वर्ष २००४ में रूमानी हास्य फ़िल्म " हम तुम " और " युवा " में अपने अभिनय के लिए , मुखर्जी एक ही वर्ष में क्रमशः फ़िल्मफ़ेयर सर्वश्रेष्ठ अभिनेत्री पुरस्कार और सहायक अभिनेत्री का पुरस्कार जीतने वाली एकमात्र अभिनेत्री बनीं ।
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