Fuglene hekker i kolonier på opp til 20 par, og redene (gjort på en plattform av ) bygges gjerne med avstand (av og til ned mot kun én meters avstand). Hunnen legger egg (typisk 2, men 1–3 regnes som normalt) fra sent til november til mars, for det meste i januar og desember, i regnsesongen. Når vannstanden i sjøen er svært lav, får ikke junindykkeren unger i det hele tatt.