Kanskje har det vært kirke på Halsa helt fra 1100-tallet. Halsynjar kirke er nevnt første gang i 1303. Ved reformasjonen ble kirkene overtatt av kongen. Under et voldsomt tordenvær i 1724 brant Halsa, Aure og Lille Fosen kirker ned. Ny kirke ble reist på ett år.