人類の雌雄を決する戦いから、一年――。人類を滅ぼさんとする天敵”異海鬼獣”との戦いは、”魔術”と”機工”の融合”魔術機工”によって長足の進歩を遂げていた。逆行し、遡生し……滅びへとつながる歴史を書きかえる戦いは、成功したかに見えた。しかし、既定路線を外れて加速した歴史は、意図を超えて動き出す。消えた「黒い魔術書」の謎、ジャークとネトを付けねらう謎の魔術機工師――そしてすべての謎は、つながっていく……畳み掛ける敗北への罠を、覆すことができるか!?