Der Präsident zieht in Erwägung:
1.
Die Verfügung des Departements Volkswirtschaft und Inneres, Amt für Justizvollzug, vom 26. September 2016 ist mit Beschwerde beim Verwaltungsgericht des Kantons Aargau anfechtbar (vgl. angefochtene Verfügung, Rechtsmittelbelehrung). Sie ist nicht letztinstanzlich. Auf die Beschwerde ist daher in Anwendung von <ref-law> im Verfahren nach <ref-law> nicht einzutreten. Zugleich ist die Sache gestützt auf <ref-law> zuständigkeitshalber an das Verwaltungsgericht des Kantons Aargau zu überweisen.
2.
Auf eine Kostenauflage ist ausnahmsweise zu verzichten.

Demnach erkennt der Präsident:
1.
Auf die Beschwerde wird nicht eingetreten.
2.
Die Sache wird an das Verwaltungsgericht des Kantons Aargau überwiesen.
3.
Es werden keine Kosten erhoben.
4.
Dieses Urteil wird den Parteien und dem Departement Volkswirtschaft und Inneres, Amt für Justizvollzug, sowie dem Verwaltungsgericht des Kantons Aargau (unter Beilage der Beschwerde) schriftlich mitgeteilt.
Lausanne, 7. November 2016
Im Namen der Strafrechtlichen Abteilung
des Schweizerischen Bundesgerichts
Der Präsident: Denys
Die Gerichtsschreiberin: Arquint Hill