जहां संरक्षण विज्ञान समुदाय के अधिकांश लोग जैव विविधता बनाए रखने के " महत्व पर ज़ोर " देते हैं , वहीं इस बात पर विवाद चल रहा है कि जीन , प्रजातियां या पारिस्थिक प्रणालियों को प्राथमिकता कैसे दें , जो सभी जैव विविधता के घटक हैं ( उदा.बोवेन , 1999 ) . जहां आज तक प्रमुख दृष्टिकोण " जैव विविधता के हॉटस्पॉट " के संरक्षण द्वारा लुप्तप्राय प्रजातियों पर प्रयासों को केंद्रित करना रहा है , वहीं कुछ वैज्ञानिक ( उदा. ) और प्रकृति संरक्षण जैसे संरक्षण संगठनों का तर्क है " जैव विविधता के कोल्डस्पॉट " में निवेश अधिक लागत प्रभावी और सामाजिक रूप से प्रासंगिक होगा ।
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