X.A.N.A. og universet Lyoko ble opprinnelig skapt av Franz Hopper for å ødelegge «Projecte Carthage». Den er et multiagent-program utviklet for den franske regjeringen for å overvåke statsfiendtlig kommunikasjon. Uheldigvis utviklet XANA selvstendighet, og når Franz Hopper og hans datter, Aelita, kom til Lyoko å gjemme seg for den franske etterretningstjenesten, grep X.A.N.A. sjansen, fengslet Hopper og stjal Aelitas minner. Deretter konstruerte han monstre som han kan materialisere nede på jorden.