**Хаплогрупата S1a** е човечка Хплогрупа на ДНК на човечки Y- хромозом, дефинирана од SNPs Z41335, Z41336, Z41337, Z41338, Z41339, Z41340 и Z41341.

S1a се наоѓа првенствено во Меланезија (особено во Папуа Нова Гвинеја), Микронезија, поморска Југоисточна Азија и меѓу домородните Австралијци.

Почнувајќи од 2017 година, вклучува неименувана примарна подклада наведена од ISOGG како „S1a~" (P405),   (кој претходно бил познат како K2b1a). Симболот „~" е начин на ISOGG да укаже дека можеби постои непроверен и сè уште неименуван непосреден предок.

Нејзините секундарни подклади вклучуваат: S1a1 (Z42413), S1a2~ (P79, P307) и S1a3 (P315).

Пред 2016 година, S1a1b (M230, P202, P204) бил познат како **хаплогрупа S\*** (а пред тоа како Haplogroup K5). (Во 2016 година, хаплогрупата S-B254 била „промовирана" во S\*, од претходната позиција на S1.)

Кладите „брат и сестри" на S1a вклучуваат: S1b (B275, Z33756, Z33757, Z33758, Z33759), S1c (Z41926, Z41927, Z41928, Z41929, Z41930) и S106 (СК).

Филогенијата
------------

**Хаплогрупата S1** (B255) ги вклучува следните подклади: ***S1a*** Z41335

* S1a1 Z42413
	+ S1a1a
		- S1a1a1 P60, P304, P308
		- S1a1a2
	+ S1a1b M230, P202, P204 – „симнат" од претходната позиција како базална **Хаплогрупа S\*** (и претходно позната како Хаплоггрупа К5)
		- S1a1b1 M254 (претходно познат како K2b1a4a)
			* S1a1b1a P57
			* S1a1b1b P61
			* S1a1b1c P83
			* S1a1b1d SK1891
* S1a2 P79, P307
* S1a3 P315
	+ S1a3a Z41763
	+ S1a3b~ P401

***S1b~*** B275, Z33756, Z33757, Z33758, Z33759
***S1c~*** Z41926, Z41927, Z41928, Z41929, Z41930
***S1d*** SK1806
(Врз основа на дрвото ISOGG од 2017 година и последователните објавени истражувања. )

Распространетост
----------------

Базалниот S1a\* се чини дека е исклучително редок или исчезнат кај живите мажи. Примарната подклада S-P405\* е исто така релативно ретка, но се наоѓа на значајни нивоа кај различните популации на Микронезија: 5,6%. Се наоѓа и кај мажите на индонезискиот остров Сумба со стапка од 0,2%. 

Според ISOGG (2017), S1a1 (Z42413) е пронајден кај народот Lebbo во Индонезија и S1a1a1 (P60) кај домородните Австралијци.  Една студија објавила дека наоѓа S-M230 (S1a1b) во: 52% (16/31) од примерокот од висорамнините на Папуа Нова Гвинеја (PNG); 21% (7/34) од примерок од Молуките (Малуку); 16% (5/31) од примерокот од брегот на Папуа Нова Гвинеја; 12,5% (2/16) од примерокот на Толаи од Нова Британија; 10% (3/31) од примерокот од Nusa Tenggara и; 2% (2/89) од примерокот од низините/брегот на Западна Нова Гвинеја. Една подклада, Хаплогрупата S1a1b1d1a (S-M226.1) е пронајдена на ниски фреквенции на Адмиралитетите и долж брегот на копното PNG. 

Распределбата на другите главни подклади на S1a според ISOGG,  е како што следуваат: 

* S1a2 (P79) - Меланезија и Папуа Нова Гвинеја, вклучувајќи ги и Адмиралските Острови;
* S1a3 (P315) – домородни Австралијци и;
* S1a3b (P401) - Вануату.

Наводи
------

1. 1 2 3 4 5  International Society of Genetic Genealogy (ISOGG; 2017), *Y-DNA Haplogroup Tree 2015* (24 March 2017).
2. ↑  „PhyloTree y - Minimal y tree".
3. ↑  „Improved phylogenetic resolution and rapid diversification of Y-chromosome haplogroup K-M526 in Southeast Asia". *Eur J Hum Genet*. **23** (3): 369–373. June 2014. doi:10.1038/ejhg.2014.106. PMC 4326703. PMID 24896152.
4. ↑  „Table 1 ("Improved phylogenetic resolution and rapid diversification of Y-chromosome haplogroup K-M526 in Southeast Asia")". *European Journal of Human Genetics*. **23** (3): 369–373. 2013. doi:10.1038/ejhg.2014.106. PMC 4326703. PMID 24896152.
5. ↑  „The Impact of the Austronesian Expansion: Evidence from mtDNA and Y Chromosome Diversity in the Admiralty Islands of Melanesia". *Molecular Biology and Evolution*. **25** (7): 1362–74. 2008. doi:10.1093/molbev/msn078. PMID 18390477.
6. ↑   „Y-chromosome diversity is inversely associated with language affiliation in paired Austronesian- and Papuan-speaking communities from Solomon Islands". *American Journal of Human Biology*. **18** (1): 35–50. 2006. doi:10.1002/ajhb.20459. PMID 16378340.