Magneto bruker Robert Kelly for å teste en maskin drevet av magnetiske krefter som kan generere et strålefelt, som fører til mutasjoner hos normale mennesker. Rogue besøker Wolverine om natten, når han har et mareritt. Forferdet, stikker han henne ned ved et uhell. Men Rogue er i stand til å absorbere hans helbredende evne for å bli frisk. Dette observeres av andre studenter ved skolen. Magneto slår ut Wolverine, kidnapper Rogue, og planlegger å plassere en maskin på Liberty Island og bruke den til å «mutere» verdens lederne som skal møtes på en FN-konferanse ved det nærliggende Ellis Island. Dermed håper han at alle mutantene skal bli akseptert av verdenssamfunnet. Men Xavier finner ut at denne mutasjonen til føre til at alle som gjennomgår denne prosessen senere kommer til å dø.