Fatti:
A. A.a Le parti si sono sposate nel 1990. La procedura di divorzio ha preso avvio il 30 luglio 2004, data in cui il marito ha inoltrato azione unilaterale. Il 26 marzo precedente, A._ aveva formulato istanza a protezione dell'unione coniugale chiedendo un contributo alimentare, sulla quale il Pretore del Distretto di Bellinzona ha statuito in data 1° settembre 2004; il Tribunale di appello del Cantone Ticino, adito dal marito, ha riformato la decisione pretorile soltanto nell'ottobre 2007.
A.b L'istoriato processuale diviene allora assai intricato: per quanto utile al presente giudizio, va ritenuto che - dopo adattamenti temporanei del contributo alimentare dovuto alla moglie convenuti fra le parti a titolo provvisorio - entrambe le parti hanno chiesto la modifica del contributo alimentare alla moglie: quest'ultima, in data 15 febbraio 2008, ne ha chiesto l'aumento a fr. 1'310.-- da giugno 2005 a dicembre 2007 e a fr. 1'450.-- oltre tale data; il marito, da parte sua, con istanza 14 marzo 2008 ha chiesto la riduzione del contributo provvisionale alla moglie a fr. 148.50 da giugno 2005 ad agosto 2008 e la sua integrale abolizione per il periodo successivo.
A.c Giunti alla conclusione dell'istruttoria di merito della causa di divorzio, il Pretore ha fissato alle parti un termine (poi più volte prorogato) per presentare un memoriale conclusivo, precisando che in quella sede esse avrebbero anche potuto integrare eventuali osservazioni sulla modifica dell'assetto cautelare. A._ ha contestato avanti al Pretore tale modo di procedere chiedendo un contraddittorio sulla propria istanza cautelare, senza tuttavia ottener ragione. Dopo ulteriori scaramucce processuali, A._ ha chiesto nel proprio allegato conclusivo 7 agosto 2008 l'aumento del contributo provvisionale a fr. 1'310.-- mensili dal giugno 2005 ed a fr. 1'800.-- mensili dal gennaio 2008.
A.d Il Pretore ha pronunciato il divorzio con sentenza 25 agosto 2008, e con decreto contestuale alla sentenza ha soppresso il contributo alimentare provvisionale a partire dal successivo 1° settembre. A._ ha tempestivamente chiesto la revoca del decreto cautelare previo contraddittorio, che il Pretore le ha tuttavia negato con decisione 3 settembre 2008 "considerato che le parti hanno avuto modo di esprimersi sull'istanza supercautelare presentata dalla moglie il 15 febbraio 2008, illustrando la rispettiva posizione nelle conclusioni scritte".
B. A._ è insorta avanti al Tribunale di appello del Cantone Ticino chiedendo l'annullamento del decreto 25 agosto 2008 e della successiva decisione 3 settembre 2008, eventualmente l'accoglimento della sua istanza cautelare 15 febbraio 2008, in terzo ordine la condanna del marito al versamento del contributo provvisionale fino alla crescita in giudicato della sentenza di divorzio. In parziale accoglimento del gravame, il Tribunale di appello ha annullato il decreto impugnato "per quanto si riferisce all'istanza cautelare presentata dall'istante [scil. A._] il 15 febbraio 2008", dichiarando l'appello irricevibile per il resto.
C. Con ricorso in materia civile 7 novembre 2008 A._ (ricorrente) chiede l'integrale annullamento del decreto pretorile 25 agosto 2008 ed il rinvio al Pretore di Bellinzona per contraddittorio ed istruzione relativi alla sua istanza 15 febbraio 2008. Non sono state chieste determinazioni.

Diritto:
1. 1.1 Rivolto tempestivamente (<ref-law>) contro una decisione di ultima istanza cantonale (<ref-law>) in tema di misure provvisionali durante una procedura di divorzio vertenti unicamente sul contributo alimentare chiesto dalla ricorrente, dunque in una materia civile (<ref-law>) a carattere pecuniario con un valore di causa superiore al minimo richiesto dalla legge (<ref-law>), il gravame rispetta i menzionati requisiti formali. Nel caso di specie, la questione a sapere se la decisione impugnata sia finale (<ref-law>) o incidentale (<ref-law>), come ritiene il Tribunale di appello, esige un suo esame approfondito; essa verrà evasa più avanti (consid. 2.4 infra).
1.2 Trattandosi di una decisione in tema di misure provvisionali, con il ricorso in materia civile possono essere unicamente sollevate censure per violazione dei diritti costituzionali (<ref-law>). Quando il ricorrente lamenta una violazione del divieto dell'arbitrio ai sensi dell'<ref-law>, il Tribunale federale esamina unicamente se la decisione impugnata applica il diritto in maniera insostenibile o se la stessa è fondata su constatazioni di fatto manifestamente inesatte, ovvero arbitrarie (<ref-ruling> consid. 7.1 pag. 398; <ref-ruling> consid. 1.2.2 pag. 252).
2. Un discorso a parte merita l'interesse giuridicamente protetto della ricorrente alla trattazione nel merito del suo ricorso (<ref-law>).
2.1 Per l'essenziale, il Tribunale di appello ha accolto l'appello della ricorrente unicamente con riferimento alla sua istanza di modifica 15 febbraio 2008. Ha, più precisamente, respinto la tesi pretorile, secondo la quale la possibilità offerta alle parti di esprimersi in sede di memoriale conclusivo anche sulle richieste di modifica dell'assetto provvisionale era sufficiente. Considerato allora che il rifiuto del Pretore di indire un contraddittorio era non involontario bensì intenzionale, i Giudici di appello hanno equiparato la situazione ad un diniego formale di giustizia.
Secondo i Giudici cantonali, questo ragionamento, per contro, non può trovare applicazione per quanto riguarda la domanda 14 marzo 2008 di modifica delle misure provvisionali proposta dall'opponente: in merito, infatti, il Pretore non si è del tutto espresso. In difetto di un formale rifiuto dell'udienza non può ascriversi al Pretore un formale diniego di giustizia. Mancando tale presupposto, secondo i Giudici cantonali la decisione sulle misure provvisionali oggetto del presente ricorso continua a valere come decreto cautelare emesso senza contraddittorio, dunque inappellabile in virtù dell'<ref-law>/TI.
2.2 Si può senz'altro discutere sull'impostazione del giudizio cantonale di scindere la trattazione di due domande di modifica delle misure provvisionali e di considerare separatamente la decisione di prima istanza siccome emanata in evasione dell'una e dell'altra domanda. In realtà, quando le due domande vertono esattamente sullo stesso tema - nel presente caso, la necessità e, in subordine, l'entità del contributo alla ex moglie pendente lite - e si distinguono soltanto per la direzione che prendono (domanda di aumento da parte della ex moglie, domanda di soppressione dell'obbligo di contribuzione da parte dell'ex marito), parrebbe ovvio ritenere che la domanda di contraddittorio proposta da una delle parti debba comprendersi siccome intesa a discutere anche la domanda di controparte, a prescindere da sottigliezze semantiche. Detto altrimenti, seguendo il proprio ragionamento il Tribunale di appello avrebbe benissimo potuto considerare sufficienti per una discussione globale le reiterate istanze di contraddittorio proposte dalla qui ricorrente prima e subito dopo il giudizio del 25 agosto 2008. Giunto alla conclusione che la possibilità offerta alle parti di esprimersi in sede di memoriale conclusivo non era sufficiente - anche perché avrebbe precluso loro la possibilità di offrire nuove prove -, il Tribunale di appello avrebbe potuto semplicemente accogliere integralmente il gravame della qui ricorrente, evitando la presente procedura federale.
2.3 Comunque sia, il ricorso qui proposto dalla ricorrente sembra fondato su un'errata lettura della decisione cantonale impugnata e scaturire invero da un equivoco.
2.3.1 È da un lato pacifico che nella misura in cui il suo appello è stato accolto dalla Corte cantonale, la ricorrente non può avvalersi di un interesse giuridicamente protetto per esigere la trattazione nel merito del suo ricorso in materia civile: si deve desumere dalla decisione impugnata, e meglio dall'accoglimento dell'appello limitatamente all'istanza cautelare 15 febbraio 2008, che il Tribunale di appello ha ritenuto che la domanda di contraddittorio inoltrata dalla ricorrente al Pretore era valida e tuttora inevasa. Pertanto, incombe ora al Pretore l'obbligo di indire tale contraddittorio. La ricorrente non ha alcun interesse ad un nuovo giudizio del Tribunale federale, per cui in quanto rivolto contro l'accoglimento parziale dell'appello, il suo ricorso deve essere dichiarato inammissibile.
2.3.2 Ciò vale invero anche nella misura in cui esso è rivolto contro la decisione d'appello di non entrata nel merito riguardo all'istanza cautelare 14 marzo 2008 dell'opponente. A ben guardare, infatti, leggendo il dispositivo della sentenza impugnata nell'ottica della motivazione proposta al considerando 4 della medesima, si deve giungere alla conclusione che, secondo il Tribunale di appello, la ricorrente ha validamente chiesto al Pretore anche il contraddittorio relativamente all'istanza cautelare dell'ex marito; solo che il Pretore non ha preso del tutto posizione in merito. Ne discende che pure tale domanda di contraddittorio è ancora in attesa di evasione. Di conseguenza, facendo difetto una discussione in contraddittorio dell'istanza 14 marzo 2008, il decreto pretorile 25 agosto 2008 in tema di misure cautelari è momentaneamente inappellabile e, di riflesso, non può essere impugnato avanti al Tribunale federale per mancato esaurimento delle vie cantonali di ricorso (<ref-law>; sentenza del Tribunale federale 5A_625/2008 del 27 luglio 2009 consid. 3.3.2).
2.3.3 Va peraltro aggiunto che la decisione cantonale, così come essa va presumibilmente letta, non causa pregiudizio alcuno alla ricorrente, motivo per cui viene a cadere l'interesse giuridicamente protetto ad una trattazione nel merito del suo ricorso (supra consid. 2). Bisogna infatti tener presente che i Giudici cantonali hanno positivamente constatato che la ricorrente aveva sollecitato il contraddittorio avanti al Pretore anche con riferimento all'istanza 14 marzo 2008 dell'ex marito. I Giudici cantonali hanno inoltre altrettanto inequivocabilmente constatato che il Pretore non vi ha dato seguito alcuno - non già scientemente, come fatto con riferimento all'istanza 15 febbraio 2008 della ricorrente, bensì senza apparente ragione. Ora, se da un lato tale modo di leggere l'operato del Pretore porta a concludere che la domanda di contraddittorio è tutt'ora inevasa - con la conseguenza che il decreto cautelare è inappellabile -, d'altro lato ciò deve necessariamente significare che la conseguenza concreta ed immediata della decisione qui impugnata consiste nell'obbligo, per il Pretore, di indire finalmente un'udienza di contraddittorio nella quale discutere l'insieme delle domande cautelari delle parti. In altre parole, correttamente letta, la decisione impugnata dà un seguito favorevole alla domanda di contraddittorio della ricorrente. Anche in quest'ottica, pertanto, fa difetto a quest'ultima un interesse giuridicamente protetto alla trattazione nel merito del suo ricorso, che anche per questa ragione si rivela inammissibile.
2.3.3 Va peraltro aggiunto che la decisione cantonale, così come essa va presumibilmente letta, non causa pregiudizio alcuno alla ricorrente, motivo per cui viene a cadere l'interesse giuridicamente protetto ad una trattazione nel merito del suo ricorso (supra consid. 2). Bisogna infatti tener presente che i Giudici cantonali hanno positivamente constatato che la ricorrente aveva sollecitato il contraddittorio avanti al Pretore anche con riferimento all'istanza 14 marzo 2008 dell'ex marito. I Giudici cantonali hanno inoltre altrettanto inequivocabilmente constatato che il Pretore non vi ha dato seguito alcuno - non già scientemente, come fatto con riferimento all'istanza 15 febbraio 2008 della ricorrente, bensì senza apparente ragione. Ora, se da un lato tale modo di leggere l'operato del Pretore porta a concludere che la domanda di contraddittorio è tutt'ora inevasa - con la conseguenza che il decreto cautelare è inappellabile -, d'altro lato ciò deve necessariamente significare che la conseguenza concreta ed immediata della decisione qui impugnata consiste nell'obbligo, per il Pretore, di indire finalmente un'udienza di contraddittorio nella quale discutere l'insieme delle domande cautelari delle parti. In altre parole, correttamente letta, la decisione impugnata dà un seguito favorevole alla domanda di contraddittorio della ricorrente. Anche in quest'ottica, pertanto, fa difetto a quest'ultima un interesse giuridicamente protetto alla trattazione nel merito del suo ricorso, che anche per questa ragione si rivela inammissibile.
2.4 2.4.1 Ad ulteriormente corroborare la lettura della decisione impugnata qui proposta contribuisce un ultimo fattore. Il Tribunale di appello ha definito incidentale la propria decisione. Considerato che, per costante e ormai nota giurisprudenza, le decisioni su misure provvisionali nel processo di divorzio sono considerate finali ai sensi dell'<ref-law> (v. da ultimo <ref-ruling> consid. 2; <ref-ruling> consid. 2.2), la natura incidentale della decisione qui impugnata può essere spiegata unicamente con il fatto che essa esplica, all'atto pratico, i medesimi effetti di una decisione di accoglimento dell'appello con contestuale rinvio al Pretore perché egli abbia a finalmente indire l'agognato contraddittorio (supra consid. 2.3); salvo casi eccezionali che qui non si riscontrano (<ref-ruling> consid. 5.2.2; <ref-ruling> consid. 1.3 non pubblicato), decisioni di rinvio all'autorità inferiore per (nuova) decisione sono infatti per costante giurisprudenza di natura incidentale (<ref-ruling> consid. 1.2; <ref-ruling> consid. 4.2 pag. 482). Per quanto coerente con l'impostazione dogmatica data alla propria decisione, si deve deprecare espressamente il mancato esplicito rinvio al Pretore da parte dei Giudici di appello; nondimeno, la decisione impugnata è da ritenersi di natura incidentale nonostante l'omissione dell'esplicito rinvio per nuovo giudizio.
2.4.2 Ritenuta la natura incidentale della decisione cantonale, la sua impugnazione avanti al Tribunale federale sarebbe dipesa dall'adempimento delle condizioni di cui all'<ref-law>. Come visto, la decisione impugnata, correttamente letta, non comporta alcun pregiudizio irreparabile a carico della ricorrente (<ref-law>) né l'accoglimento del presente ricorso porterebbe ad una decisione finale (<ref-law>; contrariamente a quanto detto in <ref-ruling> consid. 3.1, ciò è possibile quando si parli di misure provvisionali prese in una procedura indipendente, come appunto quelle in sede di divorzio, v. supra consid. 2.4.1 con rinvii).
2.4.3 Ne discende che il presente ricorso si rivela inammissibile anche per il mancato adempimento delle condizioni poste dall'<ref-law> per l'impugnazione di decisioni incidentali.
3. Per i motivi esposti, il ricorso dev'essere dichiarato inammissibile. Riguardo alle spese, va considerato che la decisione impugnata è poco chiara tanto nel dispositivo che nella motivazione, ciò che ha spinto la ricorrente ad inoltrare il presente gravame; si giustifica pertanto statuire senza spese (art. 66 cpv. 1 seconda frase LTF). Non sono dovute ripetibili: alla ricorrente poiché formalmente soccombente, all'opponente poiché non sollecitato ad esprimersi nella procedura federale (<ref-law>).

Per questi motivi, il Tribunale federale pronuncia:
1. Il ricorso è inammissibile.
2. Non si prelevano spese giudiziarie.
3. Comunicazione ai patrocinatori delle parti e alla I Camera civile del Tribunale di appello del Cantone Ticino.