Under 1996–97 sesongen ble Marleau utnevnt til kaptein for Thunderbirds og ledet dem til en andreplass (bak Portland) i . I grunnserien stoppet Marleau på 51 mål og 125 poeng og avsluttet i WHL's topp-3 i begge kategorier. I sluttspillet ledet Marleau Thunderbirds til ett Western Conference Championship, og kom på andreplass i avstemningen hvor han tapte kun for Peter Schaefer som spilte for .