ECDC má víceletý strategický program, který vytyčuje plán jeho činností a priority na období let 2007 až 2013. Správní rada střediska každoročně schvaluje roční pracovní plán ECDC.
ECDC has a Strategic Multi-annual Programme which provides a roadmap for its activities and priorities from 2007 until 2013. Every year the Centre’s Management Board approves an annual work plan for ECDC.