Hovedmatrikkel kan for eksempel være betegnelsen på en protokoll en kan finne i eldre skolers arkiv. Det er en innskrivningsprotokoll eller elevprotoll der skolens elever blir skrevet inn etter hvert som de begynner på skolen. Alle elevene ble gitt hvert sitt unike løpenummer ved den skolen de startet på, og fikk et nytt dersom de byttet skole. Løpenummeret finner en igjen i andre protokoller i et skolearkiv, som i fraværsprotokoller og karakterprotokoller. En hovedmatrikkel i skolesammenheng gir informasjon om elevens navn, fødselsdato, adresse, dato for skolestart, eventuelt tidligere skoler eleven har gått på og utskrivelsesdato. Ellers finnes opplysninger om forsørgers navn og stilling. I dag føres det ikke slike protokoller, og oversikt over elever ved skolen finnes i klasselister, som imidlertid ikke kalles matrikler.