One of the key ECDC targets included in the multiannual work programme is that ‘by 2013, ECDC’s reputation for scientific excellence and leadership will be firmly established among its partners in public health, and ECDC will be a major resource for scientific information and advice on infectious diseases for the Commission, the Parliament, the Member States and their citizens’.
Üks ECDC mitmeaastases töökorras sätestatud peamisi eesmärke on järgmine: „2013. aastaks: keskuse maine juhtiva tipptasemel teadusasutusena on rahvatervise valdkonnas tegutsevate partnerite hulgas kindlalt kanda kinnitanud ning keskusest on saanud komisjonile, Euroopa Parlamendile, liikmesriikidele ja nende kodanikele oluline nakkushaiguseid käsitleva teadusinfo ja nõuannete allikas.”