**SYBR Green** 
**SYBR Green** (SG) zianina asimetrikoen taldeko konposatu organiko fluoruroa da (formula kimikoa: C32H37N4S+), biologia molekularrean oso erabilia azido nukleikoen markaketarako. 

Molekula hau edozein harizpi bikoitzeko DNA molekulara itsasten da inespezifikoki, baina ez da agente tartekatzaile bat; izan ere, ez da bi base pareren tartean txertatzen. Hala ere, harizpi bakarreko DNA molekuletara zein RNAra ere lotu daiteke errendimendu baxuagoarekin.

SYBR Green molekula DNA helize bikoitzaren bigarren mailako egituran sartu eta DNAren azido nukleikoei energetikoki akopatzen da, igorpen fluoreszentearen tasa nabarmen igoz. Fenomeno honi **fluoreszentzia-erresonantzia bidezko energia-transferentzia** deritzo (FRET, ingelesezko siglak). Akoplazioaren ondorioz sortzen den DNA-tindatzaile konplexuak argi urdina xurgatzen du (λmax = 498 nm) eta argi berdea emititu (λmax = 520 nm).

Erabilerak
----------

SYBR Green-a biokimika eta biologia molekularraren hainbat arlotan erabili ohi da. Orokorrean tindatzaile gisa erabiltzen da, PCR kuantitatiboko metodo askotan kate bikoitzeko **DNA kuantifikatzeko** edo agarosa-gelen elektroforesian DNA **bistaratzeko**.

Azido nukleiko puruak markatzeaz gain, SYBR Green molekula DNAren etiketetan zelulen barruko fluxu zitometriarako eta fluoreszentzia mikroskopiarako ere erabil daiteke. 

### SYBR Green eta PCR kuantitatiboa

Lagin nukleotidiko bati SYBR Green molekula gehitzean, berehala laginean dagoen kate bikoitzeko DNA guztiari lotzen da. PCR kuantitatiboan DNA polimerasak itu sekuentzia anplifikatzen du, PCR produktuak sortuz; beraz, SYBR Green-a kate bikoitzeko DNA kopia berri bakoitzarekin lotzen da.  PCRa amaitzean, termozikladorean dagoen sentsoreak 522 nm-tan irakurriko du emititutako argia. Anplifikazioaren ondorioz, fluoreszentziaren intentsitatea handitzen da eta intentsitate hau PCR produktuaren kantitatearekiko proportzionala da. Horrela, hasierako DNA kopurua kuantifika daiteke.

### SYBR Green eta elektroforesia

Elektroforesi teknikan SYBR Green-a etidio-bromuroaren tindaketa alternatibotzat erabiltzen da, azken hau baino 100 aldiz sentikorragoa eta osasunerako egokiagoa delako.

Abantailak eta desabantailak
----------------------------

Fluoroforo honen abantaila nagusienetariko bat oso merkea dela da. Bestalde, oso inespezifikoa ere bada. SYBR Green-a edozein kate bikoitzeko azido nukleikora lotzen denez, erreakzioan hasleak elkarren artean elkartuko balira, fluoruroa haiei ere lotuko litzaieke, ez PCRaren produktuei soilik; ondorioz, DNAren kuantifikazioa ez da zehatza izango.

Segurtasuna
-----------

SYBR Green-a etidio-bromuroaren ordezko tindatzaile gisa erabiltzen da; etidio bromuroa giza-mutageno potentziala delako. Hala ere, DNArekin afinitate handiarekin lotzen den edozein molekula txiki kartzinogeno posibletzat hartzen da, SYBR Green barne.

Erreferentziak
--------------

1. ↑   **(Ingelesez)** Zipper, H..  (2004-07-07). «Investigations on DNA intercalation and surface binding by SYBR Green I, its structure determination and methodological implications» *Nucleic Acids Research* 32 (12): e103–e103. doi:10.1093/nar/gnh101. ISSN 1362-4962. PMID 15249599. PMC PMC484200. (Noiz kontsultatua: 2022-04-01).
2. ↑   **(Ingelesez)** PubChem. «Sybr green I» *pubchem.ncbi.nlm.nih.gov* (Noiz kontsultatua: 2022-04-01).
3. ↑   **(Ingelesez)** Dragan, A. I.; Pavlovic, R.; McGivney, J. B.; Casas-Finet, J. R.; Bishop, E. S.; Strouse, R. J.; Schenerman, M. A.; Geddes, C. D..  (2012-07-01). «SYBR Green I: Fluorescence Properties and Interaction with DNA» *Journal of Fluorescence* 22 (4): 1189–1199. doi:10.1007/s10895-012-1059-8. ISSN 1573-4994. (Noiz kontsultatua: 2022-04-01).
4. ↑   Mackay, I. M..  (2002-03-15). «Real-time PCR in virology» *Nucleic Acids Research* 30 (6): 1292–1305. doi:10.1093/nar/30.6.1292. PMID 11884626. PMC PMC101343. (Noiz kontsultatua: 2022-04-01).
5. ↑   **(Ingelesez)** Thornton, Brenda; Basu, Chhandak.  (2011-03). «Real-time PCR (qPCR) primer design using free online software» *Biochemistry and Molecular Biology Education* 39 (2): 145–154. doi:10.1002/bmb.20461. (Noiz kontsultatua: 2022-04-01).
6. ↑   **(Ingelesez)** Singer, Victoria L; Lawlor, Timothy E; Yue, Stephen.  (1999-02). «Comparison of SYBR® Green I nucleic acid gel stain mutagenicity and ethidium bromide mutagenicity in the Salmonella/mammalian microsome reverse mutation assay (Ames test)» *Mutation Research/Genetic Toxicology and Environmental Mutagenesis* 439 (1): 37–47. doi:10.1016/S1383-5718(98)00172-7. (Noiz kontsultatua: 2022-04-01).

Kanpo estekak
-------------

|  |  |
| --- | --- |
| Autoritate kontrola | 
* **Wikimedia proiektuak**
* Wd Datuak: Q423692
* Commonscat Multimedia: SYBR Green I

---

* **Medikuntzako identifikadoreak**
* MeSH: C098022
* **Kimikako identifikadoreak**
* Número CAS: 163795-75-3
* ChEBI: 51461
* ChEMBL: CHEMBL1198924
* ChemSpider: 8611764
* PubChem: 10436340
* SMILES: [N+(C2=CC=CC=C2C(=C1)C=C3N(C4=CC=CC=C4S3)C)C5=CC=CC=C5&zoom=2.0&annotate=none ID]
* InChI: ID
* InChI key: ID
* **Biologiako identifikadoreak**
* MGI: 163795-75-3

 |

* Wd Datuak: Q423692
* Commonscat Multimedia: SYBR Green I