Fayetteville ble etablert i 1822, som hovedsete i det nylig etablerte Fayette County, som ble tatt fra Creek-indianerne og som ble organisert av europeisk-amerikanere. Dette var i starten av en periode der USA fortrengte indianere fra det sørøstlige USA. Byen og fylket er oppkalt etter den franske generalen Marquis de La Fayette, som kom til dette fylket for å kjempe under general George Washington i Den amerikanske uavhengighetskrigen (1775–1783).