Fibiger var medlem av Folketinget for Thisted amtskrets 1920–1957. Gårdsdriften på Øland ble derfor overlatt til en forvalter innen hans eneste barn, Steen, kunne kjøpe den i 1948. Politisk representerte Fibiger de agrare og kirkelige strømningene i Det Konservative Folkeparti. Han ble en stor beundrer og nær fortrolig med John Christmas Møller, som på sin side representerte den urbane middelklassen. Fibiger og Christmas Møller var sterkt medvirkende til at de konservative inngikk forlik med Stauning-regjeringen om krisehjelp til landbruket i 1931 og 1932. Da Christmas Møller gikk av som formann i Det Konservative Folkepartis hovedstyre i 1939, var Fibiger hans foretrukne etterfølger, og han ble sittende frem til 1948.