それは、悩みを抱える家出少女を男子が見返りもなく無料で家に『泊め』てあげるという、
学生同士の新しい『友達』の関係。
主人公『高峰ゆうじ』はトメフレ募集サイトのチャットルームで自分を慰める日々を送っていた。
学園では孤立している彼だが、広い家で一人暮らしなのでトメフレ希望の女子たちにはモテモテなのだ！
陰キャゆえにお泊りまで少々時間がかかったものの、ゆうじがようやくトメフレ女子たちを招いてみると――
そこに現れたのはクラスメイトの美少女たちだった！？
個性豊かな美少女たちを家に泊めながら孤独を癒し癒される健全な『トメフレ』。
ゆる～い関係はいつまでつづくのやら……