Планктомицети

Планктомицетите (Planctomycetes) се колено на водни бактерии кои живеат во морски, слатки и мешани води. Се размножуваат со пупење. По форма се овоидни (јајцевидни), на дел од клеточното тело имаат тенок цилиндричен продолжеток кој на својот врв има прицврстувач кој помага меѓусебно да се прилепат за време на пупењето. 
1 Структура
Долго време бактерии кои припаѓаат на оваа група се сметаше дека немаат пептидогликан (муреин) во клеточниот ѕид, кој е важен хетерополимер присутен во повеќето бактериски клеточни ѕидови и служи како заштитна компонента. Наместо тоа се претпоставуваше дека нивните клеточни ѕидови се изградени од гликобелковина која е богата со глутамат. Сепак, неодамна, беа пронајдени претставниците од сите три таксони во рамките на Planctomycetes кои поседуваат пептидогликан во клеточниот ѕид.
Планктомицетите имаат карактеристична морфологија со внатреклеточно мембрански-оградени простори кои се нарекуваат: ''paryphoplasm'' (простор во кој нема рибозоми), ''pirellulosome'' (простор во кој има рибозоми) и ''nucleoid'' (простор кој содржи кондензирана нуклеинската киселина одвоен со двојна мембрана). Се до скорешното откривање на Poribacteria, планктомицетите беа единствените познати бактерии со внатрешно-клеточни мембрански прегради. Тридимензионална електронско томографска реконструкција на претставителниот вид, ''Gemmata obscuriglobus'', има дадено разни интерпретации за опсервацијата на внатрешно-клеточните простори. Студија од 2013 година, најде дека појавата на внатрешните прегради се должи на густо инвагинирана, но континуирана единечна мембрана, заклучувајќи дека се присутни само два клеточни простори типични за Грам-негативните бактерии - цитоплазма и периплазма. Како и да е, вишокот на мембрана тројно ја зголемува површината на клетката во однос на нејзиниот волумен, што можеби е поврзано со способноста на родот ''Gemmata ''да биосинтетизира стероли. Меѓутоа понова студија од 2014 година со употреба на слични методи го поддржува претходниот став дека мембрански-оградените внатрешни простори се од затворен тип.
Неодамна се покажа дека видот ''Gemmata obscuriglobus'' е способен да внесува големи молекули во клетката преку процес кој наликува на еукариотската ендоцитоза.
2 Молекуларни обележја
Иако ''Planctomycetes'' се познати по своите необични клеточни одлики, нивната специфичност во однос на сите други бактерии дополнително е поддржана од два CSIs (анг. conserved signature indels). Овие CSIs ја одвојуваат оваа група од соседните колена во рамките на PVC суперколеното.
Еден CSI го споделуваат сите членови на PVC групата, вклучувајќи ги и Planctomycetes. Planctomycetes, исто така, поседуваат CSP (анг. conserved signature protein), за кој е откриено дека врши важна функција која ексклузивно е присутна кај членовите на PVC групата.
3 Животен циклус
 Животниот циклус на многу планктомицети е наизменична смена меѓу сесилни и подвижни форми. Неподвижните сесилни клетки пупат и формираат клетки со камшиче кои пливаат, за по некое време да се закачат и поминат во сесилна форма која повторно ја отпочнува репродукцијата.
4 Филогенија
Филогенијата се заснова на проектот Проектот "Животно дрво на сите видови" (анг. The All-Species Living Tree Project).
5 Таксономија
Моментално прифатената таксономија е врз основа на ''Списокот на имиња на прокариотите со евиденција во номенклатурата'' (анг. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature - LPSN) и ''Националниот центар за биотехнолошки информации'' (анг. National Center for Biotechnology Information - NCBI).* Колено "Planctomycetes" Garrity & Holt 2001 emend. Ward 2011 [Planctomycetaeota Oren et al. 2015]
**  Класа Phycisphaerae Fukunaga et al. 2010
***  Ред Tepidisphaerales Kovaleva et al. 2015
****  Фамилија Tepidisphaeraceae Kovaleva et al. 2015
*****  Род ''Tepidisphaera'' Kovaleva et al. 2015
******  Вид ''Tepidisphaera mucosa'' Kovaleva et al. 2015
***  Ред Phycisphaerales Fukunaga et al. 2010
****  Фамилија Phycisphaeraceae Fukunaga et al. 2010
*****  Род ''Algisphaera'' Yoon, Jang & Kasai 2014
******  Вид ''Algisphaera agarilytica'' Yoon, Jang & Kasai 2014
*****  Род ''Phycisphaera'' Fukunaga et al. 2010
******  Вид ''Phycisphaera mikurensis'' Fukunaga et al. 2010
**  Класа Planctomycetacia Cavalier-Smith 2002
***  Вид ?"''Candidatus'' Nostocoida limicola III" ♠ Liu et al. 2001
***  Вид ?"''Candidatus'' Nostocoida acidiphila" ♠ Kulichevskaya et al. 2012
***  Ред "Brocadiales" Jetten et al. 2011
****  Фамилија "Brocadiaceae" Jetten et al. 2011
*****  Род "''Candidatus'' Anammoxoglobus" Kartal et al. 2006
******  Вид "''Candidatus'' Anammoxoglobus propionicus" Kartal et al. 2006
*****  Род "''Candidatus'' Brocadia" Jetten et al. 2001
******  Вид "''Candidatus'' B. anammoxidans" Jetten et al. 2001
******  Вид "''Candidatus'' B. brasiliensis" Araujo et al. 2011
******  Вид "''Candidatus'' B. caroliniensis"
******  Вид "''Candidatus'' B. fulgida" Kartal et al. 2004
******  Вид "''Candidatus'' B. sinica" Hu et al. 2010
*****  Род "''Candidatus'' Jettenia" Quan et al. 2008
******  Вид "''Candidatus'' Jettenia asiatica" Quan et al. 2008
******  Вид "''Candidatus'' Jettenia caeni" Ali et al. 2015
******  Вид "''Candidatus'' Jettenia moscovienalis" Nikolaev et al. 2015
*****  Род "''Candidatus'' Kuenenia" Schmid et al. 2000
******  Вид "''Candidatus'' Kuenenia stuttgartiensis" Schmid et al. 2000
*****  Род "''Candidatus'' Scalindua" Schmid et al. 2003
******  Вид "''Candidatus'' S. arabica" Woebken et al. 2008
******  Вид "''Candidatus'' S. marina" Van de Vossenberg et al. 2007
******  Вид "''Candidatus'' S. profunda" Van De Vossenberg et al. 2008
******  Вид "''Candidatus'' S. richardsii" Fuchsman et al. 2012
******  Вид "''Candidatus'' S. wagneri" Schmid et al. 2003
******  Вид "''Candidatus'' S. sorokinii" Kuypers et al. 2003
******  Вид ''Candidatus'' S. brodae Schmid et al. 2003
***  Ред Planctomycetales Schlesner & Stackebrandt 1987 emend. Ward 2011
****  Фамилија Planctomycetaceae Schlesner & Stackebrandt 1987 emend. Scheuner et al. 2014 [Isosphaeraceae Kulichevskaya et al. 2015]
*****  Род "''Bythopirellula''" ♠ Storesund & Ovreas 2013
****** Вид  "''Bythopirellula goksoyri''" ♠ Storesund & Ovreas 2013
*****  Род "''Candidatus'' Anammoximicrobium" ♠ Khramenkov et al. 2013
******  Вид "''Candidatus'' Anammoximicrobium moscowii" ♠ Khramenkov et al. 2013
*****  Род ''Aquisphaera'' Bondoso et al. 2011
******  Вид ''Aquisphaera giovannonii'' Bondoso et al. 2011
*****  Род ''Blastopirellula'' Schlesner et al. 2004
******  Вид ''B. cremea'' Lee et al. 2013
******  Вид ''B. marina'' (Schlesner 1987) Schlesner et al. 2004 [''Pirellula marina'' (Schlesner 1987) Schlesner & Hirsch 1987; ''Pirella marina'' Schlesner 1987 ill.]
*****  Род ''Gemmata'' Franzmann and Skerman 1985
******  Вид ''Gemmata obscuriglobus'' Franzmann & Skerman 1985
*****  Род ''Gimesia'' Scheuner et al. 2015 [''Planctomyces maris'' (ex Bauld & Staley 1976) Bauld & Staley 1980]
******  Вид ''Gimesia maris'' Scheuner et al. 2015 [''Planctomyces maris'' (ex Bauld & Staley 1976) Bauld & Staley 1980]
*****  Род ''Isosphaera'' Giovannoni et al. 1995
******  Вид ''Isosphaera pallida'' (ex Woronichin 1927) Giovannoni et al. 1995 nom. rev. ["''Isocystis pallida''" Woronichin 1927; "''Torulopsidosira pallida''" (Woronichin 1927) Geitler 1963]
*****  Род ''Paludisphaera'' Kulichevskaya et al. 2015
******  Вид ''Paludisphaera borealis'' Kulichevskaya et al. 2015
*****  Род ''Pirellula'' Schlesner & Hirsch 1987 emend. Schlesner et al. 2004 [''Pirella'' Schlesner & Hirsch 1984 non Bainier 1883]
******  Вид ''Pirellula staleyi'' Schlesner & Hirsch 1987 [''Pirella staleyi'' Schlesner & Hirsch 1984 ill.]
*****  Род ''Planctomicrobium'' Kulichevskaya et al. 2015
******  Вид ''Planctomicrobium piriforme'' Kulichevskaya et al. 2015
*****  Род ''Planctomyces'' Gimesi 1924
******  Вид ''P. bekefii'' ♪ Gimesi 1924 (type sp.) ["''Blastocaulis sphaerica''" Henrici & Johnson 1935; "''Acinothrix globulifera''" Novácek 1938; "''Planctomyces subulatus''" Wawrik 1952; "''Planctomyces crassus''" Hortobágyi 1965]
******  Вид ''P. guttaeformis'' ♪ (ex Hortobágyi 1965) Starr and Schmidt 1984
****** Вид  ''P. stranskae'' ♪ (ex Wawrik 1952) Starr and Schmidt 1984
*****  Род ''Planctopirus'' Scheuner et al. 2015
****** Вид  ''Planctopirus limnophila'' corrig. (Hirsch & Muller 1986) Scheuner et al. 2015 [''Planctomyces limnophilus'' Hirsch and Müller 1986]
*****  Род ''Rhodopirellula'' Schlesner et al. 2004
****** Вид  ''R. baltica'' Schlesner et al. 2004 (type sp.)
****** Вид  ''R. caenicola'' Yoon et al. 2015
****** Вид  ''R. rosea'' Roh et al. 2014
****** Вид  ''R. rubra'' Bondoso et al. 2014
****** Вид  ''R. lusitana'' Bondoso et al. 2014
****** Вид  "''R. europaea''" ♠ Frank 2011
****** Вид  "''R. islandica''" ♠ Kizina et al. 2015
****** Вид  "''R. maiorica''" ♠ Frank 2011
****** Вид  "''R. sallentina''" ♠ Frank 2011
*****  Род ''Roseimaritima'' Bondoso et al. 2015
****** Вид  ''Roseimaritima ulvae'' Bondoso et al. 2015
*****  Род ''Rubinisphaera'' Scheuner et al. 2015
****** Вид  ''Rubinisphaera brasiliensis'' (Schlesner 1990) Scheuner et al. 2015 [''Planctomyces brasiliensis'' Schlesner 1990]
*****  Род ''Rubripirellula'' Bondoso et al. 2015
****** Вид  ''Rubripirellula obstinata'' Bondoso et al. 2015
*****  Род ''Schlesneria'' Kulichevskaya et al. 2007
****** Вид  ''Schlesneria paludicola'' Kulichevskaya et al. 2007
*****  Род ''Singulisphaera'' Kulichevskaya et al. 2008 emend. Kulichevskaya et al. 2012
****** Вид  "''S. mucilaginosa''" ♠ Zaicnikova et al. 2011
****** Вид  ''S. acidiphila'' Kulichevskaya et al. 2008 (type sp.)
****** Вид  ''S. rosea'' Kulichevskaya et al. 2012
*****  Род ''Telmatocola'' Kulichevskaya et al. 2012
****** Вид ''Telmatocola sphagniphila'' Kulichevskaya et al. 2012
*****  Род ''Thermogutta'' Slobodkina et al. 2015
****** Вид  ''T. hypogea'' Slobodkina et al. 2015
****** Вид  ''T. terrifontis'' Slobodkina et al. 2015
*****  Род ''Thermostilla'' Slobodkina et al. 2015
****** Вид  ''Thermostilla marina'' Slobodkina et al. 2015
*****  Род ''Zavarzinella'' Kulichevskaya et al. 2009
****** Вид  ''Zavarzinella formosa'' Kulichevskaya et al. 2009
5.0.1 Забелешки:
♠ Видовите се наоѓаат во NCBI, но не се наведени во LSPN.
♪ Прокариоти кои не се изолирани од чисти култури или не се достапни, бидејќи не можат да се одгледуваат во култура или не можат да се одржат во култура.