Jedním z důležitých cílů ECDC obsažených ve víceletém pracovním programu je dosáhnout toho, že „pověst ECDC jako střediska vědecké excelence s vedoucí úlohou bude do roku 2013 u jeho partnerů v oblasti veřejného zdraví pevně zakotvena a ECDC se pro Komisi, Parlament, členské státy a jejich občany stane hlavním zdrojem vědeckých informací a poradenství o infekčních nemocech“. .
One of the key ECDC targets included in the multiannual work programme is that ‘by 2013, ECDC’s reputation for scientific excellence and leadership will be firmly established among its partners in public health, and ECDC will be a major resource for scientific informa\-tion and advice on infectious diseases for the Commission, the Parliament, the Member States and their citizens’ .