「特異点」南雲流星は、異空間からの侵略者たちのおかげでもう普通の高校生活をもう送れない身の上になっていた。今日も戦車と戦闘ヘリから襲われる日常だったが、彼のそばには「陸戦の戦乙女」ネルと「空戦の戦乙女」空先輩が、常に護ってくれている。近頃高校の美術部員たちの様子がおかしいという。そして愛する妹も行方不明に！？陸、海、空の魔女が入り乱れるヒロイックファンタジー第２弾！