Kjempehavørn har stor flygeevne og den er en svært dyktig seiler, som vet å utnytte turbulensen til sin fordel. Når fuglene jakter vagler den seg som regel i et tre over vannflaten, eller den sitter å venter på en steinformasjon nær vannet. Den har som andre ørner ypperlig syn. Når den oppdager et bytte stuper arten ned med føttene først for å gripe byttet med klørne, som regel på grunt vann. Den kan også sirkle over vannflaten og utføre stupet derfra. Vinterrasjonene består av cirka med mat daglig, økende til opp mot i hekketiden om sommeren, hvorav cirka kan bli gitt til et enkelt avkom og til avkom i et rede som sådan.