未知の物体メダルの発掘により開発された、意思を持った小型ロボット・メダロット。そんなメダロットが欲しくてたまらない天領イッキは、愛犬が拾ってきたカブトメダルをきっかけにメダロットのメタビーと出会う。そのイッキとメタビーは謎のレアメダルを狙うロボロボ団との戦いに巻き込まれた事件のあと、雑誌に掲載されたウソのランキング情報を信じたタマオ・ピルバーレンがロボトルを求めてやって来たのをきっかけに、メダルを巡る謎の核心に迫るのであった！
メダロットファンの根強い人気を誇るイッキ編が全４巻の新装版で再登場！
第３巻はKCDX『メダロット３』１・２巻全話を収録。