FN brukte 1,6 milliarder dollar fra 1994 til 1998 på å opprettholde en fredsbevarende styrke. Det angolanske militæret angrep UNITA-styrker i det sentrale høylandet 4. desember 1998. Dos Santos sa at han mente krig var den eneste måten å til slutt oppnå fred, og avviste Lusaka-protokollen. Han ba også FN om å forlate landet, de siste FN-styrkene forlof landet i februat 1998. På slutten av 1998 dannet flere UNITA-sjefer en utbrytergrupp, UNITA Renovada, fordi de var misfornøyde med Savimbis ledelse. I september 1999 startet regjeringsstyrkene en stor offensiv og løpet av resten av 1999 og 2000 ble UNITA presset tilbake flere steder. 11 november 2000 tilbød Dos Santos amnesti til UNITA og utbrytergruppene og mange av UNITAs avdelinger godtok vilkårene. Savimbi godtok det ikke, han trakk seg tilbake til sin historiske base i Moxico sammen sine gjenværende styrker. Disse var imidlertid svært svekket. Regjeringens offensiv presset tilbake og tvang mesteparten av UNITA til fred, men det var sivile som led de største tapene.