I 1898 dro de Morgan atter til Persia, der han foretok utgravninger med understøttelse fra den franske og den persiske regjering. Blant annet ledet han store utgravninger i Susa, der han fant de deler av byen som før persertiden hadde hatt størst betydning, og hvor gamle elamittiske konger hadde residert. Funnet av støtten med den babylonske konge Hammurabis lover i Susa i 1901 skyldes de Morgan. Den ble kjent straks av pater Scheil presentasjon med fransk oversettelse og forklaringer.