Хаплогрупа G-M285

Во човечката генетика, хаплогрупата G-M285 или G-M342, исто така позната како Хаплогрупа G1 — хаплогрупа со Y-хромозом. Хаплогрупата G1 е примарна потклад на хаплогрупата G.
Се верува дека G1 потекнува од Иран. Хаплогрупата има екстремно ниска честота кај современите населенија, освен (i) Иран и неговите западни соседи, и (ii) регион кој се протега на југ од Централен Сибир (Русија) и северен Казахстан. Најбазалните примери на G1 идентификувани кај живи поединци, кои припаѓаат на поткладот G-L830, се пронајдени низ област од Арапскиот Полуостров (Северниот граничен регион на Саудиска Арабија, Доха од Катар) до Ашкенашките Евреи од Белорусија (Минска област) и Кина (Анхуеј).
1 Генетски карактеристики
Речиси сите G1 лица поседуваат вредност од 12 при краткото тандемско повторување (STR) маркер DYS392 и сите ќе имаат M285 SNP мутација што ја карактеризира оваа група. Оваа вредност од 12 е исто така невообичаена кај другите хаплогрупи. Ознаката М за M285 покажува дека првпат била идентификувана на Универзитетот Стенфорд.
M285 ги има следните карактеристики: Наводниот ID број е rs13447378..... Позицијата Y е 21151128.... Напредната секвенца на прајмер е ttatcctgagccgttgtccctg, а обратната низа tgtagagacacggttgtaccct .... Мутацијата е од G до C. M285 првпат била пријавена во 2004 година од Џиниоглу и соработниците.
Досега сите тестирани лица кои имаат мутација M285, исто така, се позитивни на M342 SNP мутација. Доколку некој тестира поинаку, неговите резултати ќе станат основа за нова категорија Г1. M342 се наоѓа на позицијата на низата 21653330 и е AGAGAGTTTTCTAACAGGGCG во предниот прајмер и TGGGAATCACTTTTGCAACT во задниот дел. Тоа е мутација од C до T. M342 исто така била идентификувана на Универзитетот Стенфорд,
Дополнително, во рамките на хаплогрупата G, оние G1 лица кои се тестирани досега се уникатно позитивни (изведени) за SNP L89 додека сите други G лица се негативни (предци). Мутацијата L89 SNP била пронајдена и во други хаплогрупи. L89 се наоѓа на позицијата на секвенцата 8038725, а наводниот ID број е rs35160044. Тоа е мутација од Т до С. Ознаката L89 била дадена од Family Tree DNA.
2 Датирање
Додека истражувачките проучувања сè уште не го датираат потеклото на мутацијата на G1 M285 SNP, таа навидум претставува една од постарите G групи, која се појавува можеби на половина пат помеѓу потеклото на G и денес врз основа на бројот на мутации на маркерот STR.
3 Географска распространетост
Додека повеќето истражувачки проучувања не успеале да тестираат за G1, веројатни или докажани примери биле пронајдени во четири групи (по географија и/или и/или секундарен потклад):
* Иран/Средна Азија (вклучувајќи го рускиот Централен Сибир, Казахстан и Пакистан);
* Блискиот Исток / Југоисточна Европа (на пр. Грција, Турција, Ирак, Дубаи, Палестина, Јордан, Саудиска Арабија и Јемен);
* во многу мал број во Јужна Азија (на пр. Непал, Индија и Шри Ланка), и;
* на многу ниски честоти во остатокот од Европа.
Највисоката пријавена концентрација на G1 и нејзините подгрупи во една земја е во Иран, со следните најчести концентрации во соседните земји на запад. Поточно, G1 била пронајдена во 5% од 177 примероци од јужен Иран во едно проучување. Истата студија открила G1 во 3% од 33 примероци во северен Иран. Процентот на југ бил речиси еднаков на процентот на G2, единствениот регион во светот каде што било откриено дека типовите G2 не се многу доминантни. Претходните студии кои откриле приближно исти проценти на G во различни делови на Иран не успеале да тестираат специјално за G1.
Во Турција, Џиниоглу открил 1% од 523 примероци од сите типови кои припаѓаат на хаплогрупата G1 и како и сите достапни G1 надвор од Иран, G1 бил засенет од многу поголем број G2 мажи во примерокот. Сите примероци G1 во оваа студија, освен еден, припаѓале на понатамошната подгрупа G1a, а сите примероци биле од североисточна Турција.
Студија за Либан од Залуа и соработниците не успеала да се тестира за G1, но 26% од 38 G примероци имале вредност од 12 за STR маркерот DYS392, речиси секогаш карактеристичен за G1. Овие G1 примероци претставуваат само 2% од вкупно 587 либански примероци и биле добро распоредени меѓу сите религиозни групи во регионот.
Пошироко проучување за Левант од ел-Сибај и соработниците исто така не успеало да се тестира за G1, но 12% од 17 сириски G примероци имале вредност 12 на DYS392. Овие G1 примероци претставуваат помалку од 1% од 354 сириски примероци. Во истата студија, 21% од 14 јордански примероци G ја поседувале вредноста 12. Овие G1 примероци претставуваат 1% од 274 јордански примероци. Ниту еден од 8-те египетски G примероци немал вредност 12.
Веројатните G примероци во базата на податоци на YHRD од областа на јужниот дел на Кавказ (Азербејџан, Грузија, Ерменија, Абазинија, Абхазија) и од северниот дел на Кавказ (Северни Осети, Кабардинци, Ингуши, Даргињани, Лезгинци, Рутули и Чеченци) имаат само неколку примероци DYS392 со 12 вредности кои може да бидат G1.
3.1 Места со концентрации на G1
Највисока концентрација на G1 во посебна група во една земја БИЛА забележана кај казахското племе АргинИ - 67% и неговиот огранок МаџарИ од Казахстан, каде лицата Г1 сочинуваат 87% од 45 примероци.
4 G1 подгрупи
4.1 Подгрупи дефинирани од SNP
Подгрупата G1a (P20) е прилично честа кај G1 лицата, но веродостојноста на SNP P20 во идентификувањето на лицата G1a прави некои тестови за P20 да бидат проблем. Резултатите од P20 може да се пријават како P20.1, P20.2 и P20.3, а лицата може да имаат различни резултати за секоја од нив. Техничките карактеристики на P20 се: Позицијата Y е 25029911; 23396163..... напредниот прајмер е tggatctgattcacaggtag ..... обратен прајмер е ccaacaatatgtcacaatctc ... мутацијата е бришење на C. Мутацијата била идентификувана на Универзитетот во Аризона и првпат била пријавена од Y Chromosome Consortium во 2002 година Категоријата G1a има посебна подгрупа заснована на присуството на вредноста 8 на краткотрајниот маркер за повторување DYS494. Со исклучок на оваа подгрупа G1a, сите други G лица имаат 9 на овој бавно мутирачки маркер. Досега околу половина од G1a лицата кои инаку се негрупирани ја ПОСЕДУВААТ оваа вредност 8.
G1a1 (L201, L202 и L203) БИЛЕ идентификувани кај лице G1a тестирано на Family Tree DNA во есента 2009 година. Последователните тестирања покажале дека само некои G1a лица ги имаат овие мутации, и досега сите тие се од тесно поврзана еврејска група Ашкенази. Биле забележани следните Y позиции: 2718285 за L201, 13001714 за L202 и 13001715 за L203. Во L201 мутацијата е C до T; во L202 од T до C; и во L203 од A до G. Ако некој човек треба да има една од овие SNP мутации без другите, оваа информација би станала основа на новата класификација G1a1.
Стариот G1b (P76) бил отстранет од официјалната котација во август 2012 година, бидејќи неговото откривање во едно лице го прави досега само приватен SNP.
4.2 STR кластери за вредности на маркери
Постојат две карактеристични еврејски кластери од европско потекло Ашкенази во рамките на G1a1 и G1c и карактеристичен G1a казахстански кластер - сите три засновани на вредности на маркери за кратко тандемско повторување (STR). Мажите во еврејскиот кластер G1c поседуваат вредност 12 на STR маркерот DYS446 што е неколку вредности пониско од скоро сите G лица, но на другите две групи им недостасува една специфична вредност на маркерот како идентификатор. Кога се достапни приближно 30 или повеќе STR маркери кога се споредуваат примероците, членовите во секоја од трите групи лесно се утврдуваат. Во една истражувачко проучување, едно од карактеристичните комбинации на вредности на маркерот за маркери од европско потекло G1c Ашкенази, еврејски STR, била пронајдена и кај ирачки Евреин.
Меѓу достапните примероци G1 STR со 67 маркери, еврејскиот кластер Ашкенази G1a1 ги претставува најблиските роднини на кластерот Казахстан G1a врз основа на сличноста на вредностите на маркерот STR.
Кластерот Ашкенази G1c е само далечно поврзан со кластерот Ашкенази G1a1, а кластерот G1c Ашкенази има најблиски роднини наместо меѓу различните Европејци.
5 Преселби на лица од G1
Концентрацијата на G1 пронајдена денес во Иран и соседната територија на неговиот запад сугерира, но не докажува дека истата област била местото на потеклото на G1. Поради долгата старост на G1, далечните преселби на мал број лица од G1 можеле да се случат во секое време во текот на историскиот период преку различни видови на движења на населението. Би било шпекулативно да се претпостави како кластерите Ашкенази G1 или казахстанските G1 кластери мажи пристигнале во североисточна Европа и Казахстан соодветно.