मदुरई स्थित आयुर्विज्ञान कीटविज्ञान अनुसंधान केंद्र , मुंबई स्थित आंत्रविषाणु अनुसंधान केंद्र , पुणे स्थित माइक्रोबियल कनटेनमेंट कॉपलेक्‍स , पुणे स्थित राष्‍ट्रीय एड्स अनुसंधान संस्‍थान , कोलकाता स्थित राष्‍ट्रीय हैज़ा तथा आंत्ररोग संस्‍थान , चेन्‍नई स्थित राष्‍ट्रीय जानपदिक रोगविज्ञान संस्‍थान , नई दिल्‍ली स्थित राष्‍ट्रीय मलेरिया अनुसंधान संस्‍थान तथा देश के विभिन्‍न भागों में स्थित इसकी 10 फील्‍ड यूनिट्स , नई दिल्‍ली स्थित राष्‍ट्रीय आयुर्विज्ञान सांख्यिकी अनुसंधान संस्‍थान , पुणे स्थित राष्‍ट्रीय विषाणुविज्ञान संस्‍थान , आगरा स्थित राष्‍ट्रीय जालमा कुष्‍ठ एवं अन्‍य माइक्रोबै‍क्‍टीरियल रोग संस्‍थान , भुवनेश्‍वर स्थित क्षेत्रीय आयुर्विज्ञान अनुसंधान केंद्र , पोर्ट ब्‍लेयर स्थित क्षेत्रीय आयुर्विज्ञान अनुसंधान केंद्र , जबलपुर स्थित क्षेत्रीय जनजातीय आयुर्विज्ञान अनुसंधान केंद्र , पटना स्थित राजेन्द्र प्रसाद स्‍मारक आयुर्विज्ञान अनुसंधान संस्‍थान , चेन्‍नई स्थित यक्ष्‍मा अनुसंधान केंद्र , चेन्‍नई स्थित यक्ष्‍मा अनुसंधान केंद्र की जानपदिक रोगविज्ञान इकाई , पुडुचेरी स्थित रोगवाहक नियंत्रण अनुसंधान केंद्र तथा कोलकाता स्थित आईसीएमआर विषाणु केन्द्र ।
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