**Jmol** — компјутерски софтвер за молекуларно моделирање на хемиските структури во 3-димензии. Jmol дава 3D претстава на молекула и може да се користи како образовна програма, или пак како истражувачка програма на пр. во хемијата и биохемијата.
Напишана е во програмскиот Јава, па може да работи на оперативниот систем Виндоус, Мекинтош, Линукс и Уникс, доколку на истите и инсталиран пакетот Јава. Станува збор за слободен софтвер објавен под лиценцата GNU Lesser General Public License (LGPL) верзија 2.0. Постојат самостојна апликација и развоен софтверски пакет, кои можат да бидат надоградени со други Јава апликации, како што се Биоклипс и Таверна.

Позната одлика на програмот е што може да биде вграден во мрежни странициза да ги прикаже молекулите на најразлични начини.
На пример, молекулите може да се претставуваат како моделите топче и стап, просторен модел, јамчест дијаграмитн.
Jmol поддржува широк спектар на хемиски податочни формати, вклучувајќи Protein Data Bank (pdb), Crystallographic Information File (cif), MDL Molfile (mol), и Chemical Markup Language (CML). Постои исто така и самостојна верзија JavaScript во (HTML5), *JSmol*, која може да се користи на компјутери без Јава.

Програмата Jmol, меѓу другите можности, нуди алтернатива на приклучокот Chime, кој повеќе активно не се развива. Иако Jmol има многу особенсоти кои му недостасуваат на Chime, не ги содржи сите способности на, особено, модот *Sculpt*. Chime побарува приклучна инсталација и Интернет Експлорер 6.0 или Фајерфокс 2.0 на Микрософт Виндоус, или Нетскејп Кумуникатор 4.8 на Мекинтош 9. Jmol побарува инсталација на Јава и може да се користи на бројни оперативни системи. На пример, Jmol е целосно функционален на Фајрфокс, Интернет Експлорер, Опера, Гугл Хром и Сафари.

Снимки
------

* Кристалана структура на H/ACA кутија на RNP од Pyrococcus furiosus.Кристалана структура на H/ACA кутија на RNP од *Pyrococcus furiosus*.
* Означување на два солени моста во хемоглобинот (хемо-групата како стапчиња долу десно).Означување на два солени моста во хемоглобинот (хемо-групата како стапчиња долу десно).
* Дел од презапишувачкиот фактор TFIIIA кои образуваат три постепени цинкови мотиви налик на прсти, надоврзани на дел од ДНК.Дел од презапишувачкиот фактор TFIIIA кои образуваат три постепени цинкови мотиви налик на прсти, надоврзани на дел од ДНК.
* Еубактериски рибозом 70S од Thermus thermophilus.Еубактериски рибозом 70S од *Thermus thermophilus*.

Поврзано
--------

* Развоен хемиски пакет
* Jmol сестрински проект за МедијаВики
* Список на молекуларни графички системи
* Молекуларна графика
* Молекуларен уредувач
* Протеопедија
* PyMOL
* SAMSON

Наводи
------

1. ↑  Jmol translations
2. ↑  Chen, Jim X. (2008), Springer (уред.), *Guide to Graphics Software Tools*, стр. 471, ISBN 978-1-84800-900-4
3. 1 2  Herráez, A (2006), „Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue", *Biochemistry and Molecular Biology Education*, **34** (4): 7, doi:10.1002/bmb.2006.494034042644
4. ↑  Herráez, A (2007), Lulu (уред.), *How to Use Jmol to Study and Present Molecular Structures, Volume 1*, стр. 21, ISBN 978-1-84799-259-8
5. ↑  „JSmol". Посетено на 2015-11-02.

Надворешни врски
----------------

|  |  |
| --- | --- |
| Ризница | „Jmol" на Ризницата ? |

* Матична страница 
	+ Wiki with listings of websites, wikis, and moodles
* Willighagen, Egon; Howard, Miguel (June 2007). „Fast and Scriptable Molecular Graphics in Web Browsers without Java3D". doi:10.1038/npre.2007.50.1.