Etter ordinasjonen var Dougan først som prest for i Hamilton og som kapellan ved der, før han ble viserektor ved Pontifical Scots College i Roma i 2006. Etter hjemkomsten var han sogneprest i menighetene i Rutherglen og som kapellan ved i Hamilton fra 2013 til 2021. Fra 2021 var han sokneprest for i East Kilbride og kapellan ved der. og ved der. I tillegg virket som sogneprest, fungerte Dougan også som konsultor fra 2013 og som visefunksjonær ved den interbispedømmedomstolen for de skotske bispedømmene fra 2017. Han var også official i Motherwell bispedømme fra 2017.