Ifølge enkelte egyptologer, som J. P. Allen, styrte Ankhkheperure Smenkhkare sammen med Meritaten, men året etter Akhnatons død, døde også Smenkhkare. Man tror at Meritaten er den kongedatteren Akenkeres som historikeren Manetho (3. århundre f.Kr.) skriver om i og som overtok kongetronen selv under navnet Neferneferuaten. Neferneferuaten antas å ha regjert i to år og en måned og er av Manetho plassert som den umiddelbare etterfølgeren til en konge ved navn som man tror er Tutankhamon, hennes halvbror med en annen hustru til Akhnaton som man ikke kjenner navnet på.