I likhet med , består av tre hovedspillmodus: et verdenskart, et feltkart og battle screen. Verdenskartet er en tredimensjonalt forminsket versjon av verdenen hvor spilleren kan navigere fritt. Figurene kan reise over verdenskartet på forskjellige måter, inkludert til fots, bil, chocobo, tog og luftskip. Feltkartet består av spillbare 3D-figurer som er plassert på en eller flere prerendrede 2D-bakgrunner som representerer steder som for eksempel byer eller skoger. Battle screen er en 3D-modell av forskjellige steder, hvor turbaserte kamper mellom spillbare figurer og datastyrte fiender finner sted. Det tradisjonelle våpen- og rustningsystemet er ikke med i dette spillet men nytt innhold, for eksempel «Junction»-systemet og minispillet «Triple Triad», er blitt inkludert.