拠点パートでは朝・昼・夜など時間の概念がり、また自由に移動できるようになっています。
特定の時間、特定の場所でしか会えないキャラクターもいて、それぞれに仲間になる条件が異なります。
また、ストーリーを進めるメインシナリオ以外に、一定の条件を満たすことで発生するサブクエストもります。
サブクエストではレアアイテムを入手できる他、サブクエストをクリアすることで仲間になる条件が満たされることも。