På 2000-tallet ble Arraiz en lederfigur innen Den baskiske nasjonale frigjøringsbevegelsen og Batasuna. I 1998 og 2001 stilte han for Euskal Herritarrok i valgene til Baskerlands parlament, uten å bli valgt. I 2012 stilte han for valgalliansen EH Bildu og ble valgt inn i det baskiske parlamentet.