Hun var datter av den gottorpske hertugen Frederik III og hustru Marie Elisabeth av Sachsen. Den 16. september 1649 giftet hun seg på Gottorp slott med prins Johann VI von Anhalt-Zerbst (1621–1667). Samtidig med bryllupet ble også Fredsavtalen i Münster feiret, en begivenhet som prinsen hadde vært deltager i året før. Flere fyrstelige deltok i bryllupsfestlighetene, deriblant kong Frederik III av Danmark-Norge og Sophie Amalie såvel som de senere hertugene Christian I von Sachsen-Merseburg (1615–1691) og Moritz von Sachsen-Zeitz (1619–1681), begge sønner av Johann Georg I av Sachsen. Til tross for knappe ressurser, ble det ikke spart på utgiftene. Her var fyrverkeri, ringridning og turnerninger og hoffbibliotekaren Adam Olearius (1599–1671) hadde skrevet en ballet i tre akter spesielt til begivenheten.