สำหรับแนวทางในการแก้ปัญหาโรงพยาบาลขาดสภาพคล่อง สปสช. จะจัดสรรเงินให้โรงพยาบาลเพิ่มขึ้นจากเดิมงวดแรกที่เคยจ่ายให้ร้อยละ  25  เป็นร้อยละ  50  หรือกว่า  2,200  ล้านบาท พร้อมทั้งวางระบบการบริหารจัดการให้มีประสิทธิภาพมากขึ้น และจัดสรรงบประมาณเพิ่มเติมให้กับโรงพยาบาลที่มีประชากรอาศัยอยู่น้อย เพื่อแก้ปัญหาโรงพยาบาลขาดทุน