Stygge etterfulgte i 1424 Bo Mogensen som biskop i Aarhus. Han kom med det samme i strid med dronning Philippa, som under Erik av Pommerns utenlandsreise ledet riket. Uenigheten handlet om arven etter biskop Bo. Saken ble avgjort med en rekke voldgiftsmenn med erkebiskop Peder Lykke i spissen, og falt ikke ut til biskopens fordel. Stygge kunne så til gjengjeld oppleve kongemaktens ydmykelse da kong Erik ble avsatt i 1439, men det vites ikke hvilken rolle han spilte i denne konflikt.