瑠璃ノ船学園――全国から夢を抱く若者が集まり、日々勉学に励んでいるこの学園は、
男子校でもないのに男子学生率が100％で、『色も恋も見つからない灰色の船』と呼ばれている。
しかし、最近になって、学園長が各分野のプロフェッショナルな女性教師を採用し、
彼女たちは男子学生から、ある種アイドルのような人気を得ていた。
やんごとなき事情によって故郷を離れ、日本にやってきた主人公・新戸カナタは、
季節外れの転入生として、この瑠璃ノ船学園に迎えられた。
特殊な学生のカナタは、数カ月間、通常の授業に加えて放課後の補習を受け、卒業を目指すことに。
補習を担当するのは、学園男子憧れのマトな女の先生たち。
他の男子たちと違う『特別』な距離感で、カナタと先生たちの関係は、『親密』なものになっていく……