En stor del av klosteret som ble reist av Finnian ble brent i 764. Som mange klostersteder i Irland, fikk Clonard store tap under angrepene fra viking mellom 800- og 1000-tallet da det ikke lå langt fra det norrøne kongeriket Dublin. I år 838 ødela de norrøne nordboerne stedet og drepte folk. nevner spesielt at Olav Kvite skal ha drept en av kongene av Mide ved Clonard i 864. De kom tilbake igjen i 888. I 939 ble klosteret plyndret av Ceallachan, den irske kongen av Cashel i allianse med de norrøne nordboerne i Waterford. I 970 plyndret og brente Donell, sønn av Murcha, Clonard. Klosteret ble igjen plyndret av «fremmede» (de vil si vikinger) i 997.