มหาวิทยาลัยขอนแก่น วิทยาเขตหนองคาย ถูกจัดตั้งตามมติคณะรัฐมนตรี เมื่อวันที่ 20 มิถุนายน พ.ศ. 2538 และมติเพิ่มเติมเมื่อ 8 ตุลาคม พ.ศ. 2539 เพื่อกระจายโอกาสทางการศึกษาไปสู่ภูมิภาค