Jednou z hlavních činností odboru vědeckého poradenství je vypracování pokynů v oblasti veřejného zdraví a posouzení rizik vyplývajících z prevence a kontroly infekčních onemocnění, jako jsou pokyny k očkování proti lidskému papilomaviru, operativní posouzení rizik týkajících se nového kmene sezonní chřipky H1N1 odolného vůči oseltamiviru (Tamiflu) nebo vědecké stanovisko k používání vakcín proti chřipce H5N1 pro léčbu lidí.
One of the main activities of SAU is the development of public health guidance and risk assessment on infectious dis\-ease prevention and control, e.g. guid\-ance on human papilloma vaccination, rapid risk assesment on a new strain of seasonal H1N1 influenza resistant to os\-eltamivir (Tamiflu), or scientific opinion on the use of influenza H5N1 vaccines for humans.