*Bacillus subtilis*
*Bacillus subtilis,* *Firmicutes*'e hõimkonna liige
**Firmikuudid** (ladina *Firmicutes*; *firmus*, tugev, ja *cutis,* nahk) on bakterihõimkond, mis hõlmab väikese G+C sisaldusega (alla 50%) valdavalt grampositiivseid bakteriliike. Kuju poolest nad on kokid (üksikud ümarad) või batsillid (pulgakujulised). *Heliobacteriaceae* sugukonda kuuluvad bakterid on ka fotosünteesivõimelised.

Produtseerivad endospoori, mis on resistentne ekstreemsetele tingimustele ja ka kuivatamisele. Firmikuute on võimalik leida erinevates keskkondades: hõimkond sisaldab nii inimese normaalse mikrobioota liike kui ka tööstuses kasutatavaid (näiteks piimhappelisi) ja patogeenseid liike.

Uurimused näitasid, et soolemikrofloora kooslus määrab, millised metabolismirajad on indiviidil olemas ja kuidas nad töötavad. Soolemikrobiootas olev *Bacteroides/Firmicutes* suhe on oluline metabolismi määramisel, seega rasvumise diagnoosimiseks ja ravimiseks. Firmikuudid on seotud rasvade ladestumisega, kuna firmikuutide rohkus vähendab metabolismiradade mitmekesisust. *Firmicutes* mõjutavad rasvhapete imendumist ja lipiidide metabolismi. Firmikuutide rikkus on seotud lipiiditilgakeste akumuleerumisega kudedes, mis asuvad seedetraktist väljaspool.

Klassifikatsioon
----------------

Hõimkond ***Firmicutes***

* Klassi *Bacilli* kuuluvad järgmised seltsid:
	+ *Bacillales*
	+ *Lactobacillales*
* Klassi *Clostridia* kuuluvad järgmised seltsid:
	+ *Clostridiales*
	+ *Halanaerobiales*
	+ *Natranaerobiales*
	+ *Thermoanaerobacterales*
* Klassi *Erysipelotrichia* kuulub järgmine selts:
	+ *Erysipelotrichales*
* Klassi *Limnochordia* kuulub järgmine selts:
	+ *Limnochordales*
* Klassi *Negativicutes* kuuluvad järgmised seltsid:
	+ *Acidaminococcales*
	+ *Selenomonadales*
	+ *Veillonellales*
* Klassi *Tissierellia* kuulub järgmine selts:
	+ *Tissierellales*

### Klassid

Hõimkonnas on kokku kuus klassi, aga neist kaks on enam levinud: *Bacilli* ja *Clostridia*. Bakterid, mis kuuluvad *Clostridia* klassi on anaeroobsed ja *Bacilli* kuuluva klassi bakterid on fakultatiivsed anaeroobid. *Clostridia* ja *Bacilli* klasside bakterid kuuluvad inimese mikrobioota koosseisu ja täpsemalt soolemikrobioota koosseisu.

#### *Bacilli*

*Bacillus anthracis,* on värvitud Grami järgi
*Bacilli* klassi kuuluvad bakterid on aeroobid või fakultatiivsed anaeroobid, mis võivad moodustuda spoore. Igal bakteril tekib ainult üks spoor, mis on soojuse-, radiatsiooni-, külma- ja kuivamiseresistentne. *Bacilli* võivad elada ekstreemsetes keskkondades, kuna mõned bakterid on termo- ja psührofiilsed, alkalofiilsed ja atsidofiilsed, halotolerantsed ja halofiilsed ning tolereerivad suurt pH ja temperatuuri kõikumist. *Bacilli* produtseerivad piim- ja etaanhapet suhkrute fermentatsiooni tulemusena. Firmikuutide hõimkonda kuuluvana on nad grampositiivsed.

Sõna *"Bacilli"* on tekitanud segadusi mõnedes keeltes (valdavalt vene ja inglise keeles). „*Bacillus*" (suure tähega) on *Bacilli* klassi kuuluv liik, aga „bacillus" on sõna bakteri morfoloogia kirjeldamiseks, mis tähendab „pulgakujuline". Mitte kõik *Bacilli* klassi kuuluvad bakterid ei ole pulgakesed ja ka klassist väljas eksisteerib liike, mis võivad omandada pulgakuju, näiteks *Staphylococcus’*e liigid on kerakujulised, aga kuuluvad *Bacilli* klassi, samal ajal *Clostridium kamina dalla kotta* bakter on pulgakujuline, vaatamata sellele, et ei ole *Bacilli* klassis.

*Bacilli* klassi kuuluvad bakterid on võimelised sünteesima antibiootikume ja neid on kasutatud tööstuses. Samas leidub nende hulgas ka patogeenseid liike. Kõige tuntum patogeenne liik on *Bacillus anthracis* ehk Siberi katku tekitaja, mida on kasutatud bioloogilise relvana. Antibiootikumide süntees on väga tähtis omadus ja seda kasutatakse meditsiinitööstuses, näiteks neosporiini tootmine põhineb *Bacilli* klassi kuuluvate bakterite saaduse kasutamisel. *Bacilli* on spoore moodustav klass ja spoore on mõnikord kasutatud tööstuses selleks, et kontrollida sterilisatsiooni meetodite ja keemiliste detergentide efektiivsust. *Bacilli* klassi kuulub ka selts *Lactobacillales*, mida kasutatakse näiteks jogurtitööstuses. Laktobatsillide abil valmistatakse probiootikume, mis aitavad inimese soolemikroflooras säilitada pH'd. *Lactobacillales*’i seltsi liigid on seotud ka immunomodulatsiooniga ehk nad on võimelised reguleerima peremehe immuunvastust.

* *Bacilli*
	+ Selts *Bacillales*
	+ Selts *Lactobacillales*

#### *Clostridia*

*Clostridium botulinum,* on värvitud Grami järgi
*Clostridia* on klass, kuhu kuuluvad anaeroobsed bakterid, kellele on hapnik toksiline. *Сlostridia* klassi bakterid on liikumisvõimelised, pulgakujulised või keerdunud, grampositiivsed ja spoorimoodustavad. Mõned bakterid, näiteks *C. butyricum* ja *C. pasteurianum* fikseerivad lämmastiku. Bakterid fermenteerivad suhkruid orgaanilise hapete tekkimisega, näiteks põhilised saadused on piim-, butaan-, etaan- ja metaanhapped. *Clostridia* klassi kuuluvad bakterid on rohkesti leitud mullas, osa neist on ka inimesele patogeensed liigid (näiteks *Clostridium botulinum*, mis produtseerib botulismi toksiini ja *Clostridium tetani* produtseerib teetanuse toksiini (tetanospasmin)). Vaatamata sellele, et botulismi toksiin (ehk botoks), on inimestele kahjulik, kasutatakse seda mittekontrolliva lihaste kontraktsiooni ravimiseks ja ka plastilises kirurgias. Mõned *Clostridia* liigid on leitud bakteriaalse vaginoosiga naiste mikroflooras.

Mõningaid ensüüme, mis on produtseeritud *Closridia* klassi poolt, on kasutatud biotervendamiseks (näiteks reostuse kõrvaldamiseks veest ja mullast), selle jaoks baktereid pannakse reostatud keskkonda ja stimuleeritakse prolifireerimiseks ja elutegevuseks. Selline puhastusviis on mõnikord kiirem ja odavam kui muud puhastusviisid.

*Clostridia* elutegevusega on seotud mõned haavainfektsioonid. Infektsioonid pole lokaalsed, vaid neid leidub kogu maailmas. Tavaliselt peremeesorganism ei saa end kaitsta *Clostridia* bakterite vastu, sest organismi vastupanuvõime neile on väga väike või pole seda üldse. *Clostridia* baktereid diagnoositakse, iseloomustades kahjustusi ja analüüsides gramtesti abil bakterikultuuri. Vaatamata sellele, et immuunsust pole, on võimalik bakterite elutegevust haavas kontrollida antibiootikumide abil, selle jaoks sobib hästi penitsilliin. Haavu ravitatakse mõnikord ka kirurgiliselt, sügavalt haava puhastades.

* *Clostridia*
	+ Selts *Clostridiales*
	+ Selts *Halanaerobiales*
	+ Selts *Natranaerobiales*
	+ Selts *Thermoanaerobacterales*

Viited
------

1. ↑  Friedrich Götz, Tammy Bannerman, Karl-Heinz Schleifer (auth.), Martin Dworkin Professor Dr. Stanley Falkow, Eugene Rosenberg, Karl-Heinz Schleifer, Erko Stackebrandt. *The Prokaryotes: Volume 4: Bacteria: Firmicutes, Cyanobacteria [Volume 4, 3 ed.]* Lk 211-212.`{{raamatuviide}}`: CS1 hooldus: mitu nime: autorite loend (link)
2. ↑  College of Agriculture and Life Sciences. "Low G+C Gram Positive Bacteria". Vaadatud 5.12.2017.
3. ↑  Microbe Wiki. "Firmicutes and Obesity". Originaali arhiivikoopia seisuga 9.10.2017. Vaadatud 30.10.2017.
4. ↑  NCBI. "Firmicutes klassifikatsioon NCBI baasi järgi". Vaadatud 30.10.2017.
5. 1 2  Eugene Rosenberg, Edward F. DeLong, Stephen Lory, Erko Stackebrandt, Fabiano Thompson. *The Prokaryotes: Firmicutes and Tenericutes [4 ed.]* Lk 65-75.`{{raamatuviide}}`: CS1 hooldus: mitu nime: autorite loend (link)
6. 1 2 3  Microbe Wiki. "Bacillus". Originaali arhiivikoopia seisuga 6.05.2016. Vaadatud 30.10.2017.
7. ↑  Microbe Wiki. "Lactobacillus". Originaali arhiivikoopia seisuga 10.12.2017. Vaadatud 30.10.2017.
8. 1 2 3  Microbe Wiki. "Clostridium". Originaali arhiivikoopia seisuga 10.12.2017. Vaadatud 30.10.2017.

| * v
* r
Prokarüootide hõimkonnad |
| --- |
| Bakterid | 
*Acidobacteria* • Aktinobakterid • *Aquificae* • *Bacteroidetes* • *Caldiserica* • *Chrysiogenetes* • *Deferribacteres* • *Deinococcus-Thermus* • *Dictyoglomi* • *Elusimicrobia* • *Fibrobacteres* • *Firmikuudid* • *Fusobacteria* • *Gemmatimonadetes* • Klamüüdiad • *Lentisphaerae* • *Nitrospira* • *Planctomycetes* • Proteobakterid • Rohelised mitteväävlibakterid • Rohelised väävlibakterid • Spiroheedid • *Synergistetes* • *Tenericutes* • *Thermodesulfobacteria* • *Thermomicrobia* • *Thermotogae* • Tsüanobakterid • *Verrucomicrobia* |
| Arhed | 
*Crenarchaeota* • *Euryarchaeota* • *Korarchaeota* • *Nanoarchaeota* • *Thaumarchaeota* |