Jednou z hlavních činností oddělení vědeckého poradenství je vypracování pokynů v oblasti veřejného zdraví a posouzení rizik týkajících se prevence a kontroly infekčních nemocí, jako jsou pokyny k očkování proti lidskému papilomaviru, rychlé posouzení rizik týkajících se nového kmenu sezónní chřipky H1N1 odolného vůči oseltamiviru (Tamiflu) nebo vědecké stanovisko k používání vakcín proti chřipce H5N1 pro léčbu lidí.
One of the main activities of SAU is the development of public health guidance and risk assessment on infectious disease prevention and control, e.g. guidance on human papilloma vaccination, rapid risk assesment on a new strain of seasonal H1N1 influenza resistant to oseltamivir (Tamiflu), or scientific opinion on the use of influenza H5N1 vaccines for humans.