodalaydi.

Manbalar
--------

1. ↑  „GOLGA8H golgin A8 family member H [Homo sapiens (human) - Gene - NCBI"]. *www.ncbi.nlm.nih.gov*. Qaraldi: 24-fevral 2019-yil.
2. 1 2  „Clustal Omega < Multiple Sequence Alignment < EMBL-EBI". *www.ebi.ac.uk*. Qaraldi: 15-may 2019-yil.
3. 1 2  „ExPASy". *web.expasy.org*. Qaraldi: 13-may 2019-yil.
4. 1 2 3 4 5  „SAPS < Sequence Statistics < EMBL-EBI". *www.ebi.ac.uk*. Qaraldi: 13-may 2019-yil.
5. 1 2  „PROSITE". *prosite.expasy.org*. Qaraldi: 13-may 2019-yil.
6. 1 2  „Phyre 2 Results for GOLGA8H". *www.sbg.bio.ic.ac.uk*. Qaraldi: 13-may 2019-yil.
7. ↑  „I-TASSER results". *zhanglab.ccmb.med.umich.edu*. 13-may 2019-yilda asl nusxadan arxivlandi. Qaraldi: 13-may 2019-yil.
8. 1 2 3  „Genomatix: Gene2Promoter". *www.genomatix.de*. 27-noyabr 2022-yilda asl nusxadan arxivlandi. Qaraldi: 14-may 2019-yil.